The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
APWATAEYDYDAAEDNELTFVENDKIINIEFVDDDWWLGELEKDGSKGLFPSNYVSLGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Actin-binding protein
|
| publication title |
Structures of invisible, excited protein states by relaxation dispersion NMR spectroscopy
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
11
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CUB A; 2W10 A; 1AEY A; 1JO8 A; 4J9I A; 2LJ3 A; 2EKH A; 2FRY A; 2RF0 A; 1RUW A; 4HCK A; 1NM7 A; 1AZG B; 4J9D A; 2VWF A; 3VS4 A; 4RTX A; 1UEC A; 5IHK A; 1WYX A; 2F2W A; 4AFU C; 1W1F A; 1Y0M A; 1AWO A; 2DRM A; 2JS2 A; 2NWM A; 4RTT A; 1UGV A; 3A98 A; 1UUE A; 3EGU A; 2AKL A; 2EGA A; 2X3W D; 2ECZ A; 3PVQ A; 5FW9 A; 4RTZ A; 1PKS A; 1ZBJ A; 4D8K A; 3C0C A; 2J6O A; 2DYB A; 4J9H A; 1GBR A; 1G83 A; 4J9B A; 1JXO A; 2A37 A; 2C0T A; 1TUC A; 2AZS A; 1AWJ A; 1BK2 A; 4JJC A; 1I0C A; 1CKB A; 2HSP A; 2CT4 A; 2JXB A; 1H3H A; 3UA6 A; 1KIK A; 1HSQ A; 1M8M A; 2CSQ A; 1YN8 A; 1ARK A; 1WI7 A; 2KRO A; 3M0T A; 2OI3 A; 2LNH B; 2L0A A; 3GBQ A; 2EGE A; 2V1Q A; 2CRE A; 4WCI A; 1H92 A; 2VKN A; 1E6G A; 1K1Z A; 2GNC A; 4JJB A; 1GRI A; 1UHF A; 2LJ1 A; 3PE0 A; 2D8J A; 4K11 A; 3IQL A; 5IXF A; 2JMC A; 2FPF A; 2D8H A; 2E5K A; 5EC7 A; 2KXD A; 1S1N A; 1X27 A; 3I5S A; 4LN2 A; 4F17 A; 3H0F A; 2LP5 A; 2M51 A; 2EVR A; 2JMA A; 3SEM A; 2ESW A; 4J9G A; 1XOV A; 2K9G A; 2FRW A; 2FEI A; 1GCQ A; 1WIE A; 1CKA A; 1SHG A; 1SRL A; 2L3P A; 1GCP A; 1NYF A; 3UA7 A; 2RN8 A; 4JJD A; 1RI9 A; 1ZUY A; 5GJW B; 1X69 A; 5IH2 A; 1SHF A; 2JTE A; 3UF4 A; 1BB9 A; 2ENM A; 1I07 A; 3M0Q A; 1PKT A; 1UE9 A; 4DEX A; 1Z9Q A; 1ZLM A; 4AFS C; 5IHN A; 2K6D A; 1UJY A; 1QWF A; 4E6R A; 2EYY A; 2DL5 A; 2HEQ A; 1VA7 A; 1Z9Z A; 1JQQ A; 2DMO A; 2JM8 A; 1X6G A; 4RTV A; 2KXC A; 1X2K A; 3VS5 A; 3VS7 A; 1B3Q A; 1A0N B; 1AWX A; 1BBZ A; 2CH4 W; 2FPE A; 1WFW A; 3JV3 A; 1K0S A; 2VVK A; 3EG2 A; 1ZUK A; 4CC2 A; 2BZ8 A; 4RTW A; 2DRK A; 2LZ6 B; 3EG1 A; 2D1X A; 3M0R A; 3RNJ A; 3VRZ A; 2F2V A; 2RQR A; 2KE9 A; 2K2M A; 1X6B A; 1EFN A; 2ED0 A; 2FPD A; 3NMZ C; 2OAW A; 2DBK A; 2GTJ A; 2RQW A; 2G6F X; 1T0H A; 1UTI A; 2J6K A; 4Z8A A; 4Y92 A; 4LE9 A; 2AKK A; 2LCS A; 1OPK A; 2L3Q A; 2DBM A; 1M3C A; 4A63 B; 2YUO A; 1WLP B; 2A28 A; 2RQU A; 3NGP A; 3EG0 A; 2H8H A; 4OMP A; 2O9V A; 1M30 A; 2AZV A; 2DNU A; 2M0Y A; 2DLP A; 2EYZ A; 1K4U S; 4RTY A; 1SEM A; 4X1V A; 4F16 A; 2GQI A; 2GBQ A; 2F2X A; 4IIM A; 1WX6 A; 3H0H A; 2RQV A; 1WXB A; 2L3S A; 2DJQ A; 1GFD A; 2V1R A; 2DL8 A; 2YUN A; 3TSW A; 2RQT A; 3M0U A; 3U23 A; 2DIL A; 2JW4 A; 2LQN A; 2IIM A; 1OEB A; 2ED1 A; 1QCF A; 1JEG A; 1B07 A; 2K7A A; 3EG3 A; 2GGR A; 3SHW A; 4OML A; 1AWW A; 1UG1 A; 2HCK A; 4OMM A; 2YSQ A; 3REB B; 5FWC A; 3TSZ A; 5GJV B; 2FO0 A; 2B86 A; 1NYG A; 3I5R A; 1AZE A; 1VYU A; 4J9C A; 1WDX A; 1IO6 A; 1ABO A; 2PTK A; 1PRL C; 1ABQ A; 1U06 A; 1J3T A; 4KRT A; 2KT1 A; 4JPB W; 2P4R A; 3EHQ A; 4D8D A; 1NEG A; 5HCK A; 2LQW A; 2KT8 A; 4GBQ A; 1MUZ A; 2J05 A; 2MIO A; 2O2O A; 4CC3 A; 2YUP A; 1E7O A; 2KRS A; 1UHC A; 2CSI A; 1PWT A; 2JT4 A; 2J06 A; 4RTU A; 3VRY A; 1M3A A; 1RLP C; 1LCK A; 2HBW A; 1I1J A; 4HVW A; 4IIO A; 1T0J A; 2RNA A; 1TUD A; 2A08 A; 2DL7 A; 3M0S A; 1QKW A; 1GFC A; 1SRM A; 1HJD A; 2O31 A; 3QWY A; 1K76 A; 1MV0 B; 2KNB B; 1K0X A; 1WA7 A; 4LUD A; 1YP5 A; 4EIK A; 2YT6 A; 3I9Q A; 2KYB A; 2SRC A; 1X2Q A; 2O9S A; 4ORZ A; 1YCS B; 2L2P A; 5IXB A; 1HD3 A; 1KJW A; 4LUE A; 1NG2 A; 2OJ2 A; 2GTO A; 2K79 A; 5IHI A; 1VYT A; 2EYX A; 1JXM A; 3TVT A; 1AVZ C; 3PVL A; 1UFF A; 1RLQ C; 4GLM A; 3THK A; 4ZNX A; 1KSW A; 3VS0 A; 2J7I A; 3UAT A; 2EGC A; 2PNI A; 4AG2 C; 1KFZ A; 3EHR A; 4JZ3 A; 1PNJ A; 3I35 A; 2RMO A; 1UDL A; 3NPF A; 2AK5 A; 1M3B A; 1NEB A; 1PHT A; 2EBP A; 3FJ5 A; 1QWE A; 2D0N A; 4Z89 A; 1YWO A; 1TG0 A; 1MV3 A; 2KEA A; 2CUD A; 2O88 A; 2DM1 A; 2HDA A; 1M27 C; 1QLY A; 1U5S A; 2LJ0 A; 2LX7 A; 5FWB A; 2BZY A; 3R6N A; 4AFQ C; 3RBB B; 3O5Z A; 2KYM A; 1ZX6 A; 2W0Z A; 1T3S A; 2C0O A; 2CH4 A; 1QKX A; 1VYV A; 3ZL7 C; 1GCQ C; 5I22 A; 3NHN A; 2C0I A; 1GL5 A; 3QWX X; 1YNZ A; 1ZSG A; 5I11 A; 2BTT A; 1OV3 A; 3VS1 A; 4FSS A; 4AFZ C; 2MOX A; 4AG1 C; 4R0K A; 4OMN A; 3H0I A; 1BU1 A; 2FG0 A; 3VS3 A; 4OMO A; 2CT3 A; 1FYN A; 1OOT A; 1G2B A; 1SSH A; 2A36 A; 3LH5 A; 1W6X A; 2DL4 A; 2EQI A; 4J9E A; 2KRM A; 2X3X D; 4HXJ A; 2EPD A; 4RUG A; 4JZ4 A; 3VS6 A; 1OPL A; 4DEY A; 2I0N A; 2QDL A; 3CQT A; 1T3L A; 1Y57 A; 2NUZ A; 1ZUU A; 3M0P A; 1E6H A; 1GBQ A; 1N5Z A; 2KRN A; 2EYW A; 2DX1 A; 2MCN A; 1NLO C; 4F14 A; 2JM9 A; 1H8K A; 1K9A A; 2KBT A; 4J9F A; 2PZ1 A; 2RPN A; 2CDT A; 1PRM C; 3H41 A; 2DVJ A; 4M4Z A; 1CSK A; 2K3B A; 2DE0 X; 1V1C A; 1JU5 C; 1U3O A; 2DL3 A; 2EW3 A; 2YUQ A; 1WXU A; 2DA9 A; 1SPK A; 2J6F A; 2SEM A; 1FMK A; 2LMJ A; 2YDL A; 2ROT A; 4Z88 A; 1YWP A; 4CC7 A; 2KGT A; 3KFV A; 4LNP A; 3REA B; 2ABL A; 2DF6 A; 2XMF A; 1X43 A; 4OMQ A; 3VS2 A; 2ROL A; 2BZX A; 4CC4 B; 1AD5 A; 1UJ0 A; 1W70 A; 2JS0 A; 1AOJ A; 5L23 A; 4ESR A; 1WXT A; 4HVV A; 4QT7 A; 5ECA A; 3ULR B; 1NLP C; 4HVU A; 2KR3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FYW B; 1JBM A; 4QVC A; 3CCL Q; 2E70 A; 3M56 A; 1JO8 A; 1R0C B; 4J9I A; 4EMG A; 5GAM d; 2EKH A; 1RUW A; 4HCK A; 1AZG B; 3VS4 A; 4J7F A; 4BB7 A; 3I55 A; 1M2O A; 2YRC A; 3LWH A; 1UGV A; 3R6O A; 1UUE A; 5CIU A; 1S72 T; 2ECZ A; 4OP0 A; 4PK4 A; 1VUB A; 1VQM Q; 4LDW A; 2DYB A; 4M78 D; 4KBM B; 1OZ3 A; 3OYM A; 1Q82 R; 1GBR A; 1G83 A; 4E7J A; 1AWJ A; 1BK2 A; 1QVF A; 3EH1 A; 4DBH A; 2JXB A; 2ZPH B; 1HSQ A; 4OVA A; 1VQ8 T; 1MNE A; 1WI7 A; 1Y07 A; 5CKE A; 4XTU A; 3DKM A; 3CCQ T; 4ZGJ B; 2V1Q A; 4C92 G; 2CRE A; 1H92 A; 2DXB A; 2VKN A; 3X24 B; 3CPF A; 5C6S A; 2EYQ A; 3L2W A; 2GNC A; 1UHF A; 3VU3 C; 5GAM h; 2D8J A; 1BIA A; 3G71 Q; 4M78 B; 4E47 A; 1ZSZ B; 2CS7 A; 5EC7 A; 1JRI A; 4E7S A; 2MAM A; 1IHW A; 4YTL A; 3X20 B; 3H0F A; 4PFO A; 1XOV A; 4PJM A; 2K9G A; 2FRW A; 3MEU A; 4BUG A; 2NLU A; 1IRE B; 1X75 C; 3QJ6 A; 3CC7 T; 3UA7 A; 4PLI A; 2HQE A; 1RI9 A; 1X69 A; 2LX9 A; 1WPY A; 1VIE A; 3UF4 A; 4CRI A; 5LJ5 j; 4NL2 A; 5D6Y A; 4J83 A; 5GAO p; 4XU1 A; 5KYN A; 2DD4 A; 1G3S A; 4DEX A; 3S3O A; 2V8J A; 1VIF A; 2K6D A; 3VYG A; 2A3L A; 3V7R A; 1VQ5 A; 1JQQ A; 2DMO A; 2JM8 A; 3H9N A; 4C0D C; 4RTV A; 1NE8 A; 3M54 A; 2KXC A; 1B3Q A; 4TVR A; 4BE1 A; 2DFU A; 3PNW C; 4KGX B; 1ZUK A; 4CC2 A; 3CCL T; 4ZGE B; 4DBR A; 1MND A; 2EQJ A; 2KE9 A; 4BE0 A; 4C8Q G; 1NJI C; 2COW A; 3NMZ C; 4PJO G; 3CBM A; 2XD0 A; 3CMA A; 2RQW A; 2G6F X; 1K8A C; 3GNF B; 3FC3 A; 3SDZ A; 3CPW P; 4Z8A A; 4KUL A; 1OPK A; 4HT9 A; 2DBM A; 5J26 A; 2BE9 B; 2COZ A; 3LLR A; 3RMQ A; 4IUR A; 5A2Q E; 3OW2 P; 4PJO E; 1DJ7 B; 4N0A C; 4CI0 C; 4HKE A; 3OYJ A; 2X4X A; 1TTH B; 2E65 A; 3CXC S; 2OAU A; 3M4Y A; 1FMW A; 3X26 B; 1K4U S; 4F16 A; 4IIM A; 1WHH A; 1NBE B; 3CPW S; 2RQV A; 4BDY A; 3TSW A; 3U23 A; 3P8B B; 3QPH A; 2OTJ Q; 2ED1 A; 1F1B B; 1QCF A; 3UDC A; 5GAN 8; 1JEG A; 3L2U A; 2PVG B; 3JCM d; 1RAH B; 3EG3 A; 3SHW A; 2QAZ A; 4A4E A; 2QXF A; 3G71 T; 3EG9 B; 1MHN A; 3REB B; 3TSZ A; 1U1S A; 3M9Q A; 3PIO A; 3LGL A; 1QCN A; 3E9F A; 2QQA A; 2B86 A; 5KYY A; 2QEX Q; 3RDV A; 2CYZ B; 3EGX A; 4N0A A; 3GPL A; 3PIP A; 2DIQ A; 5DM7 R; 5GAN j; 3RKW A; 4EMK B; 1YJW Q; 2EAY A; 2KT8 A; 2LT4 A; 2MIO A; 2O2O A; 2K2V A; 1E7O A; 1UHC A; 2CSI A; 3LGF A; 1VQ7 A; 3INZ A; 3UWN A; 2GFU A; 3OMC A; 4Y91 A; 2CZ6 B; 2DKG A; 2QQ9 A; 3VRY A; 1M3A A; 2RHX A; 1RLP C; 2HBW A; 1T0J A; 1N9R A; 1SSF A; 4BE2 A; 2JN0 A; 3JB9 G; 3CPW A; 3OYN A; 2LTO A; 4NS5 A; 1G3Y A; 3QDR B; 3QWY A; 3N5B B; 4O5V A; 2KNB B; 1WA7 A; 4LUD A; 4EIK A; 3JCM h; 2HL3 A; 2YT6 A; 3OW2 A; 4FT4 A; 1PSE A; 1UEB A; 1RL2 A; 1NJI U; 2L2P A; 4FYX B; 5IXB A; 3MHX A; 3PT9 A; 1H64 1; 1NG2 A; 4C0Z A; 5LJ5 g; 1K8A U; 2E5Q A; 2QQB A; 3FJP A; 4E2F B; 1P92 A; 1RLQ C; 4GLM A; 4E7Z A; 3G7Z A; 2LDM A; 1S72 A; 4QW2 A; 3EHR A; 4JZ3 A; 2AT1 B; 4MDX A; 3I35 A; 1D3B A; 1BI3 A; 2RMO A; 5GAN 7; 1I5O B; 1M3B A; 3DB4 A; 1NEB A; 4QVD A; 2RJF A; 1QWE A; 1YWO A; 3GIB A; 1VQ6 Q; 5FRN A; 5KE2 A; 1MV3 A; 2KEA A; 1VQ9 A; 2PU9 B; 5GMK j; 1K73 C; 3HSB A; 3QJY A; 4FL6 A; 5LJ3 d; 2IVW A; 3C4S A; 2QDY B; 1VQ4 Q; 2H3J A; 1LOJ A; 3BW1 A; 1VQ8 A; 2JOY A; 2K4Y A; 2BKD N; 2BZY A; 4AFQ C; 2K57 A; 4ATO A; 3CCQ A; 2C0O A; 2CH4 A; 2V8I A; 1VYV A; 4OB3 B; 5I22 A; 4BY6 C; 4JS4 A; 2RHZ A; 3MCA B; 2BTT A; 4F7U F; 2OTJ T; 4AG1 C; 4R0K A; 1RAI B; 4OMN A; 3QHS A; 1G5V A; 3NTK A; 1BU1 A; 4XU0 A; 1QVG P; 5D6X A; 2DL4 A; 2QEX T; 1YIT Q; 1AHJ B; 4HXJ A; 1U1T A; 3NFC A; 4O6J A; 2QDL A; 3TCJ A; 4RKU E; 3CC7 A; 5GMK l; 1E6H A; 3P8D A; 4XU3 A; 1YJW T; 3V8L A; 2DX1 A; 1C1A A; 1NLO C; 2KVQ G; 3CCS Q; 5GMK e; 4V2S A; 5LJ3 h; 4FU6 A; 2DYI A; 2PZ1 A; 4DBF A; 3EFR A; 3H41 A; 2DVJ A; 1CSK A; 2X35 A; 2YRD A; 2P4T A; 1WXU A; 2DA9 A; 1SPK A; 2YDL A; 5A0L A; 4JLI A; 3JRZ A; 5GAN g; 2JTF A; 3KFV A; 4LNP A; 3VS2 A; 4BI4 A; 3OYE A; 7AT1 B; 2OTL Q; 4BAC A; 2BZX A; 4KH1 B; 1AD5 A; 1W70 A; 2EQU A; 2PVD B; 3HRT A; 2PUO B; 2VUB A; 3AHU A; 4HVU A; 3CCL A; 1EIF A; 3V8J A; 2CUB A; 2LJ3 A; 2O01 E; 2FRY A; 2KMT A; 2RF0 A; 4J9D A; 4M78 G; 2F2W A; 3OYY A; 3TEE A; 1TUG B; 2E10 A; 2F5K A; 4PJJ A; 1K73 U; 2AKL A; 2AIR B; 2D6F A; 1LPL A; 4A4F A; 9ATC B; 3ZFJ A; 3H8Z A; 3CC4 Q; 2QAS A; 2NUT A; 3VYH B; 1OZ2 A; 1PKS A; 3HL8 A; 5KYU A; 1ZBJ A; 3V7S A; 4D8K A; 1QVG A; 3C0C A; 3CD6 Q; 2J6O A; 2YRV A; 4J9H A; 1VOM A; 1VQ6 T; 2X51 A; 2R57 A; 2E6Z A; 2X4W A; 4J9B A; 1JXO A; 2A37 A; 2C0T A; 1TUC A; 5LJ5 f; 2RI5 A; 1X6O A; 3CCU A; 2DEU A; 3QYG B; 4C92 C; 2QTV A; 2WSC E; 2HD0 A; 1M8M A; 2CSQ A; 4MML A; 1B34 A; 1MMD A; 3O8V A; 2KRO A; 4XK8 E; 4BDZ A; 5AYF A; 2LNH B; 2L0A A; 2FZG B; 3GBQ A; 3E1S A; 3EFO A; 2RHI A; 3WVE B; 5I2M A; 3RKY A; 1M1F A; 2FB7 A; 4WCI A; 1YFN A; 2NUP A; 1K1Z A; 4M7A F; 3MJX A; 4C0D B; 3IQL A; 2JMC A; 1PSF A; 4HT8 A; 1Y96 A; 2XDD A; 1S1N A; 3I5S A; 1V76 A; 4F17 A; 1VQK Q; 4J9G A; 2VV5 A; 1YIT T; 3A8H B; 3EGD A; 5HK0 A; 3QXE B; 1GCP A; 3V8K A; 2Z0W A; 1NYF A; 4DOW A; 1M1G A; 1R8O B; 1KQS P; 3CCS T; 2CGH A; 2JTE A; 3M59 A; 3V7C A; 3G4S Q; 1TSF A; 4A4G A; 1I07 A; 4GY5 A; 1UE9 A; 1Z9Q A; 1ZLM A; 3LH0 A; 2CKK A; 5KYY B; 1QWF A; 4E6R A; 2DL5 A; 3EGX B; 4PFP A; 3A8G B; 1VA7 A; 1G8X A; 2ZPF B; 3CBO A; 1JJ2 S; 2LCC A; 2OTL T; 1X2K A; 4M7D C; 1OX9 A; 3JV3 A; 1K0S A; 2JVV A; 2XK0 A; 1VQP A; 4RTW A; 3S3N A; 2DRK A; 2LZ6 B; 1XJW B; 2RI2 A; 3RNJ A; 3VRZ A; 2F2V A; 3HTR A; 3M57 A; 2K2M A; 4J6Y A; 2OAW A; 2CP6 A; 5GAN f; 5CKB A; 6AT1 B; 3CC4 T; 4A54 A; 4LE9 A; 5GAM j; 2XKO C; 1M3C A; 4A63 B; 4XTW A; 3CCE Q; 3EG0 A; 3E9G A; 4OMP A; 2DTO A; 1M30 A; 1I5L A; 1BI1 A; 4R55 A; 1XQH A; 3CCJ Q; 2DLP A; 3G1J A; 4ANJ A; 2EYZ A; 3ER0 A; 1SEM A; 1JJ2 A; 2GQI A; 1WX6 A; 2GCX A; 2DJQ A; 1GFD A; 1KQS A; 4FSX A; 2DL8 A; 2OTJ A; 2YUN A; 3QUI A; 1D3B B; 3M0U A; 2DXC A; 2JW4 A; 2LQN A; 1IGU A; 4DBQ A; 3HFN A; 2LCL A; 3OYD A; 1TU0 B; 1N9S A; 1B07 A; 2GGR A; 2RK2 A; 1N8R R; 2MYS A; 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