The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
80
|
structure length |
80
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Chain Sequence |
GNGSTITFDELQGLVNSTVTQAILFGVRSGAAALTLIVVWITSRSRKTPIFIINQVSLFLIILHSALYFKYLLSNYSSVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
|
| molecule keywords |
Pheromone alpha factor receptor
|
| publication title |
Structure of a double transmembrane fragment of a G-protein-coupled receptor in micelles.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
24
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pheromone alpha factor receptor. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K9P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4UV8 A; 4DR6 B; 1AJN A; 4J7J A; 4DW1 A; 1MZE A; 2WLK A; 4DO2 A; 4UCV A; 4UCR A; 4O4I B; 2FKX A; 5F2V O; 4G28 B; 4TUY B; 1F4N A; 2CTW A; 2HG5 C; 4I5S A; 1EFR G; 2QR4 A; 3OD4 A; 4LNU A; 3D3Q A; 5C8Y A; 3L70 H; 4TV9 A; 3AG2 C; 3FAV B; 2KG7 B; 3T1H B; 1G1X B; 2IW5 A; 4NTX A; 2PYL A; 2OIG A; 2XOK G; 1TA8 A; 2WWW A; 2E3C A; 4DYL A; 4PDL A; 2L35 A; 5L3D A; 1Q82 W; 2X7R B; 3OAA G; 2ZXW C; 3K06 A; 5CBH A; 3K5O A; 1WJZ A; 3K79 A; 4JTA B; 5B1A C; 4F6R B; 2ZE7 A; 3VQW A; 2YIB A; 1CP9 A; 2Q68 A; 3CPW U; 1JX9 A; 2CTP A; 2R9A A; 1VQ5 V; 5KHJ A; 4Q6G A; 4LF6 O; 3DXR B; 4X1I B; 3S3W A; 3AEI A; 4DR7 B; 2XAF A; 1HNX B; 5EYP A; 1IBL O; 2R9R B; 1WA8 B; 1Z2G A; 5AG2 A; 3LNM B; 3EXA A; 3HKB A; 3H9V A; 2AW9 A; 1AI7 A; 3HKC B; 5BR8 B; 4NYK A; 1XIL A; 2GUZ A; 3P3N A; 2Z3Y A; 1Y74 B; 4TT3 G; 3JAS A; 2EIL B; 4FK5 C; 4R50 A; 1G6U A; 5L3F A; 4LF5 O; 3SYQ A; 1I7F A; 3D8C A; 3RYH B; 4FZ0 A; 5IDJ A; 1S0V A; 3FB8 C; 4DV5 O; 2HHH O; 3MDS A; 5CA0 A; 1KP3 A; 2WLM A; 1F4M A; 1SZT A; 2ZDI A; 3BEH A; 3FB6 C; 5K1P A; 3GWK C; 4AIL C; 1S76 D; 4LFB B; 3E2E A; 1XEQ A; 1S77 D; 4YJ2 B; 3G67 A; 2OCH A; 4DR3 O; 2ZIN A; 1L0N H; 4IGG A; 1M93 A; 1NU1 H; 1WNS A; 4G2K A; 4ZHQ A; 3K59 A; 4TV9 B; 1VQ6 V; 2EIL C; 3N2K A; 4YY3 B; 5B1N A; 1OCR B; 1E1Q G; 2LO1 A; 1YIJ V; 1THZ A; 5JVD A; 3APO A; 3SPC A; 3UQ8 A; 4CC6 A; 2DMX A; 3A0R A; 3HKD A; 3CCQ V; 1R3J C; 1OJH A; 5KHI A; 3A2F A; 1TGO A; 4MVR A; 1JFF A; 1V9P A; 4DV3 B; 2JIZ G; 1VF6 C; 4UCT A; 3IJ4 A; 4DV6 O; 3ZX6 A; 1BMF G; 4DV4 B; 2Q7G A; 4EB6 A; 5D5Q A; 1PKX A; 1W2B U; 3O65 A; 2DQ0 A; 3A8T A; 2RNB A; 5EYP B; 1G4Y B; 1HR0 B; 5EBL C; 3CRA A; 2YIA A; 4MW3 A; 2C2A A; 5DN6 G; 2PUS A; 3IC7 A; 3HKB B; 3KCY A; 5KA6 A; 4YHH B; 2V7Q G; 3ZIA G; 4GKJ O; 4NTY A; 2QKS A; 2GUZ B; 4E4E A; 1OCR C; 4DR2 O; 3JAS B; 2YIC A; 1FFX A; 1PNM A; 4JZG A; 4B3T O; 4J41 A; 3L72 H; 4JPR A; 3UM7 A; 2A9H A; 3AK1 A; 1X59 A; 2DOS A; 4CH5 A; 3D36 A; 4W4L A; 1H2S B; 2VQF B; 4OX9 O; 5EBW C; 5J2U A; 1K7D A; 2B9Z A; 1Y66 A; 2UXB O; 4CH3 A; 4J80 A; 2FB5 A; 3JCU Z; 2JVD A; 4KFM A; 5KHH A; 4LP8 A; 1TVK B; 4KHP O; 1QBZ A; 3AK2 A; 4JI3 B; 4QJF B; 1FS0 G; 1BHA A; 2P22 C; 3H1H H; 1JA8 A; 3RW0 A; 4EFB A; 1K9M W; 5KX5 A; 4ZHQ B; 4MVQ A; 3LSS A; 1EBO A; 3ML0 A; 4B7E A; 1H38 A; 5JCO A; 4LC1 A; 5JVD B; 2X6C A; 2F4V B; 1YJN V; 1X4T A; 1KBH A; 2OYQ A; 3HKD B; 4IIJ A; 4LBE C; 5HFM A; 4LF4 O; 3S3X A; 1VQO V; 5FL7 G; 1JFF B; 1YF2 A; 1WLE A; 4JAS A; 1NH2 B; 3RGB A; 2BOB C; 1GN3 A; 2F23 A; 1Q7Y W; 4LFA B; 4EB6 B; 1Y67 A; 2CK3 G; 5B1O A; 3ZS8 C; 3SPJ A; 2HVK C; 1W0J G; 2YID A; 3RT3 C; 1SQQ H; 1Q5O A; 3JAT A; 1M5I A; 1GAX A; 1Z5W A; 2LGQ A; 4QGP A; 2JGD B; 4JI0 B; 4JGS A; 1XNQ O; 1AR4 A; 2IJK A; 3OEE G; 4JYA B; 4DV1 O; 4G27 B; 3A0H Z; 2WLN A; 2QDO A; 2QKA A; 1FFX B; 3SJC C; 5HFL A; 2Z0A A; 1H2N A; 3FYI B; 2DYS B; 5KMG A; 2OTL V; 3G4S V; 3RYC A; 3BHP A; 1VF7 A; 3B40 A; 1W59 A; 5D5P A; 1I0H A; 5J2T A; 1XUQ A; 4GT1 A; 5J2U B; 2Q73 A; 5KHG A; 2HP8 A; 4XDL A; 4FLV A; 2B1I A; 3LDC A; 4E2L A; 4WFF A; 1ARO P; 1IVS A; 2ZR2 A; 5CA1 A; 4DXW A; 2MW2 B; 1HNZ B; 1SER A; 4DR4 O; 3CCV V; 1VP7 A; 3CE2 A; 5CBG A; 4JI7 O; 1M57 B; 3TGU H; 2XTA A; 2WA3 A; 1J95 A; 5KX5 B; 5KA5 A; 1Q6I A; 2ZCE A; 2YUA A; 1N32 B; 5LP6 A; 3UKM A; 2HJF C; 2EIK B; 4FFK A; 3X2Q C; 4WCE V; 1H2M A; 4JI1 O; 4K8X A; 1P49 A; 1CEZ A; 2DYS C; 2UXD O; 2OCC B; 4JYB A; 2QM7 A; 1QR9 A; 5BY1 A; 5IY5 B; 4HZ3 A; 2EIJ B; 4IIJ B; 3CSX A; 5CN0 A; 2UUA O; 1VF5 B; 2PGG A; 3OEH G; 4KL1 A; 4R8C A; 3VQX A; 1EN5 A; 1US6 A; 3RFR A; 1BQ0 A; 1SZX A; 2DWD C; 2WLL A; 1HDJ A; 3TJT A; 1FFT B; 1OCZ B; 4RWU A; 4O4J A; 3F5T A; 1M57 C; 1K97 A; 3CC2 V; 1PPJ H; 2Q7E A; 3JD4 A; 3SYA A; 3BFR A; 4PJ0 Z; 2ODM A; 4FM1 A; 1SKV A; 2IU0 A; 3L71 H; 2JDI G; 1PL4 A; 1Q6H A; 2EIK C; 3U11 A; 4X64 B; 4FLU A; 2HLD G; 3C3S A; 2OCC C; 3K5N A; 4D7S A; 2P4V A; 4TSF G; 1H2L A; 5KMG B; 3E35 A; 2AHZ A; 3CHX A; 2JJ2 G; 3AG3 B; 3RYC B; 2FL4 A; 3M8A A; 1TAE A; 1UPG A; 4TOI A; 2PY5 A; 5J2T B; 2RCV A; 3SPI A; 3JYC A; 3AG4 B; 3UO3 A; 1GN6 A; 3TXS A; 1YJ9 V; 4F4L A; 5CA1 B; 3STZ C; 1OCZ C; 3IC9 A; 4JI5 B; 4JI2 O; 4RQE A; 4DUY O; 2V1D A; 3RVY A; 3ZRX A; 4Z1M G; 4DV0 B; 4JI8 O; 3UO2 A; 1XL4 A; 4B3R B; 1QLE B; 4JI4 B; 5B3S B; 4B3S B; 4NXM B; 1K3E A; 1KP2 A; 4BIO A; 4IYI A; 3AG3 C; 5JWP A; 4JF3 A; 3E8H A; 1NR7 A; 1RM1 B; 2AZ2 A; 1XHZ A; 2F66 C; 1N33 B; 3E8B A; 4O4I A; 3AG4 C; 3CWB H; 4TUY A; 3L74 H; 4J7K A; 3CCR V; 4X20 A; 3K03 A; 2AHY A; 4UCU A; 3JAL A; 4I4T A; 1U97 A; 2DQ3 A; 3B09 A; 4J42 A; 1IBM O; 2PF4 E; 3FAV A; 2KG7 A; 4LF7 O; 1GH6 A; 2ZIO A; 3CEI A; 2R9I A; 4O4J B; 2F43 G; 4MTO A; 4PA3 A; 4GX0 A; 1FJG O; 2A0L A; 5LMN B; 4PI2 A; 2NN4 A; 4KP4 A; 3E8G A; 3AG7 A; 5EC1 C; 1QLE C; 5B3S C; 2IH1 C; 1HP8 A; 4PDV A; 5EIB D; 1RM1 C; 2KSD A; 3LDE A; 4WBN B; 1NJI W; 3Q4H A; 2YI8 A; 3OTF A; 5IYZ A; 1VQ9 V; 1WA8 A; 5LGU A; 1VQN V; 2P67 A; 3JD2 A; 1VQK V; 3RVZ A; 3E22 B; 2BSK B; 4H44 B; 5IJ0 A; 2XUM A; 1NVP B; 3G80 A; 2XAQ A; 4EKW A; 4HYO A; 2LFS A; 3FB5 C; 2CH7 A; 4ZBM A; 4FIP C; 4AQY O; 4C7U A; 1K4C C; 4XDK A; 5JJE B; 1FAF A; 4X66 B; 5LBQ A; 3IFX A; 5JH7 B; 3DC5 A; 4D7T A; 2WSS G; 3DC6 A; 3N2G A; 2ZNJ A; 2DWE C; 3ZHV A; 2UUC B; 4DR6 O; 1J5E B; 1SS3 A; 3ZRW B; 3OUS A; 3CRQ A; 3W7T A; 3G71 V; 4YJ2 A; 1N34 B; 5E1A C; 3ZHT A; 2WLI A; 4CH4 A; 1M9N A; 4X20 B; 1IBK B; 1ZL8 B; 3JAL B; 5CB4 A; 5LMU B; 3WB2 A; 3T1H O; 1Q3E A; 4I4T B; 3QF7 A; 4JI6 B; 1PNK A; 2IJI A; 3LDD A; 4UVA A; 3D3I A; 3APQ A; 2IM9 A; 3ZHU A; 4RUE A; 1BQZ A; 4WFH A; 4ABM A; 3K57 A; 2H8P C; 3QO8 A; 5L3E A; 4NB5 A; 2WPD G; 2N04 A; 2E75 B; 4DV2 O; 1VMG A; 2V4D A; 3SPH A; 2QWQ B; 4DR7 O; 1S5J A; 1VIB A; 1HNX O; 3Q4H B; 2ZKO A; 5IYZ B; 1SF9 A; 5LHH A; 4JV5 B; 5BR8 O; 3PJS K; 4CS4 A; 3JD0 A; 3EVK A; 5IJ0 B; 3AG1 B; 4DR1 B; 4CC5 A; 1XMQ B; 3DGE A; 3K9A A; 2CH7 B; 4X9Q A; 1XHX A; 2LP7 A; 1JCH A; 1BZK A; 2UUB B; 4B7K A; 3DSQ A; 3ASO B; 1NTZ H; 3MHS C; 2P7T C; 1WP8 A; 1ZX3 A; 3LSU A; 3SYO A; 3WU2 Z; 3CYO A; 5EZY A; 1QNM A; 3N2G B; 2JRI A; 1FKA O; 3SJB C; 3OR7 C; 1BL8 A; 4DK1 A; 4PEL A; 1K8A W; 1V54 B; 4LFB O; 1TVK A; 1YXB A; 4X65 O; 2N05 A; 2JS5 A; 2IH3 C; 4PD4 F; 3CRR A; 1QU7 A; 1S72 V; 3GB7 C; 1SET A; 4NKG B; 4FLZ A; 5KAI Z; 2P06 A; 2OT5 A; 2WLI B; 3U10 A; 3AG1 C; 4YY3 O; 5CB4 B; 2Y0I A; 2AGA A; 1WPB A; 3JD1 A; 3ABU A; 1EN4 A; 1P7B A; 1YZB A; 3NR7 A; 4JTD B; 3ASO C; 1GM8 A; 1H8H G; 1AIL A; 5KUK A; 1MAB G; 2HR3 A; 1NR1 A; 4LF9 B; 2FYU H; 3H1L H; 1H2G A; 3H1I H; 4A5U B; 4X1K A; 1ZWI C; 1V54 C; 3QVN A; 3E83 A; 3HKE B; 4O2A A; 1R3I C; 5TIS Z; 4GKK B; 2W0F C; 4U3J A; 1HR0 O; 5IYC O; 3CJH B; 3B4S A; 4YHH O; 3VBB A; 5JQG B; 3ZED A; 2LFR A; 4HNA A; 2JGD A; 1PP9 H; 1CPY A; 4MVS A; 2EZP A; 1F7Y A; 2QGN A; 3OFN G; 2ATK C; 4JYY A; 2DW4 A; 2WLJ A; 4DV6 B; 2CDY A; 2UU9 O; 1FXV A; 3R66 A; 2KQX A; 3OMN B; 3CME V; 2VQF O; 4Z2W A; 4UCS A; 3ETE A; 4KXR A; 1GK9 A; 3H01 A; 2LJ2 A; 5FNV B; 4NR1 A; 3T1Y B; 4MTF A; 1FYJ A; 3ZMU A; 5EZY B; 4IT5 A; 5LOV B; 4LWS A; 4FLX A; 3THO A; 4Z1V A; 1JJ2 U; 2BTO A; 4X89 A; 4YJ3 A; 1KEC A; 1N36 B; 4QPJ A; 5LGT A; 3QO7 A; 4IHJ A; 5LYJ A; 3HPL C; 1M90 W; 3CCE V; 1NTM H; 1IXM A; 2UXB B; 4I55 A; 4MVU A; 1AP5 A; 1O9G A; 3B8N A; 2P5O A; 4J9Y B; 4Q20 A; 3K04 A; 2F4V O; 1YTF D; 4RQF A; 1F23 A; 2PI4 A; 1XMO B; 2L6L A; 2ZE6 A; 2RDC A; 3ZJZ A; 4U7N A; 3K9S A; 1PD3 A; 5FLX N; 3CC7 V; 2GTS A; 1DLB A; 4PDM A; 1K5Q A; 4U7O A; 4X1K B; 4LFA O; 1VQP V; 2BTQ A; 4X1Y A; 4O2A B; 4DR5 O; 4PDR A; 2DN9 A; 2M7W A; 3E8F A; 4QE9 A; 5IWA B; 4U3J B; 4B3M B; 1WB8 A; 1WPX A; 1K33 A; 3I55 V; 3O9O A; 1KB9 F; 1GM7 A; 4JI0 O; 2A3Q A; 2DJV A; 4QIW F; 4JYA O; 4HNA B; 3QO5 A; 4MW8 A; 4LFC B; 1L0L H; 3ABL B; 2WA4 A; 1QVF U; 3X2Q B; 4K35 A; 2XAS A; 2UXX A; 1SQF A; 2GV9 A; 1P4R A; 2UXC B; 4DV7 B; 3WFV A; 1MA1 A; 3JSN A; 4DUZ B; 3ETD A; 2ZQM A; 4UVC A; 4PHZ A; 4BR6 A; 1Q90 D; 3JD3 A; 1I5Y A; 2QWP B; 1NQT A; 1N8R W; 1XNQ B; 1QHT A; 4LWS B; 5H6R A; 4I9Q A; 1HWY A; 4MTX A; 5J9P C; 4YJ3 B; 1Q6U A; 2R72 A; 4IHJ B; 5LYJ B; 1MG1 A; 4EEQ A; 1AR1 B; 2Q7H A; 4RO2 A; 5GON A; 3BRC A; 4JAV A; 5IYB O; 2DE0 X; 1Q81 W; 1SQP H; 1N32 O; 4BW5 A; 2Y4T A; 4I55 B; 3TCU A; 1N4C A; 1WP7 A; 4J9Z B; 3ABL C; 1UFI A; 1YHQ V; 1LR1 A; 4J10 A; 2ILM A; 2ZM6 B; 2A7W A; 3ABT A; 2Q6A A; 4OGQ B; 3M99 B; 1MZF A; 4JI7 B; 1I94 B; 4P9O A; 1FPO A; 4JAU A; 1M1K W; 3K0G A; 1A32 A; 2X0L A; 3GVM A; 4AHC A; 4QE7 A; 1OCC C; 2IU3 A; 4DK0 A; 3R65 A; 1KC8 W; 2BTQ B; 4X1Y B; 5EK0 A; 2ZE8 A; 3CRM A; 2Q0O C; 4JI1 B; 2QA4 V; 1BE3 H; 1Q8I A; 2X6B A; 4CZZ A; 1G8M A; 5H9C A; 2GHY A; 1K92 A; 2UUA B; 4B08 A; 3AK3 A; 4QPK A; 1EZJ A; 4EFE A; 4X64 O; 4RAI A; 5JJJ B; 4WFE A; 1S5H C; 1CXZ B; 2CTR A; 2Q69 A; 1KKC A; 3BA8 A; 3T1C A; 2LW7 A; 4N21 A; 4WBN A; 1YCI A; 2FTK A; 3RYF B; 3P3P A; 2Y4U A; 3ZBH A; 3OW2 U; 4O2B A; 4N23 A; 1KD1 W; 1SES A; 4MVZ A; 3BPZ A; 4MS2 A; 4IL6 Z; 4X88 A; 3E22 A; 2BSK A; 1VEW A; 4UB6 Z; 4JI5 O; 3ZN0 A; 1XI1 A; 4FPP A; 4U3F H; 3J80 N; 5ITZ A; 1Z5V A; 3OGI B; 5GTI Z; 3CXC U; 3ETQ A; 2JGU A; 1RPR A; 4GCZ A; 1GN4 A; 5GON B; 4DV0 O; 4ASU G; 1JQ0 A; 1SQB H; 1L1F A; 5JH7 A; 3H1K H; 4MVO A; 4JI4 O; 2YIB D; 4B3S O; 4NXM O; 3CD6 V; 2QM8 A; 1EN6 A; 4TQD A; 1K73 W; 1BHB A; 1RSO A; 2YEV B; 4L87 A; 4DW0 A; 4X62 O; 3OMI B; 3ZHQ A; 3ZRW A; 4ICG A; 2QM4 A; 4GYC B; 1N33 O; 5B1B B; 4BIU A; 2AZ0 A; 4K3A A; 2P90 A; 4PA9 A; 3JAR B; 4ZIB A; 1NZ6 A; 1JR9 A; 3WB1 A; 1GRJ A; 3ICX A; 5LHI A; 1ZL8 A; 2ZR3 A; 3I5D A; 4WFA V; 1LUW A; 3ZHS A; 4ZOL A; 1L8D A; 3OR6 C; 2RQ6 A; 4X8A A; 2GDS A; 5BZB A; 1YDX A; 3BVO A; 5LMN O; 5JJN B; 4NXN B; 3OTO B; 2GSM B; 1XNR B; 1VAR A; 2YDE A; 2ZT9 B; 3SGI A; 1Q86 W; 2E5L B; 5L3B A; 3C90 A; 2GTA A; 1D5N A; 2R70 A; 2KB1 A; 2PYJ A; 3CCL V; 1R1B A; 4DRX B; 4O4H A; 3L75 H; 5B66 Z; 2QSA A; 3FX7 A; 5B1B C; 5KUM A; 1XRE A; 1RFY A; 2WLH A; 1FJG B; 2AXT Z; 4O2B B; 1NBM G; 1SA0 A; 4P9P A; 4FLY A; 1LUV A; 2EUL A; 4YIP A; 4YIO A; 3TET A; 2QJ1 A; 1BS3 A; 1S5L Z; 1D2D A; 3K3W A; 4UCO A; 5ITZ B; 3LSQ A; 2HKO A; 5K1X A; 4MVM A; 4X66 O; 1S3J A; 1ORQ C; 2VWK A; 4I7Z B; 1QCE A; 2Y0P A; 3SJA C; 4JTC B; 2IBZ H; 4PA7 A; 3W7W A; 4CBC A; 4J7Z A; 2VQE B; 2WAM A; 3BA9 A; 5IE9 A; 2ZE5 A; 3KZI Z; 2UUC O; 4H33 A; 5GTH Z; 4WF9 V; 3T4Z A; 5IJ9 A; 3EFF K; 1J5E O; 1NH2 D; 1RSO B; 1COW G; 2HJD A; 3IAY A; 4K0K B; 3SPG A; 4JAA A; 1ZLZ A; 2E76 B; 1IUR A; 2FML A; 4I9W A; 1N34 O; 1O9H A; 1ZAU A; 2KKW A; 1IBK O; 5LA6 A; 1KU9 A; 4LF8 B; 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