The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GSLKVRALKDFWNLHDPTALNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHESQRGTDRIGYFPPGIVEVVSKR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Caskin-2
|
| publication title |
NMR solution structure of the CASKIN SH3 domain
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
9
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| structure length |
67
|
| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KBT A; 3PVL A; 1ABO A; 1AEY A; 4JZ4 A; 5FWB A; 2DIL A; 2YDL A; 3REB B; 5L23 A; 2F2X A; 2D8H A; 2LZ6 B; 4JPB W; 2L3P A; 1UHC A; 2DL4 A; 1AD5 A; 4OMQ A; 1GL5 A; 2CT3 A; 3NPF A; 2K6D A; 4A63 B; 1HJD A; 1WFW A; 3M0S A; 1PKS A; 2K2M A; 1UGV A; 1BU1 A; 1X27 A; 1WXB A; 3NMZ C; 2ROT A; 4J9C A; 1WI7 A; 1GCQ A; 4LNP A; 2FO0 A; 2RF0 A; 3UA6 A; 1RUW A; 4LUD A; 1OPL A; 2EKH A; 5IHI A; 3ZL7 C; 4E6R A; 2DM1 A; 4CC2 A; 2SEM A; 2JMC A; 1JXM A; 2EPD A; 3QWX X; 3GBQ A; 2ROL A; 4ESR A; 2KEA A; 2ECZ A; 3EG3 A; 1A0N B; 1JXO A; 2GBQ A; 1Z9Q A; 1ABQ A; 2DMO A; 3VS5 A; 3LH5 A; 3H0H A; 4HVW A; 2GTJ A; 2JW4 A; 1M3B A; 2J6O A; 1K76 A; 2YSQ A; 2JS0 A; 3UAT A; 1I07 A; 4Z89 A; 1I1J A; 2A36 A; 1K0S A; 2JT4 A; 1TUC A; 2FEI A; 1UEC A; 1TG0 A; 2MCN A; 2K3B A; 5ECA A; 2ESW A; 1T3L A; 1WYX A; 2GGR A; 2BZ8 A; 2MIO A; 4JJB A; 2E5K A; 3EG0 A; 2YT6 A; 4R0K A; 2VKN A; 4OMM A; 3SHW A; 1Y57 A; 1T3S A; 2JTE A; 2L2P A; 2KRS A; 1OOT A; 2SRC A; 4F16 A; 2OJ2 A; 1U5S A; 4RTZ A; 3NGP A; 2HCK A; 4J9G A; 2EVR A; 2CUD A; 5GJW B; 1SPK A; 3O5Z A; 3ULR B; 4RTT A; 4OML A; 2EYW A; 2LJ1 A; 2CDT A; 1QLY A; 2EYZ A; 5FW9 A; 3EG2 A; 2LQW A; 3M0T A; 3H41 A; 4RTX A; 5HCK A; 1WLP B; 1UHF A; 1NEB A; 1YWP A; 4LUE A; 1MV0 B; 1NLO C; 1J3T A; 3PVQ A; 1M30 A; 2MOX A; 1PWT A; 1BK2 A; 4RTV A; 2K9G A; 4CC4 B; 5IHK A; 4HXJ A; 2ABL A; 4HVU A; 1KFZ A; 1GRI A; 4DEY A; 1X69 A; 2BZX A; 1WXU A; 4CC3 A; 3R6N A; 4EIK A; 2EW3 A; 4OMP A; 2P4R A; 2M0Y A; 4JZ3 A; 1JU5 C; 2DRK A; 3I9Q A; 1U06 A; 2JMA A; 1T0J A; 1ARK A; 1ZX6 A; 1ZLM A; 4RUG A; 2JM9 A; 2DNU A; 1EFN A; 2PNI A; 3TVT A; 1M27 C; 2O2O A; 2KNB B; 1LCK A; 2C0O A; 2RMO A; 3KFV A; 1GCP A; 1BBZ A; 2JXB A; 2RQV A; 2J6F A; 3EHR A; 2DE0 X; 4Z8A A; 2LCS A; 1E6H A; 1WDX A; 4J9H A; 3M0P A; 2O9S A; 1FMK A; 2PZ1 A; 1UE9 A; 4GLM A; 1NM7 A; 2CRE A; 3EHQ A; 1QWE A; 2A08 A; 1K1Z A; 1W70 A; 4J9F A; 2AZS A; 5IXF A; 1JO8 A; 1SSH A; 1G83 A; 2ED0 A; 2YUQ A; 2B86 A; 4AG1 C; 2PTK A; 4CC7 A; 1YWO A; 4AFQ C; 4RTU A; 1SHG A; 1WX6 A; 1X6B A; 1V1C A; 2F2W A; 1SHF A; 2KYM A; 1UJY A; 3H0I A; 1X43 A; 2JS2 A; 4IIO A; 4F17 A; 4F14 A; 2K7A A; 3VS2 A; 4ZNX A; 1M8M A; 1VA7 A; 4LE9 A; 4KRT A; 1Z9Z A; 1ZBJ A; 1AOJ A; 1AWJ A; 1UUE A; 3C0C A; 3VS6 A; 1IO6 A; 2CT4 A; 1G2B A; 1PRM C; 1UTI A; 2AK5 A; 1GBR A; 2AZV A; 2EBP A; 2A28 A; 4ORZ A; 3RNJ A; 1I0C A; 4J9B A; 2KGT A; 1VYT A; 1S1N A; 2YUO A; 2CH4 W; 1GFD A; 1UFF A; 2CH4 A; 2DL3 A; 2FG0 A; 2M51 A; 3SEM A; 1ZUU A; 2EYX A; 1NLP C; 2DA9 A; 1HSQ A; 1SEM A; 3CQT A; 2G6F X; 2JM8 A; 1WA7 A; 4OMO A; 2DVJ A; 4HVV A; 1B3Q A; 1T0H A; 2GQI A; 1SRL A; 2DX1 A; 3UA7 A; 2EYY A; 4K11 A; 1OV3 A; 2RPN A; 2BZY A; 1YCS B; 2D1X A; 1SRM A; 2FRY A; 2V1R A; 4IIM A; 1AWO A; 4QT7 A; 1GFC A; 4D8K A; 3VRY A; 2KE9 A; 4J9E A; 1PKT A; 5IHN A; 1PNJ A; 1UDL A; 4AG2 C; 1RLQ C; 4JJD A; 1WXT A; 4RTW A; 3TSW A; 2NWM A; 1GCQ C; 2IIM A; 4RTY A; 1RLP C; 2I0N A; 2J7I A; 2RQT A; 1WIE A; 4J9I A; 1QWF A; 2OAW A; 4J9D A; 1U3O A; 1RI9 A; 2KRO A; 2FPF A; 2KT1 A; 1NEG A; 2LJ0 A; 2LP5 A; 1KIK A; 1GBQ A; 1NG2 A; 1X2Q A; 2CSQ A; 1NYF A; 2RQU A; 3A98 A; 2DBM A; 1MUZ A; 1JQQ A; 1YNZ A; 2LJ3 A; 1N5Z A; 3VS1 A; 1E7O A; 3I35 A; 2C0I A; 4AFZ C; 4DEX A; 1AWW A; 1W1F A; 1AZE A; 2DF6 A; 4D8D A; 3EG1 A; 4JJC A; 2YUN A; 2QDL A; 3THK A; 2GNC A; 3VS4 A; 2FPE A; 1QKW A; 3REA B; 2DLP A; 3VS0 A; 5GJV B; 1ZSG A; 2CSI A; 1M3A A; 3VRZ A; 5I11 A; 5FWC A; 2O31 A; 2RQR A; 1QCF A; 2HEQ A; 2F2V A; 4LN2 A; 1K4U S; 2HBW A; 2W0Z A; 1YN8 A; 2HDA A; 2J05 A; 1KSW A; 2ENM A; 4M4Z A; 2V1Q A; 4WCI A; 2AKK A; 2YUP A; 1HD3 A; 1CSK A; 2LQN A; 2DYB A; 1CKA A; 2BTT A; 1UJ0 A; 1VYV A; 4OMN A; 2KRN A; 3IQL A; 3M0Q A; 1Y0M A; 1VYU A; 2J06 A; 2VVK A; 3QWY A; 1H92 A; 2X3X D; 2XMF A; 1CKB A; 2OI3 A; 2VWF A; 2W10 A; 2D0N A; 1AWX A; 2RNA A; 3M0U A; 1K0X A; 2DBK A; 1B07 A; 3M0R A; 1W6X A; 3U23 A; 1X2K A; 1BB9 A; 4Z88 A; 3H0F A; 5IXB A; 2KXD A; 1YP5 A; 2C0T A; 2GTO A; 4X1V A; 2O9V A; 2LMJ A; 4AFS C; 1TUD A; 2HSP A; 2DJQ A; 1X6G A; 2DRM A; 2FPD A; 2EGC A; 2O88 A; 1E6G A; 2L3S A; 2FRW A; 1PRL C; 5IH2 A; 3NHN A; 4GBQ A; 2D8J A; 2EQI A; 1ZUY A; 3TSZ A; 2X3W D; 3I5S A; 3EGU A; 2KYB A; 1JEG A; 1NYG A; 2H8H A; 5EC7 A; 2KXC A; 1QKX A; 1OEB A; 4FSS A; 2KR3 A; 1OPK A; 2A37 A; 1ZUK A; 2RQW A; 2EGE A; 3FJ5 A; 3JV3 A; 4AFU C; 1FYN A; 5I22 A; 1UG1 A; 2AKL A; 2ED1 A; 2NUZ A; 4Y92 A; 1AZG B; 3I5R A; 1PHT A; 3UF4 A; 3PE0 A; 2J6K A; 1XOV A; 3VS7 A; 1K9A A; 2DL5 A; 1M3C A; 2LNH B; 2EGA A; 2L3Q A; 1H3H A; 1MV3 A; 2KRM A; 2RN8 A; 1H8K A; 1KJW A; 2CUB A; 2DL7 A; 2K79 A; 2LX7 A; 4HCK A; 2KT8 A; 3RBB B; 2L0A A; 2DL8 A; 1AVZ C; 3VS3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 6AT1 B; 2KBT A; 1YIJ T; 1AEY A; 4JZ4 A; 3CXC A; 3REB B; 4E47 A; 3UDC A; 2F2X A; 2L3P A; 3OYA A; 4M77 C; 1VQ9 Q; 4OMQ A; 2QAS A; 1VQN A; 3NPF A; 2PU9 B; 3JCM W; 1PKS A; 2M9U A; 3L2V A; 1M1K R; 5KYU B; 1SSF A; 2KMT A; 2ROT A; 2QA4 A; 1PD0 A; 5GAN d; 2MF2 A; 3M57 A; 3CCS Q; 1YHQ T; 1NPR A; 3CCL A; 3TCJ A; 1RAI B; 3UA6 A; 1RUW A; 4N0A A; 1IRX A; 3MEA A; 3MP6 A; 3S6W A; 3INZ A; 1VQP Q; 1YJ9 T; 1MNE A; 2DM1 A; 4CC2 A; 4J83 A; 1JXM A; 1OI1 A; 2FZK B; 3LGL A; 1M2V B; 4J7I A; 2XK0 A; 1QVG S; 2KEA A; 5GAM h; 1I8F A; 2E4H A; 5KYU A; 1D1C A; 2EWN A; 1Z9Q A; 1ABQ A; 2LNV A; 2GTJ A; 3FRN A; 1M3B A; 1TS9 A; 2J6O A; 1K76 A; 5GAO m; 3QJY A; 3OS0 A; 4B6M A; 1I07 A; 4Z89 A; 1I1J A; 2RHU A; 4GLK A; 2KQW A; 1N6A A; 3S3M A; 5FU7 C; 2K3B A; 4C5G A; 5ECA A; 5C0M A; 3I55 T; 2VV5 A; 1M2V A; 2QI2 A; 1SG5 A; 4DOW A; 3EFR A; 3E19 A; 3CMA T; 3OQ5 A; 1PM3 A; 4R0K A; 5HKC A; 3SHW A; 4ANJ A; 1Y57 A; 1XJW B; 1T3S A; 2OJ2 A; 3NGP A; 2RM4 A; 1SPK A; 3ULR B; 3GOX A; 4OML A; 2LJ1 A; 1QLY A; 5GAN 8; 3EG2 A; 1O75 A; 2V8I A; 3H41 A; 1KHI A; 4UC4 A; 4WTO B; 1MMG A; 1OZ3 A; 4M75 E; 4M7D G; 3PVQ A; 5GAN 2; 2MOX A; 1PWT A; 3HPW A; 3VYH B; 1VQ5 T; 3OYJ A; 3MP1 A; 1ZA2 B; 2DVE A; 2D6F A; 3CC4 Q; 3CCE A; 4PJN A; 2DXU A; 3R6N A; 4EIK A; 2MK5 A; 4M78 G; 2M0Y A; 2DD5 A; 4JZ3 A; 4FW2 A; 5A0G A; 4JRP A; 1U06 A; 3OYI A; 2X35 A; 3UPU A; 1YJW Q; 3JB9 G; 2ZPH B; 2DNU A; 1EFN A; 1Q82 R; 2KNB B; 2A0F B; 5GAN h; 2VB6 A; 3GLX A; 5J26 A; 2RQV A; 1ZQ1 A; 4ATO A; 2ZGW A; 3LWH A; 2DE0 X; 1NE8 A; 2LCS A; 4J9H A; 4M75 C; 4QVZ A; 1PSE A; 2COW A; 1Q7Y U; 2O9S A; 1FMK A; 1FXX A; 2L8D A; 5LJ5 j; 1D3B B; 1XQH A; 2CRE A; 1JJ2 P; 2OTJ Q; 1QVF A; 2HZY A; 2AZS A; 1JO8 A; 1K8A U; 2AT1 B; 2ZPB B; 1BCM A; 1G83 A; 4L5G A; 4RCB A; 4M77 D; 2B86 A; 3RES A; 2RB6 A; 4AG1 C; 9ATC B; 4O5V A; 1VQO A; 1YWO A; 4XTV A; 4AFQ C; 4J6Y A; 3PTA A; 2H3J A; 2F2W A; 5LL6 S; 4GY5 A; 3EG9 B; 3OS2 A; 8ATC B; 1VQ7 A; 5LJ3 e; 4MDX A; 4F14 A; 1D3B A; 1QW1 A; 5GMK e; 4LE9 A; 3I56 T; 5FRO A; 1M5Q 1; 2LCC A; 4KRT A; 3LX7 A; 2IPO B; 1UUE A; 5LJ3 g; 3VS6 A; 2WSE E; 1PRM C; 1UTI A; 2DD4 A; 1GBR A; 4ORZ A; 3QSU A; 3RNJ A; 2KGT A; 1S1N A; 2D9T A; 3EG9 A; 2YUO A; 5CKF A; 2CH4 W; 3DB4 A; 2DYI A; 1WHL A; 2BIV A; 5CCA A; 2CH4 A; 3JCM d; 1Q95 G; 3CPF A; 1VQL Q; 1G8X A; 1NLP C; 1WA7 A; 3HKS A; 4TVR A; 3OW2 S; 2CGH A; 4BE0 A; 4K11 A; 3OYN A; 1KD1 U; 2D1X A; 2FRY A; 5C6S A; 2F5K A; 2YRC A; 1AWO A; 4KT0 E; 2X4J A; 5IAY A; 2QQA A; 1M90 R; 3L2R A; 2QQ9 A; 4AG2 C; 2LRQ A; 1WXT A; 1YIJ Q; 3BE3 A; 2HQH A; 4LDW A; 4M7A D; 3L2W A; 5LJ5 d; 4CRI A; 1QWF A; 4C8Q F; 2DAQ A; 4J9D A; 1O9S A; 2OTL A; 1U3O A; 2KRO A; 2M16 A; 4QVD A; 2KT1 A; 3G6E A; 3H8Z A; 1NG2 A; 4PL6 A; 3CCU T; 5GMK l; 4C92 F; 5CK9 A; 1WZO A; 4XU1 A; 4IKF A; 1JQQ A; 1D1B A; 2LJ3 A; 4OGC A; 1ZSZ B; 2C0I A; 4DEX A; 3C95 A; 1PD1 A; 3CCJ T; 1YHQ Q; 2MWP A; 3THK A; 3KUF A; 3DKM A; 3LWI A; 1N8R R; 2DLP A; 3VS0 A; 1YIT T; 2CSI A; 4P5N A; 1YJ9 Q; 4QKU A; 2VAS A; 5KH6 A; 2RQR A; 5GAO l; 1QP2 A; 2DZC A; 3RKW A; 2QTV A; 2HEQ A; 4M75 B; 4LN2 A; 1K4U S; 4QQG A; 1M2O A; 2QQR A; 2ENM A; 4M4Z A; 1RAE B; 2AKK A; 2R57 A; 1HD3 A; 2VUB A; 1ZSZ A; 1CKA A; 4DBQ A; 1UJ0 A; 4OMN A; 2VGM A; 3QWY A; 2O4X B; 1CKB A; 1AWX A; 3M0U A; 3I55 Q; 1B07 A; 4FYY B; 1W6X A; 4J8O A; 4C0G A; 4OVA A; 5A0D A; 5IXB A; 2BKD N; 4M75 A; 1G3Y A; 3CMA Q; 1Q7Y C; 2O9V A; 1EZZ B; 3J81 E; 4HT8 A; 3JCM h; 3VKI A; 4PJO B; 5DLO A; 3LYI A; 3VV0 A; 1VQ9 A; 3A8H B; 5KCH A; 2DJQ A; 1X6G A; 2DRM A; 5GAM f; 2FPD A; 4EMK C; 4OB3 B; 2FRW A; 2JOY A; 3G71 T; 1OYX A; 3RKY A; 5J39 A; 1ZUY A; 3MET A; 2O4X A; 3KBG A; 3D7S B; 3X25 B; 3L42 A; 2KXC A; 4OF1 A; 1KQS A; 1W4S A; 1OUL A; 5D6Y A; 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3HL8 A; 1TG0 A; 3EGX B; 2MCN A; 2YLC A; 2ESW A; 1WYX A; 4NL2 A; 4JJB A; 1IZ6 A; 3EG0 A; 3L2Q A; 2YT6 A; 1IGU A; 2VKN A; 4OMM A; 5FLX E; 2KRS A; 4ZGJ B; 4RTZ A; 2CUD A; 2EJG A; 3O5Z A; 4EMK B; 2FVU A; 2BE9 B; 1M1K U; 1W2B A; 2OTJ A; 4J6X A; 3HRT A; 1ZA1 B; 2LQW A; 1VQN T; 3EGX A; 3JCM X; 4JUV A; 3CXC S; 1WLP B; 4CI0 C; 1RAG B; 1NEB A; 4LUE A; 3EH1 A; 5GMK i; 4ZN1 A; 4RTV A; 4XU2 A; 1C1A A; 4X34 A; 4CC4 B; 4HXJ A; 1KFZ A; 1GRI A; 2OX7 A; 2R5A A; 2RHX A; 1VQ4 T; 3QUI A; 4EMK A; 5FU6 B; 2ZPI B; 5GAN 4; 2JJ9 A; 1S72 T; 1KG1 A; 2EW3 A; 4C0D C; 1HYO A; 2RK2 A; 3E1S A; 4VUB A; 3CCU Q; 1EX4 A; 3I9Q A; 1G5V A; 4JDS A; 3CCJ Q; 1LCK A; 1PC0 A; 4F7U F; 1BBZ A; 4AT1 B; 4WF2 A; 1YIT Q; 4F04 B; 1IRE B; 3MPU B; 3OYD A; 3A8L B; 1QVG P; 1WHH A; 4BY6 B; 1VQL A; 2MAM A; 2Z0W A; 2XD0 A; 4M77 F; 2DXC A; 2PZ1 A; 2CP0 A; 2MMP A; 4MZM A; 1BIB A; 5A0L A; 1K1Z A; 5IXF A; 5GMK m; 1SSH A; 3JB9 H; 2JNG A; 5KYN A; 1I81 A; 3CC2 T; 4CC7 A; 4RTU A; 4OMF B; 1WX6 A; 1X6B A; 2E6N A; 4RG2 A; 4HCB A; 4DA4 A; 1YIJ A; 4FU6 A; 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