2KHOA

Nmr-rdc / xray structure of e. coli hsp70 (dnak) chaperone (1-605) complexed with adp and substrate
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
IIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGTFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFDELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein 70
publication title Solution conformation of wild-type E. coli Hsp70 (DnaK) chaperone complexed with ADP and substrate.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 181
structure length 600
sequence length 600
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 2khoA06
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2khoA05
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2khoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2khoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2khoA04
4FPAA 2FSJA 3BF3A 5ELZA 3DJCA 2F9WA 4H5RA 4H03B 1BUPA 5BPNA 3FR0A 3HTVA 4BG9A 3VF6A 5TKYA 3GE1A 3VOVA 3ZETB 4BC4A 4EZQA 5FPNA 3T47A 2E2NA 3A5OC 1P8ZA 4BREA 3GDQA 1ESVA 3A8YA 2BTFA 4EAHD 5JICA 2FF6A 3LDQA 1BU6O 3O5BA 5LJVA 2WINM 4B9QA 3DAWA 3F9MA 2QWOA 4E1JA 3UKUA 2QW9A 1BOTO 4MO5A 1KXPA 3D2EB 4NO7A 3BP8A 4B1WB 3FFKB 1C0GA 5BRFA 4XH5A 1GLAG 3WEEB 3VENA 3DPOA 3ZX2A 3VF2A 4H5TA 3JS6A 3H3OB 1K8KB 5BR9A 2P9PB 4BC3A 5F1XA 3H45C 4CZFA 4DB3A 4FWMA 4EZOA 1Q18A 3AARA 3WXJA 4DCHA 4FSVA 4BR5A 2PAVA 3MN6A 1NGAA 1GLBG 4BGAA 5AQHA 4LC9B 4CZIA 2CGKA 1NGEA 3TPQA 4O8KA 4BRAA 4FWRA 2GUPA 1CZAN 1J6ZA 5E26A 4EZNA 2WUSA 1MWKA 3UB5A 4H6HA 3HBTA 5E84A 3H46O 2E8AA 3W0LA 1NBWA 3M3ZA 3AAQA 3VF4A 2ZGYA 4BG8A 3W3DA 2P9KA 3EN9A 4A2BA 3MMVA 5KQ8A 2QM1A 5JMVA 1XC3A 3P4IA 4CZLA 1D4XA 4FO0A 4JWEA 2Q0RA 3DXMB 4RWTA 1MDUB 1QHAA 3J8AA 4R5GA 1HKGA 3IFRA 5AZJA 1NGHA 2E20A 4HTLA 4K25A 1E4GT 2YCHA 4WV7A 2HF4A 2I7PA 4MLHA 3QBXA 4BQZA 1NWKA 1EQYA 3ID8A 2VYPA 4ISFA 4JD2B 1GLEG 2A42A 4O5FA 4CJ7A 3OHXM 4PKHA 5KPZA 3QBWA 3FZLA 4AM6A 2V52B 2D4WA 2ASMA 3QFUA 1S22A 3IDHA 4EZSA 3OHRA 3FZKA 2W40A 2YHWA 1JCFA 5AQXA 4BC2A 2P9SB 5AQMA 3O8MA 1GLFO 1LCUA 5KPTA 4BROA 3CJ1A 4BRHA 1OKJA 4I6MA 4XEIA 4CZMA 1TUYA 3T49A 2D0PA 4JAXA 4C23A 4CZGA 4BQLA 1QQOA 1IJJA 2CGLA 4IXCA 4CD1A 5KQDA 4IJNA 1U6ZA 5LY3A 2E2OA 1QQNA 2YJFA 3RSEB 4B1UB 3FE1A 4BRKA 1RDWX 4FWLA 5FPEA 1C0FA 3CJAA 1YUWA 3FZHA 4CZKA 3VPZA 4B1VA 1T6CA 4B1XB 4JWDA 2H3GX 3C0BA 4K42A 3U9ZA 5FPDA 1SQKA 4BVPA 1HKCA 1XUPO 3WUHA 2P9UA 2FSNA 3ZEUA 3DXKA 3ATUA 1U2VA 2QWLA 3MDQA 2YJEA 2I7NA 2Q36A 3AY9A 4IZ9A 1DKXA 2Q31A 3FLCO 1CKRA 4CBUA 4B1ZA 3IMXA 1DKYA 4MO4A 2ITMA 4RTFD 2YHYA 3KVGA 2P9IA 5BREA 4R5JA 1BO5O 2ZGZA 1NGBA 4Z94A 1U00A 5AFUH 1HJOA 3CJCA 3UKRA 3DOBA 3VETA 2GELA 1NM1A 3ZX0A 2NZTA 4EZVA 3WQUA 5EXWA 5BRHA 2QWPA 4FOEA 4BR2A 5BN8A 3VGLA 2D0OA 1DKGD 2EWSA 2OANA 4BRCA 4A62A 3QNJA 3O1BA 4RCHA 4BRQA 2V7ZA 1HPMA 5AQRA 2A40A 3GG4A 5AZIA 4EZYA 3RSEA 4DQ8A 4H0YB 4JWCA 3U4LA 1WOQA 2QWRA 4MLEA 1JCGA 4B1YB 5AR0A 3U8XA 1YAGA 4XH4A 5AQQA 2ASOA 2CH6A 4JNEA 4FWPA 2FSKA 3A0IX 4BRPA 4JHDB 2DPNA 4EHTA 3FGUA 1RGIA 3KHYA 3BEXA 3O08A 4CZHA 3GBTA 3CIPA 1HUXA 4KBOA 2A3ZA 3L3OM 2J4RA 3L0QA 4WQ5A 3WQTA 3O6WA 2E2QA 4EHUA 5JLFA 1HLUA 4H0TB 4H5VA 4K41A 4FPBA 1DKZA 5BN9A 3ZETA 1S3XA 3ULEB 3WXIA 4BVOA 2GWJA 3ENOA 4CBWA 3C7NB 1GLCG 5AQJA 2P9NB 4IWVA 4J8FA 4FWOA 4BRLA 4H0OA 1BA0A 5BPMA 5AQFA 3U9DA 5AFUA 2V51B 4BRFA 3T4AG 2Q2RA 1X3MA 2IVNA 3G25A 3D2EA 5EX5A 1NMDA 1ZC6A 4AM7A 3CI5A 4HY9A 4QS9A 4XH1A 3O4WA 2E88A 3WEEA 3EKUA 2CGJA 1K8KA 4F01A 4BRNA 2AP1A 2P9PA 4HYBA 4BR4A 4EFHA 2Q97A 1KAYA 1NGFA 3DPQA 2QWNA 4M7YA 3L6QA 4BR9A 2UYTA 3QDKA 3DQGA 1QQMA 4H5WA 2ZWHA 4CZEA 3VEVA 1ATSA 4H5NA 2GTDA 3T48A 5AQSA 1ATRA 4EIAA 5AQGA 4BRMA 4R5KA 4GY2B 4A61A 4FWQA 2GWKA 3A5LC 1KAZA 5AQLA 3H3NO 3UKUB 1DGKN 2P9LB 3QB0A 4GNIA 3D7EO 4A2AA 3VGMA 4QS7A 1RFQA 3LL3A 1DG4A 2NLXA 1YXQA 4FOIA 1H1VA 4BGBA 4FWNA 5AQNA 4EZZA 3HSCA 3H1QA 3DXMA 5EY4A 1ZXOA 1BDGA 1T6DA 1X3NA 3FZFA 4NB4A 1MWMA 3SK3A 3H0XA 3T46A 4HWIA 3CHWA 3VEOA 1ATNA 1BWFO 1NGJA 2BUPA 2E1ZA 2CH5A 1T44A 4JD2A 4PL7A 2W41A 2QWMA 1QZ6A 1R59O 3N8EA 4BR0A 4PO2A 1Z05A 3H6EA 3O80A 4IO8A 3B8AX 2IVOA 4M7XA 4H0VB 5JLHA 4EZUA 2E2PA 2P9SA 4F9OA 4DHYA 2NRHA 3VEWA 3EL2A 3I33A 4ISEA 4ISGA 2P9KB 3VGKA 1V4SA 4FWSA 4CI6A 1GLLO 2PBDA 3ENHA 5ADXA 3R6MA 4EZTA 2F9TA 4WQ4A 1BG3A 4WQ4C 5AQVA 4CZJA 3SMPA 3VERA 4EZRA 1YVNA 3EZWA 3LDLA 3EKSA 5AZJB 2HOEA 5BPLA 5AQPA 2A5XA 2QXLA 2P9LA 1Q5LA 4H0XB 1BPRA 4R5IA 2ASPA 4FWKA 2QFFA 3BF1A 3LM9A 4F00A 1Z6RA 4H0PA 1TUUA 3CJBA 3AAPA 3MCPA 3ZX3A 3R9PA 3MN7A 3CERA 5I9EB 4JN4A 2BPRA 1TYQB 1BA1A 5KPRA 5LJWA 3M1FA 4H6IA 1NLVA 3GOIA 4WQ5C 4EZWA 3D2FB 4WYBA 4I6MB 4WV5A 3CQYA 2FXUA 2HF3A 3HZ6A 2FLOA 3QICA 4R5LA 3KZBA 3WT0A 1SZ2A 1E4FT 1ZBSA 1HX1A 2VCPA 4JWIA 4CD3A 3TU5A 4Y0WA 4IJAA 3S41A 5B8HA 4BRIA 3HI0A 4PKIA 5AQTA 1DEJA 5BRDA 3M6GA 3WXLA 2A6AA 2QWQA 3MK6A 4JNFA 1XQSC 1X9JA 4L3QA 1IG8A 3EO3A 5AQUA 5EOYA 4YDUA 1G99A 4YDUC 3VEZA 2KHOA 2P9UB 3ZEUB 1V4TA 1NGGA 2IIRA 3DXKB 2IVPA 2AA4A 2Q0UA 3SLCA 1U2VB 3UE5A 7HSCA 4BRDA 4CBXA 3LDPA 4K43A 3CJ9A 2Q1NA 5AQKA 5CE3A 5FPMA 5AQOA 5F2RA 1GLJO 4BC5A 5ADXH 3LDOA 3R8EA 1QZ5A 2P9IB 5AQWA 1Y64A 3L4IA 2FF3B 3FZMA 1HKBA 2V7YA 1GLDG 4FL9A 5AQIA 3JXUA 2YI1A 3UKRB 3CQXA 5AQZA 4JHDA 2YHXA 4BR7A 5F0XA 1TYQA 3DPPA 1NGCA 3IUCA 4PL8A 1WUAA 3LM2A 3MN5A 4M63C 3D2FA 3H1VX 4QS8A 3SMSA 2HMPA 3ATVA 3BUZB 3CETA 3VEYA 3ULEA 2ZF5O 3I8BA 2A41A 2E1YA 3O1WA 4E81A 3C7NA 1JCEA 3LDNA 2P9NA 5EVZA 5AZIB 3A5NC 3WXKA 1SAZA 4EZPA 2OP6A 4BRGA 5AQYA 3VESA 3QMLA 1MA9B 2D1KA 1NGDA 1NGIA 1KAXA 4EZXA 4PKGA 3VEXA 1LOTB 2GEMA 3MN9A 3CJ7A 3GL1A 3A5MC 3HM8A 3QFPA 2VWBA 3DWLA 3SJHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IKMA 4EZ6A 3NE6A 2RPIA 2YC1C 4TSXA 4FJ5A 4I2PA 2D4CA 3BY5A 3FR0A 4Z4FA 4UJ0A 4B9MA 2QK9A 4M3YA 5C12A 1I4TA 4OLBA 3GE1A 3ZETB 3Q7CA 4M3WA 4BC4A 1KD1O 2HSTA 3H08A 3A5OC 4LFBK 5JICA 2O4IA 3LDQA 4JI0K 1B3CA 3E7RL 3UKUA 3MXMA 2HMIA 3EE9A 1BOTO 1KXPA 4M0MA 1SKRA 2YKMA 3K57A 3UITA 3BP8A 4HE7A 2N66A 4IWOA 3QWEA 3VTIA 2WOMA 4CJWA 3TTFA 4HR1A 3TABA 3WNGA 4UAFE 3DLHA 3MWPA 3JS6A 4MQDA 1A5WA 1K8KB 2YLLA 3C6HA 1CLQA 5F1XA 1B92A 4NYNA 2IS3A 2ALWA 4HHFA 4FWMA 3WXJA 1HR0K 4FSVA 1XMQK 3J81O 3J7YP 2KLAA 1XNRK 1T7EA 3MN6A 4KIKA 4LC9B 2VGMA 1PX9A 4F8RA 2Z0OA 4V19S 4UDYX 2LKBA 3TI0A 1HNIA 3CCEN 4LY7A 1WB9A 4B3SK 3AO1A 3HT3A 4HTUA 2KGQA 1T7PA 4B8CA 2ZGYA 3KP0A 1LAVA 3T19A 3W3DA 2O8DA 3T3FA 4DQIA 5KQ8A 1RBTA 4O44A 1M1KO 3VQPA 2D0CA 2Q0RA 3OY9A 4M41A 1J5OA 1QHAA 4R5GA 3CMAN 2O8BB 4ID1A 5FDLA 4DR1K 5I3UA 4BE7B 1EKEA 1E4GT 2YCHA 1RT6A 1SN1A 4JK7A 1ZBFA 1VNBA 4O5FA 4PKHA 5BR8K 3SQ1A 2V52B 4DKWA 3SV4A 3B6OA 1N8RO 1I2UA 3IDHA 4EZSA 3EY1A 1JCFA 4BC2A 1L3VA 2O8FA 2E6MA 1YT3A 3KKSA 1ZYWA 1JL1A 4FZYA 2DFEA 4BRHA 2OTJN 1CZ9A 1TUYA 4C23A 4JI3K 3HL8A 3NGZA 4CFDA 4MQ3A 2CGLA 2X6SA 5KRSA 3WXMB 4ILJA 1N5YA 5LY3A 3OYEA 4AZCB 3BGRA 2MI7A 3WNFA 4BRKA 4FYDA 3OYIA 3V1QA 5FPEA 1C0FA 2HNDA 3NVMA 3M3WA 4XIUA 1T6CA 4B1XB 4FJIA 2XRIA 2YL6A 2KPYA 3NH2A 1SQKA 3DLLL 4FM2A 2O8EB 4BNEA 3AA4A 4JI1K 1T3VA 4GVEA 2OPRA 1U2VA 4IM0A 4CEZA 4KHSA 4WFAL 4LSLA 3MDQA 1VQ7N 4RW4A 3SBTB 2VG5A 2QEXN 1DJTA 2V0OA 3IMXA 1NJYA 4Z0UA 4DS4A 4R5JA 3SUOA 4G6QA 3FFIA 4E3CA 1U00A 2ZJRL 2RN2A 5GIPA 3B52X 4Q0BA 4CGIA 3RV0A 2NZTA 4CEDA 4EZVA 3WQUA 5JENA 3QE6A 4E7KA 2Z1HA 3P39A 2Q3SA 4A57A 2PZSA 4DR4K 1S1XA 4AEIA 2N2RA 3J7AP 1U4BA 4BRCA 3KLEA 4A62A 4FLYA 3O1BA 4CJFA 2V7ZA 1X1PA 4IEIA 2A40A 2JGUA 5AZIA 4WPCA 3RSEA 1BCMA 4DQ8A 3ZT0A 4I1QA 1Y2OA 4JWCA 2X3WA 3TAGA 3RRHA 1URUA 2Z8YA 3SYVA 4OGEA 4DTMA 1VQ9N 5AR0A 4CESA 1YAGA 3VN5A 3D0PA 2OO2A 5AQQA 4FWPA 2OYQA 4BRPA 4JKEA 3MECA 1CHZA 1SL1A 2F1AA 3WQTA 4EHUA 2E2QA 1HLUA 4DQPA 2KQ2A 3O3OB 3OYGA 4WPEA 4M42A 3ZETA 1S3XA 1NK9A 1O7DB 4O5BA 4BVOA 4IFVA 3C7NB 1GLCG 4IWVA 4J8FA 1LAWA 3EZ5A 5SZTA 4UADE 1XC9A 3QINA 1VQ5N 1BA0A 5BPMA 4I7FA 1EWQA 5C42A 2V51B 4YOUA 1I39A 3G25A 1ZC6A 1NMDA 2NRWA 4AM7A 3KLIA 2ZXQA 4CGGA 4E89A 2BRZA 4CF1A 3KLHA 3ACOA 4HY9A 4XH1A 4CHYA 3O4WA 1SU8A 4KTQA 4DSKA 3DM2A 3EKUA 1K8KA 1RT1A 1ZBHA 2YEOA 2PYLA 1KAYA 4JEPA 1NGFA 3U3GA 4LF8K 1EP4A 3RWUA 4WFBL 4WF9L 2GTDA 3ASMA 5AQSA 2ELBA 3HAHA 5AQGA 3KP1A 1UOCA 1RTHA 1GPTA 2GWKA 4CEEA 3T1YK 5AQLA 1FW6A 4DU4A 2E3FA 3D7EO 1BIUA 1LQHA 4JLHA 3VGMA 1VQPN 1TL1A 2KYQA 1RFQA 4E7JA 1DG4A 4DR6K 4FK0A 3F5TA 4FWNA 1XHZA 5AQNA 2HVIA 3HSCA 3FZFA 1R5EA 2Y1IA 4ICLA 4KO0A 2O8BA 3DLRA 4IDKA 1HNVA 3T46A 1KSPA 4B9NA 1BWFO 3UIQA 3P38A 3VQCA 3VQ4A 4CGHA 2HNZA 3KOYA 2UUAK 2NY8X 4CJTA 1Z05A 5I42A 4E7LA 4Z4CA 4IO8A 3OYCA 4H0VB 3CCJN 3V1OA 5SWMA 3G9GA 1IG9A 3L3PA 2NRHA 3L3VA 1X9WA 3CCSN 2UU9K 1JXBA 3I33A 3VQ8A 3KOXA 1GPSA 3VGKA 3V1RA 3DOKA 4FLWA 3SAGA 2ITGA 2KW4A 3ENHA 1TVRA 5ADXA 4WQ4A 1VQNN 4JK8A 1BG3A 4CZJA 1JLBA 3I0RA 3SMPA 2OZMA 2Q13A 2HHUA 4CJUA 3HYFA 2C08A 4AZCA 3VEBA 1K6YA 5AZJB 3CCMN 2YIVX 2HOEA 4IKFA 5BPLA 1I49A 5AQPA 2A5XA 2QXLA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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