The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
106
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structure length |
106
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Chain Sequence |
MTFSECAALYIKAHRSSWKNTKHADQWTNTIKTYCGPVIGPLSVQDVDTKLIMKVLDPIWEQKPETASRLRGRIESVLDWATVRGYREGDNPARWRGYLEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| molecule keywords |
Phage integrase
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| publication title |
Solution NMR structure of protein Nmul_A0922 from Nitrosospira multiformis. Northeast Structural Genomics Consortium target NmR38B.
rcsb |
| source organism |
Nitrosospira multiformis atcc 25196
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| total genus |
34
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| structure length |
106
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| sequence length |
106
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KKV A; 3MGV A; 3C28 A; 1KBU A; 1A0P A; 1NZB A; 1PVP A; 2KD1 A; 3LYS A; 1F44 A; 2HOI A; 1Q3U A; 2KJ8 A; 2A3V A; 1CRX A; 2KIW A; 4A8E A; 1P7D A; 2OXO A; 3NRW A; 3CRX A; 2CRX A; 1PVQ A; 1XO0 A; 2KKP A; 3C29 A; 5CRX A; 1XNS A; 4CRX A; 2HOF A; 2KHQ A; 2KJ9 A; 1Q3V A; 1Z19 A; 1Z1B A; 1DRG A; 2KHV A; 2KOB A; 4ACO A; 1OUQ A; 1MA7 A; 1PVR A; 2KJ5 A; 2KEY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EZ5 A; 8ICN A; 2RDI A; 5KG4 A; 2ZIX A; 1IV8 A; 3WU2 U; 5J0T A; 4Z6D A; 4DSI A; 4ECU A; 3MBY A; 1RDF A; 4EYI B; 5J0X A; 4IRK A; 1SZH A; 1MQ3 A; 4K4G A; 2W11 A; 9ICQ A; 1SB3 C; 2PFO A; 9ICO A; 1COK A; 4DQP A; 1ECW A; 2F8L A; 4KLD A; 4YVZ A; 4NWI A; 5EE9 A; 4DQS A; 3QEA Z; 3PSI A; 2H3V A; 5ALP A; 4PHP A; 3BZK A; 5J2D A; 4MF8 A; 2BHN A; 4F5Q A; 1ZD4 A; 2XI9 A; 4UAV A; 2K8B B; 7ICK A; 5KFO A; 2RQ5 A; 2RRD A; 1S9F A; 8ICE A; 4F2S A; 3M8R A; 1KEJ A; 4K4I A; 2KNJ A; 2R8G A; 4RT2 A; 1ZQI A; 1SL1 A; 3UXP A; 4JWN A; 4PH5 A; 2FI1 A; 3RBE A; 1KBU A; 5KFJ A; 1L8L A; 1SV0 C; 4GIB A; 1JMS A; 3M6K A; 3QZ7 A; 3QE9 Y; 1URJ A; 2ZXH A; 4C0Z A; 2A1J B; 4UB2 A; 1L3S A; 4K4H A; 4QZB A; 3ED5 A; 3WKD A; 4C7Y A; 2K4H A; 4LJX A; 4B9N A; 3SV3 A; 4XRH A; 3GV8 B; 4YQW A; 5EWE A; 3RB4 A; 2E8P A; 1FFV A; 2F2A B; 2WTF A; 4DFK A; 2XGP A; 5H2F U; 5AM2 A; 2QB0 A; 2HOQ A; 4QWD A; 5HP4 A; 3AL0 B; 2HHQ A; 2NO5 A; 2RLT A; 2W8K A; 1D8Y A; 1XSN A; 8ICZ A; 1LKY A; 5ALR A; 2J6T A; 3UQ0 A; 1PZN A; 3PMN A; 1NKE A; 2W9A A; 2IOF K; 4NJ8 A; 4J9R A; 3HKZ C; 3MC1 A; 2AGQ A; 5L1I A; 2YB1 A; 4EBD A; 2K8A A; 4TQR A; 2VKQ A; 3A0B U; 5DG8 A; 3ZDB A; 5KFD A; 2HVH A; 2RHF A; 1PUZ A; 5KFX A; 5AK5 A; 1Q8K A; 4J9L A; 3UQ2 A; 4U6P A; 3AUO A; 3CYM A; 3ISB A; 2ISO A; 4J9O A; 1DOQ A; 3RRH A; 4ED3 A; 3ICX A; 4O3S A; 5AK4 A; 3V6H A; 3SD7 A; 4DFJ A; 1X6I A; 3RB0 A; 5DDY A; 4M9J A; 1A76 A; 1WWV A; 5KFU A; 1NK9 A; 2YY6 A; 5AM3 A; 4RQ8 A; 4O9M A; 1K5O A; 3OTQ A; 1SZP A; 2A1J A; 5ALZ A; 3OGU A; 5JTI A; 5HR7 A; 3V7J A; 4RQ3 A; 3AN1 A; 5ALW A; 3GII A; 4OJP A; 5KFW A; 1CI4 A; 1X9M A; 5KFE A; 2LI6 A; 4QWA A; 3D2S A; 2KG5 A; 2MSN A; 3M9O B; 4F92 B; 3F2B A; 2KK0 A; 3DV9 A; 1QSS A; 5ALH A; 5ALE A; 2HCF A; 2R8K A; 5IIO A; 2PXI A; 4PZO A; 4QWE A; 1X40 A; 1X6J A; 4LZD A; 2LPE A; 1ZQN A; 5KFB A; 4O3P A; 2PMZ C; 3BQ0 A; 2AQ4 A; 1SWW A; 1GO3 F; 4R8U B; 4NY8 A; 5DBC A; 1U9L A; 1CUK A; 4KLE A; 3LVV A; 1Z00 B; 4EEK A; 2UVV A; 5L1K A; 3NVV A; 4G3I A; 1SL2 A; 2W03 A; 2BQ3 A; 3WK9 A; 1HJP A; 2P6R A; 2I1Q A; 4ED2 A; 4M9G A; 9ICB A; 5AK3 A; 3NRZ A; 3QUT A; 5AIC A; 2BCV A; 2A3V A; 9ICA A; 1RYU A; 7ICV A; 1P7D A; 3T5K A; 4UAU A; 1JI7 A; 4AYB C; 2AQ0 A; 2WF8 A; 1O03 A; 3SMV A; 1NZP A; 4ED6 A; 1ZQJ A; 2QB1 A; 4ECR A; 1WWU A; 5KFY A; 2KMD A; 3PW2 A; 2VA3 A; 1JRO A; 5KFI A; 5KFQ A; 3TAR A; 3ETL A; 5DB7 A; 3EW9 A; 4RU9 A; 4O0I A; 5DDM A; 3NVW A; 4RQN A; 4U7C A; 3L3F X; 1VLB A; 9ICM A; 4R65 A; 4ED7 A; 2DFL A; 4UB4 A; 2E1F A; 4DFD A; 3SZ2 A; 2MRL A; 2KZ3 A; 2LM4 A; 5IIK A; 1S5L U; 3UM9 A; 4OO1 J; 4FBT A; 1U49 A; 3BS5 A; 2DBY A; 2OHF A; 4UB5 A; 3GU3 A; 4RT3 A; 1ZQK A; 3QX7 A; 1NKB A; 3QU4 A; 4PHE A; 9ICJ A; 1U48 A; 1V85 A; 4JK1 A; 4PJ0 U; 2VJ4 A; 4GC6 A; 4P0P B; 2EH9 A; 5ALQ A; 1SL0 A; 1EXN A; 4EEL A; 2YN4 A; 5GTH U; 4F5P A; 3NTU A; 3K1Z A; 4CDG A; 2BCR A; 8ICQ A; 2VAN A; 1D9F A; 3F5E A; 3TAP A; 4F4W A; 2R18 A; 4F5R A; 3JPO A; 1DRG A; 1A6S A; 3G6Y A; 2GO7 A; 5J8Y C; 1K1S A; 4F4X A; 4Y2V A; 2IOF A; 4MFC A; 3KBB A; 1V97 A; 1SXE A; 4DL2 A; 1BPX A; 1FEZ A; 1CEZ A; 5AKG A; 1ZQT A; 2EAN A; 1FIQ A; 3RJF A; 4YXM A; 5D46 A; 2BR0 A; 2W43 A; 3DEE A; 3BQT A; 3H0M B; 4ED8 A; 2V4Q A; 5CRX A; 1F5S A; 4AP9 A; 2UVR A; 4IQT A; 4YFK A; 3MFH A; 8ICO A; 1VDV A; 3F5A A; 3WKC A; 3UMB A; 1ZQC A; 4CCH A; 5CHG A; 3HWT A; 3RTV A; 1T94 A; 2K4E A; 3SEN A; 1ZQL A; 1SV0 A; 4KLL A; 2ZTD A; 3CRX A; 5KFV A; 1BPZ A; 4KLO A; 5DB9 A; 4F50 A; 3N28 A; 4UB8 U; 3F53 A; 2HI0 A; 1NK6 A; 3NVZ A; 5ALU A; 4UQG A; 2W3R A; 3SQI A; 3WKE A; 2XY5 A; 1MN8 A; 3OSN A; 2AU0 A; 5L1J A; 3ORY A; 4I2A A; 5AM1 A; 3VC8 A; 5G5H A; 1RYS A; 1L3T A; 3PW0 A; 9ICX A; 2FDR A; 9ICW A; 2EDU A; 2HDO A; 2K4P A; 2JEF A; 5DLF A; 3GIL A; 4PL2 A; 4YR3 A; 3WK7 A; 4EX6 A; 2GOL A; 4HAI A; 3SEI A; 2KKV A; 1JUD A; 3C21 A; 4GFJ A; 4I29 A; 4KLG A; 3ISC A; 3TFS A; 2MUT B; 3Q8M A; 4QW9 A; 1YZ7 A; 3UMG A; 2IOH A; 5KG7 A; 3TI0 A; 4P0P A; 5DQH A; 4FZN A; 2BCS A; 3GIJ A; 4DQR A; 3H8M A; 1KSP A; 1N61 A; 2PI4 A; 5CWR A; 1YZ6 A; 5DBB A; 3BQ1 A; 3NGD A; 4P2H A; 3LK9 A; 1U4B A; 3C2K A; 5ALD A; 3PVX A; 1Y88 A; 1TAM A; 2JZB B; 2HHW A; 4RQ2 A; 5KT7 A; 2DWQ A; 4PPX A; 3FYH A; 3FDS A; 5IIJ A; 9ICP A; 4Y2T A; 5DGA A; 4QWB A; 1B43 A; 1T3Q A; 1XO1 A; 1LVH A; 1BNP A; 1KN5 A; 7ICE A; 2XGQ A; 3V72 A; 2ZJA A; 9ICG A; 5T14 A; 4IL6 U; 2YML A; 1TVA A; 1XC9 A; 2WF6 A; 3T5J A; 1F44 A; 4B9U A; 3WK4 A; 3LDA A; 4USA A; 2ATL A; 1HUZ A; 2EQY A; 2NYV A; 2ZIU A; 2V9W A; 1LB2 B; 2ASL A; 2I6X A; 5AM0 A; 5KFM A; 4YP3 A; 3C1Y A; 4TUQ A; 4QZA A; 5KG6 A; 4WJ3 B; 3ZDD A; 1L7N A; 4YG2 A; 2V4R A; 1ZQM A; 2F77 X; 2LYA A; 9ICN A; 4ZOH C; 1S0N A; 1MC8 A; 4DL5 A; 2NO4 A; 3Q8L A; 2JR5 A; 4XUS A; 4P4M A; 1ZQV A; 5DQI A; 2J6S A; 4MF2 A; 1N63 A; 4F93 B; 4EBC A; 4DSL A; 3K1R B; 2W55 A; 5KG5 A; 3PZP A; 4DWI A; 1ZQY A; 2LBO A; 5K4L A; 4I28 A; 4J9N A; 2E1E A; 5AI0 A; 2WHE A; 2AH5 A; 2B21 A; 2QB0 B; 5ALN A; 3SI8 A; 2F1I A; 1CRX A; 1TKD A; 3GZF A; 4UAW A; 3PX6 A; 4DL6 A; 4YR2 A; 4DSF A; 2KV2 A; 1LV5 A; 5BOM A; 3BQ2 A; 1UPH A; 3M6Z A; 1B4F A; 4F2R A; 1LKY B; 3MAB A; 1L7P A; 1RM6 C; 2CRX A; 5AIB A; 2IMW P; 4QZG A; 4YD2 A; 5IIL A; 2XID A; 4Y2Y A; 2NRW A; 4GXK A; 2EAP A; 3FM9 A; 4O3O A; 2XCP A; 2LM1 A; 4F3O A; 2HBM A; 2LKY A; 5KTQ A; 1UA1 A; 3D6J A; 8ICV A; 1KLN A; 4LZG A; 5J2B A; 1ZQE A; 4DL4 A; 1N56 A; 3RH6 A; 5HMM A; 3ZD8 A; 1RXV A; 5CR0 A; 5ALG A; 1JRP A; 1NNL A; 1JN3 A; 4RZR A; 2JZB A; 2DPJ A; 2OWO A; 1N5W A; 2DUY A; 3T3F A; 3C23 A; 2JH7 A; 3V6J A; 3TAD A; 1L3U A; 2IHN A; 4PGY A; 4DSK A; 4UB6 U; 1WUD A; 3RJI A; 3JPS A; 4EEY A; 3RJJ A; 9ICU A; 5KFR A; 7ICU A; 2DL0 A; 3RH5 A; 1S10 A; 2EAM A; 3A0H U; 1XS9 D; 1Q3V A; 4M6W A; 5J2F A; 9ICH A; 4DLE A; 4NL9 C; 3RR7 A; 1DGJ A; 2QLT A; 4MHV A; 4B9S A; 4EEN A; 5ALY A; 1SIJ A; 4P4P A; 5AKZ A; 3HRD D; 5KT6 A; 2JGA A; 1S76 D; 3N7R C; 4RQ0 A; 3Q8S B; 5KL1 B; 9ICE A; 1B0X A; 1L5U A; 4QIW C; 3NUQ A; 3S6J A; 4QZ9 A; 1J97 A; 8ICS A; 3RJE A; 2YMQ A; 1WCL A; 2J6U A; 4YMM A; 2W3S A; 2BCQ A; 2VA8 A; 9ICL A; 1QTM A; 3QU2 A; 4JB3 A; 2H3Q A; 4R64 A; 8ICB A; 4CGZ A; 3ZI4 A; 3H0L B; 2IHM A; 3AQE A; 5AK6 A; 1NK8 A; 1RQL A; 8ICK A; 3BZC A; 3TAQ A; 4IQU A; 4GXJ A; 4R63 A; 3TFR A; 3QUC A; 8ICC A; 4NM2 A; 1KRP A; 3HJE A; 5J8Y A; 1UQV A; 3V7K A; 5J0Q A; 3RR8 A; 1HEK A; 5J2J A; 2OYY A; 3ONN A; 3QU5 A; 3AEV A; 4DCC A; 5IIM A; 8ICL A; 3M8S A; 3R9K A; 3BDP A; 2KKP A; 2C28 A; 4J9S A; 2DQN B; 5HML A; 1ZQZ A; 3BS7 A; 2EZX A; 4C8M A; 4DO9 A; 1PVR A; 3JPQ A; 5KFZ A; 2BCU A; 2F44 A; 4RQ6 A; 5JUM A; 1ZJN A; 5A0L A; 1FO4 A; 2XVT A; 2ZUD A; 3H40 A; 4ECS A; 2ZXI A; 1ZQP A; 2KIC A; 2ESE A; 3T5H A; 2HBK A; 4Q8F A; 2HHS A; 4NV0 A; 2AGO A; 3QU9 A; 3G6X A; 1SKR A; 4C4S A; 4M0A A; 4RPZ A; 2CN1 A; 4DL7 A; 2Y9U A; 2MA1 A; 2PI5 A; 2KZM A; 2JV3 A; 2XO7 A; 2BDU A; 4US8 A; 2OH2 A; 1XU4 A; 2W9M A; 4RNM A; 2G5I B; 4UBB A; 5J0Y A; 2WB1 F; 3BS5 B; 2KE7 A; 3CP8 A; 8ICH A; 4ZH4 A; 1TFR A; 1IM4 A; 4NLZ A; 3FC4 A; 4QZH A; 1SV4 A; 4M2Y A; 4B9M A; 2FPK A; 2LHT A; 2BPF A; 2M0N A; 8ICI A; 1PK3 A; 1YT3 A; 4C8O A; 4M47 A; 5J2H A; 4BXO B; 9ICI A; 1XNS A; 4ELU A; 3ZDC A; 2EZY A; 5KFA A; 2CPR A; 4EZ6 A; 3JPR A; 3KZI U; 1ZQO A; 2VA2 A; 4QZC A; 3PSP A; 4F4Z A; 4DOA A; 4BUG A; 7ICM A; 1T3N A; 4UBC A; 5DQG A; 4NLK A; 3BJY A; 3GV5 B; 4UAZ A; 2Y0S F; 4FZM A; 1BPD A; 3SAH A; 2KFN A; 4FBU A; 2KOB A; 1RZT A; 5L9X A; 1V9P A; 3WKB A; 3WK5 A; 2P35 A; 4O5C A; 3C28 A; 1PVP A; 5HR6 A; 2KD1 A; 2KSO B; 4F8R A; 2AXT U; 1ZQW A; 1NK5 A; 2D3D A; 1NK0 A; 2H3Z A; 4CF4 A; 9ICT A; 2YTU A; 3PNC A; 2P6U A; 2WAQ F; 2K8C B; 3RF9 A; 2ZJ5 A; 1UT5 A; 2W54 A; 1NJW A; 1F0M A; 1NJX A; 3C1Z A; 3F2C A; 2UVW A; 1NI3 A; 3ZDA A; 3IHQ B; 3PR5 B; 2JH1 A; 1BNO A; 1XSL A; 4F71 A; 2KJ8 A; 9ICF A; 1N60 A; 4CF3 A; 2JEJ A; 5KFK A; 1ED1 A; 3EUB 2; 4DFP A; 8ICF A; 4RQ4 A; 3RJG A; 4O5K A; 3E0F A; 1ZQ1 C; 3PR4 A; 5AHX A; 3PO5 A; 3HPO A; 1U47 A; 2C2R A; 5KFP A; 1J2N A; 4PHA A; 4B9L A; 5G5G A; 5KFC A; 4M9L A; 3RFA A; 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