The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
GSMGRQCKVLFDYSPQNEDELELIVGDVIDVIEEVEEGWWSGTLNNKLGLFPSNFVKELE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
CD2-associated protein
|
| publication title |
Solution Structure, Dynamics and Thermodynamics of the three SH3 domains of CD2AP
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
9
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| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4CC2 A; 2IIM A; 1FYN A; 2C0T A; 2LZ6 B; 2YDL A; 5IXF A; 3M0P A; 2C0O A; 4OMQ A; 1SHF A; 2FPF A; 2V1R A; 1H3H A; 5FWB A; 4CC4 B; 1SRL A; 4HVV A; 2L3Q A; 2KYB A; 3UA6 A; 2L2P A; 3ZL7 C; 2O9S A; 1CSK A; 3PE0 A; 2VWF A; 2J7I A; 3RNJ A; 1OPL A; 4DEY A; 1AZE A; 2HSP A; 3THK A; 3C0C A; 2AKL A; 1AWX A; 1NG2 A; 2DE0 X; 1K4U S; 1UDL A; 2JM8 A; 4F14 A; 2KT1 A; 2CDT A; 2BZX A; 4Y92 A; 2DA9 A; 2DL5 A; 2EYZ A; 1V1C A; 2FRY A; 1AWJ A; 4ORZ A; 3I35 A; 4HXJ A; 3UF4 A; 2GTO A; 2HCK A; 4EIK A; 2DYB A; 2KRM A; 4CC7 A; 2DX1 A; 1NEG A; 1ZSG A; 3UA7 A; 1M8M A; 1WX6 A; 2KNB B; 3H0H A; 4OMP A; 2DMO A; 1FMK A; 2SEM A; 3VS3 A; 2PTK A; 2A36 A; 2RN8 A; 5FWC A; 3VS7 A; 1EFN A; 4J9H A; 1TG0 A; 3VS2 A; 2YUQ A; 1GBR A; 1PKS A; 1JXM A; 1BBZ A; 5GJW B; 4RTX A; 4IIO A; 2RQR A; 1UGV A; 2EYW A; 2NUZ A; 2W10 A; 1K9A A; 4HVU A; 1U5S A; 1ZUY A; 1WXU A; 1SRM A; 2CSQ A; 2MCN A; 1CKA A; 2X3X D; 2EBP A; 4LN2 A; 3I5S A; 2L3S A; 1RI9 A; 4X1V A; 5HCK A; 4J9E A; 2CUD A; 2EGC A; 3NGP A; 4AFZ C; 2K9G A; 1AOJ A; 1UEC A; 1UHF A; 2JTE A; 2W0Z A; 1VA7 A; 1ZUK A; 2F2X A; 2OAW A; 2VVK A; 1WIE A; 1HSQ A; 2DRM A; 4Z8A A; 3A98 A; 1HJD A; 4GLM A; 4WCI A; 1X6B A; 1JXO A; 2DRK A; 2FEI A; 4JZ3 A; 2F2W A; 2JT4 A; 4AG1 C; 2GBQ A; 2YUO A; 1WXT A; 1ABQ A; 2AZS A; 3NMZ C; 2O88 A; 1X43 A; 2RNA A; 2RQW A; 2KBT A; 4GBQ A; 2ROT A; 2LNH B; 1QLY A; 2XMF A; 2KRO A; 1JEG A; 2PNI A; 1OPK A; 3M0Q A; 2KRS A; 1U3O A; 2LCS A; 1UG1 A; 3TSZ A; 1GFC A; 2O9V A; 2F2V A; 2HBW A; 1UUE A; 3VS1 A; 1K1Z A; 1WA7 A; 4OML A; 1I0C A; 1M3A A; 2DL7 A; 5IH2 A; 4RTY A; 2DL3 A; 2K2M A; 4CC3 A; 2AZV A; 3EHQ A; 1T3L A; 1QKW A; 2JW4 A; 4JZ4 A; 2H8H A; 5IHN A; 1SEM A; 3RBB B; 3U23 A; 1S1N A; 3KFV A; 1X27 A; 1YNZ A; 1MUZ A; 2AK5 A; 3UAT A; 2K6D A; 1PNJ A; 1SSH A; 3CQT A; 2ENM A; 2HDA A; 1QWF A; 2L3P A; 1WI7 A; 4AFS C; 1ZUU A; 2D1X A; 2EYX A; 2J6F A; 1WFW A; 2LP5 A; 1NLO C; 2EYY A; 2RQT A; 3H0I A; 2A08 A; 1K0X A; 2JMC A; 4RTT A; 1X69 A; 2RF0 A; 3IQL A; 2DLP A; 2JMA A; 3VRZ A; 3SEM A; 1I07 A; 1UFF A; 1BK2 A; 1TUC A; 4RTU A; 1NYF A; 2CUB A; 2LJ1 A; 2LQN A; 2FO0 A; 1GRI A; 2FG0 A; 1UE9 A; 1PWT A; 4HCK A; 5I22 A; 1ABO A; 2L0A A; 3H0F A; 1I1J A; 4M4Z A; 2MOX A; 2JM9 A; 3NHN A; 3VS4 A; 3VS5 A; 5FW9 A; 1YP5 A; 3VRY A; 1G83 A; 4OMM A; 2DVJ A; 1OEB A; 1SHG A; 3TSW A; 3EG3 A; 5L23 A; 1GBQ A; 3PVL A; 2A28 A; 2ROL A; 4D8D A; 3EG2 A; 3I5R A; 3JV3 A; 1ZX6 A; 3NPF A; 1X6G A; 1E6H A; 2DBK A; 3EG0 A; 1E6G A; 2A37 A; 3FJ5 A; 4AFQ C; 1AWO A; 2ECZ A; 4QT7 A; 4AG2 C; 4LUE A; 2AKK A; 4HVW A; 1NYG A; 2KGT A; 2DL4 A; 3M0U A; 1BU1 A; 1AD5 A; 1E7O A; 2EQI A; 1PHT A; 2GQI A; 3M0R A; 3EGU A; 2DF6 A; 1UHC A; 4JJB A; 1IO6 A; 1A0N B; 2JS2 A; 4OMN A; 4RTV A; 2VKN A; 4J9D A; 1WXB A; 4LNP A; 1B07 A; 2KR3 A; 2X3W D; 2DL8 A; 5I11 A; 2YUP A; 1JO8 A; 2FPD A; 1KJW A; 1QWE A; 1ZBJ A; 2YUN A; 3O5Z A; 1PRL C; 3TVT A; 1GL5 A; 3LH5 A; 2V1Q A; 1BB9 A; 5EC7 A; 2ABL A; 1M30 A; 5IXB A; 2RQV A; 2K7A A; 5GJV B; 4F16 A; 2GNC A; 1Z9Q A; 2YT6 A; 4K11 A; 4JJD A; 2NWM A; 3M0S A; 2GTJ A; 1UJ0 A; 2P4R A; 3M0T A; 2LJ0 A; 2ED1 A; 2K79 A; 2OJ2 A; 1T0J A; 1QCF A; 2J6K A; 2E5K A; 2CT4 A; 1ZLM A; 1AWW A; 2MIO A; 1TUD A; 2DBM A; 3REA B; 4A63 B; 4ESR A; 1UTI A; 1WYX A; 3VS0 A; 2DNU A; 4ZNX A; 5ECA A; 2CT3 A; 2DJQ A; 2O31 A; 2DIL A; 4J9C A; 1RLQ C; 4E6R A; 3REB B; 4IIM A; 1U06 A; 4J9B A; 2EGA A; 2ED0 A; 4FSS A; 1OV3 A; 2YSQ A; 4LE9 A; 1VYV A; 1WLP B; 2M0Y A; 1AZG B; 1KSW A; 2EVR A; 1M3B A; 1T3S A; 1Z9Z A; 2FPE A; 1AVZ C; 2I0N A; 1H92 A; 2J06 A; 2EKH A; 2O2O A; 1X2K A; 3ULR B; 2EGE A; 2CRE A; 2J6O A; 2C0I A; 1WDX A; 1KFZ A; 1H8K A; 1N5Z A; 3QWX X; 3R6N A; 1Y0M A; 1JQQ A; 1CKB A; 4RTW A; 1NEB A; 2K3B A; 2KRN A; 1RUW A; 2G6F X; 2KEA A; 2SRC A; 3GBQ A; 1GFD A; 4J9F A; 2LQW A; 4JJC A; 2KYM A; 4KRT A; 4Z88 A; 1OOT A; 1RLP C; 1UJY A; 1QKX A; 1AEY A; 4F17 A; 2KT8 A; 4J9G A; 4DEX A; 1VYU A; 1SPK A; 1W6X A; 2KXC A; 2KXD A; 2LMJ A; 1PRM C; 1W70 A; 2QDL A; 3SHW A; 1J3T A; 2GGR A; 4OMO A; 1Y57 A; 1NLP C; 1NM7 A; 2KE9 A; 1B3Q A; 1LCK A; 2BTT A; 3EHR A; 1PKT A; 2CSI A; 3EG1 A; 1YN8 A; 4AFU C; 5IHI A; 1GCQ A; 2ESW A; 4JPB W; 1X2Q A; 2BZY A; 1XOV A; 4RUG A; 2LJ3 A; 2DM1 A; 4R0K A; 2JS0 A; 2HEQ A; 3I9Q A; 4D8K A; 2D0N A; 3QWY A; 1M27 C; 2J05 A; 1GCQ C; 2FRW A; 2EW3 A; 2D8J A; 1W1F A; 1YCS B; 2EPD A; 2RQU A; 1G2B A; 2RMO A; 4LUD A; 3VS6 A; 1ARK A; 4J9I A; 1T0H A; 1K0S A; 1KIK A; 1MV0 B; 3PVQ A; 2D8H A; 1YWO A; 4Z89 A; 2CH4 A; 5IHK A; 2B86 A; 2BZ8 A; 1YWP A; 1VYT A; 2JXB A; 1K76 A; 2LX7 A; 1GCP A; 4RTZ A; 2PZ1 A; 1HD3 A; 1JU5 C; 2CH4 W; 3H41 A; 1M3C A; 2RPN A; 2M51 A; 2OI3 A; 1MV3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CC2 A; 2IIM A; 3RIR A; 4HT8 A; 5GMK e; 2RK2 A; 2KMT A; 4XU1 A; 4OMQ A; 3RKW A; 1NBE B; 4ELZ C; 2EWN A; 1OX9 A; 1WJS A; 4BE1 A; 5GAN j; 3UA6 A; 3ZL7 C; 1YIJ T; 1IHW A; 1KC8 C; 2VWF A; 3MEU A; 3UT1 A; 3ZBD A; 3NTH A; 2DER A; 1UGP B; 4B6M A; 2AKL A; 4M77 D; 4PJO G; 1K4U S; 2HL3 A; 1UDL A; 2JM8 A; 5LJ5 e; 2PUO B; 3CMA A; 2NYS A; 2NUT A; 4EMK A; 2DL5 A; 3CCS T; 4E7J A; 2HCK A; 4EIK A; 2DYB A; 2KRM A; 2RM4 A; 1G8X A; 1RAI B; 5C0M A; 4CC7 A; 3JCM d; 3EFO B; 3UA7 A; 2BE7 D; 4EMK C; 2DAQ A; 4OGC A; 3D7S B; 1JJ2 P; 1FMK A; 2F1L A; 2AHJ B; 4L59 A; 4UC4 A; 5FWC A; 3VS7 A; 4E7S A; 1EFN A; 4J9H A; 2L8D A; 2DFU A; 2QA4 T; 1GBR A; 4ZGE B; 1PKS A; 3CCU T; 4IIO A; 1OQK A; 2B8A A; 2W10 A; 2ZPH B; 4BD3 A; 9ATC B; 1SRM A; 2CSQ A; 2NLU A; 2X3X D; 3I5S A; 2XG8 D; 3CC7 T; 2L3S A; 2HQX A; 3NGP A; 2K9G A; 4Z02 A; 1UHF A; 2RJE A; 2LCL A; 4XAX B; 5GAN e; 2W0Z A; 1VA7 A; 1ZUK A; 2F2X A; 2DRM A; 3M54 A; 1K8A U; 2K5L A; 2P0P A; 4LXC A; 1X6B A; 5AT1 B; 1JXO A; 4M75 F; 3CCQ Q; 4XTW A; 1WGS A; 4BI3 A; 2F2W A; 1K8A R; 1RAC B; 1YJ9 A; 3WVD B; 1VQ6 A; 4QVD A; 2K3X A; 3PMI A; 1WHJ A; 1M8V A; 1X43 A; 1IRX A; 5FRO A; 2LNH B; 2KRO A; 3A8O B; 5GAO n; 4BDY A; 1MHN A; 3OMC A; 1U3O A; 3TSZ A; 1WQW A; 1MGQ A; 2F2V A; 1Y07 A; 1M4Z A; 5GAM f; 3CD6 A; 3VS1 A; 4DOW A; 3CCM A; 3EG9 A; 1M3A A; 2PQW A; 3OYG A; 2QK0 A; 3QKJ A; 2R58 A; 2PUK B; 4XTZ A; 2DL3 A; 2CP7 A; 4QW2 A; 4X34 A; 1WHH A; 1UEB A; 4IUP A; 3EHQ A; 4E7I A; 5IHN A; 3OYA A; 3JB9 I; 3JCM Q; 5FRN A; 1PCX A; 2NUT B; 4EMK B; 2K6D A; 1PNJ A; 1R8O B; 4C5I A; 4FYX B; 1WI7 A; 3PNW C; 2CS7 A; 2MK5 A; 2J6F A; 2RA2 A; 1VQN Q; 1K0X A; 5LJ3 g; 1VQ4 T; 4D6W A; 2PU9 B; 3LWI A; 5A0G A; 2DEQ A; 1M5Q 1; 2MMP A; 4C92 F; 3QDR B; 3X28 B; 4J6W A; 1I07 A; 1YJW Q; 3VYH B; 2LDM A; 3I55 T; 1MMD A; 1GRI A; 3M56 A; 2DD5 A; 3HHT B; 3T9N A; 4B9W A; 5I22 A; 2DEU A; 2L0A A; 5J26 A; 1I1J A; 4JRQ A; 4M4Z A; 2MOX A; 3LYI A; 4M77 F; 1G5V A; 2DVJ A; 1C1A A; 2EKO A; 4ZN1 A; 1GBQ A; 3M53 A; 3JV3 A; 3MET A; 4OVA A; 5GAO m; 4M78 E; 2ECZ A; 4M7A F; 4A4E A; 2KGT A; 6AT1 B; 2NUP A; 1AD5 A; 1BIA A; 1E7O A; 2EQI A; 4P5N A; 4PFZ A; 3DLL A; 4JJB A; 1IO6 A; 1JJ2 A; 1AT1 B; 1Q7Y C; 4KUD K; 4LDX A; 1M2V B; 4J9D A; 4C5G A; 4DQ2 A; 1YIT Q; 2XK0 A; 2YUP A; 3BW1 A; 3CCJ A; 4N0A A; 3GNG A; 1Y96 A; 2CP2 A; 1YHQ T; 3EG9 B; 2ABL A; 5IXB A; 2DXT A; 4F16 A; 2EAY A; 3GOX A; 1IGQ A; 1Z9Q A; 4M78 D; 3V8J A; 4N0A C; 1KD1 C; 2EJ9 A; 1P92 A; 2E10 A; 3OYH A; 3M0T A; 4MDX A; 5GAO l; 2LJ0 A; 3RDV A; 3RKX A; 2VGM A; 4MZP A; 3INZ A; 4XU0 A; 4E47 A; 2FZK B; 3G4S T; 3CME T; 2KY9 A; 3A8M B; 2MIO A; 1FMW A; 3OSV A; 2XD0 A; 2AT1 B; 4ESR A; 1UTI A; 1WYX A; 4QQD A; 1Q82 C; 2CT3 A; 1MMG A; 1VIE A; 2QAS A; 4LD9 K; 4J9C A; 3EAE A; 2D6F A; 4IIM A; 5GAO r; 2MI6 A; 3DLM A; 3PGG A; 1DJ7 B; 1N6A A; 5FU7 C; 1VYV A; 3JB9 F; 2QQS A; 1AZG B; 2ZPG B; 1KSW A; 2EVR A; 5GMK i; 3ASK A; 5LJ3 j; 1VQP Q; 1ZA2 B; 3G6E T; 5CKB A; 3OY9 A; 3CD6 Q; 5HKC A; 2HNI A; 3SWN B; 3S3M A; 5KYU A; 2J6O A; 2C0I A; 1N5Z A; 1CKB A; 4C92 A; 1RUW A; 4HT9 A; 3GPL A; 1YJ9 T; 4YTL A; 1AHJ B; 1TSF A; 1VQ8 Q; 4F7U A; 2OTJ A; 5LL6 S; 2KYM A; 2QGG A; 4C92 C; 1OOT A; 1Y71 A; 1RLP C; 2XIC A; 2YRD A; 5CCA A; 4NS5 A; 4BY6 C; 1VQO Q; 1QKX A; 2LRQ A; 2DD4 A; 4F17 A; 2KT8 A; 1S72 A; 1SPK A; 4EMH A; 4M77 A; 2LMJ A; 3CCR A; 4C5E A; 4J6X A; 3SHW A; 2QEX A; 3QZ9 B; 1PSE A; 4OMO A; 4HCB A; 2KE9 A; 1B3Q A; 4A4K A; 3CCV A; 2VC8 A; 1VQ7 A; 1Y96 B; 1YN8 A; 2WSF E; 2DIQ A; 4O5V A; 1GCQ A; 4KUI A; 4M77 C; 3QSU A; 2CP0 A; 1LNX A; 3OB9 A; 2FZC B; 4ELY C; 4M7A A; 1N9R A; 3NFC A; 4BB7 A; 2I2L A; 5KYW A; 2YLB A; 3SFM A; 1M90 C; 3BE3 A; 3C12 A; 3QWY A; 2E3H A; 5LJ3 e; 1NJI C; 1M27 C; 1GCQ C; 2OTL Q; 2X35 A; 5J3B A; 5DLO A; 2EJG A; 2E5Q A; 3OS0 A; 4M7A C; 2XDP A; 1N8R C; 2HAX A; 3OYY A; 2F69 A; 1G2B A; 4LUD A; 2YXY A; 1TS9 A; 5FU7 B; 3PMT A; 1G3Y A; 2D8H A; 5FU6 B; 4PNO A; 2CH4 A; 1WPY A; 5IHK A; 2A0F B; 4CI0 C; 2EYQ A; 3JCM b; 2DO3 A; 2RHU A; 4RTZ A; 3G7Z A; 1HD3 A; 2E1H A; 3CBO A; 2E6N A; 2CH4 W; 1PC0 A; 2MF2 A; 2E64 A; 2RHI A; 3CC4 Q; 1MV3 A; 2DJZ A; 2C0T A; 4C8Q F; 4OP0 A; 3FIF A; 5GAM g; 1X6O A; 2CYZ B; 3HL8 A; 1WJR A; 4X9C A; 5KYU B; 1H3H A; 4A54 A; 2DPP B; 2KYB A; 4PJO E; 1OZ3 A; 1VQK T; 2KAF A; 5D7U A; 4C92 B; 1CSK A; 5M9O A; 3OYL A; 1KQS A; 4HKE A; 4BY6 B; 5GAO p; 1BI0 A; 3RNJ A; 1OPL A; 5I2M A; 1AZE A; 4JRK A; 3THK A; 3V8L A; 4F7U B; 1SG5 A; 3X24 B; 3AT1 B; 1HK9 A; 2FYK A; 1NG2 A; 2L89 A; 4JUV A; 4F14 A; 4DBH A; 2KT1 A; 4VUB A; 2CDT A; 2EYZ A; 4ORZ A; 3CCE Q; 4HXJ A; 5GAN 8; 3LGF A; 2DX1 A; 4M77 B; 2E70 A; 3X20 B; 4LDV A; 4FU6 A; 3FJP A; 4EDU A; 1WX6 A; 3PT9 A; 3CCQ A; 2LT4 A; 2GFU A; 1NPP A; 4BDZ A; 3N5B B; 2PTK A; 2O4X B; 2D0Q B; 4PJO D; 1TG0 A; 3VS2 A; 2YUQ A; 2YHT A; 1JXM A; 3QXE B; 3DB4 A; 1UGV A; 5KYW B; 2CKK A; 3DKM A; 4OMF B; 2HKQ B; 2MYS A; 3CC2 Q; 4HVU A; 1NE8 A; 1U5S A; 1WXU A; 2EBP A; 4LN2 A; 2GQV A; 1RI9 A; 5HCK A; 3M58 A; 1YCY A; 2QDY B; 2Y4Y A; 2WAC A; 1M9S A; 4LDY A; 1HSQ A; 4Z8A A; 3A98 A; 4GLM A; 4WCI A; 2JVV A; 2DRK A; 1XTD A; 1KQS S; 5KCO A; 2FEI A; 2LX9 A; 4NL3 A; 2P4T A; 2JT4 A; 5AYF A; 3L2Q A; 1S72 Q; 1KG1 A; 1ABQ A; 3JCM W; 4OB3 B; 1MMN A; 1ACM B; 1VQN A; 3QDF A; 1TU0 B; 2XMF A; 1QLY A; 1MND A; 1JEG A; 2V26 A; 1OPK A; 2KRS A; 2LCS A; 1UG1 A; 3CBP A; 2DK3 A; 3LLR A; 2F5K A; 4RG2 A; 2HBW A; 3OQ5 A; 1UUE A; 3LH0 A; 2QI2 A; 2RO0 A; 1YIJ Q; 1G3S A; 3QYH B; 3I56 T; 2VB6 A; 8AT1 B; 2K2M A; 1VOM A; 4CC3 A; 2AZV A; 2JW4 A; 3JCM h; 3MEW A; 1I5O B; 1Q86 U; 4XU3 A; 3J7A F; 1JRI A; 3RBB B; 5GAM j; 1MUZ A; 2AK5 A; 4DOV A; 1Q86 R; 3UAT A; 3MKD A; 3AHU A; 3CCS Q; 3CQT A; 2ENM A; 2HDA A; 1QWF A; 2GCX A; 4C8Q A; 4HCC A; 1V76 A; 1WFW A; 3OS2 A; 1VQ7 T; 2EYY A; 1I4K 1; 3G71 T; 4BI8 B; 2Y4X A; 4RTT A; 1X69 A; 1VIF A; 2RF0 A; 3HRT A; 1YI2 T; 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