The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
TVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Ephrin type-A receptor 2
|
| publication title |
Structure and function of the EphA2:SHIP2 SAM domain heterodimer
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
20
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2010-01-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EAN A; 1X40 A; 2E8O A; 1WWV A; 4IS7 A; 2E8P A; 2KSO A; 1B0X A; 2KE7 A; 3TAC B; 1F0M A; 1RG6 A; 1UCV A; 1PK1 B; 1SXE A; 3K1R B; 5KNI A; 5JRT A; 2QB0 A; 2Y9T A; 2DKZ A; 2E8N A; 3BS5 B; 5JU5 A; 2YTU A; 2EAP A; 1COK A; 4NL9 C; 2QB1 A; 1Z1V A; 2FE9 A; 2QB0 B; 1PK1 A; 1SV0 C; 2DKX A; 1X9X A; 4MHV A; 4NL9 A; 1B4F A; 2QKQ A; 2F44 A; 2B6G A; 3KKA C; 1SV0 A; 2F8K A; 3BS5 A; 1SXD A; 1OXJ A; 2QAR A; 2Y9U A; 3KKA A; 2L5Y A; 2GLE A; 3HIL A; 1PK3 A; 3IDW A; 1KW4 A; 3SEN A; 3H8M A; 3TAD C; 1SGG A; 2ESE A; 2QAR B; 2D3D A; 5JTI A; 3BS7 A; 3TAD A; 3SEI A; 4PZN A; 4PZO A; 2JV3 A; 1V85 A; 2EAO A; 1SV4 A; 2K4P A; 1X66 A; 3BQ7 A; 1OW5 A; 2E8M A; 2K60 A; 1JI7 A; 5F3X B; 2LMR A; 4RQN A; 5J8Y C; 2KIV A; 2ES6 A; 5J8Y A; 2KMD A; 2LPE A; 4RQM A; 1LKY A; 5L1M A; 2KSO B; 1V38 A; 1UQV A; 4NJ8 A; 1DXS A; 1WWU A; 2F3N A; 2D8C A; 1LKY B; 2EAM A; 2DL0 A; 2KG5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4F4W A; 1X2I A; 5AM5 A; 2E8O A; 4IS7 A; 3UQ2 A; 2PKE A; 2ALZ A; 1ZQC A; 2YQE A; 1L3T A; 4KIT B; 1F0M A; 1Q3U A; 5JRT A; 3S6J A; 2E5S A; 5KG0 A; 4PPX A; 3DEE A; 4ZH4 A; 1KN5 A; 2YB4 A; 5KFG A; 1RYS A; 3ZDC A; 5KFS A; 4F4Z A; 1Z1V A; 3QUT A; 2KHQ A; 2V4R A; 3H8J A; 2JRZ A; 4CNQ A; 2BCV A; 4J9K A; 3KHL A; 4EYI B; 1RPL A; 1RDF A; 5DG7 A; 1ZQZ A; 4C8M A; 4YMN A; 5DLF A; 4P0P B; 2RDI A; 3HIL A; 5J0T A; 1ZXI A; 3BQT A; 1ZQU A; 1SGG A; 3M8S A; 4DSL A; 3AEV A; 1TE2 A; 5KFX A; 4DSE A; 3RAQ A; 1S77 D; 3ED5 A; 4C8N A; 4C7Y A; 9ICL A; 1EXN A; 3I1Y A; 2EZX A; 1MA7 A; 5AHX A; 2ZXH A; 5C0Y A; 1DRG A; 3D2S A; 4UB5 A; 4BJQ A; 2FPK A; 3A0H U; 4RUA A; 1NJW A; 5ALM A; 2H3I A; 2JR5 A; 2OH2 A; 1BPX A; 2PXI A; 3L5K A; 5KFC A; 4QZB A; 1J97 A; 1YZ6 A; 4EEN A; 2FMQ A; 4C0Z A; 3NVZ A; 5ALV A; 4M9H A; 4EX7 A; 4YXM A; 1WWU A; 3K4G A; 1L3U A; 4RPX A; 3VC8 A; 4NV0 A; 3PSI A; 5KT3 A; 2H3F A; 4JWM A; 4C4S A; 5JTI A; 2MUT B; 3MGV A; 3SYZ A; 4EZ9 A; 2FLL A; 3CYM A; 3ISD A; 4USA A; 1Z1B A; 5DBB A; 5L1J A; 3ZDE A; 2RLT A; 4EX6 A; 4Y2S A; 5KFP A; 5KT2 A; 4F4Y A; 1CEZ A; 4YG2 A; 1V97 A; 4K4H A; 4O5K A; 4YR3 A; 3M1Y A; 4E0D A; 5KNI A; 4QZ8 A; 2BZF A; 2QB0 A; 1UT8 A; 3MR6 A; 9ICW A; 5AK3 A; 4YP3 A; 4FS1 A; 1XSP A; 7ICR A; 5ALW A; 3L3F X; 1KL9 A; 1ZQY A; 3UMC A; 4U7C A; 2VA3 A; 1UT5 A; 1PK1 A; 2DKX A; 4NXZ A; 5DBA A; 4J9M A; 2IOH A; 1NK9 A; 4DOC A; 3TFS A; 3PSP A; 3QU4 A; 4PGY A; 1XC9 A; 4X5V A; 3GV5 B; 3MFH A; 3QYP A; 1PK3 A; 4YN4 A; 5J2E A; 3ZDA A; 8ICH A; 3NRZ A; 3SEN A; 2R8G A; 5KFR A; 1QQ6 A; 7ICT A; 3OSN A; 4DQI A; 1ZQW A; 5ALU A; 4QZH A; 3SEI A; 4MFA A; 2OCE A; 2C2D A; 8ICL A; 3MGI A; 2HBJ A; 2EAO A; 5AI9 A; 2K4P A; 7ICP A; 2ZIX A; 1Q3V A; 9ICE A; 2UVR A; 4QWE A; 2XGP A; 1OW5 A; 1A77 A; 1RQL A; 5CEH A; 3EWA A; 4YVZ A; 2JEG A; 2IOF K; 2ODG A; 2BDP A; 8ICJ A; 4QW8 A; 4YQW A; 4OO1 J; 2YX8 A; 1ZQM A; 4O3N A; 3UMG A; 1XS9 D; 2JH7 A; 7ICU A; 2KVC A; 1ZD3 A; 2KFZ A; 3TAQ A; 3IP4 B; 1T94 A; 5KFZ A; 3TKA A; 3V72 A; 2EAM A; 4M6W B; 5GTI U; 1ZQS A; 3RB3 A; 1T4G A; 1TAQ A; 4NLZ A; 2E8P A; 2Q4T A; 4BDP A; 3JPR A; 3CRX A; 5CRX A; 4RPY A; 2HOI A; 2GH1 A; 3ZI4 A; 2KV2 A; 3QZ8 A; 3RH6 A; 1L3S A; 8ICV A; 3M6Z A; 5IIN A; 4O3O A; 3NTU A; 1JUD A; 5G5G A; 4UB6 U; 1NKC A; 2ZIU A; 5AKK A; 1COK A; 5J2H A; 1JXE A; 4US8 A; 1KBU A; 9ICP A; 2DPJ A; 2DQN B; 1U4B A; 5AKG A; 1LV5 A; 3TAP A; 2ZTD A; 5KFT A; 4BWM A; 3MDA A; 1XWL A; 2A19 A; 2G06 A; 5AM2 A; 3E58 A; 5A0L A; 1A0P A; 1U45 A; 5E79 U; 1D9F A; 3MR5 A; 1ZQP A; 1SWV A; 3RJF A; 3TAD C; 4KLT A; 4NLB A; 5AI6 A; 2FPM A; 5KFI A; 3TAD A; 5KG4 A; 3C1Y A; 3EPI A; 1HIW A; 3RB6 A; 2IOF A; 3V6J A; 2G5I B; 3BZK A; 4EEL A; 4UB2 A; 4NLG A; 2IMW P; 3AUO A; 4G9B A; 2PI5 A; 4B9U A; 7ICN A; 3WK4 A; 2LYB A; 9ICN A; 4CF5 A; 2Q0Z X; 3B9J A; 3NAS A; 3QUB A; 5ALI A; 4XA5 A; 2HHV A; 2KIV A; 5J0X A; 1SZP A; 1N61 A; 4DQP A; 2YMM A; 3N7P D; 3ISB A; 5KFJ A; 2K89 A; 2KMD A; 2EH9 A; 2HHU A; 1Z00 B; 8ICI A; 4RQ2 A; 2WB1 F; 3TAR A; 2MSN A; 3UPQ A; 3IHQ B; 4M9G A; 3RJK A; 4UAZ A; 4CGZ A; 4J9O A; 3TI0 A; 5KTQ A; 1KFS A; 2WB1 C; 2EAN A; 1X40 A; 3UM9 A; 3HPO A; 1S0N A; 5AKZ A; 3U26 A; 2CRX A; 2AJQ A; 2NRT A; 4YD1 A; 1BNO A; 5HML A; 4RPZ A; 2J6S A; 2YMQ A; 3N4M B; 2H3V A; 1PK1 B; 2OWO A; 4B6J A; 2BCU A; 5CJ7 A; 4F93 B; 3MC1 A; 4TUP A; 4XRH A; 4JMU A; 8ICB A; 2EDU A; 4PH5 A; 3LDA A; 3HW8 A; 4F5R A; 1NJY A; 2ZIW A; 2W11 A; 3H0L B; 3NVV A; 2GLE A; 1CUK A; 3A0B U; 3RRH A; 1X9S A; 5TZV A; 4F3O A; 5J0Q A; 2JXJ A; 2ZIX B; 2DBY A; 2XID A; 3PW4 A; 2CXY A; 1Z4O A; 1D8L A; 3FC4 A; 1N63 A; 2AGO A; 5B5E U; 5J0O A; 1V9P A; 4KLI A; 1ZD4 A; 1JXL A; 1SKR A; 5ALQ A; 3LWM A; 2P6U A; 2E8M A; 5G5H A; 5AM3 A; 3JPN A; 7ICG A; 2VA8 A; 4J9L A; 4I2F A; 1N56 A; 2G0A A; 3NRW A; 4J9P A; 4PL2 A; 4RQM A; 2F77 X; 2NRX A; 4CE6 A; 5J0S A; 2OEH A; 5KFE A; 2EZY A; 3SQI A; 3UMB A; 2OXO A; 5L1M A; 1UA0 A; 1ZQV A; 1PVP A; 5C5J A; 1PVQ A; 2F3N A; 2VIX A; 2JGA A; 1T3N A; 5IIO A; 2LYA A; 1JRO A; 3JPP A; 9ICG A; 4BWJ A; 3RAX A; 1OUQ A; 7ICH A; 2G07 A; 2HVH A; 2W43 A; 2KSO A; 5KFO A; 4OJ5 A; 5J2D A; 3PVX A; 4ZOH C; 2J6U A; 4IL6 U; 9ICM A; 3EUB 2; 5ALO A; 2A1A A; 1VDV A; 3PZP A; 2KHV A; 2Y9T A; 1TVA A; 4K4I A; 2KJ9 A; 4KLL A; 1F5S A; 4ECS A; 3PMN A; 7ICQ A; 2B21 A; 3E0F A; 4TUR A; 1SKS A; 7ICS A; 5J2J A; 1SV0 C; 3WKE A; 4KLG A; 5DQG A; 2N1R A; 4R8U A; 2P6R A; 3WK8 A; 1SV0 A; 2R8K A; 4Y2Y A; 8ICE A; 4C4T A; 2RP5 A; 1QTM A; 1L7O A; 3F5E A; 1KW4 A; 1L7N A; 4FBU A; 2BCQ A; 4Q8E A; 4DOB A; 5BOM A; 4RQ6 A; 3TQ1 A; 1WUD A; 1NZP A; 1BVS A; 2C2R A; 4ECZ A; 4QIW F; 4IQW A; 3IV6 A; 7ICO A; 4BGD A; 2FMP A; 4RQ4 A; 3G6X A; 1ZOL A; 3M9M B; 1TKD A; 2K60 A; 4EEY A; 1JI7 A; 4I2E A; 2WAQ F; 1IM4 A; 1L7P A; 2WFA A; 9ICK A; 4YR2 A; 1WYG A; 3BJY A; 4MFF A; 8ICU A; 2WAQ C; 2M9N A; 3QU5 A; 4DFD A; 8ICR A; 5L9X A; 4F92 B; 3WKA A; 4ED1 A; 1NI3 A; 4WJ3 B; 4O3S A; 1ZQA A; 3NGD A; 1NK6 A; 1MC8 A; 2DL0 A; 3LVW A; 1Z3E B; 1CRX A; 1T8E A; 4DS4 A; 1WCN A; 2OM6 A; 4Q45 A; 3HRD D; 3RJJ A; 1ZQI A; 2WF6 A; 3B0X A; 4GXJ A; 1UCV A; 4EBC A; 1MQ3 A; 3QXG A; 4F50 A; 4UB1 A; 5CR0 A; 4O5E A; 2ZIW B; 3C1Z A; 2YTU A; 1DOQ A; 5J2A A; 2EAP A; 3RF9 A; 1VJ5 A; 2FE9 A; 4YFK A; 8ICY A; 2AXT U; 1X42 A; 4MHV A; 1B4F A; 3RBE A; 4CRX A; 3HX0 A; 8ICW A; 3KKA C; 8ICF A; 1NKE A; 3KKA A; 2HI0 A; 2HHS A; 4QZG A; 4U6P A; 1J2M A; 2W9C B; 2NV3 A; 4TUQ A; 2W9A A; 5DDY A; 5IIL A; 4IRK A; 3PW2 A; 2MU2 A; 1ZQB A; 3H4B A; 4TUS A; 4ED7 A; 4PZN A; 5IIK A; 4LZG A; 2MRL A; 2H3Q A; 3TAN A; 4O5C A; 3HWT A; 4DL3 A; 2W55 A; 4ECX A; 4OD0 A; 5DQI A; 2ISP A; 9ICT A; 1NK4 A; 1C20 A; 3HJE A; 3H8W A; 4P2H A; 5J8Y C; 5KL8 B; 4F72 A; 1LVH A; 1NNL A; 4FZN A; 1TAM A; 4KN4 A; 2W8K A; 4HYK A; 4F5P A; 9ICR A; 5J8Y A; 2AGQ A; 2ZTE A; 1N62 A; 5AM4 A; 1HEK A; 4QZF A; 3PV8 A; 1DK2 A; 2KSO B; 5EE0 A; 1UQV A; 2EZZ A; 5DG9 A; 1KTQ A; 4UAW A; 1ZQJ A; 1YZ7 A; 2F76 X; 3GU3 A; 3C21 A; 3BQ2 A; 3C2L A; 1QSS A; 4OJP A; 4QZA A; 5KFN A; 3SV4 A; 2G5H B; 2R8I A; 3KFU F; 4B9L A; 3LK9 A; 5GTH U; 4US9 A; 3L4P A; 2ATL A; 4CCH A; 2VJ5 A; 3MAB A; 2W04 A; 4ED3 A; 2WF8 A; 2BR0 A; 5L1I A; 1RQN A; 1ZQ1 C; 1L8O A; 2FPL A; 2IHN A; 4RQ7 A; 5KAI U; 3QNM A; 4NM2 A; 1N5W A; 1ZQG A; 1XSN A; 2W8L A; 4RNO A; 4DQR A; 1OXJ A; 5EE3 A; 1RXV A; 3GV8 B; 2W54 A; 5DB9 A; 2JMG A; 1S8O A; 3M8R A; 4BXO A; 2HSZ A; 5KFA A; 4YMO A; 4AYB F; 3PW5 A; 2UVU A; 7ICE A; 4PHE A; 2GOL A; 4O9M A; 4JV1 A; 3LVV A; 3EYZ A; 1ZQQ A; 3RFA A; 2HHQ A; 3I76 A; 4AYB C; 4PL1 A; 2PFN A; 8ICS A; 5HR6 A; 2FJ6 A; 2A1J B; 1QQ5 A; 4OJO A; 2KP7 A; 4J9R A; 3F2C A; 5AIB A; 3RB0 A; 2XY7 A; 2NYV A; 4F8R A; 4PHD A; 2LHT A; 4P4P A; 4IRC A; 4KLE A; 8ICA A; 2J6T A; 5AKX A; 1FFV A; 4F91 B; 1V38 A; 2FI1 A; 2ZXI A; 4DSJ A; 3C28 A; 5AKY A; 5IIM A; 3DV9 A; 2BCS A; 2DFL A; 2K4E A; 1RM6 C; 3PSF A; 2HBL A; 3SMV A; 2HBM A; 2AQ4 A; 4YXJ A; 4KX3 A; 2ZJA A; 2AQ0 A; 4F4K A; 4I2A A; 1O08 A; 5AI0 A; 2JH1 A; 4QZE A; 4RT2 A; 1BPZ A; 4KMU A; 4Y2Q A; 4BX9 C; 3SI8 A; 1NKB A; 3BZC A; 4I27 A; 1BNP A; 4B9N A; 4MEY A; 4ELT A; 4YMM A; 4FZL A; 2QAR A; 4ECT A; 5HHI A; 4Z6C A; 2P66 A; 5KT5 A; 3QU9 A; 4C80 A; 2KNJ A; 5DLG A; 5KT6 A; 3PML A; 2R18 A; 3WK7 A; 2NO5 A; 4FFD A; 4UB3 A; 2FDR A; 2W9M A; 5DG8 A; 2H5X A; 5J2B A; 2JV3 A; 1V85 A; 3V7J A; 1BPY A; 1U48 A; 3AL0 B; 1TFR A; 3KZX A; 3QUQ A; 4UAU A; 1ZQX A; 4ACO A; 2W3R A; 3M9O B; 4RQN A; 9ICQ A; 1KQQ A; 5H2F U; 2ZUD A; 4P0Q A; 3IRU A; 3JPQ A; 3Q8K A; 3UXN A; 3H40 A; 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1ECW A; 2Z7J A; 4KMO B; 2HOF A; 4LZD A; 8ICX A; 3K75 D; 2KEY A; 4ECU A; 5FP0 A; 5IIJ A; 4R63 A; 3GIK A; 3H0R B; 2F1H A; 1JX4 A; 1B0X A; 4I28 A; 2KE7 A; 3OPX A; 2VKQ A; 4KN7 A; 2UVW A; 2MAX A; 4M9J A; 4J03 A; 1SXE A; 4I2J A; 1IV8 A; 9ICJ A; 1C7Y A; 2BQR A; 3H8S A; 4ICA A; 4G3I A; 2XC9 A; 5KFD A; 2P35 A; 1ARO P; 5ALS A; 4GLX A; 4YCX A; 9ICV A; 4QZC A; 2C22 A; 4B9S A; 3MBY A; 2AGP A; 4EZ6 A; 2QB1 A; 3SV3 A; 3RH5 A; 3N97 B; 4ECQ A; 5AKL A; 4HAI A; 1Q8K A; 2ZIU B; 2F44 A; 3MGH A; 4MF8 A; 7ICJ A; 3WK6 A; 2W7O A; 4IR1 A; 5KG2 A; 3BQ1 A; 2HW3 A; 3H8M A; 1M6Y A; 4EYH B; 3PO5 A; 3CP8 A; 3JPT A; 2ISO A; 5K4L A; 3T3F A; 1U49 A; 1JN3 A; 1QCK A; 4B9V A; 1ZRM A; 3RR8 A; 4RUC A; 3V7L A; 4JV2 A; 3RJI A; 4C8L A; 3IM1 A; 4F2S A; 2E1F A; 5T14 A; 3K1Z A; 5KT4 A; 1N60 A; 8ICZ A; 4F5O A; 1IG6 A; 4C4R A; 3QZ7 A; 2XY6 A; 2KFN A; 3EZ5 A; 1RYU A; 1VLB A; 4KLD A; 7ICF A; 4UAT A; 4MF2 A; 1Z4N A; 3GV7 B; 5ALD A; 1JAL A; 2QLT A; 3QE9 Y; 4QWA A; 4GIB A; 2F2A B; 2KZZ A; 2GO7 A; 4UW9 A; 3NVY A; 9ICU A; 1AQ6 A; 3ZDB A; 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