2KTYA

Solution structure of human vaccinia related kinase-1
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
360
structure length
360
Chain Sequence
MPRVKAAQAGRQSSAKRHLAEQFAVGEIITDMAKKEWKVGLPIGQGGFGCIYLADMNSSESVGSDAPCVVKVEPSDNGPLFTELKFYQRAAKPEQIQKWIRTRKLKYLGVPKYWGSGLHDKNGKSYRFMIMDRFGSDLQKIYEANAKRFSRKTVLQLSLRILDILEYIHEHEYVHGDIKASNLLLNYKNPDQVYLVDYGLAYRYCPEGVHKEYKEDPKRCHDGTIEFTSIDAHNGVAPSRRGDLEILGYCMIQWLTGHLPWEDNLKDPKYVRDSKIRYRENIASLMDKCFPEKNKPGEIAKYMETVKLLDYTEKPLYENLRDILLQGLKAIGSKDDGKLDLSVVENGGLKAKTITKKRKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase VRK1
publication title Solution Structure of human Vaccinia-Related Kinase 1
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 67
structure length 360
sequence length 360
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ktyA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ktyA01
3FQHA 4OW8A 5TT7A 4S2ZA 3ZYAA 4BHNA 5A14A 4BIDA 4J8MA 2WTCA 3HUCA 2XK4A 3PA3A 1AQ1A 5HE3A 3RZFA 4G3FA 3UOHA 2UZEA 2VX3A 1LPUA 3QRKA 4U97A 2VU3A 4AW5A 4PDOA 4OLIA 4RGJA 4AZTA 3BIZA 5CU4A 5T6KA 1FINA 2PZRA 4AUAA 3IW6A 3KU2A 1KE6A 2E9NA 4AGCA 3HVCA 3U9NA 5FXQA 4DLIA 5DRDA 2XA4A 3W8LA 1Q8YA 3MV5A 3VS3A 4AN9A 3PIXA 4HPTE 1YI6A 5M44A 3V51A 1A9UA 4M14A 5AM6A 2EXMA 5CSVA 3ZUVA 4I5MA 4AZVA 3R9OA 4EOPA 5L8KA 2REIA 5HLNA 3Q5ZA 3T9TA 5J79A 1O6KA 4I0RA 3EKNA 5FTQA 2HZNA 2W4KA 3Q4TA 3HP2A 3NUNA 3GFEA 4EK6A 5J5TA 2C5XA 3OF0A 2QVSE 1CM8A 1J3HA 4ACHA 4BN1A 2W1FA 4PL3A 2XM8A 3QZIA 3EQPA 2VTLA 2QODA 3Q4CA 2XS0A 3Q2MA 4MWIA 4UB7A 5E8SA 1SZMA 4MCVA 5C8MA 3I4BA 2WNTA 5TKDA 2BIKB 1WVWA 2DUVA 2EWAA 2YJSA 2OH0E 2BPMA 3MIAA 3P1AA 4IDVA 2PY3A 4FSNA 4RWJA 4UYNA 3TXOA 3MTFA 4XX9A 3BZ3A 3R7GA 3PPKA 3PSBA 4KSQA 2PZIA 3W8QA 4YHTA 3FLSA 2J51A 3FEGA 1G8SA 3MYGA 2XKEA 3EN4A 2FUMA 2DYLA 3DBDA 5ANKA 4CG8A 1P4OA 2CNUA 3E3BX 2YLFA 1STCE 3MJ1A 4KD1A 3ZOSA 5GHVA 3DZQA 4APPA 3BYVA 4WO5A 4EH3A 1IA8A 4YJNA 2GNFA 4NKAA 5C01A 4BCHA 3LJ2A 2JKOA 3A7JA 3DS6A 1BI7A 3RJCA 2VWUA 2IZUA 1ATPE 3KL8A 4OAUC 5FD2A 5CNNA 2GMXA 2YM8A 4P90A 1U54A 1Y91A 2BR1A 3CGOA 2YIWA 3QALE 3ULZA 3TNPC 3G6HA 5HO6A 3TV4A 2HY81 4O0XA 5FXSA 2R2PA 3GU8A 4FIFA 3RI1A 4AOJA 4IWPA 2VTRA 2WEIA 3DB6A 4V01A 5F1ZA 4EZ7A 3I81A 4BTJA 3FLYA 4KBAA 3IW5A 3R63A 4FV4A 2WTJA 4QMTA 3SRVB 1R0PA 2UW0A 3DLZA 4EUUA 4FG8A 5EW8A 3TWJA 4E5BA 1YI3A 2YAAA 4C3FA 3NNXA 3Q60A 4YJUA 2W1HA 2XK6A 3C1XA 1NY3A 4PDYA 3E62A 2PUIA 4EJNA 3UZRA 3NRMA 3MVLA 3DKOA 2WTWA 4XG2A 5DEWA 2YEXA 3FL5A 3RM7A 2EB3A 2OU7A 3SAYA 4BDIA 4JG8A 4KKGA 5L2IA 4JX7A 1OBGA 2X81A 1Q62A 2VX1A 3F5XA 4I6FA 4O0YA 3VUGA 4BBFA 2O64A 5GINE 4X3FB 3UG1A 1S9IA 3QTUA 2IVTA 2F7ZE 3FUPA 2VD5A 5AP4A 5EM7A 5JGDA 2XEZA 3OT8A 4H3PA 1H08A 5LCJA 1H1QA 4GJ3A 3OUNB 3D83A 5I0BA 3O50A 4I6BA 3IW7A 2FSTX 3EFJA 4E1ZA 2R3KA 4PL5A 4BI0A 5DA3A 5C4KA 1IEPA 3HV4A 4RWKA 3KXNA 4E7WA 1GZNA 2PVMA 4F1OA 5LMKA 4YPSA 2HZ4A 1ZY5A 2VO3A 5CU6A 1G8AA 4FTCA 1FMOE 2XK3A 2C6EA 5HO8A 4WBOA 4ZTNA 1SVGA 3ORZA 3VW8A 4MTAA 3CEKA 3I0OA 3ZRMA 2GTNA 2ITOA 5LVOA 3K5VA 3QQHA 5AM7A 2GPHA 5AJQA 1XBAA 1TQIA 4PMTA 4XRLA 2GFCA 4HVHA 4HCVA 4RRVA 4O21A 4RWLA 3HUBA 5AR7A 5IQBA 4IZ7A 3ET7A 4X2FA 1W98A 4CT2A 5CEMA 2W17A 3R9NA 4RVLA 3UYTA 3QQUA 3PFQA 4F65A 1IASA 4RX7A 3D4QA 2F49A 2PMNX 3PJ2A 2O2UA 4O0RA 4W9XA 4CQEA 1HOWA 4B8MA 5CANA 3BX5A 5EM6A 2WGJA 3ERKA 4DN5A 5CENA 3HGKA 5FRIA 3QU0A 1LP4A 2CMWA 2H34A 1OIQA 2YDKA 3EFLA 3T8OA 4DTKA 4ITHA 4UV0A 3PVWA 4YC8A 4QNYA 3SX9A 5IZFA 2WAJA 1E1VA 3HMOA 4LMNA 5I5ZA 3GFWA 4KNBA 4PPAA 2GHLA 3OXTA 4ALVA 4R5SA 1MQBA 3MFSA 3VAPA 4TNBA 2C68A 3FSKA 1TVOA 5HI2A 3E64A 5EOLA 5JH6A 1JVPP 2YA9A 2WFYA 1M14A 4C7TA 4HVIA 2QR7A 2ZV7A 5FP6A 4ALWA 3G9NA 3NYNA 4IAZA 4QMWA 2QLQA 4WSYA 3L1SA 5G1XA 4D4SA 3MY0A 1JPAA 4PTCA 4YO6A 3AD6A 2A4LA 3A8WA 4BKZA 2XJ2A 5C8NA 3SGCA 2BUJA 5EQYA 3DA6A 3EQRA 1GNGA 4OT5A 3TDVA 5BVOA 3BQCA 4I23A 3Q96A 5HNBA 2QQ7A 3Q4UA 3TACA 1J91A 1FBNA 2VX0A 3QGWA 4D2TA 4DFUA 3A4OX 4HYUA 3BWJA 4YJSA 5J95A 1PMNA 3Q5IA 3RTPA 4PWNA 4FV8A 4PX6A 2ETKA 2G2FA 3ORXA 5CZIA 3FMNA 3SA0A 4RJ6A 3W2SA 2PU8A 2VWWA 3FZPA 4C37A 4F6WA 3U87A 4JR7A 1WBPA 3LQ5A 4F6UA 4AN2A 4C57A 5I4NA 3ZXTA 2WIPA 4NT4A 2CGWA 3R83A 3RMFA 1SMHA 2Y7JA 3UGCA 3R0TA 4YSMA 2VWXA 3I1AA 3Q2JA 4FTKA 3VUIA 4FTRA 5LARA 3W55A 5B2LA 2GS7A 2Z60A 2XIRA 4QYYA 4D2RA 2OICA 4E6AA 4QP8A 5M57A 4FKQA 3HMIA 4AXAA 4A9YA 3HA8A 4ZTQA 4O27B 4RQVA 3HNGA 3HEGA 3PXZA 3RWPA 5JRQA 2H8HA 4K33A 3ULIA 3F7WA 2XBJA 2QC6A 4UEUA 4YC6A 3ROCA 1ZY4A 4LRKA 3OCGA 1GIIA 4FVQA 1O9UA 3PRIA 3ZCLA 4CZTA 2YCRA 3VS4A 3EFWA 2IW8A 3GC8A 3AQVA 4Z16A 1PKDA 3P23A 2C4GA 3SLSA 4GKIA 3DBQA 3HRFA 3U6HA 2QLUA 3PTGA 4FF8A 3TV7A 3LXPA 3QUEA 2YFXA 3FMHA 4IWQA 3F3UA 4AA4A 4PTGA 3A7IA 2WB8A 3FL4A 3L9MA 5HIDA 5EDPA 2R3MA 4ANOA 4ZZMA 3V8SA 4GUEA 3A7HA 2BKZA 3AC3A 3EN6A 4I94A 4BZNA 4UYAA 1F3MC 4FV9A 4F1TA 5CI7A 4F70A 3SC1A 3NSZA 4BKYA 5GIPE 2J50A 1A48A 1M7QA 2Z2WA 3NWWA 2BZJA 2XVDA 2G1TA 3CTHA 1XH7A 2BMCA 4CEGA 4FSWA 4D5KA 4YTHA 1XJDA 3FV8A 1Q8UA 3L9PA 5FBOA 3ZFYA 4QPMA 4C4GA 2WO6A 4QMXA 4W4YA 4EOKA 4EOOA 4CCUA 1ZYLA 5IMXA 1QCFA 2X8DA 4FODA 4UMQA 5A4CA 2BRGA 3OXZA 4H58A 2C3JA 4QMMA 2O5KA 4DFLA 1G5SA 2W5AA 4YR8A 5IQIA 4IZAA 5CXHA 1DM2A 5IF1A 4QMQA 3GP0A 3D0EA 4JG6A 1ZYJA 3CY3A 3MBLA 3MWUA 2QHNA 1R0EA 4QD6A 2GTMA 4JR3A 3KXHA 3VF8A 4RLKA 5DPVA 1O6LA 4FKPA 4ZSAA 2F4JA 2BDFA 2C1AA 4AOTA 2PWLA 3E92A 3I79A 4XG7A 2JDSA 4KBKA 5ACKA 4L6QA 4CYJA 3RVGA 1TQPA 2RF9A 2R3LA 3GUBA 4YHJA 3MJ2A 1UNGA 4BCQA 3OROA 5DT4A 4RZVA 2VTQA 4TZRA 2J90A 2YISA 4FSTA 4HCUA 2PK9A 3LCOA 4I5HA 4AWIA 4YLLA 5TO8A 4FT5A 4Y85A 5AUVA 4W4VA 1OI9A 3IS5A 3VIDA 3W1FA 2WD1A 4U3ZA 3KN6A 1JNKA 3CS9A 4IAIA 3G6GA 4I4EA 4FNZA 4DCEA 2OJ9A 3PXYA 1U54B 1H27A 2ITNA 4TN6A 5IA1A 5AUZA 4O7ZA 4GT3A 2YCFA 3ZH8A 4FZ6A 4BDHA 4N0SA 3PA5A 4QMNA 5CALA 4O7SA 2JKKA 4X3FC 3PA4A 5CSXA 4O83A 4RFMA 4ZOGA 2C3KA 2C3IB 4DFXE 4AS0A 3ZSHA 3NUXA 4FTIA 1XH5A 5AX9A 3PSDA 3RAKA 5K3YA 3S2PA 3WF6A 3UIBA 1VZOA 3FI3A 5D7AA 2J0JA 4DFBA 4DGGA 5IQHA 1QPDA 3BYSA 4FTUA 2JFMA 4QQJA 5DIAA 2BDJA 4G6LA 3B2TA 4DCAA 5ANOA 4GJ2A 3ZUTA 2YM7A 3IPHA 4Y95A 3QTZA 5EHLA 5CAOA 5E1SA 5HBJA 5GZ9A 5H9BA 3D5XA 2ITYA 2O65A 1UWHA 3PVUA 2CKQA 3EQDA 1Q99A 4O7WA 4LOOA 1EH4A 3BEAA 3IG7A 3KMUA 2G15A 3EIDA 4M66A 5A54A 1AD5A 2OH4A 2OJIA 3AMAA 3M2WA 4I20A 1R39A 4IM3A 3R7EA 5E9EA 4HGTA 1SNXA 3HV3A 4BWXA 4BCPA 1WBOA 4CRSA 5E8YA 3O0GA 3DV3A 4FK6A 3HRCA 1J1BA 5HD4A 3R1YA 4Z7GA 3VJNA 4G6NA 4JQ8A 4S34A 1UU8A 4D4VA 2I6LA 3N4TA 2FSOX 4QMLA 3V6RA 2PL0A 3RP9A 2JAMA 3ZO4A 4G5PA 4NCTC 5FTOA 3C4WA 5AEPA 1TQMA 2BRBA 3UNKA 4GG7A 4UX9A 4IQ6A 5KMKA 3NVKI 1BLXA 3VQUA 2QO9A 3V01A 4JDIA 3ACJA 4I6QA 4IMYA 1JQHA 5JMSA 4RJ3A 1OGUA 5DLSA 2JDTA 2YIQA 4GT5A 4M3QA 5A6OA 5EQPA 4JIKA 5EHOA 3TUBA 1MP8A 2BZKB 2IZRA 2J0MB 4OTGA 1CTPE 4GK3A 4F09A 3DKCA 5M09A 3LFNA 4M69A 2X2KA 4FL2A 5GJGA 5CY3A 1XHAA 4QMUA 4RG0A 4I6HA 4Y72A 1UVRA 4A7CA 5EDRA 4DGOA 1JSTA 3HA6A 1YXXA 2W1CA 4UMTA 1DS5A 3QQJA 4GK4A 3R8LA 3ZMMA 3OP5A 4BGHA 4BI1A 4FKUA 4EH4A 4UZHA 4AW1A 4F0FA 4KBCA 4DYMA 3R8VA 4J8NA 4YBKA 1XR1A 3VUHA 4DEBA 4O7LA 4IX5A 2UVYA 3QTQA 5KCVA 2HZ0A 4YJTA 4YC3A 2YIYA 1YI4A 3H9OA 5AP3A 4MD9E 3TNWA 4YO4A 1YQJA 3HMMA 4K6ZA 1QPCA 5M07A 3JYAA 3W33A 4ZY6A 3UYSA 3DT1A 3DJ5A 3UVRA 1GZOA 4TKSA 1F0QA 3ALOA 4NIFA 4NUSA 4E6CA 3GXLA 3L8XA 2QURA 4MXAA 4IB0A 2YIRA 2QOIA 1A06A 4BBEA 4O81A 1YOJA 3ORPA 4Y5QA 1ZMWA 1ZZ2A 4QOXA 4EH2A 5HLWA 5J5SA 1OKVA 5J1WA 4FKGA 5BVEA 4YTIA 2XIZA 3DTWA 4ZSLA 4ZSJA 3DBCA 3F3VA 5H2UA 4L3PA 4BF2A 2AC3A 3JS2A 4MF1A 4XG8A 5DGZA 4CV9A 4D9UA 3ITZA 3TI1A 5DT0A 5BYYA 3MESA 4DBXA 3F5UA 2R0UA 3F3TA 4RT7A 4PRJA 2E9PA 1H07A 3UG2A 3ZHPC 3R22A 5HE1A 3OXIA 3QKMA 3DOGA 3F5PA 4BVUA 4F6SA 4QP3A 3ACKA 4CSVA 3OHTA 5IQEA 3EYGA 4C2VA 2QG5A 2OXYA 4W8EA 4ZMFA 2WMQA 3F82A 3FJQE 1Y8YA 3BYUA 2Y4IB 1L8TA 5BX0A 3NUSA 2Z02A 4H3QA 4QMYA 2OO8X 3VUDA 4FTLA 5J1VA 3UOKA 4BCGA 4CD0A 4EH8A 4KINA 1CDKA 1OVEA 2OLCA 4FEVA 3OOGA 2EB2A 2A1AB 4Z9LA 4OT6A 4NH1A 3VBWA 3BHUA 3KEXA 4FOBA 4YPDA 1FGIA 3B8RA 4JOAA 2HXLA 4PQNA 2B9HA 2W4JA 3IK3A 3PWDA 4WNOA 4IVBA 3RZBA 5KNJA 2XRWA 1BMKA 4FG7A 3TL8A 2XK8A 3C50A 3I7CA 3ODZX 4V05A 5EKOA 4ZTMA 2OZAB 5HESA 3C5UA 4R8QA 3EYHA 4FG9A 1OIUA 4C36A 1Q4LA 1H0WA 3C4CA 2HW6A 3PXRA 1OKYA 5AFVA 3DKFA 3KCKA 3NYXA 3QYZA 2ERZE 3MA3A 5FBNC 4USEA 1KE9A 1V0BA 2XNBA 3COIA 4RJ4A 3U51A 2JGZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4FSR A;  4E4M A;  1SM2 A;  2C6L A;  2W1D A;  4FGR A;  5HX8 A;  4I1Z A;  2VTJ A;  4NTS A;  3ZU7 A;  5DH3 A;  3WE8 A;  3DFA A;  4WHZ A;  4H39 A;  2OK1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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