The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
2
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MKTGIVNVSSSLNVRSSASTSSKVIGSLSGNTKVTIVGEEGAFYKIEYKGSHGYVAKEYI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Toxin
|
| molecule keywords |
Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase doma
|
| publication title |
Solution Structure of CpR82G
rcsb |
| source organism |
Clostridium perfringens
|
| total genus |
2
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-05-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JXB A; 3I5R A; 2YUP A; 1NLP C; 1Y57 A; 3M0S A; 4IIM A; 1UFF A; 1AVZ C; 4JJC A; 1ZUY A; 1I0C A; 1I1J A; 4RTU A; 2K2M A; 2JT4 A; 2J6K A; 4A63 B; 2EYX A; 1QCF A; 1WLP B; 3SEM A; 2FEI A; 2G6F X; 3EG3 A; 1KFZ A; 2DL7 A; 2X3W D; 3EGU A; 4FSS A; 1H3H A; 1WXB A; 4RTT A; 3VS4 A; 4LNP A; 1UJ0 A; 2CT4 A; 5I22 A; 1AWW A; 1G2B A; 2L0A A; 3VRY A; 1HD3 A; 1QWF A; 1UGV A; 5FWB A; 4GBQ A; 1W1F A; 1NYF A; 2EQI A; 2PTK A; 3UA6 A; 2C0O A; 1JXM A; 2GBQ A; 2B86 A; 1UUE A; 2D8J A; 4RTV A; 2J6F A; 4AG2 C; 1M3A A; 2EGE A; 1GCQ A; 2EW3 A; 5IXF A; 1X2K A; 4AFZ C; 4OMM A; 1AZE A; 2DRK A; 2OJ2 A; 1X27 A; 1SHF A; 4Z88 A; 2EYZ A; 1ARK A; 1SSH A; 1ZUK A; 2DJQ A; 1W6X A; 2DL4 A; 1B07 A; 3VS5 A; 1KJW A; 1S1N A; 5FW9 A; 1K4U S; 1JQQ A; 1N5Z A; 4F16 A; 3FJ5 A; 3UAT A; 3REA B; 2C0T A; 3I35 A; 2CUD A; 2EVR A; 2LMJ A; 2EPD A; 3SHW A; 3R6N A; 4R0K A; 3QWX X; 2RQU A; 2CSI A; 4OML A; 3REB B; 2K9G A; 5I11 A; 1RLQ C; 2HCK A; 2K3B A; 1ABQ A; 1AWX A; 2K6D A; 2RQW A; 4JZ4 A; 2JM9 A; 3TVT A; 3I5S A; 4OMO A; 2MOX A; 2YSQ A; 1LCK A; 2GTO A; 1JEG A; 1TG0 A; 4CC2 A; 1V1C A; 1YP5 A; 2AZV A; 2RQV A; 2DL8 A; 1BK2 A; 2DVJ A; 3VS2 A; 4J9F A; 2EKH A; 5IHK A; 1CSK A; 2F2W A; 4CC4 B; 2BZY A; 1U06 A; 2YT6 A; 3H0F A; 4LUE A; 1I07 A; 2JMC A; 2PNI A; 1U3O A; 1SHG A; 2KYB A; 2QDL A; 2GGR A; 4RTZ A; 2HEQ A; 1A0N B; 2DL5 A; 1AD5 A; 2O9S A; 1UHF A; 3NPF A; 2A36 A; 2EGA A; 3A98 A; 1X6G A; 1X69 A; 1YNZ A; 2A28 A; 2J06 A; 2DIL A; 4AG1 C; 1T0J A; 1ZBJ A; 2ED1 A; 1JO8 A; 4KRT A; 3THK A; 2YUQ A; 1MUZ A; 2O88 A; 3GBQ A; 1RI9 A; 4RTW A; 2KRM A; 2CRE A; 1CKA A; 1OPL A; 4EIK A; 2RF0 A; 2KE9 A; 2I0N A; 1T3S A; 2EYY A; 1WDX A; 2D0N A; 2RMO A; 2LNH B; 2ECZ A; 2KXC A; 1K9A A; 1X2Q A; 3VS7 A; 4AFU C; 1GBR A; 1GCP A; 1AOJ A; 2GQI A; 2DBK A; 3TSW A; 3QWY A; 2JS2 A; 4OMP A; 1EFN A; 4E6R A; 2AKK A; 1BBZ A; 1JXO A; 1WA7 A; 3TSZ A; 2KNB B; 1K0S A; 2RPN A; 1H92 A; 1PNJ A; 2NWM A; 1UJY A; 2KBT A; 2M51 A; 4J9D A; 1TUC A; 2NUZ A; 2OAW A; 5L23 A; 4HXJ A; 4LUD A; 2SEM A; 3ULR B; 1E6H A; 4K11 A; 3H41 A; 2MIO A; 1UG1 A; 2DYB A; 3IQL A; 1GFC A; 2DNU A; 1TUD A; 2FG0 A; 5IHI A; 1PWT A; 2XMF A; 4M4Z A; 4F14 A; 4JZ3 A; 2SRC A; 1UTI A; 1X43 A; 1G83 A; 2K79 A; 5IHN A; 4AFS C; 2JM8 A; 2KRO A; 1GCQ C; 2KXD A; 2OI3 A; 2D8H A; 1E6G A; 2DRM A; 2RNA A; 3VS1 A; 2KYM A; 4WCI A; 4F17 A; 1JU5 C; 2O2O A; 1MV0 B; 2LQN A; 1PKS A; 2V1R A; 2W0Z A; 1ZX6 A; 2BZ8 A; 1XOV A; 2LP5 A; 1WYX A; 1YWP A; 1M27 C; 2EYW A; 2K7A A; 2F2X A; 5IXB A; 4J9C A; 2ROT A; 4JPB W; 1YCS B; 2KEA A; 4RTY A; 1T3L A; 4HVV A; 4RUG A; 1WI7 A; 2P4R A; 3EG0 A; 1QKX A; 4CC7 A; 1FYN A; 2GTJ A; 1K0X A; 2ROL A; 4J9H A; 2YDL A; 4D8D A; 2E5K A; 1WIE A; 1GFD A; 4Z89 A; 1X6B A; 2DX1 A; 2YUO A; 4X1V A; 1M3B A; 2L2P A; 1NEG A; 2CDT A; 2RN8 A; 1HSQ A; 1PKT A; 1K1Z A; 1W70 A; 3KFV A; 3EHR A; 1UDL A; 1UHC A; 4Y92 A; 3ZL7 C; 5IH2 A; 2CUB A; 2AKL A; 1U5S A; 3EHQ A; 1RUW A; 2J05 A; 1RLP C; 2KT1 A; 3PE0 A; 4IIO A; 5EC7 A; 2DF6 A; 2VWF A; 1ABO A; 3NMZ C; 2LCS A; 2KR3 A; 3PVL A; 4ORZ A; 1ZLM A; 3O5Z A; 2O9V A; 1Y0M A; 1NLO C; 2O31 A; 2X3X D; 1AZG B; 1M8M A; 1SRL A; 1NYG A; 1IO6 A; 4CC3 A; 1WX6 A; 4LN2 A; 1NG2 A; 4OMQ A; 2FPE A; 5HCK A; 4AFQ C; 2A08 A; 5GJW B; 3M0Q A; 4GLM A; 2A37 A; 5ECA A; 2CT3 A; 2M0Y A; 1Z9Q A; 1BU1 A; 1K76 A; 3VS0 A; 1UE9 A; 4JJD A; 1WXU A; 1BB9 A; 1VYT A; 3VS6 A; 1NM7 A; 2FO0 A; 2L3P A; 2AZS A; 3M0R A; 2KGT A; 2DLP A; 3VS3 A; 3NGP A; 1GRI A; 2YUN A; 2LX7 A; 4OMN A; 4JJB A; 3UF4 A; 2EBP A; 1M30 A; 1Z9Z A; 2D1X A; 2LJ0 A; 4D8K A; 2KT8 A; 3CQT A; 2C0I A; 3LH5 A; 2JMA A; 1VYU A; 1GBQ A; 4QT7 A; 2MCN A; 1YN8 A; 2ESW A; 2AK5 A; 3M0T A; 4RTX A; 4J9B A; 1WXT A; 1ZSG A; 3PVQ A; 2HSP A; 2JW4 A; 1VYV A; 2ED0 A; 1AEY A; 3EG2 A; 3M0P A; 1QKW A; 1KIK A; 1OOT A; 1SRM A; 2LQW A; 1UEC A; 5GJV B; 1OPK A; 2W10 A; 2ENM A; 4LE9 A; 1OEB A; 2JTE A; 2LZ6 B; 1SEM A; 2DMO A; 2FPD A; 2VKN A; 4HCK A; 3M0U A; 2RQT A; 1CKB A; 2CH4 W; 3NHN A; 2DBM A; 2DM1 A; 1PHT A; 4HVW A; 1PRL C; 2FPF A; 2HDA A; 2FRY A; 2ABL A; 1QLY A; 1AWO A; 1WFW A; 1ZUU A; 1HJD A; 3VRZ A; 2BZX A; 1MV3 A; 3EG1 A; 2CSQ A; 1B3Q A; 2J7I A; 4J9I A; 2DE0 X; 2VVK A; 4J9G A; 3H0H A; 4DEX A; 4DEY A; 2RQR A; 2BTT A; 3RBB B; 1AWJ A; 1PRM C; 1YWO A; 2V1Q A; 1H8K A; 4HVU A; 3I9Q A; 1KSW A; 4J9E A; 2DA9 A; 2IIM A; 2LJ3 A; 2F2V A; 2KRS A; 1VA7 A; 4ZNX A; 2EGC A; 3U23 A; 1SPK A; 2L3S A; 2J6O A; 3C0C A; 2JS0 A; 1FMK A; 2L3Q A; 1M3C A; 2H8H A; 3JV3 A; 2HBW A; 1J3T A; 2LJ1 A; 1T0H A; 3H0I A; 1E7O A; 2FRW A; 3UA7 A; 2GNC A; 1OV3 A; 2KRN A; 2DL3 A; 4Z8A A; 3RNJ A; 4ESR A; 5FWC A; 1NEB A; 1QWE A; 2PZ1 A; 2CH4 A; 1GL5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3I5R A; 2QA4 T; 1BI2 A; 3I56 Q; 4M7D E; 1YHQ A; 3OYM A; 5CIU A; 1KD1 C; 3VYG A; 1ZUY A; 2CS7 A; 1I1J A; 3Q1J A; 1W2B P; 2F1L A; 5GMK j; 1VQ5 T; 3CBM A; 4HCB A; 1YFN A; 1VQK Q; 1QVP A; 2JT4 A; 2QQB A; 4ZN1 A; 2YWW A; 3JB9 D; 2FEI A; 3OW2 S; 2G6F X; 3MP6 A; 1RAF B; 2L5Q A; 1KFZ A; 3A8G B; 2DL7 A; 2X3W D; 1PG5 B; 4HT8 A; 1G3S A; 1G2B A; 1HD3 A; 2P0K A; 5FWB A; 4OMF B; 2EQI A; 3J81 E; 2PTK A; 3SB2 A; 3MPU B; 1YJW T; 2C0O A; 4ZGE B; 2GBQ A; 2VB6 A; 3QHS A; 2D8J A; 2EGE A; 3MJX A; 1X2K A; 4ATO A; 2KY9 A; 2QI2 A; 4OMM A; 1NJI U; 1AZE A; 4Z88 A; 1ARK A; 1SSH A; 2MYS A; 1IXD A; 2DJQ A; 2LRQ A; 3JSC A; 5KCO A; 3G4S Q; 1K4U S; 1JQQ A; 1N5Z A; 3PNW C; 5KYX A; 3I35 A; 2CUD A; 2E6N A; 3CPW A; 3ER0 A; 5FRO A; 5GAO n; 2EPD A; 1KC8 C; 4XTW A; 3CCU A; 3G6E T; 2RQU A; 5I11 A; 3HFO A; 2K9G A; 2K3B A; 2RI5 A; 2XID A; 1AWX A; 3JCM Q; 3DKM A; 5HK0 A; 3SFM A; 3M9Q A; 1WHM A; 2BE9 B; 2LQK A; 4II1 A; 3TVT A; 4M7D G; 1UEB A; 1PSF A; 1IZ6 A; 4PLL A; 3CMA Q; 3TEE A; 4J8O A; 5LJ3 j; 2XDP A; 4IUR A; 1WHK A; 2GTO A; 1JEG A; 2RQV A; 3VUZ A; 3L2Q A; 2MK5 A; 3I55 A; 1I81 A; 4BY6 B; 4PJO D; 2F69 A; 2EKH A; 2P4T A; 2K3Y A; 2O01 E; 4FT2 A; 2F5T X; 4LUE A; 2JMC A; 2PNI A; 2PU9 B; 3HSB A; 3L2W A; 3UDC A; 5LJ5 g; 2MMP A; 2L89 A; 4N4G A; 3GP8 A; 1AD5 A; 1N9R A; 4CRI A; 4DBH A; 1VQ4 A; 2HAX A; 1VQM Q; 3CC7 T; 5IAY A; 2R57 A; 4C5E A; 4BI3 A; 5LJ5 h; 1TU0 B; 1VQ7 A; 4M77 F; 1X01 A; 1JO8 A; 4IUQ A; 2O88 A; 1RI9 A; 1QVG A; 1Q86 R; 5GAM e; 1VQM A; 3RKX A; 4R56 A; 3CC2 Q; 1OPL A; 2CP5 A; 4M7D C; 4XTU A; 4HCZ A; 4EIK A; 4DBQ A; 2RF0 A; 2KE9 A; 5KYU A; 2OTJ Q; 2EYY A; 4QW2 A; 3AHU A; 2ECZ A; 3MKD A; 3CCV A; 1X2Q A; 3LGF A; 1GCP A; 2GQI A; 2XG8 D; 3QWY A; 4M7A E; 4IUP A; 2AKK A; 1BBZ A; 3TSZ A; 5GAN 2; 1PNJ A; 2K4Y A; 2RK2 A; 2KBT A; 2M51 A; 2RA2 A; 2RB6 A; 2NUZ A; 3OYJ A; 2DXU A; 4M75 G; 5CO7 A; 2MF2 A; 3ULR B; 1AHJ B; 3PIO A; 3VV0 A; 2MIO A; 2KI7 A; 1UG1 A; 1GFC A; 1NPR A; 5GAN 8; 2VV5 A; 4O6J A; 4L59 A; 4JZ3 A; 1M1K R; 3CCE A; 1O75 A; 4LD6 A; 2XD0 A; 4BUG A; 3QJ6 A; 4FYW B; 5CKD A; 1RAA B; 1WNL A; 2JM8 A; 3SWN C; 2NUP B; 2ZPE B; 1IHV A; 4B9W A; 4EDU A; 2O4X B; 2KYM A; 4AMC A; 3CD6 Q; 1WZO A; 6AT1 B; 1JU5 C; 1MV0 B; 1OQK A; 5CKH A; 2LQN A; 4QQ6 A; 1MMG A; 4C92 F; 1Q7Y C; 3CCJ T; 3MO8 A; 3G71 A; 2W0Z A; 1ZX6 A; 1IHW A; 3CCL Q; 2BZ8 A; 2H3J A; 1XOV A; 1N6A A; 1YWP A; 2G3R A; 2HNI A; 5J39 A; 4EMK A; 3CXC P; 4EPC A; 4J9C A; 2KEA A; 3M53 A; 5FU6 C; 4HVV A; 1WI7 A; 4X9C A; 1UGQ B; 2R58 A; 5DM7 R; 2ROL A; 2F5K A; 5DLO A; 2YDL A; 1M2O A; 4LDU A; 1WIE A; 3CC4 Q; 4C0G A; 1S72 T; 2YUO A; 4RG8 A; 3UPU A; 4F7U E; 2CDT A; 2K57 A; 1KHC A; 1K1Z A; 1PKT A; 5IH2 A; 3EHR A; 1UHC A; 2X51 A; 2QQA A; 4XU2 A; 1N8R C; 1RUW A; 2HMA A; 3V7S A; 4M7A G; 4Q5W A; 4C5G A; 5CKF A; 2CYZ B; 1TTH B; 3CCQ Q; 4E7S A; 4ORZ A; 4KGV B; 4OP0 A; 1QVF A; 2O9V A; 3C94 A; 1M1F A; 4QVC A; 1R77 A; 1D1B A; 1M8M A; 4BAC A; 4BE1 A; 1WX6 A; 5KYN A; 4WTO B; 2K3X A; 1WQW A; 5GJW B; 4BDZ A; 1RL2 A; 4OB0 B; 4C5H A; 5CAI A; 3A8O B; 1I5O B; 3M0Q A; 4M7D B; 2A37 A; 4X34 A; 4MDW A; 2JTF A; 5ECA A; 1Z9Q A; 4XTZ A; 3VS0 A; 2JN0 A; 3OW2 P; 4B9X A; 5GAN h; 1BB9 A; 4KH1 B; 2K2V A; 1WJS A; 1NM7 A; 1BYM A; 1WQ7 A; 2D9T A; 3OYK A; 2E65 A; 2YUN A; 2LX7 A; 4C8Q A; 2R5M A; 2XKO C; 4OMN A; 3JB9 I; 1M30 A; 1VQN T; 2D1X A; 4D8K A; 2KT8 A; 4BD3 A; 1TH7 A; 2ZPF B; 4FYV B; 4KUL A; 4M7A C; 1GBQ A; 1BCM A; 4QVZ A; 5DLQ E; 3RKW A; 1BIA A; 5CKB A; 3JB9 J; 3WXM B; 2DAQ A; 3MEA A; 1VYV A; 1AEY A; 4Z02 A; 4M78 E; 3SWN B; 1MGQ A; 1YJ9 A; 1SRM A; 1M5Q 1; 3M55 A; 1UEC A; 5D7U A; 1SKU B; 2ENM A; 3CCS A; 3HFN A; 3OYL A; 4GY5 A; 5LJ5 j; 1OU8 A; 2DTH A; 2LZ6 B; 1NE8 A; 2DMO A; 2VKN A; 3BFM A; 4PJJ A; 3GLX A; 2DVE A; 1SG5 A; 1B7T A; 2GQV A; 3OS2 A; 3OYG A; 2CH4 W; 2FZC B; 1Q81 C; 2DM1 A; 1PHT A; 4E7J A; 3JCM e; 5FU6 B; 1I5L A; 2FRY A; 3S3N A; 1HYO A; 1QLY A; 1GXI E; 1M90 C; 1VQ9 Q; 4XAX B; 3DB3 A; 5LL6 S; 3PTA A; 2CSQ A; 1Y07 A; 2DE0 X; 1RI0 A; 4DEY A; 2K5F A; 1QCN A; 2GFA A; 5D6X A; 2RQR A; 1WHJ A; 1N9S A; 1R8O B; 3RBB B; 3L42 A; 2RHI A; 1B34 B; 2KRS A; 3KUF A; 1G3T A; 4ZNX A; 3C0C A; 3F70 A; 3H8Z A; 4QVD A; 5CVI A; 1VQ8 T; 1M3C A; 3PMT A; 2OTL A; 3QZ9 B; 2FVU A; 1SF9 A; 4LDV A; 3X24 B; 1VQO A; 2QGF B; 1HXD A; 1T0H A; 2IPO B; 2LJ1 A; 3A1P A; 1Y7X A; 4M7D D; 4QQD A; 1Y96 B; 3RNJ A; 4A4F A; 5L8R E; 1QWE A; 4M78 G; 4O5V A; 5KYY B; 4M77 G; 4E7K A; 1PM3 A; 5LJ5 f; 3RER A; 1YI2 Q; 2KQW A; 1Y57 A; 2RJF A; 2DK3 A; 3BE3 A; 3RIR A; 3FEO A; 2H3E B; 3GIB A; 4DQ2 A; 2JVV A; 2M16 A; 4M7A B; 4AT1 B; 1W4S A; 4FSS A; 1K9M U; 1QP2 A; 1WXB A; 2KAF A; 2L3R A; 3CPF A; 4RTT A; 3VS4 A; 1K8A U; 3GPL A; 3OB9 A; 3QBY A; 4OGE A; 2NLU A; 2L0A A; 2P0Q A; 3C4S A; 1NYF A; 2DEQ A; 3TQ7 P; 3UA6 A; 3T9N A; 2C06 A; 4PJN A; 1G3W A; 2IG0 A; 2J6F A; 1K73 R; 4FYY B; 4IUV A; 1M3A A; 2HD0 A; 2DXT A; 3QSU A; 4ELY C; 1YJN A; 3CCR T; 4AFZ C; 3AT1 B; 1BKB A; 2A3L A; 4L5G A; 3E19 A; 4M78 C; 1SHF A; 1VQ6 A; 1TS9 A; 1D0X A; 4LD9 K; 1B07 A; 3EFS A; 3VUB A; 5GAO p; 3O8V A; 1KQ1 A; 4F16 A; 1F1B B; 3UAT A; 4JDS A; 4C92 G; 5GAN j; 1FXX A; 1KQS P; 2M1H A; 2OX7 A; 1VQP Q; 1WJQ A; 3M4Y A; 4CI0 C; 2CSI A; 4OML A; 1Q86 C; 3V7R A; 1PD0 A; 3WVE B; 2HSE B; 2CP6 A; 1M90 U; 2HL5 C; 1WPY A; 4IKF A; 1ABQ A; 2QA4 A; 2EWN A; 2GFU A; 4JZ4 A; 3CXC S; 2JM9 A; 3RR6 A; 2QTX A; 1NZ9 A; 1KK7 A; 3I5S A; 4OMO A; 2MOX A; 4ZTF A; 1VQ5 A; 4F7U B; 1TG0 A; 4CC2 A; 1O9S A; 3LW5 E; 3BY7 A; 3GF5 A; 2DL8 A; 3CME A; 1PC0 A; 2HZY A; 2F2W A; 1U06 A; 1U3O A; 4RCC A; 2KYB A; 1YJW A; 4RTZ A; 3HHT B; 1M1K C; 4KUI A; 2DL5 A; 1YHQ Q; 2O9S A; 3NPF A; 2A36 A; 3S6W A; 3JCM b; 5GAO r; 3FJP A; 3JB9 F; 3CCM T; 1YNZ A; 1UGP B; 2DIL A; 1Q95 G; 2DXC A; 2LQ8 A; 3VJP A; 2HKQ B; 2PVO B; 3GBQ A; 2P84 A; 2NUT A; 3TRE A; 2QK0 A; 3A8M B; 4M7A D; 2LX9 A; 2FYK A; 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