The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
GPYAQPSINTPLPNLQNGPFYARVIQKRVPNAYDKTALALEVGELVKVTKINMSGQWEGECNGKRGHFPFTHVRLLDQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Cis isomer of Crk protein
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| publication title |
Structural basis for regulation of the Crk signaling protein by a proline switch.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
9
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VYT A; 2JMC A; 1M3B A; 1YNZ A; 2RMO A; 4RTZ A; 3UA6 A; 1OEB A; 2CDT A; 2M51 A; 3VS1 A; 1SEM A; 1GBR A; 3QWY A; 2FG0 A; 3M0T A; 2LMJ A; 1I07 A; 1K0S A; 1NLO C; 1SPK A; 2KRM A; 2J6F A; 1RLQ C; 4J9B A; 4FSS A; 4HXJ A; 5IXF A; 2ROL A; 1WXU A; 1UJY A; 1M3A A; 1NLP C; 2KNB B; 3VS4 A; 1WXB A; 3REB B; 2GTO A; 1CSK A; 3M0S A; 3VS7 A; 2RN8 A; 1WXT A; 2LJ0 A; 1K0X A; 1YP5 A; 2L0A A; 2E5K A; 2ESW A; 1EFN A; 2FEI A; 4JZ4 A; 2EW3 A; 2DRK A; 2O88 A; 1K4U S; 4JJB A; 4R0K A; 3I5S A; 2A37 A; 2GTJ A; 1TG0 A; 3SEM A; 1X2Q A; 1KSW A; 1UE9 A; 4F14 A; 2JTE A; 5IXB A; 1AD5 A; 2CT3 A; 4HVV A; 2FRY A; 2J6K A; 4AFU C; 3UF4 A; 1NEB A; 2M0Y A; 2VWF A; 2EQI A; 3M0U A; 1WDX A; 2AZS A; 3UA7 A; 1JO8 A; 2YUO A; 2SRC A; 1Z9Z A; 5EC7 A; 2K7A A; 2HBW A; 3QWX X; 2EGA A; 2PZ1 A; 1MV0 B; 1W6X A; 4AFQ C; 2C0T A; 2G6F X; 1PKT A; 2MIO A; 4CC2 A; 2O9V A; 1X6B A; 1OOT A; 2YUQ A; 2HEQ A; 1Y0M A; 2L3S A; 2LJ3 A; 1CKA A; 3EG2 A; 1WX6 A; 2GGR A; 3PE0 A; 1X2K A; 2EYX A; 3I9Q A; 1BK2 A; 2RF0 A; 4D8K A; 1S1N A; 4JJD A; 2KT8 A; 4KRT A; 1AOJ A; 2CUB A; 2LCS A; 5I11 A; 2EPD A; 2EVR A; 2FRW A; 2MCN A; 1ZUK A; 3M0P A; 5I22 A; 4OMO A; 2B86 A; 1YWO A; 2DL3 A; 2JS0 A; 1PRM C; 2F2X A; 2LQW A; 1PHT A; 2NUZ A; 4RTY A; 3THK A; 1TUD A; 2DL5 A; 2BZX A; 2EKH A; 3EHR A; 1K9A A; 1MUZ A; 1B07 A; 4J9D A; 3VRZ A; 3VS0 A; 1AWJ A; 3VS6 A; 1QCF A; 1JU5 C; 2DM1 A; 1ABO A; 2K9G A; 1J3T A; 2JMA A; 2DRM A; 2KRN A; 3ULR B; 1T0H A; 1ZLM A; 1VYV A; 2EGC A; 5HCK A; 2D8J A; 2ENM A; 1HJD A; 2KGT A; 2C0O A; 1GCQ A; 1QWF A; 1VYU A; 1NG2 A; 1UFF A; 2KBT A; 4J9F A; 2DA9 A; 1WFW A; 2YUP A; 2PTK A; 2ROT A; 1GL5 A; 1UUE A; 2YUN A; 5L23 A; 4WCI A; 1SRM A; 2RQW A; 2DIL A; 1M27 C; 3PVQ A; 2K79 A; 4RUG A; 2J06 A; 2W0Z A; 2J6O A; 4LN2 A; 1QKX A; 2RQR A; 1AWO A; 4RTT A; 2L3Q A; 2O9S A; 3TVT A; 1MV3 A; 1YCS B; 1ARK A; 1KFZ A; 1JXO A; 2GBQ A; 5FWB A; 1BBZ A; 2K3B A; 2CH4 A; 2XMF A; 2RQV A; 3VS3 A; 2DYB A; 5IH2 A; 2D8H A; 4Z8A A; 1UDL A; 2DVJ A; 3VS2 A; 2V1Q A; 2DJQ A; 2YDL A; 1JEG A; 2A28 A; 2JXB A; 2DL8 A; 1KJW A; 4CC7 A; 2JW4 A; 2SEM A; 3EGU A; 1T0J A; 2AZV A; 3RBB B; 2BZY A; 2KYB A; 2CUD A; 4OMP A; 1WLP B; 1E6H A; 4ZNX A; 2ED1 A; 1QKW A; 2A08 A; 2EYY A; 4QT7 A; 1U3O A; 2IIM A; 1V1C A; 3A98 A; 1AEY A; 1GCQ C; 2GNC A; 3EG0 A; 4J9G A; 4OMM A; 1RI9 A; 1ZSG A; 1U5S A; 2DF6 A; 2FPF A; 2DBK A; 1GRI A; 4F16 A; 2NWM A; 1ZX6 A; 1KIK A; 2DMO A; 2L2P A; 1IO6 A; 1U06 A; 1E7O A; 4E6R A; 4ESR A; 1PRL C; 1K76 A; 2DX1 A; 4IIO A; 2BTT A; 2KXD A; 1NEG A; 3RNJ A; 2LP5 A; 2KXC A; 1JXM A; 2CSI A; 1ZUU A; 2O31 A; 2EYZ A; 2K2M A; 1G2B A; 2OI3 A; 2HCK A; 4LUD A; 2RNA A; 1UGV A; 1W1F A; 2H8H A; 1UEC A; 4CC4 B; 1B3Q A; 1M30 A; 1OPL A; 3IQL A; 4OMQ A; 2VVK A; 1UHF A; 2HDA A; 2KEA A; 1OPK A; 1T3S A; 4Z89 A; 1Y57 A; 4RTU A; 1YWP A; 2CRE A; 4JPB W; 3EG3 A; 2F2W A; 1OV3 A; 2DL7 A; 1GBQ A; 1YN8 A; 5FW9 A; 3M0Q A; 3UAT A; 4J9I A; 1ZUY A; 2F2V A; 1I0C A; 3JV3 A; 1X69 A; 2LJ1 A; 1M8M A; 1PNJ A; 4J9E A; 2ED0 A; 3SHW A; 2K6D A; 4AFS C; 2JT4 A; 3M0R A; 1NM7 A; 4DEY A; 4RTX A; 1ZBJ A; 2RPN A; 2LZ6 B; 2BZ8 A; 2V1R A; 4JZ3 A; 1UG1 A; 1WYX A; 1X43 A; 1K1Z A; 3FJ5 A; 4X1V A; 1CKB A; 1H92 A; 2JM9 A; 1BB9 A; 4HCK A; 4JJC A; 2FPE A; 1VA7 A; 1NYF A; 1WA7 A; 3NGP A; 3H0I A; 4EIK A; 3NMZ C; 1GFC A; 3H0H A; 4CC3 A; 1JQQ A; 4LUE A; 3ZL7 C; 1RLP C; 4RTV A; 1AWX A; 2I0N A; 4J9C A; 4A63 B; 4GBQ A; 1TUC A; 4GLM A; 2DL4 A; 2KT1 A; 1UTI A; 2KE9 A; 2P4R A; 2RQU A; 1BU1 A; 2LNH B; 2W10 A; 2HSP A; 2O2O A; 3EG1 A; 1GCP A; 1AVZ C; 4HVU A; 4ORZ A; 3R6N A; 2EBP A; 3TSZ A; 2J05 A; 3GBQ A; 3LH5 A; 5GJV B; 3VRY A; 5FWC A; 2KRO A; 2X3W D; 1UHC A; 1X6G A; 3PVL A; 2FPD A; 1X27 A; 2KR3 A; 2YSQ A; 1SSH A; 1H8K A; 1AZG B; 2RQT A; 2QDL A; 3U23 A; 2X3X D; 3KFV A; 4D8D A; 2CSQ A; 1G83 A; 1N5Z A; 3I35 A; 1H3H A; 2AKL A; 2DE0 X; 2KYM A; 5IHI A; 2VKN A; 4OML A; 1WI7 A; 4M4Z A; 2JM8 A; 2D1X A; 3REA B; 3H41 A; 2J7I A; 1FYN A; 1AZE A; 4K11 A; 3O5Z A; 3TSW A; 2CH4 W; 1XOV A; 4RTW A; 2ECZ A; 4AFZ C; 1W70 A; 4J9H A; 2AK5 A; 1LCK A; 2YT6 A; 2MOX A; 4DEX A; 2GQI A; 2ABL A; 4LNP A; 3I5R A; 1Z9Q A; 2PNI A; 2L3P A; 1SRL A; 3CQT A; 2D0N A; 2LQN A; 1ABQ A; 1FMK A; 2KRS A; 1AWW A; 3NPF A; 4AG2 C; 4F17 A; 3VS5 A; 4AG1 C; 1HD3 A; 1SHG A; 4OMN A; 1I1J A; 1SHF A; 1A0N B; 2EGE A; 4LE9 A; 1GFD A; 1PWT A; 4IIM A; 4HVW A; 2LX7 A; 1M3C A; 2AKK A; 2C0I A; 2DNU A; 3H0F A; 5GJW B; 4Z88 A; 4Y92 A; 2DLP A; 3NHN A; 3EHQ A; 2A36 A; 1PKS A; 1HSQ A; 5IHK A; 1QWE A; 1UJ0 A; 2OAW A; 1E6G A; 2DBM A; 2CT4 A; 1WIE A; 2OJ2 A; 5ECA A; 2EYW A; 2JS2 A; 5IHN A; 3C0C A; 1RUW A; 1NYG A; 1QLY A; 2FO0 A; 1T3L A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DXC A; 2JMC A; 1S72 A; 1NPP A; 1YNZ A; 3QPH A; 4BB7 A; 1C0M A; 3UA6 A; 1OEB A; 2M51 A; 3EH1 A; 1SEM A; 3AHU A; 2LNV A; 3M0T A; 3CMA A; 3CCL Q; 4V2S A; 2NUP B; 5D6X A; 1VQM Q; 2XDB A; 4XTV A; 5LJ3 j; 1PD1 A; 2OTL T; 2XDD A; 2ROL A; 1WXU A; 2JVV A; 2YLB A; 4BAC A; 2KNB B; 1YHQ A; 5GAM h; 3REB B; 2PVO B; 3Q1J A; 1CSK A; 3E19 A; 2LX9 A; 3VS7 A; 2RN8 A; 4RMO A; 1M90 U; 1TTH B; 3C12 A; 2L0A A; 3MP6 A; 4C8Q C; 1IB8 A; 2ESW A; 3HPW A; 3FC3 A; 3NTK A; 4FYX B; 3G1J A; 4LDY A; 2EW3 A; 4KT0 E; 2D9T A; 2E12 A; 4E2F B; 4JJB A; 2A37 A; 1YCY A; 1AD5 A; 2CT3 A; 2FRY A; 1G3T A; 5KH6 A; 2A0F B; 4DBQ A; 4M75 A; 1ZSZ C; 2VWF A; 3M0U A; 5FRO A; 2XDP A; 3S6W A; 2SRC A; 2KAF A; 1TH7 A; 2DK3 A; 2K7A A; 3JCM h; 2EGA A; 3GNG A; 3HSB A; 4JLI A; 2RI5 A; 2G6F X; 1YJN A; 1YJ9 A; 1VQ4 T; 2A3L A; 1QCO A; 1X6B A; 4JDS A; 4A4F A; 1YBY A; 2HEQ A; 3OYJ A; 1ZA2 B; 5C6S A; 3EG2 A; 1VQP A; 3SWN B; 3PE0 A; 1WHM A; 3I9Q A; 2Z0W A; 3VYG A; 2KT8 A; 1BI2 A; 2EVR A; 2CKK A; 2MCN A; 1ZUK A; 5LJ5 h; 2HQH A; 3OYC A; 3SWN A; 1PRM C; 4HKE A; 4RTY A; 4LD9 K; 4LDW A; 2EKH A; 5KYX B; 3EHR A; 1KC8 C; 1AWJ A; 2WSF E; 1QCF A; 4QVD A; 3CCR T; 1QQJ A; 1TS9 A; 4F7U B; 2LQ8 A; 4J6Y A; 1ABO A; 4PJO G; 1OI1 A; 5KYX A; 2YLC A; 2JMA A; 2XG8 D; 2KRN A; 3MPU B; 3A8G B; 3CC4 Q; 3I56 A; 1AT1 B; 5CKB A; 3DLL A; 4F7U A; 4PJO C; 4N0A C; 3JCM c; 2ENM A; 3CCQ Q; 2C0O A; 3CPW A; 1UFF A; 4PLL A; 1VQN T; 2E41 A; 4IUP A; 5GMK e; 4OB0 B; 1WHJ A; 2KBT A; 4MZT A; 1ACM B; 1SG5 A; 4FYY B; 3CEY A; 2YUN A; 3D7S B; 1UGS B; 3PIO A; 3OYA A; 3TRE A; 2E10 A; 5I21 A; 1M27 C; 3PVQ A; 2RQR A; 3TVT A; 2H3J A; 4PJN A; 2EJF A; 3ER0 A; 1KFZ A; 1TXQ A; 2R58 A; 4M77 B; 2GBQ A; 8ATC B; 1OUL A; 5FWB A; 5GAM d; 3CCM Q; 1Q86 R; 4B9W A; 2RQV A; 4FT4 A; 3JRZ A; 1ZA1 B; 3A8H B; 3CCS A; 2DJQ A; 2A28 A; 3EG9 B; 4L6V 5; 2JXB A; 4F7U F; 2EJ9 A; 5GMK j; 2KDS A; 1JBM A; 2QGG A; 4EMK C; 3I55 Q; 1W2B P; 2AZV A; 4QVZ A; 5IAY A; 2D6F A; 4JRK A; 4OMP A; 3UT1 A; 4WTO B; 1KC8 U; 1E6H A; 4IUR A; 4C92 E; 4QT7 A; 2IIM A; 5GMK l; 1I5L A; 1VQ6 Q; 1M2V B; 1RAA B; 5KYU B; 2P0P A; 2OTJ T; 1LNX A; 1TOV A; 4OMM A; 3QKJ A; 3QJ6 A; 3PGG A; 2V8I A; 4L59 A; 1GRI A; 1S72 T; 3QYH B; 3JCM d; 1M2V A; 3HTR A; 1QVG S; 2NWM A; 2EQK A; 5KYU A; 4AT1 B; 3M53 A; 2ZPG B; 4XTX A; 3CMA T; 4OF1 A; 3CME A; 2RH2 A; 1D09 B; 2RD1 A; 4IIO A; 2CP7 A; 3JB9 J; 2FYK A; 3TEE A; 2KXC A; 1JXM A; 1NBE B; 2CSI A; 2O4X A; 2RHX A; 2JTM A; 4M77 F; 3TU4 K; 4CI0 C; 4BE0 A; 3AT1 B; 2RNA A; 1W1F A; 4CC4 B; 2QGF B; 2DIQ A; 2KEA A; 2RK1 A; 2GQV A; 4RTU A; 1YWP A; 2BUD A; 3EG3 A; 2YRC A; 1M1K R; 5CIU A; 8AT1 B; 1VQ5 A; 4XQ3 A; 3M0Q A; 1QVG P; 2E6N A; 2DZ9 A; 4M7D E; 1FX7 A; 4VUB A; 4HCC A; 2LJ1 A; 1VQK A; 1PNJ A; 2FHD A; 2K6D A; 2JT4 A; 1VQ9 A; 1JJ2 A; 1Q81 C; 4FW1 A; 2QI2 A; 3H9N A; 2QQS A; 1UG1 A; 3QXE B; 1CKB A; 1H92 A; 1VQ7 A; 4A4H A; 4HCK A; 1NYF A; 2KQW A; 1KQS P; 3NGP A; 1IRX A; 3H0I A; 1JQQ A; 2E5Q A; 2CZ1 B; 2QK0 A; 3VKI A; 2LC4 A; 3ZL7 C; 4OB3 B; 2VGM A; 2I0N A; 4D6W A; 4A63 B; 1TUC A; 1N8R C; 1WHK A; 1BCO A; 2RI2 A; 4E7S A; 5FRN A; 1YJN T; 2COW A; 1SKU B; 5GAN f; 3G71 Q; 1YJ9 T; 5EG2 A; 4HVU A; 3R6N A; 1VQO A; 1YIJ Q; 3GBQ A; 3LH5 A; 3M4G A; 1WQW A; 5FWC A; 1UHC A; 3PVL A; 4NS5 A; 3VV0 A; 2KR3 A; 1VQP T; 1Q7Y R; 1SSH A; 1AZG B; 4DBR A; 2BIV A; 3U23 A; 4D8D A; 1G83 A; 4E7L A; 2AKL A; 3X20 B; 1I4K 1; 2OAU A; 3UPU A; 1WI7 A; 3UWN A; 2D1X A; 2DEQ A; 2QXF A; 3O5Z A; 3QYG B; 3TSW A; 2AT1 B; 1NJI R; 2ECZ A; 4FW2 A; 1W70 A; 2GQI A; 3QJY A; 5KE2 A; 1Q82 C; 5LJ3 f; 3PIP A; 2LQN A; 4X9C A; 1MMN A; 3VS5 A; 4MMK A; 1Q81 U; 2X4Y A; 4JLG A; 3I56 T; 1QVF P; 1SHG A; 4IUT A; 3G4S A; 4OMN A; 2QQ9 A; 1I1J A; 1SHF A; 2RJC A; 1M2O A; 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2MIO A; 4CC2 A; 1VQ5 T; 1OOT A; 4RG2 A; 5FU6 C; 3RKW A; 1Y07 A; 2HKN A; 4C8Q B; 1Y0M A; 1VQK T; 1CKA A; 1PSF A; 1R8O B; 5KCO A; 2E70 A; 5GAN g; 5GAN 3; 2GGR A; 4PNO A; 1VQ9 T; 1BK2 A; 2RF0 A; 3RES A; 1D3B B; 4C92 G; 1RAE B; 4OB2 B; 5I11 A; 4UC4 A; 2CUB A; 2RJF A; 2D0Q B; 3L2W A; 3JCM V; 5A2Q E; 3OW2 P; 1IHV A; 5I22 A; 4OMO A; 4ZGE B; 3CCJ A; 1VQ7 T; 2DL3 A; 1MGQ A; 2F2X A; 1OYX A; 1ZSZ B; 3THK A; 1P92 A; 2YXY A; 3JCM b; 1MUZ A; 1PM3 A; 5CAI A; 3VRZ A; 3VS6 A; 2RHU A; 4M78 C; 4BD3 A; 3MEA A; 4OMF B; 3ZBD A; 1ZSZ A; 2K9G A; 3OYL A; 1J3T A; 2GFU A; 2DRM A; 1VQO T; 1VQ4 Q; 1VYV A; 3OS2 A; 4M7D F; 4BY6 C; 2C06 A; 3QDR B; 2LRQ A; 1RAF B; 4C0D B; 2DXU A; 2QA4 A; 2GCX A; 3OYM A; 1QWF A; 1VYU A; 4C8Q F; 4L5G A; 1IGQ A; 1NG2 A; 4BI4 A; 4B6M A; 3MO8 A; 2GFA A; 2HNI A; 2DJZ A; 2ROT A; 3JCM J; 1K8A C; 4WCI A; 1M90 R; 3GNF B; 1Q95 G; 1KD1 C; 2J06 A; 4LN2 A; 3C95 A; 2K57 A; 1Y7X A; 2MYS A; 2O9S A; 1MV3 A; 3CCR Q; 2MMP A; 1YCS B; 4M75 B; 4QW2 A; 1KHI A; 2K3B A; 3VS3 A; 5IH2 A; 1QMC A; 1EX4 A; 3G4S T; 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