The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GALTESQAALVKSSWEEFNANIPKHTHRFFILVLEIAPAAKDLFSFLKGTSEVPQNNPELQAHAGKVFKLVYEAAIQLEVTGVVVTDATLKNLGSVHVSKGVADAHFPVVKEAILKTIKEVVGAKWSEELNSAWTIAYDELAIVIKKEMDDAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
LEGHEMOGLOBIN (ACETO MET)
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| publication title |
X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms (Russian)
pubmed rcsb |
| source organism |
Lupinus luteus
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| total genus |
58
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1982-04-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3HHB A; 2ZFO D; 4MQI A; 2AUQ A; 4ZVA A; 2HBD A; 1JP9 A; 2MYD A; 1NS6 B; 3UHT A; 4MPM A; 4HSW A; 2IN4 A; 1DLY A; 3QM8 A; 1VRF A; 3K8B A; 5JDO E; 3NFE A; 3WCW D; 2HBF A; 1MYI A; 3HRW B; 4ESA A; 3DHT B; 1O1I A; 1Y35 B; 1DXT B; 1RQ3 B; 3FH9 B; 1J41 B; 2AV3 A; 2GNV A; 3LB1 A; 5CNG A; 1MLN A; 1BVD A; 3M3B A; 1LHT A; 2D2M D; 3UHU A; 2G3H A; 1LA6 A; 1GJN A; 3ZHW A; 1A00 A; 4X0L B; 1ABY B; 3ZJN A; 2BWH A; 4F6D A; 1COH A; 4U8U A; 2XKI A; 1VXH A; 1V4U B; 1NIH B; 1MBO A; 3G46 A; 2W6V B; 2VYY A; 1M6M A; 1YVQ A; 3H57 A; 1ECD A; 3WR1 A; 1YHU D; 2MYA A; 3HF4 B; 3ORD A; 3S48 C; 1S5X A; 1AJG A; 1MLF A; 2OH8 A; 2O58 X; 3LR7 A; 3QJD A; 4MQH A; 1GLI A; 3PT7 B; 4TWU A; 2MGH A; 3NL7 A; 1A0Z A; 1XZ5 A; 2AA1 A; 1V4X A; 108M A; 2EF2 A; 1CG8 A; 4PQC A; 1UFJ A; 4YU3 A; 1DXV A; 3WHM B; 2R4W A; 1XZ2 A; 5EU2 A; 1YEV A; 3VRG A; 2Z6T A; 1Y5J B; 2BLH A; 1LFQ B; 2ZSO A; 2MGM A; 2GNW A; 3GOU B; 2VRY A; 1Y7G B; 1RTE A; 1YCA A; 3P5Q B; 1LFL B; 5ILM A; 5CN9 A; 5EOH A; 1Y0A A; 4NK1 A; 3ODQ B; 2PEG B; 1S5Y B; 2MGI A; 1QXE B; 3PIA A; 4NXC A; 2ZLX B; 1XZ7 B; 1A6K A; 1MLG A; 5JGG B; 1BUW B; 1J7S A; 3DR9 A; 1NS9 B; 1DUK A; 1XZU A; 1Y7D A; 3VRE A; 1Y4B A; 2LH7 A; 1O1O A; 3GK9 A; 110M A; 1SDL B; 1Y4Q A; 1MZ0 A; 3A59 A; 4SDH A; 1IRD A; 1VXB A; 1MBN A; 1MLH A; 3QJB A; 3UHW A; 107M A; 4MQK B; 4ODC B; 2VEE A; 1Y7Z B; 3IA3 B; 5E6E A; 1XZV B; 2HHD B; 1VXG A; 1FLP A; 1SDK B; 5KDQ B; 3WCV A; 2XYK A; 1NWN A; 2W6X A; 2R50 A; 5CNC A; 2HCO A; 1WMU A; 1CP5 A; 4VHB A; 2Z6N A; 1ABW A; 1QSI B; 1MYF A; 3UHG A; 5CNE A; 1S69 A; 3D17 A; 3NMM B; 3GYS A; 2FRK X; 2XKH A; 1QPW A; 4L7Y B; 1YIE A; 3BJ1 B; 2D5X A; 4H0B A; 2DN2 B; 2ZT3 A; 2M6Z A; 3VRF A; 1BZ1 B; 2BMM A; 3G53 A; 1HSY A; 1ITH A; 3PI9 B; 1A3N A; 1BBB A; 1Y0D A; 4YU4 B; 1FDH A; 2ZLU A; 1S61 A; 1C7D A; 4XS0 B; 1HDA B; 4WJG A; 1C40 B; 3DHR A; 4M4B A; 3UHE A; 1Y8W A; 3G4V A; 1ECN A; 1BJE A; 1DXC A; 5CHQ A; 1KD2 B; 2MHB A; 3WCW A; 3AQ5 A; 1I3E A; 6HBW B; 3UI0 A; 4DC8 A; 3AT6 A; 4N8T B; 1HV4 B; 1CPW A; 1BIJ B; 1OFJ A; 1NS6 A; 1F63 A; 3VAU A; 1IT3 A; 5HU6 B; 3A5G A; 1O1K B; 3D4X B; 1MWC A; 3MKB B; 3S1I A; 2ZS1 C; 3MN0 A; 1CH3 A; 1YFF B; 3KUO A; 4O2G A; 3HRW A; 2OHA A; 3DHT A; 1MBS A; 1Y35 A; 2MGA A; 1DXT A; 1RQ3 A; 2LHB A; 1BZ0 A; 1CQ2 A; 1J41 A; 3FH9 A; 4MQG B; 1B0B A; 1MOH A; 3RJN B; 3UHH A; 5F0B A; 3UBC A; 1G0A B; 1SPE A; 3ONZ B; 5F2A A; 1HAC B; 1NWI A; 4X0L A; 1ABY A; 1LH1 A; 2WTH A; 1FDH G; 3ECL A; 1S0H B; 1YEQ B; 1LH2 A; 1NIH A; 1V4U A; 2ZLW B; 2W6V A; 3SZK B; 7HBI A; 104M A; 3HF4 A; 4FWY A; 1MYZ A; 3M3A A; 1DTI A; 1Y45 B; 2OLP A; 3PT7 A; 1VWT B; 2JHO A; 3WHM A; 1YEO B; 4MU5 A; 4BJA A; 1JW8 A; 1TU9 A; 4G51 B; 1MNK A; 4ROM B; 1Y5J A; 1LFQ A; 1HDS B; 2IG3 A; 2RI4 B; 3GOU A; 3PI1 A; 2MGK A; 1THB A; 1JL7 A; 1Y7G A; 3M38 A; 2QSS B; 1LFL A; 1GDJ A; 1J52 A; 3UHR A; 1NZ5 A; 2SPL A; 3ODQ A; 1Y0C B; 2PEG A; 1S5Y A; 3WR1 B; 1HGB B; 2ZLX A; 3CIU B; 1VXA A; 1XZ7 A; 1DXU A; 1ECO A; 5EYJ A; 3WCP B; 4HRT B; 5JGG A; 1BUW A; 1NS9 A; 3LB2 A; 5JDO D; 4U8U D; 5CND A; 1XYE B; 2ZS1 B; 2MGD A; 1MLS A; 1URY A; 3FS4 B; 1SDL A; 1DO7 A; 1LFY B; 2SPO A; 3ZJJ A; 3GKV B; 1UVY A; 1Y01 B; 1NGK A; 1WLA A; 3QM9 A; 1DWS A; 5EE4 C; 5CN8 A; 4MQK A; 1MBC A; 1Y7C B; 1OJ6 A; 3UHN A; 3WFT A; 4ODC A; 1CH5 A; 1Y7Z A; 2ZS1 D; 2HHD A; 3LQD B; 1JL6 A; 1HLM A; 4UUR A; 5KDQ A; 1EWA A; 1HHO B; 4NS2 A; 1W92 A; 1HBS B; 3HEN A; 2ZSX A; 3ZOL A; 1DM1 A; 2QMB B; 1Y31 B; 1QSI A; 1L2K A; 1DWT A; 1Y09 B; 3G4Y A; 3NMM A; 1JP8 A; 4MXL A; 1CO8 A; 3BJ1 A; 2DN2 A; 1BZ1 A; 1HLB A; 1RQA B; 2WTG A; 1YZI B; 3PI9 A; 4YU4 A; 5KER B; 1C7B B; 4XS0 A; 1HDA A; 4TWV A; 2AV0 A; 1C40 A; 2ZT2 A; 5AZR A; 2NSS A; 1N9X A; 3ZJQ A; 3ECZ A; 5E29 A; 1G9V A; 3G52 A; 106M A; 1Y4P B; 6HBW A; 3K3U A; 3ASE A; 3UHS A; 4N8T A; 1HV4 A; 1K1K B; 3IC2 A; 2MGJ A; 1YEN B; 1EBC A; 1Y83 B; 2GLN A; 1BIN A; 1CIO A; 2VHB A; 5SW7 B; 1CMY B; 1LH7 A; 3ZJL A; 5B85 A; 5HU6 A; 1O1K A; 3D4X A; 3MKB A; 1YOG A; 1HAB B; 1SPG B; 3LR9 A; 4WJG 1; 1YFF A; 2G0X A; 1NZ3 A; 2HBS B; 2DXM B; 2ZS0 C; 2BKM A; 5HLU A; 4MQG A; 3QM7 A; 4JYQ A; 4F6I A; 1G0A A; 3ONZ A; 1XCH A; 1HAC A; 1NEJ B; 3AT6 B; 5CN5 A; 1HRM A; 1Y8H B; 3IC0 B; 1JF4 A; 3MJU B; 1S0H A; 1YEQ A; 1UT0 A; 1Y2Z B; 2ZLW A; 1F65 A; 1QSH A; 3SZK A; 1YVT B; 1A9W E; 3HYU B; 1Y45 A; 4ROL B; 1JZL A; 1M6C A; 2SPM A; 1VWT A; 4F6B A; 5JDO F; 4HHB A; 1BZ0 B; 1YEO A; 1A01 B; 4G51 A; 4ROM A; 3HXN B; 1CH2 A; 3UHB A; 2LH5 A; 1HDS A; 2RI4 A; 4UZV A; 4F6J A; 3ED9 A; 1A9W A; 2NRL A; 2QSS A; 1ECA A; 3UGY A; 2LH2 A; 1Y0C A; 2E2Y A; 1A6G A; 1HGB A; 2EKU A; 1Y4G B; 3CIU A; 3V2Z A; 1MNI A; 1CQX A; 3WCP A; 2YRS B; 4HRT A; 4F6G A; 2GTL C; 4PNJ A; 1N9H A; 1LFZ B; 1AJ9 B; 3MJP B; 1OR4 A; 1G0B B; 4LPI A; 4C0N A; 4PQB A; 1XYE A; 2ZS1 A; 2QLS B; 1LH6 A; 3G4U A; 3O89 A; 3ARL A; 3WCT C; 4QAU A; 1B86 B; 3FS4 A; 1HBR B; 1LFY A; 4NI1 B; 3ZJI A; 3UH6 A; 3GKV A; 2ZS0 B; 1THB B; 4N7O B; 2GRH A; 1CH9 A; 1Y7C A; 1SHR B; 1VXF A; 1CBM A; 1YGF B; 3ARK A; 1CIK A; 3ZH0 A; 3LQD A; 3QQQ A; 4O4Z A; 1JP6 A; 1M9P B; 1MYJ A; 2BLJ M; 4G1V A; 1HHO A; 2W6Y A; 1YOH A; 1DXU B; 1HBS A; 2ZS0 D; 1F5O A; 1A0U B; 2QMB A; 1MLM A; 3QQR A; 1Y31 A; 2HBC B; 1CBL A; 1GCW B; 1Y09 A; 3A9M A; 2R4Y A; 3QZZ A; 1X3K A; 1YE0 B; 1BZR A; 2V1H A; 1RQA A; 3OO4 B; 1YZI A; 4L2M A; 1GVH A; 5CMV A; 3OGB A; 1HDB B; 1MYG A; 5KER A; 1C7B A; 4C44 A; 4NZI A; 3OO5 B; 3QZX A; 2H8D B; 2G14 A; 3PI4 A; 3GQR B; 1R1X B; 1LH3 A; 1K0Y B; 1A4F B; 2V1I A; 4FH7 A; 4MAX A; 2MB5 A; 5HAV A; 1Y4P A; 3PI3 A; 3W4U B; 1LUE A; 1EMY A; 3BJ3 B; 1V4W B; 1GDK A; 1K1K A; 2AUP A; 2GTL B; 1YEN A; 1Y83 A; 1R1Y B; 3OZU A; 1S6A A; 3ZJR A; 5SW7 A; 1CMY A; 1DWR A; 1YMA A; 3WCT B; 1NQP B; 1HBG A; 2D2N C; 1HAB A; 1Y85 A; 5C6E B; 1D8U A; 1SPG A; 3EOK B; 3WCU C; 4GZG A; 1EW6 A; 1IWH B; 2ZSN A; 1ASH A; 1JZK A; 1J3Z A; 2DXM A; 2HBS A; 1MTJ A; 2DHB B; 4H07 A; 1J40 B; 3AQ7 A; 5E29 B; 3WCT D; 1G9V B; 2W6W A; 1MNJ A; 1YIH B; 3S1J A; 4ZVB A; 1GCV B; 1NEJ A; 4NXA A; 1RSE A; 1Y8H A; 3IC0 A; 2HBE B; 3E4N A; 3MJU A; 3IC2 B; 1BZZ B; 2NRM A; 4G1B A; 1V75 B; 1Y2Z A; 2EVK A; 3AT5 B; 1YVT A; 2EVP A; 3GQP B; 1CG5 B; 3ZJM A; 1HGC B; 2MGL A; 3HYU A; 4ROL A; 1UVX A; 1J7Y B; 1OBM A; 4ILZ A; 3UHV A; 5EV5 A; 1Y22 B; 1MYT A; 1DUO A; 1YCB A; 2QSP B; 1A01 A; 103M A; 5B84 A; 3HXN A; 1IDR A; 2D60 B; 1Y4F B; 1PMB A; 2MGB A; 3LB3 A; 3HEP A; 1MOD A; 4O1T A; 3A0G B; 1YEU B; 1QSH B; 1YGD B; 2HZ3 A; 105M A; 1HJT A; 5HLX A; 1Y4G A; 2VLZ A; 4AVD A; 2YRS A; 1DTM A; 3G4R A; 1LFZ A; 3OVU C; 1AJ9 A; 3MJP A; 2NSR A; 1G0B A; 4HHB B; 2MGC A; 2QLS A; 3WCU B; 1B86 A; 1MOB A; 1HBR A; 4NI1 A; 2GRZ A; 2ZS0 A; 4F4O B; 2C0K A; 1FAW B; 4F69 A; 4N7O A; 3BJ2 B; 1SHR A; 1YGF A; 2O5O X; 2AUR A; 1UIW B; 3K9Z A; 3LHB A; 3WCU D; 3S66 B; 1Y0T B; 1M9P A; 3KMF C; 1CO9 A; 3D1A B; 1BAB B; 2VEB A; 1A0U A; 2Z8A A; 1Y0W B; 2WY4 A; 1NXF A; 2HBC A; 1GCW A; 1MLJ A; 4MXK A; 1GBV B; 1O1N B; 3VHB A; 2G11 A; 1YE0 A; 1X9F C; 3WFX A; 1QXD B; 3OO4 A; 3NML A; 1YE2 B; 3AQ8 A; 3GQG B; 1HDB A; 1JZM A; 1XY0 A; 1YOI A; 2DN1 B; 1MNH A; 1YHR B; 1UC3 A; 2MYC A; 1XQ5 B; 2O5T X; 1G08 B; 3OO5 A; 1Y8I B; 2H8D A; 3GQR A; 1R1X A; 2ZFO C; 1GBU B; 1K0Y A; 1A4F A; 3ZJO A; 1C7C B; 3PEL B; 1RQ4 B; 3UHQ A; 2R1H B; 3W4U A; 1MTK A; 2ZSQ A; 3AQ6 A; 3BJ3 A; 1V4W A; 5ILE A; 2GTL A; 5EUI B; 1R1Y A; 2G0Z A; 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1Y5F B; 2SPN A; 2OIF A; 1FHJ B; 4F4O A; 5EQM A; 1FAW A; 3A2G A; 1J3F A; 3BJ2 A; 2GDM A; 1UIW A; 1YHU B; 3UGZ A; 3GDJ B; 1FSL A; 3S66 A; 2LH6 A; 2BNL A; 4KJT A; 1A6M A; 1Y0T A; 1KR7 A; 3D1A A; 1O1P B; 1BAB A; 1Y0W A; 1HBH B; 1AZI A; 1QI8 B; 1GBV A; 1O1N A; 2W72 C; 3QM6 A; 1MLR A; 1MWD A; 2VM0 A; 1GDL A; 2FRF A; 3GLN A; 3UHX A; 3WFU A; 2GKM A; 3AG0 A; 1GDI A; 1YG5 B; 1MLU A; 1QXD A; 4H2L B; 1YE2 A; 3UH5 A; 2V1E A; 2G12 A; 3GQG A; 2VYZ A; 2FRJ X; 2DN1 A; 1YHR A; 3RJ6 A; 5D1V A; 1J7W B; 1MBA A; 1XQ5 A; 1JEB B; 1G08 A; 4KN3 A; 1Y8I A; 1BZP A; 2H35 B; 1GBU A; 112M A; 3RGK A; 1C7C A; 3PEL A; 1RQ4 A; 4FC3 B; 3MOU A; 1KFR A; 111M A; 3AQ9 A; 1Y5K B; 2R1H A; 3CY5 B; 1BVC A; 1O1J B; 1PBX B; 3U3E A; 4M4A B; 1MBD A; 2G10 A; 5AZQ A; 4MQJ B; 5EUI A; 1IT2 A; 1YHE B; 4MQC A; 5EET A; 3KUN A; 3QJE B; 1EBT A; 3EU1 B; 1NPF A; 3PT8 A; 1XY0 B; 2RAO A; 2ZT0 A; 2MGG A; 1JDO A; 5CHR A; 3OZW A; 3DUT B; 3M39 A; 1UFP A; 1URV A; 2AUO A; 3OZV A; 2G0R A; 2QU0 A; 4HBI A; 3SDN A; 3GKT A; 1VRE A; 1Q1F A; 1Y4R B; 3KMF A; 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