The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
QTSQDLFSYQALYSYIPQNDDELELRDGDIVDVMEKCDDGWFVGTSRRTKQFGTFPGNYVKPLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Sorbin and SH3 domain-containing protein 1
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| publication title |
Structure Basis for the Recognition of Ataxin-7 PRR with R85FL SH3 Domain
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
65
|
| sequence length |
65
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-09-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ED0 A; 2KEA A; 4ESR A; 2SEM A; 1Z9Q A; 1J3T A; 3C0C A; 2VKN A; 2VWF A; 1AOJ A; 3RBB B; 1GBQ A; 3CQT A; 2RMO A; 2CSI A; 4IIO A; 4AFQ C; 2E5K A; 1MV3 A; 1ARK A; 2W0Z A; 2J6K A; 4OML A; 2FEI A; 2ROT A; 3I9Q A; 2PZ1 A; 4K11 A; 3M0R A; 4RTU A; 2DL8 A; 3LH5 A; 2CT4 A; 4EIK A; 2EYZ A; 1I1J A; 1GBR A; 1W1F A; 4D8D A; 1UGV A; 2YUQ A; 1JU5 C; 2HEQ A; 1UDL A; 2J6O A; 4LN2 A; 1UEC A; 2DRK A; 1ZLM A; 1WLP B; 4RTZ A; 1AVZ C; 2CRE A; 1WX6 A; 3VRY A; 2GNC A; 1VYV A; 1AEY A; 2DL7 A; 1WXB A; 2K3B A; 2X3W D; 1S1N A; 4Z89 A; 2AKK A; 2IIM A; 1MV0 B; 1YP5 A; 1B07 A; 1T3S A; 2DE0 X; 5IXB A; 2JXB A; 2KT8 A; 3PVL A; 4J9F A; 3I35 A; 1GRI A; 4J9G A; 2DNU A; 2LQN A; 3I5S A; 4HXJ A; 1M3A A; 2RN8 A; 1AZG B; 4Z8A A; 5FWB A; 2DF6 A; 2KNB B; 4AFU C; 4J9H A; 2DM1 A; 1KJW A; 2EKH A; 2RF0 A; 2J05 A; 1SSH A; 1PRM C; 2F2W A; 2BTT A; 1LCK A; 2HCK A; 2DBK A; 2ED1 A; 2K9G A; 3SHW A; 1UFF A; 2O9V A; 2D1X A; 3TVT A; 1WIE A; 4JJB A; 4CC3 A; 2DRM A; 4F17 A; 1WA7 A; 1ZUU A; 3NGP A; 1Y0M A; 1WXU A; 1UUE A; 1PWT A; 1YCS B; 1YN8 A; 2BZ8 A; 1PKS A; 2K79 A; 1CKB A; 2A08 A; 1KFZ A; 4CC7 A; 3EG1 A; 4F16 A; 1T3L A; 4Z88 A; 1PKT A; 4JZ4 A; 4HVV A; 2DX1 A; 2P4R A; 2DL4 A; 1AWO A; 1U06 A; 1TUD A; 2EQI A; 1K1Z A; 3VS1 A; 1OPK A; 3GBQ A; 3TSZ A; 1X27 A; 2EGA A; 2J7I A; 2YSQ A; 1FYN A; 2EYY A; 1T0H A; 2ESW A; 4JJC A; 3TSW A; 4GBQ A; 3EG0 A; 3FJ5 A; 1SHG A; 2V1R A; 5IHI A; 3M0Q A; 4RUG A; 2D8J A; 2CUD A; 2FO0 A; 2EVR A; 2RQU A; 2CUB A; 2EPD A; 1ZBJ A; 2MCN A; 1OEB A; 2DBM A; 1UG1 A; 5IXF A; 3VS5 A; 2D0N A; 4CC4 B; 2LZ6 B; 1HD3 A; 2AZS A; 2A36 A; 2RQT A; 1WDX A; 4RTW A; 1AZE A; 2JT4 A; 4J9I A; 2DMO A; 2CT3 A; 4AFS C; 2J06 A; 2D8H A; 2DL3 A; 1ABO A; 2M0Y A; 1G2B A; 2DL5 A; 1GCQ A; 2FPD A; 2RQV A; 1IO6 A; 5I11 A; 1GL5 A; 3PVQ A; 1I0C A; 2GTJ A; 2OJ2 A; 1AWW A; 1UJ0 A; 2FRY A; 3H0H A; 1H8K A; 1SRM A; 4D8K A; 1RUW A; 1W70 A; 2MIO A; 1SHF A; 2LJ3 A; 2RNA A; 3A98 A; 2K2M A; 1T0J A; 2LJ1 A; 2JMC A; 1OPL A; 2KXD A; 1BB9 A; 1RLQ C; 3H0I A; 2AKL A; 4X1V A; 5EC7 A; 4JJD A; 4OMP A; 1GCP A; 1I07 A; 2KGT A; 2KYM A; 3VS2 A; 2LMJ A; 1X2K A; 3H0F A; 2OAW A; 3R6N A; 2HBW A; 1QCF A; 1CSK A; 1HSQ A; 2AZV A; 1N5Z A; 4A63 B; 2EYW A; 4HVU A; 2CDT A; 2DVJ A; 1SRL A; 3KFV A; 2JMA A; 1EFN A; 2KE9 A; 5IH2 A; 2PTK A; 3M0U A; 1H3H A; 1H92 A; 4RTT A; 1ZX6 A; 1PHT A; 2FG0 A; 4LNP A; 2B86 A; 1M8M A; 3NPF A; 1JXM A; 2NWM A; 2L3S A; 2QDL A; 3EHR A; 4CC2 A; 5I22 A; 1ZSG A; 2H8H A; 3ULR B; 3I5R A; 4RTX A; 1NYG A; 1OOT A; 2FPF A; 1ZUK A; 1UHF A; 3UA7 A; 1E6G A; 1RLP C; 1X6G A; 2K7A A; 1K76 A; 3EGU A; 1U3O A; 2F2V A; 3U23 A; 2JS2 A; 4AG1 C; 2LP5 A; 2VVK A; 2KRS A; 3UAT A; 1X6B A; 1JQQ A; 1TUC A; 1YWP A; 5IHN A; 4GLM A; 1OV3 A; 2PNI A; 1SEM A; 3NHN A; 2X3X D; 3NMZ C; 1A0N B; 1E6H A; 2KYB A; 2JM9 A; 2I0N A; 2EGE A; 2JTE A; 4J9E A; 2O31 A; 4RTV A; 2YUP A; 2FRW A; 1QKX A; 4KRT A; 2GTO A; 1WYX A; 2G6F X; 3REA B; 1PNJ A; 1MUZ A; 2YUO A; 1G83 A; 1NEG A; 2O9S A; 1NEB A; 1W6X A; 4E6R A; 1CKA A; 2L2P A; 1M3B A; 2KXC A; 2MOX A; 1PRL C; 2L3P A; 3H41 A; 1K0X A; 4WCI A; 5HCK A; 1K4U S; 2BZX A; 1AD5 A; 2V1Q A; 1SPK A; 4RTY A; 2KRO A; 1WI7 A; 1B3Q A; 2EW3 A; 3VS0 A; 1AWX A; 1X2Q A; 1UTI A; 4OMN A; 2SRC A; 2EBP A; 2GQI A; 4JZ3 A; 1JO8 A; 1UE9 A; 2EYX A; 3O5Z A; 4ORZ A; 1UJY A; 1QKW A; 2O2O A; 3UF4 A; 4AFZ C; 2RQR A; 5GJW B; 1X69 A; 4ZNX A; 1K9A A; 3VS3 A; 4DEY A; 1NLP C; 2RQW A; 1VA7 A; 2DJQ A; 2L3Q A; 2HDA A; 3PE0 A; 2JW4 A; 4JPB W; 1QWE A; 3SEM A; 2ABL A; 2LCS A; 2EGC A; 1BK2 A; 2AK5 A; 1NM7 A; 4LUD A; 1GFD A; 2LX7 A; 4F14 A; 1VYU A; 2C0O A; 2HSP A; 1YNZ A; 1VYT A; 2NUZ A; 4HVW A; 1WXT A; 2RPN A; 2O88 A; 1GCQ C; 1UHC A; 2FPE A; 2YUN A; 3VRZ A; 1HJD A; 2CH4 A; 4LUE A; 1BBZ A; 1X43 A; 1Z9Z A; 5FWC A; 2ROL A; 3QWY A; 2DA9 A; 2LQW A; 2KR3 A; 4HCK A; 3THK A; 1FMK A; 5L23 A; 4J9C A; 2JM8 A; 2KBT A; 4OMQ A; 1K0S A; 3M0S A; 2LNH B; 4QT7 A; 4Y92 A; 1WFW A; 2M51 A; 1E7O A; 4OMO A; 3IQL A; 3VS4 A; 3UA6 A; 4DEX A; 1KIK A; 1Y57 A; 4FSS A; 1M3C A; 5ECA A; 1ABQ A; 2DIL A; 2K6D A; 2ECZ A; 3VS7 A; 1NYF A; 2F2X A; 3REB B; 4AG2 C; 3EHQ A; 2CH4 W; 4OMM A; 1TG0 A; 4R0K A; 2A37 A; 4M4Z A; 2BZY A; 4IIM A; 2YDL A; 3ZL7 C; 1NLO C; 2C0I A; 2KRN A; 3M0P A; 2W10 A; 1JXO A; 1YWO A; 4J9B A; 1KSW A; 2GBQ A; 2JS0 A; 1BU1 A; 1XOV A; 1GFC A; 2DLP A; 4LE9 A; 5IHK A; 1M30 A; 1AWJ A; 2L0A A; 2J6F A; 2DYB A; 5GJV B; 2XMF A; 2KT1 A; 2OI3 A; 3VS6 A; 2GGR A; 3M0T A; 3RNJ A; 3EG3 A; 1V1C A; 1NG2 A; 1ZUY A; 2CSQ A; 2LJ0 A; 1QWF A; 1RI9 A; 3EG2 A; 2A28 A; 1QLY A; 2C0T A; 2YT6 A; 5FW9 A; 3QWX X; 1M27 C; 3JV3 A; 1U5S A; 1JEG A; 2KRM A; 4J9D A; 2ENM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M7D E; 1VQN Q; 2MAM A; 2DPP B; 1Z9Q A; 1KQ2 A; 3SWN A; 3RBB B; 4BUG A; 1Q86 C; 4BI8 B; 1VIF A; 3CBP A; 4IIO A; 2E5K A; 1IGQ A; 2J6K A; 3T9N A; 2X4X A; 4FCY A; 3QHS A; 3C12 A; 4M78 G; 4BY6 B; 2R58 A; 2DL8 A; 3CC7 Q; 3CXC P; 1Y07 A; 2RJE A; 3CCU T; 2KVQ G; 5AT1 B; 1VQ6 T; 3S3M A; 2DO3 A; 3A1P A; 3URG A; 2E1H A; 4JRI A; 2J6O A; 1M90 C; 4J5Y A; 4FIB A; 3M54 A; 1VQ4 A; 2OTL A; 2HBP A; 1U1T A; 2VGM A; 4BY6 C; 4E7K A; 5GAN g; 4DBF A; 2YRC A; 1VOM A; 3PFS A; 3QO3 A; 5FU7 C; 2IIM A; 5J39 A; 1YP5 A; 4FM4 B; 3OYM A; 1BI3 A; 2PVG B; 4WTO B; 2QTV A; 4J9F A; 5GAO r; 3JB9 F; 1ZSZ C; 2LCL A; 1VQM T; 1JJ2 P; 2HKN A; 4IUP A; 2EQJ A; 2LQN A; 4EMH A; 3QBY A; 3CMA Q; 3CPW S; 3JCM Q; 5LJ5 j; 1M3A A; 2RN8 A; 1G3S A; 2XG8 D; 3A5Z B; 4Z8A A; 1VQ5 Q; 4F7U A; 2J05 A; 4DOV A; 3CME A; 4E7I A; 3G6E Q; 4DBQ A; 1PRM C; 2GCX A; 1VQL A; 4R55 A; 1LCK A; 5KYW A; 2L89 A; 1BIA A; 5D6Y A; 4A4E A; 4R56 A; 2CKK A; 1UFF A; 2O9V A; 2D1X A; 4DBH A; 1WIE A; 4JJB A; 4CC3 A; 1HYO A; 1ZUU A; 4ATO A; 3MP6 A; 4KBM B; 1WXU A; 5KH6 A; 1YCS B; 4PJO F; 4X9C A; 2K79 A; 3FC3 A; 1CKB A; 2XU8 A; 4CC7 A; 2QGF B; 4LDV A; 2JNG A; 4M77 F; 1LPL A; 3VS1 A; 2EFI A; 5KCH A; 1BKB A; 3JCM g; 1YHQ A; 3JB9 J; 3HRS A; 3PGG A; 3EG0 A; 5DY9 A; 1V76 A; 3CCQ A; 3CPW A; 2WAC A; 1WQW A; 3ASK A; 3F70 A; 3M0Q A; 3OSV A; 4L5G A; 3CCM A; 2X35 A; 2D8J A; 1Y7X A; 4M7A A; 1VQ7 T; 2RQU A; 2CUB A; 1G5V A; 3BDL A; 2MCN A; 2JVV A; 2CZ0 B; 1TUG B; 1UG1 A; 5IXF A; 4HCC A; 1IRE B; 1GXI E; 1WDX A; 3MEA A; 4AFS C; 2CT3 A; 3SWN B; 2M0Y A; 1GCQ A; 1NE8 A; 1IO6 A; 5HY6 A; 3PVQ A; 2EQK A; 4E47 A; 3CC4 A; 2FRY A; 3A8G B; 5GAN h; 1SRM A; 5GAO m; 1RUW A; 2P0K A; 3SWN C; 3NTI A; 1D09 B; 3VYG A; 4M77 E; 4ZTF A; 1SHF A; 5IAY A; 5FU6 C; 2ZPB B; 2FZK B; 2O4X A; 2JMC A; 2QGG A; 3H0I A; 2L5Q A; 4OMP A; 4PJM A; 1I07 A; 1OX9 A; 3OW2 P; 1OQK A; 2HAX A; 1QCF A; 1CSK A; 3CCR A; 2PU9 B; 3RES A; 4N4I A; 4A63 B; 3AT1 B; 3PMI A; 2PTK A; 1WHG A; 1H92 A; 4RTT A; 1ZX6 A; 1PHT A; 1SF9 A; 2ZGW A; 1M8M A; 3NPF A; 1YJN Q; 2NWM A; 1Q86 R; 5I22 A; 1ZSG A; 1K9M U; 4II1 A; 2H8H A; 4E2F B; 1OOT A; 3EFO A; 4Y28 E; 1FX7 A; 4F7U B; 1X6G A; 3EGU A; 2K7A A; 3U23 A; 2XD0 A; 2CYZ B; 3C95 A; 4C8Q F; 1VQ8 T; 1X6B A; 5I2M A; 1M8V A; 5CKF A; 2QK0 A; 2VC8 A; 3OQ5 A; 1OV3 A; 1M90 R; 2X3X D; 5EG2 A; 4A53 A; 1E6H A; 2KYB A; 2JM9 A; 1S72 A; 2EGE A; 3GNG A; 4M75 D; 2MPX C; 3TU4 K; 2X9H A; 2FRW A; 2MI6 A; 2ZCF B; 3X28 B; 4KRT A; 1WJS A; 4N4G A; 2DIG A; 1YBY A; 1NEB A; 1W6X A; 5GAO p; 3J80 E; 1CKA A; 2L2P A; 4C8Q A; 4N0A A; 3UPU A; 1PRL C; 3H41 A; 5CKD A; 1BI0 A; 3CCV Q; 3E9G A; 1YIJ Q; 1WI7 A; 3X26 B; 1K9M C; 3RER A; 4M7D D; 4EPC A; 4M7A B; 3FB9 A; 3X20 B; 4MMK A; 2RJF A; 1UE9 A; 3O5Z A; 2QG9 B; 1VQO A; 4ORZ A; 2V8K A; 2GQV A; 4FT4 A; 4M75 G; 2QI2 A; 1R8O B; 3UF4 A; 5GJW B; 1X69 A; 2FVU A; 3CD6 A; 4J6W A; 3CCS Q; 2OTL T; 4M7A C; 2JW4 A; 2E3I A; 4LDU A; 4XTY A; 2LCS A; 2DXU A; 1BK2 A; 2LT4 A; 2FB7 A; 3OMG A; 1MMG A; 2C0O A; 3ZBD A; 4P5N A; 1NJI C; 1VYT A; 2WSC E; 2NUZ A; 4HVW A; 2O88 A; 3RIR A; 1GCQ C; 2O4X B; 2CH4 A; 1BBZ A; 4M7D G; 3A8L B; 1KHC A; 2DA9 A; 1PG5 B; 4HCK A; 4JRP A; 1FMK A; 4J9C A; 2RJD A; 1K0S A; 4QT7 A; 4Y92 A; 3RKX A; 1WHL A; 3CME T; 1MNE A; 1MGQ A; 1VQL T; 4FSS A; 5FRN A; 5GAN 8; 3V7C A; 2F1L A; 2ECZ A; 4FU6 A; 2DKG A; 2K2V A; 1WZO A; 3CCE A; 3EHQ A; 2CH4 W; 5LJ3 e; 1VQN A; 4XU2 A; 4M4Z A; 3CBO A; 2C0I A; 4M78 B; 1YWO A; 4UC4 A; 2QDY B; 2JS0 A; 1GFC A; 2DLP A; 2GFU A; 1AWJ A; 2J6F A; 2M0O A; 3HRU A; 2VYT A; 3M0T A; 2LCC A; 2BUD A; 3JCM b; 3EG3 A; 4C0D B; 1YHQ T; 3CC7 A; 4A4G A; 5GAN 6; 1QWF A; 1RI9 A; 3G4S A; 1QLY A; 4M78 C; 2C0T A; 3CCQ T; 2EIF A; 5FW9 A; 3M55 A; 3CCM T; 1U5S A; 5GAN 2; 3J7A F; 2ENM A; 4ESR A; 3DB4 A; 2SEM A; 3CBM A; 3JB9 D; 5LJ3 h; 3BFM A; 3OYJ A; 4C0D C; 5KE3 A; 4BI4 A; 2E12 A; 4RCC A; 1UB4 A; 2HZY A; 3GP8 A; 1GBQ A; 2P4T A; 3GIB A; 3S3N A; 3CPF A; 4IUU A; 2QQA A; 3KXT A; 3I9Q A; 2Y4X A; 3UDC A; 3CC4 T; 4ZN3 A; 3PNW C; 3OYL A; 1PC0 A; 2EYZ A; 1I1J A; 3CMA A; 1GBR A; 2QA4 Q; 1N6A A; 4N0A C; 2HEQ A; 5CK9 A; 1VQ5 A; 3M9Q A; 2K57 A; 3G6E A; 3OS0 A; 2DET A; 5KCO A; 2DRK A; 1ZLM A; 2LDM A; 1WJQ A; 4RTZ A; 1WX6 A; 1FWZ A; 4J7I A; 2QAZ A; 4C92 E; 5CO7 A; 4D6W A; 1N8R U; 2E5Q A; 4J83 A; 1WXB A; 4JRQ A; 4M77 D; 3E1S A; 2K3B A; 3CCR T; 4B6M A; 4Z89 A; 2M16 A; 3O8V A; 2K5L A; 1MV0 B; 1LNX A; 1T3S A; 3JCM W; 2DE0 X; 5LJ3 d; 5IXB A; 2KT8 A; 4KH0 B; 3I35 A; 1GRI A; 2R5M A; 4OGE A; 2DNU A; 2RD1 A; 3DB3 A; 4DBR A; 1MMA A; 3BE3 A; 3I5S A; 2EJF A; 2YWW A; 5GAO n; 4J9H A; 2DM1 A; 2YLC A; 2EKH A; 2RF0 A; 1K9M R; 4YTL A; 3UT1 A; 5KE2 A; 1VQ6 Q; 1UGS B; 2DBK A; 2XID A; 4IUT A; 2K9G A; 4LDW A; 5HK0 A; 1YI2 Q; 4F17 A; 2DRM A; 2K3Y A; 3NGP A; 1BIB A; 1X75 C; 3DKM A; 2M1H A; 5GAM g; 3RKY A; 2X4Y A; 1SG5 A; 1YN8 A; 2A08 A; 3QDF A; 4B9W A; 1LJO A; 1UGP B; 1T3L A; 4Z88 A; 3MEV A; 4XTX A; 2X51 A; 3G1J A; 1S72 T; 1PM3 A; 2MYS A; 1AWO A; 2DL4 A; 1I4K 1; 1NPP A; 4XTU A; 3OYD A; 4RMO A; 1EX4 A; 1WGS A; 1N8R C; 4OB2 B; 5GMK i; 1YIT Q; 1RAI B; 3CXC S; 5CKB A; 3GBQ A; 2WSF E; 3TSZ A; 2J7I A; 2CZ7 B; 1FYN A; 5GMK l; 3C4S A; 2EYY A; 3CCJ Q; 3TSW A; 4GBQ A; 3NTH A; 2LNV A; 3FJ5 A; 2EWN A; 3KBG A; 1U1S A; 3JB9 H; 1QMC A; 3A8O B; 2FHD A; 1ZBJ A; 5FRM A; 4QQG A; 2DBM A; 2RA2 A; 3VS5 A; 4CC4 B; 1HD3 A; 2RQT A; 2LX9 A; 4RTW A; 2D9T A; 2FL7 A; 2ZAE A; 2J06 A; 1ABO A; 2DD4 A; 2HL3 A; 1D0X A; 2HD0 A; 2RM4 A; 3JCM V; 4EMG A; 3D7S B; 1PSE A; 1KD1 U; 2RQV A; 1IZ6 A; 2CP3 A; 2FZG B; 1SSF A; 1GL5 A; 2LQ8 A; 1JJ2 S; 1ZBX A; 2MMP A; 2OJ2 A; 1G3T A; 3H0H A; 1YFN A; 3CD6 T; 1H8K A; 3HHT B; 4KGV B; 1YJN A; 5D7U A; 4F7U F; 3TCJ A; 3RR6 A; 1W70 A; 3CXC A; 3FIF A; 3OYN A; 3QYH B; 1WQ7 A; 3H6Z A; 2NUP B; 4RG2 A; 1OPL A; 1BB9 A; 2AKL A; 1GCP A; 3A8M B; 3VS2 A; 2JN0 A; 2KYM A; 5LJ5 g; 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