The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
44
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structure length |
44
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Chain Sequence |
TKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| molecule keywords |
Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A
|
| publication title |
Cross-Validation of the Structure of a Transiently Formed and Low Populated FF Domain Folding Intermediate Determined by Relaxation Dispersion NMR and CS-Rosetta.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
|
| structure length |
44
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| sequence length |
44
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-10-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | FF domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LKS A; 2DOD A; 2KFD A; 2KIS A; 2DOF A; 2B7E A; 2L9V A; 2E71 A; 4FQG A; 1UZC A; 2DOE A; 2CQN A; 2K85 A; 2KZG A; 2JUC A; 2KIQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3IH4 A; 1SMT A; 1D1B A; 3CD6 I; 2QCO A; 2MC3 A; 1OMI A; 1HLV A; 2L5Q A; 3TO9 A; 1UG0 A; 4D5C A; 1ONV A; 3FBI B; 5DV5 A; 1RIO H; 4XKW A; 2R5Z A; 4GDF A; 3CP2 A; 5IOY A; 1P4X A; 4BXF A; 4MO7 A; 1Z7U A; 3MVP A; 3ZMU A; 4FX4 A; 1Z77 A; 2QBY B; 2VBX A; 4ZC3 A; 3ZXS A; 1H9G A; 1YW9 A; 4D7N A; 4M71 A; 3KLO A; 3DXJ F; 3E6B A; 4L5I A; 1ZAR A; 1X3U A; 4XK4 A; 1MJB A; 5CVR A; 2LH9 A; 2NOG A; 4CXF A; 2Y0S N; 1B9N A; 4XLF A; 2K7L A; 1ZHF A; 2LTP A; 1FTT A; 4BXU A; 5GPC A; 3HOV J; 2HR3 A; 2V9P A; 2IW5 A; 4IZZ A; 4M3B A; 3MZH A; 3HOW J; 3IH3 A; 1BR2 A; 3EPZ A; 3CES A; 4AIK A; 3A1Y A; 2KIU A; 3KP7 A; 2FX0 A; 4J01 A; 1YW7 A; 3D5S C; 4Y33 A; 1ZH5 A; 3ZRG A; 1O3T A; 3W2V A; 1Y1V J; 2E2H J; 1YJW I; 3I4N J; 1SC7 A; 4IEJ A; 4B48 A; 4YIF A; 4FTH A; 2CJJ A; 4Q48 A; 1G8X A; 3K2A A; 1BJZ A; 1G3Y A; 2DTR A; 5K7Z A; 2LSO A; 4U7B A; 3RKW A; 3ZQF A; 3FBN B; 1RPW A; 3CME I; 4AM3 A; 2MG4 A; 4C2U A; 2OJE D; 5JLW A; 1KQ0 A; 4JX4 A; 3WTU C; 2DO7 A; 4ESF A; 1SAN A; 4AYB N; 4GFB A; 3SDG A; 4IX7 A; 3VFZ A; 3GXO A; 4YII A; 5JHU A; 4UUS A; 1X3W B; 3QOP A; 1T39 A; 3FK7 A; 2NRA C; 3MKW B; 1YIT I; 2XAH A; 3ASN H; 4LLL A; 2K9S A; 1O4X A; 2OCC H; 1ACI A; 1K79 A; 2HDD A; 4EJO A; 3DEE A; 2W82 A; 3C3W A; 3GZ5 A; 3PJR A; 3F3X A; 1S5L C; 1JHH A; 1CF7 A; 3BTC A; 2WBM A; 2BE5 F; 4F92 B; 4I99 C; 2QSF X; 3DU6 A; 3K7A J; 2ZME B; 3U1K A; 4LK1 F; 1FMV A; 3IWF A; 1APL C; 3W2A A; 2KZV A; 1GT0 C; 2EQR A; 1PVE A; 1PDN C; 3RSN A; 4UV8 A; 3OIO A; 2ZFW A; 4I02 A; 4DJA A; 1V4R A; 1W0T A; 1IW7 F; 1YE9 A; 3UNG C; 1H9T A; 3EUH C; 1XD7 A; 3IAS 2; 1V5E A; 1FBQ A; 2ISY A; 4XOP A; 3HHG A; 5DCM B; 3CJN A; 3W6K B; 4BAC A; 2ACJ A; 3HGG A; 1R22 A; 2OPT A; 4PUS A; 4UNO A; 4II2 A; 4HV5 A; 4M74 A; 2RQP A; 2BEO A; 4LIV A; 2MAB A; 1TNS A; 2IA1 A; 2V1U A; 3H35 A; 4P9F A; 1FOY A; 3DPU A; 1O3R A; 4RLQ A; 2KRC A; 5FJ8 J; 3KFW X; 3GFL A; 3IWZ A; 3QRF F; 1XG1 A; 4E7I A; 3GTL J; 4B44 A; 1YI2 I; 1RKT A; 2VUM J; 4ZDP A; 3NQO A; 2VPL A; 2M30 A; 3QQA A; 4WCG A; 2XHK A; 1A35 A; 2DU9 A; 1I6H J; 1LDD A; 2DT5 A; 3R0A A; 4QTR A; 3LSK A; 2XB5 A; 3AG4 H; 4XSX F; 4S0H B; 4I98 B; 2YU3 A; 5IYD J; 2FA5 A; 2HDW A; 2P6S A; 2VPR A; 1B72 B; 3K1N A; 3FHZ A; 2V1D A; 3Q0U A; 1EA3 A; 1D1C A; 4U0V A; 3CUQ A; 1ZG5 A; 2FXA A; 2HU9 A; 2RGV A; 5HLH A; 2NVT J; 4MQ9 F; 1ZEL A; 1R71 A; 1IUY A; 1FSE A; 1B6A A; 4ZTJ A; 1RUN A; 3ZR8 X; 1MH4 A; 5F1J A; 2E7X A; 3QP6 A; 1HW5 A; 1K61 A; 3BTL A; 1JGG A; 4A3C J; 3RKX A; 2F5C A; 3OYE A; 1MKM A; 1M1E B; 2JPB A; 3F8F A; 4CO8 A; 2ICW G; 1MBG A; 2X6X A; 4LK0 F; 2O7O A; 1T56 A; 5JVG F; 1FSH A; 2FEZ A; 1I27 A; 5E79 C; 2R92 J; 3FXO A; 4E7S A; 3TED A; 2E2J J; 5L3C A; 1FP2 A; 1XSV A; 3KYC B; 2W84 A; 1GLN A; 2ESN A; 3ABU A; 2DK5 A; 4MLO A; 1TT0 A; 1XB4 A; 2CQX A; 2MGQ A; 1K4T A; 4BXX J; 5CLS A; 1N78 A; 2L01 A; 1AHD P; 4KIG A; 1ETX A; 4UVC A; 3IL2 A; 1OCZ H; 3E7L A; 2DOA A; 2XPW A; 4CCJ A; 1QO0 D; 4AIJ A; 4E7H A; 1WFX A; 2F6C A; 2EZI A; 2M8G X; 1KU9 A; 4MEX F; 3KZZ A; 4HX8 A; 2IS6 A; 1J9I A; 3LSI A; 1B9M A; 2R7U A; 2JZY A; 1H0M A; 3QU3 A; 1SD6 A; 2CQ7 A; 2LKX A; 5D6F A; 5DTD A; 4ASN A; 3AFH A; 3WG9 A; 2RV8 A; 4AYB A; 2BBY A; 1K6O A; 3RQ4 A; 5HLT A; 3NWT A; 1MJ9 A; 4N4O B; 1FYK A; 1G3T A; 4W1U A; 2Z9O A; 2XGC A; 4OAY A; 2X51 A; 2E34 A; 5EZH A; 3CO6 C; 1YOV B; 2LLK A; 3OYN A; 2VKD A; 1VQ4 I; 5CJ9 A; 3Q0V A; 2OCE A; 3BT9 A; 1R36 A; 3LSG A; 1ODD A; 4AUX A; 3C18 A; 3OYJ A; 2HZD A; 4AVP A; 3RPQ A; 1DU6 A; 3PNV A; 2Q2E A; 1K78 B; 4XRM A; 1OR7 C; 1JT0 A; 4CSW A; 5HS8 A; 2O9L A; 3S1N J; 3IP4 B; 3HOX J; 2QF7 A; 4FX0 A; 3AAF A; 3HOS A; 4RAG A; 5FRM A; 4OIQ F; 1JUP A; 1MH3 A; 3KCC A; 3S2W A; 2A6T A; 4QPO A; 3WHC A; 1BC8 C; 4RA2 A; 1PUF A; 4LIU A; 4G6D A; 4UB6 C; 4XID A; 1CGP A; 3T5X A; 4BJT A; 4X0G A; 2XF6 A; 3JRE A; 3M8J A; 1QU3 A; 1R5G A; 3D0S A; 2DN0 A; 3HHH A; 3KIO A; 2BY0 A; 2IJL A; 3DU5 A; 1JXS A; 3JRD A; 1XC5 A; 1D8K A; 3BPV A; 1W4M A; 4UXN A; 1B4A A; 2NS7 A; 2MBF A; 1B8I B; 3KP5 A; 5LFA A; 1GVD A; 4E7K A; 2L54 A; 2ISZ A; 2KJC A; 5FRN A; 4C9Y A; 4B47 A; 1RR7 A; 4IHY A; 5BOX A; 2MD0 A; 5JFR A; 2FUG 2; 2EBI A; 3JSO A; 1UHM A; 1ZGA A; 2CFO A; 2K9N A; 4PGH A; 1QBJ A; 5CVJ A; 3RZD J; 3BR3 A; 4GYG A; 3JTH A; 5ILS A; 4QSH A; 3LSP A; 1XS9 A; 2LYC A; 2XAQ A; 3BR0 A; 3SHF A; 2VQC A; 3HOY J; 3SFI A; 1SVL A; 2UUZ A; 4EM2 A; 1DPU A; 2JVH A; 4A3I J; 1BN5 A; 4HX7 A; 4XLP F; 3K70 D; 3Q9V A; 4E70 A; 1EH7 A; 2PMZ N; 5DDG A; 2BYV E; 1VQ7 I; 2DA7 A; 3CP8 A; 3QYF A; 4Q47 A; 5CYV A; 1W36 D; 2OTJ I; 4OIP F; 1LUJ B; 1QPI A; 3FKI J; 1V54 H; 2DCE A; 4HF2 A; 5HOD A; 1E2X A; 2V1X A; 3GVA A; 4BS9 A; 2CV1 A; 3NEU A; 5EJC A; 5KK1 A; 4IRH A; 1SAX A; 3A01 B; 1Y8R B; 3OSF A; 4LGW A; 4IRI A; 5HDK A; 1D0Z A; 1TQP A; 1X19 A; 4LLG F; 4ZJZ A; 2XAU A; 3OYM A; 3N4M A; 1D5V A; 1Z05 A; 3PUB A; 4E4H A; 4AU7 A; 2STW A; 1X2N A; 4M73 A; 4L0Y B; 4FET A; 1Y0U A; 4NUB A; 3TBI A; 2V79 A; 2TRT A; 4NQW B; 1VTN C; 2VBZ A; 2P81 A; 4NC7 A; 1RKW A; 2WV0 A; 1PJR A; 4MIM A; 1MMA A; 1VQM I; 4L0Z B; 4DYC A; 3OL3 A; 2R5Z B; 1SFK A; 4G7H F; 1O3Q A; 2E1N A; 1GVJ A; 3CMM A; 2GWR A; 4LLN A; 3TMO A; 1KON A; 1MZB A; 1MMN A; 5J1R A; 1DQU A; 5B1A H; 4DYQ A; 2JA6 J; 5D4R A; 4N0B A; 1FLI A; 2EIN H; 2IGM A; 4JX5 A; 4ENM A; 2D2W A; 4M6V A; 1W0U A; 5EYR A; 5KHD A; 2V1N A; 3OL4 A; 2D1V A; 4U0W A; 3O3K A; 1D5Y A; 9ANT A; 3EQL F; 2YS9 A; 2IA2 A; 2DMN A; 4Q5S F; 2OQR A; 2L0K A; 3FF5 A; 2HZT A; 3T0Y A; 3AG1 H; 4Y52 J; 2W85 A; 5K1Y A; 2B63 J; 2HYG D; 1UMQ A; 3H5A A; 2OC6 A; 3FM3 A; 5FLX Z; 1F9N A; 5E3O A; 4AC0 A; 1I1G A; 4XQF A; 3IV5 A; 1R9T J; 3PO2 J; 2DQL A; 5D5W B; 2UXN A; 1IN8 A; 3KEQ A; 2ZC2 A; 2IS4 A; 2LP0 A; 2QQ9 A; 3S32 A; 2IVM A; 2M34 A; 2CFX A; 4IO9 F; 4I6Z A; 5LGT A; 3DEW A; 3HUG B; 2AQF A; 5E8G A; 4KNY A; 3X2Q H; 2DYS H; 3R61 A; 5LGU A; 4E7J A; 1YLF A; 2LFB A; 4DYR A; 3BG7 A; 3O2P E; 2PQ8 A; 1TQM A; 1P92 A; 4BJ5 C; 1XGM A; 2R7W A; 1Y6I A; 3DKX A; 3KPH A; 2W24 A; 4HG2 A; 4NNJ A; 1Z0X A; 2BHY A; 2VJI A; 1G59 A; 2L9R A; 2K86 A; 4X1E A; 5HS7 A; 2E36 A; 3KEO A; 2CW8 A; 4KN7 X; 4UUS B; 1H8A C; 5L3B A; 2I10 A; 2EIK H; 3B6C A; 3V7R A; 3CLQ A; 5DUI A; 3RCO A; 2M0C A; 3R4K A; 1FYL A; 3VYR B; 4EM0 B; 4G12 A; 2OA4 A; 3QPT A; 1R1T A; 1G6N A; 2CUF A; 5LHI A; 3N97 A; 2PBI A; 1XGS A; 3HTS B; 5BS6 A; 4HDU A; 2A5W A; 3LOC A; 1TWA J; 3SXY A; 1GV2 A; 1S29 A; 5GAH J; 3RYP A; 1U3E M; 4BDZ A; 4RBO A; 2HOS A; 1KQ8 A; 2VKH A; 2ECB A; 2OBP A; 2XSJ C; 1V5F A; 2FD5 A; 3F8B A; 4WF2 A; 1IV6 A; 2MFZ A; 3OIP A; 3H5R A; 1HOM A; 2YPR A; 2F5E A; 1WWX A; 2DW4 A; 2PMZ A; 1LFB A; 1LDK B; 1BI2 A; 2IS1 A; 1NTC A; 3K4J A; 2KIQ A; 2K4B A; 2Z33 A; 2X6Y A; 1S9H A; 3CCE I; 4GCV A; 1ETQ A; 1GV5 A; 2ZO4 A; 2W4S A; 1BR4 A; 5M5W J; 2HKO A; 2X1D A; 2QZ8 A; 3TDU C; 3ZQI A; 2CUJ A; 3H9J A; 4YG2 F; 1W1W E; 5FKN A; 1IDY A; 1A36 A; 1BI3 A; 4IHV A; 2H27 A; 2JRT A; 2JQ7 A; 1WGX A; 4BBR J; 1EH8 A; 4R8H A; 2FNP A; 2H6C A; 2DJI A; 2BOL A; 5HOO A; 3M9A A; 4UVB A; 1D8J A; 1HKQ A; 2HPM A; 3GFI A; 5JI6 A; 3O8G A; 3L2U A; 1Y56 A; 2E19 A; 4B1R A; 3BTJ A; 4HQE A; 5IPA A; 1A5J A; 5EEH A; 2QQA A; 3J81 K; 1WRJ A; 3K6G A; 1Z67 A; 2IAI A; 3S1M J; 2XVC A; 3SDB A; 1L3L A; 1JT6 A; 1OCO H; 3BG9 A; 5C4X J; 3G71 I; 3I5U A; 5BQT A; 1U5T A; 3CUQ B; 3H9G A; 5CPR B; 1SFU A; 1STZ A; 3CCM I; 2E60 A; 3GFM A; 3S2D J; 3HB9 A; 2LKS A; 2CV0 A; 2ZME C; 2RDP A; 4HBL A; 3E6D A; 1ORK A; 2FQ4 A; 3BG6 A; 4RLF A; 3K1P A; 1EKE A; 3M7G A; 1VI0 A; 2L9S A; 4MTD A; 1H88 C; 4IHS A; 2R7T A; 4RGU A; 3ZMT A; 1WKM A; 4IXA A; 4RB1 A; 4W97 A; 5DS9 A; 3IH2 A; 2DI3 A; 3KZY A; 1I3A A; 3MMY B; 3AL0 C; 2PFB A; 3VYT B; 5IP6 A; 1SD5 A; 3ZMD A; 3BG3 A; 1XCV A; 2R5Y A; 2VAS A; 3ABK H; 3RI4 A; 4O3M A; 2XKO A; 4RM2 A; 5H6Q A; 4HLY A; 4Y4R A; 1YHQ I; 3G6E I; 4DGW B; 3CCJ I; 1TBX A; 4CH7 A; 1VQN I; 1R4M B; 1I39 A; 2AXT C; 2QM3 A; 4OIN F; 2EH3 A; 3IHU A; 2V6E A; 2JA8 J; 2ELK A; 2VIX A; 4GGG A; 2KIM A; 2OUM A; 4O5V A; 3OS2 A; 3LAP A; 1WI3 A; 2LBF A; 3FXR A; 4EV0 A; 3JAM Z; 4HST A; 4ESB A; 1DUX C; 1S72 I; 1OKR A; 2FF4 A; 3PQJ A; 4RB2 C; 4P55 A; 1TWG J; 4Y13 A; 4ZYE A; 3HM5 A; 1ZTR A; 4M72 A; 4CIC A; 2RNJ A; 2KP6 A; 1TC3 C; 3LWF A; 2UZK A; 3RPU A; 2VQL A; 2WAQ N; 3DP7 A; 5FB2 A; 1ZRD A; 2HOT A; 3G4S I; 3LNQ A; 4S04 A; 1KYZ A; 4KT6 A; 5LRR A; 3IRR A; 2GXA A; 2VKE A; 2M4K A; 3IKT A; 1UB9 A; 5HS9 A; 1XX5 A; 2OAZ A; 2XV4 S; 4UVA A; 1SVO A; 1H89 C; 2Q2E B; 2F48 A; 1X2M A; 3C1D A; 1OCC H; 3I53 A; 1BA5 A; 4L5E A; 2HDC A; 1QVU A; 2CQQ A; 4ETS A; 2IS2 A; 1TLH B; 2Y0M A; 1SFO J; 3MZ8 A; 3BQZ A; 4RS8 A; 1MDM A; 2ZJR F; 1R7J A; 1IJW C; 2EIL H; 2L9N A; 2DT7 B; 2W1O A; 3ZMZ A; 2IGO A; 4DZP A; 4L18 B; 1OYY A; 3GTP J; 4LG3 A; 1IF1 A; 5EGO B; 2EZH A; 2QVO A; 5FGM A; 5EG0 A; 3V7S A; 4BQN A; 4JP0 A; 4BAY A; 5HNH A; 4ZTF A; 2RKH A; 5E1X A; 3ERM A; 2VT3 A; 2CRG A; 3LA7 A; 2RNG A; 2XRN A; 1ZAO A; 4HLX A; 2XGX A; 3LST A; 1JI8 A; 2Y48 A; 2M7A A; 4YFX F; 3M8F A; 2E2I J; 3VWB A; 2QSH X; 3O8H A; 1A31 A; 4HOB A; 1FPQ A; 1L0O C; 2CS3 A; 5EZG A; 1WSU A; 1T2K A; 3WTV C; 2K02 A; 1UCR A; 4M9S A; 1P7I A; 2E1M C; 5KCM A; 1ZKG A; 2HXO A; 2BW3 B; 1PUE E; 2H6B A; 2EA2 A; 2LF7 A; 3GTQ J; 1KQ9 A; 1LE8 B; 2JWT A; 3ZPL A; 3NAU A; 2KPM A; 2LOO A; 3OR1 C; 4BY1 J; 3HKZ A; 1ETW A; 1JGS A; 2JPC A; 3I59 B; 1I1S A; 2LC2 A; 2XPU A; 1IN4 A; 3HG9 A; 1JUS A; 4E7L A; 1TNT A; 2X6O A; 1K6Y A; 3M1C A; 3WTS C; 4EQQ A; 3QOD A; 1WH7 A; 4A5N A; 3A0B C; 4G6T B; 5FKK A; 3TO7 A; 3K4N A; 1X4P A; 4EVI A; 1LKX A; 4RB0 A; 2HXI A; 4UUT A; 5LEK A; 3K4C A; 1W7P A; 4D0P A; 2FBK A; 2BVL A; 1KU2 A; 3BCA A; 2ZNY A; 2L7F P; 2P5V A; 4QLC U; 2L02 A; 1Z7L A; 4ENJ A; 4C30 A; 2VT2 A; 3G1O A; 2Z5U A; 1QRY A; 3VDX A; 3SQN A; 2CUZ A; 4QPQ A; 4BE2 A; 2XAJ A; 2Z16 A; 1PP8 F; 4MHG A; 4PGG A; 4CCN A; 4DZJ A; 2F4M B; 4JYK A; 4DIQ A; 4NC6 A; 2FNA A; 5L3F A; 4IF4 A; 1WCM J; 2JMW A; 5B1B H; 3E6C C; 1ZRF A; 5F27 A; 1VQO I; 1EJ9 A; 2DOE A; 2OU2 A; 1IN7 A; 2DA1 A; 3KEY A; 5GTH C; 5ILU A; 3PQK A; 3AL0 B; 5J1U A; 4F93 B; 3E1S A; 4XKV A; 2E1C A; 3D5L A; 4XLH A; 3L1P A; 1IXR C; 2M45 A; 1FOK A; 3WTY C; 3F72 A; 5J8C A; 5J4Y A; 2Y30 A; 3Q9S A; 3JRH A; 4I76 A; 4HRI A; 3QOE A; 1YFH A; 4CYC A; 3GF2 A; 3H0G J; 3COA C; 3LSM A; 2M2E A; 2VBY A; 3K4K A; 2E1O A; 1PYV A; 3GTO J; 3SZP A; 2WAQ A; 1OQY A; 3ZQG A; 2VLA A; 3L7W A; 4R1H A; 3S1R J; 1IN6 A; 3DTI A; 3WTZ A; 4ZZL A; 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