The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
66
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structure length |
66
|
Chain Sequence |
GPLGSPEETVVIALYDYQTNDPQELALRRNEEYCLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYVPSSYLVEKSP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
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| publication title |
The SH3 domains of the Tec family kinase Itk and the Src family kinase Lck compete for adjacent sites on T-cell specific adapter protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
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| structure length |
66
|
| sequence length |
66
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2011-12-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YNZ A; 2HSP A; 3R6N A; 2DL3 A; 1N5Z A; 2JM9 A; 3VS3 A; 1NYG A; 4LE9 A; 2BZ8 A; 3H41 A; 4AG1 C; 2K2M A; 2L3Q A; 3VS5 A; 1AWJ A; 2GTJ A; 2HBW A; 1SHG A; 5IXB A; 2YUQ A; 3REB B; 2DRM A; 2OAW A; 2GGR A; 1GCP A; 1XOV A; 2NWM A; 4EIK A; 4IIO A; 4LUD A; 1JXO A; 1SPK A; 2KT8 A; 1YWP A; 2HDA A; 2EPD A; 4AFZ C; 3VS6 A; 1AZG B; 4X1V A; 3UF4 A; 2ROL A; 4RUG A; 1MUZ A; 2FPF A; 4AFU C; 1GBQ A; 1UTI A; 1CSK A; 1NM7 A; 4J9F A; 2W0Z A; 2QDL A; 2O31 A; 2LQW A; 2JXB A; 4DEY A; 1JEG A; 1GFD A; 2C0I A; 2FPD A; 2FEI A; 2EYZ A; 2K79 A; 1W6X A; 2YT6 A; 2PZ1 A; 2DX1 A; 2DNU A; 1B3Q A; 2J6F A; 2YDL A; 4OMO A; 4D8D A; 4AG2 C; 1QWE A; 3I5R A; 1T0H A; 5FW9 A; 1H8K A; 2L2P A; 2B86 A; 2W10 A; 2MCN A; 1ABO A; 3REA B; 2AZS A; 3VS2 A; 1UHC A; 2D0N A; 4RTV A; 4JPB W; 3NMZ C; 4F16 A; 1PNJ A; 2EBP A; 1SSH A; 1ZUK A; 2CDT A; 3QWY A; 2KBT A; 2DBM A; 2CSQ A; 3H0F A; 2DJQ A; 2ECZ A; 1KSW A; 2O2O A; 1BBZ A; 2IIM A; 2SEM A; 1WIE A; 1I0C A; 1VYV A; 2A28 A; 3NHN A; 5HCK A; 1AZE A; 2GQI A; 2LNH B; 3SHW A; 1AD5 A; 2G6F X; 1BU1 A; 1X43 A; 5IXF A; 2YUN A; 2DIL A; 2PNI A; 2KRS A; 4M4Z A; 1U3O A; 1AWW A; 3TVT A; 1E7O A; 1T3S A; 4J9B A; 3RBB B; 4OMQ A; 1UJ0 A; 1T3L A; 2C0T A; 3QWX X; 1OPK A; 4RTT A; 4RTW A; 3IQL A; 1PKT A; 2CUD A; 1PKS A; 1OPL A; 5IH2 A; 3CQT A; 1ZBJ A; 4D8K A; 2ESW A; 2V1R A; 4Z8A A; 4F14 A; 1SHF A; 4E6R A; 2LX7 A; 1GCQ A; 1KFZ A; 1WXT A; 1JO8 A; 2J7I A; 1AWX A; 1X2Q A; 1VA7 A; 1Z9Q A; 5L23 A; 2KR3 A; 3I9Q A; 1ZLM A; 2KRM A; 1HJD A; 1Y57 A; 2AKL A; 1MV0 B; 5EC7 A; 2JMA A; 3A98 A; 2YSQ A; 4CC3 A; 2X3W D; 3EG3 A; 5IHN A; 3ULR B; 3VS0 A; 3O5Z A; 1HSQ A; 2F2W A; 5ECA A; 2ENM A; 3RNJ A; 1EFN A; 1UUE A; 1HD3 A; 1X6B A; 1FMK A; 2RPN A; 2OJ2 A; 4JJD A; 3M0T A; 3JV3 A; 1GRI A; 1PRL C; 2VWF A; 4HVW A; 3I5S A; 2A37 A; 2O9S A; 2XMF A; 2AKK A; 4JZ4 A; 3VRZ A; 3KFV A; 3PE0 A; 2K7A A; 1ZUY A; 2KRO A; 1GFC A; 4J9D A; 1RLP C; 2F2V A; 1AOJ A; 4OMN A; 1CKA A; 3PVL A; 3I35 A; 1X2K A; 2DL8 A; 2KEA A; 4J9H A; 2DL7 A; 2AK5 A; 1M27 C; 2BTT A; 5I22 A; 4DEX A; 2RN8 A; 1PHT A; 2LQN A; 2X3X D; 5FWB A; 2CUB A; 2O88 A; 1ABQ A; 2L3S A; 1RUW A; 2EKH A; 3NPF A; 2D8H A; 1ZUU A; 5I11 A; 2J06 A; 4ESR A; 2LJ3 A; 4J9E A; 2FRW A; 1JQQ A; 2CH4 W; 2JMC A; 4GLM A; 2ABL A; 1PWT A; 3M0R A; 3UA6 A; 2HCK A; 2BZX A; 4JJC A; 2KXD A; 1K1Z A; 2H8H A; 2CT3 A; 1SRM A; 2M51 A; 3VS1 A; 1KIK A; 1UDL A; 4RTZ A; 2FPE A; 1K4U S; 1WYX A; 2VKN A; 2SRC A; 4R0K A; 5IHI A; 3PVQ A; 4WCI A; 2O9V A; 2PTK A; 1JU5 C; 2J05 A; 1NG2 A; 3EHR A; 4OMP A; 2VVK A; 1QKW A; 1U5S A; 2JW4 A; 1I07 A; 1X6G A; 1GBR A; 2MOX A; 1U06 A; 2EVR A; 1GL5 A; 1J3T A; 1IO6 A; 3C0C A; 1YCS B; 2LJ0 A; 4K11 A; 1Y0M A; 2EGC A; 2K6D A; 2RQR A; 2KYB A; 1WA7 A; 1WI7 A; 1K0S A; 1W1F A; 2FG0 A; 1E6G A; 2GTO A; 4RTU A; 1NLP C; 4AFS C; 1M30 A; 2EYX A; 4LN2 A; 1ZSG A; 2KNB B; 1TUD A; 2I0N A; 1UGV A; 2LP5 A; 4J9G A; 1AEY A; 1WLP B; 2FO0 A; 2DA9 A; 1ZX6 A; 2CH4 A; 3VRY A; 2J6K A; 2DE0 X; 2OI3 A; 1X27 A; 1QCF A; 1K0X A; 4RTY A; 1JXM A; 1OV3 A; 3M0S A; 2ROT A; 2JTE A; 2A08 A; 1W70 A; 1FYN A; 3GBQ A; 4HCK A; 1YP5 A; 4HXJ A; 4LUE A; 2RQU A; 4ORZ A; 1QWF A; 2DM1 A; 3TSZ A; 1M8M A; 2YUP A; 2DYB A; 1ARK A; 2M0Y A; 1M3B A; 2DMO A; 1B07 A; 3LH5 A; 4JJB A; 2EGA A; 2CT4 A; 2P4R A; 1A0N B; 2F2X A; 2KGT A; 1G83 A; 2K9G A; 3NGP A; 1OOT A; 1K76 A; 1SEM A; 2MIO A; 4RTX A; 2ED1 A; 2DF6 A; 3EGU A; 2GBQ A; 2D8J A; 1UE9 A; 3H0H A; 1H3H A; 1CKB A; 2CSI A; 1OEB A; 5GJW B; 3M0U A; 2KRN A; 1BB9 A; 3THK A; 3VS7 A; 4OML A; 2JT4 A; 1YWO A; 1WDX A; 2EQI A; 3EG2 A; 4Z88 A; 2EYW A; 2JS2 A; 1VYT A; 2RMO A; 2KT1 A; 2EGE A; 2E5K A; 2RF0 A; 1RLQ C; 2J6O A; 1BK2 A; 2EYY A; 1V1C A; 2HEQ A; 1NLO C; 2LMJ A; 4KRT A; 2JM8 A; 2DVJ A; 2NUZ A; 1E6H A; 1K9A A; 1TG0 A; 2KE9 A; 2RQW A; 1M3A A; 2L0A A; 3TSW A; 4F17 A; 1M3C A; 2RQV A; 4FSS A; 2ED0 A; 3ZL7 C; 3VS4 A; 1X69 A; 1NEG A; 2DBK A; 1QLY A; 2BZY A; 3M0Q A; 1UHF A; 1WX6 A; 4GBQ A; 1UEC A; 1YN8 A; 1WXB A; 1NYF A; 4OMM A; 4QT7 A; 4JZ3 A; 5GJV B; 2LZ6 B; 1QKX A; 5IHK A; 1UJY A; 2D1X A; 2DRK A; 3UAT A; 1UG1 A; 3EG0 A; 1AWO A; 3EG1 A; 1WXU A; 4CC2 A; 1T0J A; 2EW3 A; 5FWC A; 4AFQ C; 3FJ5 A; 1LCK A; 2K3B A; 1MV3 A; 4A63 B; 2DL5 A; 2L3P A; 2JS0 A; 3EHQ A; 1UFF A; 3UA7 A; 1H92 A; 1WFW A; 1G2B A; 2V1Q A; 2LJ1 A; 4J9I A; 4CC7 A; 4HVU A; 2KXC A; 2RQT A; 2LCS A; 1Z9Z A; 1GCQ C; 4LNP A; 2YUO A; 2FRY A; 1S1N A; 2A36 A; 1PRM C; 4ZNX A; 4Z89 A; 1KJW A; 2CRE A; 2RNA A; 1AVZ C; 4Y92 A; 2GNC A; 1VYU A; 2KYM A; 4IIM A; 4J9C A; 1SRL A; 3SEM A; 2AZV A; 2C0O A; 3U23 A; 1NEB A; 3M0P A; 4CC4 B; 1RI9 A; 2DLP A; 1I1J A; 4HVV A; 1TUC A; 2DL4 A; 3H0I A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4UC4 A; 5I2M A; 2QA4 Q; 1IRX A; 4JUV A; 4JS4 A; 3R6N A; 2VV5 A; 4X34 A; 4TVR A; 3G1J A; 1VQ4 Q; 3H41 A; 3ZEH A; 4BUG A; 4O6J A; 5KYY B; 1JJ2 A; 1AWJ A; 3JCM g; 5A0D A; 3L2R A; 1YJN Q; 1S72 Q; 2YUQ A; 1BCM A; 3RES A; 3I56 T; 3CME A; 3GLX A; 4IIO A; 4J6W A; 8AT1 B; 4PJN A; 3HFO A; 2HDA A; 2EPD A; 3VS6 A; 1AZG B; 4X1V A; 3UF4 A; 4M7D F; 4RUG A; 3JB9 J; 3VUZ A; 1GBQ A; 2M02 A; 4J9F A; 2C0I A; 2P0K A; 2K79 A; 5GAO p; 1WHH A; 2PZ1 A; 1KQS P; 5GAO m; 4D8D A; 3JCM W; 4AG2 C; 4ZTF A; 3I5R A; 5FW9 A; 3SWN C; 4PL6 A; 2EJF A; 1ABO A; 2QEX A; 2GCX A; 2D0N A; 1C0M A; 4C8Q E; 2EBP A; 1AT1 B; 1D0X A; 1SSH A; 2XDB A; 4KUI A; 3QWY A; 1VQ6 A; 4XTW A; 4XTX A; 3H0F A; 2DJQ A; 3SDZ A; 4PLI A; 1XQH A; 4C92 G; 4E7H A; 4C5E A; 2HSE B; 1VQP Q; 3NHN A; 3CCM T; 1KK7 A; 5GAM f; 1Y96 B; 3SHW A; 3JSC A; 3NTH A; 3CCR T; 2E70 A; 1PM3 A; 1X43 A; 2YUN A; 5GAM d; 2L3R A; 2KRS A; 4M4Z A; 1AWW A; 1E7O A; 4FYX B; 1YIT A; 1YJW Q; 1VQ7 A; 4EDU A; 3L2U A; 1OPK A; 2QQR A; 4RTT A; 4RTW A; 3IQL A; 3DKM A; 1XNI A; 1PKS A; 5IH2 A; 2LQK A; 5GAN e; 4XU0 A; 4L6V 5; 2ESW A; 1QVF S; 2LX7 A; 1GCQ A; 4M75 C; 1KFZ A; 1WXT A; 1AWX A; 2VYT A; 1VA7 A; 2JTM A; 2KR3 A; 1B34 A; 3RKX A; 1HJD A; 2O4X A; 1PC0 A; 5IN1 A; 1JJ2 P; 1Y57 A; 2AKL A; 1MV0 B; 4OMF B; 1VQ9 A; 4CC3 A; 1WJR A; 1SG5 A; 1UGQ B; 3KUF A; 3MP1 A; 3G7Z A; 3E9G A; 3O5Z A; 1FMW A; 4J83 A; 4JLI A; 3CBP A; 4E7Z A; 1HD3 A; 1D0Y A; 1KHC A; 1FMK A; 2OX7 A; 5KH6 A; 1GRI A; 3INZ A; 2PU9 B; 1WZO A; 4DBR A; 3P8H A; 1W2B A; 1V76 A; 2A37 A; 2KVQ G; 3VRZ A; 2G3R A; 3VV0 A; 3EFO B; 2JN0 A; 1GFC A; 2RJE A; 4OMN A; 1VQM A; 3PVL A; 2EFI A; 4ZGD B; 3EFS A; 2JZ2 A; 4R56 A; 3E9F A; 4XTY A; 1ZQ1 A; 2M0O A; 1RAD B; 2RN8 A; 5GMK h; 3A8G B; 1K8A R; 3HRT A; 2CUB A; 2PUO B; 5J26 A; 2X9H A; 2L3S A; 1PCX A; 2D8H A; 1ZUU A; 3OYF A; 2J06 A; 1TH7 A; 1MGQ A; 2LJ3 A; 1VIE A; 4M77 G; 2FRW A; 2YWW A; 4EMG A; 1JQQ A; 2JMC A; 4GLM A; 4F7U B; 2BZX A; 2H8H A; 4PFZ A; 2RJF A; 4ATO A; 3QO3 A; 2M51 A; 3VS1 A; 3L1A A; 1KIK A; 2DYI A; 3OYI A; 3ZBD A; 3DB3 A; 1TTH B; 3OS0 A; 5KE2 A; 2OTJ A; 4C5H A; 2PTK A; 4AMC A; 1W4S A; 1TS9 A; 1NG2 A; 5HK3 A; 3L2W A; 5LJ5 g; 1OU9 A; 1U5S A; 2JW4 A; 1VQL Q; 1X6G A; 2EWN A; 3M55 A; 3X26 B; 2EVR A; 4HKE A; 5GAN 7; 1IO6 A; 2P0P A; 3C0C A; 2LJ0 A; 1WHJ A; 1Y0M A; 3OYB A; 4MZT A; 2JNG A; 1YI2 Q; 2RK1 A; 1VQ9 T; 1KQ1 A; 1D09 B; 2FZG B; 1VQ8 A; 3CC4 A; 4HCB A; 1N27 A; 2P0Q A; 4C5G A; 3CC7 T; 3A8M B; 1MMN A; 1E6G A; 5LJ3 g; 1NLP C; 1VQO Q; 1C6V X; 4XTZ A; 2EYX A; 2HQH A; 3HFN A; 2A7Y A; 1ZSG A; 2RHU A; 2RHX A; 3LGL A; 1UGV A; 1M4Z A; 4J9G A; 2FO0 A; 1PSE A; 2DA9 A; 5CVI A; 3RR6 A; 1VOM A; 2QA4 A; 1ZX6 A; 1SSF A; 2QQA A; 1QP2 A; 1VQ4 A; 2CP2 A; 2ROT A; 3VU3 C; 1YJN A; 4BI3 A; 3M57 A; 1S72 A; 1Q86 R; 1O75 A; 2PUK B; 3JB9 D; 4N4I A; 3CC2 T; 4HCC A; 2VAS A; 3N5B B; 1RAA B; 4ZN3 A; 4LUE A; 3OSV A; 5GAN d; 5GAO n; 1KQ2 A; 4ORZ A; 1W2B P; 5D6X A; 5I21 A; 2DER A; 2ZPE B; 4KH1 B; 4BY6 C; 3A8H B; 2CP0 A; 1PD1 A; 3DLM A; 5FU6 B; 2HQX A; 4A4K A; 4M7D C; 2YUP A; 2M0Y A; 2RJC A; 3CXC A; 1G8X A; 1B07 A; 3CCL T; 3MEU A; 1IXD A; 1ZA2 B; 2F5T X; 4IUR A; 5CO7 A; 4OVA A; 4JRI A; 2FYK A; 3JCM e; 1OOT A; 4MDW A; 4RTX A; 1K73 C; 2ED1 A; 2CZ7 B; 2ZPF B; 2A3L A; 3TQ7 P; 5LJ5 h; 3PTA A; 2A0F B; 3WVD B; 3M0U A; 4KH0 B; 2DAQ A; 2EQI A; 3EG2 A; 2HNI A; 1VYT A; 1BI1 A; 1TSF A; 2EGE A; 2RF0 A; 2WSE E; 4FIB A; 4LD9 K; 1BK2 A; 4E7K A; 1YCY A; 4J8O A; 2LMJ A; 5HK0 A; 2JM8 A; 2OAU A; 2YXY A; 5LJ3 h; 2B8A A; 4XTV A; 1K9A A; 1VQP A; 2HL3 A; 1U1S A; 4MML A; 1M3C A; 2RQV A; 1M9S A; 4FSS A; 3CCS T; 4LDX A; 3V8J A; 1B7T A; 1MNE A; 3TRE A; 1UHF A; 1WX6 A; 2MF2 A; 1UEC A; 3S3M A; 4XAX B; 1G3Y A; 2CYZ B; 3CCE A; 2D1X A; 1Y07 A; 3UAT A; 2YRV A; 4X9D A; 3LLR A; 1RAB B; 1YJW A; 2LRQ A; 1AWO A; 1YJN T; 2EQU A; 4E7I A; 2RHI A; 3HP9 A; 3X24 B; 1MV3 A; 2F69 A; 4M77 E; 2L3P A; 2LDM A; 3EHQ A; 4QQ6 A; 4DOW A; 2X4Y A; 2V1Q A; 1KC8 U; 5D6Y A; 2DKG A; 2RQT A; 2LCS A; 2EQK A; 3EFO A; 2COZ A; 3GF5 A; 4N4H A; 1BIA A; 4ZNX A; 4X9C A; 1KJW A; 2RNA A; 4Y92 A; 3HKS A; 2MMP A; 2KYM A; 3SEM A; 2AZV A; 3CPF A; 4FYV B; 2V8K A; 2E41 A; 1BI3 A; 1YNZ A; 4JLG A; 1N5Z A; 3VS3 A; 1YHQ Q; 3OS5 A; 4C0D C; 3CXC P; 1SHG A; 2RO0 A; 3REB B; 2OAW A; 4JRK A; 1NBE B; 1XOV A; 3CCJ T; 4EIK A; 2RHY A; 4HA8 A; 4LUD A; 3FEO A; 2KT8 A; 3X20 B; 2CKK A; 1KHI A; 2NLU A; 3C94 A; 4AFZ C; 3CMA T; 2MWO A; 4A4F A; 4M7A B; 2FPF A; 4AFU C; 5GAN 2; 1B34 B; 2O4X B; 1NM7 A; 2O31 A; 2FZC B; 1RI0 A; 1H3Z A; 3QYH B; 2FPD A; 1OX9 A; 2EYZ A; 4N4G A; 3LWI A; 2C06 A; 5CKF A; 3OYN A; 1FXX A; 3JCM d; 3PMI A; 2DNU A; 1B3Q A; 2J6F A; 2YDL A; 3SB2 A; 1KQS A; 4GLK A; 1G3S A; 2AHJ B; 2B86 A; 2CP3 A; 3UPU A; 3REA B; 1VQ5 Q; 3GIB A; 3VS2 A; 4QVD A; 2FB7 A; 2V26 A; 2DEQ A; 4JPB W; 4ELY C; 2VB6 A; 1PNJ A; 2PQW A; 5GAM e; 2XD0 A; 2HMA A; 4IUV A; 2LVM A; 1VQL A; 4WF2 A; 1YJ9 Q; 1QVG A; 3WVE B; 3R6O A; 3MKD A; 4C8Q C; 1VYV A; 1YI2 A; 5GAN 5; 2GQI A; 1KC8 C; 2FL7 A; 2RM4 A; 4LDW A; 2G6F X; 4NL2 A; 1BU1 A; 1WJQ A; 5GAO r; 1VQO A; 4F04 B; 2JVV A; 1U3O A; 1T3S A; 4GY5 A; 3OYG A; 1G5V A; 3CCQ Q; 3SWN B; 1UJ0 A; 3J80 E; 1RAE B; 1JJ2 S; 1M90 C; 2X4J A; 3OS2 A; 2LCC A; 1KD1 U; 4J6Y A; 3CD6 Q; 5J39 A; 3CQT A; 1ZBJ A; 5KYX A; 3MP8 A; 3CCU Q; 4LDV A; 4E6R A; 4EMK C; 5DY9 A; 1VQN Q; 2J7I A; 4LDY A; 1Z9Q A; 2CS7 A; 1ZLM A; 2OTL Q; 4M77 F; 1UGS B; 5FRO A; 1JBM A; 3RMS A; 2RHZ A; 2EKO A; 3I55 T; 3ULR B; 1IGQ A; 3VS0 A; 2ENM A; 3RNJ A; 1EFN A; 5GMK i; 2ZZD A; 1X6B A; 3CCV Q; 3JV3 A; 1PRL C; 1WPY A; 3P8B B; 2CZ6 B; 2O9S A; 3PIO A; 2YRD A; 1BIB A; 2K7A A; 1ZUY A; 4LD6 A; 1N9S A; 2F2V A; 1AOJ A; 2E10 A; 4F7U F; 1LJO A; 1R0C B; 2DL7 A; 5GAN j; 3LGF A; 3BE3 A; 3AHU A; 4A4H A; 4M75 B; 4IUQ A; 4BDZ A; 4BE1 A; 1ABQ A; 4M78 F; 3TEE A; 1TWB A; 2EKH A; 2XK0 A; 3NPF A; 2CZ0 B; 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