The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
67
|
structure length |
67
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Chain Sequence |
GSHMKKQKVKTIFPHTAGSNKTLLSFAQGDVITLLIPEEKDGWLYGEHDVSKARGWFPSSYTKLLEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein/protein binding
|
| molecule keywords |
Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein
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| publication title |
Enterohaemorrhagic Escherichia coli exploits a tryptophan switch to hijack host f-actin assembly.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-12-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LMJ A; 2EGE A; 4IIO A; 2PZ1 A; 5IHI A; 2DRK A; 1I1J A; 2YUP A; 1FYN A; 2J06 A; 1SRM A; 3VRZ A; 4R0K A; 2FPE A; 1SHF A; 4HXJ A; 2GQI A; 4F17 A; 3EGU A; 1I0C A; 1PWT A; 2DL5 A; 2ED1 A; 4J9E A; 3TSZ A; 2RNA A; 1AZG B; 2V1R A; 1QCF A; 2DF6 A; 1K9A A; 2DBM A; 1YN8 A; 1LCK A; 2EGC A; 3TVT A; 1AWX A; 2NWM A; 1NYF A; 3NHN A; 2ECZ A; 2DVJ A; 2F2X A; 4JPB W; 2LJ1 A; 1IO6 A; 4J9F A; 2OJ2 A; 4Y92 A; 1E6G A; 4DEX A; 4OMN A; 1U06 A; 4D8K A; 1AOJ A; 2X3W D; 1GCP A; 4LUD A; 3TSW A; 2O9S A; 1Y57 A; 2J05 A; 4OMQ A; 2CT3 A; 1G2B A; 3PE0 A; 1GFC A; 1NEG A; 2W0Z A; 4HVW A; 1AWO A; 4OMO A; 2KE9 A; 1RI9 A; 4JZ4 A; 5I22 A; 5FWB A; 3O5Z A; 4CC7 A; 1E6H A; 2AZV A; 1WXB A; 1RUW A; 2VVK A; 5GJV B; 4AFZ C; 4CC3 A; 4OMP A; 2FO0 A; 1CKB A; 1WI7 A; 2M51 A; 1WLP B; 4JZ3 A; 4RTW A; 1SHG A; 2D8H A; 5IXB A; 2SEM A; 3EG3 A; 2KYB A; 2L3Q A; 2LX7 A; 3IQL A; 1UUE A; 2EBP A; 1E7O A; 2CSI A; 3PVL A; 2O31 A; 2PTK A; 2C0O A; 2K7A A; 2MCN A; 2MIO A; 1PKT A; 3GBQ A; 4ESR A; 1OOT A; 4LE9 A; 1H3H A; 2SRC A; 4RTX A; 2L3S A; 2F2V A; 2KYM A; 4HVU A; 1UE9 A; 2HCK A; 4J9I A; 1GFD A; 2HEQ A; 2OI3 A; 1UTI A; 4J9H A; 1RLP C; 2DL8 A; 5EC7 A; 4KRT A; 2CSQ A; 5ECA A; 2VWF A; 1T3L A; 1GRI A; 5L23 A; 1MV0 B; 1UHF A; 1AWW A; 2KEA A; 3KFV A; 2FG0 A; 5IHN A; 1VYV A; 2FRW A; 1YWO A; 1QKX A; 2DMO A; 3FJ5 A; 1QWE A; 2DJQ A; 4K11 A; 1Y0M A; 2GBQ A; 3M0U A; 4CC4 B; 2JT4 A; 1S1N A; 1K4U S; 1UG1 A; 2GGR A; 5FWC A; 3I9Q A; 4AG2 C; 1M27 C; 3I5S A; 2A08 A; 4E6R A; 1Z9Z A; 1T3S A; 1Z9Q A; 1ZUU A; 2AKK A; 1K0S A; 2L3P A; 4J9G A; 2LCS A; 4A63 B; 1JXM A; 1AD5 A; 1EFN A; 5HCK A; 1KJW A; 2FRY A; 3REB B; 2AK5 A; 2E5K A; 1U3O A; 2DL4 A; 1BBZ A; 2JW4 A; 2KBT A; 1WXU A; 1SPK A; 2YSQ A; 3U23 A; 2K2M A; 3VS1 A; 2AZS A; 3RBB B; 4AG1 C; 1NM7 A; 1WX6 A; 4AFU C; 2EKH A; 3EHQ A; 1W70 A; 3VS6 A; 2DX1 A; 4Z88 A; 1SRL A; 2B86 A; 1M8M A; 1NYG A; 1KIK A; 1QLY A; 1ZLM A; 2HDA A; 4Z89 A; 1AZE A; 3QWX X; 2KT1 A; 2A37 A; 3REA B; 2EW3 A; 3VS3 A; 1PRL C; 2JS0 A; 2GTJ A; 1B07 A; 1NLO C; 2K79 A; 1M3A A; 1NG2 A; 2F2W A; 2HBW A; 2JM9 A; 3VS2 A; 1KFZ A; 2ROT A; 3NPF A; 4EIK A; 1U5S A; 2X3X D; 1YCS B; 3M0S A; 3SEM A; 1UHC A; 1YP5 A; 1ABQ A; 3PVQ A; 2EPD A; 2ROL A; 2JXB A; 3VRY A; 2XMF A; 1MV3 A; 2D0N A; 2K6D A; 2J6F A; 4J9D A; 1YWP A; 4D8D A; 2DNU A; 2DBK A; 3ULR B; 2J7I A; 2C0I A; 2YUO A; 3VS0 A; 1BK2 A; 2JMA A; 1XOV A; 3M0Q A; 2BZX A; 1WIE A; 2J6O A; 4JJD A; 1T0J A; 1K0X A; 2CT4 A; 2JMC A; 1MUZ A; 2QDL A; 2W10 A; 1B3Q A; 2RPN A; 4JJB A; 1OV3 A; 1SSH A; 1AEY A; 3JV3 A; 2RQW A; 1M30 A; 2DL3 A; 3RNJ A; 1HJD A; 1OPK A; 2BZ8 A; 2RMO A; 3VS4 A; 1QWF A; 2RQV A; 2EYY A; 1OPL A; 2KRN A; 1X43 A; 4J9C A; 2EQI A; 2DL7 A; 2P4R A; 2L0A A; 2A36 A; 4LNP A; 1VYT A; 2CDT A; 2DA9 A; 3H0F A; 4ZNX A; 2IIM A; 4LN2 A; 2CUD A; 2FPD A; 1G83 A; 2K9G A; 2LJ0 A; 1GCQ C; 2LP5 A; 2FEI A; 2YUN A; 4DEY A; 4M4Z A; 2KRM A; 2RQR A; 2JS2 A; 2RF0 A; 4IIM A; 4CC2 A; 1TUC A; 2BZY A; 1UJ0 A; 4RTV A; 2LQN A; 3THK A; 2DE0 X; 2VKN A; 3UA7 A; 1V1C A; 4RTU A; 2DYB A; 2H8H A; 1X27 A; 2KR3 A; 1HSQ A; 1BU1 A; 4OMM A; 3EHR A; 2GTO A; 1GBQ A; 3H0H A; 2G6F X; 1GL5 A; 2KXC A; 1H92 A; 3VS5 A; 1M3B A; 4QT7 A; 2KT8 A; 1ARK A; 3I5R A; 1CKA A; 1ZUK A; 1WDX A; 1RLQ C; 1HD3 A; 2RQU A; 1QKW A; 3UF4 A; 1VYU A; 2CH4 W; 4GLM A; 3CQT A; 5GJW B; 1JO8 A; 1ZBJ A; 3ZL7 C; 2EYZ A; 2KGT A; 2BTT A; 1WFW A; 1ZUY A; 3EG0 A; 1X2Q A; 3C0C A; 3M0R A; 1AWJ A; 2JM8 A; 2RN8 A; 2J6K A; 1N5Z A; 2EVR A; 1CSK A; 4JJC A; 1JQQ A; 1UFF A; 2EGA A; 2I0N A; 3EG1 A; 2ESW A; 1J3T A; 3R6N A; 3M0P A; 2CUB A; 1UGV A; 2V1Q A; 5FW9 A; 2L2P A; 2C0T A; 1UDL A; 1NEB A; 5IXF A; 1YNZ A; 1WYX A; 2O88 A; 4AFS C; 1K76 A; 4RTY A; 2HSP A; 1UEC A; 1KSW A; 1PRM C; 1JU5 C; 2O2O A; 2OAW A; 2YT6 A; 2CH4 A; 1ZX6 A; 2D1X A; 3H41 A; 3H0I A; 1H8K A; 1M3C A; 2D8J A; 1PHT A; 2ENM A; 1GCQ A; 1PNJ A; 2A28 A; 1TG0 A; 1X6B A; 5IH2 A; 1W1F A; 4GBQ A; 3M0T A; 2DIL A; 2LZ6 B; 1NLP C; 3NMZ C; 3NGP A; 1GBR A; 2EYW A; 3UAT A; 2AKL A; 1X69 A; 2KNB B; 3I35 A; 4J9B A; 1A0N B; 4AFQ C; 1OEB A; 4OML A; 1X6G A; 2EYX A; 1K1Z A; 2NUZ A; 1ZSG A; 2DM1 A; 1WXT A; 1UJY A; 2ABL A; 2LJ3 A; 4FSS A; 2KXD A; 3VS7 A; 2YDL A; 1ABO A; 4RUG A; 2MOX A; 4ORZ A; 4RTT A; 2KRS A; 1W6X A; 2PNI A; 2LQW A; 1I07 A; 2LNH B; 1X2K A; 2JTE A; 2K3B A; 4RTZ A; 4X1V A; 4HVV A; 2GNC A; 3SHW A; 1JXO A; 2YUQ A; 1FMK A; 5IHK A; 1PKS A; 2ED0 A; 2RQT A; 2KRO A; 2M0Y A; 4WCI A; 1AVZ C; 1BB9 A; 2DLP A; 2O9V A; 4HCK A; 4LUE A; 4F16 A; 4F14 A; 2CRE A; 4Z8A A; 2FPF A; 1VA7 A; 1WA7 A; 3LH5 A; 1T0H A; 1JEG A; 3QWY A; 3UA6 A; 1SEM A; 2DRM A; 3A98 A; 5I11 A; 1TUD A; 3EG2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4IIO A; 2DRK A; 3V8K A; 1NJI R; 3ZBD A; 2J06 A; 2B8A A; 5A0D A; 9ATC B; 4M77 A; 4F17 A; 3EGU A; 1I0C A; 3QJ6 A; 3CCU Q; 5LJ3 g; 2ZPF B; 2ED1 A; 4KGX B; 3TSZ A; 2RNA A; 1AZG B; 1MMA A; 2E64 A; 2F5K A; 2P84 A; 1RL2 A; 4A4F A; 2JNG A; 2NWM A; 2RHI A; 5CKE A; 3CCR A; 5KYX A; 1M90 R; 2DVJ A; 3G1J A; 2F2X A; 1WHH A; 5KYN A; 4J9F A; 2RHX A; 2GF7 A; 3UT1 A; 4F7U G; 1E6G A; 3CCU A; 5GMK e; 1YI2 T; 5GAN 4; 1G2B A; 3BW1 A; 1U8R A; 3PE0 A; 4QW2 A; 2HQE A; 3JB9 D; 1KK7 A; 1V29 B; 3HRU A; 2YRV A; 1YHQ T; 2FZK B; 1AWO A; 3OW2 S; 4CC7 A; 2DO3 A; 4AFZ C; 2EQM A; 2FO0 A; 3X26 B; 4XU1 A; 2RA2 A; 2A7Y A; 5AT1 B; 4JZ3 A; 2X51 A; 5IXB A; 2SEM A; 4C8Q A; 2DVE A; 1E7O A; 2QI2 A; 2QTV A; 5GAO r; 4XQ3 A; 3G4S Q; 4QQG A; 4ESR A; 1OOT A; 4LE9 A; 2L3S A; 2FZG B; 2F2V A; 1IHW A; 2KYM A; 1D0Y A; 1UE9 A; 2HCK A; 1GFD A; 2AHJ B; 2XG8 D; 3Q1J A; 4E7S A; 5ECA A; 4MML A; 2VWF A; 1W2B P; 3JCM J; 4DOW A; 3M55 A; 1UHF A; 3KFV A; 1C0M A; 2FG0 A; 3QDF A; 3HL8 A; 5GAM j; 5KYY A; 5FU6 C; 4C92 C; 1Y0M A; 3M0U A; 4CC4 B; 1S1N A; 4FW2 A; 3S3N A; 1Q95 G; 2VYT A; 4ELY C; 1UG1 A; 1WHM A; 1UGP B; 3CCV T; 4AG2 C; 1PD1 A; 4FYX B; 2CKK A; 1Z9Z A; 4M7D G; 1G3S A; 3A8G B; 2X4W A; 4EMG A; 2AKK A; 4AMC A; 4J7I A; 1RAH B; 2LCS A; 4A63 B; 1LPL A; 1AD5 A; 1N8R U; 2QQ9 A; 4KT0 E; 3REB B; 2E5K A; 3MET A; 2DL4 A; 1BBZ A; 2X4X A; 2KBT A; 1SPK A; 2L5Q A; 2YSQ A; 4JRP A; 3U23 A; 4KGZ B; 2K2M A; 3G6E T; 3JB9 J; 1C1A A; 5GMK i; 1Q86 R; 2KQW A; 2DAQ A; 2JTF A; 3FEO A; 2EKH A; 5A0G A; 2PU9 B; 5FRN A; 1EIF A; 1I5L A; 4M75 B; 2ZPI B; 2XU8 A; 2DYI A; 3CME Q; 1SRL A; 3OYY A; 3MEU A; 4M78 B; 1M8M A; 1NYG A; 2EJF A; 3HHT B; 2HDA A; 1Q82 R; 2EIF A; 4DOV A; 4IKF A; 2RI5 A; 3JCM b; 5KE2 A; 3CCQ Q; 1B07 A; 2EAY A; 4M7A A; 2JOY A; 2HBW A; 3VS2 A; 3CME A; 1ZA1 B; 2DTI A; 3TCJ A; 3ZFJ A; 4X9C A; 2QAS A; 2K3Y A; 1U5S A; 2X3X D; 3C4S A; 2LQK A; 3M0S A; 4D6W A; 4NS5 A; 2LQ8 A; 4OGE A; 3VRY A; 3CCQ A; 4ZTF A; 1PG5 B; 3GIB A; 1K8A C; 2FB7 A; 3EH1 A; 3GPL A; 4D8D A; 3OS2 A; 4BI4 A; 3ULR B; 3CCJ Q; 2YUO A; 3BFM A; 3VS0 A; 4C92 A; 1VQ7 A; 4HT9 A; 2COZ A; 4RMO A; 4XTU A; 2BZX A; 1T0J A; 1K0X A; 1MUZ A; 2QDL A; 1ZQ1 A; 3QBY A; 1B3Q A; 3ASK A; 1SSH A; 4XTV A; 5FU7 C; 4MZP A; 3JCM Q; 1JRI A; 1YIJ T; 3EGX B; 3CCJ A; 2RMO A; 1QWF A; 3SWN B; 2EYY A; 4J9C A; 1X43 A; 1Y7X A; 2EQI A; 3GOX A; 1KQS S; 2L0A A; 2VUB A; 4O5V A; 3HP9 A; 4LN2 A; 3HRT A; 2NUT A; 2LP5 A; 2XID A; 1PC0 A; 1VOM A; 3C94 A; 2RF0 A; 4IIM A; 3VJP A; 3BE3 A; 2LQN A; 4IUQ A; 3THK A; 5KE3 A; 2DE0 X; 3UA7 A; 3G6E Q; 4RTU A; 2DYB A; 5HK3 A; 1BU1 A; 4OMM A; 3EHR A; 3H0H A; 3HFN A; 1UB4 A; 2KXC A; 4ZGD B; 3JB9 I; 1K9M U; 4J5Y A; 1MND A; 2D9T A; 1YJN A; 1XQH A; 2RQU A; 4OF1 A; 1D09 B; 1JB0 E; 3LGF A; 1BCO A; 1Q81 C; 5GJW B; 1JO8 A; 1AT1 B; 3ZL7 C; 4B9X A; 2A3L A; 1FWZ A; 1BI3 A; 1PD0 A; 4XTW A; 3WXM B; 3L2U A; 2LTO A; 4Z02 A; 3EFO B; 1IXD A; 1ZUY A; 4M75 C; 4PJL A; 3EG0 A; 3HFO A; 3URG A; 1N8R R; 3HPW A; 1AWJ A; 4M78 C; 1RAA B; 1UFF A; 2EGA A; 4NL2 A; 2I0N A; 4F7U F; 2ESW A; 1B34 B; 3P8D A; 3MHX A; 5GAN 6; 3M0P A; 2CUB A; 1Q7Y C; 1IB8 A; 4CRI A; 1K76 A; 2HSP A; 5HY6 A; 2HAX A; 1VQP T; 3CC7 Q; 1QVG S; 2OAW A; 4HCZ A; 5GAM h; 2VXF A; 1WZO A; 1BCM A; 1H8K A; 5CKB A; 1M3C A; 3RUX A; 2K5I A; 1PNJ A; 4HCB A; 1YIJ Q; 1TG0 A; 5AYF A; 2CP6 A; 4L59 A; 3QJY A; 1MHN A; 2ZPG B; 3NMZ C; 5C6S A; 3NGP A; 1QQJ A; 4WF2 A; 3CC7 A; 4AT1 B; 5GAN e; 4LDW A; 4AFQ C; 2DXB A; 4BD3 A; 4E7I A; 2YRC A; 2BKD N; 4N4G A; 2EKO A; 3V7C A; 2HBP A; 1ZSG A; 2BE7 D; 2DM1 A; 4QVZ A; 2HSE B; 1UJY A; 2ZPE B; 5DLQ E; 4ME7 A; 2LC4 A; 2LJ3 A; 4EDU A; 4E7J A; 5J3B A; 2H3E B; 3VS7 A; 2YDL A; 1D1B A; 1VQM A; 4RUG A; 2KY9 A; 1QW1 A; 2MOX A; 4E7Z A; 3JCM e; 1TXQ A; 4E7K A; 1MGQ A; 4RTZ A; 2LNH B; 3SWN C; 2FYK A; 3I55 A; 2GNC A; 3UDC A; 4C5H A; 1MMN A; 1M90 U; 4BB7 A; 3CXC S; 4WCI A; 1AVZ C; 3LGL A; 2M02 A; 3EFS A; 2QK0 A; 2O9V A; 4M75 A; 3OYA A; 4F14 A; 1UGS B; 2FPF A; 4M78 A; 4UC4 A; 4M7D F; 3LH5 A; 1T0H A; 1X01 A; 1UEB A; 3QWY A; 1WGS A; 3UA6 A; 2LCC A; 1SEM A; 1VQ5 T; 4Q5W A; 2EGE A; 2WSE E; 5IHI A; 1RAI B; 1I1J A; 2YUP A; 1FYN A; 1SRM A; 3RKX A; 3VRZ A; 1KC8 U; 2FPE A; 4BE1 A; 4A4G A; 2HZY A; 2P0Q A; 1PWT A; 3A8M B; 4J9E A; 4ZGE B; 2RB6 A; 2V1R A; 1VQ4 Q; 2DF6 A; 1K9A A; 4RG8 A; 1NZ9 A; 2EGC A; 1AWX A; 2HQX A; 1SSF A; 1NYF A; 4C92 E; 1WHG A; 4JPB W; 2LJ1 A; 4PJN A; 2JUF A; 4LXC A; 4OMN A; 2PVD B; 2LVM A; 2CZ1 B; 3TSW A; 2E12 A; 4FW1 A; 2J05 A; 4OMQ A; 2BE9 B; 2CT3 A; 1VQ4 A; 1K9M R; 2W0Z A; 4HVW A; 4M77 C; 1WJQ A; 3QO3 A; 3SD4 A; 1QVP A; 3OW2 A; 1RI9 A; 5FWB A; 3CPF A; 5GAM g; 2CP7 A; 1WXB A; 2DET A; 1RUW A; 2EJG A; 4EPC A; 5CCA A; 1SKU B; 3OS1 A; 3OYN A; 4CC3 A; 4DBF A; 2QQA A; 4F7U B; 2E3I A; 4MMK A; 1WI7 A; 3E9G A; 3EGX A; 1SHG A; 2D8H A; 1N6A A; 3EG3 A; 3A8H B; 3SWN A; 2PQW A; 3MP1 A; 3PVL A; 4C8Q G; 3MEW A; 3CC2 T; 1VUB A; 2XHC A; 2MCN A; 1H3H A; 4J6Y A; 2RM4 A; 4HVU A; 4J6X A; 2P0K A; 2HEQ A; 1BI0 A; 4FM4 B; 2OI3 A; 1UTI A; 4J9H A; 2QA4 T; 1R8O B; 2GQV A; 1GRI A; 3PNW C; 1Q86 U; 5IHN A; 4PJJ A; 1QP3 A; 3OYC A; 5IAY A; 2BIV A; 1VQL T; 3FIF A; 3L1A A; 4DQ2 A; 4HA8 A; 5I21 A; 3CCS T; 2JT4 A; 1G8X A; 3CCE T; 4KUI A; 2JTM A; 2K2V A; 3BY7 A; 3RMQ A; 5LJ5 j; 3I9Q A; 2RD1 A; 2XDD A; 4PJO B; 1WHL A; 1O9S A; 2L3P A; 4IUT A; 4JLI A; 3CBM A; 1KD1 R; 3EH2 A; 1VIE A; 1WQW A; 2AK5 A; 3QSU A; 1EZZ B; 3EFO A; 2AZS A; 3G7Z A; 1WX6 A; 3OYI A; 4AFU C; 3LLR A; 3EHQ A; 1VQ6 T; 1W70 A; 2OAU A; 5CQX A; 3VS6 A; 1Y71 A; 2AT1 B; 4M7D D; 1OUL A; 4Z88 A; 1B34 A; 3M59 A; 4M7D B; 4HKE A; 3CMA T; 4ZGJ B; 3OW2 P; 1SG5 A; 3G71 T; 1VQN T; 1K73 U; 1KIK A; 3KBG A; 4JS5 A; 2A37 A; 3REA B; 4XTY A; 1B7T A; 2GTJ A; 1NLO C; 1M3A A; 1NG2 A; 3PFS A; 2JM9 A; 2XDB A; 1M2V B; 4PFZ A; 5GAN 5; 4JUV A; 3NPF A; 1KC8 R; 4EIK A; 4FT2 A; 2RO0 A; 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