The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
9
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-02-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1T3L A; 2KRO A; 1NLP C; 4JZ3 A; 1UE9 A; 4ESR A; 1S1N A; 2CSI A; 2ROL A; 1WA7 A; 2K9G A; 2HDA A; 1ARK A; 2G6F X; 4EIK A; 3M0P A; 1JXM A; 1T0H A; 1PHT A; 1OPK A; 4FSS A; 2J06 A; 2JTE A; 2K2M A; 2DNU A; 3ZL7 C; 1NG2 A; 1QCF A; 4J9F A; 1WFW A; 1K4U S; 3TVT A; 1K0X A; 2EGC A; 2RQT A; 2GTJ A; 3U23 A; 2LP5 A; 4J9B A; 2DMO A; 1K1Z A; 1GCP A; 2JM8 A; 3ULR B; 1X6B A; 1ABQ A; 2DBK A; 1E6G A; 5I11 A; 5GJW B; 2DL8 A; 2KT1 A; 2A08 A; 2EYX A; 2ABL A; 1X6G A; 3A98 A; 2DRM A; 4RTV A; 1OEB A; 2BZX A; 2O9S A; 1WX6 A; 4ORZ A; 4A63 B; 1M30 A; 4F14 A; 2AZV A; 2KYB A; 3VS3 A; 2DL3 A; 2SRC A; 3PE0 A; 2KR3 A; 1B3Q A; 3I35 A; 1KFZ A; 2KRS A; 5L23 A; 3NHN A; 2DVJ A; 2RQU A; 2A37 A; 3I9Q A; 2W0Z A; 1YN8 A; 1UJY A; 2JW4 A; 3R6N A; 2YSQ A; 2YUO A; 1EFN A; 1BU1 A; 1GL5 A; 1AZE A; 2XMF A; 4OML A; 1WI7 A; 2DL5 A; 1K9A A; 2NUZ A; 2DL7 A; 2DF6 A; 3O5Z A; 2F2W A; 1UG1 A; 2PZ1 A; 2VKN A; 4Y92 A; 5GJV B; 1GRI A; 1U06 A; 2DX1 A; 4J9C A; 3EGU A; 2V1R A; 3REB B; 1WIE A; 5EC7 A; 2J6F A; 5I22 A; 1WLP B; 2L3P A; 3PVL A; 2OAW A; 4J9I A; 1V1C A; 3VS0 A; 3TSW A; 3QWX X; 4OMP A; 2GNC A; 2YUN A; 2V1Q A; 2KGT A; 1SRM A; 5IHK A; 4LN2 A; 1HSQ A; 3EG1 A; 2BZY A; 3CQT A; 2K6D A; 2KT8 A; 1X2Q A; 3SHW A; 2GGR A; 1WYX A; 2DRK A; 2FPF A; 3M0T A; 1AOJ A; 2DYB A; 2A36 A; 4J9E A; 1ZX6 A; 2E5K A; 3NPF A; 1A0N B; 1X27 A; 2KBT A; 1YWO A; 1QLY A; 1NM7 A; 4HXJ A; 1PKT A; 2CDT A; 2O31 A; 4WCI A; 2ESW A; 2LJ3 A; 2A28 A; 2KRM A; 3H0I A; 4RUG A; 1GFD A; 2LZ6 B; 1AZG B; 1I0C A; 1NLO C; 1LCK A; 2DLP A; 2LMJ A; 2CH4 W; 3QWY A; 2FPE A; 2FRW A; 4IIM A; 1MUZ A; 4M4Z A; 2FG0 A; 1VYV A; 1ZBJ A; 2MOX A; 1JEG A; 4Z89 A; 1TUC A; 1QWE A; 2LX7 A; 5IXB A; 5IH2 A; 1YCS B; 4KRT A; 4OMM A; 4J9D A; 2SEM A; 3RNJ A; 3EG0 A; 3C0C A; 2F2X A; 4GLM A; 1VYT A; 1GCQ A; 1JO8 A; 1UUE A; 4X1V A; 1AD5 A; 5IXF A; 2L3Q A; 1RLQ C; 4JJB A; 1PNJ A; 1RI9 A; 2F2V A; 4E6R A; 4J9G A; 3REA B; 1AWJ A; 2PTK A; 2L3S A; 1K76 A; 3M0R A; 4HCK A; 4J9H A; 1FMK A; 2KEA A; 1KIK A; 4RTT A; 2RMO A; 1SHG A; 2OJ2 A; 1AWW A; 2K7A A; 3VS5 A; 1PWT A; 3LH5 A; 1SEM A; 2EGA A; 4F16 A; 4JZ4 A; 1PKS A; 2NWM A; 2C0I A; 1NEG A; 3RBB B; 1KJW A; 1HD3 A; 1X43 A; 4AG2 C; 1UEC A; 3EHR A; 4ZNX A; 4QT7 A; 3GBQ A; 4JJC A; 2CUD A; 3KFV A; 1WXT A; 2ENM A; 1HJD A; 2RQW A; 3I5S A; 3EG3 A; 2K3B A; 5IHI A; 1I1J A; 1N5Z A; 1OPL A; 2D1X A; 1W1F A; 2JS2 A; 1X2K A; 1SRL A; 1AEY A; 2GQI A; 1QKX A; 2ROT A; 2AKK A; 2O2O A; 3VRZ A; 1E7O A; 1OV3 A; 2KXD A; 1B07 A; 1UGV A; 2QDL A; 2KRN A; 2M0Y A; 4LUD A; 1H3H A; 1M8M A; 3IQL A; 2RF0 A; 2EYW A; 2LJ0 A; 1NEB A; 3VRY A; 4RTZ A; 2HEQ A; 2J6O A; 2MCN A; 3EHQ A; 1UTI A; 4Z88 A; 5HCK A; 2LNH B; 4Z8A A; 2HBW A; 2EQI A; 2L2P A; 4AG1 C; 4D8D A; 1GBR A; 4CC3 A; 2EYZ A; 2L0A A; 1ZUU A; 1G83 A; 2W10 A; 1M3C A; 1E6H A; 2KXC A; 5FW9 A; 4D8K A; 2IIM A; 2H8H A; 1BBZ A; 3H0F A; 2EVR A; 5ECA A; 3TSZ A; 1G2B A; 3VS2 A; 1UHF A; 1VYU A; 2X3W D; 2RN8 A; 3UA7 A; 3H41 A; 2CT3 A; 2DBM A; 2DIL A; 2K79 A; 2FRY A; 5IHN A; 2ECZ A; 3M0U A; 2C0T A; 2D8H A; 4RTU A; 1ABO A; 3VS6 A; 2VWF A; 1MV0 B; 2JMA A; 1CKA A; 2CT4 A; 3PVQ A; 2RPN A; 1ZSG A; 2JT4 A; 2EBP A; 1Z9Q A; 1AWX A; 2CRE A; 1SSH A; 4HVV A; 2CH4 A; 2YUP A; 2OI3 A; 4RTW A; 3UF4 A; 4OMO A; 1NYF A; 2B86 A; 2RQV A; 4CC4 B; 1BK2 A; 2LJ1 A; 4RTY A; 1UDL A; 1JQQ A; 1IO6 A; 1Y57 A; 1ZUK A; 5FWC A; 2JM9 A; 2J6K A; 1JXO A; 1BB9 A; 3VS1 A; 3FJ5 A; 1H8K A; 1QKW A; 3NGP A; 4LUE A; 4LNP A; 3VS4 A; 1WXU A; 4OMN A; 4RTX A; 3UA6 A; 2C0O A; 2DA9 A; 3VS7 A; 2HCK A; 2KE9 A; 4JPB W; 1TUD A; 4IIO A; 1CSK A; 1K0S A; 2JXB A; 2AKL A; 2YUQ A; 2J05 A; 1GBQ A; 1UJ0 A; 2ED1 A; 2MIO A; 1TG0 A; 2M51 A; 1M3B A; 2FO0 A; 3SEM A; 1AVZ C; 2D0N A; 1AWO A; 4JJD A; 2RNA A; 3JV3 A; 1H92 A; 2LQN A; 2P4R A; 5FWB A; 1Z9Z A; 2DJQ A; 2KYM A; 4AFS C; 2JMC A; 3UAT A; 2I0N A; 4AFZ C; 1YP5 A; 4HVW A; 2JS0 A; 4CC7 A; 1MV3 A; 4R0K A; 1Y0M A; 2PNI A; 3THK A; 1T3S A; 2LCS A; 2EW3 A; 2X3X D; 2BZ8 A; 3M0S A; 4OMQ A; 1PRL C; 2HSP A; 1I07 A; 2FEI A; 1YNZ A; 1J3T A; 2EGE A; 1YWP A; 1SPK A; 4DEY A; 1KSW A; 2AZS A; 1T0J A; 1SHF A; 1M3A A; 2EYY A; 1M27 C; 2CSQ A; 1RUW A; 1ZLM A; 2DM1 A; 2J7I A; 1NYG A; 2GTO A; 2ED0 A; 1JU5 C; 1W6X A; 2FPD A; 1CKB A; 2DE0 X; 4GBQ A; 4F17 A; 1UFF A; 3NMZ C; 2RQR A; 4CC2 A; 2AK5 A; 3M0Q A; 2O88 A; 1W70 A; 1UHC A; 2D8J A; 1GCQ C; 1X69 A; 2EKH A; 1QWF A; 1FYN A; 3I5R A; 2YT6 A; 4DEX A; 2YDL A; 2GBQ A; 4LE9 A; 1VA7 A; 2EPD A; 4HVU A; 1U5S A; 1GFC A; 2O9V A; 2VVK A; 3H0H A; 1OOT A; 1ZUY A; 4AFQ C; 4AFU C; 1U3O A; 4K11 A; 2KNB B; 1WDX A; 3EG2 A; 2BTT A; 2CUB A; 2DL4 A; 2LQW A; 1PRM C; 1RLP C; 1XOV A; 1WXB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KUF A; 1OU9 A; 4LDX A; 1NLP C; 3OYE A; 1UE9 A; 4ESR A; 1S1N A; 4C0F A; 4OGC A; 2V8I A; 5LJ3 f; 2GCX A; 1ARK A; 1SG5 A; 2G6F X; 3G4S A; 3JB9 G; 4FYY B; 1WFW A; 4OP0 A; 2EIF A; 2RK2 A; 2LP5 A; 1GCP A; 5GAO m; 2JM8 A; 3JCM W; 3JB9 J; 2X9H A; 1X6B A; 3E9G A; 5GJW B; 2EYQ A; 3G71 A; 1LJO A; 4RCC A; 4BUG A; 4JRI A; 2ZAE A; 4RTV A; 5FRO A; 3LX7 A; 2O9S A; 2BZX A; 4ORZ A; 1M9S A; 4FT2 A; 4F14 A; 3HRT A; 2DL3 A; 3NHN A; 2DVJ A; 4M77 G; 4IUT A; 1W2B P; 2GFA A; 2DTI A; 2JW4 A; 3R6N A; 1WHH A; 1FX7 A; 2YUO A; 5A0D A; 1AZE A; 1KD1 R; 4RG2 A; 1JJ2 S; 1WI7 A; 3NTI A; 1K9A A; 4M77 C; 1TTH B; 2DET A; 2DF6 A; 1LPL A; 1UG1 A; 3URG A; 1PCX A; 1BI0 A; 1YJ9 T; 1VQ9 Q; 1KHI A; 2WAC A; 2QAZ A; 4FM4 B; 3RKY A; 1VQO T; 2L3P A; 1V1C A; 3QWX X; 2RHX A; 4OMP A; 3I55 T; 2COY A; 2K5L A; 5IHK A; 2BZY A; 2K6D A; 1M4Z A; 2D0Q B; 4KGX B; 2CP5 A; 1YCY A; 2GGR A; 2E5Q A; 5KYY A; 3CCJ A; 2DRK A; 2FPF A; 2LDM A; 1KQ1 A; 3M5A A; 5CIU A; 3A5Z B; 3OYY A; 2XD0 A; 2E5K A; 2FYK A; 4C92 D; 2LNV A; 1X27 A; 4FW2 A; 4M77 E; 2O31 A; 1ZA2 B; 3OYH A; 2LJ3 A; 2A28 A; 1G8X A; 1AZG B; 1I0C A; 2QAS A; 2I2L A; 4HT8 A; 1LCK A; 4PJJ A; 2KSS A; 2RA2 A; 2DD4 A; 5LJ5 g; 4XU2 A; 3CME Q; 1AT1 B; 1RAI B; 2FG0 A; 1VYV A; 3NTK A; 1TUC A; 3EGD A; 3N5B B; 5GAN 6; 4E7Z A; 2CZ6 B; 1N6A A; 2QK0 A; 3S3O A; 1KD1 C; 1PSE A; 3RNJ A; 3C0C A; 2F2X A; 3UDC A; 1BYM A; 3L2R A; 1GCQ A; 4PJO B; 1NBE B; 1UGP B; 3GNG A; 3OA6 A; 3G1J A; 1B34 A; 2P0P A; 3SD4 A; 1VIF A; 3JCM f; 5GMK e; 1AWJ A; 1OYX A; 3BFM A; 2PTK A; 4DBQ A; 2AT1 B; 3QO3 A; 3PNW C; 2NUT A; 4M7A A; 3MET A; 2FB7 A; 1FMK A; 1X01 A; 1N8R C; 3M56 A; 1KK7 A; 1Q82 U; 2DTO A; 2RMO A; 2ZPI B; 1AWW A; 3LH5 A; 1SEM A; 4Q5W A; 2EGA A; 3GNF B; 3OS5 A; 4JZ4 A; 2IVW A; 2L5Q A; 3LWH A; 2C0I A; 2L89 A; 4N0A C; 1QCN A; 1KJW A; 2DO3 A; 2MMP A; 3G4S T; 1UGR B; 1X43 A; 4AG2 C; 3EHR A; 2HQE A; 4PLL A; 4JJC A; 2LT4 A; 1I1J A; 2D1X A; 1W1F A; 1VQL A; 2LT1 A; 2O2O A; 1RI0 A; 1UGV A; 1Y7X A; 2KRN A; 3CD6 Q; 1M1K R; 2OTJ Q; 2YWW A; 3PIO A; 3G71 T; 4X34 A; 2KK4 A; 3MEW A; 1KC8 R; 2X4X A; 3QJY A; 2LJ0 A; 1NEB A; 3QJ6 A; 4JRQ A; 1VQ4 A; 5GAN d; 1H64 1; 3KXT A; 4M7D B; 1VQP A; 1NZ9 A; 4PJO G; 2HKQ B; 1GBR A; 5GMK i; 1X75 C; 2V8J A; 1D1C A; 4PJO C; 2JVV A; 2M0O A; 3GOX A; 2RD1 A; 3S3M A; 5FW9 A; 4QQG A; 3LGL A; 2QA4 A; 4DBH A; 1JBM A; 3TSZ A; 3TU4 K; 4QVD A; 1PSF A; 1Y96 A; 4DQ2 A; 1N27 A; 4IUU A; 2A3L A; 2CZ0 B; 1BIA A; 1QMC A; 2M16 A; 3M0U A; 3QYH B; 4C92 F; 2H3E B; 3G6E Q; 2Y4X A; 1W2B A; 4O6J A; 2JMA A; 4II1 A; 3V8L A; 2RPN A; 3CCJ T; 1AWX A; 1SSH A; 2YUP A; 2KVQ G; 3UF4 A; 4FSX A; 1M1G A; 4PJO E; 1H3Z A; 3CCV A; 2E4H A; 1BI2 A; 1NYF A; 3UT1 A; 1M8V A; 2B86 A; 4CC4 B; 2LJ1 A; 1M1K C; 1KC8 C; 1ZUK A; 4NL2 A; 2JM9 A; 1WHJ A; 1YIJ Q; 1IRE B; 1Q82 R; 4A4K A; 4KUD K; 1BB9 A; 1Q7Y U; 1M90 R; 2PVG B; 2ATC B; 3FJ5 A; 2E3H A; 3NGP A; 1YJW Q; 2DAQ A; 4LUE A; 4LNP A; 1WZO A; 1TXQ A; 4ELY C; 1YFN A; 4FYV B; 4M7D G; 2QXF A; 5GAN e; 4PJL A; 5CKH A; 2VXE A; 4M7A D; 2OTL Q; 2J05 A; 2ED1 A; 2M51 A; 5KYX B; 1MND A; 1ZSZ B; 3V7S A; 4M7D C; 4DOW A; 3OQ5 A; 3CMA Q; 5M9O A; 3JV3 A; 4ZN1 A; 3R6O A; 4JRP A; 4AFZ C; 1Q81 R; 3HRS A; 2RI3 A; 1Y0M A; 1JRI A; 3M4Y A; 4C0Z A; 5LJ5 f; 3BY7 A; 3HFO A; 1PRL C; 2FEI A; 5J39 A; 4BAC A; 1YNZ A; 1J3T A; 3CCM Q; 2O4X A; 1UB4 A; 4LD9 K; 3TQ7 P; 4JLI A; 4MZM A; 1K8A R; 1MMD A; 2IPO B; 1M1F A; 3H8Z A; 1VUB A; 1RUW A; 4EMK A; 3RDV A; 2DM1 A; 4M7D E; 1YBY A; 1IXD A; 1D09 B; 5GAO r; 4E7L A; 1JU5 C; 4N4G A; 2EAY A; 3CCE A; 4C8Q B; 3GP8 A; 1NE8 A; 4KH1 B; 2A7Y A; 5CKB A; 4FU6 A; 1M90 C; 2O88 A; 3DB4 A; 2ZGW A; 1UHC A; 1VQL T; 4GY5 A; 1X69 A; 1QWF A; 4LE9 A; 2O9V A; 2VAS A; 2VVK A; 1R0B G; 3VUB A; 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2YRV A; 1Q7Y C; 1Q86 U; 1I5L A; 3SHW A; 1WYX A; 4C5H A; 2DXC A; 1AOJ A; 1XTD A; 1ZX6 A; 1OX8 A; 1YWO A; 3M53 A; 3CXC A; 2XU8 A; 2PU9 B; 1VQ5 A; 1PKT A; 3CC7 A; 3SFM A; 3SWN B; 2ESW A; 5KYN A; 3BDU A; 4O5V A; 2EJG A; 4M78 F; 2FL7 A; 2LZ6 B; 3EFO B; 5KYW A; 1MNE A; 2CH4 W; 4RG8 A; 2L8D A; 3S3N A; 3JCM X; 2BUD A; 4B9X A; 1ZBJ A; 1VQK A; 4FW1 A; 1I81 A; 4HCC A; 4Z89 A; 5GMK l; 4PNO A; 5IH2 A; 2NYS A; 3PIP A; 1YCS B; 4PL6 A; 2KMT A; 7AT1 B; 1QVG P; 3OS0 A; 2E70 A; 3DKM A; 4A4E A; 3JAM E; 3CCE T; 2X35 A; 1QP3 A; 2OX7 A; 2DER A; 3OYI A; 1UUE A; 1WJS A; 2COZ A; 5CR2 A; 1XJW B; 1D3B B; 3CCR A; 2HAX A; 3P8H A; 2E6N A; 2LRQ A; 2L3R A; 3CC2 A; 2DZ9 A; 1AD5 A; 5IXF A; 2L3Q A; 4HCZ A; 3CCQ A; 1KQS A; 4E6R A; 4J9G A; 3REA B; 1IRX A; 2DTH A; 3CEY A; 1QP2 A; 3M58 A; 4KH0 B; 2L3S A; 5D6X A; 2MYS A; 1K76 A; 3M0R A; 2QQR A; 1HYO A; 2JJ9 A; 2KEA A; 2JOY A; 1YJ9 Q; 1G3W A; 3CC4 T; 1WHM A; 1RAE B; 4XK8 E; 5CAI A; 3LLR A; 1PKS A; 2NWM A; 1VQO Q; 4ZN3 A; 3I56 A; 1VIE A; 3RBB B; 3I55 Q; 3WVE B; 3EG9 A; 1HD3 A; 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