2LQNA

Solution structure of crkl
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAYAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Crk-like protein
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqnA01
1UECA 3IN8A 2EYVA 3ULRB 1SHFA 1X69A 2EW3A 5I6VA 4WWQA 1V1CA 1K1ZA 2AOBA 2F2XA 2B86A 2E5KA 1ZUYA 4DEXA 3U23A 2GBQA 4Z8AA 2PNAA 1GBRA 2JS2A 4FL2A 4FL3A 3S8NA 2DRKA 2Y1NA 1QLYA 1XOVA 3UA7A 2JM8A 2EGEA 2FRWA 2OAWA 5L23A 3OVEA 1MV0B 1QCFA 5AXIA 3TSZA 2DM0A 1M3BA 1O4BA 1PNJA 1LUIA 3TKZA 2AKKA 1O48A 4J9GA 2GGRA 1A0NB 4NWFA 4F59A 2EBPA 3EGUA 1GCQC 1M61A 1JU5C 1OO4A 1HJDA 2ETZA 1H3HA 2L0AA 1JXOA 4A4BA 2K79B 2X3XD 3S8OA 1HD3A 5KAZA 1O44A 1UG1A 2JS0A 3H41A 1LCJA 4JEGA 3EACA 4CC4B 2VKNA 4ZNXA 3O5ZA 1K9AA 3VS4A 3VRPA 3I5SA 1PKSA 1KJWA 1VYVA 2JMCA 1BM2A 3RNJA 2F2WA 2ABLA 2EYXA 1E6HA 4OHEA 1ZUUA 1IS0A 5DF6A 2FPEA 2DF6A 2RPNA 2EKXA 4AG1C 2A37A 4J9BA 3VGOA 1B07A 2RQVA 2SRCA 3NGPA 4HCKA 1UHFA 1ZFPE 2YSXA 3PJPA 4ROJA 1OO3A 1SSHA 2EQIA 5EG3B 4M4ZA 1X6CA 3N84A 2HEQA 3PS5A 2IUHA 1KC2A 2LNXA 1X0NA 4J9IA 4LE9A 2CBLA 3PLFB 1ZBJA 2ENMA 2PNIA 2O9SA 1RLQC 3PVQA 1YNZA 2FPFA 3VROA 2EGAA 1AYAA 4AFZC 1JYUA 1QWFA 1SRMA 1O46A 1TUCA 2DJQA 1CWEA 4JE4A 3LH5A 3SEMA 3A98A 1PRLC 2DM1A 1NYFA 2O2OA 3PVLA 2CUDA 2DX1A 3KFVA 2MK2A 4E68A 4H1OA 2I0NA 2KRMA 1A81A 2G6FX 2H5KA 1BMBA 1O4QA 1AZEA 2JTEA 4RTUA 1GBQA 1UURA 5BO4A 2DVJA 1O4NA 2DMOA 1GCQA 2J6FA 3IQLA 1FYRA 1JU5A 1KSWA 4OMMA 1O4KA 3M0QA 4QT7A 4A63B 1WQUA 1Z3KA 1E7OA 4DGXA 1IJRA 2NWMA 3IN7A 1GL5A 1KIKA 1SHBA 2J05A 1O4EA 2O9VA 2W10A 1SRLA 2KEAA 2KT8A 1N5ZA 3GBQA 3PQZA 5EC7A 2JYQA 1NG2A 3NMZC 1YVLA 2HMHA 2PLDA 3M0TA 1WXTA 2AUGA 3OP0A 2J6KA 2KGTA 4F5BA 1BBZA 3N7YA 1R1PA 2KXDA 2KE9A 3EG1A 1BB9A 2ED1A 2K7AB 1ABOA 3M7FA 2LJ1A 1ZSGA 2RNAA 2LNHB 4JJCA 1BF5A 2BZYA 2EYZA 2KR3A 2JM9A 1PWTA 4IIMA 4LNPA 3THKA 3BKBA 3VS6A 1SKJA 5FWCA 1O4GA 1BLJA 4U1PA 4F5AA 1CSZA 2RMOA 2A28A 2MRJA 1WI7A 2LJ0A 1A1BA 3OB2B 1ABQA 1B47A 2FRYA 2D0NA 2EKHA 2EU0A 2LQNA 1F1WA 2CSIA 1AOTF 1FU6A 2KROA 1GCPA 2PZ1A 2O88A 2YSQA 4KRTA 1PICA 4LUEA 1QKXA 4FSSA 2AKLA 2RMXA 1GFCA 2YUNA 2ED0A 3BUMB 1OPKA 1AOJA 1H92A 1R1SA 1BHHB 1CWDL 3EAZA 3RBBB 3VRNA 1VYUA 1F2FA 1A09A 2JXBA 2L3QA 4RTYA 1NRVA 1JYQA 2HDVA 1SPRA 4HVWA 1BU1A 3N8MA 5IHKA 3VRYA 3BUNB 4HVUA 2DCRA 2M51A 2AZSA 3K2MA 1TCEA 3FJ5A 3GQIB 2CSQA 5GJVB 3VS2A 4NWGA 1BG1A 1RLPC 2CI8A 5DC4A 1EFNA 1HCTB 2DL7A 2L4KA 2DNUA 2CUBA 4EIHA 4GL9E 2FCIA 1H8KA 1UUSA 5J3XA 2CR4A 4OHHA 1WXBA 1X43A 1D1ZA 1YCSB 2ECDA 2DILA 3OB1B 3WA4A 2DL4A 1UFFA 4RTWA 2V1RA 2KRSA 3QWXX 2PNBA 2NUZA 1FMKA 3EG0A 2DBKA 1YVHA 1RQQC 1M27C 1OV3A 5CDWA 2Y1MA 2EYYA 2HDXA 1X2KA 2GNCA 5DC9A 1JYRA 3PE0A 1I0CA 2C0TA 1CSYA 1SHGA 3VRZA 4D8DA 5IHIA 2RVFA 2QDLA 1U06A 1U3OA 2JT4A 1LUKA 1G83A 2BZ8A 3SHWA 5IBSA 2DX0A 2W0ZA 1M30A 3CQTA 5IH2A 2GSBA 2L3SA 1WLPB 4R0KA 1WDXA 4HXJA 1UE9A 2FPDA 2V1QA 3QWYA 1MUZA 1O4CA 1AOUF 5IXBA 1CSKA 1O42A 3NHNA 2ECZA 3R6NA 2D1XA 1SPSA 2MRKA 1O4OA 1VA7A 4DEYA 4RTZA 3IMJA 5HKZA 5GJIA 1LKLA 1QWEA 1MILA 4JGHA 1KFZA 1O4DA 1O4JA 1O47A 2BZXA 2DA9A 2FEIA 2KNOA 4K11A 3MXCA 1PHTA 1BLKA 2SHPA 4OHIA 1NLPC 4K44A 4ORZA 4J9DA 2CRHA 3H0HA 1W6XA 2LCSA 1TUDA 2A08A 1WXUA 4OMNA 1T0HA 1D4WA 2KBTA 5AULA 3HHMB 2GTJA 3BUWB 1LCKA 3I35A 3MAZA 3CD3A 2IZVA 1O4IA 3PSKA 2H46E 1QKWA 1O41A 2K9GA 3VS5A 1NZVA 2K2MA 3NPFA 4JPBW 4OMQA 1M3CA 1O4MA 2YDLA 5I11A 1M27A 1HSQA 4X1VA 1K0SA 4AFSC 1UGVA 2SEMA 1SEMA 1NEGA 1UJ0A 2MCNA 3UF4A 4JJBA 1QG1E 2HUWA 1RI9A 1W1FA 2F2VA 2P4RA 1I3ZA 4QSYA 2X3WD 2ROLA 1RJAA 2JMAA 4J9EA 2CIAA 2YUQA 1J3TA 1SHDA 4GLMA 5HCKA 2EOBA 1R1QA 2K6DA 1BHHA 5EHPA 3REBB 4CC7A 3CWGA 3ZNIA 4HVVA 1XA6A 2CT4A 1AWOA 3HCKA 4F16A 3EG2A 1O43A 3TVTA 1CKAA 1FYNA 2K79A 3GXWA 1Z9ZA 1GFDA 3I5RA 2DL3A 4GPLB 2CS0A 4JZ4A 5I22A 2KNBB 1AYDA 2CDTA 2LMJA 3S8LA 4JJDA 1NEBA 1HCSB 2C9WA 1SPKA 3OV1A 2IUGA 1NYGA 2DBMA 1M8MA 2KXCA 5EEQA 5EHRA 2OJ2A 4AFUC 1O4PA 1GRIA 4ESRA 2K3BA 3CXLA 1K4US 1BKLA 1AYBA 2EVRA 1Z9QA 2DRMA 1FU5A 1ZUKA 3ZL7C 1GHUA 5GJHA 4X6SA 2IIMA 4FBNA 2PTKA 1YP5A 3IMDA 1LKKA 3BUOB 3VS1A 1TZEE 2RQUA 1X6BA 1Y57A 1O4HA 2RQWA 5DC0B 4U17A 2EYWA 2IUIA 3VS0A 1WFWA 1P13A 2L3TA 4CC2A 3UA6A 4OMLA 4AG2C 1K0XA 2YU7A 1BHFA 2O31A 1VYTA 2D8JA 2RSYA 4LN2A 4D8KA 1X6GA 2JW4A 1JXMA 2ROTA 1UJYA 2KYMA 1AB2A 5IXFA 1JO8A 1ZLMA 1O49A 1OPLA 1G2BA 4LUDA 2LJ3A 4K45A 5IHNA 2BBUA 2RF0A 4E6RA 4XZ1A 4F14A 2VWFA 4F17A 3TL0A 1LUMA 3VS7A 1PRMC 1I07A 2LZ6B 1O4RA 3S9KA 2DL8A 1YN8A 1T3SA 1AVZC 1BFIA 5FW9A 2H8HA 2L3PA 1ARKA 1RPYA 4GBQA 2MOXA 2EPDA 1UHCA 2B3OA 1M3AA 1SHAA 2DE0X 1O4LA 4TZIA 1CJ1A 1CKBA 3H0FA 1T0JA 4RTVA 4DGPA 4A4CA 3EHQA 2J7IA 1UTIA 1UUEA 4P9VA 4RUGA 5ECAA 3T04A 4K2RA 5HKYA 2C0IA 1A1CA 2J06A 2BTTA 4JZ3A 1WYXA 1YWPA 1BFJA 1FHSA 2EO6A 2OZOA 1U5SA 2XMFA 2AK5A 1TG0A 2YUOA 1T3LA 1AEYA 2EL8A 3UYOA 1A07A 1QADA 5EELA 5HKWA 2K7AA 2MIOA 1NLOC 1A08A 1PKTA 1WIEA 4XZ0A 3VRQA 1X2QA 1S1NA 1K76A 4Y92A 4H34A 2QMSA 4L1BB 4WCIA 2LNWA 3C0CA 4OMOA 4CC3A 4EIKA 2DL5A 2LCTA 2PLEA 1AZGB 2EGCA 3CBLA 4P9ZA 2A36A 2D8HA 1I1JA 3M0UA 1KA6A 2Y3AB 2GTOA 1O4AA 2DYBA 2L2PA 2AOAA 3EG3A 1BK2A 3REAB 1AD5A 2RN8A 3M0SA 1O45A 2XP1A 1E6GA 4Z88A 4IIOA 4EY0A 3M0PA 1OOTA 1RUWA 1WA7A 2DLPA 2LP5A 2RORA 3H0IA 3I9QA 3US4A 2AZVA 2LX7A 2HBWA 3KFJA 4OMPA 2M0YA 5FWBA 3TSWA 1FBZA 2HDAA 1X27A 4E93A 3EHRA 2HCKA 2CREA 2YT6A 2DLZA 3MXYA 1A1AA 3PFVA 2HSPA 1AWJA 1Y0MA 1BKMA 4RTTA 3PSJA 5IBMA 1IO6A 2LQWA 2FO0A 2KT1A 2KRNA 2RQRA 5D0JA 2VIFA 1NZLA 1AWWA 2GQIA 2MC1A 3JV3A 1B3QA 1WX6A 1D4TA 4Z89A 1KA7A 2L6KA 2CI9A 1O4FA 1W70A 4RTXA 1Y1UA 1FBVA 2MQIA 3HIZB 4OHDA 1NM7A 2ESWA 1A1EA 2OQ1A 2C0OA 4OHLA 3GXXA 3M0RA 1YWOA 1MW4A 2RQTA 4GWFA 2KK6A 2CH4A 2KYBA 1JEGA 3VS3A 1OEBA 2CH4W 3UATA 1JWOA 1LUNA 3BUXB 3C7IA 2OI3A 1MV3A 1AWXA 1UDLA 2EO3A 2FG0A 2YUPA 4AFQC 1H9OA 4J9FA 1ZX6A 2VVKA 4J9CA 5GJWB 1AYCA 2DLYA 2CT3A 2GE9A 3VRRA 4J9HA 2J6OA 1JQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IN8A 4RG2A 1QVGA 3M56A 1SHFA 1X69A 5I6VA 4WWQA 2B86A 2DXUA 4DEXA 2LVMA 2PNAA 1OX9A 1WHLA 4QQDA 1QLYA 1XOVA 3BDUA 4C92C 5AXIA 3EFOB 2DERA 4OF1A 4M78E 1EZZB 1Q81C 1IXDA 1M3BA 1KD1U 2RHIA 3CPWS 2AKKA 3SDZA 4NWFA 5GAMd 3CCMT 3M58A 2F5KA 3NTKA 5GAN4 4ZNXA 5CVIA 1K9AA 1VQOQ 2FZKB 2GFUA 2JMCA 1Q86U 1N8RU 4OHEA 2HKNA 2OTLA 5KYYB 1IS0A 2RHZA 3CCRT 5DF6A 2A37A 3VGOA 3UDCA 2RQVA 5LJ3h 2VGMA 1QW1A 5CAIA 3CCEA 3CCUT 1X6CA 2PUKB 3X28B 1N9SA 1WHJA 3PS5A 4EMKC 5KYNA 2O9SA 2CS7A 2FPFA 1Q82U 2ZAEA 5FRNA 3VROA 1SRMA 3MEVA 2YRVA 4JE4A 1QP3A 4C92A 2O2OA 2QEXT 5M9OA 4F7UG 2KRMA 4NL2A 1UGSB 2JTEA 4RTUA 1MGQA 2DVJA 1KSWA 3D7SB 4JRQA 4QT7A 4RCCA 1IJRA 2DXBA 4QVZA 3PT9A 2J05A 2W10A 1SRLA 2K5LA 1N5ZA 4EPCA 1Y96B 1K73R 2JYQA 1VQNA 3NMZC 2PLDA 4M7AG 2V8KA 2P0KA 3HP9A 4FT2A 2XKOC 2MWOA 1WXTA 2FVUA 2KGTA 1I5LA 3NTIA 3QJYA 2CZ0B 3GP8A 5GAOn 1BB9A 2ED1A 3DB4A 2QTVA 2LX9A 3JCMV 2RNAA 4JJCA 1BF5A 1D0YA 4EMKA 3G71Q 1D1CA 4N4HA 5KYUB 3VUZA 2JM9A 3CPFA 4LNPA 2RK1A 1SKJA 3CXCS 3JCMc 4PJJA 5EG2A 2A28A 3EFRA 1WJRA 1VQ7A 1F1WA 4M7AD 4M78G 3CCLT 2PZ1A 2L89A 1IGQA 1OU8A 4FSSA 1QKXA 3QG1A 4ELYC 2CP2A 3OYMA 2RMXA 4KBMB 3A8HB 4L5GA 2Z0WA 5D7UA 5KE3A 1YITQ 4E7LA 4E7HA 3CMEA 2YHTA 1W2BS 1A09A 4M7AC 2R5AA 1NRVA 2P0PA 5GAOr 1BU1A 3DKMA 3CC4T 1NBEB 1S72Q 3MPUB 3CD6Q 3VS2A 4NWGA 1BG1A 1EFNA 2L4KA 3EGXB 2M16A 3I56A 2CYZB 1WXBA 1D1ZA 2BE7D 3CCSA 3WVDB 2DL4A 4LDUA 3G6EA 2PNBA 2XICA 4F7UA 2DBKA 1M2VB 1YVHA 2QGGA 2JZ2A 4C8QB 5CDWA 2Y1MA 5CKEA 5IN1A 2HDXA 1JYRA 3VRZA 4M78C 2RVFA 2EJFA 3JCMf 3JCMQ 6AT1B 3FIFA 3SHWA 3PIPA 1WHGA 2BE9B 3QDFA 1UE9A 5IXBA 1K73U 2ECZA 2XK0A 3R6NA 2X35A 1O4OA 4DEYA 4RTZA 3OYEA 5HKZA 2ZGWA 1MILA 4M7AA 1O4JA 3HL8A 2BZXA 1K9MC 2KNOA 1M1KR 3JB9H 1ZSZC 1JJ2P 2SHPA 4C5GA 4J9DA 1W6XA 2NUTA 4J5YA 2A08A 1T0HA 2QGFB 2GTJA 1LCKA 1PSFA 2LQKA 2FB7A 3I35A 3CD3A 4NL3A 1QVFS 1O41A 4MDXA 2JUFA 1U8RA 1HSQA 2FYKA 4AFSC 2SEMA 1SEMA 1NEGA 3OSVA 1I81A 3UF4A 4JJBA 3C12A 3FB9A 1VQLA 1QG1E 4M78A 2P4RA 3S3OA 2X3WD 5CKHA 2ROLA 4J7FA 4J9EA 2CIAA 2RA2A 4M7AF 2OTLT 1KQSS 1R1QA 4Z02A 3REBB 4A54A 3ZNIA 1FMWA 2M1HA 1XA6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UEC A;  3IN8 A;  2EYV A;  3ULR B;  1SHF A;  1X69 A;  2EW3 A;  5I6V A;  4WWQ A;  1V1C A;  1K1Z A;  2AOB A;  2F2X A;  2B86 A;  2E5K A;  1ZUY A;  4DEX A;  3U23 A;  2GBQ A;  4Z8A A;  2PNA A;  1GBR A;  2JS2 A;  4FL2 A;  4FL3 A;  3S8N A;  2DRK A;  2Y1N A;  1QLY A;  1XOV A;  3UA7 A;  2JM8 A;  2EGE A;  2FRW A;  2OAW A;  5L23 A;  3OVE A;  1MV0 B;  1QCF A;  5AXI A;  3TSZ A;  2DM0 A;  1M3B A;  1O4B A;  1PNJ A;  1LUI A;  3TKZ A;  2AKK A;  1O48 A;  4J9G A;  2GGR A;  1A0N B;  4NWF A;  4F59 A;  2EBP A;  3EGU A;  1GCQ C;  1M61 A;  1JU5 C;  1OO4 A;  1HJD A;  2ETZ A;  1H3H A;  2L0A A;  1JXO A;  4A4B A;  2K79 B;  2X3X D;  3S8O A;  1HD3 A;  5KAZ A;  1O44 A;  1UG1 A;  2JS0 A;  3H41 A;  1LCJ A;  4JEG A;  3EAC A;  4CC4 B;  2VKN A;  4ZNX A;  3O5Z A;  1K9A A;  3VS4 A;  3VRP A;  3I5S A;  1PKS A;  1KJW A;  1VYV A;  2JMC A;  1BM2 A;  3RNJ A;  2F2W A;  2ABL A;  2EYX A;  1E6H A;  4OHE A;  1ZUU A;  1IS0 A;  5DF6 A;  2FPE A;  2DF6 A;  2RPN A;  2EKX A;  4AG1 C;  2A37 A;  4J9B A;  3VGO A;  1B07 A;  2RQV A;  2SRC A;  3NGP A; 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 2HBW A;  3KFJ A;  4OMP A;  2M0Y A;  5FWB A;  3TSW A;  1FBZ A;  2HDA A;  1X27 A;  4E93 A;  3EHR A;  2HCK A;  2CRE A;  2YT6 A;  2DLZ A;  3MXY A;  1A1A A;  3PFV A;  2HSP A;  1AWJ A;  1Y0M A;  1BKM A;  4RTT A;  3PSJ A;  5IBM A;  1IO6 A;  2LQW A;  2FO0 A;  2KT1 A;  2KRN A;  2RQR A;  5D0J A;  2VIF A;  1NZL A;  1AWW A;  2GQI A;  2MC1 A;  3JV3 A;  1B3Q A;  1WX6 A;  1D4T A;  4Z89 A;  1KA7 A;  2L6K A;  2CI9 A;  1O4F A;  1W70 A;  4RTX A;  1Y1U A;  1FBV A;  2MQI A;  3HIZ B;  4OHD A;  1NM7 A;  2ESW A;  1A1E A;  2OQ1 A;  2C0O A;  4OHL A;  3GXX A;  3M0R A;  1YWO A;  1MW4 A;  2RQT A;  4GWF A;  2KK6 A;  2CH4 A;  2KYB A;  1JEG A;  3VS3 A;  1OEB A;  2CH4 W;  3UAT A;  1JWO A;  1LUN A;  3BUX B;  3C7I A;  2OI3 A;  1MV3 A;  1AWX A;  1UDL A;  2EO3 A;  2FG0 A;  2YUP A;  4AFQ C;  1H9O A;  4J9F A;  1ZX6 A;  2VVK A;  4J9C A;  5GJW B;  1AYC A;  2DLY A;  2CT3 A;  2GE9 A;  3VRR A;  4J9H A;  2J6O A;  1JQQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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