The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
NPCLSESDASTRCLDENNYDRERCSTYFLRYKNCRRFWNSIVMQRRKNGVKPFMPTAAERDEILRAVGNMPY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Unknown function
|
| molecule keywords |
Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protei
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| publication title |
Structural characterization of CHCHD5 and CHCHD7: Two atypical human twin CX(9)C proteins.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
24
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-03-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | CytochromE C oxidase copper chaperone |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LQT A; 2LGQ A; 1HP8 A; 1U97 A; 2HP8 A; 2RN9 A; 1U96 A; 1Z2G A; 2RNB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4YXW G; 3K57 A; 5J2U A; 2OYQ A; 2CTP A; 2P4K A; 1RFY A; 3EVK A; 1FXV A; 3LSQ A; 2KB1 A; 2C2A A; 2JDI G; 1DF5 A; 1YXB A; 4NYK A; 4RUE A; 2CAZ C; 4WFG A; 2P06 A; 1VQO V; 2DYS C; 4WCE V; 2UU9 B; 3ETG A; 5L3F A; 1I94 O; 1ZAU A; 5KA5 A; 1GN4 A; 1GKF A; 1M4U A; 5CB4 B; 1XQ8 A; 1Q5O A; 1N36 O; 1CPY A; 4I0X B; 5EIB C; 2F93 B; 3ZX6 A; 2RN9 A; 4WFH A; 4JI4 B; 3TJT A; 2BCC H; 3DC6 A; 2EIN B; 2HJF C; 3J81 N; 3CC4 V; 2IJH A; 4ZHQ A; 1KD1 W; 3T4Z A; 3F5W C; 1OJH A; 2ZD9 A; 1N4C A; 1TGO A; 2IH1 C; 3T4D A; 2PI4 A; 3JAL B; 4DR2 B; 4XDJ A; 1H38 A; 3WG7 C; 4O2B A; 5CA1 A; 1NR1 A; 3AEI A; 4O4J A; 3BAB A; 3WB0 A; 3OGI B; 3Q4H B; 4EEQ A; 3K79 A; 1J5E B; 4JAU A; 3UQ8 A; 3I5D A; 2DE0 X; 2EIL B; 1HWY A; 2UXD O; 2JEX A; 1F4N A; 2DWE C; 4UFZ A; 4I9W A; 1KUQ A; 3C90 A; 2HFE C; 4LNU B; 3O65 A; 2VWJ A; 2ZE5 A; 4IYI A; 1SQP H; 5EIB D; 2XAS A; 3F7Y C; 4L87 A; 4X9Q A; 2CTR A; 4UVA A; 2W6I G; 5LHG A; 5B1A B; 1YJW V; 3CCM V; 1BQ0 A; 1BHA A; 2IU3 A; 4IGG A; 1N0J A; 2KSD A; 3FAV A; 5CB4 A; 4AQY B; 4OGQ B; 3DTU B; 1PL0 A; 3LDE A; 3SPG A; 4PD4 F; 4K8Z A; 1VEW A; 3SYP A; 5EYP A; 5KUK A; 4JYY A; 1AP5 A; 1DF4 A; 3ABL C; 3BHP A; 2YC0 A; 1BGY H; 1VAR A; 2ZXW B; 3K06 A; 1K73 W; 4EFB A; 2BOB C; 3AG2 B; 3ABK C; 1NR7 A; 5LGU A; 2JS3 A; 5B1N A; 1UFI A; 3JAL A; 1GK9 A; 3ICX A; 4MS2 A; 4QPJ A; 3TXQ A; 1UJW B; 2GTA A; 4LH6 A; 2ODM A; 2HVK C; 4FZ0 A; 5LL6 Y; 3LSS A; 3IC7 A; 3P3P A; 1S5J A; 2XT9 A; 3RYI B; 3ABM C; 1MSD A; 4EB6 A; 4DYL A; 4BWA A; 1THZ A; 4JTD B; 4YIP A; 1BHB A; 1SS3 A; 2B9Z A; 1FS0 G; 5FNV A; 1M57 B; 1SA0 B; 4PA4 A; 1YZB A; 4JI1 B; 1R6K A; 1N0N A; 2Y69 C; 3CB2 A; 3LUT B; 1GO3 F; 5L3E A; 1EN5 A; 4PJ0 Z; 4MTO A; 2JK5 C; 4QE9 A; 3APO A; 2X7R B; 1JJO A; 3VBB A; 3JD0 A; 2LW1 A; 4KHP B; 3L70 H; 5LMN B; 5LMU O; 1FAF A; 4FM2 A; 4CH3 A; 1VQ6 V; 3RFR A; 2JEU A; 1XHX A; 2A9H A; 4B3S B; 4JI3 O; 1Q6I A; 3ABT A; 4FLT A; 2QE7 G; 5CA0 B; 2EIJ B; 4GKJ O; 4CC5 A; 1OCC B; 1IBL B; 4H33 A; 3OTO O; 3QO8 A; 5IJ9 B; 2B1I A; 3CC7 V; 1YJ9 V; 2QGN A; 3FB6 C; 5EK0 A; 1VQ5 V; 2EUL A; 2Z3Y A; 4W4L A; 3ZBH A; 1VF5 B; 1XMQ B; 1EN4 A; 4J9Y B; 4OPA A; 2Q8V A; 4FFB B; 4CS4 A; 5K1X A; 5E1A C; 3T1Y B; 3RYI A; 3K0D A; 2HVJ C; 4UCV A; 2UXX A; 3SJQ C; 4X1I B; 2PYJ A; 4PDR A; 1MSW D; 3W7X A; 3OMI B; 4LF7 O; 5B3S B; 1GTO A; 1J5E O; 1IBK O; 2DMX A; 4DV2 B; 5KMG B; 2FML A; 2EIK C; 1HNX O; 3HKD A; 3HR0 A; 4GX2 A; 3PJS K; 2XAH A; 1QCE A; 3L73 H; 3BPZ A; 2VQE B; 4GX5 A; 3A0B Z; 3OR6 C; 3M8A A; 2JVD A; 2EJR A; 1GAX A; 5IJ0 A; 3ZRW B; 2WPD G; 1J95 A; 2Y4U A; 2HP8 A; 1L1F A; 1NTM H; 1H2M A; 2IU0 A; 1VIB A; 5IDJ A; 4MVU A; 2AGA A; 2RCV A; 4DR3 B; 4LFB O; 4LP8 A; 5IY5 B; 4YJ2 A; 3ZED A; 5BZB A; 1KKC A; 3QO5 A; 4JI0 O; 1ZSP A; 4N21 A; 1KQS U; 1Y74 B; 4IIJ B; 3G6E V; 2VQF O; 2QM8 A; 3TK1 A; 4P30 A; 5KHJ A; 4ZBM A; 3W7U A; 4H44 B; 2ATK C; 1KU9 A; 1S5H C; 3A0H Z; 5CN0 A; 1D5N A; 5GON B; 2EIM C; 5H6R A; 4DR7 O; 5D5Q A; 3OM3 B; 3L74 H; 4JYB A; 2XHB A; 2ZNI A; 1A32 A; 3TGU H; 4MTF A; 5IYC O; 4QNH B; 1V54 B; 2W0F C; 4R6Z A; 2P4V A; 3JAR A; 4ICG A; 1M90 W; 5KA6 A; 1NJI W; 1CEZ A; 3JAW A; 5LGN A; 4DRX A; 3CME V; 1WP7 A; 2Q0O C; 1ENV A; 2A79 B; 2NN4 A; 1MOF A; 2QTO A; 4IYH A; 5EZY B; 4AHC A; 4DV1 O; 4MVQ A; 5IE9 A; 1JVM A; 2YIB D; 2KKW A; 1Q90 D; 4PA7 A; 4UCR A; 4DR5 O; 5KMG A; 1SF9 A; 2ZIM A; 1FXH A; 2Q7G A; 3H9V A; 3P32 A; 2BSK B; 2PI5 A; 1RPO A; 3SYA A; 1Y6X A; 2QM4 A; 1I94 B; 1NVP D; 3LNN A; 4ABM A; 4ASU G; 1GMG A; 2YXL A; 1W2B U; 4JZG A; 4DR1 O; 3ZRW A; 1N36 B; 2ZXW C; 4ZKI A; 3MD0 A; 3CCS V; 3AG2 C; 3CCR V; 5C93 A; 3KG2 A; 2PYL A; 2YDE A; 5L3C A; 2Q6A A; 5LA6 A; 3TCU A; 1OCR B; 1K9M W; 2LJ2 A; 1QVG U; 5LP6 A; 1LNQ A; 1AVM A; 1L0N H; 3C3T A; 1SES A; 1WN7 A; 2LFR A; 3HKC B; 1R3I C; 3C3S A; 1VP7 A; 4X65 O; 1JJ2 U; 1Q86 W; 2JRI A; 1RSO B; 4B7E A; 4PI2 A; 3RBZ A; 1KP2 A; 3HKE B; 1EZJ A; 3S3X A; 5GON A; 4LBE C; 4MVS A; 2RMK B; 3CHX A; 4DV3 O; 2JJ1 G; 2Q0A A; 4QGP A; 1SZT A; 4CH4 A; 1H2L A; 3BRC A; 5KHH A; 2QM7 A; 3DSQ A; 2GBO A; 1N8R W; 2UXD B; 3SPJ A; 1WA8 B; 5B1B C; 1PL4 A; 3JCU Z; 4X1K A; 4TV8 B; 4FJC C; 2R70 A; 4B3R O; 3T1Y O; 1NS1 A; 4CH6 A; 4NXM O; 4FZ1 A; 4UB8 Z; 1M5I A; 3G80 A; 1AI4 A; 2DYR C; 3QO7 A; 1E1R G; 3K3W A; 4KFM A; 3UM7 A; 1MZE A; 3KCY A; 2PTM A; 2R72 A; 1ZX3 A; 3RYH A; 1YJN V; 2EIJ C; 4BW9 A; 3CCL V; 1OCC C; 2GHY A; 2ZIO A; 1XBL A; 4LFA O; 1Y66 A; 4J42 A; 4BR6 A; 4LF4 O; 5TIS Z; 4JYC A; 4RO2 A; 4F6E A; 3GWO A; 5HFM A; 4OX9 O; 3UCS C; 5JCO C; 4HYO A; 1US6 A; 2A0L A; 4J10 A; 1VQM V; 4GX1 A; 2P22 C; 1YDX A; 1ZL8 B; 4DK0 A; 3GVM A; 3HKE A; 4UCU A; 2IJJ A; 2WLN A; 5B3S C; 4K35 A; 1F51 A; 2WLM A; 5KHI A; 1SRY A; 3EHB B; 1VF6 A; 1HNW B; 3L71 H; 5CA1 B; 1QU7 A; 4G28 B; 4DUY O; 2CDY A; 3LSU A; 3OFN G; 4JTC B; 1URF A; 1WA8 A; 2CE4 A; 1XEQ A; 2X6C A; 1G6U A; 1XL6 A; 1AJQ A; 1ARO P; 1M93 A; 1FXK B; 2NR5 A; 4TV8 A; 4JI8 O; 2P7T C; 3JD1 A; 5L3G A; 2LQT A; 4JF3 A; 4LH7 A; 1B06 A; 1EBO A; 3BY6 A; 1V55 B; 1YTF D; 2LGW A; 1Q82 W; 2DJV A; 1HW7 A; 5IY5 C; 4JYA O; 1VMG A; 2IH3 C; 1Q8I A; 2AZ2 A; 5LMU B; 3MAQ A; 2Q5Z A; 3FAV B; 3JCZ A; 1WLE A; 2MW2 B; 4JI3 B; 3JAM N; 1GN2 A; 1IX9 A; 5EC2 C; 2NNU A; 1LR1 A; 4OXS A; 4GKJ B; 4EFE A; 1QR9 A; 1SQB H; 4LF5 O; 5BXZ A; 2V4D A; 4P2Z A; 3OTO B; 3CEI A; 4OPH A; 1OCO B; 2UXN A; 5EYP B; 3ASN B; 1XHZ A; 3ZMS A; 3ZMU A; 4KXR A; 3ETD A; 1NTK H; 3RWR D; 3E8F A; 2EJ7 A; 2F23 A; 4DR6 O; 1ZL8 A; 3FYE B; 4KP4 A; 1NTZ H; 3K9A A; 4DV5 O; 2HEP A; 1NH2 B; 1B6Q A; 3A0R A; 2Z5U A; 4F4L A; 1AI7 A; 5L3D A; 4FPP A; 3NXS A; 1P4R A; 2CUG A; 3CC2 V; 4LF7 B; 5DEC A; 3W7S A; 1SQV H; 5DN6 G; 1IBK B; 2P6J A; 4EB6 B; 4DV6 O; 1LUV A; 1PP9 H; 1FXK A; 4D6T H; 1HNX B; 1K34 A; 1G1X B; 2L35 A; 4X88 A; 5FNV B; 2Q4P A; 3AG4 B; 4BAY A; 1FPO A; 4UV9 A; 3ZHU A; 3I55 V; 1TUB B; 2RJZ A; 1OCR C; 1SET A; 1F4M A; 4JAV A; 2LO1 A; 3TET A; 4JI6 O; 3CP1 A; 2D3O W; 3HKB A; 2N04 A; 2FTK A; 3D36 A; 5IT9 N; 3O9O A; 4DV7 B; 1G4Y B; 4LFB B; 4MT8 A; 2YSU B; 2CGN A; 3R66 A; 2Z0A A; 4JI0 B; 1PNK A; 4PDV A; 5LXT A; 2JJ2 G; 2YUA A; 2VQF B; 1VF7 A; 1P7G A; 1NZ6 A; 5A9G A; 1QBZ A; 2JGU A; 3DXR B; 2LGQ A; 4R50 A; 3S3W A; 2HJD A; 5B66 Z; 2XAJ A; 3SJA C; 4DR7 B; 4LCU C; 2YID A; 1VQN V; 1K92 A; 2Q7E A; 1Y4M A; 1QLE C; 4NKG B; 4UUJ C; 2IJI A; 2Q67 A; 3FYI B; 1TAE A; 2W0X A; 1R6N A; 2H94 A; 4O4I A; 4AIL C; 3SYC A; 2ZNJ A; 3ZHT A; 2K9P A; 2DQ3 A; 4HNA A; 4MVR A; 3AG3 B; 4UCS A; 2ZE8 A; 2QEX V; 4RQE A; 4DV1 B; 2ADQ B; 1HNW O; 4GYC B; 3ABU A; 1QVF U; 4J9Z B; 2XUM A; 2E75 B; 4DR5 B; 1NQT A; 1N32 O; 4D7S A; 4I4T A; 4HAM A; 2ZE6 A; 4JV5 O; 5JJN B; 3E22 A; 3E8B A; 3HKD B; 3NR7 A; 1BMF G; 2B1G A; 1TUB A; 1I5Y A; 3BA8 A; 3IGA C; 4DR1 B; 2QJ1 A; 5GTH Z; 4X66 O; 2CK3 G; 4FM1 A; 3CCE V; 3ASO B; 3UKM A; 1SQF A; 3HB3 B; 5KHK A; 4TSF G; 2EX3 A; 3OE7 G; 3OGC C; 3H1J H; 2KG7 B; 4BIO A; 2AW9 A; 5IJ0 B; 3IFX A; 4FLZ A; 5IYZ A; 1K4D C; 4DXW A; 1VQP V; 3E8H A; 4O4L A; 4NR1 A; 2XAQ A; 1HNZ O; 4LWS B; 4JZ2 A; 3EFF K; 3B09 A; 4YJ2 B; 5LYJ B; 1S3J A; 2QKC A; 4X65 B; 1JOY A; 3DXR A; 1PPJ H; 1N33 O; 3N2G B; 1XOU A; 1HR0 B; 4ZIB A; 1ZTE A; 2OCC C; 2EBO A; 4X62 O; 3THO A; 4DV3 B; 4X1Y B; 1BQZ A; 3BA9 A; 5DM6 V; 1VQ7 V; 1XI1 A; 3QVN A; 1V55 C; 5LHH A; 4TT3 G; 2WAM A; 3WB1 A; 4XDL A; 3JAR B; 4O4H B; 3JAW B; 4B3R B; 2BTO A; 4I50 B; 1JQ0 A; 3ZHS A; 1MZF A; 1AP6 A; 2FYU H; 4DRX B; 5LBQ A; 4NXM B; 3UO2 A; 1DK1 A; 4J7J A; 2A3Q A; 2UUA O; 2HLD G; 5JJE B; 3K58 A; 1WJZ A; 1Q7Y W; 5CMU A; 4NVP A; 1CXZ B; 4TWK A; 5FPO A; 5CA3 A; 2WLL A; 4YIO A; 4LFA B; 4LF4 B; 3L72 H; 1K8A W; 1ZLZ A; 2Y48 A; 4CZZ A; 3FFQ A; 4I55 B; 2EIN C; 5L3B A; 2KG7 A; 1F23 A; 5B5E Z; 2ADP A; 3I56 V; 1S5L Z; 4OX9 B; 3AG1 B; 3X2Q B; 4DV7 O; 3GB7 C; 4LWS A; 5J2T A; 5LA6 B; 2ZR2 A; 1RM1 B; 5LYJ A; 5A2Q N; 3FD9 A; 2E76 B; 3QNE A; 1WNS A; 1FJG O; 5LP6 B; 4BIZ A; 1S76 D; 3N2G A; 2OIE A; 1DGS A; 2LP7 A; 5CBH A; 4JTA B; 5JH7 B; 5KAF Z; 1U96 A; 4UCO A; 1FKA O; 1TVK A; 2CH7 A; 2EIL C; 4X1Y A; 2FKX A; 4DUY B; 2ZKO A; 3UT5 A; 2F4V O; 2OTL V; 3AG4 C; 1G8M A; 2XAG A; 3D8C A; 4DV4 O; 3RYF B; 4CS3 A; 4TV9 A; 3M7M X; 5LGT A; 2DYS B; 1SQQ H; 4O4H A; 5BY1 A; 4JI8 B; 4I50 A; 2FL4 A; 4UXN A; 2HR3 A; 3B8M A; 3MDS A; 3OD4 A; 5B1A C; 3SPI A; 5H2F Z; 2QWO B; 1BT8 A; 4X1K B; 3BAA A; 4G2K A; 1KYO F; 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2QKS A; 4JI5 O; 3F7V C; 2ZE7 A; 1B3Q A; 3CSX A; 1VQ8 V; 1KBH A; 2QWN B; 2VWK A; 5B1O A; 1FFX B; 3CCV V; 5IWA O; 1UPG A; 1RPR A; 4WFA V; 3STL C; 2UXB O; 2HG5 C; 1COW G; 2E5L O; 1IXB A; 1NU1 H; 1KP3 A; 3FB7 C; 4U3J A; 5D5P A; 2ITD C; 4FFK A; 1N34 B; 1ORQ C; 3CWB H; 1GM8 A; 2DN9 A; 2HHH O; 1Y76 A; 3B4S A; 4X20 A; 2LW7 A; 2QWR B; 3SYO A; 5LHI A; 1QNM A; 3VOU A; 3CRM A; 2BTQ A; 3JAS B; 1FD9 A; 1FYJ A; 2KQX A; 2YEV A; 4YJ3 B; 3G4S V; 1N32 B; 1R3L C; 4YY3 O; 3OMA B; 4FK5 C; 1BE3 H; 3T1H B; 2NLJ C; 2UUB B; 4X64 O; 3K5M A; 3K08 A; 4JV5 B; 3CX5 F; 5LOV A; 2JGD B; 3RYC A; 1R1B A; 1CP9 A; 4JAS A; 1EFR G; 4U7N A; 1O9G A; 4B3M O; 1PNM A; 4X66 B; 3OMN B; 4DUZ O; 5EBM C; 2P67 A; 4J80 A; 5ITZ A; 3ZN0 A; 4MTX A; 3CRQ A; 2CTQ A; 1R73 A; 4L8J A; 4TOI A; 1JX9 A; 4WBN B; 4TUY A; 5LP6 C; 4Z1V A; 2IJK A; 4AI8 A; 4Q6G A; 1M9N A; 3HKB B; 3UO3 A; 1I0H A; 4XDK A; 1HNZ B; 1FFX A; 4PDL A; 2Q7H A; 4H0L B; 4YHH O; 1SQX H; 1JFF B; 1KB9 F; 1NT2 B; 3BFR A; 2UXC O; 1K3E A; 5LXT B; 1N33 B; 1PD3 A; 3L9D A; 4TQD A; 3GWK C; 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