The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
AKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Ubiquitin
|
| publication title |
Distinct Ubiquitin Binding Modes Exhibited by SH3 Domains: Molecular Determinants and Functional Implications.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-09-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2BTT A; 1WFW A; 2EKH A; 4JJC A; 3NHN A; 1PKT A; 2A28 A; 1KSW A; 4RUG A; 2BZX A; 5FW9 A; 4RTZ A; 2K7A A; 2X3X D; 4OMM A; 2DBM A; 1W70 A; 2EGA A; 2JM8 A; 2EGE A; 2V1Q A; 2EQI A; 3SEM A; 2DE0 X; 4RTX A; 2CUB A; 3LH5 A; 5GJV B; 4J9I A; 1ZUU A; 1YWO A; 1ZUY A; 3M0T A; 1JEG A; 4EIK A; 2RQR A; 1VA7 A; 1M27 C; 3M0P A; 1RLQ C; 2AZS A; 2J05 A; 4AFQ C; 1WLP B; 4ORZ A; 4OMP A; 5IHI A; 3VRY A; 2KRO A; 2OI3 A; 3TVT A; 4KRT A; 1M3C A; 3VS2 A; 2CUD A; 2DIL A; 3H0I A; 3UAT A; 2A08 A; 4LE9 A; 2OJ2 A; 1B07 A; 4E6R A; 2EGC A; 2LZ6 B; 4DEX A; 1G83 A; 4DEY A; 1G2B A; 1SHG A; 1YWP A; 1M30 A; 2MCN A; 2KT1 A; 2KYM A; 2KNB B; 1QLY A; 2DLP A; 1FYN A; 2GBQ A; 1FMK A; 3EG0 A; 2A37 A; 1AEY A; 1HD3 A; 1UGV A; 5I22 A; 4J9D A; 1NLO C; 3RNJ A; 1OV3 A; 1SEM A; 1PRL C; 1WYX A; 1NEB A; 3A98 A; 2DL4 A; 3VS1 A; 1AWJ A; 2M51 A; 2X3W D; 2FPD A; 2ABL A; 2K79 A; 2RQV A; 3M0S A; 2NUZ A; 2GGR A; 2ED0 A; 1PNJ A; 3PVQ A; 1MV3 A; 3NMZ C; 2RN8 A; 2SRC A; 4Z8A A; 1U06 A; 2DF6 A; 4RTU A; 3PE0 A; 4AFU C; 4K11 A; 4ESR A; 4RTY A; 2K2M A; 2DRK A; 1SSH A; 2A36 A; 2L2P A; 1SRL A; 4HXJ A; 1AWO A; 2M0Y A; 1M3B A; 3TSW A; 1ZLM A; 4HCK A; 1NLP C; 1ZUK A; 3VS4 A; 4AG2 C; 1UJY A; 1LCK A; 1JO8 A; 2ECZ A; 2H8H A; 1B3Q A; 4F16 A; 3EG3 A; 4IIM A; 3EGU A; 1SHF A; 1X6B A; 2L3S A; 2DL5 A; 1YCS B; 1ZSG A; 4AG1 C; 4Z89 A; 1UE9 A; 3M0Q A; 2GQI A; 4IIO A; 2F2X A; 2C0T A; 2FEI A; 2LNH B; 3THK A; 4JZ3 A; 1UJ0 A; 1TUD A; 1XOV A; 1MV0 B; 2CSI A; 2AK5 A; 2O2O A; 1T0H A; 2LMJ A; 2QDL A; 3EHR A; 1S1N A; 3VS7 A; 1H8K A; 1HSQ A; 2MIO A; 1QWE A; 2O31 A; 3NGP A; 1UG1 A; 3VS0 A; 2DA9 A; 2LX7 A; 1GL5 A; 2DBK A; 2EYW A; 3UF4 A; 1GFC A; 1JQQ A; 5ECA A; 2DL3 A; 2DRM A; 1CKB A; 2ED1 A; 1J3T A; 2GTJ A; 2K9G A; 2EW3 A; 1CSK A; 4LUD A; 5IXB A; 1AOJ A; 2FPE A; 2YT6 A; 4CC7 A; 2KXD A; 2J06 A; 1X2Q A; 2EBP A; 4HVU A; 2L3Q A; 1ZBJ A; 2J6F A; 1VYV A; 2LJ1 A; 2AKK A; 2J7I A; 1SPK A; 1TUC A; 3ULR B; 5IH2 A; 2DL8 A; 1RLP C; 2L3P A; 3I5R A; 5IHN A; 2E5K A; 3FJ5 A; 4JPB W; 4J9H A; 1UTI A; 2LQW A; 4JJB A; 2RPN A; 2JS2 A; 2IIM A; 2F2W A; 1I07 A; 1UEC A; 1K4U S; 2DL7 A; 3UA6 A; 1AWW A; 2KR3 A; 1E6H A; 2RNA A; 3C0C A; 4RTV A; 2JW4 A; 2LJ3 A; 1BK2 A; 2RMO A; 1H3H A; 3H0F A; 1GCQ C; 1T0J A; 2XMF A; 1VYT A; 2ROL A; 2FRW A; 1KFZ A; 1X43 A; 1JU5 C; 3EG2 A; 2V1R A; 2YUP A; 3O5Z A; 2ENM A; 2FRY A; 1PWT A; 2W0Z A; 2GNC A; 2HBW A; 1A0N B; 2CH4 W; 4Y92 A; 2LCS A; 1VYU A; 3M0U A; 1JXO A; 1T3L A; 4J9B A; 1GRI A; 4JZ4 A; 2KXC A; 2J6O A; 4R0K A; 3REA B; 5IHK A; 2KGT A; 2C0O A; 2DX1 A; 2EYX A; 4CC4 B; 2KE9 A; 3REB B; 1AZE A; 2FO0 A; 2YDL A; 2EPD A; 1KIK A; 4JJD A; 2AKL A; 4LUE A; 1M3A A; 1M8M A; 4CC3 A; 4ZNX A; 2YUN A; 4QT7 A; 1Z9Q A; 3VS3 A; 2MOX A; 1UHC A; 2KYB A; 3H0H A; 2FG0 A; 2KEA A; 1OPK A; 2VVK A; 2PTK A; 1QKX A; 2KRS A; 3PVL A; 1BU1 A; 2JXB A; 1OPL A; 2SEM A; 4HVW A; 2PZ1 A; 4J9E A; 2RQW A; 1X6G A; 1OOT A; 4HVV A; 5FWC A; 1AWX A; 2EYZ A; 3QWX X; 1PKS A; 3RBB B; 2D0N A; 2G6F X; 1Y0M A; 4AFS C; 2NWM A; 2D8H A; 1W6X A; 1SRM A; 2KRN A; 1WXB A; 2CH4 A; 1AVZ C; 1V1C A; 2RF0 A; 2W10 A; 4LN2 A; 1QWF A; 4OMN A; 1AD5 A; 1GCP A; 2ESW A; 1QCF A; 1IO6 A; 2O88 A; 1GBQ A; 3U23 A; 5I11 A; 1W1F A; 4M4Z A; 1NG2 A; 4FSS A; 1WDX A; 2LJ0 A; 4RTT A; 1K0X A; 2GTO A; 1X27 A; 1EFN A; 2D8J A; 2O9V A; 1RI9 A; 2C0I A; 1GBR A; 1H92 A; 4WCI A; 3I35 A; 2RQU A; 2DNU A; 2YUO A; 5HCK A; 4F14 A; 1ARK A; 4LNP A; 4D8D A; 2K3B A; 4D8K A; 2HSP A; 2F2V A; 1BBZ A; 1K1Z A; 2LQN A; 2CT4 A; 4OMO A; 1E6G A; 1ZX6 A; 3SHW A; 2EVR A; 3QWY A; 3UA7 A; 1PHT A; 2P4R A; 1WI7 A; 1X2K A; 2JMA A; 4J9C A; 1NYF A; 2KT8 A; 3VS6 A; 1WXT A; 4RTW A; 2K6D A; 3VRZ A; 1YP5 A; 2JM9 A; 4GLM A; 4J9G A; 1K0S A; 1RUW A; 2PNI A; 1U3O A; 4OML A; 1KJW A; 4F17 A; 3H41 A; 1AZG B; 1OEB A; 1NYG A; 3KFV A; 2ROT A; 1UFF A; 1ABQ A; 1WIE A; 2FPF A; 2I0N A; 1N5Z A; 3GBQ A; 2DVJ A; 2CSQ A; 4AFZ C; 1NEG A; 1U5S A; 3ZL7 C; 1T3S A; 2HDA A; 1I1J A; 2HCK A; 1K9A A; 4Z88 A; 5L23 A; 5IXF A; 4A63 B; 2VWF A; 2CDT A; 2J6K A; 2L0A A; 4CC2 A; 1E7O A; 1TG0 A; 1YN8 A; 1GCQ A; 1WX6 A; 1ABO A; 1I0C A; 1MUZ A; 2YUQ A; 2LP5 A; 4OMQ A; 1BB9 A; 2BZY A; 3EHQ A; 1UDL A; 2DMO A; 2HEQ A; 2B86 A; 1WXU A; 5GJW B; 2BZ8 A; 2YSQ A; 5EC7 A; 1HJD A; 4X1V A; 4GBQ A; 1Y57 A; 1YNZ A; 2CT3 A; 3JV3 A; 2D1X A; 3I9Q A; 2OAW A; 3NPF A; 3I5S A; 3VS5 A; 1Z9Z A; 2KRM A; 3R6N A; 1NM7 A; 1X69 A; 3M0R A; 3IQL A; 2DJQ A; 2JT4 A; 3EG1 A; 4J9F A; 1GFD A; 3TSZ A; 2JMC A; 2VKN A; 1UUE A; 2O9S A; 2RQT A; 1JXM A; 1UHF A; 2DM1 A; 2EYY A; 1CKA A; 1QKW A; 2DYB A; 1PRM C; 1WA7 A; 2CRE A; 3CQT A; 5FWB A; 2JTE A; 2KBT A; 2JS0 A; 2AZV A; 1K76 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OTL Q; 3CC2 Q; 2OX7 A; 1Q82 U; 4N0A C; 2A28 A; 3OY9 A; 1YHQ Q; 2BZX A; 1VQP T; 2QEX A; 3CCE T; 2BIV A; 5D6X A; 4OMM A; 1OZ2 A; 2VV5 A; 1KD1 C; 1M2V A; 2EGE A; 2LVM A; 3FLG A; 4ZGD B; 1I81 A; 2EJF A; 1ZUU A; 1W4S A; 4M7A C; 1YWO A; 4NL3 A; 3EFO B; 2X4X A; 3M0T A; 3OYA A; 3CCM T; 1VQK A; 2OTJ T; 1M27 C; 3TCJ A; 2AZS A; 3RMQ A; 3URG A; 2YLC A; 4VUB A; 4XTV A; 6AT1 B; 2MYS A; 1VQ6 Q; 4OMP A; 1QVF A; 4OMF B; 2OI3 A; 5GAN f; 1M2O A; 1WZO A; 4E7K A; 3VS2 A; 2DIL A; 2EAY A; 2A08 A; 1YIT T; 5KE3 A; 1YI2 A; 1B07 A; 1G83 A; 3CBO A; 1NPP A; 4DEY A; 3GOX A; 1SHG A; 5A0L A; 1YWP A; 1M30 A; 2O01 E; 2QAS A; 2KNB B; 1TWB A; 2DVE A; 5IN1 A; 2PQW A; 2GBQ A; 1FMK A; 4MDX A; 1LOJ A; 3EG0 A; 4E7L A; 4ZTJ A; 5I22 A; 4J9D A; 5GAN 7; 4FSX A; 1SKU B; 1OV3 A; 1WYX A; 2A0F B; 5EG2 A; 3VS1 A; 2P4T A; 1RAB B; 1HK9 A; 3CCM Q; 2DD5 A; 2OTJ Q; 2FZK B; 2RQV A; 2NUZ A; 2GGR A; 4C92 A; 3PVQ A; 4OGE A; 1RAE B; 4IUP A; 4M77 C; 4EMH A; 3CC7 A; 2GFU A; 2E70 A; 2K2M A; 2DRK A; 2XK0 A; 1RAH B; 4HXJ A; 4JRK A; 2EJ9 A; 2M0Y A; 2KK4 A; 3A5Z B; 1QP3 A; 2I2L A; 3TSW A; 3RES A; 1D3B B; 1ZUK A; 3VS4 A; 2WSE E; 5KYU B; 1JO8 A; 2ECZ A; 5GMK i; 4FM4 B; 4BUG A; 1B3Q A; 3LYI A; 3EG3 A; 4IIM A; 1K9M C; 1X6B A; 4M7A D; 4XU1 A; 1ZSG A; 1UE9 A; 1QVG A; 1KD1 U; 3THK A; 1XOV A; 1MMG A; 1MV0 B; 5KYY B; 5CKB A; 3VS7 A; 4PFP A; 2MIO A; 5KYX A; 4DBR A; 4M7A E; 2DA9 A; 5LJ5 h; 1GL5 A; 2DBK A; 3J7A F; 1M8V A; 4RMO A; 2DRM A; 3JCM V; 2GTJ A; 2EW3 A; 3DB3 A; 3OYD A; 4JUV A; 3F70 A; 1VQ9 T; 2QQR A; 3CCL A; 2H3J A; 2KXD A; 3EG9 B; 3OS2 A; 1QMC A; 2J06 A; 2HKN A; 1ZBJ A; 2L3Q A; 2X9H A; 2RI3 A; 4FIB A; 3WVE B; 4Z02 A; 3OYH A; 5IH2 A; 2DL8 A; 3I5R A; 5GAO n; 4JPB W; 2V8I A; 3LX7 A; 1UTI A; 3PNW C; 4JJB A; 4C8Q F; 3QII A; 1VQL A; 2DL7 A; 5IT9 E; 2YRV A; 3UA6 A; 4BE1 A; 4BY6 B; 5KE2 A; 2RNA A; 3C0C A; 2LJ3 A; 1VIE A; 4M77 D; 2E3H A; 1VQO A; 5AYF A; 4M78 F; 3EGX A; 2ZGW A; 3HTR A; 5M9O A; 5FRM A; 1LVK A; 2CYZ B; 1KFZ A; 3HHT B; 3L2U A; 2JOY A; 1X43 A; 1XNI A; 2YUP A; 4J5Y A; 2LCC A; 3O5Z A; 1ZHI A; 2G3R A; 2FRY A; 2K5I A; 1PWT A; 1R0C B; 3JB9 H; 1VQK Q; 4M77 E; 5FRO A; 1A0N B; 2QGF B; 3NFC A; 3M57 A; 2QG9 B; 1BCM A; 4C0D B; 3ZBD A; 3ER0 A; 1JXO A; 2HL5 C; 2KXC A; 1M9S A; 2J6O A; 5FU7 C; 5GAO l; 3MEA A; 2C0O A; 2V8K A; 2E3I A; 4A4K A; 3CC4 A; 1Y71 A; 2KE9 A; 2E6Z A; 3OW2 P; 2LRQ A; 1AZE A; 2KI7 A; 1UEB A; 1KIK A; 3M4Y A; 4JJD A; 2AKL A; 4CC3 A; 2FYK A; 1ZSZ A; 5HK3 A; 4NOY A; 1K9M U; 3V8J A; 1PG5 B; 1Z9Q A; 2JTM A; 3HKS A; 5LJ3 j; 3JB9 D; 3H0H A; 2KEA A; 3CBM A; 1OPK A; 5GAM j; 5J39 A; 2CZ7 B; 2VVK A; 3OYE A; 4IUU A; 2X35 A; 3Q1J A; 1D09 B; 3JAM E; 1K73 R; 3GIB A; 1JBM A; 2SEM A; 4ZGE B; 4J9E A; 2EQJ A; 4QKU A; 2Y4X A; 3EH1 A; 1PKS A; 2D0N A; 2G6F X; 3OS5 A; 3VUB A; 4FYY B; 3HFO A; 1Q86 R; 4MML A; 1WQW A; 3MP6 A; 1RAA B; 1WXB A; 4IKF A; 1I5O B; 1QQJ A; 2EQK A; 3H8Z A; 3NTI A; 1PSF A; 4OMN A; 3G71 T; 2A3L A; 2ESW A; 3BFM A; 3RIR A; 3JCM e; 3H9N A; 2EKO A; 4KT0 E; 4C5H A; 5GMK j; 4KH0 B; 4PJL A; 3GNF B; 4XTU A; 4M7D B; 3CEY A; 1WHK A; 4WCI A; 3CCJ A; 2L8D A; 1VQ8 T; 1RI0 A; 2RQU A; 5GMK m; 2YUO A; 3E9G A; 1RL2 A; 3ME9 A; 2FZG B; 4LNP A; 2YLB A; 4D8D A; 2F2V A; 4P5N A; 3M9Q A; 2CP0 A; 1NPR A; 3CCV A; 1ZX6 A; 2EVR A; 2QA4 T; 1I8F A; 1LNX A; 4TVR A; 3I56 T; 3S3O A; 3HFN A; 2KDS A; 3VS6 A; 4BI4 A; 3L2R A; 3GPL A; 3BE3 A; 2RA2 A; 1D0Z A; 3VRZ A; 2JM9 A; 2PU9 B; 3CPF A; 2Z0W A; 3MEU A; 3JCM c; 1KJW A; 2K2V A; 3H41 A; 1WIE A; 2FPF A; 4M7D G; 2I0N A; 3M59 A; 1ZBX A; 4C92 G; 1VQ5 A; 3QJY A; 4RCB A; 3CCS A; 1D1C A; 1G3Y A; 1VQ8 Q; 3RUX A; 2ZCF B; 1KC8 C; 4C0G A; 1I1J A; 4C0F A; 3EFO A; 3PFS A; 1TU0 B; 4XTZ A; 2OTL A; 3CBP A; 5KYW B; 3CC2 A; 1QVF S; 1VQL Q; 2CDT A; 1IHW A; 1YHQ A; 1YN8 A; 1MNE A; 2ZPI B; 1KC8 R; 4C8Q C; 4ZN3 A; 2YUQ A; 3C95 A; 1IGQ A; 2RJD A; 3RKW A; 4RG8 A; 1BB9 A; 2F5K A; 2DMO A; 3TRE A; 1RAI B; 2B86 A; 2RI5 A; 4KUL A; 4E7H A; 1I4K 1; 2YSQ A; 2WSC E; 2RK2 A; 5LJ5 e; 1AT1 B; 1K8A R; 3D7S B; 3EH2 A; 2OAW A; 3I9Q A; 4M78 C; 2KMT A; 1BI0 A; 1B7T A; 4IUT A; 3VS5 A; 1Z9Z A; 1BIB A; 3M0R A; 1VQ6 A; 2DJQ A; 4J9F A; 1GFD A; 1YJ9 T; 2JMC A; 2O9S A; 3L2W A; 1R8O B; 4JRI A; 2RJC A; 1C1A A; 4R56 A; 3VYH B; 2NUT B; 4LDW A; 3NTK A; 1QKW A; 1PRM C; 2O4X B; 1IHV A; 3AHU A; 3X24 B; 1K76 A; 3AT1 B; 1PKT A; 3FJP A; 3QHS A; 4RUG A; 5FW9 A; 4DQ2 A; 4RTZ A; 2K7A A; 2YHT A; 2EQI A; 1Q81 R; 3ZEH A; 3I55 T; 2DE0 X; 1WPY A; 3LH5 A; 2JN0 A; 1ZUY A; 4XQ3 A; 3CCM A; 2OTJ A; 1JEG A; 4BAC A; 3M0P A; 3T9N A; 1RLQ C; 1D3B A; 1Q82 R; 3P8H A; 1H3Z A; 5KYU A; 4JRQ A; 4ORZ A; 3A8M B; 1YJ9 Q; 1QVG S; 3VKI A; 3VRY A; 3SWN B; 5IAY A; 3TVT A; 1AHJ B; 2RK1 A; 4RCC A; 5GAO q; 1M3C A; 2P0K A; 2CP5 A; 3J80 E; 2EQU A; 2CUD A; 1YIT A; 2OJ2 A; 4Y28 E; 1KC8 U; 2K5F A; 2PUK B; 5KYY A; 2YXY A; 1PSE A; 3E19 A; 2KQW A; 2KYM A; 3QYG B; 1QLY A; 3KXT A; 3P8D A; 1QVF P; 2A37 A; 4OB1 B; 3I55 Q; 2LDM A; 1K8A U; 1PRL C; 3E9F A; 3ASK A; 1NEB A; 3DB4 A; 1WJS A; 2DL4 A; 4PLL A; 1VQN T; 2RHX A; 4ANJ A; 3QO3 A; 3EG9 A; 1R77 A; 1PM3 A; 1H64 1; 3A8L B; 3M0S A; 3MP1 A; 2HZY A; 4L59 A; 3EFS A; 3NMZ C; 2SRC A; 4Z8A A; 3C4S A; 1U06 A; 4IUQ A; 2DF6 A; 4E47 A; 3PE0 A; 4NS5 A; 1YIJ T; 3FDR A; 4AFU C; 1N9S A; 2XDB A; 2E64 A; 1SSH A; 2A36 A; 1ACM B; 5CKH A; 1AWO A; 1KHI A; 2VUB A; 4PJO B; 1NLP C; 3S6W A; 4EMK B; 2HMA A; 3V8K A; 3MP8 A; 1VQ5 Q; 1R0B G; 2H8H A; 2RJF A; 4EMG A; 2M0O A; 3CMA T; 1SHF A; 2L3S A; 4FYX B; 4DOV A; 5GAN j; 3M0Q A; 2FEI A; 4M7D F; 2LNH B; 4JZ3 A; 4KUD K; 2DPP B; 1KQS A; 1LJO A; 4C92 F; 2CSI A; 2IPO B; 1S1N A; 3NGP A; 3JSC A; 2GF7 A; 4O6J A; 3HRS A; 3JCM Q; 3UF4 A; 1EIF A; 4O5V A; 1TXQ A; 1CKB A; 4JS4 A; 4PJO G; 2K9G A; 1QVG P; 1CSK A; 2ZPG B; 1VQ9 A; 3MCA B; 3MHX A; 2YT6 A; 4OF1 A; 4PKC C; 4E7J A; 1KD1 R; 4X9D A; 1VYV A; 3UT1 A; 4A4G A; 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