The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
93
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structure length |
93
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Chain Sequence |
MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMSDEKTQLIEAFYNFDGDYDGFVSVEEFRGIIRDGLPMTEAEITEFFEAADPNNTGFIDYKAFAAMLYSVDES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| molecule keywords |
myosin light chain MlcB
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| publication title |
Structure of the small Dictyostelium discoideum myosin light chain MlcB provides insights into MyoB IQ motif recognition.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
10
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| structure length |
93
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| sequence length |
93
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-12-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Recoverin; domain 1 | EF-hand |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SBJ A; 4P5O E; 1KFX L; 4CPV A; 1A03 A; 4YI8 A; 2LVK A; 5ER4 X; 3TS5 B; 3VRQ A; 4HRE E; 2R2I A; 1KK7 Y; 3IQO A; 1F8H A; 5FYX A; 3TS5 C; 3CS1 A; 4MRX A; 4I5J A; 5AEQ A; 1DJY A; 3CR4 X; 2I7A A; 2BCA A; 3MSE B; 3PM8 A; 5CSN A; 2LVV A; 1SK6 D; 2KOT A; 2Y1N A; 1YRT B; 3RM1 A; 2WCB A; 1CKK A; 2GV5 A; 2M29 A; 2M3W A; 3PFV A; 2BKI B; 1XYD A; 1SNL A; 2LP2 A; 1FI6 A; 5AFP A; 2LLU A; 1SCM B; 2LMT A; 3TDU A; 1TTX A; 1XK4 C; 3WHT B; 3SG6 A; 4DUQ A; 1M31 A; 4HSZ A; 1WLM A; 1SCM C; 3LCP C; 5B8I B; 2NZ0 A; 5GQQ C; 1B4C A; 1AJ4 A; 1DT7 B; 3EK8 A; 2LVJ A; 2F3Z A; 1LA0 A; 1QX2 A; 3SG7 A; 1JBA A; 1PK0 D; 1BG1 A; 3BOW B; 2M0R A; 1RJV A; 1NCY A; 4E68 A; 4YI9 A; 1IKU A; 1MWN A; 1N2D A; 2K8M B; 4MZJ A; 1DMO A; 1CLM A; 1PSR A; 2BCX A; 3SIA A; 2EGD A; 1BT6 A; 2H61 A; 1S6J A; 1A4P A; 1MQ1 A; 3EKJ A; 3SIB A; 2MA2 A; 1D1O A; 1UHH A; 1TN4 A; 2KDH A; 3EK7 A; 1IJ5 A; 4ORA B; 1DGU A; 3GOF A; 1WRZ A; 1SCV A; 3CR2 A; 1J7Q A; 2QAC A; 2I94 A; 2I2R E; 3BXK A; 5HLO A; 1YRU B; 3VRR A; 1S5G Y; 1OSA A; 1YUR A; 1CB1 A; 1KQM B; 4CLN A; 4MVF A; 2PRU A; 1CM4 A; 2CTN A; 2JTZ A; 2LM5 A; 5CPV A; 3M0W A; 4U8D A; 1KQM C; 4ORB B; 4YGD B; 3VRO A; 1W7J B; 2FJU B; 2PSR A; 3IF7 A; 2OS8 B; 1BOC A; 4DS7 A; 3JVT B; 4GGF A; 1GGW A; 1LVC D; 1YUU A; 2OS8 C; 4USL A; 1NX1 A; 4L9M A; 3NSI A; 1KFX S; 3JVT C; 5DKR A; 2KBM A; 3OB2 B; 1DF0 A; 3I5I B; 4GBA A; 1AVS A; 1F4Q A; 1UWO A; 1CFF A; 1B7T Y; 3I5I C; 1EJ3 A; 2GGZ A; 2K7D A; 1E8A A; 3JTD B; 1TCO B; 3CR5 X; 1CM1 A; 3OB1 B; 5AXI A; 1F4O A; 1XFX O; 3JTD C; 3DF0 B; 2ZN9 A; 3SG2 A; 1NX2 A; 1NUB A; 3FWB A; 2BBM A; 4P2Y B; 3GK4 X; 3SG5 A; 3CLN A; 1QVI Z; 5HKY A; 2B1U A; 3LK1 A; 1J7O A; 2CT9 A; 1DJX A; 1KQV A; 1Y1A A; 2L2E A; 4PCW A; 1UUR A; 2MBX A; 1IRJ A; 2P6B B; 1WY9 A; 1Y1U A; 2F8P A; 2HET A; 1K9P A; 1G8I A; 1K96 A; 1MXE A; 1DTL A; 3PAL A; 2LAP A; 3KPX A; 3PN7 B; 4XJK B; 1C07 A; 2M49 B; 4CID A; 3CTN A; 2LVI A; 3PN7 C; 1A75 B; 1OMR A; 2F33 A; 2KQ6 A; 3GK1 A; 4JWQ A; 1YR5 A; 1U5I B; 1BR4 B; 4UPG A; 1Q80 A; 2O5G A; 4OR9 B; 1B1G A; 2AAO A; 3FIA A; 2K7B A; 2WCF A; 1CDL A; 1BOD A; 5HYD A; 3QRX A; 4PAL A; 3OHM B; 1XFU O; 1B47 A; 3DD4 A; 1TRF A; 1N65 A; 5I8N A; 1UP5 A; 4F0Z B; 2LMU A; 1OMD A; 2LHL A; 1DJH A; 1ZUZ A; 1AP4 A; 3NSK A; 1RFJ A; 2LUC A; 4PHM A; 1SKT A; 5KSZ A; 4N1G A; 4GNK B; 2WCE A; 3KO0 A; 1IWQ A; 1C7W A; 1OE9 B; 1Y0V H; 4PE7 A; 1OZS A; 2L5X B; 4JPZ B; 5KU1 A; 3LK0 A; 1NWD A; 1JF2 A; 2ZKM X; 1PAL A; 1B9A A; 4XYN A; 1M63 B; 2JU0 A; 3O78 A; 4OCI A; 1JFJ A; 5D69 A; 1DVI A; 2JNX A; 4YGC B; 2JXC A; 3C1V A; 3FWC A; 3BYA A; 1YUS A; 2E30 A; 3AKA A; 1YX8 A; 1K90 D; 1M45 A; 4FQO A; 4CFR A; 2NXQ A; 3ICB A; 1QAT A; 1KSM A; 4NDC A; 2NCO A; 5HLV A; 2CNP A; 1JUO A; 2G9B A; 1NP8 A; 3I5F B; 2K0J A; 3EVU A; 3O4Y A; 1DGV A; 3I5F C; 3LL8 B; 5J3X A; 1NSH A; 4OKH A; 1A29 A; 1CFC A; 3H4S E; 4AQI A; 3OX5 A; 1W7I B; 1IG5 A; 1QIW A; 1SL7 A; 4QJ5 B; 3PSR A; 5HKZ A; 1MF8 B; 1TNP A; 1B8L A; 2L4I A; 3EVV A; 1ZMZ A; 3OP0 A; 1YVH A; 2LP3 A; 1H8B A; 1WRL A; 1OZO A; 4N5X A; 1ALV A; 1PVB A; 2JC2 A; 5AAN A; 4YRU A; 1H4B A; 1QX5 B; 2JZI A; 2H61 C; 5D7F A; 2DOQ A; 1NX0 A; 1GQM A; 1UHI A; 4NDB A; 2KAV A; 1JWD A; 1YTZ C; 1FI5 A; 2K7O A; 4A4C A; 2LHI A; 5I2O A; 1AJ5 A; 1J7R A; 1LIN A; 2KI6 C; 2Y5I A; 2GGM A; 2EHB A; 2AUC A; 3D0Y A; 1NPQ A; 5IBW A; 4PE0 A; 1TIZ A; 2LUX A; 4M2Q A; 4MBE A; 4MRY A; 2LNK A; 4GPL B; 1F70 A; 5HKW A; 1NYA A; 2LCP A; 4NQG A; 2Y4Q A; 2KAX A; 3DVE A; 1DJZ A; 1S36 A; 2L98 A; 1K94 A; 3BUM B; 1CNP A; 2OPO A; 2HQ8 A; 2BE4 A; 1CDM A; 1CLL A; 1TNW A; 2BKH B; 4QJ3 B; 3VGO A; 1DJG A; 4CFQ A; 1DJI A; 1EG4 A; 1M39 A; 1IJ6 A; 4GGF C; 1KK8 B; 1AHR A; 3WHU B; 1QTX A; 1QLS A; 3WNX B; 5PAL A; 1CDP A; 1KK8 C; 1YX7 A; 2LLS A; 2KI6 D; 1J1D A; 1B8C A; 2MLF C; 3E3R A; 2BL0 B; 1EH2 A; 2JTT A; 2K2F A; 1CLB A; 2M9G A; 2JT8 A; 3TUY B; 3DVK A; 4PHK A; 2BL0 C; 3DF0 A; 1QS7 A; 1QJT A; 4YBH B; 1GJY A; 4A4B A; 3LLE A; 3TUY C; 4FTG A; 1IQ3 A; 1B7T Z; 2HF5 A; 2BE6 A; 2KAY A; 1S26 D; 3CGA A; 1OQP A; 4I5L B; 1F71 A; 1WLZ A; 3FS7 A; 2Q91 A; 1J55 A; 1SY9 A; 2M8U A; 2RGI A; 2BCB A; 2KGR A; 1ZOT B; 3RLZ A; 3VRP A; 1KWO B; 3AAJ A; 1PRW A; 2ISD A; 5JJG A; 2ZFD A; 1G4Y R; 1NCX A; 2KSP A; 3F45 A; 1L7Z A; 1KWO C; 1R2U A; 4PHN A; 1F54 A; 2CCM A; 4Q04 A; 1TCF A; 4XJK A; 1IH0 A; 2MRD A; 2I18 A; 2KYC A; 1A75 A; 4DCK A; 3SG4 A; 3TDI A; 3SG3 A; 2CXJ A; 2V53 A; 5CSF A; 1S6C A; 4BY5 A; 1WDC B; 3SJS A; 1L2O B; 3NXA A; 1SRA A; 1CMF A; 4NDD A; 2FCD A; 1WDC C; 4OV2 A; 5F6T A; 1L2O C; 1CFP A; 4WQ2 A; 1JF0 A; 1HQV A; 3PLF B; 1K93 D; 1K2H A; 1QAS A; 2KFG A; 2ZNE A; 3K21 A; 4PE1 A; 4HRG A; 1TOP A; 5BPJ A; 2H2K A; 1IQ5 A; 1J7P A; 2JUL A; 2PMY A; 1XFY O; 5TNC A; 1KFU L; 3D10 A; 2KQY A; 4YGB B; 4YGA A; 4M2P A; 1QXP A; 4GAO A; 2TN4 A; 4GFT A; 1ALW A; 1ZAC A; 3TZ1 A; 2JWW A; 1J1E A; 4I5K A; 2JRF A; 1SMG A; 2ZN8 A; 2MJW B; 1KK7 Z; 1QIV A; 2Q4U A; 2M1K B; 4DIR A; 1K9U A; 3KF9 A; 1XA5 A; 1XK4 A; 2LAN A; 2JNF A; 1CFD A; 2QPT A; 1EL4 A; 1FBV A; 3TDZ A; 1JC2 A; 1REC A; 1YUT A; 4AOM A; 1EXR A; 2JOJ A; 3BQ3 A; 1GGZ A; 3I5H B; 4OVN F; 1F55 A; 1MXL C; 1XFV O; 2ZND A; 2D8N A; 2KYF A; 4WQ3 A; 3EKH A; 4TNC A; 1CMG A; 1K95 A; 3I5H C; 1FW4 A; 4MEW A; 4R1E A; 1S1E A; 4ETO A; 2OTG B; 3DVM A; 2JPT A; 3BOW A; 5CSI A; 3VRN A; 1FF1 A; 2OTG C; 2NLN A; 2PAL A; 4YGE B; 3OX6 A; 4HRH A; 1DJW A; 1AK8 A; 4PE4 A; 1C7V A; 3IQQ A; 1A2X A; 1SYM A; 1QLK A; 3NSO A; 4GGN A; 2KHN A; 1TNX A; 2M7N A; 1UUS A; 1QV0 A; 3AAK A; 3O6B A; 1CTR A; 1UHN A; 1X02 A; 1UHJ A; 2ZRT A; 2COL B; 1SL8 A; 1OMV A; 3I5G B; 2L50 A; 2NCP A; 2JT0 A; 2ZRS A; 3HX4 A; 4MN0 A; 3I5G C; 5I2Q A; 1YVL A; 1V1G A; 2G2B A; 2M97 A; 2L51 A; 1AUI B; 1S3P A; 1HT9 A; 1LKJ A; 4M2O A; 3PAT A; 4JQ0 D; 1BF5 A; 2F2O A; 4MSP A; 2BEC A; 1KSO A; 2EC6 B; 4D1E A; 3ZWH A; 2LC5 A; 1RK9 A; 4GUK A; 1FPW A; 1PSB A; 2EC6 C; 2K7C A; 3D0Y B; 5DKQ A; 3NSL A; 1S5G Z; 3CZT X; 3BUN B; 5JOL A; 2KI4 B; 1G33 A; 2JT3 A; 2IS9 A; 2KI4 C; 1K8U A; 2AMI A; 1KFU S; 1DF0 B; 1EG3 A; 1N0Y A; 4I5N B; 3ZNI A; 1LA3 A; 4ORC B; 1UHK A; 1PUL A; 2LV7 A; 2WC8 A; 2WND A; 1NX3 A; 4ICB A; 2F3Y A; 1S6I A; 3GK2 A; 5CSJ A; 1QX7 A; 3CWG A; 1NCZ A; 1SW8 A; 1QVI Y; 5DKN A; 5G08 A; 2MLE C; 1JSA A; 2L0P A; 1SR6 B; 1MUX A; 1MHO A; 5ER5 A; 2BBN A; 2FOT A; 1BLQ A; 1Y1X A; 1B8R A; 3A4U B; 1IGV A; 1SR6 C; 1SPY A; 3EVR A; 4PDZ A; 2KNE A; 4N1F A; 2LLT A; 2KFF A; 2HPS A; 2A4J A; 3HCM A; 1MR8 A; 3AKB A; 1ODB A; 4C0L A; 1XFZ O; 2HQW A; 1SL9 A; 5KTY A; 2O60 A; 2Y1M A; 4WRI A; 2K2A A; 3O2P A; 2F2P A; 3A8R A; 1XO5 A; 4DRW A; 1XFW O; 2E6W A; 2FCE A; 1RRO A; 2KGB C; 4AQJ A; 2VRG A; 1K9K A; 2LE9 B; 3EK4 A; 1BJF A; 2JXL A; 1Y6W A; 2M7L A; 1KCY A; 1PVA A; 1CDN A; 2MHH A; 1BMO A; 2L4H A; 3DVJ A; 4BY4 A; 2M1U A; 1TNQ A; 1R6P A; 1U5I A; 4ZCU A; 1BR1 B; 2WOS A; 1M46 A; 2PAS A; 2LMV A; 4QJ4 B; 1JFK A; 3KHE A; 1RWY A; 2SAS A; 1VRK A; 2CBL A; 5I2L A; 5K89 A; 2WOR A; 1QV1 A; 3KEV A; 3BUX B; 4MLW A; 4MZL A; 4ZCV A; 1RTP 1; 3WXA A; 2K61 A; 4C0J A; 4C0K A; 1LXF C; 4PHJ A; 2KBI A; 1ZFS A; 3BUO B; 1XVJ A; 2JQ6 A; 3BUW B; 4IL1 A; 1OOJ A; 2MAZ A; 1V1F A; 1BU3 A; 1WRK A; 1NIW A; 2KFH A; 2PVB A; 2SCP A; 5AER A; 4MZK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SBJ A; 4P5O E; 1KFX L; 4CPV A; 1A03 A; 1Z2C B; 4YI8 A; 2LVK A; 5ER4 X; 3TS5 B; 3VRQ A; 4HRE E; 2R2I A; 1KK7 Y; 3IQO A; 1F8H A; 5FYX A; 3TS5 C; 3CS1 A; 4MRX A; 2WC6 A; 4I5J A; 5AEQ A; 1DJY A; 3CR4 X; 2I7A A; 2BCA A; 3MSE B; 3PM8 A; 5CSN A; 2LVV A; 1SK6 D; 2KOT A; 2Y1N A; 3O4X A; 1YRT B; 3RM1 A; 2WCB A; 1CKK A; 2GV5 A; 2M29 A; 2M3W A; 1T14 A; 2WCK A; 3PFV A; 2BKI B; 1XYD A; 1SNL A; 2LP2 A; 3S0F A; 5AFP A; 1FI6 A; 2LLU A; 1SCM B; 2LMT A; 3TDU A; 1TTX A; 1XK4 C; 3WHT B; 3L4L A; 3SG6 A; 4DUQ A; 1M31 A; 4HSZ A; 1WLM A; 1SCM C; 3LCP C; 5B8I B; 2NZ0 A; 5GQQ C; 1B4C A; 1AJ4 A; 1DT7 B; 3EK8 A; 2LVJ A; 2P71 A; 2F3Z A; 1LA0 A; 1QX2 A; 3BFA A; 3SG7 A; 1JBA A; 1PK0 D; 1BG1 A; 3BFB A; 3BOW B; 2M0R A; 1RJV A; 1NCY A; 1ORG A; 2QEO A; 4YI9 A; 4E68 A; 1IKU A; 5FI2 A; 3BJH A; 1MWN A; 1N2D A; 2K8M B; 4MZJ A; 1DMO A; 1CLM A; 1PSR A; 2BCX A; 3SIA A; 2EGD A; 1BT6 A; 2H61 A; 1F54 A; 4OZD A; 1S6J A; 1A4P A; 1MQ1 A; 2KLD A; 3CZ1 A; 3EKJ A; 3SIB A; 2MA2 A; 1D1O A; 1UHH A; 1TN4 A; 2KDH A; 2BAP A; 3EK7 A; 1IJ5 A; 4ORA B; 1DGU A; 3GOF A; 1WRZ A; 1SCV A; 3CR2 A; 1J7Q A; 2QAC A; 2I94 A; 3B86 A; 2I2R E; 3BXK A; 5HLO A; 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