2N9GA

Solution structure of the bromodomain of trypanosoma brucei bromodomain factor 2(bdf2)
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
MSKNERDTSFNKNGCLVFVSRLWDLDKLGMFHHPVSAEELPDYHTVIKRPVDLSSIRDGIEKGTYATDVDVQNDVARMITNALEYNAKGSTWYQEAMSFRKTYLDLARQSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Gene regulation
molecule keywords Putative uncharacterized protein
publication title Solution structure of the bromodomain of Trypanosoma brucei Bromodomain Factor 2(BDF2)
rcsb
source organism Trypanosoma brucei brucei treu927
total genus 26
structure length 111
sequence length 111
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2n9gA00
5FH7A 4BW2A 5CY9A 2YW5A 5EPRA 4QEVA 3UW9A 5A5SA 1JM4B 2KTBB 5FE3A 4YYMA 4BW1A 4HXMA 5HRWA 4A9MA 4QSXA 4CUSA 4LYIA 4YYGA 4NR7A 5ENEA 5D24A 5EA1A 5HELA 5F5ZA 5IBNA 5KTWA 4MEOA 2DVRA 4IOOA 4UIXA 5D3HA 2LSPB 5BT3A 4QSVA 5KU3A 1X0JA 4YADA 5HFRA 4Z93A 4TT6A 5DYXA 5D7XA 5FE1A 4QUTA 4OGJA 4QEWA 3QZSA 4HXNA 5CQ4A 5FB0A 4A9HA 5LJ2A 4QSSA 3DAIA 5EI4A 2DVSA 3HMEA 2L84A 4LYWA 4KCXA 4O7FA 5F63A 4UITA 4YYDA 5FH8A 3U5MA 4XY9A 5LVRA 4O70A 3Q2EA 4NYVA 4IR5A 2G4AA 5COIA 5E9KA 4QR5A 4QC1A 4QSUA 5EP7A 5C87A 4CUPA 4UYFB 4PCEA 5E74A 3JVLA 5I83A 5EM3A 4QEUA 5CQ6A 4DONA 3AQAA 4QSWA 3MUKA 5LJ0A 2R0SA 5DLZA 4UYGA 5ENBA 4ALGA 4Z1SA 4NR4A 4MEQA 4Z6IA 4O78A 5F36A 4QSQA 4HBVA 5CS8A 5CUBA 5C4QA 5D3RA 2H60A 4J0SA 4PKLA 2D9EA 4LZ2A 4A9FA 5IGLA 5H1UA 5A82A 4FLPA 5L8UA 4LDFA 5C85A 2YQDA 4QBMA 4TT4A 4NYWA 5ACYA 2DKWA 5EWCA 2GRCA 4TQNA 5H1TA 5FBXA 4O75A 5CQAA 4HXOA 5KTUA 5I7YA 2DATA 5A5QA 3JVJA 3U5OA 2YYNA 2OO1A 3UVYA 5DKHA 5II2A 2WP2A 4O7EA 4LZRA 4O7AA 5D3JA 5CQ7A 5DFCA 5CP5A 4A9EA 4PTBA 4HXKA 3LQJA 5FG4A 5CUAA 5F25A 4NUDA 3P1DA 3JVKA 4A9OA 2E7OA 4YY6A 5DYUA 5E73A 1WUGA 5EGUA 4OUFA 4HBWA 5DX4A 2R0VA 5A5OA 5EV9A 5LKZA 4HXSA 5CZGA 3MB3A 3P1CA 4HXRA 5E3GA 4UYDA 4Q0OA 5EVAA 3UV2A 4NRCA 4CLBA 4O7BA 5ENCA 3TLPA 5HCLA 5IGMA 4XYAA 4TS8A 4LYSA 5CUDA 5ENJA 4Q0NA 4NR5A 4O74A 5H85A 3D7CA 3U5PA 4ALHA 5FB1A 5F60A 4TU4A 4UYHA 2N9GA 4N4FA 5G4SA 5CUEA 4ZC9A 5C8GA 5EPBA 5I89A 5E3DA 5L99A 3I3JA 3LQIA 4WHWA 5FFYA 5F2PA 5DYCA 4N4HA 4YYJA 5DKDA 5EWHA 4NRBA 5D3NA 4LC2A 3U5NA 2RS9B 5FE5A 5I86A 3U5JA 5A81A 5DYAA 3NXBA 4A9JA 2RI7A 5EISA 3ZYUA 5FE9A 3S92A 5AD3A 5CRMA 2FSAA 2E3KA 5ETDA 5E9LA 4O72A 4QSPA 2OUOA 4QZSA 5ENGA 4KV1A 2L5EA 4KV4A 2DWWA 4YY4A 5D0CA 2D82A 4CUTA 4TZ8A 3UVWA 2YEKA 3GG3A 4QY4A 5CPEA 5AD2A 3S91A 3IU5A 5FFVA 4NR8A 4BHWA 5L8TA 4AKNA 3P1FA 4PY6A 5LVQA 4NYXA 2RNYA 4XUAA 5FFWA 4NUEA 5DFBA 5HRVA 5BT4A 5HRXA 5CQ3A 4Z6HA 4TZ2A 5J0DA 5F1HA 5L96A 4CUQA 4NS5A 4F3IA 5I40A 4GPJA 4UIUA 4C67A 4YH4A 5CFWA 3LXJA 4MR3A 2RFJA 4MEPA 3QZVA 5LUUA 5LKUA 4YBMA 4YYNA 1E6IA 5FE4A 5I80A 4X2IA 5F1LA 5TCMA 3SVGA 5A7CA 5D25A 5IGNA 5FG6A 5CQ8A 4Y03A 4O77A 4MENA 4YK0A 5FE7A 5C89A 4HBYA 4BW3A 3JVMA 5CRZA 2RNWA 5KO4A 5D3TA 5EK9A 3ONIA 4NQMA 4XY8A 5A5NA 4J0RA 3HMFA 2OSSA 3P5OA 5E0RA 5EWVA 5HEMA 5L98A 3UVXA 5I29A 4Z1QA 3U5LA 4A9IA 5DBMA 4YYIA 3FKMX 5I1QA 5I88A 4UYEA 5HLSA 4TT2A 5EQ1A 3MULA 4QSRA 5HM0A 4UIYA 4J1PA 4TU6A 1JSPB 4CUUA 4IR4A 4N4GA 5EWWA 4UIWA 5A85A 4N3WA 5EU1A 4YATA 5FE2A 3UV4A 3IU6A 3UV5A 4MR4A 5CGPA 4YYKA 5HENA 2YELA 5IGKA 4MR6A 1ZS5A 5LKXA 4OGIA 5FE6A 5G4RA 5LJ1A 4A9NA 5EPSA 4NUCA 5HQ7A 5CUCA 4UIVA 5JI8A 4NRAA 5IG6A 5E7DA 4CFLA 2RO1A 4ZQLA 5A5RA 5F61A 2NXBA 4QR3A 5AMEA 3MXFA 3P1EA 5CQ5A 5FG5A 4LZSA 4RVRA 4PCIA 3O33A 4HBXA 4QNSA 5HFQA 5E9IA 5ENFA 3HMHA 2RNXA 4YBTA 4PS5A 3RCWA 1F68A 1WUMA 4A9KA 4YC9A 4BW4A 4CL9A 4J3IA 3Q2FA 4YBSA 5DW2A 5DY7A 4WHUA 4HXPA 4O7CA 3SVFA 5DLXA 2I7KA 4TYLA 5CQTA 4QYDA 5AMFA 5IIDA 2YDWA 4WIVA 5I7XA 4NQNA 4NXJA 5E9MA 4E96A 3SVHA 2R0YA 4QUUA 1N72A 4UYFA 2MJVB 4YABA 2YEMA 4YH3A 4YAXA 3K2JA 5FE8A 5A83A 1EQFA 3O36A 4QYLA 5EWDA 4MR5A 5CTLA 5C7NA 4IOQA 3O35A 3QZTA 5D26A 2DVVA 2I8NA 5CUGA 5HQ6A 5KHMA 4TTEA 3LQHA 5E9VA 4C66A 5D3SA 4QB3A 5ENHA 4O76A 5JWMA 3MB4A 4IR6A 5HQ5A 5L97A 5F3AA 5H1VA 5LKTA 5DFDA 5TB6A 3G0LA 4A9LA 4HXLA 5ETBA 4LR6A 4CFKA 4ZW1A 3AADA 3DWYA 4NR9A 4UIZA 4BJXA 3O34A 5K29A 5ENIA 4IR3A 4CURA 4YYHA 3U5KA 5DKCA 4LRGA 5II1A 2R10A 2F6JA 2F6NA 5F62A 4NR6A 5E9YA 5BT5A 4QC3A 5D3LA 2DVQA 5HJCA 5FDZA 4N4IA 4XUBA 5DW1A 5D3PA 4O71A 2WP1A 2L85A 3O37A 5FE0A 4QSTA 4IORA 5A5PA 3MQMA 2E7NA 5FH6A 3UVDA 3G0JA 5EICA 3LJWA 5CU8A 4QR4A 5KTXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FH7A 4BW2A 5CY9A 2YW5A 5EPRA 4QEVA 3UW9A 5A5SA 1JM4B 2KTBB 5FE3A 4YYMA 4BW1A 4HXMA 5HRWA 4A9MA 4QSXA 4CUSA 4LYIA 4YYGA 4NR7A 5ENEA 5D24A 5EA1A 5HELA 5F5ZA 5IBNA 5KTWA 4MEOA 2DVRA 4IOOA 4UIXA 5D3HA 2LSPB 5BT3A 4QSVA 5KU3A 1X0JA 4YADA 5HFRA 4Z93A 4TT6A 5DYXA 5D7XA 5FE1A 4QUTA 4OGJA 4QEWA 3QZSA 4HXNA 5CQ4A 5FB0A 4A9HA 5LJ2A 4QSSA 3DAIA 3ERRA 5EI4A 2DVSA 3HMEA 2L84A 4LYWA 4KCXA 4O7FA 5F63A 4UITA 4YYDA 5FH8A 3U5MA 4XY9A 4AKIA 1PUOA 5LVRA 4O70A 3Q2EA 4NYVA 4IR5A 2G4AA 5COIA 5E9KA 4QR5A 4QC1A 4QSUA 5EP7A 5C87A 4CUPA 4UYFB 4PCEA 5E74A 3JVLA 5I83A 5EM3A 4QEUA 5CQ6A 4DONA 3AQAA 4QSWA 3MUKA 5LJ0A 3D1DA 2R0SA 5DLZA 4UYGA 5ENBA 4ALGA 4Z1SA 4NR4A 4MEQA 4Z6IA 4O78A 5F36A 4QSQA 4HBVA 5CS8A 5CUBA 5C4QA 5D3RA 2H60A 4J0SA 4PKLA 2D9EA 4LZ2A 4A9FA 5IGLA 5H1UA 5A82A 4FLPA 5L8UA 4LDFA 5C85A 2YQDA 4QBMA 4TT4A 4NYWA 5ACYA 2DKWA 5EWCA 2GRCA 4TQNA 5H1TA 5FBXA 4O75A 5CQAA 4HXOA 5KTUA 5I7YA 2DATA 5A5QA 3JVJA 3U5OA 2YYNA 2OO1A 3UVYA 5DKHA 5II2A 2WP2A 4O7EA 4LZRA 4O7AA 5D3JA 5CQ7A 5DFCA 5CP5A 4A9EA 4PTBA 4HXKA 3LQJA 5FG4A 5CUAA 5F25A 4NUDA 3P1DA 3JVKA 4A9OA 2E7OA 4YY6A 5DYUA 5E73A 1WUGA 5EGUA 4OUFA 4HBWA 5DX4A 2R0VA 5A5OA 5EV9A 5LKZA 4HXSA 5CZGA 3MB3A 3P1CA 4HXRA 5E3GA 4UYDA 4Q0OA 5EVAA 3UV2A 4NRCA 4CLBA 4O7BA 5ENCA 3TLPA 5HCLA 5IGMA 4XYAA 4TS8A 4LYSA 5CUDA 5ENJA 4Q0NA 4NR5A 4O74A 5H85A 3D7CA 3U5PA 4ALHA 5FB1A 5F60A 4TU4A 4UYHA 2N9GA 4N4FA 5G4SA 5CUEA 4ZC9A 5C8GA 5EPBA 5I89A 5E3DA 5L99A 3I3JA 3LQIA 4WHWA 5FFYA 5F2PA 5DYCA 4N4HA 4YYJA 5DKDA 5EWHA 4NRBA 5D3NA 4LC2A 3U5NA 2RS9B 5FE5A 5I86A 3U5JA 5A81A 5DYAA 3NXBA 4A9JA 2RI7A 5EISA 3ZYUA 5FE9A 3S92A 5AD3A 5CRMA 2FSAA 2E3KA 5ETDA 5E9LA 4O72A 4QSPA 2OUOA 4QZSA 5ENGA 4KV1A 2L5EA 4KV4A 2DWWA 4YY4A 5D0CA 2D82A 4CUTA 4TZ8A 3UVWA 2YEKA 3GG3A 4QY4A 5CPEA 5AD2A 3S91A 3IU5A 5FFVA 4NR8A 4BHWA 5L8TA 4AKNA 3P1FA 4PY6A 5LVQA 4NYXA 2RNYA 4XUAA 5FFWA 4NUEA 5DFBA 5HRVA 5BT4A 5HRXA 5CQ3A 4Z6HA 4TZ2A 5J0DA 5F1HA 5L96A 4CUQA 4AI6A 4NS5A 4F3IA 5I40A 4GPJA 4UIUA 4C67A 4YH4A 5CFWA 3LXJA 4MR3A 2RFJA 4MEPA 3QZVA 5LUUA 5LKUA 4YBMA 4YYNA 1E6IA 5FE4A 5I80A 4X2IA 5F1LA 5TCMA 3SVGA 5A7CA 5D25A 5IGNA 5FG6A 5CQ8A 4Y03A 4O77A 4MENA 4YK0A 5FE7A 5C89A 4HBYA 4BW3A 3JVMA 5CRZA 2RNWA 5KO4A 5D3TA 5EK9A 3ONIA 4NQMA 4XY8A 5A5NA 4J0RA 3HMFA 2OSSA 3P5OA 5E0RA 5EWVA 5HEMA 5L98A 3UVXA 5I29A 4Z1QA 3U5LA 4A9IA 5DBMA 4YYIA 3FKMX 5I1QA 5I88A 4UYEA 5HLSA 4TT2A 5EQ1A 3MULA 4QSRA 5HM0A 4UIYA 4J1PA 4TU6A 1JSPB 4CUUA 4IR4A 4N4GA 5EWWA 4UIWA 5A85A 4N3WA 5EU1A 4YATA 5FE2A 3UV4A 3IU6A 3UV5A 4MR4A 5CGPA 4YYKA 5HENA 2YELA 5IGKA 4MR6A 1ZS5A 5LKXA 4OGIA 5FE6A 5G4RA 5LJ1A 4A9NA 5EPSA 4NUCA 5HQ7A 5CUCA 4UIVA 5JI8A 4NRAA 5IG6A 5E7DA 3D1BA 4CFLA 2RO1A 4ZQLA 5A5RA 5F61A 2NXBA 4QR3A 5AMEA 3MXFA 3P1EA 5CQ5A 5FG5A 4LZSA 4RVRA 4PCIA 3O33A 4HBXA 4QNSA 5HFQA 5E9IA 5ENFA 3HMHA 2RNXA 4YBTA 4PS5A 3RCWA 1F68A 1WUMA 4A9KA 4YC9A 4BW4A 4CL9A 3VKGA 4J3IA 3Q2FA 4YBSA 4AKGA 5DW2A 5DY7A 4WHUA 4HXPA 2EJNA 4O7CA 3SVFA 5DLXA 2I7KA 4TYLA 5CQTA 4QYDA 5AMFA 5IIDA 2YDWA 4WIVA 5I7XA 4NQNA 4NXJA 5E9MA 4E96A 3SVHA 2R0YA 4QUUA 1N72A 4UYFA 2MJVB 4YABA 2YEMA 4YH3A 4YAXA 3K2JA 5FE8A 5A83A 1EQFA 3O36A 4QYLA 5EWDA 4MR5A 5CTLA 5C7NA 4IOQA 3O35A 3QZTA 5D26A 2DVVA 2I8NA 5CUGA 5HQ6A 5KHMA 4TTEA 3LQHA 5E9VA 4C66A 5D3SA 3VKHA 4QB3A 1ZKRA 5ENHA 4O76A 5JWMA 3MB4A 4IR6A 5HQ5A 5L97A 5F3AA 4AKHA 5H1VA 5LKTA 5DFDA 5TB6A 3G0LA 4A9LA 4HXLA 5ETBA 4LR6A 4CFKA 4ZW1A 3AADA 3DWYA 4NR9A 4UIZA 4BJXA 3O34A 5K29A 5ENIA 4IR3A 4CURA 4YYHA 3U5KA 5DKCA 4LRGA 5II1A 2R10A 2F6JA 2F6NA 5F62A 4NR6A 5E9YA 5BT5A 4QC3A 5D3LA 2DVQA 5HJCA 5FDZA 4N4IA 4XUBA 5DW1A 5D3PA 4O71A 2WP1A 2L85A 3O37A 5FE0A 4QSTA 4IORA 5A5PA 3MQMA 2E7NA 5FH6A 3UVDA 3G0JA 5EICA 3LJWA 5CU8A 4QR4A 5KTXA
chains in the Genus database with same CATH topology
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