2NM1A

Structure of bont/b in complex with its protein receptor
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
436
structure length
430
Chain Sequence
SEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTEPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin,hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
publication title Botulinum neurotoxin B recognizes its protein receptor with high affinity and specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 103
structure length 430
sequence length 436
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nm1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nm1A02
1GKBA 2LALA 1WW5A 1AVUA 2VW2A 3IM7A 2PHUA 2D44A 3CA6A 3OGGA 2DUOA 1LULA 2MIBA 3RQ0A 1C4RA 2JECA 3AZYA 1W6MA 4FP2A 4FPYA 31BIA 4YG3A 4XZPA 2DTWA 3WCRA 2GN7A 3MALA 3AYAA 1R8OA 2V5YA 1GSLA 3CA0A 3AH2A 1HIBA 5D63A 2ZKNA 3O44A 2JDZA 4I4XA 1DZDA 4I4OA 5BVPI 1UPSA 2R1BA 1SZ6B 3POSA 2AAIB 3BOPA 2WJSA 4KBBA 5BP5C 3I29B 5CBLA 5E24E 3NBNA 2NYYA 3OY8A 1IOAA 4I4PA 2BEAA 4U2AA 3T2TA 1F5FA 4A7ZA 2Y9FA 1UAIA 1EV2A 4XDQA 4YGEA 4QBVA 2FHRA 4BMBA 2Y9WC 2PHWA 3NBCA 1W3GA 2XG3A 2UURA 1LJ7A 1OQ1A 4Y26A 3Q7XA 1KITA 4WVVA 4EFPA 4DFSA 5GZEA 3AJ6A 1JQZA 4FOWA 2FFUA 3FJ9A 4SLIA 4ISRA 5T5LA 4Z8SB 3CRGA 3ZC9A 4XYXA 1YYNA 3POKA 1HQWA 5JVVA 4LBQD 1YIFA 1Q04A 5GZGA 5BOWA 3WHTA 1W6PB 1IILA 4LBOA 2DWRA 1MZ5A 2Y9XE 3WNXA 2W39A 5CB7A 3AP4A 3ZPYA 1HCDA 2ZQNA 5DG1A 3M3EA 1XHBA 2FGFA 3NV1A 4XHBA 2VXTI 1AXKA 4LO0C 2YY1A 3OYWA 3WUCA 2UWCA 4WV8A 5IK5A 3D6EA 4XKIA 1V6LA 1P63A 2GO2A 3B9UA 1LTEA 1C1FA 1WW7A 4FOVA 3HMYA 1F31A 1QDCA 4ZOTA 3B9CA 3SNVA 1YO8A 3FLPA 5DUWA 3ZX7A 3CNAA 7I1BA 3POYA 3N7MA 4LBLA 4UW4A 3LSEA 1SLTA 3V64A 4I4YA 3BA4A 1FATA 3EF2A 3N36A 4R6UB 1LOGA 3BIWE 2ZHKA 2A6ZA 3AKGA 4YW2A 1DQ1A 1ULDA 2OUJA 2SLIA 3HN1A 2A5ZA 3HR9A 1HQLA 2W52A 4LO2A 4J2KA 1ABRB 4WBCA 4ZFUB 3T1MA 3ATGA 3QLQA 3M3OA 1W6MB 2A70A 4A7KA 4GWMA 2F8XC 5BYNA 5EC5A 1PC8B 4I1EA 1YTOA 2D3SA 3BTAA 3U4XA 1CR7A 4FOQA 4ISQA 5GAQA 5DZFA 3S8JA 1UZZA 1DQ6A 1RITA 4PF5A 5F5QA 1DFQA 3MPPG 1QMJA 3WA1A 3INAA 2E53A 2RSTA 4FVVA 1D0HA 5DUXA 5GLZA 3AYCA 3OJ2A 2ZQOA 3PHZA 2RG9B 4I0YA 4FPOB 2ARBA 1DQOA 1W6OA 4M3CE 4I1BA 2ZHLA 1RG8A 3FFZA 1IOBA 5T5OA 1AJOA 4NOTA 5EYXA 2L5XA 4DEPA 2DUPA 2CTVA 3VV1A 4M00A 3LSDA 1WLWA 4DRVA 4X39A 4FQZA 1BYHA 1HWNB 4XTMA 4XJWA 4IZXA 4YM2A 1RZOB 4WVWA 4I4RA 1V6KA 1N1TA 5IK8A 2UWAA 3ZSJA 2GDFA 5E89A 1DQ4A 4G6JA 1MZ6A 1IKQA 2PHFA 5HPZA 2VW0A 1SLIA 3GNEA 3OJMA 1G9DA 3AJZA 1W6NA 1HCEA 3WCSA 4EEEB 3WDXA 3CA1A 2IHOA 2ZMNA 3IIRA 2C9AA 3AZZA 2NP0A 2HWAA 4R9DA 1URXA 1IS5A 1ULCA 1BFGA 3BA5A 1QNYA 1EYLA 1WLDA 4JKXB 4I7IA 3E8LC 3AXDA 1S0DA 1SR4A 3OYWB 5GZCA 3O4OA 1GBGA 4XFTA 1XYFA 5E88A 2K43A 4R9CA 3BADA 3O0XA 1HKDA 3UD9A 5FNXA 9ILBA 4Y1YA 2D23A 5JOZA 3RMYA 3AZVA 4XJ9A 4H04A 3T8SA 3W9TA 4Y24A 2P37A 1W0PA 4XTPA 2ZHMA 5BXTA 1IRAX 1G9FA 3ILAA 3L2YA 2NTDA 3RG0A 5DXDA 4YW3A 1WBFA 3IAGC 4CRQA 2Q5TA 2R9KB 2A6YA 1C1LA 1FMZA 2WRYA 1PUMB 1QQLA 4FPLA 4Q8LA 3AXEA 5IT6A 2TEPA 3BAVA 3BAOA 2D1ZA 1R1ZA 1BLDA 3FUOA 3A22A 5H9QA 4YW4A 3V65A 3JUTA 4P14A 3RS6A 3TB0A 4I4QA 3IPVA 1CJPA 4IYBA 5HCBA 3A23A 3KMVA 4JP0A 1N1YA 4YFZA 4R9AA 3SLIA 2Z49A 2DYCA 1GICA 4USPA 1AZDA 1WUVA 5G00A 1GLHA 5JOXA 2WT0A 3I2XA 3PG0A 4DQAA 3VKOA 1II4A 4OUJA 1TWEA 1VIWB 5GLTA 4LBNA 4IY9A 3NWKA 1MS3A 4XBNA 1QF3A 2R0HA 1Q8QA 4XOGA 3N7KA 1SLLA 2XB6C 4AYUA 2GNTA 3I2AA 2P3KA 4AVSA 2ENRA 2D24A 4UW6A 3ZXJA 1MR5A 2PHXA 1YXWA 2J3PA 1IS4A 1VCLA 3ZYPA 3IM0A 4C1WA 2DVDA 4P0JA 3WVJA 2Q9XA 3O3QA 4USOA 2BFHA 3V0AB 3I8TA 1KJRA 3N35A 4Y22B 1EPWA 4I8MA 4TLPA 2JJ6A 1YBIA 1V6OA 3BA7A 1DIWA 2GNDA 4M3CA 1Z0HA 1HWMB 2R49A 3SITA 4G1RA 2WLQA 1CQ9A 3ZXEA 4IZEA 5B2HA 1JHNA 5T5PA 1ENQA 1FX5A 1GZCA 1WBLA 3UL2A 5T5JA 4OEGA 1L2HA 2ET2A 2AYHA 3WZ1A 3M3CA 1S0GA 2X2TA 2W68A 4XHXA 3A21A 4I96A 1ITBA 2ES3A 5LK5A 2A3XA 2GNMA 3KQRA 1FWVA 4Q1PA 1AVXB 2HWMA 5GZDA 1SFYA 4GP0A 3POWA 1S0JA 3B01A 3AKHA 1APNA 1WBAA 3HOMA 4ENDA 1LHNA 4KEKA 3MEPA 1TP0A 2DTYA 3A0KA 3K1XA 1OKQA 2ZGPA 1GZWA 1V6UA 1UL9A 3AP5A 4LO2C 1VALA 4XJ8A 4AN6A 1OFSA 3VT1A 4I4VA 1ENSA 3O4CA 4L4IA 2P2KA 1DZQA 4ZBVB 3O5SA 5GLWA 4HL0A 5F8WA 2D6LX 1G7YA 1I3HA 1AXYA 1S1AA 3FJDA 3JUUA 4YZ2A 5IK4A 3WDWA 3WINA 2F2FC 2DRYA 1G9CA 1BA7A 2YZ4A 1XZZA 4YZ1A 5FZYA 4XIKA 2R1DA 2MLLB 4QKRA 2DUQA 2WBCA 1LEDA 4X3AA 1QU0A 1BQPA 1DYPA 1BXHA 2OUHA 4Y1VA 3JRRA 1FV2A 4EB2B 4YW5A 1O4YA 1G86A 4FPJA 4G6MA 4JQ0A 4J2XA 2YROA 5GALA 2AREA 3CAHA 3QR5A 3B3QE 1MC9A 1FQ9A 4Y20B 3C9ZA 1ISXA 1YF8B 2DU1A 1S0CA 4KEIA 1S0IA 1GANA 4LO3A 1AVBA 3UK9A 3USUA 4Q26A 3WO2A 1YRZA 4J23B 3PMEA 3WO4A 5GLUA 4DPNA 1DGLA 1W6QA 1V6XA 4F34A 1WCSA 5KXCA 1JYIA 4II0A 4KC3A 2WSVA 5T52A 1Q8PA 1RINA 2ZZJA 1NUNA 5HCAA 4LO1A 4ZFWB 1KNMA 1Z4SA 4FOYA 2Y9GA 4GP3A 4YG0A 1KDKA 1N3QA 1QQKA 5GJ6A 3WLUA 3WHUA 1Q8SA 1DBNA 1OQLB 1SR4C 2D6MA 3WDYA 2ZHNA 3CA4A 3O4AA 3H6SE 2MC2A 1CVNA 4M3CB 3FJIA 1FN0A 1JT4A 3BAQA 4YLZA 1A8DA 3W59A 3QCWA 1HDKA 8I1BA 1MS8A 2DRZA 2BEBA 3N0KA 4GXLA 1LHVA 2D6NA 1JT3A 5H9PA 1FV3A 2RHPA 1ILR1 1GYKA 4EKXB 2D22A 4GAIA 3SISA 4AVVA 4IQPA 4ATEA 1TTUA 3DUIA 3UJOA 4BLIA 1GZ9A 3TAYA 5H9SA 1CPMA 3FUQA 4PBOA 3O0VA 2Q3NB 3I4IA 3WDUA 3AKFA 3BB2A 1GZWB 1I1EA 2XOAA 2LIQA 3VKNA 1WD4A 3FJEA 1QKQA 4JKQA 2P39A 2F2FA 3M2MA 2WNEA 1Q8VA 4OWJA 2CY6A 2EXJA 1VAVA 3D4KA 4I30A 3FGMA 4XJAA 4D8HA 3A4UA 4AGRA 2DVAA 4ITCA 5HCFA 1AX2A 2E4MA 4GKXA 2AENA 2ERFA 3OY8B 2AUYA 3ZYRA 4P0LA 4RL7A 3ILNA 2WSUA 1NZKA 4I3NA 1M16A 1N3OA 5EG6C 3RTJB 2YXSA 2WQZC 3BAUA 1DQGA 3FJJA 3CQAA 4XFUA 3FJAA 1JTCA 1Q56A 3MW4A 1KDMA 1JLYA 1BLAA 41BIA 1BZWA 4YZ4A 4YM1A 1RMLA 3IN9A 2A6XA 3ZXGA 1BJQA 3P6JA 3AP6A 1D2SA 4K21A 2ZMLA 4U36A 3FBYA 5F8YA 3PVNA 4QBCA 3RTIB 4AWDA 2X2SA 2I1BA 2ARXA 1HWPB 2VU9A 3AP7A 2EALA 2KM2A 4XJUA 5T50A 3FJBA 1DLLA 1SBDA 4QALA 4HR6C 21BIA 3SNMA 1FNYA 3ZSLA 1ENRA 1B09A 2ZGUA 2Z42A 1MACA 2NM1A 2ZBJA 1QXMA 1S0EA 1W6QB 2I2SA 3BAGA 4Q2FA 1BFFA 3PJQA 4P0KA 3CRIA 1A3KA 1T4QA 2D43A 4F83A 1IS3A 1MS1A 2V73A 1HKNA 3UD7A 1LOFA 2NVHA 4ATFA 5SV8A 3NJ5A 4YGCA 3VUOA 2Z48A 4YM3A 3T1LA 1W0OA 5GZFA 2K4AB 1QOOA 1BASA 2A7AA 1NLSA 1Q03A 1PWAA 1TFMB 2ESUA 3F1RA 4ZKTB 5IK7A 3N7LA 4XE9A 1MD6A 3NBEA 3BODA 2KKIA 3AX4A 1V6WA 4DENA 5FREA 2ZGTA 3O49A 2GMMA 4GA9A 1IS6A 3MW2A 1MVEA 3CRHA 2EXKA 1DQ5A 1FMMS 1E0OA 2D6KA 1TOOA 4BQ1A 1ONKB 1A78A 4Q9PA 5H9RA 2CWMA 4YG6A 2GALA 1LCLA 2AXMA 1WW4A 3WINC 1BARA 1MS4A 3R4SA 4XXPA 5F8SA 3WV6A 2JE7A 4FPKA 4ZGRB 3H6QA 5BXRA 3ZXKA 3WMUA 3D5OA 4Y1XA 5I1BA 4Q8KA 2UU8A 4QD2B 2HZ9A 5DZGA 1PUUB 1G8WA 3VKMA 2PELA 1Z2VA 1SBEA 3VSFA 2HYKA 1CE7B 4ZXKA 3UJ4A 4ZA3B 4W65A 4ASMB 4M01A 1LU1A 2AH2A 1W6OB 1HLCA 3WG2A 2P23A 1CESA 1V00A 1JW6A 2EXHA 4LO3C 1ISZA 1QOTA 1LHOA 1VAMA 1PZ8A 4CJMA 2NZ9A 3SH5A 1DQ0A 1SCRA 4QC4A 1JOJA 2A6WA 2VY0A 1RIRA 1LHWA 5T55A 1G82A 1PZ9A 3Q7WA 4BOWA 4FPEA 1T9FA 3NBDA 4JAWA 3BRFA 3AJ5A 4LO1C 1W6NB 3W58A 2P3JA 1C57A 1EVTA 2AQZA 5DUUA 2LIEA 1PZZA 5GM0A 5BQUA 2WT2A 4DRRA 2H0BA 4P9WA 4AN7B 1AVWB 3VKFC 3IM5A 1WLCA 2FMDA 2B7YA 2E51A 3ZXFA 3VT0A 1QNWA 4FPHA 1V6NA 2ZA9A 1QDOA 5CAZA 4P6AA 3FJ8A 4Z9WB 4YGBA 5KXBA 2LTNA 1IT0A 3OBRA 4LBKA 3M1HA 1AF9A 3HSMA 2DS0A 3OBTA 4EFQA 4LO8B 4BM8A 3LCPA 1JT5A 1FAYA 2D7RA 5FZUA 2YV8A 3Q7YA 2W08A 2DV9A 2NMOA 4QO3A 3NV3A 4JRAA 4LBJA 4NO4A 2EF6A 1MVQA 3O12A 1IHKA 2VSEA 1AX0A 4Q27A 3CU1B 4Q1RA 2ZAAA 1LGNA 4GALA 3ZSKA 1H9WA 1UKGA 1TIEA 4K1ZA 1V6VA 3FLRA 3WMVA 1AX1A 2KI4A 4BPZA 3SH3A 4PC4A 4K20A 1JUIA 4QD2C 5JLVA 4OEFA 3BRDA 5L73A 3ASIA 4I6IA 3O5WB 2OVUA 3KM5A 3ILFA 2E4MC 3ZVXA 3IPVB 1JN2P 2DURA 4XMIA 1PZ7A 3DGTA 5JOWA 2CL2A 4GKYA 2A6VA 2AR6A 1N4KA 2M49A 4GWNA 3ENRA 4CTEA 4JPZA 5GLVA 2D6PA 3WDVA 1DYKA 3O4DA 1CN1A 1ZA4A 3WG1A 1N1VA 1XQNA 3N3HA 3V0BA 4TYSA 3F62B 4L8QA 3FJCA 5JDBA 1WW6A 2D7IA 4CZSA 3M3QA 1KQRA 3WG4A 1H9PA 4I4SA 5AVAA 2YMZA 5E8AA 3WOGA 4LO7C 3AZXA 4AVTA 1SLAA 4FPGA 4RA0A 4DS0A 2EXIA 4M3CF 2AGSA 3IMNA 1DZCA 5D61A 3ZC8A 3VKLA 5DSSB 4L4HA 1ULEA 4LBQA 2BQPA 2OW4A 6I1BA 1LENA 4ZFYB 3QYDA 3ZXLA 4PCRA 1H30A 2EAKA 2FFVA 3OJVA 4LBMA 3FLTA 4OEEA 1ULGA 3VEQA 3LLPA 3A0NA 1Q1UA 1W3FA 5EHAA 3VSZA 1CVSA 4YOLA 1ZM1A 1IRPA 3B00A 4P9XA 1LU2A 2YUGA 1WBCA 4XXAA 4D0TA 1BKZA 3NV4A 2UUSA 1DJSB 1GNHA 3NV2A 5IUQA 3RRDA 5EWSA 1LOFC 2CYFA 2ZGOA 4H9WA 1AVAC 3HALA 3P6IA 3HBWA 3BAHA 5JMCA 2KI6B 4XFSA 2DVBA 4XBQA 3AYDA 1NXD1 2CWSA 1V6JA 4Q91A 2QYIB 2VXRA 3AH1A 1QGLA 4H55A 1X50A 3S8KA 2P3IA 3AP9A 2A75A 4Y1ZA 3R05A 4OW4A 4UW3A 1G9BA 1LHUA 1HWOB 2K8RA 1UX6A 1JYCA 2GNBA 4J2SA 4IHZA 4P9YA 3OGFA 1DFCA 1GGPB 4HA2A 2KLLA 2ZGQA 1JLXA 1CONA 2ZABA 1BFCA 5DUYA 5BP5A 4YW1A 2JE9A 1FWUA 3ILRA 4XJZA 4TZDA 2ZR1B 2G4IA 2GMPA 3H6RA 1V6MA 5CA6A 1FNZA 1K5VA 4R9BA 1S0FA 1DQ2A 3AH4A 2VUAA 1Q8OA 5FRAA 3RSJA 2C5DA 1IKPA 1LGBA 3CA3A 1S0LA 2QN4A 2UWBA 3UJQA 1J1TA 1GNZA 1CIWA 4JCKA 1ONAA 3MW3A 1SLBA 2D3PA 5EYYA 1BFBA 1Y7BA 1YI7A 3WG3A 3VWCA 1DHKB 1GV9A 1LOEA 4J2YA 3IKWA 2JKBA 4AGGA 2ZGRA 4I4UA 2ERMA 1CPNA 1JT7A 4OWKA 4Q9GA 2PHTA 1UN1A 1K5UA 2SBAA 2GN3A 4IONA 3V0BB 1KRIA 5F9TA 1SLCA 2JD4A 4EFRA 3TC2A 4C1XA 3H0OA 3JU9A 3CA5A 3PUBA 4GOYA 4HJJA 1I1BA 3V0AA 5BXPA 3USUB 1TEIA 3OPZA 4Y22A 3BRGC 5FNWA 3PVOA 2R16A 4XIOA 3B69A 3Q9OA 2DVFA 2EIGA 5F90A 2R0FA 2FO1A 3O4BA 1UMZA 4LO0A 4FGFA 1AJKA 4I37A 2ZGKA 4OWLA 1R8NA 3WO3A 1JY0A 1AXZA 1SACA 4LBQB 1ISWA 5BQUC 2VSAA 1MS5A 3IM6A 3VT2A 4YZ5A 4MYEA 4X38A 1LGCA 1LODA 4I2SA 4HANA 4OZXA 1SBFA 2D7FA 1UZYA 2ZGLA 3PVEA 4BLJA 2A3YA 2A3WA 1V6IA 1KJLA 5DG2A 4AGVA 2PHRA 2WKKA 2E6VA 1LESA 2DVGA 1Z78A 2FDBM 4UW5A 1O4ZA 3WUDA 5EXOA 4WZFA 3LTQA 2P34A 3D7WB 3WDTA 1WD3A 1XG6A 3ZXDA 4Y1UA 3N7JA 1JBCA 3SH4A 3AKIA 3UJ0A 3APBA 2AFGA 2D6OX 3AZWA 4IY8A 1LOBA 3OJBA 3UD8A 4XBLA 5KXDA 4G9NA 4G9MA 3R4UA 2D3RA 3UDAA 5D62A 4K1YA 4KEJA 3O0WA 4A7YA 4QKSA 1ISVA 1M2TB 1S0BA 1MS9A 4JC1A 5FZZA 3AK0A 1N3PA 2KH2A 2ZGMA 4XILA 1MS0A 4PBPA 3ZSMA 4D0ZA 3GALA 4FQ4A 4YZ3A 2ZMKA 5CNAA 2ZGSA 5KXEA 4YM0A 2CNAA 5DZUA 3H6RB 4DCKC 4YGDA 1LOCA 4Y20A 5DUVA 2VLCA 5BXSA 3AYEA 3FJHA 1U0AA 1N1SA 1JXNA 2E7TA 1FGAA 2NMNA 2IWTB 1ULFA 4PQ9A 4FP3A 4YFWA 4X37A 1W6PA 4ZLBB 1FYUA 1RY7A 1G9AA 1AXMA 2HW9A 2WT1A 2VW1A 2VH9A 2RQ9A 2D20A 1LEMA 1LECA 4FPFA 1ISYA 3C2UA 1N47A 2GZBA 3RMXA 3P53A 5JOYA 2DU0A 1VLNA 3A07A 4LO7B 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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