The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
62
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structure length |
62
|
Chain Sequence |
LNTFYDVQQLLKTFGHIVYFGDRELEIEFMLDELKELYMNHMIEKEQWARAAAVLRKELEQT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
Hypothetical protein yqgQ
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| publication title |
Structure of YqgQ protein from Bacillus subtilis, a conserved hypothetical protein.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bacillus subtilis
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| total genus |
23
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| structure length |
62
|
| sequence length |
62
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-10-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | YqgQ-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2NN4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3AG2 C; 1FXV A; 4CC5 A; 1XMQ B; 1YJN V; 5L3B A; 3RYF A; 4AHC A; 2UXC O; 2XAJ A; 1N36 O; 1P7G A; 2R9I A; 3K5O A; 1DLB A; 3K03 A; 3RT3 C; 2F23 A; 1K97 A; 1FYJ A; 2ZE8 A; 5LMU B; 2UXN A; 1SQB H; 3CWB H; 4X1I A; 4CC6 A; 1ROP A; 4CH4 A; 2JS5 A; 5KHG A; 1OJH A; 4JI3 B; 4RQE A; 1KU9 A; 2IW5 A; 4X65 O; 4ASU G; 3OUF A; 2FB5 A; 4TV9 A; 1BL8 A; 1XUQ A; 2HJF C; 5EBW C; 3D36 C; 1X4T A; 3E22 A; 3UT5 B; 3ZRS A; 2K1E A; 2Y0I A; 3ABU A; 3MHH C; 4GX1 A; 2M6Y A; 1ZSP A; 3H1L H; 3HKC B; 3JCZ A; 3ZRW B; 1DTO A; 2BTQ B; 5C93 A; 3A0R A; 3OGI B; 2NN4 A; 1HNZ O; 5KUK A; 1JFF A; 4B3M O; 5KX5 B; 1N34 O; 3RYH A; 4FM0 A; 2EIJ B; 1M56 C; 3ZCC A; 1BZK A; 4N23 A; 1XMO O; 4QGP A; 1NQT A; 2XAS A; 4R6Z A; 1YZB A; 3I5D A; 1J95 A; 2RQ6 A; 1L8D A; 4GT1 A; 1RFY A; 4JI4 O; 3CCS V; 3ABL C; 4IIJ A; 3JSN A; 2GHY A; 4B3T B; 3C90 A; 1XL6 A; 2DQ3 A; 2X0L A; 4AQY B; 5IJ9 A; 4DV6 O; 1JPX A; 4I9W A; 2EZO A; 3LNM B; 1AI7 A; 1ARO P; 3LUT B; 1W0K G; 1U97 A; 4W4L A; 4FVM A; 2KB1 A; 3TXS A; 4BIO A; 3LDC A; 1K4D C; 1WAZ A; 2Q9L A; 1OCR B; 4LWS B; 2CGN A; 4MVZ A; 4J10 A; 2VQF B; 4X62 B; 3OAA G; 3T4Z A; 4UVB A; 1NVP D; 2XAG A; 2VWJ A; 1QHT A; 4DV0 O; 1KUQ A; 2Y69 C; 1YEW A; 1WP8 A; 4TWK A; 2ZCE A; 3JAL A; 1LNQ A; 4TV8 A; 4LF4 B; 2Q4P A; 3J80 N; 1EN4 A; 3WG7 C; 4WFG A; 4UCO A; 2P06 A; 5EYP B; 2HR3 A; 1WNS A; 4DR6 O; 4J9Y B; 2IU0 A; 3KG2 A; 5JJN B; 4PD4 F; 4JI6 B; 4WFA V; 3ASO B; 4DV5 O; 4JV5 O; 4UXN A; 3ZN0 A; 5J2T B; 1VEW A; 5KLV H; 2WA4 A; 5LMN B; 1QU7 A; 4Q6G A; 4DR4 O; 4LP8 A; 1WB8 A; 1K33 A; 2XUM A; 1N8R W; 1IZ3 A; 4X64 O; 4DUY O; 4K35 A; 4JI5 O; 1TUE B; 1XHZ A; 3OMN B; 1Y74 A; 1YF2 A; 2ZIN A; 1Y66 A; 4PDR A; 1M90 W; 3U11 A; 3JD0 A; 2CH7 B; 1KBH A; 2WWW A; 2YEV A; 5EBL C; 4GX2 A; 4PDL A; 5DED A; 4DYL A; 4DV4 O; 2JGU A; 3JSL A; 3K5N A; 2BTQ A; 1YI2 V; 1UPG A; 2LO1 A; 3OTO B; 2Q8V A; 4CS2 A; 5GON B; 5KX5 A; 1I0H A; 1R1B A; 4GKK O; 3RYI A; 3HKE A; 3K59 A; 4K0K O; 1HNX O; 4JI1 B; 4B3R B; 2BCC H; 5HFL A; 5KHJ A; 1V54 B; 2AXT Z; 4IT5 A; 3ETG A; 3J81 N; 2F4V O; 3T1H O; 1KYO F; 2Q6A A; 4FJC C; 4K8Z A; 4L87 A; 4LF8 B; 1K5S A; 4B7K A; 1AIL A; 1DGS A; 3FB8 C; 3THO A; 4CZZ A; 3E8F A; 1MSD A; 5LP6 C; 2VQE O; 3UQ8 A; 4KHP O; 1N32 O; 1WA8 A; 3MD0 A; 3BAA A; 5IJ0 B; 1Z5V A; 3RVZ A; 4J42 A; 1K34 A; 3OEE G; 3GWO A; 3FAV A; 1FJG B; 5IDJ A; 3FFQ A; 2Q0O C; 4DV2 O; 3CCR V; 2N04 A; 2HVJ C; 1IDS A; 2QGN A; 4LWS A; 4O2B B; 2F43 G; 1R3J C; 4NXN O; 5EIB D; 4X89 A; 4X66 B; 4YJ2 B; 2N74 A; 4OPA A; 3BFR A; 2Y48 A; 1OCC B; 5B1B B; 4D7S A; 2KQX A; 4WCE V; 3CE2 A; 4CS3 A; 5IYB O; 1KD1 W; 1VQ8 V; 1F7Y A; 1VIB A; 4OGQ B; 2RDC A; 1VF6 A; 1BMF G; 4F6R B; 2V4D A; 1VQ4 V; 2V1D A; 1SKV A; 1XNR O; 1G4Y B; 3H1J H; 1K7D A; 1V9P A; 3CYO A; 4H33 A; 2BOB C; 1XHX A; 2FKX A; 2WLL B; 4FLX A; 4PA7 A; 3A0H Z; 3WFV A; 2HJD A; 3BA9 A; 4LFB B; 1Z2G A; 1Q43 A; 2QWQ B; 1KEC A; 4QJF B; 3STZ C; 1VQM V; 2WLM A; 1D5A A; 4JGS A; 2E5L O; 4LF9 O; 2P67 A; 4FPP A; 4I50 B; 4ZIB A; 2CH7 A; 4YIO A; 2RJZ A; 4U3F H; 3HB3 B; 1EZJ A; 4DV7 B; 5EC1 C; 3D36 A; 4U7O A; 2ZR2 A; 1H8E G; 1AR1 B; 1YXB A; 2ZKO A; 2EJR A; 4ICG A; 3E8H A; 3ML0 A; 4CH3 A; 2HFE C; 2XAH A; 2Z5U A; 1FXK C; 2GTS A; 2Q73 A; 1VF7 A; 1XOU A; 1M4U A; 5IE9 A; 3L73 H; 4JYB A; 4TSF G; 5H6Q A; 2QJ1 A; 4C7U A; 2ZM6 O; 1I94 B; 3NR7 A; 3T1Y O; 1SQX H; 3F5W C; 1WPX A; 1YSC A; 2UXB B; 3SPC A; 4JI7 O; 3QVN A; 2P6J A; 4WFE A; 5IJ0 A; 1SA0 A; 2EIM C; 2ZNI A; 2ODM A; 3CHX A; 4DUZ O; 2ZNJ A; 1AVM A; 3TJT A; 1KP3 A; 1YTF B; 2MW2 B; 3SGI A; 5KA5 A; 1MMM A; 3E83 A; 5ITZ B; 4JAV A; 4CS4 A; 4DV1 O; 1AR4 A; 1QVG U; 5CA0 B; 3R65 A; 5IYZ B; 3OMA B; 1VQ6 V; 4DR7 B; 3RGB A; 5FL7 G; 4YXW G; 3JAT A; 4IHJ B; 4NTY A; 3APO A; 3G4S V; 2XHB A; 3W7W A; 2L6L A; 1YIJ V; 4P2Z A; 5J9P C; 1Q3E A; 1AP5 A; 2YC0 A; 4FZ1 A; 4F6R A; 2UXC B; 4ZKI A; 1IBK O; 2ZE7 A; 3JAS A; 1HR0 O; 2UUB O; 5H9C A; 1TUB B; 3L72 H; 2LJ2 A; 1N36 B; 5KMG B; 4Z1M G; 2GSM B; 2QE7 G; 3WB1 A; 4DR3 O; 2W0X A; 4PEL A; 2AHY A; 3JAM N; 4EEQ A; 1VF5 B; 4GZR B; 3ZHT A; 2YDE A; 1LUW A; 1E79 G; 2BE3 A; 1TGO A; 2KG7 B; 2PGG A; 1V55 B; 4X65 B; 3AK1 A; 2EIJ C; 2DW4 A; 4YJ3 A; 2X6B A; 2CAZ C; 2PI5 A; 4FFK A; 2RN9 A; 1SF9 A; 5CA3 A; 4I50 A; 4JPR A; 3F5T A; 1ZX3 A; 4LF5 B; 3CP1 A; 2IU3 A; 3GWK C; 4PI0 A; 4GKJ O; 4B3M B; 2X6C A; 4LH6 A; 3G71 V; 3VOU A; 3FB6 C; 3VBB A; 2BSK B; 4H37 A; 1R3K C; 4RUE A; 4DR5 O; 5EC2 C; 3CCV V; 3N2G B; 1BQ0 A; 1QNM A; 2XAF A; 2UUC B; 2ATK C; 4JI4 B; 4PA6 A; 1YIT V; 4MTO A; 5L3E A; 4YHH O; 3KCX A; 4A5U B; 2B9Z A; 1M9N A; 3ZS8 C; 4EB6 B; 5C8Y B; 5LP6 A; 3RYC B; 4O4H A; 3SPG A; 2O57 A; 5EZY B; 4TUY A; 1EN6 A; 5HFM A; 1PD3 A; 1RPO A; 1MOF A; 3NXS A; 2OIG A; 3D3I A; 1N4C A; 2VWK A; 2DN9 A; 2Z3Y A; 4FLW A; 2Q7G A; 4JYC A; 2D2C B; 5KHH A; 4O4I A; 4ZI7 A; 3RFR A; 5JCO C; 5IYC O; 4Q20 A; 4DW1 A; 2D3O W; 3ASO C; 5IYZ A; 1JVM A; 2AW9 A; 4I0X B; 2CTW A; 1BS3 A; 4PA3 A; 3EFF K; 2DQ0 A; 1L0L H; 3JD2 A; 1JR9 A; 2NR5 A; 3OR7 C; 1VQP V; 3Q4H A; 1PM9 A; 2OWO A; 4NTW A; 1P4R A; 2A3Q A; 3E35 A; 2OCH A; 4G27 B; 1KKD A; 2YUA A; 1Q6H A; 3JD4 A; 4JV5 B; 5LOV B; 4ZOL A; 5BR8 O; 1H2K A; 4X1Y B; 5H2F Z; 2IM9 A; 4TOI A; 3ZMZ A; 1NU1 H; 2CTP A; 4CH6 A; 3GB7 C; 5FNV B; 3SPJ A; 4HAM A; 2H8P C; 3AG3 B; 2W6J G; 5CBF A; 2IH3 C; 1XBL A; 3WU2 Z; 4JI5 B; 5KA6 A; 5CBG A; 4IYH A; 2LGQ A; 2YIC A; 4L8J A; 3H1I H; 4U3J B; 3K9S A; 2ZIM A; 4B3S O; 1NH2 D; 2YSU B; 5K1P A; 3CCE V; 1Y67 A; 4LFC B; 1V54 C; 4UV8 A; 1FKA O; 3STL C; 2IH1 C; 3HKD B; 3UO3 A; 3CJH B; 2UXD O; 4P9P A; 5JVD A; 4R50 A; 1Q82 W; 3CD6 V; 1Q81 W; 1NR7 A; 2Q7E A; 4K0K B; 3B2E E; 3SJA C; 1HNX B; 1SQQ H; 1XQ8 A; 4O4L A; 4JI8 B; 2ZQM A; 3QF7 A; 1PNK A; 4P9O A; 2YID A; 3DXR B; 4HNA B; 4X1K B; 3JAW B; 1I7F A; 1FXK A; 3CCL V; 5JH7 B; 1NI8 A; 4O4J A; 3BY6 A; 4J80 A; 4MTX A; 5JQG A; 1KC8 W; 2QR4 A; 1VP7 A; 1VQO V; 2WLK A; 5C8Y A; 4DV3 B; 1K5Q A; 2IJI A; 1S72 V; 1Y4M A; 1OCC C; 3DSQ A; 5LYJ B; 3CME V; 1IXM A; 1AR5 A; 2AHZ A; 5B1B C; 1N33 O; 4QE7 A; 3L71 H; 4RWU A; 4DV2 B; 3ICX A; 5CA1 B; 4KL1 A; 3B8N A; 5LHI A; 2HG5 C; 4TQD A; 4MVU A; 4YIP A; 3N2K B; 1S5J A; 4FM2 A; 1R6T A; 1UJW B; 2AZ0 A; 2Q68 A; 3ASN B; 3QO5 A; 2K9P A; 4RO2 A; 4QE9 A; 3PJS K; 3K79 A; 4NKG B; 4UVC A; 3LSS A; 2ZR3 A; 1R6N A; 2QM7 A; 5CMU A; 4DRX B; 1U96 A; 1K9M W; 4X1Y A; 2P5O A; 4ABM A; 3L74 H; 4UCV A; 1F51 A; 2HHH B; 2WLI B; 3T4D A; 3LDD A; 2IJK A; 1H8H G; 1NKD A; 1HNW O; 3UT5 A; 2DMX A; 1SC5 B; 2ILM A; 2LGW A; 3HKC A; 3ZRW A; 1S0V A; 5LXT B; 4PA9 A; 2DWD C; 1GH6 A; 4LFA B; 1PL0 A; 4BIZ A; 3EHB B; 3QTC A; 3MHS C; 1W2B U; 2E5L B; 4UVA A; 4JI0 O; 4YY3 B; 1T5E A; 4GX5 A; 4JZ2 A; 3ABM B; 3FB7 C; 1YJ9 V; 3CRQ A; 4LF6 O; 3CRA A; 3E89 A; 4QNH B; 1JMK C; 4X20 B; 4HYO A; 2WSS G; 1XL4 A; 5B66 Z; 4X9Q A; 3J7A U; 3OFN G; 5AG2 A; 4DK0 A; 4I4T B; 2CDY A; 5BMV B; 1ZWI C; 5J2U B; 3K5M A; 3ABK B; 3BCC H; 1PPJ H; 3ETE A; 3JAW A; 1SER A; 1IBM B; 1ORQ C; 3L70 H; 4ZHQ B; 4OX9 B; 4GYC B; 4BWA A; 4ZBM A; 1Q7Y W; 2ADQ B; 1GN2 A; 5B1O A; 3T1Y B; 1JJO A; 2UUA B; 4FLT A; 1FPO A; 3BA8 A; 1HW7 A; 3LNN A; 4FLV A; 3P32 A; 3TK1 A; 2EIK B; 4GCZ A; 2JVD A; 3MDS A; 4J7Z A; 3JYC A; 4J11 A; 1NTK H; 1O9H A; 4X62 O; 2HEP A; 2Z0A A; 4E4E A; 3SPH A; 5KHK A; 2GUZ B; 2X6A A; 5IWA B; 4HZ3 A; 2W0F C; 2P4K A; 2XT9 A; 1SQP H; 2JGD B; 3JCU Z; 3M99 B; 4LF4 O; 1EM1 A; 2Q69 A; 5DM6 V; 1YCI A; 3UCS C; 4DXW A; 5D5P A; 2AGA A; 3A2F A; 5EYP A; 4QIW F; 1HDJ A; 1BT8 A; 3HKB B; 2OCC B; 3BPZ A; 5B1A B; 1BHB A; 5JCO A; 1NT2 B; 2ZXW B; 4JI6 O; 5J2T A; 3SYP A; 4BAY A; 4EFB A; 1YJW V; 5L3G A; 5JWP A; 4DR1 O; 2ZE6 A; 2RMK B; 4LF7 O; 4AIL C; 1IBK B; 2PYL A; 1WN7 A; 2R70 A; 5LMN O; 1S5L Z; 1URF A; 1HR0 B; 3AG7 A; 2UU9 O; 2CE4 A; 3L9D A; 3ZED A; 1V55 C; 3JAR B; 1J5E B; 1OV9 A; 3K58 A; 3K08 A; 5LHG A; 1O9G A; 4D6T H; 3K06 A; 3FYE B; 2WLI A; 5L3C A; 3SJB C; 2DWE C; 1QLE B; 4MVQ A; 1GRJ A; 4DR2 B; 1LUV A; 3APQ A; 1NS1 A; 3OGC C; 4LH7 A; 4EKW A; 5GON A; 1H2M A; 1Y76 B; 1JOY A; 5LA6 B; 1WLE A; 2YI8 A; 5LGU A; 3D3Q A; 3TET A; 1VQK V; 4JI2 B; 1QLN A; 4WBN B; 3P3N A; 4JI1 O; 4B3R O; 3B4S A; 4JF3 A; 3OD4 A; 3CRM A; 4X20 A; 3MAQ A; 1FFX B; 3OUS A; 4LF8 O; 1QCE A; 1PV0 A; 2DE0 X; 1P84 F; 3G6B A; 4X88 A; 5FLX N; 4J9Z B; 2CK3 G; 4KXR A; 1ZTE A; 3K57 A; 2QM4 A; 4BW9 A; 2PYJ A; 1L0N H; 4O2A B; 5CB4 B; 2N05 A; 3OM3 B; 1GTO A; 1FJG O; 1XNQ B; 4GLX A; 4O2B A; 4NTX A; 3CCM V; 1OCO B; 2BOC C; 1CEZ A; 1SZX A; 4YJ2 A; 3AG4 B; 3VQV A; 4X66 O; 1B06 A; 2JJ2 G; 1PP9 H; 2EZP A; 4RQF A; 1SET A; 1JCH A; 3SJC C; 1R3L C; 5GTI Z; 2MK3 A; 2QWP B; 5DN6 G; 4QPJ A; 3B40 A; 3RYF B; 3P30 A; 3ZN1 A; 4JTD B; 1NZ6 A; 1NVP B; 1LR1 A; 3U10 A; 1K73 W; 3SYA A; 2YI9 A; 3AG3 C; 2F66 C; 2KKW A; 4FMT A; 2QDO A; 1KMI Z; 2QTO A; 4UUJ C; 3B09 A; 2WLL A; 4X1I B; 3SPI A; 1A32 A; 3B77 A; 1BE3 H; 5BR8 B; 2OT5 A; 2YIA A; 1TVK B; 2M7W A; 1R73 A; 4I7Z B; 3W7U A; 2GBO A; 5FPO A; 1IBL O; 3JAK B; 1GN3 A; 4LFB O; 2HVK C; 2P22 C; 1HP8 A; 4PV1 B; 1MG1 A; 1QR9 A; 4TV9 B; 3ABT A; 2LQT A; 1D2D A; 3OT7 A; 2E75 B; 3DC5 A; 4DK1 A; 1I5X A; 4IYI A; 3LDE A; 1DF4 A; 1HNZ B; 4B3S B; 4MVM A; 1N34 B; 2EIL B; 1D5N A; 4X8A A; 4BR6 A; 1JFF B; 3AG1 B; 4U7N A; 1ZAU A; 3OR6 C; 3RYH B; 3CC2 V; 2Q0A A; 1XMO B; 4HBN A; 1RM1 B; 1S5H C; 4JTC B; 3SJQ C; 1MAB G; 4JAS A; 3ETD A; 2Y0P A; 2W6I G; 3O65 A; 5LHH A; 1N0N A; 4H44 B; 1S76 D; 3F7V C; 4IIJ B; 2GV9 A; 1VQ7 V; 1Q6I A; 2B5U A; 2RCV A; 1I94 O; 3JD3 A; 4PA4 A; 3UO2 A; 4DV6 B; 4W4K A; 5IJ9 B; 2DYR B; 3E8B A; 2F93 B; 1SQF A; 2UXB O; 2WLN A; 2NNU A; 1MSW D; 1THZ A; 5K1X A; 4RUF A; 2AZ2 A; 3ZMT A; 4J7K A; 5F2V O; 1CPY A; 2WLH A; 1IX9 A; 3CC4 V; 4PDV A; 5B5E Z; 5ITZ A; 3ASN C; 5FPR A; 4DV0 B; 3ZBH A; 5BY1 A; 5CA0 A; 2H94 A; 1SQG A; 1DK1 A; 1OCZ B; 3W7T A; 4KP4 A; 3CMA V; 4IHJ A; 4TV8 B; 3JAL B; 3DGE A; 1FD9 A; 3E8G A; 3BVO A; 1NBM G; 1I08 A; 3KKY A; 4LBE C; 3IFX A; 2QA4 V; 1VQ5 V; 4PI2 A; 3CEI A; 3ZMS A; 4MSW C; 3CSX A; 4DR6 B; 1YHQ V; 4DV5 B; 2E3C A; 1TUB A; 5KMG A; 2PY5 A; 1M57 B; 4NXM O; 3ZHV A; 4DR4 B; 1CXZ B; 4FIP C; 1S77 D; 1G6U A; 2JEU A; 4OXS A; 1BSM A; 1H2L A; 4F6E A; 4KFM A; 4LR3 A; 1EBO A; 1QR8 A; 4FK5 C; 1XEQ A; 3ZHR A; 4X64 B; 4DUY B; 3HR0 A; 1US6 A; 2VRZ A; 4MTF A; 2FML A; 3N27 A; 1TVK A; 2EJ7 A; 2KG7 A; 3X2Q B; 3ZRV A; 5A2Q N; 3JAK A; 3FKS G; 3JD1 A; 1Y74 B; 1YVW A; 3PN1 A; 1XIL A; 1W59 A; 5IY5 B; 5JJE B; 4JYY A; 3ABM C; 1HNW B; 5LGN A; 4G2K A; 3DTU B; 5GW7 A; 2YEV B; 4MT8 A; 4DV4 B; 1GKF A; 1FFT B; 4R7C A; 2B1G A; 1VAR A; 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