2NN7A

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase i
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
PDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nn7A00
5SZ5A 5SZ4A 2Q1BA 4ITOA 1RZAA 1CNHA 3RJ7A 3OYQA 3HKNA 4FU5A 5SZ1A 1ZFKA 4QY3A 3P5AA 3D8WA 3NB5A 1KWRA 2H4NA 3R16A 4RUXA 3M2XA 3S9TA 1THKA 4JSSA 2HD6A 1CRAA 2FNKA 5G0BA 4FRCA 3RGEA 4QEFA 4QJWA 1CNCA 4Z1EA 1Y7WA 3V7XA 4Q7PA 1CNJA 5BRUA 1ZNCA 3CZVA 5CLUA 3T82A 3MNJA 2FOSA 4Q8XA 4CNRA 4Q6EA 3MNAA 2FNMA 3RYZA 1IF7A 1ZSBA 5LMDA 5FNHA 3TVNX 4Q49A 4KUVA 4RFDA 3W6HA 3OIKA 3R17B 1Z9YA 4Z0QA 2ILIA 4RUYA 4WW8A 3ML5A 5AMLA 4CQ0A 2CA2A 2HOCA 1BNTA 4Q7SA 3V3IB 3M5EA 3P4VA 1BNNA 4XIWA 5EH8A 4QJPA 4Q87A 3MNHA 3F7BA 4HEYA 4MTYA 4K0TA 1TG9A 2NWOA 4Y0JA 5EH7A 4MDGA 3MWOA 2WD2A 1ZFQA 1LGDA 4FVNA 3U7CA 3EFTA 1I8ZA 3D93A 1BN4A 3FE4A 4KP5A 5FL4A 1CNGA 5JDVB 1G46A 1TEUX 9CA2A 1FQNA 4LU3A 2WD3A 4KNNA 5FL5A 1ZH9A 1IF9A 3U47A 1OQ5A 4HT0A 4HT2A 1JV0A 3RG3A 3V3FA 3KOKA 1G0FA 4MDMA 3U3AX 5JGSB 4RUZA 2EU3A 3M1JA 3MHIA 5HPJA 1KOQA 4Q06A 1H9NA 1IF5A 5SZ6A 5EHWA 4IWZA 1UGBA 4YGLA 5E5UA 5DSKA 3F4XA 1XPZA 1V9EA 1CNIA 5DSIA 1AZMA 3S8XA 4ZAOA 1YO0A 1CVFA 1EOUA 1CAHA 4KNIA 1BNMA 4Q6DA 4Q08A 3IBNA 3T5ZA 1BNUA 3M5SA 1KOPA 1BV3A 4QTLA 1RZCA 3OKVA 3SAXA 5JESB 1DMXA 4Q78A 4XE1A 1DCBA 3HKTA 3HS4A 3MNUA 4PXXA 3KONA 4KP8A 1BNWA 2O4ZA 5E2SA 3TMJA 3UYQA 1G52A 1AVNA 5DSMA 1I9MA 4MLTA 3HKQA 5DVXA 1LUGA 2FMZA 4WUQA 5DSNA 3V2MA 5A25A 4N16A 2ABEA 1YDCA 5SZ0A 3P3JA 1FQLA 2NNSA 4YGJA 4ZX1A 1CNWA 4JSZA 2X7TA 1CA2A 4KNMA 4ZWXA 3S74B 3RZ1B 3DA2A 5EOIA 5G0CA 4COQA 4Z1KA 2OSMA 5G01A 1URTA 5FNGA 1CVBA 4QIZA 1CVEA 3DC3A 5EHEA 5IPZA 5AMGA 1FR4A 1J9WA 5BYIA 4QJXA 3RZ8A 5JGTB 4FL7A 3S75B 3RZ0B 5DRSA 1I91A 4R5BA 1XEGA 5DSLA 2HL4A 2NNGA 1IF8A 2NXRA 3P3HA 2X7SA 4LP6A 3MHLA 1HUGA 3IGPA 3B4FA 5DOHA 1CNXA 4L5WA 1UGDA 4M2RA 5FNIA 4X5SA 1BN1A 4RH2A 3CYUA 3LXEA 3KIGA 3S77B 4RIUA 4Q09A 1RJ6A 2AX2A 3DVBA 1G54A 2NN7A 3V3GB 3N4BA 3OKUA 1YO1A 3IAIA 3DCCA 1CAKA 3HKUA 3T5UA 1FSQA 3D9ZA 4ILXA 4YXIA 4XFWA 1OKMA 3RZ7A 3HFPA 3IBUA 5EKJA 3ZNCA 1JD0A 3MHCA 4FPTA 3RG4A 4YXOA 3GZ0A 3DD8A 3RYVB 4QIYA 3RLDA 2QO8A 4ZX0A 4QJMA 4E3FA 1TE3X 4CNXA 3BETA 1MOOA 3RYYA 3SBHA 3MDZA 5JEPB 4M2UA 1I9QA 3EFIA 1TB0X 5FNKA 3P5LA 4QJOA 1I9PA 3NJ9A 1G53A 2NN1A 4CNVA 4E3DA 5FLTA 3P44A 4BF6A 2EZ7A 3L14A 3M1WA 3F8EA 1FQRA 1YDAA 1UGGA 3SBIA 3UYNA 1KWQA 4QK3A 4ZWIA 3C7PA 3S78B 3VBDA 1RZBA 5BNLA 3OYSA 1HCBA 4QK1A 4YHAA 1CAYA 2NNVA 1I9NA 5EH5A 4G7AA 3DCWA 4RFCA 3KOIA 1T9NA 2GD8A 1CZMA 2NWPA 2WEOA 1UGCA 1CAMA 1CCTA 3D92A 5JG5B 2FMGA 3K7KA 3N3JA 1MUAA 3OILA 3N2PA 5J8ZA 3T83A 1RZDA 5JQTA 3M2ZA 2HNCA 3KKXA 1IF6A 4PYYA 3OY0A 1OKNA 1CILA 3M5TA 3MHOA 4WR7A 4WL4A 4QJ0A 2QP6A 5L3OA 3DVCA 1FSRA 3M1QA 4L5VA 4ZWYA 3OIMA 1CANA 3P58A 5FDIA 3M3XA 3TVOX 1G4OA 1G45A 1ZSAA 2FOQA 1CVHA 5SZ7A 1CAZA 1G6VA 5DSQA 4IDRX 1G48A 4Q07A 3BL1A 1CINA 1BN3A 2OSFA 7CA2A 2Q1QA 2WEHA 3IBLA 1Z97A 4WW6A 4DZ7A 2NNOA 5FLRA 4KUWA 6CA2A 4YXUA 3FW3A 1RZEA 1CALA 4K13A 4YVYA 5FNLA 3V3JA 1UGAA 3PJJA 5FNMA 3S76A 5FLPA 3NI5A 4Q8YA 1AM6A 5BRWA 4R5AA 2VVAX 4RIVA 1ZE8A 4K1QA 4QSAA 3HLJA 4N0XB 1CVAA 2FNNA 5DSOA 1G3ZA 1HVAA 4QSJA 2CBCA 4YGNA 3DC9A 4HEZA 5EIJA 2POUA 1CAJA 1ZGFA 1G0EA 1LG5A 4JSWA 1TTMA 2HKKA 2FOYA 3V2JA 4PQ7A 4PYXA 4ZWZA 3QYKA 1HECA 4Q0LA 1KEQA 1I9LA 3DAZA 1DCAA 1BICA 4CACA 3M2YA 3S97A 1Z93A 3JXFA 3F7UA 2CBDA 4LHIA 4PZHA 2NWZA 3S73B 3U45X 5E2RA 4E9OX 4CNWA 4C3TA 3BL0A 4Z1JA 5DSJA 2CBAA 3V5GA 2HFWA 2GEHA 5JQ0A 5CA2A 5E5RA 4K0SA 3DV7A 5FDCA 1CNKA 4MLXA 2EU2A 4FIKA 5E2NA 5FLQA 4E49A 4KV0A 4Q7WA 4ETQC 4TWMA 4QSIA 3M40A 5E2KA 4Z1NA 4QK2A 3M2NA 4K0ZA 3DD0A 3IBIA 1UGEA 1IF4A 1HEBA 4TWLA 2FOUA 2ZNCA 3IEOA 1HUHA 4R59A 1TBTX 1FQMA 1RAZA 4E3GA 4Q7VA 1XQ0A 3RZ5A 3RYXB 2IT4A 1LG6A 5CJFA 1BCDA 1RAYA 3M14A 3W6IA 1LZVA 4HBAA 5CACA 1ZGEA 4KNJA 4CA2A 2X7UA 4Q9YA 3KLDB 5EKHA 5SZ2A 1H4NA 4M2VA 4E5QA 5E2MA 4YX4A 3ML2A 4E3HA 5E28A 4XZ5A 4Q99A 2CBBA 3K34A 4KAPA 3S71B 4Q90A 3SAPA 1ZSCA 5DSPA 1H9QA 3DVDA 1HCAA 2H15A 2NXTA 1YDBA 3CAJA 5BRVA 3M1KA 2CABA 2Q38A 2FOVA 3RYJB 12CAA 1CRMA 3CA2A 5G03A 1OKLA 2F14A 5EHVA 3JXGA 1I9OA 4QSBA 1FLJA 1CIMA 2POVA 1BZMA 1F2WA 1RJ5A 3PO6A 1CCSA 1G1DA 5FLSA 3V3HB 4YWPA 3JXHC 3PYKA 5JEGB 1CNBA 4MDLA 2POWA 1DMYA 1FSNA 3B1BA 4UOVA 3MMFA 2AW1A 3KWAA 3DBUA 5DOGA 3S72B 5L6KA 4YYTA 8CA2A 3MZCA 1YO2A 3T85A 2FW4A 1XEVA 1YDDA 1V9IC 4ITPA 2VVBX 4MO8A 4Q8ZA 4JS6A 1HEAA 1TG3A 5A6HA 1TEQX 4KUYA 5FL6A 3ZP9A 4BCWA 5JEHB 3M98A 4JSAA 1JCZA 5JG3B 1CVCA 4G0CA 2W2JA 1CVDA 4E4AA 5AMDA 1G4JA 1UGFA 5FNJA 4HEWA 3Q31A 4HF3A 4YGKA 4HU1A 3KS3A 4L5UA 4RN4A 2CBEA 3MNKA 4M2WA 4DZ9A 5DSRA 3MHMA 4Q83A 1BNVA 3P55A 4BF1A 1CNYA 4FVOA 1FR7A 1A42A 4XIXA 2NWYA 1CA3A 4YGFA 5EKMA 3KNEA 4Q81A 3FFPX 2NXSA 5C8IA 5FLOA 1CAOA 4GL1X 3M04A 1I90A 2WEJA 3MNIA 5SZ3A 1BNQA 2NMXA 4WUPA 3DCSA 3N0NA 3T84A 1CAIA 3K2FA 2WEGA 2QOAA 5EZTX 1CCUA 1HEDA 3M96A 1TH9A 3D0NA 3M67A 3MYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5SZ5 A;  5SZ4 A;  2Q1B A;  4ITO A;  1RZA A;  1CNH A;  3RJ7 A;  3OYQ A;  3HKN A;  4FU5 A;  5SZ1 A;  1ZFK A;  4QY3 A;  3P5A A;  3D8W A;  3NB5 A;  1KWR A;  2H4N A;  3R16 A;  4RUX A;  3M2X A;  3S9T A;  1THK A;  4JSS A;  2HD6 A;  1CRA A;  2FNK A;  5G0B A;  4FRC A;  3RGE A;  4QEF A;  4QJW A;  1CNC A;  4Z1E A;  1Y7W A;  3V7X A;  4Q7P A;  1CNJ A;  5BRU A;  1ZNC A;  3CZV A;  5CLU A;  3T82 A;  3MNJ A;  2FOS A;  4Q8X A;  4CNR A;  4Q6E A;  3MNA A;  2FNM A;  3RYZ A;  1IF7 A;  1ZSB A;  5LMD A;  5FNH A;  3TVN X;  4Q49 A;  4KUV A;  4RFD A;  3W6H A;  3OIK A;  3R17 B;  1Z9Y A;  4Z0Q A;  2ILI A;  4RUY A;  4WW8 A;  3ML5 A;  5AML A;  4CQ0 A;  2CA2 A;  2HOC A;  1BNT A;  4Q7S A;  3V3I B;  3M5E A;  3P4V A;  1BNN A;  4XIW A;  5EH8 A;  4QJP A;  4Q87 A;  3MNH A;  3F7B A;  4HEY A;  4MTY A;  4K0T A;  1TG9 A;  2NWO A;  4Y0J A;  5EH7 A;  4MDG A;  3MWO A;  2WD2 A;  1ZFQ A;  1LGD A;  4FVN A;  3U7C A;  3EFT A;  1I8Z A;  3D93 A;  1BN4 A;  3FE4 A;  4KP5 A;  5FL4 A;  1CNG A;  5JDV B;  1G46 A;  1TEU X;  9CA2 A;  1FQN A;  4LU3 A; 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