2NNSA

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
259
structure length
258
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLEVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nnsA00
4Q08A 12CAA 4E3DA 4GL1X 1RAYA 3M40A 4KUVA 5CACA 4Q99A 3SAXA 2F14A 5DOHA 4Z1JA 5JG3B 1KWQA 3P3JA 5DSPA 4K0ZA 3M2XA 4E5QA 1CNYA 2EU2A 1G4OA 3OIMA 4Q7VA 4CNRA 1CIMA 5JEHB 2HNCA 2FMZA 2X7UA 5SZ0A 4UOVA 5DSOA 1BNVA 3D9ZA 3RGEA 3MHIA 5JEGB 3S76A 5DSNA 4K0TA 3DCWA 4KUWA 3C7PA 1G54A 3M04A 2FNMA 3KLDB 3TVOX 3U7CA 5AMDA 3DVCA 3HKTA 1I9NA 1YDBA 3JXGA 3Q31A 4HF3A 4KNMA 4YVYA 1CRAA 5FLTA 1KOQA 1G52A 4ZAOA 4QSAA 4CNXA 1CNIA 2WEGA 4MTYA 3SBIA 1CAHA 2FNKA 2POUA 1HCBA 1HUGA 1FR7A 1RAZA 4R5BA 1JV0A 4HT2A 3FFPX 5A25A 3P3HA 3PO6A 2WD2A 3D93A 1I9OA 3P44A 1OKMA 4KNIA 3VBDA 1IF9A 2NNOA 1H9QA 5L3OA 4WUPA 3S77B 4X5SA 5JQ0A 4COQA 4QJOA 1Z97A 1LUGA 3HKNA 2HFWA 3KS3A 5BRWA 4DZ9A 1HCAA 1TB0X 5FLQA 3ZNCA 4ITPA 5DSKA 1G0EA 2HD6A 5CJFA 5EHWA 4YWPA 4PXXA 5JDVB 3M2YA 4QIZA 3RZ8A 5DSRA 5BYIA 4Q8ZA 1RZCA 5DSJA 5EOIA 1Z93A 2HKKA 3CYUA 1HEDA 1TTMA 3DA2A 2ILIA 4LU3A 2NMXA 2O4ZA 5FLPA 3DD8A 4FIKA 1TG9A 5E2RA 2EZ7A 4QJMA 3KWAA 4RUXA 2CABA 3P4VA 2WEHA 3DC9A 3RJ7A 4Q06A 4ZWZA 4QJ0A 2NXTA 4KNNA 4QJWA 5JGSB 3M5SA 1CNBA 4E49A 2IT4A 1CAZA 1FQMA 3RZ7A 1UGAA 1IF6A 3V3IB 3K34A 4CNWA 5FNGA 5SZ4A 4HU1A 1G46A 1BCDA 8CA2A 1ZGEA 3EFTA 1CA2A 2FMGA 1TEQX 4G0CA 5SZ7A 3RLDA 1BNQA 1CNGA 3U3AX 3T85A 7CA2A 5EH5A 4RN4A 1CALA 1XEVA 1Y7WA 4Q83A 4WUQA 1FQNA 5FNMA 1V9EA 4K13A 4YGLA 3R17B 1ZGFA 1CVAA 3W6HA 1OKNA 3RYXB 1LGDA 4RFDA 3S78B 3D0NA 5SZ6A 3N3JA 5DSMA 1G4JA 4Q8YA 1JD0A 4KNJA 2CBBA 5FNLA 2NN1A 3W6IA 1TG3A 1CVFA 2Q1BA 3T83A 2WD3A 2WEJA 1I9QA 1UGDA 1ZE8A 4MDMA 4KP5A 5E2KA 4LP6A 2CBAA 3T5UA 2FNNA 3OIKA 1CVHA 4MDLA 1IF4A 5HPJA 3DBUA 3M67A 4YGKA 5EKJA 1I8ZA 1JCZA 4RFCA 3S8XA 1UGEA 4L5VA 2ZNCA 1G6VA 4KP8A 2CBEA 1ZFKA 1RZBA 3F8EA 1KWRA 4QEFA 3M1JA 3F7BA 1EOUA 1URTA 3KOIA 4WW6A 1AM6A 3PJJA 3MHOA 4Q87A 3M2ZA 1CVEA 1I9LA 5E28A 3KKXA 3IBIA 3HKQA 5E2SA 3FW3A 4Q7SA 4YHAA 1MUAA 3T5ZA 4C3TA 1CCSA 4HEZA 4E9OX 4YXIA 3JXFA 4QY3A 1ZSBA 3HFPA 4Q6DA 2POWA 3BETA 3RG3A 1RZDA 5E2MA 3RYJB 1H9NA 5DSLA 3MHCA 4QIYA 4XFWA 1CAJA 2Q1QA 1MOOA 4K0SA 1HEAA 3RZ5A 4KAPA 5IPZA 1TH9A 5FNIA 3T84A 5CA2A 2HOCA 3MHLA 5FLSA 4Q9YA 3S71B 5DOGA 1FQLA 5G03A 1DMYA 4E3GA 5E2NA 1J9WA 4YXOA 4QK1A 1RZAA 5J8ZA 2ABEA 1CCUA 3KIGA 1A42A 5FLOA 4MLXA 4DZ7A 2QOAA 4WR7A 4QSIA 1CVCA 4K1QA 1H4NA 4QSJA 3ML2A 4BF6A 4ZWYA 6CA2A 5EKHA 3HS4A 1KOPA 4ILXA 5C8IA 3HKUA 3MNJA 1CINA 2FW4A 1BNWA 2GEHA 4N0XB 5EH7A 4JSWA 4HEYA 5CLUA 9CA2A 1CZMA 3B4FA 1CNHA 3QYKA 4MDGA 3M96A 3IEOA 4HEWA 3MDZA 1TEUX 2FOSA 5FL6A 4ZWXA 3MNIA 4HT0A 5E5RA 5EZTX 1CNWA 1CAIA 2CA2A 3MZCA 4ETQC 4KV0A 1CVDA 3P55A 3V2MA 1CAMA 1G48A 1ZFQA 1LG6A 5FNKA 3MNUA 3IBUA 3R16A 3DCSA 4YXUA 1FSRA 1BNNA 1I9PA 1FSQA 3RZ1B 1CNXA 2FOQA 3M5TA 3PYKA 1CNJA 2OSMA 3OILA 5DSIA 4RUZA 2NN7A 4YX4A 3MMFA 1LZVA 2QP6A 3MNKA 1V9IC 4BF1A 4WL4A 5L6KA 1YO1A 1ZSCA 1TE3X 4FRCA 4QSBA 3KNEA 1CVBA 1UGGA 2EU3A 3MHMA 3M1QA 1YO0A 4CA2A 3MYQA 3RYYA 3V5GA 2VVAX 3DD0A 3FE4A 3M2NA 3P5AA 4CQ0A 3DAZA 4FVOA 5DVXA 1AVNA 5AMGA 4TWLA 1G53A 4Q7PA 3K7KA 4MLTA 4HBAA 4ZX1A 3U45X 5EHEA 1FLJA 2AX2A 3TVNX 3CAJA 5SZ1A 4M2UA 1BNMA 3NI5A 5JESB 1CNCA 4JSSA 1UGCA 4XIXA 1BV3A 2NWPA 1CNKA 2CBDA 3RZ0B 5BNLA 1ZH9A 3V7XA 1HEBA 2NWYA 1I9MA 3RYVB 4RIUA 1IF8A 3GZ0A 1CAYA 2FOUA 5FLRA 3SBHA 1XPZA 4Z0QA 2X7TA 2VVBX 1YDAA 4FVNA 1LG5A 5AMLA 5FDIA 4CNVA 3MNAA 1AZMA 1UGFA 2NWOA 3DC3A 4M2WA 1KEQA 4QK3A 3V3GB 3IBLA 5JGTB 4L5UA 4QJPA 1YDCA 2NXSA 4Y0JA 5JQTA 1FQRA 4PYYA 3T82A 1DMXA 3S73B 1IF5A 2Q38A 3V3HB 2NNSA 3EFIA 4R5AA 4JSAA 5FL5A 1CILA 4RH2A 5E5UA 1CA3A 5G0BA 3B1BA 4E3HA 3JXHC 4Z1EA 1Z9YA 1G1DA 3HLJA 1G0FA 4LHIA 1CCTA 1BZMA 5EKMA 3V2JA 4Q49A 2POVA 3BL0A 3CZVA 5EIJA 1OKLA 3IGPA 3ZP9A 1IF7A 3V3FA 3IBNA 1CRMA 3D92A 4RUYA 2QO8A 4ZWIA 4ZX0A 3L14A 1BN1A 1F2WA 4JSZA 3OY0A 5FNHA 1ZSAA 5SZ2A 2H4NA 3IAIA 4N16A 3V3JA 1DCBA 4YGNA 3S9TA 1G45A 4FL7A 2GD8A 4CACA 3M14A 3N4BA 3N2PA 4IWZA 3P5LA 3U47A 4PZHA 3DV7A 1BN4A 1FR4A 4G7AA 4YYTA 4JS6A 5FNJA 2CBCA 3KONA 3LXEA 2NWZA 4FU5A 3S74B 3NJ9A 1BNUA 1CANA 1HVAA 3MNHA 3P58A 4Q09A 5FDCA 2OSFA 3UYQA 3M98A 1YDDA 1UGBA 4Q6EA 4RIVA 1I91A 3RYZA 3BL1A 1THKA 1BN3A 3D8WA 5JG5B 2W2JA 1HUHA 5BRUA 5JEPB 1ZNCA 4Q7WA 3OYQA 5G0CA 1RZEA 2FOYA 3OKUA 1BNTA 1I90A 3K2FA 1T9NA 1DCAA 3MWOA 3F4XA 2AW1A 4L5WA 1RJ6A 2HL4A 3OKVA 1OQ5A 2NXRA 3UYNA 4Z1KA 4Q90A 2NNVA 3RG4A 4WW8A 4Q8XA 3S72B 5DRSA 4QK2A 1RJ5A 4IDRX 4QTLA 3M5EA 3F7UA 1TBTX 4PYXA 4XE1A 3N0NA 4Z1NA 4Q78A 4YGFA 1XEGA 4R59A 1HECA 3SAPA 4MO8A 2FOVA 4TWMA 3DCCA 3S97A 5DSQA 5A6HA 5EHVA 1CAKA 4Q07A 3M1WA 2H15A 4BCWA 1YO2A 3CA2A 4KUYA 4E3FA 4Q0LA 2X7SA 3TMJA 2NNGA 4YGJA 3OYSA 1G3ZA 5FL4A 5BRVA 1XQ0A 4QJXA 3KOKA 1BICA 5SZ3A 4PQ7A 4E4AA 4FPTA 1CAOA 4XZ5A 4XIWA 3DVDA 3S75B 5LMDA 3ML5A 4M2VA 4ITOA 4Q81A 2WEOA 4M2RA 5SZ5A 1FSNA 3NB5A 5G01A 5EH8A 3M3XA 3M1KA 3DVBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q08 A;  12CA A;  4E3D A;  4GL1 X;  1RAY A;  3M40 A;  4KUV A;  5CAC A;  4Q99 A;  3SAX A;  2F14 A;  5DOH A;  4Z1J A;  5JG3 B;  1KWQ A;  3P3J A;  5DSP A;  4K0Z A;  3M2X A;  4E5Q A;  1CNY A;  2EU2 A;  1G4O A;  3OIM A;  4Q7V A;  4CNR A;  1CIM A;  5JEH B;  2HNC A;  2FMZ A;  2X7U A;  5SZ0 A;  4UOV A;  5DSO A;  1BNV A;  3D9Z A;  3RGE A;  3MHI A;  5JEG B;  3S76 A;  5DSN A;  4K0T A;  3DCW A;  4KUW A;  3C7P A;  1G54 A;  3M04 A;  2FNM A;  3KLD B;  3TVO X;  3U7C A;  5AMD A;  3DVC A;  3HKT A;  1I9N A;  1YDB A;  3JXG A;  3Q31 A;  4HF3 A;  4KNM A;  4YVY A;  1CRA A;  5FLT A;  1KOQ A;  1G52 A;  4ZAO A;  4QSA A;  4CNX A;  1CNI A;  2WEG A;  4MTY A;  3SBI A;  1CAH A;  2FNK A;  2POU A;  1HCB A;  1HUG A;  1FR7 A;  1RAZ A;  4R5B A;  1JV0 A;  4HT2 A;  3FFP X;  5A25 A;  3P3H A;  3PO6 A;  2WD2 A;  3D93 A;  1I9O A;  3P44 A;  1OKM A;  4KNI A;  3VBD A;  1IF9 A;  2NNO A;  1H9Q A;  5L3O A;  4WUP A;  3S77 B;  4X5S A;  5JQ0 A;  4COQ A;  4QJO A;  1Z97 A;  1LUG A;  3HKN A;  2HFW A;  3KS3 A;  5BRW A;  4DZ9 A;  1HCA A;  1TB0 X; 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