The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
64
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structure length |
60
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Chain Sequence |
MMTKKERIAIQRSMAEEALGKLKAIRQLCGAEDSDMQEVEIWTNRIKELEDWLWGESPIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
Hypothetical protein SO2669
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| publication title |
Structure of SO2669 protein from Shewanella onedensis Mr-1, a singleton of unknown functions.
rcsb |
| source organism |
Shewanella oneidensis
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| total genus |
24
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| structure length |
60
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| sequence length |
64
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | SO2669-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ODM A; 2GBO A; 2NR5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DR1 B; 2EIN B; 3CHX A; 3G4S V; 1THZ A; 3T2M A; 2H3O A; 3BY6 A; 1OCO C; 4DR4 O; 4DV0 B; 1JOY A; 1KKC A; 5KA6 A; 2LO1 A; 5LXT A; 1HNZ O; 5B3S C; 4X65 B; 4MVS A; 4LFB B; 3CXC U; 4I55 B; 4FLU A; 2VWJ A; 1KBH A; 1Q6U A; 4P9O A; 1NQT A; 4LF7 B; 4JI6 O; 4DV7 O; 3OMI B; 2JGD B; 4ICG A; 4R7C A; 3ZED A; 5J9P C; 2JDI G; 3ZN1 A; 2E74 B; 3JAT B; 1M9N A; 1KC8 W; 1SER A; 1W59 A; 4O4I B; 3ZRV A; 4K3A A; 2IJI A; 3T1H B; 4ZI7 B; 3KG2 A; 2IU3 A; 4BIU A; 3JD4 A; 3IFX A; 5L3E A; 5KX5 B; 4Z1V A; 5GTH Z; 5EIB D; 4CZZ A; 2EIN C; 3U10 A; 3HKC B; 4TT3 G; 2UUA O; 2F4V O; 4FFB A; 4FM2 A; 1PNL A; 1VMG A; 1I0H A; 5E1A C; 4CH6 A; 1XDC A; 2GV9 A; 3QVN A; 2QSA A; 5LP6 C; 4RO2 A; 3CEI A; 3UM7 A; 1MG1 A; 3KCY A; 4LWS B; 5B5E Z; 2JJ2 G; 1YVW A; 3ZHU A; 1WP8 A; 3ZHQ A; 4MVM A; 4U3J B; 4FLY A; 3L74 H; 2YEV A; 4N21 A; 4X1K A; 1GM9 A; 4O2A A; 3QNE A; 1QVF U; 5CBG A; 4FFK A; 3QO5 A; 2HHH B; 3ZBH A; 1GTO A; 4RUF A; 2B5U A; 3UO3 A; 4TQD A; 3I55 V; 4NR1 A; 1M90 W; 2WLI A; 3ZMU A; 1MZE A; 2YUA A; 4TV8 A; 1NTM H; 3ZN0 A; 2LQT A; 4JZG A; 2D3O W; 1T5E A; 3ABM B; 1I5Y A; 3OT7 A; 1NVP B; 5HFM A; 3UCS C; 3EXA A; 3FB8 C; 2KG7 A; 3B77 A; 5LA6 B; 4UCU A; 1XEQ A; 4GT1 A; 1IXB A; 4X20 A; 1BHB A; 1XNQ O; 1WNS A; 3AG7 A; 2XAF A; 3LSS A; 4F6E A; 1SA0 B; 3B09 A; 4F6R B; 4NKG B; 3STL C; 2Q5Z A; 4B3R O; 4BIZ A; 2ZT9 B; 3G6B A; 4U7N A; 2QTO A; 1Y4M A; 1KUQ A; 1ZX3 A; 3ASO B; 4DV2 O; 1VQ6 V; 1S0V A; 3RYC B; 1OCZ B; 2ZD9 A; 4B08 A; 3LDE A; 1Y76 B; 1N32 B; 1IUR A; 2WLL A; 3E22 A; 3N27 A; 3G80 A; 2E75 B; 3CCR V; 1GK9 A; 2GTS A; 4KUM A; 5LXT B; 3A0H Z; 2HJD A; 1O9H A; 4ZKI A; 1XIL A; 4LFA B; 3JAS A; 2QWQ B; 3A8T A; 2ZM6 B; 1VQ9 V; 3ZIA G; 2ZR2 A; 4J7K A; 1GN3 A; 1SS3 A; 2IJJ A; 4JYA O; 2UUC O; 4PJ0 Z; 1E1R G; 4WFF A; 3AG2 B; 3JD2 A; 4MTX A; 4JI8 B; 3W7X A; 4FMT A; 1XNR B; 4YJ2 A; 3AEI A; 3W7S A; 4QJF B; 3CJH A; 4HBN A; 1Y6X A; 4MTO A; 3JYC A; 4FM1 A; 1K4C C; 2JIZ G; 4G27 B; 2Q69 A; 5B1A B; 1OCZ C; 4DR5 O; 2R72 A; 2VS0 A; 3WG7 C; 2V7Q G; 2DJV A; 2Y4U A; 1EZJ A; 2CE4 A; 4DV6 B; 1N33 B; 4FLW A; 2EZP A; 1OCR B; 1QNM A; 2BOC C; 3HPL C; 1SQV H; 3BCC H; 4MTG A; 5L3G A; 2YIB A; 4P30 A; 1KP3 A; 2V4D A; 3S3W A; 4ABM A; 3K03 A; 4DV1 O; 1XI1 A; 2YEV B; 4GX1 A; 1RM1 C; 4O2A B; 2QWP B; 1M4U A; 4I4T A; 5IY5 C; 2QWO B; 3UKM A; 1PL0 A; 1QLE C; 4UXN A; 2W0X A; 2KQX A; 3CMA V; 3CRM A; 2WLI B; 4LF9 O; 2VQF O; 4TV8 B; 1HDJ A; 1K92 A; 3OEH G; 3MHH C; 3GWK C; 4AHC A; 3JAR A; 4MVO A; 4JGS A; 1RFY A; 3K5N A; 1H8H G; 1IBK B; 1HP8 A; 4JYY A; 2NR5 A; 3ZHT A; 5DM6 V; 5ITZ A; 2LW7 A; 1R3L C; 1SQP H; 2X6A A; 1VQ4 V; 4K35 A; 4X20 B; 3CYO A; 1TA8 A; 2BCC H; 3D3Q A; 4FVM A; 2P67 A; 1DTO A; 4PDV A; 1G1X B; 1PD3 A; 2E5L B; 1DF4 A; 5B1O A; 2OIE A; 4LF8 O; 5B1B B; 5J2U A; 2Q7H A; 3QO7 A; 5KHH A; 4YHH B; 4EFE A; 3MAQ A; 2OIG A; 3IJ4 A; 1MAB G; 4LF6 O; 3E35 A; 2RCV A; 3BFR A; 5L3C A; 3C3T A; 2L35 A; 1H2M A; 1A32 A; 2ITD C; 2WLH A; 3N2K A; 2ZXW C; 2WLL B; 3E22 B; 1VQK V; 5F2V O; 2QWN B; 3OAA G; 1ZWI C; 1XMQ O; 3KZI Z; 1MSW D; 4JI7 O; 2JS3 A; 2Z3Y A; 3FB6 C; 3SYP A; 4PD4 F; 4B3T B; 3SGI A; 1YHQ V; 2UU9 O; 4FJC C; 4YJ2 B; 4IL6 Z; 3CJH B; 1N34 O; 4GYC B; 4O4H A; 3G6E V; 1JPX A; 2DN9 A; 4IGG A; 1YXB A; 4J7J A; 4LC1 A; 1XMO B; 3JAL A; 2OYQ A; 1BCC H; 2QM7 A; 4A5U B; 3HB3 B; 2UUB O; 1J95 A; 3AG1 C; 5KAF Z; 3FYI B; 1QLN A; 1GN4 A; 1BHA A; 2YDE A; 1FXV A; 1K3E A; 1DLB A; 1SKV A; 2PYL A; 2N04 A; 1AI5 A; 4DUZ O; 4RAI A; 3E83 A; 3W7T A; 2QJ1 A; 3FKS G; 3S3X A; 1HNW O; 1U97 A; 3FB7 C; 5JH7 A; 5JQG A; 2XHB A; 5EK0 A; 1FAF A; 1IX9 A; 3CCJ V; 5KUK A; 1YZB A; 4PI2 A; 4MTF A; 5CN0 A; 4LF4 O; 4C7U A; 4I4T B; 1D2D A; 3AG4 B; 4JI2 B; 3IAY A; 3LSQ A; 5LMN B; 4AQY B; 2HVK C; 1VF5 B; 4FZ0 A; 4UVB A; 3ZRX A; 3K04 A; 3QTC A; 2EJ7 A; 4OX9 O; 4FK5 C; 2K1E A; 1K34 A; 3JAM N; 2H8P C; 2Q8V A; 1KKD A; 1Q81 W; 4DV4 O; 4ZBM A; 2XAJ A; 3T1Y O; 2WA3 A; 4CH3 A; 5ITZ B; 5LP6 A; 4I55 A; 5LYJ A; 1I94 O; 5L3B A; 1S3J A; 5IYB O; 3WB2 A; 2YID A; 2FML A; 1MNG A; 1SQQ H; 5BR8 O; 4OPA A; 3JSN A; 2OCH A; 1YJN V; 2W0F C; 3OR7 C; 3OR6 C; 2F23 A; 4MVZ A; 4UVA A; 3KKY A; 3SYC A; 1AVM A; 5J2U B; 1UJW B; 3OMN B; 1M1K W; 3OW2 U; 4KHP B; 1P84 F; 2ADQ B; 4ZI7 A; 2ZQM A; 4HAM A; 3D36 C; 4MSW C; 1F7Y A; 3ZMT A; 4YXW G; 1F51 A; 3X2Q B; 4UCS A; 5KX5 A; 4DW1 A; 2ZIM A; 1PP9 H; 1IVS A; 5EBL C; 3HKC A; 3N2K B; 4GCZ A; 1BQZ A; 5JWP A; 1FXK B; 5EC1 C; 1AJQ A; 1EM1 A; 4EEQ A; 5DN6 G; 4DR1 O; 2Y69 B; 3BHP A; 3SYQ A; 1RSO B; 1MMM A; 1NI8 A; 3CS5 A; 4LWS A; 3Q4H A; 4P9P A; 2ZE8 A; 1N36 B; 1SQX H; 3CCS V; 4DR2 O; 1YIT V; 3R65 A; 4KXR A; 2BE3 A; 3UT5 B; 2CGO A; 1Y74 A; 2ZNJ A; 2Y0I A; 1MA1 A; 3ETE A; 3M99 B; 1EN4 A; 1RPO A; 3JAL B; 2E76 B; 3X2Q C; 4R8C A; 4NXN O; 3BA8 A; 3G67 A; 2LP7 A; 4JAS A; 4Z2W A; 1XBL A; 1B04 A; 3B40 A; 1Z5V A; 5KHJ A; 3R66 A; 1FXK C; 3ASN B; 1FJG B; 5B3S B; 1SET A; 3RBZ A; 1CEZ A; 2HJF C; 2QR4 A; 3BVO A; 2WLJ A; 5JH7 B; 2UXD B; 4LF5 O; 4F6R A; 2AGA A; 4X9Q A; 1QR9 A; 1JCH A; 3AK1 A; 5BY1 A; 4X64 O; 1HNX O; 1H2G A; 4H0L B; 2B9Z A; 1K5S A; 1NR1 A; 3E89 A; 3ETG A; 3SJC C; 2PI5 A; 3D3I A; 2KKW A; 3T4Z A; 2XAS A; 3RYC A; 5IJ9 A; 4FLZ A; 1YJ9 V; 4PDR A; 4LBE C; 1XHZ A; 4LFC B; 1Y76 A; 1YI2 V; 2Q0A A; 2V1D A; 2W6J G; 2RDC A; 3LNM B; 4DUY O; 2YI9 A; 4WFA V; 4UV9 A; 2P90 A; 2CH7 B; 3SJA C; 3GWO A; 2W6I G; 1R73 A; 3ASN C; 2A7W A; 2GDS A; 4QNH B; 3I56 V; 1J5E O; 5LP6 B; 3UQ8 A; 5LYJ B; 3THO A; 4JI5 B; 3RVY A; 2WLM A; 4PEL A; 4UB8 Z; 4TOI A; 1XOU A; 2VRZ A; 1K9M W; 2JEU A; 1GAX A; 1WN7 A; 4I9Q A; 3CME V; 3CRQ A; 4W4L A; 1I08 A; 5BZB A; 4CS3 A; 1QU7 A; 3SDL A; 2JEX A; 2F95 B; 3A0B Z; 2PZS A; 1YTF B; 1QVG U; 4YJ3 A; 2DWE C; 3MDS A; 4AIL C; 3OTO B; 4MT8 A; 2AW9 A; 1HR0 O; 3ZX6 A; 3WU2 Z; 5EYP B; 3APO A; 1N32 O; 1AJP A; 1U96 A; 1GMG A; 2AXT Z; 4YY3 O; 4NVP A; 4WFG A; 3Q4H B; 1VF6 C; 1VQ5 V; 2WWW A; 5IWA B; 4LFA O; 2ZM6 O; 1R6T A; 1PM9 A; 2CUG A; 3DXR A; 2IM9 A; 1Y66 A; 5JCO C; 4K8X A; 1HWY A; 2PI4 A; 2VQE O; 3P32 A; 1G8M A; 1Y74 B; 4WFE A; 1XNR O; 1M93 A; 2X6C A; 4N23 A; 2OCC C; 4B7E A; 1AJN A; 2BOB C; 4JAA A; 4J41 A; 4DW0 A; 4DV3 O; 1J5E B; 5CB4 A; 2KB1 A; 3K58 A; 1S77 D; 2RN9 A; 4UCT A; 3OTF A; 3NXS A; 1Q43 A; 4K0K O; 4ZOL A; 5LL6 Y; 3HKB A; 1AP6 A; 1F4M A; 1VQO V; 2Q7E A; 3T4D A; 3P3P A; 4K8Z A; 1F23 A; 1COW G; 3F5T A; 3GB7 C; 3OE7 G; 1TUB A; 1BMF G; 1N33 O; 2UXB O; 1EFR G; 3ABL B; 1R3I C; 3QG5 A; 4B7K A; 1XHX A; 2HLD G; 5BMV A; 3P30 A; 4GKJ B; 2P5O A; 4NXM O; 2XTA A; 4G2K A; 1W2B U; 1JVM A; 5IJ9 B; 2ARH A; 3WG7 B; 2PY5 A; 3JCZ A; 2LGW A; 5LMU O; 1NT2 B; 1P7B A; 3H1H H; 1IZ3 A; 3CCV V; 4NTY A; 3RYF A; 2IJK A; 2LFS A; 2JJ1 G; 2RNB A; 2UUA B; 3K5L A; 3AK2 A; 3M7M X; 2F4V B; 4TUY A; 2ZIN A; 5LHG A; 5C8Y A; 1IBK O; 1XUQ A; 3I5D A; 3IGA C; 1VQN V; 3ABL C; 2HVJ C; 5IDJ A; 2UXC B; 1MOF A; 1RM1 B; 3RGB A; 1KMI Z; 5IY5 B; 1N0N A; 4QE9 A; 2FL4 A; 4QE7 A; 2QDO A; 1JJ2 U; 5KA5 A; 1QLE B; 2Y0P A; 1SQG A; 4JI0 O; 3L70 H; 3K9A A; 1SRY A; 2QGN A; 4RWU A; 2PYJ A; 2KSD A; 4CS4 A; 4D7T A; 4BW5 A; 1UFI A; 4PA4 A; 1WP7 A; 5EC2 C; 4YJ3 B; 1QBZ A; 5EBM C; 1YEW A; 2D2C B; 5IYD O; 1ZL8 A; 1AR4 A; 3FYE B; 5FPO A; 3SPG A; 3CE2 A; 4QIW F; 3TJT A; 1JX9 A; 3LDC A; 1XNQ B; 4B3M O; 3BA9 A; 3DGE A; 2R9I A; 3J7A U; 3K08 A; 4DR6 B; 4BWA A; 3WFV A; 3DXR B; 1V9P A; 1AB3 A; 5KHK A; 2ZIO A; 3D36 A; 3VQV A; 2XND G; 2YIB D; 3O9O A; 4B3R B; 1KB9 F; 1FFT B; 2LW1 A; 4B3T O; 2Y48 A; 2X6B A; 3AK3 A; 2DWD C; 3JSL A; 4LCU C; 4FLV A; 1R6N A; 4PA3 A; 2E3C A; 2F1M A; 5H5N A; 1GM8 A; 4DV2 B; 5EIB C; 4RQF A; 2DYS C; 2ZXW B; 2Q9L A; 1Q90 D; 1XMO O; 5CB4 B; 2JK5 C; 1CXZ B; 3F5W C; 3ZRW B; 4ZOL B; 5JJN B; 4JYB A; 3B2E E; 3HKB B; 2P22 C; 4UV8 A; 3K9S A; 1Y67 A; 2BSK A; 5EZY A; 4DR3 O; 1KQS U; 1TUB B; 3PN1 A; 1V54 B; 3RYH A; 2EIL B; 1WB8 A; 3DSQ A; 2R9A A; 3SPH A; 1FXH A; 4CH5 A; 5B1N A; 3TXS A; 5BMV B; 1BS3 A; 2WAM A; 2WSS G; 4JYA B; 2UUC B; 1OZ0 A; 1URF A; 1OCC C; 1XL4 A; 2DOS A; 5A2Q N; 2YXH A; 1WPB A; 3CC7 V; 1IXM A; 4J80 A; 3EFF K; 4BIO A; 4IYI A; 3AG1 B; 4JI2 O; 2N05 A; 3OD4 A; 5LMN O; 2RJZ A; 4X62 B; 1FXK A; 1R1B A; 5HFL A; 5KHG A; 3JD3 A; 3BRC A; 2QEX V; 3RYF B; 3T1C A; 4DR5 B; 1BZK A; 3U11 A; 1IBM B; 3ZS8 C; 3STZ C; 4TQF A; 1RSO A; 4TUY B; 1XRE A; 3BPZ A; 2Q7G A; 4LP8 A; 2YIC A; 5C8Y B; 2ILM A; 2BTQ A; 4JV5 B; 2OWO A; 1V54 C; 2EX3 A; 3K3W A; 1SF9 A; 3O65 A; 2EIL C; 5DEC A; 4AI8 A; 2Q68 A; 4IYH A; 4EKW A; 3LDD A; 1N0J A; 4X66 O; 5FLX N; 3UT5 A; 4U3F H; 1EN5 A; 4DV1 B; 1L0N H; 1WLE A; 4MW3 A; 3G71 V; 1G6U A; 1IBL B; 2A06 H; 2F43 G; 4J11 A; 1XL6 A; 4QGP A; 4IT5 A; 4DYL A; 4WFB V; 4GLX A; 1IDS A; 4RUE A; 2YC0 A; 1SQF A; 4LF9 B; 5CMU A; 2VQF B; 5IT9 N; 2QM8 A; 3OGI B; 3CRR A; 2ODM A; 1M57 C; 3ZJZ A; 2AHY A; 4NTX A; 1ZL8 B; 4XDJ A; 3P3N A; 4G28 B; 3SJB C; 2ZKO A; 5JJJ B; 2FTK A; 4J7Z A; 3RYI A; 1KD1 W; 1Q5O A; 4LH7 A; 3C90 A; 1N36 O; 2LJ2 A; 3K59 A; 1M5I A; 2R9R B; 2M7W A; 2EIK C; 1FYJ A; 2DQ3 A; 1I5X A; 2O57 A; 2CH7 A; 2IH3 C; 1L1F A; 3CRA A; 3RT3 C; 2UXN A; 3TCU A; 2EIJ C; 2QKC A; 3ZMV A; 1Q86 W; 1KYO F; 3MD0 A; 2PTM A; 1VF6 A; 2DYR C; 1BSM A; 2BSK B; 5EZY B; 1XMQ B; 4PA9 A; 2YXY A; 4CC5 A; 4J9Y B; 3RYH B; 1M56 B; 4JI7 B; 4NYK A; 2L6L A; 4CBC A; 2Q0O C; 4B3S O; 1Q6I A; 4Q6G A; 4LH6 A; 2UXD O; 5JCO A; 4O4J A; 4UB6 Z; 1B6Q A; 1K97 A; 2UU9 B; 4JI1 B; 2EZO A; 2C2A A; 4PDL A; 2A0L A; 1N34 B; 1VIB A; 3CP1 A; 4LR3 A; 4TSF G; 3HKD B; 4UCV A; 5LOV B; 3W7U A; 2Z0A A; 4PI0 A; 3H1I H; 1V55 B; 2UUB B; 5EYP A; 2RQ6 A; 4X8A A; 4EB6 A; 1HW7 A; 2QE7 G; 3RN4 A; 3CD6 V; 4ZHQ A; 3CX5 F; 5LGU A; 4X88 A; 1Q8I A; 4DV0 O; 1NH2 B; 2BTQ B; 1QR8 A; 4YIO A; 3CCU V; 4DUZ B; 1VEW A; 1ZSP A; 4X65 O; 1HNW B; 1M56 C; 2XT9 A; 4LFB O; 3AG3 B; 3U0Z A; 1FFX B; 2ZE6 A; 4LF7 O; 1E1Q G; 1R3K C; 5IJ0 A; 3WB0 A; 4HNA A; 1ZLZ A; 3HKE B; 4FM0 A; 2F66 C; 4QPJ A; 3OUF A; 1WPX A; 4QPK A; 4L87 A; 3T1H O; 3CC2 V; 4BAY A; 4DV5 B; 4J42 A; 5JVD B; 1JQ0 A; 2HFE C; 4X1I A; 1EZV H; 1V55 C; 2GUZ A; 3ZHV A; 3ZRS A; 1AI7 A; 2EBO A; 4DV4 B; 3OTO O; 3T1Y B; 3DC6 A; 2X0L A; 4HYO A; 3L72 H; 5LHI A; 2JS5 A; 1NVP D; 4MS2 A; 2MK3 A; 3E8G A; 3RYI B; 1I94 B; 4O2B A; 3AG3 C; 3F7Y C; 4I7Z B; 3A0R A; 5BR8 B; 3K06 A; 2GBO A; 4BR6 A; 1ORQ C; 1SQB H; 5IWA O; 1YF2 A; 2ZE7 A; 4JF3 A; 2P6J A; 1H2S B; 5B66 Z; 4JI4 B; 2A79 B; 2HHH O; 2OTJ V; 1MZF A; 2ZCE A; 2WA4 A; 1GN2 A; 4JI3 B; 4D7S A; 4WBN A; 3ETQ A; 2XAG A; 1VAR A; 1MSD A; 5JJE B; 1E79 G; 5IE9 A; 3H01 A; 4IHJ B; 2LGQ A; 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