2NRXA

Crystal structure of the c-terminal half of uvrc, in the presence of sulfate molecules
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
GLRKEALEELMKLLNMKDFPYRIEGIDISHLQGKYTVASLVVFEDGFPKKGDYRRYKIEQDHPDDYESIRTVVKRRYSKHPLPNLLFVDGGIGQVNAAIEALKEIGKDCPVVGLAKKEETVVFENREIHLPHDHPVLRLLVQIRDETHRFAVSYHRKRREKESLRSVLDNVPGIGPIRKKKLIEHFGSLENIRSASLEEIARVIGSTEIARRVLDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords UvrABC system protein C
publication title Structure of the C-terminal half of UvrC reveals an RNase H endonuclease domain with an Argonaute-like catalytic triad.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08459 UvrC_HhH_N UvrC Helix-hairpin-helix N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.150.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle DNA polymerase; domain 1 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain 2nrxA02
3.30.420.340 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nrxA01
5J2BA 4XA5A 5IIJA 5J2AA 4DSFA 5DB7A 2IA6A 5J0YA 3SV3A 4QZHA 5BOLA 4YG2A 4RQ5A 2KFNA 3ISDA 4QWBA 2JEFA 3HP6A 4DSLA 1ZETA 5KG1A 2BPCA 3RB0A 5KG0A 4RQ0A 2BGWA 5KFTA 5HP4A 1NKCA 2Q0ZX 1S97A 4DF8A 3Q8PB 5D46A 3RJKA 2KN7A 4KMUA 2ALZA 4EEYA 3MDCA 4GC6A 3KHLA 3RAQA 4YR3A 3H40A 3GV8B 1X2IA 2KFZA 5KFDA 3G6VA 1KDHA 2VA2A 1ZJNA 1N48A 1QSLA 5KFZA 2NRRA 5J0XA 5D4BA 3M9MB 4E0DA 7ICVA 1S0MA 2W9BB 1KRPA 8ICSA 3C1ZA 3LDAA 3BQ1A 5CJ7A 5L1KA 2ZTEA 3ZD9A 3PMLA 1UA1A 2HHSA 1SKSA 5KG5A 3EZ5A 5DGAA 2A1JB 5KFAA 1S76D 4NM2A 1BPYA 1K1SA 4RPYA 2R8JA 3FDSA 3JPSA 3RH4A 3RJJA 1DGSA 4ED2A 1ZQUA 2ASDA 4F4XA 2AGQA 1JN3A 4ECTA 1NKEA 4G3IA 3PW5A 3RH6A 2BQUA 2V4RA 3T5LA 1TK8A 2AQ4A 4Z6FA 3JPTA 2ZUCA 1Z00A 1D9DA 3RJHA 3M9OB 2F1HA 1ZQWA 3ZDEA 5KT2A 3MGIA 4J9KA 8ICHA 1ZQGA 4NXZA 7ICIA 8ICNA 3GILA 3UXNA 3EYZA 4M0AA 3RBEA 9ICSA 4MFFA 1X9SA 4F5RA 4JV2A 3JPPA 3MABA 4DOAA 3UXPA 8ICYA 1WCNA 1U9LA 4MEYA 4EYHB 2J6TA 3THVA 3M9NB 2JEIA 3BDPA 1TAUA 3Q8SB 3Q8QB 4RUAA 4RQ1A 4BGDA 2UVUA 2FMPA 4RPXA 3Q8LA 4PPXA 3V7KA 5J0QA 3C2MA 5KFXA 2PI4A 2FLLA 2HW3A 9ICBA 5DGBA 4O3OA 3K4GA 1H38A 3G6XA 2I1QA 2BKEA 1NK4A 1ZQEA 4I2HA 5JUMA 1MQ2A 5DLFA 3MGHA 2UVWA 9ICKA 5KFUA 1NK7A 5J2EA 4UB5A 2AQ0A 2MAXA 4ED3A 5TZVA 4HYKA 4KLDA 5J2HA 3JPNA 1EXNA 4MF8A 2NRVA 2XCAA 2LYHA 3MFIA 4IQWA 7ICTA 3TFSA 1KFSA 4DL5A 8ICPA 5BPCA 1Z00B 4RT3A 2W9MA 3G6YA 9ICAA 4DS4A 1ZQZA 5DDYA 9ICLA 4M04A 4NLNA 9ICFA 8ICQA 5KTQA 4FO6A 5J2DA 3MR6A 4F4WA 1L3VA 4NLGA 1NJZA 9ICNA 4GXIA 4DSIA 3MR3A 2DFLA 2M9NA 2NRXA 4R8UA 4C8KA 5DB8A 1BPZA 5KFIA 4UB3A 1D9FA 4Z6CA 1CUKA 1XU4A 5KFEA 3PNCA 2HHQA 1V9PA 4I2EA 1U4BA 2BCRA 5CHGA 2BR0A 1S0OA 4KLFA 2FPLA 1S10A 4JK1A 4QZ8A 3EWAA 3B0YA 4ED7A 8ICCA 1TVAA 1A76A 5IIIA 5DBCA 2ZTCA 3N4MB 3ZDAA 3OJUA 4J9MA 2W9CA 4UB2A 4KLQA 4RT2A 1ZQOA 7ICGA 3NTUA 4O0IA 4QW8A 2J6UA 4DSJA 3LK9A 5CWRA 3GIIA 3IHQB 4TQSA 4O5EA 4F5QA 4M9JA 7ICHA 2XC9A 4TUQA 3EPGA 4QWDA 4UB1A 3BQ0A 1QTMA 1LV5A 1S0VA 7ICNA 1AROP 1U45A 1HJPA 4Q43A 1RXWA 2Y1JA 4M2YA 4O3NA 9ICEA 3MDAA 1RZTA 1KFTA 4J9LA 3E2EA 2BDPA 1ZQXA 4M6WA 1IXRA 2W9AA 3TQ1A 4BXOB 3ZDDA 1COOA 4DFKA 2XY6A 3C2LA 3QE9Y 3GIJA 4ZH4A 7ICUA 4DQPA 4F5NA 5KFMA 3GQCA 4R8UB 1TK5A 9ICMA 8ICLA 2HHTA 4ED8A 3T5KA 4DFMA 3C5FA 4K4IA 1NK0A 3UQ2A 1NK9A 4RQ6A 4R63A 4UAZA 7ICQA 4YVZA 1X9WA 5J29A 5J2KA 4YR0A 4GC7A 4QZIA 4LZGA 1XS9D 4ECRA 3RJFA 2C2DA 4F8RA 4KITB 4ECWA 7ICFA 3TARA 4UQGA 5CB1A 3HT3A 3MFHA 1UT5A 2XO7A 2KZZA 4O3PA 3JPQA 2W9CB 1JX4A 5KG3A 1L3TA 2BCVA 2KTQA 5J0TA 4J9PA 1SL1A 1ZQIA 4I2CA 2HHVA 5D49A 2AU0A 5KFCA 4ECZA 4O5CA 3C1YA 8ICRA 4UBBA 4I28A 1ZQAA 5J2CA 4NM1A 4QZBA 2XY7A 4P2HA 4PHEA 5CR0A 4C8LA 4TUSA 3V7JA 1XWLA 4DL4A 2IBKA 3H4BA 5J2IA 5KFHA 5J2GA 2IMWP 5CP2A 4M6WB 2BPGA 5KG2A 3H8WA 5DB9A 3H7IA 5KG7A 5IINA 5KG6A 4DQQA 8ICAA 3RB6A 4DS5A 4C8OA 3QZ7A 3OSPA 1BGXT 4YCXA 4YXMA 2WTFA 3MR5A 1XSNA 2P6RA 2BQRA 1NK5A 2P66A 1ZQLA 4ECQA 4Q8FA 9ICCA 5DQGA 2ZUBA 4ELVA 4NY8A 4MFCA 4YFKA 2MUTB 3M8RA 3QEBZ 4K4HA 1NJXA 3T3FA 5DB6A 1ZQFA 3RB3A 4J9SA 3PX0A 2BCQA 4ECXA 1QSYA 1ZQJA 5CA7A 8ICKA 2FMQA 2GWSA 8ICUA 1JIHA 7ICLA 4R65A 4QWAA 4O3RA 4KLGA 4ECVA 3AU6A 4IRKA 5EWEA 8ICOA 1BPEA 5L1IA 4I2AA 5DKWA 7ICMA 4P4PA 1BPDA 4O3SA 2XCPA 1RXVA 3K75D 4Q8EA 5J2JA 5J0PA 3RJGA 3TFRA 2AJQA 1JMSA 5J0OA 3KHHA 2F1IA 2JZBB 3PV8A 2RDIA 1T7PA 4F5PA 4KLIA 3SZ2A 4RQ4A 1NK6A 1ZQDA 3AU2A 1D8YA 3EPIA 1U47A 3HWTA 5DBAA 4EBCA 5KG4A 4R64A 4R66A 1ZQMA 2IHNA 4NLZA 2I9GA 4B9VA 3RJEA 1ZQKA 1IM4A 5KFFA 4F4ZA 5J2FA 3TI0A 4RQ7A 5EWGA 3PO5A 2HVIA 1NKBA 1U48A 5KFLA 4BXOA 1NK8A 3KTQA 4QWEA 4EBEA 5J0UA 4PHPA 4DSEA 2PFNA 8ICWA 4RZRA 4PGQA 5IILA 2ATLA 3KHGA 4XUSA 3T5HA 4I27A 3PW2A 4F91B 9ICJA 4RUCA 4C8MA 4YMOA 4F2RA 5DG9A 1NJYA 2ZTDA 5IIKA 4RPZA 2PFOA 4B9SA 4J9RA 3RR7A 3GV7B 2W8KA 3C21A 1XO1A 4XRHA 4EYIB 5BOMA 4PHAA 4MF2A 3BQ2A 3LWLA 5HNKA 2B21A 2XY5A 1TKDA 5KFOA 5HHIA 7ICOA 1SKRA 1SZPA 3RBDA 8ICTA 4P4OA 3PR5B 3H8JA 4DQRA 4ED6A 3PVXA 2HHUA 3C2KA 9ICTA 4DFPA 2R8IA 1Y88A 3OGUA 4GXJA 2DPJA 4QZ9A 7ICEA 4KN4A 3HW8A 2C28A 8ICZA 4ECSA 5J0WA 1RPLA 5HHHA 4FS2A 3RRHA 5F9NA 2UVRA 4KLLA 5KFQA 4Q44A 8ICBA 4O5KA 2R8GA 4YMNA 3QZ8A 3RB4A 3PR4A 2H5XA 4IQUA 5KFSA 2RDJA 4DL2A 4KLOA 9ICUA 4EBDA 1HUOA 4F3OA 3MR2A 4JV1A 2KZ3A 4EZ9A 9ICQA 1SL2A 4XQ8A 1S77D 4B9TA 3RTVA 4IQVA 1LB2B 2V4QA 3TAQA 5F9LA 3H4DA 1ZQSA 3KHRA 4RNNA 1QSSA 1MSWD 2UVVA 2PFPA 2HHXA 1Z3EB 5KFKA 3RH5A 4M9NA 1ZQRA 5KFBA 1ZQYA 5KT6A 1JXLA 4F92B 2ASLA 1BPXA 4EZ6A 4P4MA 3HPOA 4RQ2A 4YN4A 2R8KA 5IIOA 4Z6EA 2MUTA 4KLSA 2Y1IA 1QLNA 1BPBA 5L1JA 4J9OA 2BHNA 1T8EA 1L5UA 1XSPA 3PX6A 5KT4A 4C8NA 1ZJMA 3JPRA 4JWMA 1KLNA 4FBTA 5DDMA 2W8LA 7ICRA 2R8HA 1K1QA 4B9MA 4YR2A 3UXOA 3V72A 5KFPA 1ZQQA 7ICKA 5DBBA 4ELUA 4TQRA 4DEZA 3JPOA 9ICVA 3RR8A 4DL7A 1HUZA 5EOZA 2ZJAA 4DQIA 9ICRA 4DL6A 3MBYA 2FMSA 2FPKA 1TFRA 4UB4A 4DF4A 4JWNA 2FPMA 1U49A 2JZBA 1XSLA 4M9HA 4O3QA 4I2IA 3HX0A 3ZD8A 4LZDA 5KFRA 5C5JA 2ZUDA 3C5GA 2C2RA 1ZQVA 3GFKB 4ED1A 4F4YA 4JUZA 4DO9A 5KFVA 2VANA 1KEJA 3OJSA 1ZQTA 4MEXA 9ICXA 1SKWA 4PH5A 4DOBA 3GDXA 1C7YA 1TAQA 2ISOA 5J0RA 4IR9A 3RJIA 2C22A 2VA3A 8ICJA 4DWIA 4FBUA 4LVSA 2NRZA 9ICOA 3Q8MA 4FS1A 2PXIA 1ZQNA 2FLPA 8ICIA 4UBCA 1S0NA 4IQTA 2NRTA 4BWMA 4QW9A 3GV5B 1ZQPA 4DQSA 4I29A 7ICPA 1JXEA 4RQ8A 2XGQA 4I2JA 1X9MA 3PW0A 2PFQA 2V9WA 2ASJA 7ICJA 1L3SA 4DLGA 4YD1A 1L3UA 4KLHA 4NLKA 4I2DA 1XC9A 4K4GA 1MC8A 4YD2A 4F50A 2JEGA 3ORYA 5DQIA 3V6HA 2AGOA 5KFJA 1T4GA 3UPQA 4O9MA 8ICEA 4YQWA 2F1JA 8ICFA 1UT8A 4PHDA 3QEAZ 2J6SA 3AUOA 3PY8A 4IRDA 3RRGA 5KT7A 4BWJA 4KLTA 3M8SA 9ICHA 4IR1A 4QZCA 4ECYA 4RQ3A 5KT5A 4GLXA 5KFWA 4J9NA 4KLMA 2C2EA 1CEZA 2HVHA 3PO4A 4F5OA 3GIMA 1KSPA 4JV0A 4Z6DA 3ISCA 4DLEA 1T3NA 3SYZA 4YP3A 1SL0A 2ZJ5A 4YMMA 1BVSA 3V7LA 3PW7A 4DOCA 1TK0A 8ICGA 5HMMA 1B43A 4M9GA 2FLNA 8ICXA 1NJWA 3FYHA 4PGXA 9ICPA 4DFJA 5KFYA 2BPFA 5L1LA 2IHMA 1UA0A 2XGPA 4M47A 3TANA 3ZDCA 4CCHA 1PZNA 3V6KA 9ICIA 4RNMA 2HHWA 3LWMA 1ZQHA 5EWFA 3ETLA 2VA8A 3BQTA 4ED0A 3N97B 1TV9A 8ICMA 2P6UA 5KFNA 4Q45A 3RAXA 1RYRA 2KZMA 4YXJA 3PW4A 5HMLA 4DL3A 4DSKA 2PI5A 5KFGA 3OHBA 3TAPA 1RYSA 1KTQA 3ISBA 4RNOA 2AGPA 3GIKA 4F2SA 3IM1A 4M9LA 1ZQCA 1DOQA 1D8LA 4UAWA 4RU9A 3PMNA 5DLGA 4UAYA 4ECUA 1KFDA 5L9XA 4MFAA 3PX4A 4TURA 5DQHA 2OWOA 4J9QA 2JEJA 2NRWA 3NGDA 1B22A 2BCUA 1NOMA 4KLUA 2ISPA 9ICWA 4PGYA 3ZDBA 3B0XA 3C23A 4B9NA 4B9LA 4ELTA 4F4KA 5J0SA 1N56A 4TUPA 3Q8KA 1S9FA 3EW9A 2BCSA 5DG8A 3C65A 4IRCA 5IIMA 2ZJ8A 3Q8RB 3OSNA 1A77A 3OHAA 3BJYA 4GXKA 5DG7A 4I2BA 4KTQA 1ZQBA 4QZEA 1MQ3A 1WCLA 3V6JA 4B9UA 2W9BA 9ICGA 3SV4A 4QZGA 3UQ0A 2BQ3A 1ZYQA 4I2FA 7ICSA 4I2GA 4KLJA 4F93B 4KN7A 3SI8A 4KLEA 8ICVA 4QZAA 5KT3A 4BDPA 3H8SA 4QZDA 3T5JA 4X5VA 4QZFA 4QWCA 2DPIA 2A1JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VCPA 3NF8A 5J2AA 4O3MA 3CJAA 5DB7A 4CF1A 5GIPA 3F9MA 3WK8A 3SV3A 3VPZA 2ZM6K 5BOLA 3K57A 2LYBA 1YJ9N 3ISDA 2G8VA 3CC7N 2D0AA 1VQ5N 2OYQA 3HP6A 5BRHA 1ZBLA 3WK4A 3WT0A 4CIGA 3T1HK 1UCVA 2UYTA 5BR8K 2UUBK 1PUZA 3RB0A 1EQYA 3CCUN 2BGWA 5KFTA 2JWLA 4FWRA 2AP1A 2H3VA 3D2FB 3BF1A 2FBTA 4CEEA 3QEVA 3Q8PB 5D46A 4H0XB 1WYGA 3QO9A 4KMUA 4HCBA 5BRDA 1BHLA 3ZT1A 4EEYA 5AI4A 2ZWHA 5ALIA 3KHLA 4JKBA 4LF8K 2P9NA 4OKJA 1X2IA 1GLEG 1KBUA 3G6VA 5F2RA 3JSMA 4X66K 4XH4A 4ZTJA 2NRRA 7ICVA 1HIWA 5AKJA 1F21A 5KNIA 1IKYA 2W9BB 2HDOA 3OHRA 5SZTA 4BDZA 8ICSA 4FJIA 3C1ZA 3LDAA 2QXLA 2ZTEA 2YV0X 5AI6A 4H0YB 1VQ4N 3UE5A 5BPNA 3F9KA 4CGZA 1KAXA 2WF8A 1FXXA 2GEMA 2QI2A 3KKAC 4PKHA 4RPYA 4BRAA 3RH4A 3JPSA 3J80O 4CJ3A 5BRFA 1ZQUA 3CM6A 1JN3A 3UMGA 4ECTA 4JK8A 2W3SA 4MDAA 3KZBA 2E2OA 3T5LA 4FJKA 3WKDA 1RDFA 3NVVA 2AQ4A 4Z6FA 1D9DA 1KVAA 2I5JA 4AM6A 3V4IA 2F1HA 4QIWC 2CH5A 2HMIA 4J9KA 1EWRA 2E8AA 3SMPA 1ZQGA 3VEVA 4DCHA 7ICIA 8ICNA 3GILA 3UXNA 1GOAA 5M1NA 2ITGA 9ICSA 2YMLA 4MFFA 1N33K 1SZHA 1X9SA 2LM4A 3KLEA 3OPXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5J2B A;  4XA5 A;  5IIJ A;  5J2A A;  4DSF A;  5DB7 A;  2IA6 A;  5J0Y A;  3SV3 A;  4QZH A;  5BOL A;  4YG2 A;  4RQ5 A;  2KFN A;  3ISD A;  4QWB A;  2JEF A;  3HP6 A;  4DSL A;  1ZET A;  5KG1 A;  2BPC A;  3RB0 A;  5KG0 A;  4RQ0 A;  2BGW A;  5KFT A;  5HP4 A;  1NKC A;  2Q0Z X;  1S97 A;  4DF8 A;  3Q8P B;  5D46 A;  3RJK A;  2KN7 A;  4KMU A;  2ALZ A;  4EEY A;  3MDC A;  4GC6 A;  3KHL A;  3RAQ A;  4YR3 A;  3H40 A;  3GV8 B;  1X2I A;  2KFZ A;  5KFD A;  3G6V A;  1KDH A;  2VA2 A;  1ZJN A;  1N48 A;  1QSL A;  5KFZ A;  2NRR A;  5J0X A;  5D4B A;  3M9M B;  4E0D A;  7ICV A;  1S0M A;  2W9B B;  1KRP A;  8ICS A;  3C1Z A;  3LDA A;  3BQ1 A;  5CJ7 A;  5L1K A;  2ZTE A;  3ZD9 A;  3PML A;  1UA1 A;  2HHS A;  1SKS A;  5KG5 A;  3EZ5 A;  5DGA A;  2A1J B;  5KFA A;  1S76 D;  4NM2 A;  1BPY A;  1K1S A;  4RPY A;  2R8J A;  3FDS A;  3JPS A;  3RH4 A;  3RJJ A;  1DGS A;  4ED2 A;  1ZQU A;  2ASD A;  4F4X A;  2AGQ A;  1JN3 A;  4ECT A;  1NKE A;  4G3I A;  3PW5 A;  3RH6 A;  2BQU A;  2V4R A;  3T5L A;  1TK8 A;  2AQ4 A;  4Z6F A;  3JPT A;  2ZUC A; 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 5HMM A;  1B43 A;  4M9G A;  2FLN A;  8ICX A;  1NJW A;  3FYH A;  4PGX A;  9ICP A;  4DFJ A;  5KFY A;  2BPF A;  5L1L A;  2IHM A;  1UA0 A;  2XGP A;  4M47 A;  3TAN A;  3ZDC A;  4CCH A;  1PZN A;  3V6K A;  9ICI A;  4RNM A;  2HHW A;  3LWM A;  1ZQH A;  5EWF A;  3ETL A;  2VA8 A;  3BQT A;  4ED0 A;  3N97 B;  1TV9 A;  8ICM A;  2P6U A;  5KFN A;  4Q45 A;  3RAX A;  1RYR A;  2KZM A;  4YXJ A;  3PW4 A;  5HML A;  4DL3 A;  4DSK A;  2PI5 A;  5KFG A;  3OHB A;  3TAP A;  1RYS A;  1KTQ A;  3ISB A;  4RNO A;  2AGP A;  3GIK A;  4F2S A;  3IM1 A;  4M9L A;  1ZQC A;  1DOQ A;  1D8L A;  4UAW A;  4RU9 A;  3PMN A;  5DLG A;  4UAY A;  4ECU A;  1KFD A;  5L9X A;  4MFA A;  3PX4 A;  4TUR A;  5DQH A;  2OWO A;  4J9Q A;  2JEJ A;  2NRW A;  3NGD A;  1B22 A;  2BCU A;  1NOM A;  4KLU A;  2ISP A;  9ICW A;  4PGY A;  3ZDB A;  3B0X A;  3C23 A;  4B9N A;  4B9L A;  4ELT A;  4F4K A;  5J0S A;  1N56 A;  4TUP A;  3Q8K A;  1S9F A;  3EW9 A;  2BCS A;  5DG8 A;  3C65 A;  4IRC A;  5IIM A;  2ZJ8 A;  3Q8R B;  3OSN A;  1A77 A;  3OHA A;  3BJY A;  4GXK A;  5DG7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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