2NZLA

Crystal structure of human hydroxyacid oxidase 1
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
358
structure length
339
Chain Sequence
RLICINDYEQHAKSVLPKSIYDYYRSGANDEETLADNIAAFSRWKLYPRMLRNVAETDLSTSVLGQRVSMPICVGATAMQRMAHVDGELATVRACQSLGTGMMLSSWATSSIEEVAEAGPEALRWLQLYIYKDREVTKKLVRQAEKMGYKAIFVTVDTPYLGNRLDDVRNRFKLPPQLRMKNFGLAAYVAKAIDPSISWEDIKWLRTSLPIVAKGILRGDDAREAVKHGLNGILVSNHGARQLDGVPATIDVLPEIVEAVEGKVEVFLDGGVRKGTDVLKALALGAKAVFVGRPIVWGLAFQGEKGVQDVLEILKEEFRLAMALSGCQNVKVIDKTLVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Hydroxyacid oxidase 1
publication title Crystal structure of human hydroxyacid oxidase 1
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 131
structure length 339
sequence length 358
ec nomenclature ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date 2006-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01070 FMN_dh FMN-dependent dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nzlA00
3AJXA 4Q4KA 4MY1A 2ATSA 2FPTA 4RCXA 3W87A 3W7KA 1ZAJA 1RZMA 4TR9A 1KBIA 4RZ6A 3GVGA 4NJHA 4AWTA 1DQXA 1TPUA 5H2ZA 1PL9A 1GZGA 2NWRA 5E93A 4D2JA 1T96A 5HULA 4AWSA 2I14A 1SQ7A 2V2DA 1IXNA 1FXQA 2ZZ3A 3O6CA 4LNYA 4TU1A 3S9YA 3WK1A 2C3ZA 1JUKA 2Y62A 3W2UA 3DFQA 4AF0B 4KWVA 2I9EA 1XFBA 1YYAA 2Z0IA 4PA8A 3EEGA 3NQMA 3ZS4A 1PCKA 4NJIA 3C2FA 3CT7A 3LTYA 3E9AA 2CLHA 4HSOA 1TV5A 1MEWA 1S5VA 1TPWA 3ZR4A 4DPQA 3UQNA 5D09A 2C18A 4UCGA 3DU0A 5AHNA 4R53A 2VFFA 4O13A 4O15A 3UWYA 5IBXA 3RMJA 3B04A 4B5NA 4NZFA 3L66A 5AYXA 1XL9A 1LM1A 1JR1A 3WK3A 1LBLA 4FEZA 1YTDA 3TAKA 1TMHA 4UTMA 4MLJA 2A7NA 3GLCA 5FF3A 2A4AA 1SO4A 5HNRA 6ALDA 1QO5A 4JTHA 1X7FA 3U6WA 1D3GA 4K39A 3TX9A 1W5MA 1GPWA 2HTMA 5I3GA 2GQ9A 1IGSA 3C2RA 3LXCA 4NQ1A 3UWWA 1WBJA 1VLIA 2RHGA 3LXAA 2V2CA 4I7WA 3IIOA 4XBSA 3ATYA 4HT3A 3WK0A 4AMAA 2DZPA 2CW6A 4ZVJA 2RDWA 2V82A 4JX6A 5J5DA 2F84A 1JUBA 3PULA 3EKLA 4FXRA 3TE9A 5DCDA 1RVGA 3G0SA 4UFHA 3NYZA 4QM1A 5AHLA 2CLFA 4O14A 3C2EA 1X8FA 2C16A 4LTSA 1JCXA 1L6YA 3MI6A 3VCRA 1YXCA 2WSQA 3GYEA 1Z42A 2NUXA 3W2KA 2OZ0A 1UB3A 3OVQA 1C9DA 4LV4A 1JCJA 1EIXA 2C13A 2NX9A 2OT0A 4MFEA 3B0UX 4A2RA 3A23A 3W1XA 4M19A 4UTTC 4JTSA 1BWLA 1L9WA 3M44A 3NQAA 4WZHA 3UPWA 1LLWA 4ZMGA 3A22A 3VKJA 4O12A 4HHPA 4QISA 4N02A 1B57A 2QKFA 3VI2A 1TSIA 1LOSA 4PC8A 1WQ5A 3GDRA 5D02A 1DJQA 4UMAA 3M7WA 3NPVA 3E0IA 4WOQA 3TNOA 4UNKA 3OVRA 5K4ZA 4R7JA 3EXRA 3HPZA 2H90A 3W9ZA 5ABTA 2VOMA 4N6FA 3UD6A 4OGZA 3BLFA 1KV8A 1DOSA 5KSWA 2Y7GA 1C8VA 1RR2A 4LS1A 5C6MA 1OX5A 3W7NA 5HINA 1ALDA 3GXNA 1OF6A 1TPDA 2X30A 1LRNA 3ANYA 5EBUA 3L21A 2YYTA 4JTGA 4BI6A 4JY8A 1QCWA 3B8DA 1FWSA 3RU6A 1KTNA 2ZZ1A 3R12A 1LYXA 4ORMA 1GVOA 2QCNA 3BLIA 1LORA 4E2DA 3MWAA 1K02A 4LS2A 2VENA 1NF7A 3PBYA 2JGQA 4WQ6A 3W75A 5F4XA 3MP4A 3RFAA 1X1ZA 3LX9A 4RLIA 4O28A 3ELFA 4IOTA 3ZFHA 3TFCA 3I6RA 1LOLA 5C55A 4BFAA 2A1YA 1S5TA 2GJNA 3P74A 1K7EA 1IIGA 1W56A 3WJSA 1A53A 2V2HA 2Z6IA 3N9SA 3NR0A 3ABRA 4UTKA 4MYXA 4UTJA 1FBAA 4POCA 5AHFA 4JNMA 4P61A 1K7XA 4YWIA 5HWNA 2YYUA 3LRKA 2G97A 1SW7A 1H1YA 3EB2A 1A5AA 1KM5A 2PRMA 3NGJA 4LS0A 1M7PA 3GDLA 3LCLA 3NOEA 3HPSA 3W86A 2NX1A 3C0JA 2A7PA 3IVTA 3IEBA 5BNKA 3QMTA 5G2WA 4JS3A 4LOCA 3S42A 2A5HA 2QAFA 1OK6A 2ZZ5A 4MVAA 5CPLA 3EKZA 1ZENA 4XKYA 3NO5A 1M5WA 5EYWA 4EF9A 1QNVA 3N14A 5I3JA 5IBXC 3LHUA 5U7SA 4DPPA 3G1YA 4FIQA 1S3HA 3BV4A 3MO7A 2WQPA 3NNTA 4DF0A 1RQEA 3NZRA 1KTCA 2YGYA 4NNAA 5LNUA 2WNNA 2WPBA 1Q3NA 2B7NA 3W6YA 3P67A 1NF0A 5EMUA 4H6KA 3QQ0A 1JVNA 5D05A 3O07A 5AHEA 2YPIA 1P0KA 2GUUA 2NV1A 3W1QA 3P81A 1SZNA 3T4CA 4CQ8A 3KVMA 1JRCA 2Y6ZA 5AYYA 4QSHA 1H51A 3W7DA 2R8WA 1UJPA 2EGZA 3BW4A 3M5ZA 4EWND 3UWQA 1YDOA 5LNSA 4C1KA 1YTKA 1OFOA 3NPWA 5T26A 3W85A 2QUUA 4WD0A 4K6AA 3FJ6A 4JTLA 4O0KA 4EVZA 2VELA 3IGXA 2JKPA 3EX4A 1AG1O 1ME9A 2B0MA 3QW4B 2J9YA 3ABOA 4RK8A 4NUWA 4UTLA 1A5CA 2DORA 4FHAA 1OFAA 3E12A 4YCPA 5D04C 3SJ3A 1JQXA 2WOQA 2XFWA 1HO1A 3UNDA 1K3UA 4Z0SA 1S5WA 3HB9A 4NVTA 4BI5A 3SW6A 1LZOA 3LHWA 4RKAA 1VYSX 4UTIA 4O53A 1P0NA 4Y96A 2F7FA 2W6RA 3BW2A 1G6CA 1QAPA 5HWMA 5LZLA 3C52A 3UXDA 1GG0A 3PY2A 5GVJA 2A0NA 3UXAA 4FF7A 3DHDA 1IXQA 4YL2A 2QUTA 3P62A 3PG8A 3FKKA 5F4SA 3O15A 4N4PA 4FIRA 2G95A 2NX3A 3LV5A 1KV5A 2QR6A 1H7PA 1ZALA 1V5XA 4AF0A 1KM0A 2DZXA 4UFIA 1KM4A 1NVMA 4UXDA 3M0ZA 4M6PA 1G7UA 3BW3A 1ZHAA 4K38A 4ZQNA 3IGUA 1N7KA 3LHVA 4FB7A 3G24A 3W1LA 3GDMA 3QMRA 1PIIA 3DKJA 3O06A 1SFLA 3IRDA 4JTKA 1W3TA 3O6YX 1AW2A 3MI3A 3EWXA 3QFEA 2VEIA 1OJXA 5HJLA 4O11A 3GNNA 2FLIA 3LTPA 3NQFA 1EUNA 2HSAA 1GT8A 3NEVA 3TK7A 4OQVA 2ISVA 4PL1A 3UZJA 3LERA 5H91A 3CB8A 3N73A 3LCWA 2XN0A 3VE7A 3GB6A 1NAL1 3TDFA 2ZA2A 2NXGA 3G0UA 5CSRA 2WNZA 3T40A 2FFCA 5F4WA 3BG3A 3FA5A 3GR7A 3MHFA 1FUYA 3KAOA 4Z1CA 4JTIA 3LHTA 3A9IA 2PE4A 1WDWA 3GAKA 2A85A 1NEYA 3TUUA 2CLLA 6TIMA 4XWUA 1O95A 3W1UA 1XKYA 2DJXA 4DF1A 2B7PA 4IXXA 1GVQA 3NPUA 4X22A 3EWUA 2A6NA 1H1ZA 3G1SA 3PBVA 1WX0A 3DENA 4O1AA 4UTTA 1MEHA 2V5BA 2E77A 3G18A 1O60A 1QPRA 2BXVA 4PTNA 2FQIA 1QO2A 4IMGA 4A22A 2JBMA 3QH2A 4YMZA 5KTLA 3NL3A 3HGSA 3SFKA 1F74A 4K8HA 1W31A 4ALDA 2OCZA 4MJZA 4MKNA 2Y85A 2E5BA 3B05A 2CZDA 2C15A 3DZ1A 5KMYA 2Y7FA 2EKCA 1UUMA 3LCGA 1SO3A 1GVFA 5D03A 3HQ1A 1ZFJA 4M6QA 1H60A 3G1DA 4JD4A 1QWGA 4MOZA 3SECA 3MW7A 3QC3A 4M7SA 1G4SA 1QDSA 4TMBA 3S1UA 3H53A 4O1DA 1L6SA 4OV4A 2ZA3A 5D30A 3TMLA 4JX4A 1SUXA 3P5ZA 1TQJA 3A21A 3W7JA 1YADA 3E02A 5G4WA 1A5SA 3F1QA 4Y90A 5AC7A 3CWOX 3PG9A 3SGUA 4Z08A 1ICQA 4JTUA 3L5MA 1OFEA 3N34A 5D2VA 1QOPA 4AVFA 1V7YA 2VFGA 4K7VA 3PBWA 2LLEA 5D38A 2Q3OA 1LBFA 3NM3A 3TQKA 1O5KA 4LVFA 2C19A 1VLWA 3L9CA 2FTPA 2ABBA 4JYEA 1F76A 2J27A 4BR1A 1OX4B 3DGRA 3EWZA 1OVDA 1HG3A 1R2RA 1SPQA 1Z48A 4AHOA 4BWLC 3C2OA 4JTJA 4MZYA 3O1NA 2CWNA 3NA8A 2FB2A 4S2BA 4EOUA 3CHVA 4WY0B 1N55A 4FX7A 4JICA 1R2TA 1JCMP 2A21A 5KZDA 3W7EA 3WK2A 3B4UA 2VXNA 5EY5A 2ZTKA 1FWTA 3G1VA 4CNPA 2NWSA 3G0XA 3R13A 5CZ0A 1FWRA 3IVUA 1M6JA 2RKXA 5TBOA 3M41A 4P2VA 4YXGA 4MFDA 1OFDA 2YSWA 3O16A 4O57A 4IX0A 2WJZA 4K8EA 3QZEA 5LSMA 1OYCA 2Q8ZA 2E1DA 5F2MA 4FNUA 4U4MA 1NSJA 5D32A 1TPH1 1SO5A 3EWBX 5G5IA 5G1YA 1KFBA 3SIZA 2HMCA 4O8RA 5EA9A 2TYSA 2WSYA 3CTLA 3YPIA 2UV8G 1KM6A 2GQAA 3UYCA 2YR1A 5K9DA 4UR7A 1BKSA 2BLEA 1YDNA 5G4EA 3M5YA 3W88A 3THAA 1YPIA 2CFFA 3FEMA 3C56A 3W76A 3W7OA 3CC1A 1D3HA 1VYPX 1GEQA 3TCEA 3CQ0A 1LDCA 2VKZG 1SFJA 2NLIA 5F2IA 4S2CA 4O17A 5CPNA 3BLEA 1KLZA 2CZFA 3KX6A 4M7TA 3NQ7A 3TKFA 4YCOA 4E2BA 1SSDA 3P82A 4PH6A 3ABSA 4IWWA 1EX5A 3T44A 2PRHA 5AC6A 3N3MA 4JGDA 4WX2A 3OVPA 3W71A 2IQTA 3DHFA 5FF7A 5LNWA 4IUOA 1GG1A 1MO0A 1TPEA 2E5DA 4QNWA 3QSRA 3FKRA 5CZSA 3MI2A 1TB3A 3S0CA 1OK4A 4N9EA 4KKXA 4Q32A 3S5OA 2YZRA 3GK0A 3TA6A 1ZY9A 3H55A 4DO4A 1OFQA 1HUVA 4GUFA 3ZWSA 4DEFA 3PSWA 5FEZA 1ICSA 3P5YA 5I3HA 2E5CA 5TQLA 4RV8A 1QPOA 2Z2UA 4DF2A 4WY0F 1VCVA 1U5JA 3NXFA 2J6XA 1UCWA 1JCYA 2NUWA 2BTMA 2V81A 3S8HA 1LRQA 2X1UA 3G3MA 1PHQA 3NM1A 3HPXA 3Q2DA 2JKAA 3UWUA 4NXSA 1CX9A 3S1XA 1ME8A 1Q6OA 5DXXA 2J24A 3OG3A 3L2IA 2H3BA 3NL6A 3SI9A 3W73A 3W1TA 4N2YA 2VC6A 3GKFA 5AN7A 5SWUA 2ZCGA 3PVFA 2E6FA 2ZA1A 3FFSA 3KVKA 3C4UA 2R94A 3C6CA 3ATZA 3LBCA 3W2LA 2OJPA 1WXJA 1EP3A 2YDAA 3P61A 3CU2A 3G8EA 3LRMA 3LRLA 2PRLA 4HPJA 1KLYA 1SR9A 1WOBA 3FJLA 2BWGA 3NL2A 4O52A 4KFPA 3DAQA 3H54A 1EEPA 5FF2A 3STFA 2E6YA 4JYDA 3TXVA 3W7MA 1H62A 1LRTA 1XBVA 5HUOA 5CKSA 3FS2A 4IMEA 1TTJA 1TPFA 2ZFAA 1IXPA 1PHWA 3PBUA 2XN2A 4LVDA 4N9BA 3OEXA 1I2NA 3NL5A 1VHCA 1G67A 2DU2A 3PC0A 4XTIA 2KZHA 4A2SA 4QJ1A 4BI7A 1W54A 3K30A 4RJEA 5G2HA 3FYPA 3DFOA 1EWDA 3A24A 2GQ8A 3QSTA 2AAMA 1G7VA 1OFBA 1H7NA 1ZNNA 3JR2A 4N9DA 2HS8A 5DCEA 3I65A 2QCGA 5LNVA 4MYAA 1DJNA 1VRDA 3OBKA 2FPVA 4FNPA 1AMKA 4HPXA 4OHQA 3ZWTA 1K03A 2QEZA 2ZZ4A 4O0ZA 3TXZA 5HR6A 1I2QA 3LHYA 3S1WA 5HQEA 3LXBA 3W7QA 2ZZ6A 1DV7A 3M9YA 3NDOA 1LOQA 1BWKA 3E49A 5BMXA 2WSRA 4ICNA 3INPA 1VHNA 1AL7A 1L2UA 2WNQA 3W23A 1AK5A 4GUHA 5HMSA 1C29A 1TQXA 1WYIA 1I8JA 4XUGA 1I2OA 1GYNA 3GDKA 3W70A 1R47A 1SU5A 1IXOA 2ZZ2A 5LKYA 2ZRVA 1ZCOA 2Y7DA 4RXGA 4CNNA 4O16A 4EF8A 4G1KA 2ABAA 3PB2A 3VFLA 4GRSA 1QR7A 1SW0A 5D2TA 4RZ4A 4A29A 4KWWA 1EP2A 2CZ5A 4NXKA 2RDUA 1XC4A 4RR4A 3TSMA 2WKJA 3W7HA 4HNUA 5LNRA 4PCFA 4JY9A 3W07A 5LGZA 1KFCA 1YDVA 4WJEA 5K2ZA 3BGJA 3I7SA 3Q37A 2J9ZA 4O19A 1TV7A 2VFIA 3MYOA 1O94A 3R89A 3EWWA 4JDBA 4N9CA 1OFRA 4X3ZA 1PCWA 3DFNA 3MHGA 1RPXA 1G4PA 3BO9A 1J5TA 3L5LA 2BZNA 3HGRA 3N9RA 2GVJA 1JCLA 1W1ZA 2WO5A 4LC8A 1EA0A 4DBEA 4ONVA 4ZQRA 1DL3A 1F05A 3TJXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q4K A;  4H7C A;  4DUX A;  1IHI A;  4TR9 A;  4NSB A;  4NJH A;  4AWT A;  5CC3 A;  2G8Z A;  3FYY A;  4FSA A;  3ALG A;  2G3I A;  5HUL A;  2WXD M;  4HCH A;  4CVW A;  1SQ7 A;  1IXN A;  1FXQ A;  2RJG A;  2YA0 A;  3WML A;  3O6C A;  3CS2 A;  4LNY A;  4MB3 A;  4TU1 A;  5CGM A;  3GTN A;  1L0P A;  3S9Y A;  3WLK X;  3S6T A;  5FJO A;  3W2U A;  2C8N A;  3RAO A;  4JKM A;  5JH2 A;  3N18 A;  1XFB A;  4PA8 A;  1A0D A;  4ZE4 A;  3LD5 A;  1XIC A;  3PNZ A;  3TWB A;  3EEG A;  3GG0 A;  3OPS A;  4H41 A;  3NQM A;  4HZ6 A;  2DT2 A;  3C2F A;  1WUE A;  1XGD A;  3CT7 A;  3MTW A;  1B30 A;  3LTY A;  3IAQ A;  1AQF A;  1V77 A;  3OG2 A;  3WEM A;  1EGV A;  4OBS A;  4HMC A;  1DTN A;  3F2B A;  4H2C A;  1R38 A;  2BFG A;  1ZJH A;  4B5N A;  1XL9 A;  1XIS A;  5JMU A;  1LBL A;  1JAK A;  2OYK A;  4NG3 A;  1AFS A;  3KTC A;  5FF3 A;  3GTI A;  5HNR A;  4IQE A;  1SFS A;  3U6W A;  4AZG A;  1A3H A;  1H49 A;  2BG5 A;  1W5M A;  1IGS A;  4DJD C;  3RIK A;  3UWW A;  2QDD A;  2RHG A;  1UG6 A;  3IIO A;  3ATY A;  4W4Q A;  3VUS A;  3WNN A;  2V82 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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