The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Ponsin
|
| publication title |
Second SH3 domain of ponsin solved from powder diffraction
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
13
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| structure length |
67
|
| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2J6O A; 2CH4 W; 4J9F A; 1VA7 A; 2D8J A; 4JZ3 A; 3H41 A; 2DL8 A; 2C0O A; 1UUE A; 2X3X D; 1HSQ A; 1WYX A; 2SEM A; 2HDA A; 3UAT A; 3I5S A; 2AKK A; 2KXC A; 1OOT A; 1AZE A; 1K0X A; 2ROT A; 2GQI A; 3PVL A; 2RQV A; 2G6F X; 2BZX A; 4RTV A; 1U5S A; 4FSS A; 4Y92 A; 1V1C A; 1M3C A; 3M0U A; 2KRS A; 3EHR A; 1PKT A; 1H8K A; 2NUZ A; 2V1R A; 4OMN A; 3M0Q A; 2KRM A; 1AWO A; 4J9E A; 1RLQ C; 3A98 A; 1E6H A; 4AG2 C; 2J6F A; 2RQW A; 2LJ1 A; 3UA6 A; 4J9B A; 3UF4 A; 3TVT A; 4OMO A; 3VS5 A; 4OMM A; 4K11 A; 4R0K A; 2JT4 A; 4RTT A; 4F17 A; 4OMQ A; 1UDL A; 2A36 A; 2CSQ A; 1ZUY A; 4CC3 A; 1X43 A; 1JXM A; 1WXU A; 3GBQ A; 2FRW A; 1B07 A; 1ZBJ A; 2LX7 A; 4OMP A; 2EGC A; 1GFC A; 1WI7 A; 2O31 A; 4D8D A; 2IIM A; 1GRI A; 2J06 A; 2EKH A; 2L2P A; 2HBW A; 1NEG A; 2EYZ A; 1WLP B; 1Z9Q A; 1ZUU A; 1RLP C; 4GBQ A; 1KIK A; 5IXF A; 3VS2 A; 2DX1 A; 2KYM A; 4JJC A; 2K7A A; 1QWF A; 1AWJ A; 2ENM A; 1K4U S; 1ARK A; 2AZV A; 2I0N A; 5IXB A; 2GBQ A; 3UA7 A; 2F2V A; 5IHN A; 1SHF A; 2ROL A; 2JMC A; 2YT6 A; 1UG1 A; 1X2Q A; 1M27 C; 3QWX X; 1UJ0 A; 2HSP A; 1W70 A; 3C0C A; 4AFZ C; 1NM7 A; 3REB B; 2FG0 A; 3H0I A; 2JMA A; 2DVJ A; 2DL3 A; 1N5Z A; 2XMF A; 2DBK A; 2LCS A; 2K3B A; 2VKN A; 2JW4 A; 3U23 A; 2DBM A; 4J9H A; 2YUQ A; 1S1N A; 2ESW A; 2EGE A; 1NG2 A; 4AFQ C; 2BZ8 A; 4X1V A; 3VRZ A; 1ABO A; 2F2X A; 1UTI A; 2LMJ A; 2C0I A; 2C0T A; 2RMO A; 2JS2 A; 4CC4 B; 2H8H A; 3KFV A; 1PKS A; 2ECZ A; 2KYB A; 1YN8 A; 4AG1 C; 2DLP A; 2V1Q A; 2KNB B; 1NYF A; 2EYW A; 1M30 A; 2ABL A; 2FEI A; 2J7I A; 1JO8 A; 1WXB A; 1UGV A; 1HD3 A; 2LP5 A; 5EC7 A; 2E5K A; 4RUG A; 5IHI A; 1U06 A; 2GNC A; 4J9D A; 3I5R A; 1BK2 A; 2EVR A; 1JEG A; 1ABQ A; 1YCS B; 1QCF A; 2YUN A; 1X69 A; 2X3W D; 4LE9 A; 1EFN A; 1KFZ A; 1ZX6 A; 2EYX A; 5HCK A; 1RUW A; 1MV3 A; 1M3B A; 4RTX A; 2LQW A; 1PNJ A; 2MIO A; 2KEA A; 2FO0 A; 3M0R A; 4E6R A; 2CUB A; 1XOV A; 1SHG A; 2JM8 A; 1AWW A; 1HJD A; 2A08 A; 2YUP A; 1WXT A; 1FMK A; 1WDX A; 2A37 A; 1K0S A; 2LJ3 A; 2DRK A; 2DIL A; 2PZ1 A; 5GJV B; 3O5Z A; 1PRL C; 1CSK A; 2KXD A; 2LQN A; 2RNA A; 1KSW A; 2CT3 A; 1K9A A; 2OAW A; 1GL5 A; 1I07 A; 4LUE A; 2CH4 A; 3PVQ A; 4KRT A; 2D0N A; 4F16 A; 3NHN A; 2RQU A; 2SRC A; 3ZL7 C; 2P4R A; 3SEM A; 3CQT A; 4GLM A; 3TSW A; 1OV3 A; 1CKB A; 4LNP A; 1AEY A; 2AK5 A; 1AOJ A; 3EG2 A; 1WA7 A; 2EBP A; 4A63 B; 1T3S A; 2DL5 A; 1E7O A; 3EHQ A; 2O9S A; 1Y57 A; 2RQT A; 3LH5 A; 2JS0 A; 1J3T A; 4HVV A; 4AFS C; 1GBQ A; 1QWE A; 2BTT A; 1AVZ C; 4DEY A; 2RPN A; 3M0S A; 4ZNX A; 4F14 A; 1OEB A; 2PTK A; 2KT8 A; 1ZUK A; 4JJD A; 4Z88 A; 1GCQ A; 2DM1 A; 2O2O A; 4D8K A; 4ORZ A; 1IO6 A; 1VYU A; 4CC7 A; 1WX6 A; 2K9G A; 2MOX A; 2YDL A; 4AFU C; 4CC2 A; 2EPD A; 2A28 A; 3M0P A; 4RTU A; 2J6K A; 1AZG B; 1YWP A; 1UHF A; 3VS4 A; 2VVK A; 1YWO A; 5FW9 A; 1B3Q A; 2D8H A; 2RF0 A; 2KGT A; 3TSZ A; 1BB9 A; 3THK A; 2DYB A; 4HVW A; 2EQI A; 2FPD A; 5IH2 A; 2JM9 A; 4Z8A A; 1W6X A; 1MV0 B; 2B86 A; 2KRN A; 4JZ4 A; 1FYN A; 3NMZ C; 2GTJ A; 2KBT A; 2M0Y A; 3RBB B; 3I35 A; 2NWM A; 3VS1 A; 2F2W A; 2VWF A; 2LZ6 B; 1WFW A; 1X2K A; 5ECA A; 2DJQ A; 1H92 A; 4DEX A; 5FWB A; 2ED1 A; 2O9V A; 2EGA A; 3QWY A; 2CSI A; 1MUZ A; 2ED0 A; 2FRY A; 4OML A; 5GJW B; 4EIK A; 1NLO C; 1WIE A; 4RTY A; 1AWX A; 3REA B; 3EG1 A; 2CDT A; 1RI9 A; 2D1X A; 3IQL A; 2J05 A; 1K76 A; 2KRO A; 4WCI A; 1Z9Z A; 3FJ5 A; 3ULR B; 1I0C A; 2FPE A; 4J9I A; 1NEB A; 1LCK A; 1OPL A; 1YNZ A; 4J9G A; 5L23 A; 1M8M A; 1JQQ A; 2HEQ A; 1OPK A; 1SRM A; 2OJ2 A; 1K1Z A; 2M51 A; 4HXJ A; 1X27 A; 1T3L A; 2L3Q A; 2L0A A; 2LJ0 A; 2QDL A; 1T0J A; 2L3S A; 2W10 A; 3VS6 A; 3VS3 A; 1TG0 A; 2K79 A; 1AD5 A; 1JU5 C; 1PWT A; 3H0F A; 3PE0 A; 2DRM A; 1U3O A; 4JPB W; 1YP5 A; 2CRE A; 2L3P A; 2PNI A; 1NYG A; 1X6B A; 2JXB A; 1UEC A; 1G83 A; 1QKX A; 1M3A A; 1UFF A; 1SEM A; 1GBR A; 1GCQ C; 1JXO A; 2EW3 A; 1KJW A; 1SRL A; 3EG0 A; 4LUD A; 3EGU A; 4RTZ A; 2W0Z A; 4J9C A; 3NPF A; 3M0T A; 1BU1 A; 3RNJ A; 4HVU A; 5IHK A; 1G2B A; 2KR3 A; 1UE9 A; 1X6G A; 2CUD A; 1TUD A; 1BBZ A; 3JV3 A; 3I9Q A; 1UJY A; 1QKW A; 2YSQ A; 2CT4 A; 1NLP C; 2K2M A; 2EYY A; 1PHT A; 2OI3 A; 1GCP A; 1GFD A; 2DMO A; 1E6G A; 3VS0 A; 4IIO A; 1T0H A; 3SHW A; 1CKA A; 1W1F A; 2YUO A; 2DE0 X; 1QLY A; 2KE9 A; 2O88 A; 4LN2 A; 1SSH A; 4QT7 A; 1PRM C; 1SPK A; 2LNH B; 4RTW A; 4ESR A; 1VYT A; 2AKL A; 2DF6 A; 2KT1 A; 2MCN A; 2AZS A; 1VYV A; 2JTE A; 5FWC A; 2RQR A; 2DL7 A; 3VS7 A; 1A0N B; 4HCK A; 1UHC A; 4Z89 A; 3NGP A; 3H0H A; 2RN8 A; 5I22 A; 2BZY A; 4M4Z A; 2GTO A; 2HCK A; 5I11 A; 1H3H A; 1TUC A; 2FPF A; 2DA9 A; 3EG3 A; 4IIM A; 2K6D A; 2DNU A; 2DL4 A; 1ZSG A; 1I1J A; 3R6N A; 1Y0M A; 3VRY A; 1ZLM A; 2GGR A; 4JJB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2G3R A; 1WZO A; 2CH4 W; 2MMP A; 4J9F A; 4E7H A; 1VA7 A; 2DL8 A; 1UUE A; 2HSE B; 4DBR A; 2SEM A; 5GAN e; 1R8O B; 4PJL A; 1VQM A; 2ATC B; 3JAM E; 4M78 G; 1VQ6 T; 3EHR A; 1PKT A; 1SSF A; 2BUD A; 3V8L A; 3HKS A; 1M90 R; 1IHW A; 1RLQ C; 2WAC A; 3A98 A; 2J6F A; 3FLG A; 2Y4Y A; 3UF4 A; 4EDU A; 3HRS A; 4JS5 A; 1YJ9 A; 4OMM A; 4R0K A; 2OTJ Q; 4RTT A; 3EFR A; 2FL7 A; 5GAO r; 2QAS A; 4OMQ A; 1WHM A; 5GAM f; 3OB9 A; 1WXU A; 1PG5 B; 2F5T X; 2XG8 D; 3RES A; 1B07 A; 3FIF A; 4IUU A; 1IGU A; 4PJO C; 2EGC A; 4NL3 A; 3I55 Q; 2O31 A; 2JTM A; 4D8D A; 1M1K U; 2CP2 A; 3L2Q A; 1GRI A; 2J06 A; 1PSE A; 1Z9Q A; 2K4Y A; 1BI0 A; 1RLP C; 2VYT A; 4JDS A; 3G71 Q; 1M1K R; 2XD0 A; 1VQ5 T; 3VS2 A; 2I2L A; 3CMA A; 2DX1 A; 2KYM A; 3EH1 A; 2K7A A; 3QBY A; 5HK3 A; 4E7K A; 5IHN A; 1O75 A; 5I2S A; 3QWX X; 1VQN A; 1W70 A; 2NUP B; 2LCC A; 2JMA A; 4XAX B; 2DVJ A; 2DBK A; 3PFS A; 2LCS A; 2VKN A; 5I2M A; 2JW4 A; 4J9H A; 4XTV A; 5CKD A; 2EGE A; 2QEX Q; 2BZ8 A; 3S3N A; 2F2X A; 1UTI A; 2JOY A; 2JS2 A; 2H8H A; 1ZA2 B; 2DEU A; 1PKS A; 1YI2 T; 3E9G A; 1VQP T; 1VQL A; 2ZGW A; 3M9Q A; 5GAN 6; 2ABL A; 4HA8 A; 4VUB A; 1VQ7 A; 4PJM A; 4J5Y A; 4M7D F; 1RAG B; 4RUG A; 4PK4 A; 1VQK T; 2HKQ B; 1OUL A; 1WNL A; 7AT1 B; 1BK2 A; 3KBG A; 4QVD A; 2L5Q A; 2RA2 A; 3QZ9 B; 2CYZ B; 4A4K A; 1EFN A; 2E64 A; 2GF7 A; 1TOV A; 1MV3 A; 1SG5 A; 1QQJ A; 2H3J A; 1RAI B; 3PMI A; 4RTX A; 3TCJ A; 4E6R A; 3A1P A; 3JRZ A; 5AYF A; 4PJO G; 5GAM g; 2VXE A; 4E7S A; 4E7L A; 5GMK l; 4MDX A; 2M02 A; 3PMT A; 1WHL A; 1HK9 A; 4C92 D; 1UB4 A; 3G6E T; 3CBP A; 1G3Y A; 2PVO B; 4XQ3 A; 3A8O B; 2RNA A; 1KSW A; 2CT3 A; 2X4Y A; 5KCH A; 1I07 A; 3PVQ A; 2V26 A; 4KRT A; 2D0N A; 3OYJ A; 3OMG A; 4WTO B; 4F16 A; 4M7A C; 3V8K A; 4JRQ A; 5LJ3 g; 1D0X A; 2NUP A; 1BIB A; 2DK3 A; 3M4G A; 1AEY A; 3LGL A; 1M8V A; 4MML A; 3EG2 A; 1WA7 A; 1G3S A; 2C06 A; 1BI2 A; 5GMK h; 2DXT A; 2DXB A; 4JLG A; 1E7O A; 3CCJ A; 3X28 B; 4MMK A; 2E3I A; 3VKI A; 4JRI A; 1X6O A; 5HY6 A; 5FRO A; 2RHI A; 1J3T A; 2QG9 B; 3OQ5 A; 4AFS C; 1GBQ A; 1RAB B; 1AVZ C; 2RPN A; 5HKC A; 3CCM T; 1IGQ A; 1OEB A; 2PTK A; 1ZUK A; 4BAC A; 4D8K A; 5GAM d; 2YRC A; 1ZA1 B; 3MEU A; 1BIA A; 2DXU A; 2PUO B; 2OTJ A; 1KQS P; 2JZ2 A; 4M78 B; 2YDL A; 4CC2 A; 1OZ3 A; 3EGD B; 4ZGD B; 3OW2 P; 3M0P A; 5GAN 2; 1AZG B; 1UHF A; 3VS4 A; 1VQM T; 2VVK A; 3CBM A; 1YWO A; 3QDR B; 5FW9 A; 2AHJ B; 3THK A; 2DYB A; 4N4H A; 2EQI A; 3EFO B; 2FPD A; 4GY5 A; 2JM9 A; 4Z8A A; 3CCS A; 4ANJ A; 3J80 E; 1W6X A; 2KRN A; 5LJ3 d; 3HRT A; 3C12 A; 2GTJ A; 2KBT A; 4EMK C; 4BE2 A; 4FL6 A; 3OYC A; 2DJQ A; 4FW2 A; 3DLM A; 1MUZ A; 2MK5 A; 2FRY A; 2RK1 A; 3OYE A; 2CZ0 B; 2YHT A; 5HK0 A; 1RI9 A; 2D1X A; 5C6S A; 4QQD A; 5KE3 A; 1LNX A; 3ULR B; 5GAM h; 2E3H A; 3CCV A; 2HQE A; 2RI5 A; 4FW1 A; 2FB7 A; 1OPL A; 2Y4X A; 2QEX A; 2WSE E; 4PKC C; 1X27 A; 2Z0W A; 3INZ A; 2L3Q A; 4IKF A; 2VC8 A; 3PE0 A; 2JN0 A; 1VQ9 Q; 3CD6 Q; 1JJ2 P; 2HNI A; 5LJ3 h; 1D1B A; 2RO0 A; 2LDM A; 1WQW A; 4M77 F; 5D6X A; 1UGR B; 3CC7 T; 5IN1 A; 4C0Z A; 1IHV A; 1UFF A; 4M7D A; 3JCM J; 1VQ6 A; 4NL2 A; 1VQ4 Q; 4BB7 A; 1D3B B; 4C5E A; 2EQK A; 5GAM e; 4IUT A; 3MP8 A; 3JB9 G; 4LDX A; 3FRN A; 4LUD A; 4HT9 A; 3VUB A; 4HCB A; 1RAH B; 4BI3 A; 3HSB A; 1MGQ A; 3ER0 A; 4FYV B; 4KUI A; 3RNJ A; 3JCM V; 1X6G A; 2KR3 A; 4JLI A; 1VQL T; 3JV3 A; 1WGS A; 3FC3 A; 1UJY A; 3I56 Q; 2X35 A; 4FM4 B; 2YSQ A; 4J6W A; 4EMH A; 3A5Z B; 1XQH A; 2EYY A; 3GPL A; 4KUL A; 3EFO A; 3VS0 A; 1G3T A; 4F04 B; 5GMK j; 1T0H A; 4RMO A; 2ZPI B; 2DE0 X; 4LN2 A; 4BDY A; 3HFN A; 2VUB A; 1VYT A; 2EQM A; 4MZT A; 2BE7 D; 4M75 E; 1VYV A; 2L89 A; 3VS7 A; 1VIF A; 5CVI A; 3G4S Q; 1VQ5 A; 2H3E B; 3H0H A; 3QJY A; 4J7I A; 4A4H A; 2HL5 C; 4M4Z A; 5I11 A; 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2K5I A; 2HSP A; 5GAN h; 3G71 T; 1QCN A; 3MKD A; 2RI2 A; 4N0A A; 2FVU A; 2DL3 A; 1N5Z A; 4MZM A; 5LJ5 j; 3U23 A; 3SD4 A; 4PJO D; 4IUV A; 2ZZD A; 1B34 B; 2QGF B; 1QW1 A; 1S1N A; 2EIF A; 3ZBD A; 1UEB A; 1JB0 E; 1ABO A; 2QGG A; 2QI2 A; 2C0T A; 3HFO A; 2E6N A; 2KSS A; 4M77 A; 1YN8 A; 4PLL A; 3CCV T; 3VV0 A; 3V7R A; 2DLP A; 2KNB B; 1NYF A; 3CCM A; 2FEI A; 5CKB A; 2QEX T; 1QCO A; 1UGV A; 2RI3 A; 2MF2 A; 2B8A A; 2EJ9 A; 1U06 A; 4M7D G; 1Q7Y C; 3O8V A; 2YLC A; 4E7Z A; 4YTL A; 1Y96 A; 2X4J A; 2LC4 A; 1ABQ A; 4NS5 A; 2V8J A; 2YUN A; 1X69 A; 2EWN A; 1OI1 A; 1ZX6 A; 1IZ6 A; 2QQR A; 3R6O A; 2DYI A; 1MMG A; 2FO0 A; 3M0R A; 1I4K 1; 1M2V A; 1R77 A; 3HTR A; 1KC8 U; 1XOV A; 1SHG A; 2JM8 A; 2ZPB B; 1FWZ A; 1WXT A; 1FMK A; 3G4S A; 5DY9 A; 2A7Y A; 1JRI A; 1KC8 R; 4M7A E; 1K0S A; 4C8Q B; 1WHK A; 2KAF A; 3HP9 A; 1CSK A; 2KXD A; 2DZC A; 3JCM c; 1KK7 A; 3VUZ A; 1K9A A; 4A4E A; 5KYU A; 3UWN A; 4F7U E; 1GL5 A; 4LUE A; 2CH4 A; 1K9M U; 5KYY A; 4AMC A; 2RQU A; 2E41 A; 2K5F A; 2SRC A; 2KQW A; 4FT4 A; 3FDR A; 1K9M R; 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