2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
5AQYA 4BQZA 1MA9B 4CBUA 3LDOA 3HBTA 3VGMA 2YHYA 4J8FA 2FXUA 3M1FA 1HKCA 4WQ5A 5AFUH 1J6ZA 1GLEG 4MO5A 5FPNA 2QXLA 4H0TB 1LOTB 2P9SA 4JHDA 3O6WA 5KQ8A 1JCEA 2E2OA 4A2AA 3P4IA 3EZWA 1X3MA 2Q31A 4B1WB 2VCPA 4RWTA 3QFPA 3H1VX 1BOTO 1QHAA 3HM8A 4K25A 2YJFA 3FR0A 1NBWA 3ATVA 3VGLA 2Q0RA 1X3NA 3EKSA 5AQQA 2GELA 2NLXA 2QWMA 4BREA 3FZHA 3MDQA 1ATRA 3FLCO 5BN9A 4H5TA 2CGLA 3F9MA 1BA0A 5AQUA 5KQDA 2W40A 3TPQA 2YHXA 1H1VA 2GUPA 3BP8A 4BRCA 4DB3A 3DWLA 4JD2A 1RGIA 2QWOA 3DXKB 5AZIA 1TUYA 3ENHA 1YUWA 4BC5A 3MCPA 1S3XA 1GLLO 2KHOA 3BUZB 4EAHD 3WXLA 4BRAA 4HTLA 5AQWA 3HZ6A 2D0OA 3L0QA 3LL3A 3VEOA 2CGJA 4IXCA 5AQRA 4AM6A 3A5LC 3R8EA 3VEWA 1ATSA 1SZ2A 3D2FB 1QQMA 4M7YA 5CE3A 1OKJA 5LJVA 2Q97A 4QS9A 4BVOA 1HUXA 2ASOA 3L4IA 1HKGA 1DGKN 2YJEA 2E2QA 5EY4A 3CIPA 4EHTA 4M63C 3W3DA 3D2EA 4DHYA 5JLHA 5FPMA 4BRNA 4BROA 4CBWA 4BC2A 3LM2A 4CD1A 2E2NA 2QW9A 5BN8A 1GLCG 1G99A 1NGBA 1Z05A 2A6AA 3M6GA 3LDPA 3SK3A 5B8HA 2ZF5O 2QWLA 2A42A 4FSVA 1JCFA 4XEIA 1HPMA 3IUCA 3O80A 1HLUA 4QS8A 3GOIA 4JNEA 3VEXA 1E4FT 2AP1A 2FF3B 3SMSA 1LCUA 1YXQA 4B1YB 3CJ7A 3GG4A 3HI0A 4BRMA 1QZ6A 5BPMA 5LJWA 5FPEA 1NGIA 3IDHA 3GBTA 4ISEA 3WT0A 5AQNA 5AQJA 4H5WA 4FWNA 3VERA 2F9TA 5AZIB 3H6EA 4I6MB 4CZGA 3A8YA 5JLFA 4PL7A 3O1BA 3C7NA 4FOEA 3O1WA 3MK6A 1TUUA 1BUPA 3JS6A 5BRFA 3UKRA 3J8AA 2IIRA 4AM7A 5AZJA 4BR4A 5AQMA 3DJCA 2W41A 5EVZA 1Z6RA 5BRDA 2FF6A 3LM9A 5E84A 3ZETA 4RTFD 3QDKA 2Q2RA 3WQUA 1YAGA 3H3NO 2A40A 2D0PA 4E1JA 3DXMB 3VENA 3D2EB 3VEZA 3CJ9A 5JMVA 4K43A 4BR7A 4MO4A 4CD3A 4FPBA 1K8KB 2GTDA 4H0XB 4B9QA 4BGBA 3AY9A 3VF6A 3WXIA 5FPDA 2FSKA 5LY3A 1KAXA 3EKUA 4PKIA 2Q0UA 4FWSA 2P9LB 1R59O 1NGHA 1U2VA 3UB5A 2P9IB 5KPTA 2A41A 3U8XA 1NM1A 2P9PB 3HSCA 3O08A 2ZWHA 1TYQA 4HWIA 4DCHA 3ZX0A 4LC9B 4GY2B 3H1QA 1NGDA 5AQKA 2P9NA 3O5BA 1YVNA 5AQLA 5BR9A 4BR5A 3AAQA 5AQTA 4BR9A 3QMLA 3ZEUB 4BG9A 5F0XA 1BA1A 1NGEA 4C23A 5EXWA 4Z94A 3KHYA 3OHRA 3CQXA 2Q1NA 2J4RA 3WUHA 4CI6A 1QZ5A 3VF2A 3MMVA 4FL9A 4PL8A 2E1ZA 2QWPA 2PAVA 3R9PA 3UKUA 1ZC6A 4CZHA 2ZGZA 4NO7A 4K41A 3VF4A 3HTVA 1Y64A 4XH4A 4BRLA 4BRDA 4FWQA 3W0LA 4EIAA 4KBOA 4CZMA 5F1XA 2EWSA 1NGAA 3O8MA 1KAZA 4ISFA 4YDUC 3ZX2A 4BRIA 3GDQA 4IO8A 4F9OA 3FZFA 2AA4A 1HX1A 3VOVA 2P9SB 4FWLA 3FE1A 2E2PA 2P9KA 4JHDB 4WQ5C 4WYBA 5AQZA 3MN6A 2H3GX 3WEEA 3BEXA 5BPNA 2BUPA 4BQLA 1NMDA 4CJ7A 2NZTA 4A61A 2F9WA 2BTFA 2IVPA 3VETA 1MDUB 2V51B 4BR2A 2I7NA 1Q18A 4B1ZA 4FWKA 4CZIA 1BG3A 3U9DA 1BDGA 2QM1A 3C0BA 2YHWA 4B1VA 5AQVA 4CZEA 4BR0A 4XH5A 4M7XA 3LDQA 3CJCA 4IJNA 2V52B 4IWVA 3WXKA 1E4GT 5AQGA 2GWJA 3SMPA 1NGJA 1U6ZA 5EOYA 2IVNA 3LDNA 3G25A 4JD2B 3U4LA 4GNIA 2HOEA 2I7PA 1C0FA 4H0VB 3GE1A 3ZX3A 5BPLA 2FLOA 1MWKA 3KZBA 4H03B 5AQXA 4JAXA 3ENOA 5KPZA 1RFQA 3S41A 3VGKA 4FOIA 1V4SA 3CQYA 4NB4A 1T44A 3FZKA 3DXKA 3UKUB 3O4WA 4IZ9A 4MLEA 2QWRA 4B1XB 4CBXA 2QWQA 3CHWA 1X9JA 2V7YA 4FWMA 4PKGA 4H5NA 4FO0A 5ELZA 1WOQA 2UYTA 3IFRA 4CZFA 4A62A 1GLFO 1WUAA 3B8AX 3D2FA 1QQNA 3LDLA 2ZGYA 5AR0A 3SJHA 4QS7A 3WEEB 1P8ZA 4BC3A 3FFKB 1XUPO 3VESA 3A0IX 2ITMA 2ASPA 3CJAA 3I8BA 4H0PA 1T6DA 4BG8A 3ULEA 5I9EB 1KXPA 2A3ZA 1HKBA 2PBDA 2E20A 3RSEA 3ID8A 3QB0A 4BRPA 4BRFA 2FSNA 4O5FA 3VPZA 3UE5A 2YI1A 4H0OA 1QQOA 2VWBA 3IMXA 3AARA 3TU5A 2WUSA 1HJOA 3ATUA 4FPAA 4CZKA 2E8AA 1ZBSA 1DEJA 3A5NC 4CZLA 1RDWX 4L3QA 3SLCA 4FWPA 4EFHA 3C7NB 4WQ4A 5ADXA 3R6MA 1NWKA 5AQFA 3UKRB 2GWKA 2YCHA 2VYPA 3KVGA 3WQTA 1V4TA 5AZJB 4K42A 2GEMA 5TKYA 4BRQA 4I6MA 4Y0WA 1DKGD 2CH5A 4BRKA 2D4WA 5BREA 3CETA 3BF3A 2P9UA 3ZETB 2OANA 1S22A 3JXUA 2FSJA 2NRHA 4H0YB 1GLJO 1SAZA 5AQPA 2HF3A 1CZAN 3QBXA 4B1UB 3EO3A 3FGUA 2D1KA 2HF4A 1MWMA 3MN7A 5F2RA 4BRGA 1ZXOA 1GLDG 5BRHA 3MN9A 3H3OB 3M3ZA 5KPRA 4O8KA 3VEVA 5ADXH 3VEYA 1XC3A 3DXMA 4H5VA 3WXJA 4IJAA 1U2VB 4BC4A 3QICA 3FZMA 3ULEB 4DQ8A 4PKHA 1TYQB 1EQYA 2CH6A 2E88A 3RSEB 1K8KA 3GL1A 3QBWA 2Q36A 3QFUA 3FZLA 4CZJA 2P9NB 3U9ZA 1ESVA 1GLAG 4ISGA 3DAWA 2ASMA 1JCGA 5EX5A 4BVPA 1SQKA 1D4XA 2P9LA 4BRHA 2P9IA 5AQHA 2IVOA 2HMPA 2P9PA 1NGCA 4RCHA 3CERA 1NGGA 5E26A 5AQOA 3BF1A 2E1YA 3D7EO 3L6QA 5AFUA 4A2BA 1C0GA 1T6CA 3ZEUA 1ATNA 5AQIA 3H45C 3MN5A 4FWOA 3A5OC 4WQ4C 3CJ1A 2DPNA 2V7ZA 1IJJA 4MLHA 3AAPA 1NGFA 3CJBA 4H5RA 3A5MC 4JN4A 4FWRA 2P9UB 1BWFO 1KAYA 1BO5O 5JICA 2QWNA 3EL2A 1NLVA 1BU6O 2CGKA 4XH1A 4BGAA 4EHUA 1XQSC 1IG8A 5AQSA 3CI5A 2A5XA 3H46O 2P9KB 3I33A 1GLBG 3EN9A 4YDUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LF9K 1LWEA 4CBUA 4OLAA 3DRRA 3HSTB 4J8FA 4O4GA 4WQ5A 4KHWA 3OYGA 4FM2A 3OBWA 4BWMA 1WBBA 1KFSA 4MO5A 2QXLA 4RW9A 5KQ8A 1NK6A 1R0AA 5KRSA 4IBNA 3RMBA 1X3MA 3ZSRA 3NCIA 1C1AA 4K25A 2YJFA 1DTTA 1NBWA 3AVLA 1VQNN 2Q0RA 3HPGA 1KFDA 4BREA 5A2QO 3FZHA 3MDQA 3THYB 1ATRA 3FLCO 4ZHRA 5KQDA 1BA0A 5EU7A 3PO4A 2FBYA 2GUPA 1BIUA 4GW6A 4DB3A 3DWLA 3LP2A 2NRRA 1EKEA 2O8BB 4FM0A 1U45A 1M1KO 1RDBA 4OVLA 1S3XA 4DG1A 3LAMA 4CHYA 3PIOL 2ZM6K 3PIPL 4EAHD 3WXLA 3NVKA 5AQWA 1NOYA 3OYBA 3MEGA 3VEOA 2X6SA 3A5LC 1JLAA 1SZ2A 2AJQA 1OKJA 5M1FA 3MEDA 5LJVA 3SI6A 4BVOA 3L2WA 3VN5A 3T19A 1SL2A 3K9JA 2G8UA 3OY9A 3CD6N 4NLCA 1RBTA 5EY4A 3PY8A 3O9QA 4YORA 5JLHA 3AVFA 5FPMA 4YOXA 4BROA 2RKIA 1VSEA 1JLFA 3AA4A 4FJXA 1Z05A 3M6GA 3OYCA 2QWLA 2A42A 1UWBA 2FBTA 4XJXA 3MECA 3IUCA 1HLUA 3VEXA 5DK5A 2QA4N 4LD0A 2FF3B 3SMSA 1YXQA 2KZZA 4ID1A 3RVCA 2O8EA 2O8DB 1QZ6A 5LJWA 3IDHA 1BCMA 1U04A 4PWDA 4FZXC 5AZIB 4B9MA 3A8YA 5JS1A 4PL7A 3O1BA 3MXMA 1E3MA 3O1WA 3O9RA 3MEEA 4UQGA 3S3MA 4KFBA 4FJGA 4RW7A 5BRFA 3NGIA 3UKRA 3TAEA 4FJ9A 2IIRA 3NF7A 5AZJA 3QLHA 2OYQA 4BR4A 3DJCA 2HHWA 3L2RA 5J2PA 2G8VA 1HNXK 3NAEA 1I39A 2D5RA 1YITN 1JLGA 1RT3A 1KTQA 3D2EB 3VEZA 5JMVA 2W00A 4K43A 4IFEA 3DLEA 1SL1A 4PY5A 3CCSN 1K8KB 4B9QA 3HT3A 1S1UA 4CGFA 1HR0K 4CJKA 5FPDA 5LY3A 4DV2K 1KAXA 3EKUA 3AA5X 2Q0UA 2P9LB 1R59O 3L3VA 3RMCA 4DFKA 3U8XA 2P9PB 3O08A 3THWA 2ZWHA 1TYQA 2IC3A 4DCHA 1WSEA 1ITGA 3PV8A 4JI6K 4KTWA 3O5BA 5AQLA 1LW0A 3DM2A 4M3YA 3AV9A 1QVFM 4YOYA 1IH7A 5HP1A 1D5AA 3I56N 1BA1A 4EP4A 3S3OA 1M90O 2KFNA 3OTOK 1SS6A 3KHYA 3OHRA 4CJ3A 1OVQA 1GOAA 4RW6A 1YTAA 4IDHA 3VTIA 4CK1A 4CI6A 2GV9A 4LFCK 4FL9A 3A2FA 3R9PA 3UKUA 2VQFK 3JSMA 4E7KA 4CGDA 3THXB 5HRPA 1EWRA 4BE0A 1A5XA 3V6DA 4EIAA 1B92A 2EWSA 4ISFA 2KZMA 1GOBA 3AA2A 3E9LA 4DS5A 3GDQA 3KLIA 4F9OA 1YJWN 3TSPA 1HX1A 4CF8A 4FWLA 4WYBA 4WQ5C 4FLYA 3QERA 4K8XA 4AILC 2BUPA 4PA1A 3TI0A 3ZT4A 3NBPA 3TAFA 1WAJA 3VETA 2IVPA 5K14A 1WBDA 4BR2A 4KB1A 2I7NA 1Q18A 1NJWA 1BG3A 3U9DA 2F8SA 3QIOA 5BR8K 1HYVA 2YHWA 4B8CA 3SBTA 3SZ2A 4DTXA 1S1XA 1IG9A 5KI6A 4Q0BA 4IJNA 3ZT2A 4C1NK 1K9MO 2OTLN 2HVIA 4KI4A 2ATQA 2NNWA 5AQGA 3CCRN 4B9VA 3SMPA 3I8DA 1NGJA 3MXJA 4IDKA 3U4LA 4H8KA 1XHZA 5CYQA 1QSYA 1CZBA 5BPLA 2G8HA 4HCBA 4R5PA 5AQXA 2G8KA 3AO5A 2XY5A 4EZ6A 3S41A 1J5OA 1J5EK 1WN7A 1JLQA 1T44A 3DXKA 4AF1A 3O4WA 3T1HK 1T05A 5H1SQ 3PSIA 2W6LA 1JJ2M 3N4QA 2QWQA 4AHCA 1X9JA 2V7YA 1NK0A 4PKGA 4FO0A 2UYTA 2YNFA 4OGCA 1Q81O 4A62A 3VQBA 4HUEA 4OKJA 3B8AX 3LDLA 1QQNA 4X65K 3SJHA 4ILHA 4AH9A 4BC3A 1WSHA 2XY8A 1XUPO 2UXDK 4FK2A 4B8AB 4JS4A 2EX3A 4ID5A 1JXEA 2A1RA 4J2BA 1FW6A 3NE6A 3PX0A 1CLQA 4JK7A 1EX4A 2B4JA 1Y97A 1QS4A 1KXPA 3KWGA 1K8AO 3B6OA 3M8RA 1XC9A 4WF9L 5C24A 1B9FA 4FVUA 4O5FA 3NDKA 3UE5A 1KVAA 2O8EB 4KHUA 3AVKA 4M3RA 4H4OA 5IT9O 4B9LA 3AARA 1CXQA 1SKSA 3TU5A 3K5NA 3G6EN 2WUSA 1YVUA 2BANA 3MWPA 1Q9YA 1OH7A 3HL8A 5GIPA 3M8PA 2HBJA 3SV3A 4B3SK 5AQFA 3UKRB 1TKZA 3OYLA 3V1QA 2ZD1A 5AZJB 5TKYA 2GEMA 3VQ5A 2W42A 1RDUA 4Y0WA 3TTFA 1XNQK 4BRKA 1HQUA 1HNZK 2P9UA 4CCHA 1NKCA 2FSJA 1GLJO 5AQPA 2HF3A 2OZMA 3QBXA 3QESA 4CHZA 2HF4A 1VRUA 3PUFA 3MN7A 2F96A 1FKOA 3QEWA 1ZXOA 1GLDG 1D9DA 4ILGB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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