The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDWLIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Ligand pathways in myoglobin: A review of trp cavity mutations.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
62
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-01-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MBO A; 2G12 A; 2XKH A; 2O5B X; 1Q1F A; 3MKB A; 1CG8 A; 2HZ3 A; 2PGH A; 2OLP A; 1YHU D; 3WCV A; 2BKM A; 1HLM A; 1Y5J A; 3OZU A; 1PMB A; 3S1J A; 1LH6 A; 1G9V B; 3OK5 A; 1LHS A; 3ZJR A; 2ZS1 C; 4HRT B; 1Y46 B; 1J3Y A; 1HAC B; 1Y8I A; 2O58 X; 3D17 A; 1MLH A; 1O1L A; 5JDO D; 4IRO A; 3O89 A; 5IKS A; 2ZSQ A; 1XZ2 B; 4X0L B; 3ASE A; 1GVH A; 1THB A; 1BIN A; 1RPS A; 1MOH A; 2FRF A; 3NL7 B; 3W4U A; 1HHO B; 2VEB A; 1HAB A; 1YHU B; 1K1K A; 2O5M X; 1YHE A; 4OOD A; 1NS9 B; 1A6M A; 4WJG A; 105M A; 1GBV B; 1DXU B; 2O5T X; 1XCH A; 109M A; 5CMV A; 1YGD A; 2EKT A; 1CP5 A; 1CP0 A; 3DHR B; 1Y8W A; 1IT3 A; 2AA1 B; 1K0Y A; 3A59 A; 3R5I A; 1S69 A; 1YIE A; 2ZS0 C; 3LR9 A; 5B84 A; 1BZ1 A; 1Y0D B; 2MHB B; 1J3Z B; 5KER A; 1FAW A; 1JL6 A; 1HCO A; 1Y4Q A; 3UHD A; 2FAL A; 2PEG A; 3ARJ A; 1LTW A; 3B75 B; 2LH1 A; 4HSW A; 1HDS A; 3D7O A; 1O1N B; 1YG5 A; 3GQP B; 4ROL A; 4MQI A; 2NSR A; 5C6Y A; 3G4Q A; 1XYE A; 3WCP A; 1MYM A; 2D2M D; 3LQD A; 1GLI A; 2HBS A; 1GCW A; 3CY5 B; 1JF3 A; 5HU6 B; 1A01 A; 1HGC B; 4N7O A; 1N9X A; 1OJ6 A; 2H35 B; 3E5I A; 1O1K A; 1Y4G B; 1Y7Z B; 1SDL B; 3QM6 A; 3AQ6 A; 1VHB A; 1J7W A; 1CBL A; 2BWH A; 3ZJO A; 3K8B B; 1MNI A; 1CH3 A; 5E6E B; 1NZ3 A; 3NG6 A; 2WY4 A; 3UH3 A; 4M4B B; 1HBS A; 1MLO A; 5CN9 A; 3PT8 B; 2D2M B; 1IWH A; 3DHT B; 3UHN A; 2GNW A; 3UHB A; 3ODQ A; 4ROM A; 4NXA A; 2MGH A; 5CN7 A; 3WI8 A; 2HBF A; 7HBI A; 4WJG 1; 1DLW A; 3UHU A; 1WMU A; 3ARK A; 4N8T A; 1G08 B; 2MGG A; 1DTM A; 4UZV A; 1X9F A; 2FAM A; 2VHB A; 3PI9 B; 1C7C B; 2NSS A; 3CIU B; 1KFR A; 3QM8 A; 3GQG A; 1OBM A; 3ECZ A; 1Y7D B; 2H8D A; 1Y0A B; 5CN8 A; 1Y4F A; 1CH5 A; 1O1O A; 2EF2 A; 1C7D B; 2PGH B; 3S1I A; 2LHB A; 1MOA A; 3HEP A; 4WCH D; 1J7Y A; 4JAC A; 1YE2 A; 1R1X A; 2QSP A; 2V1F A; 3UHI A; 1O1I A; 2Z6N A; 1Y8I B; 1Y7G A; 1EBC A; 1QPW A; 1O1L B; 1Y0W A; 5EE4 C; 1FSX A; 2JHO A; 2MGL A; 1MKO A; 1QXE B; 4F6J A; 3QQQ A; 4ILZ A; 2D5X B; 3HEO A; 6HBI A; 1OFJ A; 3ZJH A; 2ZSY A; 2OH9 A; 1C7B B; 1GBU B; 1HBH A; 1S5X A; 1THB B; 3W4U B; 2AV3 A; 1DWS A; 2MGD A; 2ZS1 A; 3SZK A; 1DXT B; 1YEU A; 3GYS A; 3NMM B; 2QMB B; 3UBC A; 3VRG A; 3ZJJ A; 4MBN A; 1MBD A; 2XKG A; 3PT7 B; 1HBB A; 4FC3 B; 4UIQ A; 5D1V A; 1A4F A; 1Y4B B; 2HZ1 A; 1JDO A; 1Y22 A; 3AG0 A; 3ORD A; 1YH9 A; 3KMF C; 2SPL A; 1YIE B; 1MTJ A; 3SDH A; 1Y0T A; 4KJT A; 3R0G A; 4M4A A; 2Z85 A; 2W72 B; 4KN3 A; 1FAW B; 1AJH A; 3GKV B; 2ZLU A; 4F6G A; 2HBG A; 3UHY A; 4O2G A; 3AT5 B; 2DN2 A; 1G0B A; 3ZOL A; 4MAX A; 1G9V A; 1JWN A; 2HBC A; 5CN6 A; 1DUK A; 1OFK A; 1RTE A; 2BMM A; 1Y31 B; 4HRT A; 1JEB B; 3WHM B; 1JP9 A; 2GLN A; 1Y46 A; 1HAC A; 111M A; 2EB8 A; 4PQC A; 1MWB A; 3LQD B; 5HLX A; 3WCU C; 1GCW B; 3QJC B; 1YEO B; 4X0L A; 2HHB B; 2IN4 A; 3NL7 A; 4B4Y A; 1HHO A; 1B86 A; 3UHS A; 1YHU A; 2NRM A; 1O1K B; 2AUP A; 2HHE B; 3BA2 A; 4NXC A; 3A5A A; 1JZM A; 2O5S X; 1J7W B; 2M6Z A; 1LH7 A; 3A9M A; 1DKE B; 1DXU A; 1EMY A; 1X46 A; 2V1K A; 4B3W A; 1NPG A; 4BJA A; 1AZI A; 2HHD B; 1MLU A; 3DR9 A; 2O5L X; 2AA1 A; 3NML A; 5CNF A; 3HXN B; 3WCT C; 3UGY A; 2ZT4 A; 1H1X A; 1JY7 A; 3GDJ B; 1Y0D A; 2MHB A; 1J3Z A; 3OZV A; 2VEE A; 1VXG A; 1CH2 A; 1Y7C B; 3G4U A; 3S65 A; 3PEL A; 2GKM A; 3B75 A; 5CHR A; 2MGM A; 1O1N A; 3GQP A; 2H8D B; 5B85 A; 3P5Q B; 2HBD A; 1TES A; 3E5O A; 3FH9 B; 1OR4 A; 1DXC A; 1HDB B; 3OO5 B; 1LJW B; 2W6V B; 1M6C A; 1HV4 B; 3WCW C; 1HJT A; 2OIF A; 4KMV A; 1YE2 B; 3TM3 A; 1A6G A; 3CY5 A; 1FSL A; 1HGC A; 2H35 A; 2WTH A; 1FDH A; 1Y7Z A; 1AJ9 B; 3H58 A; 5CN4 A; 4G51 B; 3A0G B; 1MCY A; 1QXD A; 3K8B A; 1HSY A; 5E6E A; 110M A; 1RQA B; 2ZLX B; 4M4B A; 2ZS1 B; 1GDL A; 1QI8 B; 2MYE A; 2AUO A; 5HLQ A; 3PT8 A; 2D2M A; 1B0B A; 6HBW B; 3DHT A; 4MQC A; 1MNK A; 1BUW B; 3OO4 B; 3AQ7 A; 2GTL D; 2BLJ M; 1MLJ A; 2ZFO D; 2XKI A; 2LH2 A; 3ZHW A; 4HRR A; 1BZR A; 1Y22 B; 3EU1 A; 3RGK A; 1VRE A; 5F2A A; 1SPG A; 1CO8 A; 1CG5 B; 3PI9 A; 1VXB A; 1Y0T B; 1C7C A; 3CIU A; 2QFN A; 1Y8H B; 1LFV B; 2NX0 A; 3PI2 A; 1BZZ B; 3QM7 A; 1WVP A; 1YZI B; 1Y0A A; 3OGB A; 3G4R A; 2ZLU B; 4N7P A; 3VRF B; 1HRM A; 1C7D A; 1V75 B; 2V1H A; 5JGG A; 4TWU A; 2DN2 B; 1V9Q A; 1G0B B; 3PI3 A; 2HBC B; 2ZS0 B; 3VHB A; 1A0U B; 3G53 A; 4MQG B; 4G1B A; 1CH4 A; 2G0X A; 1QXE A; 3GOU A; 2D5X A; 5EV5 A; 1XZ7 B; 1VXF A; 1C7B A; 1GBU A; 1YMB A; 3UHC A; 1B86 B; 3MYM A; 1G0A B; 1X3K A; 1DXT A; 3NMM A; 2QMB A; 5HLU A; 1J41 B; 2M6Z B; 5ILR A; 2ZSZ A; 1T1N A; 2OHA A; 2BK9 A; 4MQH B; 4LPI A; 3PT7 A; 1F5P A; 1MWC A; 4FC3 A; 5E83 B; 1Y4B A; 3BJ2 A; 2QSS B; 2GTL C; 2BNL A; 2ZT1 A; 3DUT A; 1V4U B; 2FRI X; 4O1T A; 1A6N A; 3OVU C; 2ZFO C; 2MGF A; 1MDN A; 1A00 B; 3G4W A; 3IC2 B; 2WTG A; 1ABY B; 1HBA B; 1FN3 B; 2RAO B; 1JY7 B; 3GKT A; 1EW6 A; 2W72 A; 3GKV A; 3LB1 A; 3S65 B; 3PEL B; 4MQK A; 1MNO A; 2Z6T A; 1O1J A; 3AT5 A; 1O1M B; 3QJE B; 2ZSS A; 1YIH A; 1A9W E; 106M A; 3QM9 A; 3PI1 A; 2HBD B; 2MGC A; 1Y31 A; 1TU9 A; 1ABW B; 1JEB A; 2D2N D; 3WHM A; 3TLD A; 4OF9 A; 1J7S B; 1Y4V B; 1NS6 B; 1UX9 A; 5CN5 A; 1BIJ B; 1S5Y A; 5EE4 D; 4KMW A; 1YOH A; 1XXT B; 1MBN A; 3QJC A; 1YEO A; 103M A; 3PI8 B; 3PIA B; 2HHB A; 2DXM B; 1MOB A; 2ZLV B; 3SDN A; 2MGJ A; 2HHE A; 4AVE A; 3WFX A; 1DO7 A; 4NK1 A; 1QXD B; 5C6E A; 5AB8 A; 3ONZ B; 1SI4 B; 3WFU A; 1DKE A; 2QLS B; 2ZFB A; 1Y0C B; 2R4W A; 1BZ0 B; 5CNC A; 1G09 B; 2HHD A; 4MQC B; 3VRE B; 3UHW A; 3GK9 A; 4MU5 A; 2DN3 B; 2MGB A; 3HRW B; 3HXN A; 4ESA B; 4MXL A; 1I3D A; 3GDJ A; 2MGI A; 2EVP A; 1Y35 B; 4HRR B; 1ECA A; 4N7N B; 3ECX A; 3EU1 B; 3LB2 A; 1SPG B; 1Y7C A; 3WCV D; 1Y2Z B; 1NZ2 A; 1NWN A; 1JZK A; 4H07 A; 2R4Y A; 1LFY B; 4TWV A; 1FHJ A; 2G10 A; 3ZH0 A; 2ZT0 A; 1MTI A; 3ZJL A; 3P5Q A; 1VWT A; 3FS4 B; 3FH9 A; 4N7P B; 3UHZ A; 5JDO F; 1HDB A; 5ILP A; 1YMC A; 1LJW A; 1MYG A; 2W6V A; 3OO5 A; 1HV4 A; 1MLS A; 1GJN A; 5JGG B; 1S0H B; 1YVQ B; 4ODC B; 2G3H A; 2CMM A; 4FH7 A; 2D2N C; 1GCV B; 4XS0 B; 1NAZ A; 1QSH B; 1CIO A; 4NS2 A; 3WCU D; 4HSX A; 1M6M A; 3S66 B; 4JYQ A; 1AJ9 A; 2C0K A; 3GOU B; 4G51 A; 3A0G A; 1JW8 A; 2W6Y A; 1UX8 A; 1KR7 A; 1O1P B; 1RQA A; 2ZLX A; 1QI8 A; 3QZX A; 6HBW A; 3HYU B; 3G4V A; 2G11 A; 1BUW A; 3WFW A; 2ZLW B; 2NRL A; 2VYW A; 1MOD A; 3OO4 A; 1T1N B; 2V1G A; 5CHQ A; 2R4Z A; 3WCU B; 1PBX B; 3WCT D; 1DWT A; 3BJ2 B; 1LFL B; 1FCS A; 3D4X A; 2H8F A; 3DUT B; 1OUU B; 1Y45 B; 1CG5 A; 1CH9 A; 1YVT B; 1RQ4 B; 1R1Y A; 4HHB B; 5EET A; 1Y09 B; 5E29 B; 3MBA A; 1Y8H A; 1LFV A; 2FRK X; 2G0V A; 1BZZ A; 3TM9 A; 1YZI A; 2Z6S A; 3WCV C; 4YU3 B; 3ZJP A; 4NI0 B; 3A2G A; 4MQK B; 3VRF A; 1N9I A; 3GQR B; 2VYY A; 1V75 A; 1O1J B; 5CNG A; 1XZU A; 1Y4R B; 1MLK A; 2ZT3 A; 3E4N A; 3UI0 A; 3G4Y A; 3WCW D; 2G0R A; 1YIH B; 3UGZ A; 1Y83 B; 2ZS0 A; 3WCT B; 1A0U A; 2Z8A A; 1YHR A; 1RQ3 B; 4MQG A; 2QU0 B; 2GRZ A; 3LB4 A; 3BJ3 A; 4NZI A; 2YRS B; 1S5Y B; 1BVD A; 1JP6 A; 2VLY A; 1XZ7 A; 1HBI A; 3GLN A; 1LA6 A; 1A0Z B; 1YGF B; 1S61 A; 5JOM A; 1VXH A; 1G0A A; 4FWX A; 1MYZ A; 3H57 A; 2O5O X; 1J41 A; 5C6E B; 3MJP B; 1HBR B; 1YOG A; 3BJ1 B; 4MQH A; 2ZFB B; 4IT8 A; 4L7Y B; 5E83 A; 1DWR A; 1XY0 B; 2QSS A; 1X9F D; 1IOP A; 1XQ5 B; 2HBE A; 1F63 A; 1V4U A; 2W6W A; 1A00 A; 2B7H B; 2D5Z B; 1DTI A; 3IC2 A; 3NFE B; 4H2L B; 5EUI B; 5EYS A; 2MBW A; 1ABY A; 3ZJM A; 1HBA A; 1EBT A; 1FN3 A; 2RAO A; 3LR7 A; 1Y85 B; 2GRF A; 2V1I A; 5EQM A; 1A6K A; 4MBA A; 1N9H A; 1CQ2 A; 1YDZ B; 2D60 B; 1MBC A; 1O1M A; 3QJE A; 1FHJ B; 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1MWD A; 1S0H A; 1YVQ A; 3KMF A; 4ODC A; 2W31 A; 2ZFO B; 3ED9 A; 3ECL A; 1GCV A; 1NEJ B; 1NWI A; 4XS0 A; 1MLR A; 4F6I A; 1YHR B; 1QSH A; 1RTX A; 3D1A B; 1UT0 A; 3AQ9 A; 1NXF A; 3BJ3 B; 2LH3 A; 1UFJ A; 3HHB B; 3S66 A; 1MTK A; 1GDK A; 1URV A; 1COH B; 1Y4P B; 1W92 A; 2HCO A; 1J3F A; 2MGK A; 1JL7 A; 4DWT A; 1GDJ A; 1LA6 B; 1QSI B; 4C44 A; 1O1P A; 3ZJN A; 1JP8 A; 1YEQ A; 2E2Y A; 1J52 A; 1SWM A; 1LFT B; 3BCQ B; 3HYU A; 2ZLW A; 2HZ2 A; 1MYH A; 2FRJ X; 1ECD A; 3BOM A; 5EOH A; 3WCU A; 1PBX A; 4MQJ B; 1OR6 A; 4ZVA A; 4U8U C; 2XYK A; 1LFL A; 5ILM A; 4YU4 B; 2HBE B; 1OUU A; 4NI1 B; 4O35 A; 1NZ5 A; 1Y45 A; 1YVT A; 1RQ4 A; 1L2K A; 3O7N A; 1Y09 A; 4HHB A; 5E29 A; 3UH5 A; 2VLZ A; 1ECO A; 4YU3 A; 4NI0 A; 2AV0 A; 2D6C A; 1XZ5 B; 3GQR A; 4PNJ A; 3QZZ A; 4F6D A; 3UHG A; 5KKK A; 1Y4R A; 1UFP A; 5JDO E; 4F69 A; 1YCA A; 1BAB B; 3MN0 A; 1OUT B; 1Y83 A; 1Y5F A; 1YCB A; 3WCT A; 1IRD B; 1V4W B; 1YOI A; 1RQ3 A; 2QU0 A; 4QAU A; 1Y01 B; 4C0N A; 1S56 A; 1F65 A; 2LH5 A; 4PQB A; 4F6B A; 3HEN A; 3IC0 B; 2YRS A; 1GZX B; 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