The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
66
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFWSEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Ligand pathways in myoglobin: A review of trp cavity mutations.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
66
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-01-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HGB B; 1RPS B; 2DN2 A; 1MZ0 A; 3WCW A; 1BIJ A; 1MLR A; 1UIW A; 3ODQ A; 1YEU A; 2FRJ X; 1MOB A; 1VWT A; 105M A; 1MOD A; 2V1J A; 2VLZ A; 1LFQ B; 1JPB A; 4FWX A; 1GDL A; 2GKN A; 1IWH B; 2ZLV B; 1JDO A; 1MBI A; 4AVD A; 2ZS1 B; 3GLN A; 1CQ2 A; 1MYH A; 2GTL C; 2V1E A; 3ZH0 A; 3UHS A; 1DO3 A; 2D2N D; 1Y0W A; 4IT8 A; 4B4Y A; 1J7Y B; 2D2M D; 3PEL A; 5CN4 A; 1HGC A; 4NXC A; 1XY0 B; 1RQ4 B; 1IBE B; 1YHU B; 1S5X B; 1G0B B; 5E6E A; 1V4W A; 2AA1 A; 1OFJ A; 3OZU A; 3GDJ B; 3A5G A; 2HBF A; 1HBR A; 5HLX A; 1ABY A; 1FLP A; 5HBI A; 1NZ5 A; 3AT6 B; 1HV4 B; 1YHR B; 1NIH A; 6HBI A; 3GQR A; 3WCT B; 5HLU A; 2R1H B; 2BW9 M; 1ABS A; 1SI4 B; 1RVW A; 2GNW A; 3K8B A; 1MYF A; 4XS0 B; 2D60 B; 1V4U A; 1CMY B; 1BZ0 A; 2Z6T A; 1N9I A; 1XZV B; 3HRW A; 2GL3 A; 1A0Z A; 4MXL A; 3HYU A; 2HBE A; 4H07 A; 1G0A B; 1Y8W A; 3GQG B; 2VLX A; 5AZQ A; 1ECO A; 1CH5 A; 2DN1 B; 1U7R A; 2ZS0 A; 1MYT A; 1O1O A; 4HRT A; 1MLF A; 1MBO A; 3KUN A; 1O1M A; 3ZJL A; 1GBU B; 3S65 A; 2D6C A; 5B84 A; 3OGB A; 3UHI A; 5HLQ A; 5HY8 A; 3LB4 A; 1XXT A; 3FS4 B; 2MGJ A; 4N7N B; 1HBI A; 3ARL A; 1VXH A; 1LTW A; 1CG5 A; 1Y7C A; 3VRE A; 3ONZ A; 1DKE A; 1Y09 A; 1RSE A; 3QMA A; 3UHD A; 3QJE B; 2ZSO A; 5E83 A; 3CIU B; 2XKI A; 1YE0 A; 3OO5 B; 2NRM A; 1JP8 A; 5EU2 A; 1JY7 B; 3WFW A; 3PI9 B; 2ZST A; 3M38 A; 1MLM A; 1FSX B; 1YVQ B; 1BZZ B; 3PT8 A; 1YGF B; 2QFN A; 2D2N B; 1Y45 A; 3GOU A; 3HHB B; 2D2M B; 1XZV A; 1SHR B; 1O1L B; 3LQD A; 3G4R A; 2QU0 A; 1ABW B; 1MYI A; 1X9F C; 1YIH A; 1IRD A; 1EBC A; 5KDQ A; 3ZOL A; 3UHQ A; 1LFZ B; 1UT0 A; 3ARK A; 4IRO B; 1K0Y A; 3K9Z A; 3BJ1 B; 1Y0A A; 1YEQ A; 5EYS A; 1QSI B; 2FRF A; 1JP6 A; 2GRF A; 3GYS A; 3CIU A; 4PQB A; 1XZU B; 3W4U B; 1Y46 B; 1Y2Z B; 3TM3 A; 4HRR B; 1Y8H B; 2G0R A; 2SPM A; 4DWT A; 1J40 A; 4NI0 B; 1NWN A; 2W72 A; 1MYM A; 1C7D B; 4OF9 A; 2MGL A; 2H35 A; 5M3S A; 4U8U A; 4KN3 A; 2ZT4 A; 2B7H B; 1J3Y B; 1A0U B; 2R4W A; 2ZLU B; 3GKV A; 3PT7 B; 1HAC B; 4O2G A; 2H8D A; 4M4B B; 1A00 B; 2ZSN A; 1LJW B; 1MOH A; 2IG3 A; 5ILP A; 1HDB B; 1Y31 B; 1HDS B; 1NPF A; 1VXA A; 1JZK A; 1GCW A; 1YZI A; 1SWM A; 3EOK B; 4IRO A; 4L7Y B; 5ILE A; 2ZSX A; 2VEE A; 3NL7 B; 2AUP A; 2MGD A; 2H8F B; 4OOD A; 1G08 B; 1CG8 B; 1BZ6 A; 1X46 A; 3UHH A; 1Y7Z A; 3AQ6 A; 1MBN A; 1GZX A; 1YIE B; 3ZHW A; 1HAB B; 1UC3 A; 1I3D A; 2ZFO C; 1H1X A; 4G51 A; 2HHE A; 3GQP B; 4FH6 A; 5CN8 A; 3V2Z A; 1J41 A; 2RI4 A; 2GTL A; 2QMB B; 2R80 B; 2NSS A; 1MCY A; 1CP0 A; 1Y5F A; 1JZL A; 1MLN A; 3A0G B; 1URY A; 1URV A; 4MU5 A; 1Y0D B; 3WCP A; 3BA2 A; 1MLG A; 2MGA A; 3QZX A; 4N8T B; 2VHB A; 1SPG A; 1JL7 A; 2G10 A; 1XZ2 B; 3R5I B; 2VYZ A; 1LH1 A; 1LH3 A; 4FC3 B; 1NAZ A; 4DWU A; 2Z85 A; 3NFE B; 1Y7G B; 1VXF A; 2M6Z A; 4NS2 A; 2ZSZ A; 5EQM A; 3S1J A; 1V5H A; 1HLM A; 2XKH A; 1NQP A; 2LH3 A; 4PQ6 A; 1GCV A; 1NS9 A; 1B0B A; 2G0S A; 4KMW A; 2QSP B; 3BJ2 B; 3UHG A; 104M A; 3WCU D; 1MNH A; 3HC9 A; 4N7P A; 3BOM A; 4MQC B; 1BZ1 A; 1Y8K A; 2EVK A; 5MBA A; 2DXM B; 1B86 B; 2AUQ A; 1HBB B; 3QM5 A; 5D5R A; 3DUT B; 1XQ5 B; 1W92 A; 1JEB B; 1O1P A; 3MBA A; 1G9V A; 1XZ4 B; 3WCT C; 1FAW B; 1DXU A; 1CH2 A; 1BBB A; 2MGE A; 2QLS B; 1Y0C B; 1MNK A; 2YRS A; 4ILZ A; 3DHR B; 3MKB B; 1FDH G; 2HBC B; 4MQJ A; 3D1A A; 2HZ1 A; 2MGK A; 2ZLX B; 2Z6N B; 1DM1 A; 1FCS A; 3G4W A; 4HSW A; 2HBD A; 1MYZ A; 3RJN B; 3G4V A; 1LFT A; 1DXT A; 1R1Y B; 1Y35 B; 3PI8 A; 1S61 A; 3ORD A; 3HEO A; 2G3H A; 1QXD B; 1G09 A; 3BJ3 A; 2R4Z A; 1V75 B; 1AJ9 B; 2XKG A; 3VAU A; 4ROL A; 5JDO D; 5IKS A; 1LUE A; 1GBV B; 1X9F A; 2BMM A; 1HBH A; 4BJA A; 1O1I A; 1YG5 B; 1Y4F A; 1Y4V A; 2MYD A; 1C7C B; 4O1T A; 3QJB A; 1S69 A; 1Y5K A; 3D1K A; 1F65 A; 2BLH A; 3UGZ A; 3LB3 A; 2ZS1 D; 3DUT A; 4ZVB A; 4NZI A; 2VEB A; 1PBX A; 1NPG A; 3D17 B; 5ILR A; 1S5Y B; 4MQH A; 5D1V A; 1XZ5 B; 1A01 B; 1DO7 A; 2AV0 A; 1HBS A; 1OUU A; 3ZJO A; 4NXA A; 5EE4 D; 1YHU D; 1GJN A; 6HBW A; 1RQ3 B; 2D2N C; 3WCU B; 1NEJ B; 2D2M C; 1TU9 A; 4MQI B; 1JP9 A; 3GK9 A; 1NZ2 A; 4O4Z A; 1MLK A; 3CY5 B; 1J52 A; 1DXV A; 1YE2 B; 3WI8 A; 3ZJQ A; 1ECA A; 1VHB A; 1BVC A; 1Y8I B; 2OHA A; 2WTG A; 1MLQ A; 4MQG B; 1YVT B; 1MKO B; 3BCQ A; 5CHQ A; 2FRK X; 2DHB A; 2QSS A; 3RGK A; 2W6V A; 1LH2 A; 1KD2 B; 2HBS A; 5HAV A; 1R1X B; 4UIQ A; 1LH6 A; 1X3K A; 1HJT A; 2EKT A; 1HBA B; 2O5M X; 2AV3 A; 1NZ4 A; 5CNG A; 2G0V A; 5KKK A; 1OUT A; 7HBI A; 1BIN A; 1J7S B; 1LFL A; 3ZJN A; 3DHT B; 4PNJ A; 1DTI A; 1THB A; 1HCO B; 1A3N B; 1LFV A; 1YMA A; 1YEN B; 4ODC B; 4MBA A; 3UHK A; 1NEJ A; 5CN9 A; 4LPI A; 1Y5J B; 1LHS A; 1YEO A; 2ZFO A; 3D4X B; 5JOM A; 4G1V A; 1IOP A; 1QI8 A; 1YGD B; 3G4U A; 5CN5 A; 2W31 A; 3EU1 B; 1A4F A; 1F5O A; 1O1N A; 2BNL A; 4HHB B; 3K3U A; 1EBT A; 1C7B A; 2HBG A; 2LH2 A; 1Y7D A; 1HDA B; 1BUW A; 3OZV A; 1COH B; 2ZFB A; 1FN3 B; 3SDN A; 4N7O B; 1O1J B; 2D5Z A; 1H97 A; 1HGB A; 1RPS A; 3B75 B; 1J3Z B; 2MHB B; 4DC8 A; 4MPM A; 1GDI A; 1LFQ A; 1Y85 B; 2OHB A; 3MYN A; 4H2L B; 3WR1 B; 1MLH A; 1V4X B; 2O5O X; 2LH7 A; 1IWH A; 2ZLV A; 3UH5 A; 1FHJ B; 2ZS1 A; 2R4X A; 1BJE A; 1XZ7 B; 3HF4 B; 2HHD B; 1GVH A; 3HEP A; 2O58 X; 1ASH A; 2PEG B; 3SDH A; 2ZSQ A; 1J7Y A; 3A5B A; 1XY0 A; 3G4Y A; 1RQ4 A; 1IBE A; 1YHU A; 4DC7 A; 1S5X A; 1G0B A; 3MN0 A; 3IC2 B; 3GDJ A; 5CN6 A; 2NX0 A; 4NK2 A; 5C6E B; 2NSR A; 3GKT A; 2EF2 A; 2FRI X; 1DXC A; 5CNC A; 1A6G A; 2MGC A; 3AT6 A; 1HV4 A; 3TLD A; 1YHR A; 3AQ7 A; 1CIO A; 3WCT A; 3ZJR A; 1Y22 B; 1CQX A; 2R1H A; 1MBC A; 2G12 A; 3B75 A; 1Y0T B; 1SI4 A; 4SDH A; 3HXN B; 4XS0 A; 2D60 A; 4XDI A; 2MGB A; 1CMY A; 1JF4 A; 2VYW A; 1M9P B; 1AJG A; 4H0B A; 1YOG A; 1G0A A; 3GQG A; 1OBM A; 2DN1 A; 1NS6 B; 3A9M A; 1XCH A; 1LA6 B; 1WMU B; 3G52 A; 3NMM B; 2SPN A; 3UHY A; 3S66 B; 1Y4G B; 2GRH A; 4QAU A; 1AZI A; 1Z8U B; 1K1K B; 1GBU A; 3WFU A; 1RQA B; 3UHU A; 3FS4 A; 4N7N A; 5EOH A; 5EV5 A; 1MLJ A; 1LH5 A; 1S6A A; 3PIA B; 1BZR A; 3QJE A; 1Q1F A; 5C6Y A; 3OO5 A; 1JY7 A; 3PI9 A; 1FSX A; 3P5Q B; 1YVQ A; 1BZZ A; 3A59 B; 2MGF A; 1YGF A; 4HSX A; 2D2N A; 4M4A B; 2ZT0 A; 3HHB A; 4YU3 B; 2R50 A; 1GDK A; 1M6C A; 2D2M A; 3WFT A; 5E29 B; 2O5Q X; 1M9P A; 1SHR A; 1O1L A; 2GDM A; 2CMM A; 2DN3 B; 1ABW A; 1J7W B; 1A6M A; 1MBA A; 4ESA B; 2ZLT B; 1JL6 A; 3AQ9 A; 2Z6S A; 1BAB B; 2GLN A; 3AG0 A; 1DXD A; 3ED9 A; 1QSH B; 3MOU A; 1LFZ A; 3WHM B; 1JZM A; 1ECD A; 1AJH A; 3BJ1 A; 3MJP B; 1A3O B; 2ZWJ A; 1QSI A; 3LR9 A; 3U3E A; 1XZU A; 3W4U A; 1Y46 A; 1Y2Z A; 3WCU C; 4HRR A; 1Y8H A; 1YOI A; 2V1G A; 2OH9 A; 3IXF A; 4NI0 A; 1SDK B; 5JDO E; 1OJ6 A; 1NXF A; 3WTG B; 1C7D A; 1BZP A; 3NG6 B; 3OO4 B; 3PI2 A; 1VRF A; 2B7H A; 3S48 C; 4G1B A; 2DC3 A; 1J3Y A; 4FH7 A; 1MTK A; 1A0U A; 2HCO B; 4MQK B; 2ZLU A; 3PT7 A; 1HAC A; 5AB8 A; 4M4B A; 1A00 A; 1Y83 B; 1LJW A; 3E5I A; 4GZG A; 1HDB A; 1Y31 A; 1HGA B; 1HDS A; 1HRM A; 1RTE A; 1SDL B; 4YU4 B; 1YCA A; 2OIF A; 3UHT A; 3EOK A; 4L7Y A; 2KSC A; 1Y4R B; 2ZSR A; 3NL7 A; 1HHO B; 2H8F A; 5SW7 B; 2ZLW B; 3WCV B; 1G08 A; 1CG8 A; 2BKM A; 4NI1 B; 1C40 B; 5JDO C; 1YHE B; 2HZ2 A; 1YIE A; 3AQ5 A; 1HSY A; 2RAO B; 1HAB A; 3A5A A; 1MBD A; 1M6M A; 1DO4 A; 4F4O B; 106M A; 1YH9 B; 3ZJP A; 1Y4Q B; 2ZS1 C; 1S56 A; 3QJD B; 3GQP A; 1YDZ B; 3ECX A; 5HU6 B; 2QMB A; 2R80 A; 5EE4 C; 1YHU C; 3A0G A; 1CLS B; 5KER B; 1YEV B; 1GLI B; 2D5X B; 1Y0D A; 1CIK A; 1JWN A; 3QM7 A; 4N8T A; 2HHB B; 1XZ2 A; 3R5I A; 1VXE A; 1N9X A; 1IDR A; 110M A; 1KFR A; 1QXE B; 3D7O B; 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2V1F A; 4KJT A; 1NIH B; 4MQI A; 3UH7 A; 1NGK A; 3GQR B; 3QM6 A; 1RVW B; 3CY5 A; 3K8B B; 4TWV A; 1DO1 A; 3E55 A; 1YE2 A; 3ZJI A; 1V4U B; 3UHW A; 1BZ0 B; 2MYA A; 1Y8I A; 4FWY A; 3HRW B; 3QQR A; 1A0Z B; 1IRC A; 4TWU A; 1MGN A; 3HYU B; 4MQG A; 1YVT A; 1MKO A; 2HBE B; 1DWS A; 4NK1 A; 1Y8W B; 1F63 A; 2G11 A; 1KD2 A; 2ZS0 B; 3UBC A; 1O1O B; 1CO8 A; 1R1X A; 1Y01 B; 1HBA A; 4HRT B; 3UI0 A; 1O1M B; 4TYX A; 3S65 B; 4U8U D; 1J7S A; 5HY8 B; 2W6Y A; 1XXT B; 2C0K A; 3DHT A; 2O5S X; 1DWR A; 1HCO A; 2ZSP A; 3LHB A; 1A3N A; 1UX8 A; 1CG5 B; 1Y7C B; 3VRE B; 1YEN A; 3ONZ B; 1DKE B; 3PI3 A; 4ODC A; 1Y09 B; 4WCH D; 1UVY A; 5E83 B; 1YE0 B; 4F6B A; 3NML A; 1Y5J A; 108M A; 3MYM A; 2LH1 A; 3PT8 B; 4MBN A; 3D4X A; 3OK5 A; 1Y45 B; 3GOU B; 1V9Q A; 1YGD A; 3FH9 B; 3EU1 A; 3V2V A; 3LQD B; 4HHB A; 2MB5 A; 1MLU A; 2QU0 B; 1MNO A; 4L2M A; 3QZZ A; 2EVP A; 1DWT A; 1IT2 A; 1YIH B; 2QRW A; 1CH1 A; 1IRD B; 1HDA A; 1COH A; 5KDQ B; 3WCV C; 1FN3 A; 4N7O A; 1O1J A; 2ZSS A; 4MXK A; 1K0Y B; 1J3Z A; 4FWZ A; 5EYJ A; 1Y0A B; 1F5P A; 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