2ON5A

Structure of nagst-2
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
206
structure length
206
Chain Sequence
MVHYKLTYFAGRGLAEPIRQIFALAGQKYEDVRYTFQEWPKHKDEMPFGQIPVLEEDGKQLAQSFAIARYLSRKFGFAGKTPFEEALVDSVADQYKDYINEIRPYLRVVAGVDQGDPEKLFKELLLPAREKFFGFMKKFLEKSKSGYLVGDSVTYADLCLAEHTSGIAAKFPSIYDGFPEIKAHAEKVRSIPALKKWIETRPETKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Na Glutathione S-transferase 2
publication title X-ray structures of Na-GST-1 and Na-GST-2 two glutathione s-transferase from the human hookworm Necator americanus
pubmed doi rcsb
source organism Necator americanus
total genus 77
structure length 206
sequence length 206
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2on5A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2on5A01
5COHA 2HFDA 5KN3A 2R6KA 1UA5A 3TCOA 1RK4A 2LUSA 4HI7A 6GSYA 2AAWA 2DJ0A 2HRFA 3TGZA 3Q19A 3P2AA 1QQ2A 3P8WA 2FHEA 1X5CA 1GSDA 3GRXA 2QC7A 4KX4A 5AIXA 3KTBA 4WETA 3LQ7A 4MP4A 4YH2A 2A2RA 4I5QA 1T8EB 3GTUA 4POMA 4GSTA 1MD4A 19GSA 4HJ2A 1ZZYA 2PUKC 5HFIA 2KUCA 3Q6OA 2LKUA 4ECJA 4F0CA 1EP8A 1OKTA 1TP9A 2CZ3A 2IIYA 1HQOA 5HR3A 2GQKA 1OYJA 4TXVA 5JCGA 1V57A 11GSA 3IK7A 5ENUA 1E6BA 2DSAA 1OC9A 1VF3A 5D8IA 3VPTA 2YZUA 4TR3A 12GSA 2V41A 4ZILA 1GSYA 2C8UA 3FW2A 4CW9A 1N8JA 3IC8A 2H1AA 3VK9A 4NAXA 1YF0A 4TOPA 3QOUA 1U3IA 1K0AA 4D73A 3UAPA 2YP6A 2CX4A 5FWGA 3HYPA 5H5QA 1PKWA 1EEMA 3BJ5A 4IQAA 5C04A 1TOFA 5DAKB 3IA1A 3NZNA 2HRKB 3GURA 5LNKe 3FR9A 3LXZA 1A2MA 4TKYA 6GSWA 1XXUA 3RBTA 2EIRA 3ZFLA 2VL9A 4GCIA 1OE7A 1GSSA 5D9VA 1AIUA 2DJKA 4E8EA 4AJ6A 1ON4A 3EWLA 1TRSA 2X8HA 3F9UA 3HDCA 2LV3A 4RUVA 1MD3A 2FY6A 2B7KA 3APSA 5G31A 1YKAA 4Z7XA 4NV2A 4GWRA 2GS3A 1GLQA 4ML1A 3GX0A 1EZKA 4NMUA 5IQYA 1V58A 2FUG2 3HD5A 2C3QA 1J08A 2PU9C 1YKCA 2IPAA 5FHIA 2K9FA 3M8NA 4HDEA 3BCKA 3M1GA 2CT6A 3CSJA 1VRSD 1F9MA 4TR1A 1TDIA 5EVOA 5J9CA 5ELAA 2GT5A 22GSA 1M0UA 2MBTA 2LJKA 1X5DA 4Q5RA 2HSNB 5ECSA 1B48A 7GSSA 2H1GA 5IMDA 1YDKA 3HJMA 4NHWA 3GL5A 1LU4A 1FHEA 4TVEA 2PVOC 1W89A 1DSBA 3KZQA 4PURA 3FZ5A 3D4MA 5B8AA 2VL3A 4BL7B 3HY2A 3ZFBA 4JZQA 3KH7A 3ZITA 1GNEA 3ZL5A 1DBYA 1K3YA 4O92A 2H6XA 3UVHA 3RDWA 1ILOA 5G5FA 4ECIA 4TXOA 2QKEA 1GUHA 3VI7A 1FAAA 3EMXA 1NHOA 4L8EA 3KMNA 5JWQB 3QAGA 4IHUA 1XWKA 4MA9A 5IMZA 3O76A 3CXGA 1LBKA 4GXZA 2HSMA 4HS1A 2FA4A 4KSMA 3HJOA 4POBA 4MJAA 3A2WA 2GSQA 2GTUA 3PR8A 2B5YA 5HR0A 4K7OA 1UN2A 2XC2A 1SJ6A 2I9HA 1YQ1A 1M2BA 1EGRA 2VM2A 2FWEA 2YWOA 2HSYA 4NXIA 3APOA 1O81A 3L78A 1A8LA 3F3QA 4BWQA 2LNSA 3FZ4A 2NBSA 5ECQB 4IGJA 2YJHA 1Z9HA 3H1NA 1K3OA 1S3DA 14GSA 4N0ZA 5LCZA 4F0BA 2JZSA 2XPEA 1G7OA 2VO4A 3ED3A 4JR6A 3L4NA 1TK8B 3CBUA 4MPGA 1Q98A 4ZL7A 1TJDA 2YV7A 3KCMA 1QK8A 4FYUA 1GUMA 4J57E 1TU7A 4FYCA 2WJUA 3MWHA 3ME8A 1IYIA 1XWGA 4IP6A 3QPMA 4L5OA 3IDVA 3GKMA 2LNTA 2CVDA 4DSSB 13GSA 4XS1A 5ECPB 4V1Ag 4IJ3A 1U88A 5J3RA 4PNGA 2XBIA 2HRAA 3IXRA 2CAQA 2HSHA 4LA1A 2H75A 4G0LA 3GSSA 4DVCA 3N5OA 5HFGA 2IFQB 1A8YA 3V1WA 2R2JA 3EU3A 3W8SA 4GQFA 3TUEA 1GL8A 2JU5A 3M0FA 1ZYEA 1SL2B 4QQ7A 2RIIA 4MLYA 2RUFA 1B4QA 5CRGA 3LJRA 3VWUA 5J4UA 3UJ1A 2GGTA 3TJFA 2QGVA 4L0WA 1EP7A 2H66A 2F8FA 1ZYQB 4FH8A 2MBSA 20GSA 1EV4A 5AN1A 2CVKA 3QFBC 1NSWA 2CV4A 5IOXA 1OC3A 3ZYWA 4WKWA 1ERTA 3KP8A 3C71A 4IJIA 1PL2A 8GSSA 4K2DA 4O32A 4OMVA 3ZIVA 4LL4B 2BMXA 3L0HA 5ELGA 4BPYA 2GDRA 2ES7A 2LRNA 3DVXA 4BVYB 2O8VB 2VCVA 3W8JA 1GUKA 3HVVA 2X99A 3HKRA 2JSZA 4K8MA 2HZEB 1USBA 3VURA 5D9WA 1ML6A 1WJKA 1BQ7A 2B1KA 1UC7A 1XFLA 3ZTLA 4OFNA 4V2LA 17GSA 2H01A 2GVPA 3GKNA 3F0IA 1R5PA 3RAZA 4X0XA 5F05A 4PQIA 2CAIA 2DMMA 2VL2C 4DEJA 4V2MA 2GSRA 4YAPA 2H0GA 4IP1A 5ECOB 3HHVA 3TKSC 1KBNA 5JCUA 4KDUA 1KTEA 1M2AA 2LEGA 2QSIA 2EIOA 4ZB6A 2LRTA 1K0BA 1AXDA 5G2ZA 3VWVA 1C72A 1K3LA 3QMXA 1GTIA 4I97A 4TR4A 3KD0A 5INYA 5ID2A 2JSYA 1N2AA 4F03A 5GSTA 1M99A 1W4VA 3ERGA 4F2IA 1AQVA 4MMMA 4IBPA 1GRXA 1B8XA 4PTSA 1G7EA 4HZ2A 1XWAA 2EIQA 2WFCA 6GSTA 1AC1A 2OE3A 2R5GA 2DBCA 2WS2A 4ZL8A 2K6VA 1XOBA 1VF1A 4GLTA 1XWCA 2IJYA 1WWJA 3GFKA 4K9ZA 1XVWA 4MH2A 4L0UA 10GSA 2B3SA 3ZMKA 3VFIA 2RM6A 5D73A 2YOIA 4ZL9A 2KOKA 4EVMA 5DCHA 1PKZA 1B9XC 1V40A 1MEKA 3H4KA 4FQUA 1GSQA 1TTZA 1WRYA 5E59A 2P0GA 2ZCTA 3D4TA 5D9XA 1ST9A 4FIWA 1GNWA 2PVQA 3APQA 2AV4A 2LTKA 2HI7A 3KJYA 3WT1A 3KGKA 3TDGA 5B8BA 3DYRA 4F82A 5A4VA 1OKDA 1Q4JA 2JZTA 4FYBA 1QGVA 1ZCPA 1XW5A 1TI3A 5GZZB 3DMLA 4ID0A 4CHSA 2ZNMA 3H8QA 1K0MA 4YQUA 3GV1A 4G19A 2WZ9A 2YWIA 1YY7A 2NDOA 1M9AA 4F9ZA 5FT3A 1F3AA 3NIVA 3CMIA 1WIKA 2IWTA 1GWCA 1FVJA 3TJKA 4HEA2 3KEBA 2YV9A 2B5EA 5DALA 1KNGA 3BD2A 1X0RA 3Q18A 2OBIA 4GF0A 2AYTA 2CZ2A 4N11A 2V1MA 4HZ4A 4MF6A 1A2JA 1MDKA 1ZMAA 3IRAA 5CO3A 2IMIA 3HZ8A 1EV9A 4ZBAA 3DGQA 3BCIA 3LEFA 4TRXA 2DJ3A 1VF4A 5IMAA 3VPQA 2FGXA 1CQHA 5ECNB 2KP2A 1J0FA 3EYTA 3O3TA 4KSOA 5CP1A 2GT6A 3LYPA 3IK9A 2GQMA 3A5WA 2B7JA 2H72A 1GTBA 3ERFA 1G0TA 4JE1A 4KF9A 2H71A 2BTOT 1FVKA 3GTUB 2K18A 1S3AA 1GULA 3TOUA 4G10A 1T1VA 2RLIA 1X9MB 2AB6A 4LMWA 3GIXA 2GZZA 2VL2A 3DVWA 2M80A 1RQMA 3RPPA 4WBRD 3WGXA 1VF2A 1XW6A 4IS0A 1FW1A 5IM9A 3TKSA 5A5KA 4DSRA 4AJ8A 3J7Yk 1SK0A 4CDOA 2HLSA 2Z9SA 4HQSA 2X64A 3KIJA 4IKHA 5D93A 3A2XA 1A23A 2C80A 3E9JB 4G0KA 3TRXA 2LSTA 3TJGA 5DBQA 3WGEA 5G1LA 4D73B 3SWLA 3ZRDA 2N5AA 5LD0A 2J9HA 2F51A 4WBJA 4JEDA 3ZLPA 3RHCA 5IPHA 5GAND 1WOUA 2NPBA 2H76A 1GSEA 1ZL9A 3FHKA 3HXSA 1GLPA 1U87A 1SK1A 1WPIA 1F37A 3EE2A 3FR3A 3PINA 4WEYA 3GYKA 1WP0A 3I9V2 2UZ8A 2H8LA 2C3NA 4K0GA 4I8BA 3L9VA 2RM5A 2JZRA 2O87A 4NWYA 4HJMA 5BMUA 1A24A 1DE1A 2VCWA 4Q5QA 4XS6A 4PQ1A 2NVLA 3QAVA 4BVXA 4TR1B 3VWWA 4EF0A 2H1BA 3CYNA 1ERVA 3ZMLA 2A4VA 4JU5A 4NPBA 3U5RE 3UBLA 2VUPA 1VGLA 5ABRA 5IMFA 1UVZA 2ALBA 2DJJA 5H5SA 4XIHA 3IR4A 1TRWA 3DRNA 3CRUA 1T4YA 3F8UA 2WDUA 5L71A 4QL7A 1SYRA 4TW5A 1QXHA 3QFAC 3TJJA 2VCQA 1OAZA 2G2QA 2N5BA 4YQMA 1V98A 2GLRA 3UBKA 5DCGA 2IFQA 3LORA 2CVBA 3U6VA 3FEUA 4XS4A 3CRTA 1GSUA 1TRUA 4HOJA 1QUWA 5DJMA 1PD21 2B6MA 4HUAA 4TXOB 4ECBA 1V2AA 3BOAA 1F6MC 4OWYA 4XRAA 1GTAA 4N10A 1FB6A 3FK8A 3IPZA 5JWOB 1EOHA 2WULA 3ZIJA 4O7HA 2N5FA 2MMOA 3HA9A 2HSMB 3R2QA 3GHAA 1JLVA 3GUSA 4P3YB 2I4AA 3UEMA 3ZREA 1GP1A 3UVTA 2P31A 1ACVA 5JCWA 4ILFA 1X9SB 4MDCA 5B7CA 4J2FA 4ULXA 3P90A 1TKDB 4MZWA 4X1UA 4BVYA 2YWMA 4QL9A 1PQNA 2FNOA 2K8SA 1XCCA 2V6KA 2JACA 4V1Ap 4RI6A 1O6JA 3JCML 5F0GA 1R4WA 2HZEA 1LJRA 2PBJA 3TKPA 2GQLA 5HQPA 2F9SA 2R4VA 3EURA 1PRXA 2DLXA 1Z6NA 3VLNA 1HNCA 1O8XA 4RQXA 1SL0B 2RUEA 4ISDA 3C73A 2VD0A 1JFUA 1K0DA 3D6IA 6GSXA 1SK2A 2E2MA 1J9BA 2PGTA 2L5OA 3UMAA 3FR6A 5DDLA 1THXA 4EO3A 3LYKA 1JZOA 5HR1A 3HVXA 4KA0A 1M2DA 1NM3A 4N30A 1SJZA 2P5QA 4WR5A 3KXOA 6GSVA 4XTSA 4IQ1A 4KDYA 3O6TA 4K0NA 2F8AA 3IAM2 1SKWB 1G6WA 1NW2A 6GSSA 5KN2A 2VLTA 5DJLA 3UL3A 4K7IA 4PGTA 4KE3A 3EU4A 5AGYA 4KNDA 2OADA 4MCUA 5E4WA 2PWJA 3GH6A 2JADA 2H30A 2H70A 2L6CA 1F3BA 3NOFA 2I3YA 4KCAA 4PUFC 5D96A 4GSNA 3DEXA 3LWAA 3FRCA 3A3TA 2OE1A 4JR4A 5DQSA 2NTOA 1K0CA 1YZXA 1O7UA 3QD9A 3RHBA 1BX9A 2H73A 3UOMA 4MJEA 1SYXA 2C0DA 2L4QA 1PX7A 4OCFA 2AJQB 3C8EA 1WE0A 1GSFA 1FG4A 2E7PA 1OVNA 4RQRA 4G0IA 3N9JA 2IMDA 1TU8A 5H5RA 2VLVA 1MDIA 2YCDA 3LGCA 1BEDA 2B5XA 4GRFA 2CX3A 2P5RA 3VI5A 3D0ZA 5AIVA 1QMVA 3F4SA 2M46A 1EGOA 3FKFA 2BJXA 2GZYA 1URMA 4XRDA 3KM6A 2AUVA 2YZHA 3TRPA 2WB9A 2HRNA 3C1RA 1XWBA 2C1YA 3FYGA 2VLUA 5IPGA 3WGDA 4GTUA 1IYHA 1TK0B 4FO5A 4LL1B 4OO5A 1SKSB 5B6MA 2DJ2A 1PSQA 3HZ4A 4KGIA 3I6AA 4OCEA 2VCTA 1XW9A 4XHMA 1PL1A 3MSZA 3KMOA 2HE3A 4EXJA 2O89A 3DKSA 2V32A 3GMFA 3M9KA 5B6NA 5JWRB 3CTGA 2CA8A 2KLXA 4G2EA 2WGRA 1DE2A 3ZVJD 5J5NA 4IW9A 4DSQA 3GL3A 1YJ6A 2FWFA 5A4UA 3DXBA 1SKRB 2VIMA 2M72A 2B1LA 2KP1A 5GSSA 2H74A 5ID2B 2JL4A 2VM1A 2VAFA 1FO5A 2E0QA 2HXKA 3IC4A 2HQTA 2FD3A 4EC0A 5DAKA 4PXOA 2HRKA 1ZGNA 5ECIB 5KEJA 1K0NA 2VOCA 3PGTA 1YEXA 5ECMB 2L6DA 4OFTA 2LS5A 1ABAA 2YWNA 2H0HA 2OBKA 3ME7A 4MJBA 1X5EA 2VCXA 3F4TA 5ECKB 1TXXA 4J56E 4MZBA 2MMZA 1A0FA 2V2GA 1AAZA 3FZ9A 5D9TA 2FWHA 4POKA 3G7IA 2EC4A 1AW9A 3HCZA 3M3MA 3E3EA 2G0FA 2ON5A 5IMVA 2IMKA 1I5GA 1EWXA 3WD6A 1M7TA 5CRDA 4AJ7A 1SJIA 3P7XA 2TRXA 1BAYA 2XPDA 1HNBA 3ERWA 1MDJA 3KP9A 4L5LA 4MF7A 3TKRA 2I1UA 2IMEA 4BA7A 3BBYA 5HFKA 1NHYA 2GZPA 1R7HA 4WF5A 1A0RP 5J9BA 4X43A 2ON7A 4LMVA 4E8HA 3GKKA 3UARA 3DIEA 4KH7A 2LRCA 5DALB 3FY7A 4IN0A 4H86A 1O85A 2IL3A 3A2VA 3F4RA 1AQXA 2KHPA 4BL7A 2YJ7A 5GAPD 1OC9B 1PN9A 4ZB8A 3TJBA 2XBQA 3IV4A 1GH2A 6GSUA 2CQ9A 3LFLA 4WF4A 2HZFA 2FCHA 3CTFA 3ZZXA 1U3AA 4USSA 4ZB9A 4AGSA 2H6ZA 4KB3A 1SU9A 4TN8A 3GX8A 5CAXA 2O85A 1SL1B 1KEBA 2D2ZA 2TRCP 2GSSA 2WCIA 2VD1A 3W6GA 1Y6EA 4MK3A 5IO0A 1PMTA 3I69A 5F07A 3GH9A 3TOTA 3VWXA 2LQQA 1PA3A 1XBSA 1SENA 3GA4A 4RI7A 3EVIA 3QAWA 2MMAA 4I2UA 1DUGA 2H6YA 3RPNA 1TW9A 4HU7A 1QFNA 3G7YA 2DIYA 5IIZA 3GN3A 2ZUPA 1T3BA 4MPFA 1U6TA 5G30A 2FA8A 3H93A 4EUYA 1JZWA 1B9YC 2XHFA 5CREA 1Z3EA 4WR4A 2E2GA 4N0VA 4HU9A 4IVFA 3GSTA 2I81A 3MAKA 2X8GA 4EDZA 4PX1A 4KCEA 3KTLA 1GTUA 1CQGA 5CYYA 3S9FA 4EDYA 2L4CA 1SD9A 4LLRA 2K8VA 1JLWA 3C7MA 4PUAA 1XOAA 1EEJA 1YF1A 1O8WA 2L57A 4I2TA 3LXTA 2PMTA 1BG5A 3QCPA 3H79A 3HVSA 2C3TA 5G5EA 1Y25A 1JZDA 1X9WB 4K7NA 9GSSA 2LQOA 2VCZA 4KAEA 5HR2A 1HD2A 2WRTA 2C0GA 3MDKA 1T7PB 4JBBA 4DSSA 2PPTA 2MYGA 1E2YA 5IMCA 2OJLA 2O7KA 2H0IA 5IO2A 4YAVA 3QDNA 2C4JA 3QR6A 3EMPA 3MNGA 3HJPA 4EL1A 1HNAA 1R5AA 2DIZA 3EC3A 1ERUA 1Z7RA 2H1DA 2C0FA 3GKXA 1XPVA 3KH9A 3F63A 5C00A 1V9WA 2IN3A 3EINA 1EOGA 1BJXA 3F6DA 2OA7A 5ECRB 2R37A 3SBCA 4EE0A 2OE0A 3IBHA 1Z6MA 1XIYA 2L5LA 1AUCA 4NV5A 2HNLA 4TR0A 3R3EA 5EL8A 4BVXB 4K6XA 3IE3A 2PN8A 3ISOA 4MABA 1XVQA 1FOVA 3CSIA 3E0UA 5KN0A 3D5JA 4K1FA 4PQHA 5DQYA 2DMLA 16GSA 3DWVA 3WT2A 3IOSA 3L9SA 5CRHA 4KDXA 1TRVA 1H4OA 2X8CA 3G9BA 3I43A 4NHZA 3D22A 2PERA 4AF2A 2OKAA 2AHEA 4ZBBA 3GNJA 4GQCA 1O73A 1T4ZA 2YANA 4KW6A 4JRRA 5KN1A 4BWSA 4POLA 1M9BA 1Z5YE 3TKQA 4KUNA 3M9JA 3D21A 3PPUA 2V6OA 2A2SA 4XS4B 3ZVJA 2MMNA 2REMA 5ECHB 1R26A 3DD3A 4ECCA 2R3XA 4EKZA 5CNWA 5A4WA 2H19A 3L9UA 3TRQA 3OR5A 5J41A 3WYWA 2HYXA 2OACA 3AY8A 1A2LA 2LJAA 1G6YA 4MH3A 4MJCA 3FZAA 3F6FA 1MTCA 3K8NA 4ML6A 1JZRA 1T00A 5G1KA 3LG6A 2FLSA 3J7Yb 1OC8A 1SD8A 1S3CA 3LSZA 3F3RA 2YPMA 4XCSA 3C1SA 5CRWA 1B4PA 4HQZA 1TI1A 1F2EA 4YQVA 5EY6A 1ERWA 4O5RA 2FWGA 3Q74A 1Z7PA 4I6XA 1FB0A 1I9DA 4OO4A 1YEPA 5DVBA 3CSHA 1H75A 1PX6A 3UIWA 5ECLB 1ZOFA 4Q5FA 2DJ1A 3PH9A 2F3MA 5F8BA 2J23A 5IOWA 4Q5NA 3IHQA 2YN1A 4OD7A 4OFMA 4MZCA 4G9HA 5F06A 1PGTA 2L59A 5AISA 2LJRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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