2P9IB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
354
structure length
272
Chain Sequence
VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALDDMKHLWDYTFGPLLTEPPMVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 76
structure length 272
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iB03
3CERA 5BN8A 4FWLA 1Z6RA 4H0OA 4CZIA 1T44A 5EOYA 3FZKA 4FO0A 3HI0A 5EX5A 5AQQA 3H45C 2CGKA 2P9LB 4FL9A 3CQXA 4PL7A 3VEZA 4EIAA 4BRCA 1HX1A 1HPMA 1JCFA 1J6ZA 1GLLO 4NO7A 5AQRA 2CH5A 4BRIA 4K41A 4A61A 2FXUA 2WUSA 3CJ9A 2PAVA 3TU5A 3WXJA 2P9IA 3IFRA 5BRDA 3O8MA 3D2FA 4YDUC 4CD3A 3R8EA 5KPZA 4B1VA 3A5NC 5BRFA 1XC3A 5EXWA 4A2AA 2V7YA 4B9QA 4IJNA 1DEJA 2P9SA 3FR0A 5AFUH 5KPTA 1Y64A 1GLDG 4EFHA 2HOEA 2P9UA 4M7XA 5AQTA 4BRMA 5AQSA 4MLHA 4BRDA 1CZAN 4BQLA 4IWVA 2J4RA 3RSEB 3O4WA 2ZGZA 4H0TB 2IVOA 4QS8A 1E4GT 3W0LA 2E2QA 2E1ZA 4PKHA 3CJAA 3IDHA 1QQOA 4CZFA 4JN4A 4XEIA 3JS6A 4CD1A 2KHOA 3O5BA 4FPAA 3VESA 5KPRA 3D2EA 3VEWA 5AQHA 1WOQA 2E88A 3MMVA 2F9TA 3ATVA 2P9LA 3U9DA 3OHRA 2ZWHA 3O80A 4FWOA 1IG8A 3H3OB 3ID8A 4BC4A 4FSVA 4B1XB 1LOTB 1T6CA 2ZF5O 1LCUA 4BQZA 3UKRA 5LJWA 4XH1A 3FE1A 1RFQA 2VYPA 2AP1A 4O8KA 2PBDA 4PKGA 2I7PA 5KQ8A 4RTFD 3LDNA 5I9EB 3DJCA 5F2RA 2Q0UA 5TKYA 2FSNA 1V4SA 1NGCA 3AAQA 2FF6A 5BRHA 4WQ5C 4BVPA 3SMPA 1WUAA 4BRQA 5ADXH 5AZIB 3W3DA 4K25A 5AQJA 4BG9A 3QBWA 3FZLA 2Q97A 4IO8A 2QWMA 1ZBSA 5JLHA 5FPNA 1GLJO 3RSEA 2NZTA 1U2VB 1HLUA 5LJVA 1NGBA 1BU6O 5EVZA 3ENHA 1YXQA 3QMLA 3VF4A 2P9SB 4WQ4A 4B1ZA 4GNIA 3VGMA 1QZ5A 1HUXA 4KBOA 4BREA 2Q1NA 3LL3A 5AQNA 3BUZB 4WYBA 1OKJA 2AA4A 2D4WA 3GL1A 1V4TA 1NMDA 3L6QA 3U9ZA 5JMVA 4BC2A 3QB0A 1GLFO 4M7YA 4XH5A 4CZKA 4EHTA 2A6AA 3SK3A 2D1KA 1BG3A 1MA9B 3VF6A 3TPQA 1KAXA 2QWNA 1HKCA 1GLBG 2V52B 4BRGA 5F1XA 2E20A 3L4IA 3D2EB 2A42A 1QQMA 3SJHA 5ADXA 1SAZA 5BPMA 4AM6A 3EZWA 2CH6A 4BG8A 3U8XA 1ATRA 1NGDA 2IVPA 3P4IA 4BC3A 2BTFA 3FFKB 4H03B 3D7EO 1P8ZA 3O1WA 3MN5A 3ATUA 5AZJB 3LM9A 5AZIA 1QHAA 2ASMA 1HKGA 3HBTA 1TYQA 3BEXA 3UKRB 3VF2A 4PKIA 1NGJA 2Q0RA 5BPNA 3A8YA 1Z05A 2P9PA 4H5NA 2FSJA 4FOEA 1IJJA 1JCEA 1U2VA 2E8AA 4ISGA 4HTLA 5FPEA 2V51B 1KXPA 3FZHA 4BR4A 3VENA 2P9KA 1NGGA 5E84A 5BR9A 4WQ5A 3DAWA 4MO4A 5BPLA 1RGIA 2QWRA 2Q31A 2QWLA 3H46O 3S41A 3GG4A 4RCHA 2W41A 4WQ4C 3QFPA 3ZETA 3GBTA 5LY3A 2YHXA 1R59O 2QWPA 4BROA 4JHDB 4DHYA 3EKUA 3EO3A 3LDPA 5AQGA 2E2PA 4EAHD 1MWMA 4B1YB 4E1JA 2Q36A 1MDUB 4IXCA 1X3MA 4BR5A 4CBWA 2YHYA 3C0BA 3B8AX 2CGJA 4BRKA 1NGFA 3C7NB 3WUHA 2GWJA 4CI6A 5AR0A 2EWSA 3UKUB 4BR7A 3VEYA 4A2BA 1K8KA 3DXMA 3O1BA 4K43A 4JAXA 3QDKA 3ZX3A 1D4XA 5AQPA 5AQXA 3WEEA 3FZMA 2YI1A 2GEMA 3QBXA 3UB5A 2GTDA 4BVOA 5AZJA 2YJFA 1NM1A 1BO5O 3H6EA 2P9NB 1G99A 4FWQA 4M63C 1BOTO 4BRHA 3AY9A 2YHWA 5FPDA 3BF1A 4JD2A 2QWOA 1ESVA 3MK6A 3DWLA 4ISFA 5ELZA 1NGIA 4GY2B 1ATNA 2ASOA 1ATSA 2GWKA 3GDQA 3KVGA 1YAGA 5BN9A 4CZEA 1TUUA 4NB4A 4BR9A 4FWSA 4FOIA 3LDOA 1TYQB 3VEVA 3CI5A 4JHDA 4BRFA 2P9PB 2E2NA 2UYTA 1X9JA 2GELA 2F9WA 3A5MC 2HF4A 4FWNA 2P9KB 3CQYA 3IUCA 3MCPA 3ZX0A 3IMXA 3AARA 4FPBA 1RDWX 2HF3A 3A5LC 5CE3A 2E2OA 3CJ1A 4XH4A 3CHWA 3C7NA 3ZETB 4CZMA 4CZHA 1HKBA 3UKUA 3VGLA 5AQMA 3MDQA 2A5XA 4CZLA 4MLEA 3VPZA 1MWKA 3FGUA 3MN7A 1JCGA 1S3XA 4BC5A 1X3NA 2Q2RA 3VEXA 4FWPA 2NRHA 3DXKA 2QM1A 3L0QA 1C0GA 4O5FA 3MN9A 2P9NA 1T6DA 4ISEA 2V7ZA 3H3NO 4J8FA 1XUPO 4H0PA 2YJEA 3CIPA 1K8KB 3DXMB 3EL2A 3I8BA 2IIRA 1E4FT 3VGKA 4H5TA 4JNEA 2E1YA 5AQIA 3WEEB 3VERA 4HWIA 4H5WA 4RWTA 2ZGYA 4K42A 4CBXA 2HMPA 2FLOA 3CJ7A 2DPNA 2FSKA 4LC9B 1SQKA 2BUPA 1HJOA 4JD2B 3QFUA 3R6MA 3KHYA 3EN9A 1BDGA 3KZBA 1YVNA 2A41A 5KQDA 4CZJA 3ENOA 4H0VB 3BP8A 3H1VX 4A62A 3UE5A 3R9PA 2VWBA 4QS7A 4Z94A 4PL8A 5AQFA 1BWFO 4C23A 3ULEA 3JXUA 4DCHA 3O08A 1GLEG 3HM8A 4I6MA 1NGAA 2W40A 4FWMA 1H1VA 3WXKA 3AAPA 3SLCA 4CZGA 4BGBA 1KAZA 2QXLA 4IJAA 5AQLA 1ZXOA 3ZEUA 3CJCA 2A3ZA 4BRAA 5AQYA 4B1UB 4BRLA 4B1WB 4EHUA 3GE1A 2ASPA 1BUPA 5BREA 4AM7A 5JICA 4BRNA 3GOIA 1BA1A 1C0FA 5AQWA 4DQ8A 3A0IX 3WXLA 3FLCO 3HSCA 3LDQA 5FPMA 2YCHA 1KAYA 1NGHA 4MO5A 3DXKB 1ZC6A 4Y0WA 3CETA 1S22A 5EY4A 1QQNA 1NLVA 2NLXA 5AQKA 4BR0A 3HZ6A 3J8AA 2D0OA 3M1FA 3VOVA 2VCPA 4CBUA 3M3ZA 5B8HA 4F9OA 1NGEA 3WQUA 1GLAG 2QW9A 3VETA 3WXIA 3I33A 1BA0A 1XQSC 3BF3A 3A5OC 2D0PA 1Q18A 4H0XB 2I7NA 1YUWA 5AFUA 3G25A 5AQVA 3F9MA 3SMSA 4H0YB 3WQTA 3VEOA 1EQYA 4IZ9A 1DKGD 5F0XA 4H5RA 3U4LA 3HTVA 4DB3A 4L3QA 5JLFA 3O6WA 3MN6A 4CJ7A 1U6ZA 3LM2A 3QICA 5AQZA 3LDLA 3ULEB 2P9IB 4BR2A 4YDUA 3FZFA 3D2FB 2H3GX 4I6MB 3H1QA 2OANA 4FWRA 3CJBA 5AQUA 4BGAA 1GLCG 1DGKN 2IVNA 4FWKA 3ZEUB 3WT0A 3EKSA 4H5VA 1NBWA 3M6GA 1QZ6A 2QWQA 4QS9A 2ITMA 2P9UB 1NWKA 1TUYA 3ZX2A 1SZ2A 2FF3B 5AQOA 2A40A 2CGLA 5E26A 2GUPA 4BRPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KZMA 2Z1IA 2Y1IA 3HI0A 1G15A 3H45C 4FL9A 3B6OA 4JK8A 4CJ5A 2O8DB 2HNZA 2PYJA 1GLLO 2O8CB 3E66A 4BRIA 1VQLN 2KTQA 1JXEA 3U3GA 4C1NI 4AHSA 3IFRA 5HLFA 2YHBA 2RN2A 2KLAA 4CD3A 5HL7L 4YY3K 1VRTA 4B1VA 3OW2M 4DQSA 1NJXA 2KFNA 2XHBA 1XC3A 4CJPA 5C2DA 3THWB 4A2AA 2P9SA 3S9HA 5KPTA 1Y64A 4GMJB 4FK4A 4EFHA 1SUQA 4M7XA 3WNGA 1WAJA 3RMBA 1L3UA 3KK2A 1KQSM 1ASWA 3NVMA 4BQLA 2UXCK 4IWVA 1KVCA 3O4WA 1IKYA 4IFVA 3DLEA 4KHQA 4PY5A 2IVOA 2E1ZA 4CEZA 3IDHA 4XEIA 2O8EB 4CD1A 4W5QA 3C95A 3VESA 5KPRA 3G4SN 2F9TA 4DQRA 3RR7A 3JYTA 3U9DA 3OHRA 3OS2A 5SWMA 2HNDA 1SKSA 5CYMA 3DLKA 3H3OB 2O8CA 4JI7K 3LALA 4JRPA 5M1QA 4GV6A 4LFCK 4YNQA 3F5TA 1RFQA 3G6EN 2VYPA 1BCOA 3PIPL 3LAKA 3OA9A 3I8DA 4DSJA 4OKEA 2FSNA 3THWA 1VSLA 4H4MA 3SCXA 4C8MA 4BRQA 4F2RA 3QBWA 3FZLA 3TTCA 4U7BA 4JKGA 4RW4A 2DY4A 5FPNA 3DOLA 4OO1J 2D0BA 2NZTA 1YHQN 4BE2A 2HBMA 2O8EA 4B1ZA 2BANA 1T03A 4KBOA 4LH5A 4BREA 2IS3A 2OPQA 3BUZB 1OKJA 2AA4A 3GL1A 3EY1A 3J7AP 1NMDA 3AA5X 3OVNA 2XO7A 3ASMA 3QB0A 1GLFO 3RMCA 5HRRA 4CZKA 3SK3A 1TAQA 4ID5A 4I9QA 4E1NA 4CGGA 2WTUA 4FM1A 3VF6A 2XY5A 1I94K 3CF5L 5KGXA 1VQPN 1FXXA 1FKPA 2DTUA 2E20A 3D2EB 3PX0A 1TKTA 2A42A 1FJGK 1DTQA 3SJHA 4DS5A 2HHVA 4RW9A 3AVBA 4G1QA 3U8XA 3P4IA 2IVPA 4BC3A 4B9LA 3FFKB 4X62K 4OPHA 4IOAL 1U47A 5AZJB 3SNNA 4GKJK 1YTUA 4FW2A 1TYQA 3UKRB 5BPNA 2IGIA 4HUFA 4CGFA 1KVAA 3TTFA 1Z05A 3E9PA 1IJJA 5KGWA 2ITGA 3VQCA 4ISGA 3SV3A 5FPEA 2IAJA 1KXPA 4JV5K 3DMJA 4JKHA 5E84A 5BR9A 3DAWA 3DLRA 4NLBA 3K5NA 2QWRA 3AVAA 3BGRA 5LY3A 2YHXA 1R59O 3WNEA 5KRSA 4CJ4A 2HNYA 4FZYA 2HBJA 3EO3A 4MFBA 4RW7A 4FJJA 4EAHD 4FJXA 3AGKA 3KK7A 4IXCA 3MWTA 5SZTA 4BRKA 4Z4CA 3WUHA 4IDKA 5AR0A 2EWSA 3UKUB 3VEYA 3O1BA 4JAXA 3AVFA 3ZX3A 4DSLA 5LMUK 1D4XA 5AQXA 2GEMA 3HPGA 4KPYA 4F3OA 3IS9A 4BVOA 5AZJA 4WFNL 1VQMN 3MEEA 5FDLA 1DT9A 3NGYA 1IV0A 4BRHA 5JS1A 3T69A 5FPDA 2QWOA 1XHZA 3MK6A 3DWLA 4E7LA 1YJNN 4ISFA 4KI4A 2O8BA 1ATNA 2QTDA 4KTZA 5JENA 1ATSA 1IBLK 5BN9A 1TUUA 3OJUA 4FWSA 4HHTA 2BDPA 4FOIA 3SUPA 3CI5A 1HQEA 2P9PB 2GELA 2O4IA 2HF4A 4FWNA 5DK5A 2P9KB 2ZD1A 1JL2A 3ID6A 3ALYA 3MCPA 3V9XA 1DTTA 1FK9A 1RDWX 3A5LC 1WAFA 4YHHK 1VSFA 3LPTA 4CZMA 4IFYA 1A5VA 3UKUA 3KLGA 5AQMA 4MLEA 1HPZA 3FGUA 3MN7A 4KFBA 5I42A 4J2AA 3G0ZA 5M1FA 1HNXK 1C0GA 4DV0K 3NF9A 1VSHA 1Q81O 3AVJA 5JVGL 4DTPA 1K8KB 3DXMB 1ZBHA 3PX4A 4JNEA 1ZBLA 1Q7YO 3WEEB 4HWIA 4DSFA 2ZGYA 3TSQA 3WNHA 1T8EA 4F4KA 3CJ7A 2D5RA 1IKXA 1Q9YA 2OPRA 4KV8A 3U3YA 1ITGA 2HMIA 4CZJA 3RRHA 3ENOA 5M1PA 3L4QA 4A62A 3UE5A 1RTJA 5EU7A 1W0HA 3O9SA 3CXCM 4JKCA 4QS7A 4M41A 4DSIA 1GLEG 2QKBA 1S6PA 2FBXA 3MCAB 1TGOA 1NGAA 4B9UA 4M3UA 2O8FB 2HHHK 4M3ZA 1S9GA 3VA0A 3TI0A 3EE9A 4CGDA 1ZXOA 4AF1A 4JLHA 4BRAA 5AQYA 4Y1DA 4BRLA 4EHUA 4OLAA 5GIPA 2YNHA 2PFUA 1T7PA 1U04A 1OVYA 4CJUA 1RILA 4BRNA 3S3OA 3PIOL 4BE0A 1C0FA 4B08A 1J5OA 4DQ8A 4JKDA 3HSCA 4DG1A 2ZE2A 3TAFA 1KAYA 3DLGA 4Y0WA 5IWAK 2XY6A 2BGGA 3OBYA 1N8RO 3DLHA 3HZ6A 3A2FA 2D0OA 1SS6A 3M1FA 3NVKA 2VCPA 4CHNA 3M3ZA 1JXBA 1NK6A 3V81A 1RCHA 3DLBA 2X74A 1BA0A 3C65A 3M8QA 3A5OC 3LAMA 5AFUA 5AQVA 1TK5A 3F9MA 3MAQA 4KH6A 3SMSA 3WQTA 4WF9L 4IZ9A 1DKGD 4CEDA 4DB3A 2VQFK 1QVGM 3AA4A 3MN6A 2Y1JA 2RHKA 1UA0A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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