2P9LA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
415
structure length
399
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 124
structure length 399
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2p9lA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9lA04
3JS6A 4XH1A 3DXMB 4CZKA 3IMXA 5AQOA 2IVPA 5AQPA 2KHOA 1KAYA 3AY9A 3CETA 3D2EA 3C7NB 4DQ8A 4FPBA 5JLHA 3FZLA 1BG3A 3R9PA 4BR9A 1BWFO 4XH5A 2GEMA 2E8AA 2CGLA 4NO7A 4C23A 4NB4A 3KVGA 3CIPA 2WUSA 1DGKN 4DCHA 5AZIB 3TU5A 5BRDA 4H5RA 4J8FA 5AQHA 3VERA 5AQNA 1T6DA 4JD2A 1MDUB 3QICA 4IJAA 5E84A 3VETA 1U2VB 3FZHA 4FWRA 3O1BA 4BRNA 3FGUA 4FL9A 1JCFA 4CD3A 1QQOA 2P9UA 2D1KA 2ZF5O 1GLBG 3VGKA 1NGJA 2IVNA 1E4FT 3EL2A 3MN9A 4FPAA 4A61A 3FZMA 3U8XA 2FSJA 3ID8A 1WOQA 3BUZB 3EZWA 3GBTA 2P9PA 5AQMA 4WQ4A 1V4TA 5EXWA 1K8KA 5FPEA 2ZGYA 4BC4A 4A2BA 3GDQA 4IXCA 4BRHA 1CZAN 5F2RA 3H3OB 1T6CA 3GOIA 2YHWA 4Z94A 4BR2A 4MLHA 1XUPO 4DHYA 3DAWA 1NGGA 2FF3B 4BQZA 4M7XA 1OKJA 4EIAA 2D0OA 3BEXA 2P9LB 2W40A 3LL3A 4KBOA 4EAHD 5EOYA 3ZX0A 4EHUA 5ADXH 1Y64A 4MO5A 4RTFD 4A2AA 3EO3A 2A6AA 3H46O 4JNEA 2F9TA 3MDQA 4PKHA 4FWPA 3ENHA 3VEZA 3WEEB 3MN6A 3WXLA 5BRHA 2A40A 4CD1A 2E2NA 1S3XA 4CZGA 2CH5A 4FSVA 2NZTA 5ELZA 1YVNA 4CBXA 5JLFA 1SAZA 1NGBA 3O08A 5BPMA 3CJ1A 3UB5A 4ISGA 1E4GT 4CI6A 4CZJA 3CQYA 3FZFA 5AQTA 1QZ6A 2HMPA 3DXKA 4BR0A 1HLUA 1TUUA 1BO5O 1NGEA 1YAGA 3VF4A 2GWJA 2V51B 4CBWA 3D2EB 3G25A 3M6GA 4BR5A 3I33A 1HX1A 1LOTB 2Q0UA 2E1YA 5AQYA 2HF3A 2F9WA 2Q36A 5FPMA 4EFHA 1DKGD 3FFKB 1T44A 1GLLO 1GLJO 5BPNA 3HTVA 1NGIA 4BRGA 2E20A 4BRIA 2J4RA 3F9MA 3SMPA 1HPMA 3FE1A 4IZ9A 3LDNA 2VYPA 4F9OA 4BGBA 2ASPA 3A5MC 3JXUA 4H5VA 1ESVA 3FLCO 2PBDA 1Q18A 4MLEA 4FWNA 2NLXA 3A8YA 4JD2B 3WXJA 4BRPA 5AQWA 1YUWA 1NGDA 2GELA 4BVPA 4H0PA 2P9IA 5BPLA 1QQMA 4BROA 1ATSA 3R6MA 1X3NA 2CH6A 3CHWA 1NGHA 4FOIA 2YJFA 2QM1A 4JAXA 4CZIA 2P9UB 5E26A 5AQUA 4CZFA 1HUXA 2P9KB 4WYBA 5FPDA 5AQGA 5AQKA 5LJWA 5KPRA 2QXLA 4YDUC 2P9PB 3GE1A 3U9ZA 3R8EA 2BUPA 4IO8A 1K8KB 2A3ZA 3D2FA 3S41A 2A5XA 3FR0A 4ISFA 2ITMA 5BRFA 1NLVA 4PKIA 3IDHA 3A5LC 2I7PA 1NM1A 3MK6A 4BGAA 1RFQA 2P9NA 3QBXA 4H0VB 1D4XA 1BU6O 1NGFA 1NWKA 3O80A 2E2PA 2Q1NA 3SLCA 3H1QA 3QFPA 2FXUA 3BF1A 4FO0A 2P9KA 3EKSA 4LC9B 5EY4A 4BR4A 2Q0RA 4H5TA 2QWMA 5AQQA 3WQUA 3UKRA 4JN4A 3FZKA 5AQLA 3O1WA 3H3NO 4O5FA 1ZBSA 3H6EA 1MWMA 4CZEA 1BA0A 3D7EO 3VEVA 1NGAA 3OHRA 3DJCA 3WUHA 2D4WA 5KPTA 3SMSA 3LDLA 1H1VA 1R59O 1JCEA 3CJBA 4FWSA 3A5OC 3RSEA 2QWNA 3U9DA 4WQ5C 3L0QA 3ULEA 1BDGA 3DXKB 5F1XA 2HF4A 4FWLA 4K25A 4CZLA 3B8AX 1YXQA 4B1YB 1BUPA 2Q2RA 1QZ5A 1WUAA 4O8KA 3ATUA 4BRDA 3VGLA 2ASOA 3WXIA 2VCPA 3C0BA 3EKUA 3QMLA 2A41A 4QS7A 4E1JA 5AQIA 1ATNA 2QWPA 3LM2A 3WXKA 5AZJA 4B1ZA 5AFUH 3SK3A 2QWOA 5AQSA 3ENOA 5BR9A 3CERA 5AQZA 1SZ2A 3L6QA 5B8HA 1NMDA 2IIRA 1V4SA 4PL8A 1XQSC 3CQXA 4B1XB 2PAVA 2YHXA 4XEIA 3SJHA 1BOTO 4BRLA 4AM7A 1P8ZA 1ATRA 3DWLA 2CGJA 5BN8A 1C0GA 2P9IB 5F0XA 5KPZA 1KXPA 4GNIA 2GUPA 4MO4A 3LDOA 4FWMA 1GLEG 4XH4A 5FPNA 5BN9A 4BREA 3IFRA 1HJOA 2FF6A 1MWKA 2E88A 5ADXA 3ZETA 1DEJA 2UYTA 4JHDA 4HTLA 3HM8A 1NGCA 1TYQA 4CBUA 3AARA 3D2FB 4BR7A 2I7NA 3EN9A 3LDQA 3MCPA 3KHYA 5KQ8A 2AP1A 4I6MB 3HBTA 1IJJA 1S22A 2ASMA 5TKYA 2P9NB 3CI5A 3UKUA 1U6ZA 2Q97A 1ZXOA 4H5NA 3VEOA 5KQDA 4BRQA 3VESA 4CJ7A 3VEYA 4H0OA 1J6ZA 4YDUA 4BQLA 5EVZA 4IWVA 2P9SA 3O5BA 2QW9A 3QB0A 4FWOA 2ZWHA 3LM9A 3UKRB 2H3GX 3GG4A 2BTFA 3MN7A 2DPNA 1EQYA 4H0TB 4B1WB 5CE3A 3ZX3A 4B1VA 3H45C 4H03B 1HKGA 1QHAA 4I6MA 2A42A 2D0PA 1Z6RA 5AQVA 1NBWA 5EX5A 4QS9A 3RSEB 5AQXA 3ULEB 3ZEUA 4FWKA 1IG8A 4DB3A 5JICA 3TPQA 2Q31A 2OANA 3ZX2A 3DXMA 2E2OA 5AQFA 2QWRA 4L3QA 2IVOA 3GL1A 3QBWA 2VWBA 4QS8A 3C7NA 3HSCA 3O6WA 5AZJB 1KAXA 1X9JA 5I9EB 1SQKA 3A0IX 4B1UB 4H0XB 4CZHA 4BRAA 4RWTA 4WQ5A 3HZ6A 1HKCA 4K43A 2V52B 3MMVA 3MN5A 4Y0WA 3CJ7A 2YI1A 2V7ZA 2ZGZA 3P4IA 4EHTA 2GWKA 4RCHA 5AZIA 5BREA 3VF2A 2GTDA 3CJCA 4FWQA 2QWQA 2FLOA 4WQ4C 4B9QA 4GY2B 1U2VA 2NRHA 3BP8A 3W0LA 3VOVA 2YCHA 4AM6A 4BG9A 4BC3A 3AAQA 3I8BA 3VGMA 3ZETB 3AAPA 3QFUA 5LJVA 3CJ9A 3U4LA 3KZBA 4A62A 4JHDB 1LCUA 1TYQB 2YJEA 2QWLA 5JMVA 3VPZA 3O4WA 4FOEA 4ISEA 3WT0A 1Z05A 4BC5A 1RGIA 4H5WA 2FSNA 5AQRA 1JCGA 5AQJA 1TUYA 4BRMA 3M1FA 4BRCA 3CJAA 4M63C 3UKUB 4BVOA 1BA1A 3QDKA 4M7YA 3A5NC 4PL7A 1XC3A 3M3ZA 2HOEA 2FSKA 1G99A 2E2QA 2P9LA 2P9SB 3H1VX 1KAZA 4PKGA 2V7YA 4K41A 4H0YB 3ATVA 3HI0A 3VEXA 3J8AA 3L4IA 1GLCG 4HWIA 3VEWA 3O8MA 2YHYA 3VENA 3WEEA 5AFUA 3W3DA 5AR0A 3WQTA 4BRKA 3UE5A 4BRFA 1GLAG 2CGKA 1QQNA 1HKBA 1ZC6A 2W41A 3IUCA 1MA9B 1GLDG 5LY3A 1X3MA 3VF6A 1C0FA 4BC2A 1GLFO 4IJNA 2E1ZA 3ZEUB 1RDWX 2AA4A 2EWSA 3BF3A 3LDPA 4BG8A 4K42A 4CZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JS6A 3G4SN 4CZKA 3KLGA 3CCEN 1LAVA 1KAYA 4EP4A 5GAEP 3D0PA 3THYB 1EKEA 5C12A 4J2AA 3R9PA 4YOWA 3QEVA 2HW3A 5CZ1A 4NO7A 3O4NA 4NB4A 4DG1A 2IAJA 4W5TA 2GV9A 2KQ2A 4BECA 2P5GA 4H5RA 1XNQK 4DSKA 4E19A 3Q7CA 3MXIA 4L8RB 1RDAA 1EO1A 3QICA 3QO9A 5M1KA 1NJXA 4KHNA 1U4BA 1VHXA 3CF5L 3ZT1A 4FL9A 3O9SA 2P9UA 1TL3A 3P5JA 1KCFA 3MN9A 1NOZA 3DLRA 3WXMB 4BY9C 1WOQA 1E3MA 4B3TK 3EZWA 4JEPA 2P9PA 5AQMA 4WQ4A 1V4TA 3M8PA 2Z1HA 2P1JA 5FPEA 1QTMA 4BC4A 3KIOA 4B3RK 4N41A 1CZAN 1C0MA 4CEAA 4MLHA 3CPEA 1NGGA 2FF3B 5KRSA 1UA0A 4B3SK 4DTUA 4EAHD 1TK0A 4RTFD 3H46O 4JNEA 4HHTA 3SQ1A 4FWPA 3VEZA 1VQKN 4JI8K 3WXLA 5BRHA 5JS1A 4GMJB 4GVEA 4CD1A 3PO5A 1VSLA 4CK1A 5J2MA 3WNEA 2NZTA 1VQPN 4IG3A 4O55A 3LALA 4F3TA 4ISGA 4MDAA 4BDPA 4DR5K 3FZFA 1KQSM 4CEEA 1YAGA 5FRNA 2HHWA 1L3TA 3KWGA 4DU1A 2W6KA 1DTTA 1X9MA 1HYZA 2NRVA 4JKHA 4IFEA 1JLFA 3F73A 5JVGL 3FFKB 3NH1A 3QESA 3NF9A 3RMDA 5BPNA 4DS4A 1NGIA 2E20A 3SMPA 3LDNA 3JYTA 3CCSN 3JXUA 1VSKA 4H5VA 1HQUA 2OCEA 3FLCO 2PBDA 4MLEA 4CEBA 2NLXA 4JD2B 3JSMA 2Y1JA 1RDUA 2A1RA 1B9DA 2P9IA 4H0PA 4J2DA 1ATSA 4E7KA 3OYHA 1TKTA 4DV7K 3NMUA 2CH6A 3SJJA 1WSIA 5E26A 1U47A 4CZFA 2FBYA 3PUFA 4AF1A 2VG6A 4C8OA 3O9UA 4JKDA 3D45A 3MAQA 3MX5A 4TSXA 2BUPA 4IO8A 2A3ZA 4CEZA 4RW8A 1XMQK 3KJVA 3Q7BA 4JI2K 2I7PA 1NM1A 4DR6K 3TAEA 1U45A 5KGXA 1OH7A 3EKSA 1N33K 2G8FA 2IGIA 5EY4A 4H5TA 4JN4A 3FZKA 1NKCA 1N6QA 4KHUA 4GW6A 2VGMA 1VQ7N 2YV0X 4CZEA 4E72A 4F2SA 4BE7B 2DFFA 3TI0A 3F9KA 1K9MO 4MFBA 3HP6A 3K59A 4CGDA 3V1QA 4WQ5C 3L0QA 4JI6K 3DXKB 5F1XA 5M1OA 5CY4A 1RNHA 3WNFA 4CHOA 3SUQA 1M90O 3KK7A 2DTUA 3EKUA 5M1PA 4E1JA 4CCHA 2QXFA 3OW2M 2QWPA 3WXKA 4FCYA 4RW6A 5AQSA 3CERA 3CG7A 5AQZA 5J2NA 3L6QA 3OJUA 3ID6A 1XQSC 3V9SA 1J5EK 4XEIA 1RBRA 3SJHA 3QEWA 4O0IA 3VQQA 1BOTO 2PYJA 1ATRA 4CJ3A 4GVMA 2CGJA 4E0DA 3VQ4A 1KXPA 4GNIA 4MO4A 3SBTA 5C2FA 4XH4A 5BN9A 2ZJRL 3IFRA 3DLBA 4G9ZA 4OPAA 4GV3A 3SCXA 4M3TA 3V1RA 4CEQA 3PSFA 1T3VA 2HHSA 4HTLA 3OTOK 3DRPA 2R7YA 1TKDA 2O8FA 1LW0A 3D2FB 4Z4EA 3U3GA 4BR7A 3S9HA 1W2BM 1IJJA 2I5JA 1S22A 2ASMA 3M8RA 3DM2A 1NK9A 4LFBK 4FJGA 1U6ZA 5KQDA 4YOYA 1D5AA 4BRQA 2D0AA 3BY5A 1TAQA 4H0OA 4CJ7A 2OTLN 1J6ZA 4E1NA 5HROA 1NKEA 3O5BA 4X65K 3LM9A 3UKRB 3GG4A 3SAHA 2BTFA 1EQYA 3SZ2A 4DSIA 1YT3A 3SV3A 3H45C 4H03B 1QHAA 2A42A 2G8WA 2D0PA 1XHXA 3OYBA 4B9VA 3ITHA 4I7FA 1W0HA 3RSEB 4FJXA 3ULEB 2ATQA 4DB3A 1IG8A 3RMCA 4B3MK 3A2FA 5CYQA 3CMEN 4FJJA 2YX6A 1T03A 3IRXA 4OJRA 5IT9O 2OANA 3ZT4A 5GADP 3DXMA 1RILA 2KZZA 3QERA 4M41A 4BE0A 2IVOA 4Q0BA 3GL1A 2VWBA 4QS8A 4ID5A 2FBXA 2IC3A 2EHGA 4B9MA 4WQ5A 2V52B 1KVCA 2C1IA 4G1QA 3VTIA 2PZSA 1TK8A 2HHIA 3LPTA 4IFYA 3DI6A 1Z25A 4RCHA 3DLEA 4F3OA 5BREA 2GTDA 4DTSA 1O13A 1JLQA 5HBMA 3G0ZA 2FLOA 4BEBA 3ZT2A 3N4PA 4GY2B 1HNIA 3W0LA 3ENBA 4JI0K 4BC3A 2OTJN 3ZSOA 3ZETB 1Q7YO 1VQLN 3HM9A 3KZBA 4A62A 4JHDB 4O8UA 1N34K 4CHZA 1TYQB 3CCJN 3I0SA 3ZSWA 2OA8A 4FJ8A 4BDYA 1I94K 4ISEA 3WT0A 4FZZA 4RW9A 1TUYA 4RG8A 4BRMA 3M1FA 2RN2A 4M63C 1S72N 3UKUB 4YY3K 5C15A 4OLBA 1GOBA 4PL7A 4Y1CA 2FSKA 2P9SB 2ZM6K 3NF6A 4K0KK 5LMNK 5HL7L 3PX0A 4KRFA 4C8NA 4N56A 3NFAA 1OVQA 4FJHA 3WQTA 4BRFA 4CHYA 2W41A 1EP4A 3LWMA 1X3MA 3VF6A 1NK8A 4BC2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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