2P9NB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
QAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 51
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9nB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9nB02
1IJJA 5AQKA 2ITMA 3M3ZA 4AM6A 3WQUA 2Q36A 1YVNA 5B8HA 2D1KA 5E84A 1SQKA 1WOQA 2YHWA 3FGUA 4GNIA 2ASPA 4QS9A 3MK6A 2A41A 5AQOA 1J6ZA 1QQMA 3TU5A 2H3GX 2P9SB 2YI1A 2GWJA 3RSEA 5BRFA 3MN9A 4BRMA 3ATVA 5LJWA 3H46O 3D2FA 4JNEA 5EY4A 4FOEA 4H5RA 3U8XA 2GEMA 4EHTA 5AQNA 1BU6O 2VYPA 3SMPA 1NGHA 3J8AA 5AQZA 3FZFA 3HZ6A 2FF6A 3WEEA 3LDPA 4B9QA 1OKJA 2A40A 5FPNA 5AQMA 3M6GA 3G25A 3B8AX 5JICA 2F9TA 3QBXA 1QZ5A 5AZIB 1HKGA 1SAZA 4B1YB 4BR5A 1GLFO 3A5MC 2Q31A 2ASOA 2CGJA 3WXJA 4KBOA 1JCGA 4BQZA 5FPEA 1JCEA 1T6DA 4XH4A 3UB5A 2P9PB 1GLEG 4B1XB 3AY9A 2QWLA 3VGLA 3JXUA 1G99A 4DQ8A 3ULEB 3QDKA 3SK3A 4H0OA 1BDGA 3H1QA 4CZHA 2ZGYA 4BVPA 2J4RA 2IVPA 1DEJA 2A3ZA 3I8BA 4BGBA 3EL2A 4C23A 2WUSA 4CZKA 3FE1A 4H0YB 5AQYA 4XH5A 5FPMA 1E4GT 3VF4A 2IVNA 4K43A 1NGJA 4BVOA 2HF3A 3DXKB 3EKUA 4I6MB 3VEVA 4BR7A 1YUWA 3ULEA 3SJHA 3UKUA 2FLOA 3JS6A 4YDUC 4DCHA 3GL1A 4WQ5C 1YAGA 4H0VB 1NGGA 2D4WA 3BEXA 3O08A 5AQUA 2QWOA 1D4XA 1ZC6A 2HOEA 4JAXA 4BRCA 5JMVA 1NGDA 3CERA 4CZGA 3BF1A 3FFKB 3ZX0A 5LY3A 5I9EB 2QWMA 4XH1A 3ENOA 5KQ8A 4WQ4C 3H3OB 1NWKA 4RTFD 3CETA 5F0XA 4BREA 3QMLA 3WT0A 5BPMA 2BUPA 3VEXA 5EVZA 2P9KA 3GOIA 4IWVA 4O8KA 3H45C 2FSNA 4FWNA 2E2PA 2CH5A 5BN9A 3OHRA 3ZX3A 3U9DA 1GLLO 5TKYA 3HI0A 1NGCA 5AFUH 4JHDA 3TPQA 5AQWA 5BREA 1HKBA 3W0LA 3RSEB 1BA1A 2E20A 4CJ7A 1JCFA 3D2FB 4MO4A 4BR2A 5BPNA 4K25A 3ZETA 2QW9A 3MDQA 4BR4A 2A5XA 1SZ2A 2GELA 3GE1A 4BC4A 3R6MA 4IO8A 4PKIA 1T44A 3VGMA 1GLDG 3WQTA 2P9UA 1NBWA 2I7NA 2Q0UA 2A42A 3WEEB 3LDQA 5AQGA 3IMXA 1HPMA 1LCUA 1MA9B 3CJBA 2P9LA 4GY2B 4A62A 4FWOA 3FZHA 3VESA 5BR9A 1KAYA 4FWLA 4H5NA 2F9WA 4BRFA 5KPRA 4L3QA 2E2OA 5JLFA 3AAQA 3GG4A 1HX1A 5AQRA 4IXCA 4EHUA 5F2RA 1IG8A 1XUPO 3O1WA 2NLXA 2YHXA 3VETA 2EWSA 1NGEA 2KHOA 5CE3A 3HTVA 1BUPA 1T6CA 2V7YA 1MWKA 3A5NC 4BC2A 4BC5A 4A2BA 2YJFA 1BA0A 1LOTB 4FL9A 2D0OA 3A5LC 3IUCA 3IDHA 1KXPA 1V4SA 3H3NO 3O6WA 1ATRA 4E1JA 3QFPA 1DKGD 5LJVA 1DGKN 2E1YA 4QS7A 2V7ZA 3FZMA 1GLCG 4FWPA 3C0BA 2ZWHA 3VEYA 4DHYA 4BROA 3UKUB 4AM7A 4PKGA 2FSJA 3EO3A 4BQLA 2CGKA 1HUXA 2E2NA 3CHWA 2IIRA 3WXKA 3UKRA 4M7XA 3VEZA 3L0QA 5AQQA 3VENA 3KVGA 4K41A 4BRGA 2A6AA 4B1UB 3C7NA 3GBTA 4WQ5A 2GTDA 1C0FA 2NZTA 3ID8A 4B1WB 3AAPA 4MO5A 5F1XA 4Z94A 1QHAA 1TYQB 3M1FA 3GDQA 4FSVA 4BR0A 3CQYA 4BGAA 4BRLA 1YXQA 2P9NA 4EFHA 2P9KB 3VPZA 5KQDA 3DXMA 4WQ4A 3F9MA 2E1ZA 3CJ1A 2FXUA 2GWKA 3AARA 4FWRA 4FWQA 3D2EA 3MCPA 5KPZA 3FLCO 2E8AA 4ISGA 4JHDB 4B1ZA 2VWBA 3EN9A 1NGBA 4CBUA 4FOIA 4BRHA 2QWQA 1QZ6A 4FPAA 4CI6A 1TYQA 1NGAA 3DJCA 4M7YA 3ZETB 5AQVA 1HLUA 2OANA 5ADXA 3VF6A 5FPDA 3H6EA 3EKSA 2Q97A 3LL3A 2P9UB 1GLJO 4IZ9A 1H1VA 4F9OA 1HKCA 5AQTA 4FWKA 3ZEUB 3R9PA 1KAXA 3SLCA 4BRPA 1XQSC 2P9LB 3O4WA 4HTLA 4FWMA 1X9JA 3P4IA 3VF2A 3ENHA 1Q18A 5AZJA 4IJNA 1NGIA 1S3XA 2Q1NA 4RCHA 3EZWA 4A61A 1NGFA 2V51B 2P9IB 1K8KA 1Z05A 3ATUA 4H5VA 4J8FA 5AQXA 3HM8A 3WXLA 4A2AA 5BRDA 1U2VA 4BR9A 4H03B 3ZEUA 4BRAA 3H1VX 4ISFA 3A8YA 2YCHA 1HJOA 1NMDA 3LM2A 2QWRA 2CGLA 4JD2A 1QQOA 1TUUA 2GUPA 1BO5O 5ELZA 4DB3A 3MN6A 4BG8A 1QQNA 3U4LA 5BN8A 1RGIA 3W3DA 3QB0A 2P9IA 3CJ9A 1ATSA 3D7EO 1V4TA 1EQYA 1X3MA 3CJ7A 3MMVA 3A5OC 2QWPA 2UYTA 3QICA 2HMPA 3UKRB 4EIAA 1WUAA 5BPLA 2HF4A 2AA4A 1BOTO 5EX5A 4QS8A 5AQFA 1ATNA 3C7NB 3LDLA 4BG9A 4BRIA 5BRHA 1TUYA 4RWTA 1P8ZA 1MDUB 3DAWA 3R8EA 4EAHD 3WUHA 2ZF5O 3CJAA 4BRQA 3O8MA 3DWLA 2YHYA 2DPNA 1NLVA 2E2QA 1BG3A 2YJEA 4BRKA 3O1BA 4MLEA 2CH6A 4ISEA 2P9NB 4CZIA 4H5TA 4BRNA 1XC3A 2P9SA 3DXMB 2QM1A 5AQLA 1GLBG 3MN7A 4NB4A 4YDUA 1NM1A 4BRDA 3L6QA 3L4IA 3D2EB 3SMSA 3FZKA 1ZBSA 1RDWX 2PBDA 3VERA 2QWNA 4NO7A 5AQJA 5EXWA 2V52B 1GLAG 1ZXOA 3U9ZA 4CBWA 4CZJA 4H0PA 2Q2RA 3KHYA 4K42A 2Q0RA 5KPTA 5E26A 5AZIA 1E4FT 5AQIA 4FPBA 2I7PA 4MLHA 4CD3A 3LM9A 4JN4A 3IFRA 4XEIA 2AP1A 2P9PA 4B1VA 1Y64A 3A0IX 4LC9B 3O5BA 5AZJB 4M63C 4PKHA 1KAZA 5JLHA 4CD1A 2BTFA 1K8KB 2FF3B 2IVOA 4FO0A 2W40A 2W41A 2D0PA 3QFUA 4CZMA 1U2VB 4H5WA 4PL8A 2VCPA 3KZBA 3BUZB 1C0GA 4HWIA 1ESVA 4O5FA 3VOVA 5AFUA 2ASMA 1U6ZA 4CBXA 3DXKA 4I6MA 1BWFO 1MWMA 3FZLA 3LDNA 3QBWA 3MN5A 2PAVA 3VEWA 5AQHA 5AQPA 4H0TB 3FR0A 4JD2B 2NRHA 4BC3A 3VGKA 3BP8A 1RFQA 3CI5A 4H0XB 4CZEA 5ADXH 1X3NA 3CIPA 2FSKA 5AQSA 3I33A 3HBTA 3HSCA 3WXIA 4Y0WA 1Z6RA 2ZGZA 3BF3A 4CZFA 3LDOA 3UE5A 2E88A 1CZAN 4FWSA 1S22A 2QXLA 3S41A 1R59O 5AR0A 3CJCA 3O80A 4CZLA 4PL7A 3ZX2A 4WYBA 5EOYA 3CQXA 3VEOA 4IJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IJJA 1VSDA 2ITMA 4BWMA 3M3ZA 5HLFA 2E6LA 1YJWN 4CF2A 3EEQA 2NRWA 4CJRA 3FGUA 4GNIA 3MK6A 1RDUA 1QQMA 2GV9A 1WSFA 4CVNE 2P9SB 3AO5A 5C0YA 2GWJA 3RSEA 3KD1E 3MN9A 3VQ6A 3ATVA 4KPYA 1YVUA 1S9GA 3D2FA 4FW2A 4EHTA 5CR4A 2PZSA 1NGHA 4FJHA 3AGKA 3LAKA 4DV3K 4CF1A 1RBVA 1GOCA 3LDPA 2E5LK 4HVJA 3NE6A 4KRFA 1TKTA 1X1PA 1QZ5A 2O8FA 3K59A 4ELVA 4RW9A 4B1YB 4FJJA 2RPIA 1N34K 1HNIA 1RDDA 4DR4K 1Q8IA 4I2PA 4FZXC 4CJTA 3RMCA 4XH4A 2EHGA 3UB5A 3AY9A 2QWLA 3VGLA 1G99A 3HYFA 3QDKA 3SK3A 3NH1A 3CYMA 4BVPA 2J4RA 4EZ9A 3OYKA 2WUSA 4CHZA 2HW3A 3Q7BA 4H0YB 5AQYA 2PFUA 3VF4A 4CFAA 2IVNA 1QS4A 3OYGA 4E7JA 4K43A 3I8DA 1NGJA 2X74A 4C8NA 1XI1A 1VQLN 2HHHK 3OBWA 3ULEA 4YDUC 1T3VA 3LANA 1Z25A 4KHNA 3ZSWA 4CJWA 3O3GA 4CFBA 1YAGA 4H0VB 1NKCA 3BEXA 2QWOA 1JLCA 3TARA 1HQEA 1D4XA 4JS5A 2O8CA 4B3RK 3QEVA 4CZGA 4FVUA 5HP1A 1LWFA 5DM6L 1Q7YO 1BISA 3ZX0A 5LY3A 3MXMA 2C1IA 3ENOA 4WQ4C 3H3OB 3HPOA 4DF4A 4F3OA 1VQ8N 5GIOA 3WT0A 5BPMA 4HUFA 1TK8A 4O8KA 3ZCMA 1CZ9A 3E9PA 4MDAA 2IAJA 4AHCA 4JKHA 4DQRA 3ZX3A 5TKYA 3MX2A 4CK1A 3OYMA 3TSPA 3M5RA 5C15A 3AGRA 3TSQA 2QK9A 3PO5A 4JS4A 2W00A 3SAHA 3VGMA 2O8BB 3WQTA 2P9UA 2I7NA 2Q0UA 2A42A 4DF8A 3WEEB 4JKFA 3P31A 1LCUA 1QHTA 1N6QA 5JVHL 3OYNA 2P9LA 1LW0A 2VG5A 4FWOA 3FZHA 3TTFA 1NJZA 1DLOA 4H5NA 4N56A 4DTXA 3LPTA 4ILHA 3AAQA 3MWTA 1JXEA 4CEAA 3PY8A 1XUPO 3S3NA 4CJVA 4W5TA 3KLFA 2EWSA 2D5RA 2PYLA 5CE3A 3MXJA 3CFRA 1T6CA 3RMBA 1WBDA 4BC2A 4BC5A 2BH1A 4CJUA 4FZYA 1BA0A 1LOTB 4FL9A 3IUCA 2JWKA 2VWKA 3K2PA 3ALYA 4AQYK 3IDHA 4EP4A 5LMUK 4ILJA 3O6WA 4M42A 2HHQA 3CG7A 3QFPA 3OYHA 1SKRA 5I42A 2V7ZA 3FZMA 1GLCG 1CXQA 4ID5A 3R3LA 1WSEA 4BACA 2ZWHA 4DHYA 3UKUB 4R79A 4FLYA 1SUQA 3NBPA 4DR2K 1YTAA 2CGKA 1HUXA 1BIUA 3WXKA 1XHXA 3QO9A 2ZJPL 5AQQA 4B3SK 3VQBA 3KVGA 1KCFA 3KKRA 2HBKA 1R0AA 1KLMA 3C7NA 3AVHA 4LSNA 3L2QA 1C0FA 3ID8A 2RHKA 4CJ3A 5F1XA 1QHAA 1WN7A 4M3RA 4FSVA 4YOTA 2P9KB 4DTRA 4DSLA 1KVAA 4GV6A 1XNQK 2E1ZA 4AH9A 3THXA 3C6AA 3IRXA 4KFBA 2GWKA 1OH8A 3D2EA 4OKEA 4CE9A 4JHDB 2O8DB 4ICLA 4CBUA 1A5WA 4M41A 4JK8A 1TYQA 1NGAA 3DJCA 4KHPK 2OANA 1KRPA 3CM5A 3ZT4A 3H6EA 4JRQA 3LL3A 4IZ9A 4F9OA 3OS2A 1RBTA 2NUBA 3V1RA 2I5JA 5AQTA 4IOCL 3TAGA 4FK0A 1IKVA 1CLQA 1QSLA 3MAQA 4NLBA 3R9PA 1KAXA 2JWLA 1JXBA 4OGEA 4HTLA 1BCOA 1X9WA 4CGIA 4KKOA 3VF2A 1Q18A 2NRXA 3QNOA 2BE2A 3O3FA 1SL1A 2A1RA 4DR6K 4H5VA 3MEEA 5KGXA 1XMOK 5AQXA 2C1GA 1J54A 3DMJA 4DU3A 1U2VA 1Z26A 1FKPA 3ZEUA 4DLEA 4FVMA 3A2FA 1S1WA 3H1VX 1VQMN 3RR7A 2YCHA 4E7LA 4UQGA 1W7AA 4CCHA 3LM2A 4F4KA 4JD2A 1NMNA 1BO5O 5ELZA 3IKMA 4J2AA 4BG8A 3U3YA 2VWJA 3U4LA 3SYZA 3E9OA 3W3DA 3QB0A 4LD0A 4O8UA 1V4TA 4FM1A 4GW6A 2D0BA 3M8RA 3MMVA 3MEGA 2QWPA 2UYTA 4DQSA 4EIAA 1WUAA 2G8UA 2F7TA 4DR5K 1BIZA 3C6HA 4PHTX 3THWB 5EX5A 2HSTA 1NJXA 3EYZA 4BRIA 1K73O 1P8ZA 1MDUB 3BZKA 3R8EA 1C1AA 3LAMA 3KK1A 3AO4A 3DWLA 1WAFA 1OH7A 3QIOA 3HP6A 4MLEA 2P9NB 4H5TA 1XC3A 4CJFA 2P51A 3DXMB 5AQLA 1NK9A 4NB4A 1VQON 4YDUA 1EX4A 3L4IA 4FJ7A 3J7YP 4LF9K 1VQ5N 1RDWX 2PBDA 4JKGA 2VGMA 3NGYA 2V52B 3BZCA 4JV5K 3U9ZA 4Z4CA 1HYVA 4CBWA 4JI6K 3THYB 2Q0RA 5KPTA 4Z4GA 3SBTA 2ZD1A 1E4FT 1XNRK 3T7ZA 4FPBA 2I7PA 3G71N 4GMJB 4JN4A 3TAMA 3IFRA 4CERA 4AHUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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