2P9PB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
190
structure length
184
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEVGVAELLFNTIQADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 50
structure length 184
sequence length 190
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9pB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9pB02
1ATNA 4BR0A 4BR7A 1LOTB 1XUPO 1SZ2A 2BTFA 2P9LA 3C7NA 2P9UA 5BPLA 1NGJA 4EAHD 3VGKA 4PKGA 3LDPA 5AQJA 1BWFO 3W3DA 3VEYA 1GLDG 1ATRA 4FOIA 3L4IA 1NGBA 1KAXA 2Q2RA 4BGAA 1U6ZA 3H46O 1YAGA 4MO4A 3KVGA 3ZETB 1YXQA 2HF3A 5B8HA 3H45C 4BC4A 1NGGA 4B1ZA 2GWJA 3IFRA 3SLCA 1Z05A 4WQ4C 5BRFA 3R8EA 4H5TA 5AZJB 4B1WB 4BR5A 2YHXA 3H3NO 4WQ4A 3VGLA 3HM8A 4CZGA 1HUXA 4IO8A 5AQPA 4J8FA 3VPZA 1OKJA 3HTVA 2A3ZA 2CH5A 4FPAA 4B1XB 2EWSA 2FSJA 2E2OA 3GL1A 3WXKA 3ZEUA 1HX1A 4JNEA 1MA9B 3CETA 4FOEA 4ISEA 3ZX2A 4IJAA 5JLFA 3IUCA 2Q0RA 3U4LA 2YI1A 3UKRB 2CGLA 4Y0WA 3LDLA 4BROA 2QXLA 4BC2A 3DXMA 4KBOA 4H5VA 2P9SA 2P9NA 3CQYA 4GY2B 5BPNA 3O08A 2IVNA 2GTDA 3A5MC 2FXUA 3GG4A 4JD2B 1ATSA 5JICA 2QWOA 4A61A 2VWBA 4CBWA 5KPTA 1BA1A 1EQYA 3WEEA 1ZXOA 1XQSC 1Y64A 4RWTA 4FWOA 2IIRA 4PKHA 2AA4A 2V7ZA 3BUZB 4M7YA 3A5NC 4AM7A 1TUUA 1NGDA 1MWMA 5BN9A 3I8BA 2HOEA 1BDGA 3A5OC 1KAYA 3WXIA 1G99A 4FWLA 3A0IX 1NMDA 2QWLA 4I6MA 4CZJA 4EIAA 3FGUA 3FZHA 1GLJO 4CZEA 5AQGA 5FPMA 2Q36A 4H0YB 3MMVA 1NGHA 3F9MA 1DKGD 3VOVA 4DQ8A 4JHDA 3H1QA 5AZIA 3IDHA 4EHUA 1KXPA 2Q31A 3O1WA 4IZ9A 3M6GA 3DXKA 1J6ZA 3D2FB 1NWKA 3VETA 5AFUA 5BREA 3KHYA 2P9PB 1C0GA 1MDUB 1GLAG 2ZWHA 3W0LA 2NRHA 4FWMA 2YHWA 2ASOA 2IVOA 4BRPA 3BF3A 3O80A 3FR0A 3G25A 3UE5A 5AQFA 3CERA 3VF4A 2V51B 4M63C 4CBUA 3DAWA 3O6WA 4BRKA 1HKGA 4RTFD 4XH4A 2A5XA 2P9PA 3QFPA 2W40A 4CI6A 3LDOA 3ULEA 3H6EA 4DCHA 2ASMA 3CJ7A 2H3GX 4EHTA 2QWMA 4MLEA 1HJOA 4IJNA 1ESVA 3O4WA 3A8YA 3RSEA 3FZFA 3CJAA 5LJVA 3S41A 2D0PA 1BG3A 4BRDA 3VENA 1X3MA 3DWLA 2E88A 5AQWA 4H03B 1NM1A 4H0TB 3FZKA 4XH5A 1BA0A 3BEXA 1H1VA 4F9OA 2F9TA 2PAVA 1X3NA 2HF4A 3CQXA 5I9EB 4H5RA 4K43A 5AQZA 4BRHA 2E2QA 1IJJA 5AQXA 3EL2A 4FWNA 1P8ZA 4EFHA 3AAPA 3BF1A 3LDNA 4BG8A 4GNIA 4O8KA 3ZX3A 4BC5A 1QQMA 3ZETA 1HKBA 2QWQA 3UKUB 5EY4A 2YJFA 1E4FT 4FL9A 4YDUC 4CZIA 1CZAN 3HBTA 1NGIA 3QBXA 3U9ZA 3QMLA 1D4XA 1JCEA 3P4IA 3VEVA 4Z94A 5ADXA 5F0XA 2F9WA 4YDUA 1T6DA 4ISGA 5AZJA 4ISFA 4LC9B 1TYQB 1NGEA 1QHAA 2P9KB 2I7NA 2P9IB 5ELZA 3R9PA 4BR9A 4MLHA 2V52B 2FLOA 2GWKA 4B9QA 2CGJA 5E26A 3CHWA 2A40A 2CGKA 2P9KA 2YHYA 3O1BA 2A42A 2D4WA 2NLXA 1DEJA 1BU6O 3D2EB 5EX5A 3UKRA 4CZHA 4BRIA 4BG9A 5EVZA 3AARA 4FWRA 1X9JA 1K8KB 3MK6A 3M1FA 2A6AA 3WUHA 2WUSA 4MO5A 3R6MA 2FF6A 4JD2A 3GDQA 3KZBA 4BQZA 2QWRA 4H5NA 4B1VA 3MDQA 5AR0A 4BR4A 3CJBA 4IWVA 2ITMA 4BRAA 3ID8A 3VF6A 1WUAA 3GE1A 5AQLA 4HWIA 3FLCO 1RDWX 3LL3A 4FWPA 4CZLA 3VEZA 3AY9A 1V4TA 3VEXA 3FFKB 4FWSA 1BOTO 4B1UB 5EXWA 4IXCA 4FO0A 3J8AA 4BR2A 1RGIA 4CD3A 4XH1A 4BC3A 2ASPA 1GLLO 2IVPA 2YCHA 3L0QA 2GEMA 1JCFA 2UYTA 1GLFO 1SAZA 2ZGYA 4HTLA 3EO3A 4FPBA 3MCPA 4QS8A 4FWQA 5KPZA 5F1XA 4H5WA 3QBWA 3WQUA 3H3OB 3JS6A 1HPMA 4E1JA 1U2VB 3FE1A 2V7YA 3LM9A 2QW9A 3QFUA 3QB0A 3AAQA 4NO7A 3D2FA 4C23A 1S3XA 4A62A 3GBTA 4CD1A 5FPEA 3MN9A 5FPNA 5FPDA 3OHRA 1IG8A 2QWPA 1NGAA 3O5BA 5AQHA 4CZFA 1Z6RA 4BRLA 2BUPA 2D0OA 3LDQA 4BVOA 5TKYA 5LY3A 3UB5A 3EZWA 3CJ9A 3MN5A 3CIPA 4XEIA 3A5LC 4WQ5C 2AP1A 3ZX0A 1NLVA 2NZTA 3QICA 5KQDA 2P9LB 2Q97A 2P9UB 3C7NB 3C0BA 3WXLA 4K41A 4WQ5A 4RCHA 5AQMA 1DGKN 1ZBSA 3EN9A 1BO5O 5JMVA 3HI0A 3SK3A 4M7XA 3VESA 4CBXA 4L3QA 1RFQA 1T6CA 3VGMA 3I33A 4A2BA 1BUPA 1NGCA 3B8AX 3SJHA 3ENHA 1JCGA 3WQTA 2VCPA 5AQTA 4FWKA 5LJWA 5AQUA 5KPRA 5BR9A 5JLHA 4CZKA 4AM6A 3LM2A 2OANA 2E8AA 1S22A 1QQOA 1MWKA 5BPMA 2QWNA 4BVPA 3ENOA 3IMXA 4PL8A 3UKUA 4CZMA 4BRMA 2FF3B 4FSVA 4BRQA 3JXUA 3TPQA 2W41A 3MN7A 4DB3A 5BN8A 3ZEUB 2Q0UA 4CJ7A 1TYQA 4WYBA 4BQLA 5AQOA 2E2NA 3FZMA 1TUYA 2P9IA 3GOIA 3VERA 2HMPA 1GLCG 3VF2A 4BRNA 4NB4A 3DXMB 5AQQA 2P9SB 2P9NB 3U8XA 5AQSA 1QZ5A 3MN6A 3WXJA 2Q1NA 1WOQA 1QZ6A 2FSNA 5BRHA 3SMPA 5E84A 3D2EA 1V4SA 2E2PA 4BREA 4H0PA 1YUWA 2A41A 4H0OA 3WT0A 3CJ1A 5CE3A 4PKIA 5AFUH 3WEEB 3FZLA 1K8KA 3O8MA 3ATUA 3QDKA 2CH6A 2QM1A 3VEWA 4H0VB 2E1ZA 4QS7A 1QQNA 3D7EO 1T44A 3M3ZA 3ATVA 4O5FA 5AQNA 4BGBA 4B1YB 2I7PA 3EKUA 5AQRA 4BRCA 5AQVA 1HLUA 4I6MB 2D1KA 2ZF5O 2E20A 3DJCA 1XC3A 2FSKA 5AQKA 3TU5A 1C0FA 3HZ6A 2YJEA 4H0XB 4JHDB 5AZIB 4JN4A 3VEOA 3H1VX 5BRDA 2DPNA 3DXKB 2KHOA 4A2AA 1HKCA 5EOYA 1SQKA 4BRGA 3BP8A 5F2RA 2ZGZA 3CI5A 4PL7A 1GLBG 4QS9A 4JAXA 2GELA 5AQIA 4DHYA 2E1YA 2J4RA 1NGFA 1U2VA 5KQ8A 1ZC6A 1Q18A 3HSCA 4K25A 3U9DA 3EKSA 1LCUA 3ULEB 1YVNA 3CJCA 1E4GT 3L6QA 1R59O 3SMSA 5AQYA 2PBDA 4K42A 2VYPA 5ADXH 3RSEB 2GUPA 1NBWA 1GLEG 1KAZA 4BRFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DR5K 4BR0A 4KTZA 1TK5A 1XUPO 1VQ4N 3TAEA 2GX9A 2AJQA 3LAKA 3CCVN 3AGKA 2OTLN 4CF0A 4QOZB 3VEYA 1D9DA 1N8RO 2O8BB 3RWUA 4FOIA 3L4IA 1NGBA 1JKHA 4BGAA 3SQ4A 1NJXA 2QA4N 4ILHA 1YXQA 4DTRA 4DV0K 5B8HA 3H45C 4H4MA 3IFRA 3SLCA 1HNVA 3CCEN 3PSIA 4I2PA 4DFJA 3OVNA 2OTJN 3H3NO 1NMNA 4GV9A 4CZGA 1HUXA 4IO8A 4KAZA 3V9SA 3KKRA 1B92A 1OKJA 1RTJA 2A3ZA 4FPAA 3VQ7A 3SCXA 4FJKA 3K9JA 5HBMA 3OYCA 4CCHA 4DFPA 2UXCK 3ZEUA 2E4LA 1HX1A 4JNEA 1MA9B 4FOEA 4ISEA 2ITGA 3UKRB 4BROA 3JAMO 3LP2A 1Z26A 2KLAA 2B6AA 1RT6A 2XRIA 4IDKA 2P9NA 3OYDA 3ENBA 2HMIA 4K8ZA 2KQ2A 5M1OA 1TGOA 2GUIA 4CBWA 1E3MA 5HP1A 2DFFA 1WSJA 4IFVA 3QEVA 1ZXOA 3B6PA 1UWBA 2IIRA 4M7YA 4AM7A 2IAJA 3T7ZA 3HPOA 3I8BA 4KPYA 1VQMN 3K5MA 1VRTA 1D5AA 3AA3A 1WBDA 2O8FB 1BQMA 1VSIA 3A0IX 4DR4K 1K73O 3NHGA 4JKCA 1VSDA 4IG0A 4GKJK 4CZEA 1WLJA 4YORA 3NDKA 3BZKA 1NGHA 1DKGD 3V9UA 4DQ8A 1XHXA 4NLBA 1Q9YA 3IDHA 4EHUA 1KXPA 2Q31A 3O1WA 3M6GA 1J6ZA 1U47A 4HVJA 4KHQA 1FJGK 1MDUB 1HQEA 3VQDA 3AVGA 1EKEA 1BIZA 3LZJA 2ASOA 2IVOA 4BRPA 3K0SA 2A1RA 3G25A 1KVBA 5AQFA 4LY7A 3DAWA 4FLWA 4BRKA 5GINA 2E6LA 2HHXA 3QFPA 1HQUA 2W40A 2HBJA 1KVAA 3ULEA 2VWJA 2HHTA 1NJZA 2F7TA 2YX6A 3KWIA 3O4WA 1IBKK 3ZT4A 1X9MA 3NH0A 1J5EK 2O4IA 4IFYA 3LP0A 2D0PA 2QI2A 3K5NA 1VSFA 3DRRA 1NM1A 3FZKA 4JV5K 2HW3A 1H1VA 4FJ9A 2JGUA 2F9TA 2PAVA 2HF4A 2HNYA 4K43A 2E2QA 3EL2A 1KSPA 1KFDA 4FWNA 2O8BA 4W5NA 1T05A 4BG8A 3AO5A 3CYMA 1QQMA 4OKJA 4DTUA 3SZ2A 4DR3K 3PSFA 5M1FA 3PO5A 4IOAL 2YJFA 3U9ZA 3P83D 1D4XA 1JCEA 1IBLK 1XMOK 4E3SA 4J2DA 4YDUA 4ISFA 1GOAA 3QEIA 3DI6A 2I7NA 3O3GA 3VQCA 4FK2A 4FK0A 3ISNC 4FZZA 1ASUA 3KLIA 2Z1JA 2CGJA 4BE1A 1NK8A 3CHWA 4LF4K 3ZYYX 4U7BA 4EZ6A 1IO2A 3O1BA 4DSIA 2D4WA 3K9KA 3BY5A 1L3TA 3TTCA 1BU6O 1EP4A 1C1BA 2LSNA 3D2EB 5EX5A 4C8OA 3UKRA 4CZHA 4BG9A 3K2PA 1C0TA 4XJXA 3K5OA 3MK6A 5KGXA 4ZTJA 3CCJN 2W00A 3R6MA 4BQZA 2OPPA 3TAMA 3VTHA 4FM1A 3KK3A 4BR4A 2XY8A 4IWVA 2ITMA 5KTQA 3MX2A 4B9VA 3VF6A 4KHUA 3GE1A 5AQLA 1VSHA 4FWPA 5T7BA 4B1UB 1REVA 5CHIA 5JVHL 3DOLA 3P31A 1FK9A 4FJJA 1U49A 4XH1A 4FW2A 1N36K 2O8FA 3VQBA 4DKWA 2IVPA 5J2MA 3AVNA 3MXJA 3VQ9A 3M8SA 4H4OA 2ZE2A 1QQCA 5HOOA 4N5SA 1VQLN 4W5OA 2RE2A 5LMUK 3OYBA 3CMEN 4E1MA 4X62K 5KPZA 5F1XA 4H5WA 2C1GA 3JS6A 2V7YA 4K8XA 3QFUA 3CCLN 3NF6A 3DLBA 5HLFA 4Q5VA 4CK2A 1IG8A 5AQHA 5J2QA 3KKSA 4BVOA 5TKYA 4YOTA 4JI0K 5JS1A 5LY3A 3UB5A 3VQ6A 3EZWA 3ZT0A 3A5LC 2VQEK 4LFBK 3SNNA 3C7NB 1NJYA 1SL1A 1L3SA 4F2SA 5AQMA 2C1IA 1DGKN 4PHTX 3EN9A 5JMVA 1NJWA 3AVHA 3SK3A 4M7XA 4JI5K 4JI8K 3I33A 4CEEA 1NGCA 4QAGA 3T19A 3QO9A 1JCGA 3E66A 1EO1A 1RBSA 4CEOA 4LD0A 3N4QA 4F8RA 3PX6A 5JLHA 3LM2A 2O8EB 1VQ9N 4R79A 1S22A 3I0SA 1QQOA 3L3VA 3PV8A 3C6TA 2FF3B 4BRQA 4DQQA 1VQON 3NGZA 3FFIA 4AHSA 2HNDA 3P39A 4CJKA 1YHQN 2Y1IA 4IO9L 3FZMA 3CQ8A 4B08A 3C6UA 1BGXT 1QVGM 4NB4A 5AQQA 4FZYA 3S3OA 4KREA 3SQ0A 1N6QA 2E5LK 5AQSA 1QZ5A 3MN6A 1R0AA 1RT3A 4C1NK 3VA0A 1WOQA 4IOCL 5BR8K 5BRHA 4K0KK 4CGJA 4JKEA 2YKNA 1RT5A 3D2EA 1YUWA 4LFCK 2KKZA 1S1VA 1DLOA 5FLXO 5CZ1A 3BGRA 3O8MA 4GKKK 2CH6A 2QM1A 3K59A 4H0VB 3O3HA 3L2VA 4EZ9A 1QQNA 4DSFA 5DM6L 3KK2A 4NCGA 1NG9A 3M3ZA 3ATVA 1NKEA 3EKUA 5AQRA 4DSEA 1HLUA 3PO4A 4B9SA 1O1WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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