2P9UB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with amp-pnp and calcium
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
248
structure length
222
Chain Sequence
TEPPMIQAVLTLYQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 59
structure length 222
sequence length 248
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9uB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9uB02
3WQTA 1TYQB 3A5MC 5ELZA 3VF6A 4DQ8A 3C7NB 4K25A 5AFUH 1U2VB 5AQLA 4BR4A 4XH4A 5E26A 5AQUA 2YJEA 3S41A 5BREA 4IWVA 3H46O 3O80A 2IVOA 1RDWX 1Y64A 3GBTA 2P9LB 2P9NA 3QBXA 3O1BA 5LY3A 5KPZA 3FLCO 3CERA 1YVNA 4HWIA 4BRDA 3LM9A 1EQYA 1SQKA 2QWRA 2E8AA 4FWLA 3A0IX 5AQYA 1GLAG 3FGUA 3R8EA 3R6MA 1NMDA 4CBUA 2BUPA 2QM1A 4BR2A 4B1UB 2Q97A 3CJ9A 5F1XA 1MDUB 2BTFA 1HPMA 3ATUA 3D2EA 4FWRA 3L6QA 5AQGA 5JLHA 4BRLA 2QWPA 5BN9A 1QQNA 3EKSA 4A61A 3CJCA 4CBWA 3VGKA 3VF2A 1BOTO 3VEOA 1NBWA 1RGIA 2Q0UA 4BRGA 1JCEA 2A42A 3I8BA 4JN4A 1NGHA 2ZGYA 2UYTA 5AZJA 1KAXA 5BN8A 3UKUA 3UKRA 3A8YA 4CZKA 2A40A 4FSVA 1GLCG 1Q18A 4CZIA 4B1XB 1E4FT 1TUUA 4ISGA 3AARA 4WQ4C 2FLOA 4CI6A 3HM8A 4H0YB 5CE3A 5AQVA 2ASPA 3D7EO 2QWLA 4RTFD 2E88A 4BRAA 4BVOA 2A41A 1TYQA 2HMPA 2ASMA 3GOIA 3C7NA 5AZIA 2E1ZA 1R59O 3IMXA 4PL8A 1MWMA 1NGAA 2Q31A 2P9LA 3A5LC 1IG8A 5EOYA 2P9IB 3WEEB 4EFHA 3MMVA 4XH1A 1HJOA 3ENHA 2E1YA 3QICA 5EX5A 3OHRA 3TU5A 3L0QA 3VERA 1SAZA 5AQOA 4H5NA 5BPNA 1NM1A 1HKCA 2HOEA 3VENA 3EZWA 1P8ZA 3HI0A 1QHAA 5AZJB 1IJJA 3UB5A 2EWSA 3BF3A 3VGLA 2YCHA 4QS9A 1MWKA 4DCHA 3H1VX 4M7YA 4PKGA 4XEIA 3UE5A 3DXKB 4GNIA 2FSKA 5EY4A 5AQZA 4A62A 1GLDG 4IXCA 3QFPA 4MLHA 5E84A 4CD3A 2E2NA 4NO7A 5JICA 2ZGZA 5BRFA 5JMVA 4CZMA 4B1WB 1QQOA 4C23A 1Z05A 3VETA 3BP8A 1GLFO 3ZEUB 4FOEA 1NGIA 3CHWA 4L3QA 2D0OA 5AQFA 4ISEA 3LL3A 1GLBG 4NB4A 4QS8A 2Q36A 4Z94A 4A2AA 3R9PA 2QWNA 5AQKA 1QZ6A 3FZHA 3SMSA 2A3ZA 5AQIA 5AZIB 1GLEG 4EIAA 4JD2B 4RWTA 3ZETB 4A2BA 4Y0WA 4EHUA 3LDLA 4BRHA 4BRNA 2P9KB 1JCGA 4H0PA 3VEYA 2W41A 2WUSA 2GUPA 3BF1A 3LDNA 4CZJA 3FZLA 4FWPA 1ATNA 2V52B 3G25A 3RSEB 3ZX3A 1H1VA 3ULEA 1XUPO 2D1KA 3CJ1A 3VGMA 1K8KB 4FPAA 4BC5A 2YHWA 4FOIA 3CI5A 3U8XA 5AQWA 2CH6A 4IJNA 1HUXA 4WQ5A 4AM6A 4CZHA 2QWQA 4KBOA 4PKIA 4BRFA 1YXQA 4BGBA 3BUZB 4BROA 4DB3A 3F9MA 3O5BA 1ESVA 3C0BA 4H0VB 2NRHA 3WEEA 2P9IA 4FWKA 5BR9A 5BPLA 4WQ4A 4F9OA 3VPZA 3LDOA 3MN6A 5BPMA 1E4GT 3ID8A 3U4LA 1T44A 4FWNA 4CZEA 4MO5A 4FL9A 3DXMB 3MN5A 5LJVA 1J6ZA 2D0PA 4H03B 3AAQA 5AQPA 3DXKA 3CIPA 3MDQA 3W3DA 3O8MA 4MLEA 4EHTA 3AAPA 1WUAA 5F2RA 2I7PA 3GDQA 3FE1A 2HF4A 1QZ5A 1NGCA 3ZEUA 2E2PA 1YAGA 2F9TA 3ULEB 2P9UA 3LDQA 3O08A 1T6DA 3CJ7A 1D4XA 3VEXA 2P9SB 4B1ZA 1NGBA 4JD2A 5B8HA 2VYPA 3ZX2A 3M6GA 3ZETA 2QXLA 4LC9B 1S22A 1WOQA 2NZTA 4I6MB 3DAWA 2P9KA 2D4WA 3QB0A 3QFUA 4GY2B 4J8FA 4O5FA 5AQHA 2ASOA 1G99A 2E2QA 2PAVA 4EAHD 1ZBSA 4BR5A 4YDUC 3RSEA 4B1VA 3SLCA 3KZBA 2DPNA 4FWMA 4MO4A 1X9JA 3H3OB 5TKYA 3DJCA 3GL1A 1K8KA 1BUPA 1BG3A 1MA9B 1ZC6A 4PL7A 3H3NO 3EO3A 4JAXA 4K42A 3TPQA 3WXJA 2Q0RA 4CZLA 2QWMA 5AQXA 1HX1A 2V7YA 2GELA 5BRHA 3CJAA 2QWOA 4AM7A 3CETA 2FF3B 5EVZA 1ATRA 4BQLA 1C0GA 1ZXOA 5ADXA 1BU6O 4BRMA 3U9ZA 2V7ZA 3CQYA 5KQDA 1BO5O 4FO0A 4E1JA 3QDKA 4CZFA 2I7NA 1HKGA 3FZFA 4H5RA 4JHDA 4CZGA 5AFUA 1V4TA 2FF6A 2P9UB 3MK6A 4RCHA 5LJWA 4CD1A 2CGKA 3SK3A 1KAYA 3GE1A 1XQSC 3DXMA 3MCPA 3LM2A 3IUCA 2PBDA 3IFRA 1LCUA 2VWBA 2IVNA 3JS6A 4M63C 4BREA 2IVPA 3J8AA 2FSJA 3DWLA 4BR7A 3D2FB 4BG9A 2FSNA 3HBTA 3IDHA 2IIRA 1NWKA 1LOTB 2AA4A 3WQUA 2ZF5O 2A5XA 3O4WA 1RFQA 3A5OC 2P9SA 2YHYA 1Z6RA 2P9PB 3H45C 4JNEA 1DEJA 3ENOA 3FFKB 5EXWA 4BRKA 2NLXA 5AQRA 1KXPA 4I6MA 2VCPA 3SMPA 5FPDA 2J4RA 3FZKA 4B9QA 3M3ZA 1NGDA 1NGJA 4BC2A 3QMLA 5AQJA 4ISFA 4BR9A 1T6CA 4DHYA 3O1WA 3VESA 3LDPA 4JHDB 2ZWHA 1S3XA 3MN9A 3H1QA 2FXUA 2W40A 3L4IA 3O6WA 4BR0A 1BDGA 3WXKA 2KHOA 3QBWA 4IO8A 4QS7A 5AQQA 3WUHA 5KQ8A 4XH5A 4B1YB 2V51B 4K41A 3VEZA 4HTLA 3P4IA 5AQMA 4BQZA 3VOVA 4WQ5C 1NLVA 2ITMA 1XC3A 1ATSA 4CBXA 4FWSA 4H0XB 3EL2A 1HKBA 1SZ2A 2A6AA 4PKHA 5KPRA 4YDUA 2E20A 3VF4A 1CZAN 2H3GX 4FWOA 3WT0A 4BC4A 4BC3A 1KAZA 1HLUA 3VEVA 2CH5A 4CJ7A 1V4SA 2P9NB 4K43A 1NGGA 5F0XA 3D2FA 4H5TA 3SJHA 2GWKA 3W0LA 3KHYA 4BVPA 3I33A 4FPBA 5AQSA 4BRQA 1BA1A 3BEXA 1C0FA 3M1FA 3EN9A 3JXUA 4O8KA 3A5NC 1U2VA 2CGLA 2OANA 1NGFA 2Q2RA 2P9PA 3AY9A 2GEMA 2HF3A 3D2EB 4IZ9A 5KPTA 3H6EA 5AQTA 3WXLA 4BG8A 5FPEA 4M7XA 2QW9A 3WXIA 1GLLO 1BWFO 5FPNA 3EKUA 1X3MA 3VEWA 5JLFA 1DGKN 5AR0A 5I9EB 3ATVA 4IJAA 3HSCA 4FWQA 2Q1NA 2YHXA 4BRCA 1X3NA 2YJFA 4H0TB 4BGAA 2YI1A 3U9DA 2CGJA 1YUWA 3CJBA 4BRIA 3UKUB 3UKRB 5FPMA 3MN7A 4H5WA 1U6ZA 1GLJO 2F9WA 2GWJA 4WYBA 3FR0A 3FZMA 5AQNA 1QQMA 1DKGD 4BRPA 3HTVA 3B8AX 1BA0A 5ADXH 4H5VA 1JCFA 3ZX0A 1OKJA 3KVGA 1TUYA 1NGEA 5BRDA 2E2OA 2GTDA 3HZ6A 2AP1A 3GG4A 4H0OA 3CQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LW2A 3WQTA 1TYQB 1ZBUA 1C1CA 1QVGM 3AO3A 4E7LA 4H4OA 1JLFA 4XH4A 5E26A 3ZT0A 3S41A 4HUEA 4BE2A 1Y97A 3O80A 3GBTA 1ASWA 2P9NA 3QO9A 1JL2A 3N4QA 4E7JA 1HYZA 4HWIA 4BRDA 1EQYA 1SQKA 4YHHK 2BANA 4JI0K 1JLQA 4ELUA 1SS6A 1FKPA 1NK9A 3HT3A 3MXIA 4B1UB 1VRTA 2Q97A 1XHZA 4ELVA 1IKYA 1XWLA 5F1XA 4AHUA 3D45A 3D2EA 3WXMB 1QQNA 3EKSA 2F8TA 3CJCA 2UUCK 2HHUA 5CR4A 3K2PA 2JLEA 4PHTX 3LZJA 1BOTO 4DR1K 1WN7A 4XIUA 4FM2A 3VEOA 1RTHA 2UUAK 5GINA 5IWAK 1JCEA 3L3UA 1Q9XA 4IEIA 3ZCMA 2UYTA 3K5LA 3CXCM 1QSSA 1KAXA 3ZSZA 3UKUA 4J2BA 1YHQN 3EE8A 1QE1A 2HHVA 4CZIA 4B1XB 3KD1E 4LF7K 4KHWA 1TUUA 5IT9O 3L4QA 1LAVA 1YJWN 3HM8A 3HP9A 2XHBA 1M1KO 2HHWA 2Q3SA 2WC9A 5AQVA 1RBVA 3D7EO 3SAFA 2QWLA 4RTFD 3LAMA 1T05A 4CFCA 1IH7A 3N4PA 3NH0A 4BRAA 1I39A 3HXMA 5FROA 4Z4EA 2QA4N 1TYQA 4EP4A 3GOIA 2DY4A 2YHBA 2VWKA 2X6SA 1VQ5N 3OYGA 1TK0A 4KFBA 4ILGB 3HM9A 1MWMA 4C1NK 4IG3A 2Z1HA 1B9FA 3LWMA 3QEPA 5CYQA 3A5LC 3KWGA 1Q7YO 2PYLA 4E0DA 5EOYA 2P9IB 3WEEB 2OZSA 1HR0K 4IBNA 3K59A 3MEEA 2E1YA 2VGMA 3VERA 3L0QA 5D3GA 4LD0A 4Z4CA 2HOEA 3NVMA 4Z0UA 1P8ZA 3HI0A 4JKHA 4FJHA 3R3LA 2VGNA 2IAJA 3H1VX 4XEIA 3UE5A 4O0IA 4BWJA 3CCUN 1EO1A 3OYIA 2P51A 1RDAA 5BRFA 5JMVA 4JI7K 5J1EA 2KFNA 3BP8A 1GLFO 2W00A 1L3VA 1QVFM 4L3QA 1VQLN 4ISEA 4FXDA 3WNGA 3AVJA 3PUFA 4CEAA 4CIGA 3KTQA 2QWNA 5C15A 1QZ6A 1ITGA 1UA1A 4AF1A 4KI6A 1K6YA 4DTOA 4EIAA 3CCMN 3BZKA 4JI2K 4RWTA 4CIFA 3AVCA 2NRZA 3QINA 3NMUA 4DU3A 1KLNA 3V1RA 4CIEA 5A2QO 1A5WA 2GUPA 2WUSA 5C12A 3EY1A 4DWIA 4LH4A 1ATNA 3D6RA 2OPPA 1H1VA 3CM6A 4FJ5A 1XUPO 1QSLA 4CESA 4EZ6A 4FPAA 2YHWA 2XY6A 3Q7CA 4IJNA 4AM6A 4CZHA 1ZBIA 4PKIA 4Z4HA 4DR6K 1D9DA 3C6AA 4BROA 3U3YA 3O5BA 2NRHA 3WEEA 2P9IA 4FLWA 4FWKA 4HTUA 1HYVA 4WQ4A 4FW1A 2HHXA 4AH9A 2ZM6K 1U49A 3ZSVA 3OYFA 2XY5A 5KGWA 1BGXT 2O8FA 4DTXA 2E5LK 1LWFA 1KVBA 1ASVA 4FL9A 3AVNA 3KD5E 4H03B 3J7AP 2Z1JA 5AQPA 3F2KA 3THVA 3CIPA 3MDQA 3DOLA 1CLQA 3SYZA 3O8MA 3TTFA 4BE0A 2FBXA 4B3MK 1UWBA 1NKBA 3VQ6A 4ZTFA 5M1OA 1BCOA 4B3SK 2A1RA 5C0YA 3O4QA 3LDQA 3VTIA 4CJEA 3CJ7A 3PX6A 1UOCA 1D4XA 3CPWM 1HRHA 3KLHA 4DSJA 2KLAA 3ZX2A 4M3UA 5T7BA 3O4NA 2PZSA 3E9PA 4OKKA 3DAWA 3SBGA 5AQHA 4A5BA 2E2QA 3V6DA 4CK1A 1W97L 4FWMA 4YORA 1Q86O 3AA3A 2DFEA 1BG3A 2X78A 1ZC6A 1WNSA 3EO3A 4K42A 3WXJA 2Q0RA 4FLYA 5HOOA 3TR8A 3P31A 3M8SA 4CFBA 2GELA 4IOAL 3CJAA 3CETA 3O9SA 4BQLA 1C0GA 2F96A 4CK3A 1BU6O 4LH5A 3UIQA 5KI6A 3U9ZA 1VQ9N 3S3OA 2V7ZA 3CQYA 4FO0A 4E1JA 3K9JA 4MFBA 4Y1DA 2F7TA 4H5RA 1HKGA 5AFUA 4M3YA 1KLMA 5KTQA 4F2SA 2CGKA 1XQSC 5MLCQ 4KTZA 2P1JA 3LM2A 3CD6N 5J2QA 5DM6L 3IFRA 3MAQA 4WFBL 3KKRA 4N41A 4HVJA 4BREA 4KH4A 4QOZB 2IVPA 2FSJA 3DWLA 3HBTA 4F8RA 4CW7B 4JKAA 1T3VA 2HBKA 2NRTA 4UY8O 4BE7B 3JYTA 4E1MA 2NRWA 4B3OA 2D0AA 1RILA 5CZ1A 4IO9L 4EZ9A 1W2BM 3CCSN 4F3TA 1DEJA 5EXWA 1U47A 3TAMA 2NLXA 2HBLA 2VCPA 2Z1IA 5HL7L 2ZQBA 5FPDA 2J4RA 4DQRA 4KHSA 3AO4A 1NGDA 3ASMA 3QMLA 1T6CA 5AJ3K 1BQNA 3AVFA 4DHYA 2GBZA 2BE2A 3O1WA 4CJWA 3VQBA 3OYKA 1RT6A 5C2DA 1HQUA 3RRHA 2I5JA 1UAXA 5C25A 2KHOA 3QBWA 3WUHA 4OVLA 4QS7A 1RT7A 4B1YB 1RTIA 2QI2A 3QEWA 3I56N 2YNHA 4WQ5C 4DMNA 4FJ9A 2XY8A 1ATSA 1VSLA 4FWSA 4K0KK 4CJRA 1HKBA 1TKXA 3L2UA 3BY5A 3AO2A 4CJUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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