2PAVA

Ternary complex of profilin-actin with the last poly-pro of human vasp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 129
structure length 361
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pavA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pavA03
3KHYA 3DXMB 4GNIA 4CI6A 5AQGA 5ADXA 4WQ4A 2UYTA 2FSJA 3WXIA 4WQ5A 4PL7A 4FOIA 5BRFA 3O1WA 1OKJA 3DAWA 3ZEUB 3ID8A 3M1FA 3DXMA 5EY4A 3AAPA 4BQZA 4DHYA 1R59O 4RTFD 1LOTB 1QQNA 3ULEB 2P9PB 3QDKA 3A0IX 3ZEUA 2EWSA 3BUZB 1NLVA 2A3ZA 1T6CA 2ZF5O 1E4FT 1MA9B 4BC2A 2YI1A 2P9UB 5TKYA 3LM2A 3ULEA 3CQXA 4CZJA 5AQKA 2P9PA 4QS7A 3UKUB 4B9QA 4H03B 4HWIA 2F9TA 2I7PA 3UE5A 2DPNA 3O8MA 2P9UA 1JCFA 1S3XA 4M7XA 1XUPO 4H0XB 5KPRA 3LDLA 3UKUA 3GE1A 1EQYA 4MO4A 2NZTA 5EXWA 3EKUA 3HBTA 3R6MA 4MLEA 2VWBA 2A6AA 4Y0WA 3B8AX 3IFRA 2P9LB 3CIPA 3SLCA 1NGIA 4IJNA 3VERA 4BRFA 1ZC6A 4J8FA 3LDQA 1ATNA 3VEWA 1KXPA 3VESA 5FPMA 1JCEA 2P9IB 2P9LA 3IUCA 1TUUA 2GUPA 1Y64A 2QWMA 3EO3A 4BRKA 3HM8A 3CERA 2AA4A 1SAZA 4BROA 3I33A 4FWOA 2VYPA 4AM6A 4DQ8A 4FWNA 1SQKA 5F0XA 5AZIB 5KPZA 3CJ9A 3KZBA 2P9IA 4GY2B 4KBOA 4BC4A 5LJWA 1CZAN 3U4LA 4A2BA 1MDUB 4EAHD 5BRHA 3WEEA 3QFUA 4FWMA 3HZ6A 3MDQA 3FZHA 2QWPA 3FZLA 5AZIA 5KQDA 5KQ8A 1DGKN 5AQFA 5AQUA 2Q0UA 3VF6A 3J8AA 5B8HA 4IJAA 5AQQA 2V7ZA 2BTFA 4DB3A 2IIRA 5E84A 4JN4A 3ZX2A 4BC3A 3JS6A 3LM9A 5CE3A 3VF4A 4YDUA 1NGAA 3FGUA 4EHUA 3H6EA 1GLDG 4K43A 2Q36A 1ZXOA 3WXLA 2PAVA 4FWRA 1U6ZA 4PKIA 3MCPA 1GLJO 1GLLO 2FF6A 3H45C 4O8KA 3CJ7A 2IVPA 3D2EB 3QB0A 4FL9A 1K8KB 5AQHA 4BG9A 2Q31A 3ENHA 4F9OA 4RCHA 1YXQA 1NM1A 4H5NA 1XQSC 2F9WA 4BRMA 3HI0A 3BF1A 2YJFA 4FO0A 2V7YA 3ZETB 3D2FB 3WXJA 4H0YB 4IZ9A 5AQZA 2QWNA 3D2EA 4MLHA 5JMVA 5EOYA 1K8KA 1IJJA 3BEXA 4FPAA 1V4SA 3MN6A 5BR9A 3TU5A 5AQSA 4H0OA 2ASOA 4MO5A 3HSCA 3ZETA 1RFQA 3D2FA 4WQ5C 3CJBA 4CZKA 2QM1A 4WYBA 3QBXA 1GLEG 2IVOA 4FWPA 2QWRA 3C0BA 3CJAA 2YJEA 1ESVA 3UKRB 4BVOA 1HLUA 2ZGZA 3CHWA 2GWJA 1P8ZA 5AQWA 1ATRA 1KAZA 4O5FA 1DKGD 2GEMA 1IG8A 2P9KB 2CH6A 3D7EO 2NRHA 4CZLA 3UKRA 3GL1A 2VCPA 1KAXA 5AQPA 5EVZA 4B1WB 4EFHA 1YUWA 3AARA 4B1YB 2P9KA 4CBWA 4XH4A 4JNEA 1WUAA 4H5RA 3CJ1A 2OANA 5BN9A 2FF3B 1WOQA 4BR2A 2FLOA 1QQMA 3LDNA 5BRDA 1NGHA 4I6MB 3LL3A 2Q1NA 3O08A 3SJHA 3U9ZA 2D0PA 4B1XB 2YHXA 2CH5A 2ZWHA 4PL8A 3EKSA 1ZBSA 4PKHA 5AQTA 1HKCA 4I6MA 3BP8A 3MN9A 5AR0A 3HTVA 4XH1A 3VEXA 4IXCA 2E2OA 4BRHA 3DWLA 2AP1A 1T6DA 1D4XA 2NLXA 1JCGA 3O80A 3DXKB 1NGGA 2P9SB 5FPEA 4Z94A 4BGBA 1HPMA 4LC9B 3IDHA 2HF3A 4E1JA 3GOIA 5FPDA 4H5WA 5BPLA 3JXUA 3DXKA 2P9SA 5AQXA 4BRNA 5I9EB 2A41A 1J6ZA 2ASPA 3H3OB 2E2NA 5LY3A 3O5BA 3VGKA 2E8AA 3H1QA 2QWQA 4K41A 4CZHA 2P9NB 4C23A 2IVNA 2D4WA 5FPNA 4BRCA 4BR0A 4BR4A 4H0PA 3QBWA 2QWOA 2E88A 2Q97A 3VEYA 3O1BA 1HKGA 3U8XA 2P9NA 3FZFA 4H5TA 4YDUC 2Q2RA 5BN8A 5AQIA 5AQRA 5E26A 3MMVA 5AQOA 4ISEA 3VEOA 1NGFA 1H1VA 2A40A 2QW9A 3O6WA 4H0TB 1BA1A 3O4WA 5JICA 5AQYA 5ELZA 1QZ6A 4L3QA 5KPTA 5BPMA 2KHOA 4QS9A 1TUYA 4JD2B 1Z05A 3UB5A 3ATVA 2I7NA 4CZMA 2YHWA 2GELA 3L6QA 4BRLA 1NMDA 3LDPA 5AQJA 3A5MC 3GG4A 2WUSA 4JD2A 3KVGA 4RWTA 3FZKA 4BVPA 3SMSA 4WQ4C 5AFUH 4CJ7A 2V51B 2CGKA 1BOTO 1QHAA 4BQLA 5F1XA 3H3NO 3C7NB 5AQNA 1GLFO 2QWLA 2YCHA 2GTDA 1Z6RA 3CETA 3VOVA 3WXKA 3TPQA 1ATSA 3L4IA 3AY9A 3H46O 3C7NA 3MK6A 4XEIA 4JAXA 1V4TA 4FWQA 4CBUA 4CD1A 3LDOA 3GBTA 1Q18A 1BUPA 1NGDA 1NGEA 4A62A 4BR7A 5ADXH 4PKGA 3SMPA 4DCHA 1BG3A 1E4GT 1QZ5A 3G25A 1HJOA 4M7YA 1MWKA 2CGJA 3ENOA 2D1KA 3R8EA 3RSEB 2A5XA 1C0FA 4QS8A 5EX5A 1T44A 3WQUA 1LCUA 1X3MA 2E1ZA 3EN9A 2E1YA 1U2VB 3W3DA 5AQLA 3CJCA 3QMLA 3RSEA 4BRIA 1GLBG 4FWSA 4BRPA 3VPZA 1NBWA 4IO8A 4K42A 4ISFA 3M6GA 3CQYA 3FR0A 1U2VA 1YVNA 1KAYA 2QXLA 3ATUA 3ZX3A 2A42A 4BRGA 3P4IA 2FSNA 3VETA 1X9JA 3VGMA 1BO5O 1BA0A 1MWMA 3WQTA 3MN7A 3VEVA 4NO7A 5AQMA 4IWVA 4CZGA 5BREA 2HMPA 3F9MA 3U9DA 5AZJB 3IMXA 3VGLA 4FWKA 5AQVA 1BU6O 1YAGA 4CBXA 4A61A 5JLHA 3A5OC 1QQOA 1C0GA 1GLCG 5AZJA 3BF3A 3M3ZA 4H5VA 3EL2A 2E2QA 1RGIA 3VENA 3WEEB 4BG8A 1NWKA 3GDQA 3WUHA 1HX1A 4EIAA 1HKBA 4BGAA 3WT0A 2W41A 4HTLA 4FOEA 4M63C 3AAQA 1SZ2A 2Q0RA 4JHDB 3VEZA 4A2AA 3A5NC 2FXUA 3FLCO 2FSKA 5LJVA 3SK3A 3EZWA 5BPNA 3FFKB 2ITMA 2HF4A 3W0LA 4FWLA 1XC3A 1X3NA 2ASMA 4CZEA 2PBDA 2BUPA 4JHDA 4BRDA 2YHYA 1RDWX 3H1VX 3S41A 2E2PA 4AM7A 4BR5A 1HUXA 4EHTA 1NGJA 3MN5A 3A5LC 3FE1A 4K25A 4BREA 4B1UB 4BR9A 2GWKA 2W40A 4XH5A 1NGCA 3DJCA 1BWFO 2HOEA 2E20A 4BC5A 1TYQB 5AFUA 4BRAA 2ZGYA 4FSVA 1NGBA 4ISGA 5F2RA 5JLFA 3R9PA 3L0QA 1S22A 4B1VA 4BRQA 3QICA 3CI5A 1BDGA 1G99A 1TYQA 2CGLA 2V52B 4FPBA 3A8YA 4CZIA 2D0OA 1DEJA 4CZFA 3QFPA 3FZMA 4CD3A 2H3GX 3I8BA 4H0VB 3OHRA 3VF2A 2J4RA 4NB4A 3ZX0A 1GLAG 4B1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GNIA 1KLMA 4N41A 3NBPA 5AQGA 5C24A 4Z4HA 4DR5K 4DWIA 3MEEA 1QSLA 3NH0A 4ID5A 4G9ZA 5BRFA 3ZT2A 4M3WA 2NRWA 5KRTA 4M3XA 3M1FA 3TTDA 5KRSA 3V1OA 4DSLA 2OCEA 1LOTB 3ULEB 5IT9O 1FXXA 2EWSA 1BHLA 3V9XA 3EYZA 4FZYA 4CW7B 2A3ZA 2ZF5O 1NJYA 1MA9B 3L4QA 3ULEA 3KK1A 3LM2A 3THVA 1RT7A 3HRGA 3O9RA 4QCLA 3TAGA 1OH7A 3UKUB 2B4JA 4NLCA 4H03B 3O3HA 1QS4A 2HSTA 1WB9A 3C6AA 1KFDA 4H0XB 3LDLA 3UKUA 1NK7A 4HTUA 5EXWA 4JKAA 4J2AA 1XNRK 1LW2A 5GAGP 3OYMA 3AO3A 1TV6A 3CIPA 3DLGA 4F3TA 1X9WA 3CPWM 4B9SA 1JL2A 4J8FA 3DLHA 3G6EN 1KXPA 3VESA 2AJQA 4J2BA 3EO3A 1Y64A 1A5VA 2ZJPL 3CERA 3PX0A 1SAZA 3TTFA 4FWOA 4DQ8A 1OH6A 1SQKA 3OS1A 3CJ9A 3U4LA 4DR1K 3T3FA 3DOKA 4R79A 2C1IA 2PYJA 3WEEA 1C0MA 1FK9A 3CC7N 2QWPA 1QVFM 3VQPA 3SV4A 1RT2A 5KQ8A 5AQUA 2Q0UA 5MLCQ 3HO1A 1BISA 3J8AA 1TKDA 4IJAA 5AQQA 2YNFA 4LD0A 2VG5A 3HPOA 1EX4A 1VQKN 5C25A 1X9MA 2IIRA 1ASVA 5E84A 4A57A 4LF7K 1Q8IA 1EWQA 5DMRA 4BC3A 3JS6A 4M41A 3OTOK 3CFPA 5CE3A 4OLBA 4DSJA 3MWPA 3H6EA 4FK0A 1GLDG 3J7AP 3VMFB 4M3UA 3WXLA 2PAVA 1U6ZA 1W2BM 4CJ5A 4BE0A 3DLLL 3KKSA 3MEGA 4ILGB 4RCHA 1YXQA 1NM1A 3CCUN 1JLEA 4DV2K 3WNFA 5BR8K 4FO0A 3ZETB 4KHWA 4MLHA 4O0JA 1HMVA 1ZBFA 2B6AA 1VRTA 1YTUA 4CGHA 3K0SA 4FPAA 3NHGA 4YNQA 1GOAA 3HSCA 3ZETA 4WQ5C 1K9MO 5C12A 4LF9K 4ZHRA 4CZKA 4WYBA 3QBXA 1GLEG 2RKIA 1DTTA 3SUPA 4BEBA 2HBLA 2ZGZA 3CHWA 2G8WA 4YOUA 1XWLA 1RILA 3D7EO 3DM2A 1C1AA 2NRHA 3LALA 5LL6Z 1KAXA 5EVZA 4EFHA 3AARA 1L3SA 4CF1A 4JNEA 3CJ1A 1YJWN 4NLBA 1B9DA 4NCGA 2RF2A 4BWMA 1EXQA 2YHXA 3TAQA 2P51A 2P5GA 1B92A 3T69A 5K14A 3EKSA 3SAHA 4KHPK 1J54A 3I0SA 3PIOL 1IG9A 3BP8A 3AGKA 3U6FA 1GOBA 2E2OA 2AP1A 5M1QA 1W0HA 1D4XA 3SUNA 2G8KA 3O4NA 1NU0A 1NGGA 3THXB 4CIEA 4IDHA 4JK8A 4LC9B 1U04A 1IKXA 2O8BB 1RBTA 3PSIA 3LP1A 4Y1DA 3THXA 4HHTA 4W5QA 1J6ZA 4CJWA 5GAEP 1KTQA 2O8BA 4IDKA 3VGKA 3H1QA 4K41A 4CZHA 4E7KA 2YNIA 1I94K 2P9NB 4C23A 1KVCA 2IVNA 2ZD1A 5HBMA 1ILYA 4BR0A 4CFAA 2OZSA 3O9TA 2QWOA 2Q97A 2P9NA 5HRPA 3IKMA 1XHZA 5AQIA 5E26A 4DTJA 1VQPN 5KGWA 1NGFA 1RTDA 4Q5VA 2A40A 4FCYA 3O6WA 5JICA 3RMBA 4FJKA 2IGIA 4WCEL 5BPMA 2JGUA 2KHOA 4DTMA 1TUYA 3LZIA 2NRXA 3CCVN 2I7NA 4JKDA 4FJ7A 3NF8A 1WSGA 3L6QA 1NMDA 3VQ9A 4CEZA 4KI6A 1VSMA 2NRRA 3CCMN 4O4GA 4YHHK 4WQ4C 1BCOA 1BOTO 4CCHA 4BQLA 3N4QA 1O1WA 3VQ4A 3C7NB 3CCSN 4WF9L 3NE6A 1X1PA 3V1QA 3DLEA 4WE1A 3I0RA 4M45A 3P5JA 4DSFA 3C6TA 4DSEA 3HVRA 1XMOK 5GINA 1XMQK 2VWJA 3C7NA 1UA1A 4XEIA 4DR6K 1V4TA 3AO2A 5KGXA 4AH9A 4CFBA 3GBTA 1SS6A 1NGEA 3P31A 4RW7A 1U4BA 2HVIA 4DUYK 3SCXA 5HRSA 1E4GT 4JRPA 4FLXA 5TKWA 3ENOA 2RN2A 3S3MA 2D1KA 3RSEB 4CGGA 5EX5A 4CECA 4RW8A 4UY8O 2O8EB 3LDSA 4B9NA 2VG6A 1S1XA 3RSEA 1GLBG 1ZBLA 4BRPA 4R5PA 4OPKA 4IO8A 4IOXA 3LWLA 2E4LA 3E1YA 4LF8K 2O8EA 3FR0A 4RW4A 4DLGA 1YVNA 1S6PA 4FZZA 3ATUA 4B9UA 3ISNC 2FSNA 2WTUA 1BA0A 3AVAA 3VEVA 5AQMA 4WFNL 4FJGA 3B6PA 4B3TK 2HMIA 3U9DA 5AZJB 3KTQA 1L3VA 2B5JA 3WXMB 3CYGA 4DF8A 1RDBA 2HNYA 4YY3K 4NCAA 3FFIA 2OPPA 2EHGA 3ZT0A 3KLEA 5AZJA 1TK0A 3M3ZA 2HHTA 5J2PA 4PQUA 4DR2K 4Z4IA 4X65K 1RGIA 4CEAA 2NRZA 1CLQA 3WT0A 3AAQA 4GKJK 2Q0RA 3MX2A 4AF1A 3FLCO 3K9JA 3E66A 4X66K 1TKTA 5LJVA 1J5EK 5CZ2A 2ITMA 3W0LA 1LWEA 4FWLA 3J7ZO 2ZM6K 3DRRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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