2PB1A

Exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-b-d-glucopyranoside at 1.9 a
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Hypothetical protein XOG1
publication title Exo-B-(1,3)-Glucanase from Candida Albicans in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-B-D-glucopyranoside at 1.9 A
rcsb
source organism Candida albicans
total genus 154
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2pb1A00
3KEHA 4WF7A 1JF6A 3AIVA 3PZOA 1OSEA 2YL8A 1TG7A 1UKQA 3AIQA 5CG0A 1H1NA 4MB4A 4WLCA 4JHZA 1PZ3A 2YA1A 4OJYA 5LA0A 4P8VA 2XUCA 1CZ1A 2GK1B 4FMVA 1LLOA 4KRTA 4S3KA 2WNWA 4JFSA 3W26A 3O9NA 5FKYA 4HMCA 2PWHA 2WMIA 9CGTA 5D4YA 2JIEA 1JYXA 1W9PA 1OGSA 2QV4A 2ZIDA 3SCOA 4F9JA 1DWHM 4QDMA 1KXTA 2XIIA 3N1AA 1E73M 1GHRA 3IJ7A 1ZU8A 1GNXA 3SURA 3OG2A 4MAZA 1FHDA 2PWDA 3GDBA 2V38A 3FXYA 4F79A 1KCKA 3PZMA 3PZNA 3WSUA 2VCAA 3ZT5A 1SR0A 3VPLA 5CXPA 5ABFB 3VD7A 3UCQA 1GHSA 4JL2A 1UA7A 4PUEA 1OT1A 1MYRA 4GQQA 4LXFA 1OT2A 2GJXB 1CGVA 2VQUA 4HOZA 2EO7A 2BHUA 3MUAA 2EJ1A 1WDPA 3PHAA 1SFSA 1H2JA 3RILA 3VNYA 4FLOA 1JXKA 3UESA 3W27A 4GZEA 3L4VA 5BXTA 5A6MA 4X0VA 3ZO9A 4JIEA 3WBEA 1EO5A 1FFRA 1WDRA 2BXZA 1HKKA 1W2PA 3WQ8A 4PCSA 1XCXA 2J75A 1H4PA 3AMGA 1XSIA 1CWYA 1UQZA 1BVZA 1HIZA 3N15A 4LYPA 2D2OA 3SCTA 1ZL1A 5A6JA 3K8KA 1SMAA 3DECA 2W91A 1BGAA 4DUXA 1DWJM 4CD4A 1N82A 3WNMA 3O6AA 5FL0A 4AW7A 5A94A 4CD6A 4AZ5A 2VRJA 3F5KA 1P6WA 2CETA 4ZE5A 2XFRA 1Q4NX 3T0BA 3NDYA 3BAWA 2VZSA 2VL4A 3WH7A 3GH5A 5F7UA 1CBGA 3GXFA 1LF1A 4UTFA 1G94A 3WDPP 3VIIA 2CXGA 5IFPA 1C8QA 4KMQA 3ARQA 5CPTA 4QP0A 2BFGA 4OOZA 5DT5A 4DM1A 2J47A 4Q7NA 1BSIA 2BY1A 1D7FA 3A4XA 2DPEA 3NSMA 1QOXA 1VAHA 3QGVA 5HXMA 1WPCA 1GPFA 3WH9A 1JZ3A 4H04A 4M24A 1BG4A 1ITXA 3AHTA 1C92A 2D20A 4LQ1A 3WNLA 3EDJA 4A3YA 2ZUTA 2VURA 4Z2IA 1UWSA 2E8YA 2XVPA 2XM2A 1J10A 1KQYA 3CUIA 1R86A 1QVBA 1LJYA 1ISVA 1D3CA 1FA2A 4W5ZA 2WVUA 5LA2A 1VRXA 2QLYA 3WNPA 3VIFA 3PZVA 1XH1A 1JZ7A 2NSXA 4UQAA 2Y8VA 3WUBA 3PZQA 4DM2A 1UYQA 1MXGA 1HJQA 1ISXA 3SCNA 1FH9A 1J0KA 4GXPA 2BHZA 1H41A 5FOOA 3ARZA 4JFWA 1QW9A 2WMHA 3AZSA 5JUVA 3KE0A 2JFEX 2CBUA 1TR1A 4LPCA 3VUPA 1JD9A 4H41A 3WF0A 2GJPA 1WE5A 2PWEA 4V2XA 2A3CA 1XRVA 3ALGA 3ARTA 4AMCA 4CU6A 2J62A 2CBIA 3I3EA 2YA2A 3WF4A 1ODUA 1C8XA 1DWGM 1W3HA 1NWSA 2G41A 3VIPA 3T0DA 3L2LA 1PIFA 1C7TA 1PAMA 2VTFA 3CIVA 4CCEA 1WCGA 3W0KA 5A2CA 1CPUA 2WK2A 1E0XA 2WCSA 3WEMA 4PCTA 1R8LA 1QHOA 1WZAA 4C7GA 5A3HA 3VD5A 2Z1KA 2E9BA 2XVGA 4IUGA 1Q6CA 1QNPA 1CDGA 3GZAA 4TVUA 5D8ZA 1V3IA 1XYFA 1V3JA 4CD5A 4NI3A 3ZQ9A 2W92A 2A3BA 3VX0A 2YLAA 5DFAA 4U5IA 1XYZA 3LPPA 3UG3A 1K9DA 2D24A 2VUYA 3NJ3A 4J3WA 1ZB5A 2DH2A 3WMSA 4D6DA 4XZWA 4GZIA 4LYQA 3OLIA 2CKSA 1XD1A 1ZJBA 1K9FA 2WVTA 3F5LA 5A8NA 4PMDA 1D2KA 2VO5A 1M53A 4QLKA 5D8WA 3OGVA 1C7SA 2ZUMA 1VFOA 1G1YA 1DTUA 2XFYA 2ZOXA 2ZXBA 1NM9A 3VM7A 3WY1A 5A8PA 5M03A 4HOXA 4C7FA 1E5JA 4JKLA 4ATDA 7A3HA 1V3KA 1X6LA 1BQCA 1E4LA 3CH9A 3L4UA 3IANA 3CHDA 2W4XA 3PZTA 3TTQA 1B90A 1W1TA 4W8LA 3SUTA 3N13A 3TA9A 2G3MA 4Z2GA 1MQQA 1E3ZA 1M04A 2X1IA 3QOMA 3ZJ6A 1EQCA 3BAYA 1UR8A 1KWGA 1UZ1A 1QHZA 4AY1A 3RO8A 5E09A 3FHQA 3WUGA 4UQBA 5CGTA 2WHLA 3IJ9A 4BQ4A 1DEDA 4D6HA 2D3LA 1Z32X 2BHYA 3LMYA 4J27A 5EB8A 1ISYA 4MNJA 2DSUA 3ZOAA 2WLZA 4ATWA 5IHSA 2YDQA 3WD3A 4MB5A 4PMZA 4ZFMA 3CMGA 4P8XA 1IZJA 3GBEA 4MNKA 1TVPA 2OWCA 2WPGA 4HTYA 3VD4A 4OOUA 4P7QA 3WF3A 3ALFA 1VENA 3VGHA 2WSKA 2J79A 4H2CA 1KR0A 1US3A 1DWIM 4CU7A 2YIHA 3MV11 4KWUA 5A2BA 1H5VA 4U5KA 1RH9A 6CGTA 2WMGA 1TZ7A 3GM8A 3VU2A 4P8WA 1BGGA 3K4DA 3NSXA 3OZPA 3EDEA 2WWDA 3L4XA 1B3XA 1XH2A 2J74A 1LWHA 3AHVA 4AISA 5E6YA 4Q22A 4CN1A 2VJXA 3ARRA 1ISWA 1BG9A 3ARWA 4TX6A 2RGMA 1CGTA 4E2OA 1UUQA 2VT0A 4E4PA 5I5RA 3WDRA 2FGZA 1MW2A 1GOKA 4NZCA 1E6QM 4UFJA 3TP4A 3VIJA 4AD1A 1H09A 3NUKA 3SCPA 4R27A 2XIBA 2XVNA 1EHAA 2E9LA 2X05A 2W62A 4GIAA 3TTOA 4WKAA 4PN2A 2XPKA 2WHJA 1B2YA 1R87A 1JFXA 1UD2A 1WP6A 4MAVA 1V6VA 1XD0A 1R85A 3AS3A 1HKJA 3BAKA 3L4YA 2VCCA 1MWOA 3WQ5A 3ZJ8A 1PX3A 1CENA 3M6DA 2ZUVA 1CXFA 4ACZA 1V6YA 7CGTA 1WO2A 3EMQA 4J7RA 4BA0A 3U57A 1XGZA 4QCFA 1DHKA 2UY4A 3VMOA 4GQRA 1Q6EA 1TUXA 4W5UA 3WD0A 4W85A 3IAQA 3U7VA 3S2CA 4BCEA 1VBRA 4OZOA 4EKJA 3WBAA 1US2A 2YOCA 3AOFA 4PTMA 3ARYA 2VR5A 5IXEA 1GOOA 3K8LA 1HP5A 3WQWA 1E3XA 2OSXA 3W38A 1JDDA 4XB3A 1C3FA 4D6FA 4AD2A 2WCGA 2Y4SA 4MB3A 3AIRA 1WDSA 1X1NA 1KQZA 1HVXA 5DMYA 5A6BD 1GOQA 1LG1A 5DEZA 5I6SA 1HJWA 2AAAA 2IUZA 5A6LA 4RE2A 1BLIA 3WD4A 4AXNA 3RCNA 4FLQA 2NW0A 1UWIA 3CHCA 2FH6A 4B9ZA 1R7OA 3FY1A 4TTUA 1ESWA 4KGJA 1UHVA 4D6IA 2XJ7A 3MMUA 3RIKA 2QHAA 2Z1SA 2Y24A 4JZ5A 4AEFA 2E40A 3M07A 1EXPA 3OB8A 1KFWA 5I79A 2OWWA 1X6NA 3VD9A 1UWQA 2JEPA 1JFHA 2WVVA 1J0YA 5I0DA 3NDZA 4H8VA 1MW0A 4QAWA 3EYPA 1QHPA 2DT3A 1HJVA 4BZYA 4EK7A 3T2QA 4W86A 3POHA 5A69A 5ABGA 5ABHA 2X09A 2CESA 2YBTA 1XC6A 3VILA 1QBBA 2WW5A 1GJUA 3VGBA 3DYMA 2DEPA 3BLKA 1WKYA 2G3NA 4CD7A 3WFLA 1JZ8A 5BYWA 3QHMA 4JFVA 1NWRA 4DWSA 2ESCA 3PZ9A 3CZ8A 1JI1A 1EDTA 1HNYA 1KCLA 2WZIA 1KGWA 1UR9A 4R5EA 1ZBCA 2J8FA 1BYAA 1TCMA 3A47A 4ACYA 2HISA 1B31A 3B9DA 2QPSA 4A4AA 1W1PA 3ARVA 3DYOA 3A4WA 1SMDA 2OYLA 1G9HA 5AC5A 2BVYA 4EE9A 3N12A 4BQ3A 2WZEA 2V3EA 5A8QA 2GFTA 3W6LA 2XWEA 3VOCA 1BHGA 3BGAA 1UZ4A 3PTKA 4UCFA 3WH8A 2V5CA 1AVAA 3W37A 1PPIA 2WVSA 2NT0A 1VBUA 1JDAA 5HNNA 4LYRA 1UA3A 3CHEA 4W88A 1UR1A 1H0GA 3AS2A 4W84A 1B3WA 3D5HA 4YHGA 1Q6DA 2J4GA 2CNCA 4WK9A 2YJQA 4AZ7A 2J7HA 4QFUA 4WIWA 4B9YA 3PN8A 1GVYA 4J3VA 4KGLA 1NWTA 2Y8KA 3MO4A 1RD6A 4OKDA 1LL6A 2YDSA 3GNRA 3UR7A 5I78A 2FGLA 4Z2HA 1CECA 3W82A 2XWDA 1H0IA 5D9PA 2VZTA 4L4OA 5D9MA 1BAGA 1XCWA 3ZT7A 5ABEA 1KB3A 8CGTA 3CUGA 1MW1A 3GNOA 1BF2A 3PTQA 3U5UA 1PX8A 3CZJA 3QR3A 2D0GA 2J77A 5LYRA 1WZKA 3OIHA 4HP5A 4W7WA 4PMVA 4D6EA 3F5JA 3AYSA 1VJZA 4D6CA 2DSKA 2WZHA 5EFDA 1O6IA 1GOIA 2GVYA 2BV9A 1V3LA 3W29A 3MS8A 1E56A 3ARPA 3BXWA 2O92A 1FHLA 1UR2A 1NARA 5GNYA 3FW6A 2XYLA 2VX6A 3VIOA 1UKPA 3HMCA 3RJXA 5E6ZA 1UH2A 1KBKA 4ZE4A 1CXEA 3WIJA 3RMEA 3L4ZA 1HX0A 5BROA 3L2MA 3BH4A 3VX1A 1IV8A 1U30A 2BVTA 2A3HA 4MPKA 1Q6FA 3VGEA 1CTNA 3K8MA 3M7SA 1C91A 3SCSA 4ATLA 3RM9A 3T2OA 1EIBA 1A47A 3VDCA 1VFUA 5TD4A 3VM5A 1E6ZA 1LG2A 3K1DA 1OM0A 2V3DA 3BSGA 3OZOA 4ZENA 3POCA 2DT2A 1UD4A 4J3TA 4S3JA 3TOPA 3ARXA 4IPNB 2PBGA 4PMXA 4AYSA 1QNSA 4M29A 1CXHA 3FHAA 4OUEA 1TA3A 1NH6A 3CZKA 1L0PA 2ZXDA 4PTXA 3ARUA 3ZSSA 4GINA 2CKRA 2YL9A 4X9YA 2PWFA 3AFBA 4IPLA 2WAGA 1JG9A 3I3BA 1MFVA 3ZR6A 3SEPA 4PMRA 3WEZA 1CNVA 3N04A 3AHXA 1PZ2A 1KXHA 1GQLA 2VRQA 1KBBA 4BF7A 2FH8A 2VVNA 2JALA 2JEQA 4XX6A 3FAWA 4W87A 1W1YA 4U3AA 3SUSA 1MW3A 3MANA 3CZGA 4UFKA 1E70M 3G6MA 2WCAA 1VEPA 2VC9A 3PZGA 2EXOA 4GI9A 2O9RA 1LQ0A 3UETA 4ZXLA 2ZX9A 1OB0A 4CN6A 2UWFA 1GVIA 2HVMA 1VIWA 3FNDA 4TTGA 4AZCA 4D6GA 2DDXA 1QBAA 1EQPA 2ZUSA 3TTYA 3OGSA 2ZX8A 2OSYA 1J0HA 4MJ4A 4ACZB 4JCLA 3UERA 1OGBA 2G8ZA 1BFNA 3QHNA 1G5AA 4JL1A 1AQMA 2CERA 3GXMA 3UEQA 1PX4A 1M01A 2WXDM 5E0FA 4TVDA 4AZ6A 1B3YA 2JE8A 2G4FA 3BAJA 3QOKA 3L4TA 2DSZA 2X0YA 4L4PA 3VNZA 3SCWA 2CYGA 2F61A 4IISA 2GSJA 2D23A 2J25A 2ZXAA 3S6TA 1GZJA 3IK2A 2VRKA 2QMJA 3GYCA 1C93A 1EDQA 1UQYA 2E0PA 4NF7A 2VR4A 1E0VA 3BAXA 4MNLA 2EPNA 3SUUA 1BPLB 3JUGA 3AROA 1O7AA 3VD3A 5IFTA 1HN1A 4GZJA 2XGIA 4W7VA 4P7NA 1B1YA 4U2ZA 2DSWA 4MTVA 3EDDA 1CGYA 1W9UA 5D9NA 1UG6A 2ZWYA 1L8NA 1UH4A 1C8YA 1FFQA 2CEQA 1PEZA 1E6RA 1JIBA 1JYWA 4UFMA 3EBVA 2ZWZA 5IDIA 4XZBA 2VI0A 3A4AA 1JI2A 2AOSA 2XVKA 2WVVB 4M81A 4UFIA 2DIJA 4F8XA 3J7HA 3WUEA 4JAWA 2ZE0A 4BQ2A 5CSUA 5CPSA 2J8GA 4J28A 2D3NA 2WMFA 4UFLA 4WJXA 4XV0A 1C90A 1S46A 3AIUA 3WDQA 1M03A 1MQPA 1ZBVA 5M3WA 2PB1A 1E1FA 1E4NA 3VIMA 1J0IA 5GQBA 1JZ2A 2CHNA 3ECQA 1E15A 5GNZA 3EDKA 3T2PA 4P8UA 5EMYA 3CHFA 1W1VA 2GUYA 2WMIB 4CCDA 4YHEA 1VEOA 4JKKA 1V6WA 2XSBA 1HL9A 2F2HA 2JF6A 1W9XA 4DWSB 3RDKA 2IXUA 1B3VA 5CPQA 2VCBA 3WF1A 3KWXA 4PMYA 1F4AA 4UFHA 3K46A 1EGZA 1OBAA 3MU7A 1QNQA 4E8DA 2WLYA 1EH9A 2CHOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3KEH A;  4WF7 A;  1JF6 A;  3AIV A;  3PZO A;  1OSE A;  2YL8 A;  1TG7 A;  1UKQ A;  3AIQ A;  5CG0 A;  1H1N A;  4MB4 A;  4WLC A;  4JHZ A;  1PZ3 A;  2YA1 A;  4OJY A;  5LA0 A;  4P8V A;  2XUC A;  1CZ1 A;  2GK1 B;  4FMV A;  1LLO A;  4KRT A;  4S3K A;  2WNW A;  4JFS A;  3W26 A;  3O9N A;  5FKY A;  4HMC A;  2PWH A;  2WMI A;  9CGT A;  5D4Y A;  2JIE A;  1JYX A;  1W9P A;  1OGS A;  2QV4 A;  2ZID A;  3SCO A;  4F9J A;  1DWH M;  4QDM A;  1KXT A;  2XII A;  3N1A A;  1E73 M;  1GHR A;  3IJ7 A;  1ZU8 A;  1GNX A;  3SUR A;  3OG2 A;  4MAZ A;  1FHD A;  2PWD A;  3GDB A;  2V38 A;  3FXY A;  4F79 A;  1KCK A;  3PZM A;  3PZN A;  3WSU A;  2VCA A;  3ZT5 A;  1SR0 A;  3VPL A;  5CXP A;  5ABF B;  3VD7 A;  3UCQ A;  1GHS A;  4JL2 A;  1UA7 A;  4PUE A;  1OT1 A;  1MYR A;  4GQQ A;  4LXF A;  1OT2 A;  2GJX B;  1CGV A;  2VQU A;  4HOZ A;  2EO7 A;  2BHU A;  3MUA A;  2EJ1 A;  1WDP A;  3PHA A;  1SFS A;  1H2J A;  3RIL A;  3VNY A;  4FLO A;  1JXK A;  3UES A;  3W27 A;  4GZE A;  3L4V A;  5BXT A;  5A6M A;  4X0V A;  3ZO9 A;  4JIE A;  3WBE A;  1EO5 A;  1FFR A;  1WDR A;  2BXZ A;  1HKK A;  1W2P A;  3WQ8 A;  4PCS A;  1XCX A;  2J75 A;  1H4P A;  3AMG A;  1XSI A;  1CWY A;  1UQZ A;  1BVZ A;  1HIZ A;  3N15 A;  4LYP A;  2D2O A;  3SCT A;  1ZL1 A;  5A6J A;  3K8K A;  1SMA A;  3DEC A;  2W91 A;  1BGA A;  4DUX A;  1DWJ M;  4CD4 A;  1N82 A;  3WNM A;  3O6A A;  5FL0 A;  4AW7 A;  5A94 A;  4CD6 A;  4AZ5 A;  2VRJ A;  3F5K A;  1P6W A;  2CET A;  4ZE5 A;  2XFR A;  1Q4N X;  3T0B A;  3NDY A;  3BAW A;  2VZS A;  2VL4 A;  3WH7 A;  3GH5 A;  5F7U A;  1CBG A;  3GXF A;  1LF1 A;  4UTF A;  1G94 A;  3WDP P;  3VII A;  2CXG A;  5IFP A;  1C8Q A;  4KMQ A;  3ARQ A;  5CPT A;  4QP0 A;  2BFG A;  4OOZ A;  5DT5 A;  4DM1 A;  2J47 A;  4Q7N A;  1BSI A;  2BY1 A;  1D7F A;  3A4X A;  2DPE A;  3NSM A;  1QOX A;  1VAH A;  3QGV A;  5HXM A;  1WPC A;  1GPF A;  3WH9 A;  1JZ3 A;  4H04 A;  4M24 A;  1BG4 A;  1ITX A;  3AHT A;  1C92 A;  2D20 A;  4LQ1 A;  3WNL A;  3EDJ A;  4A3Y A;  2ZUT A;  2VUR A;  4Z2I A;  1UWS A;  2E8Y A;  2XVP A;  2XM2 A;  1J10 A;  1KQY A;  3CUI A;  1R86 A;  1QVB A;  1LJY A;  1ISV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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