2PE4A

Structure of human hyaluronidase 1, a hyaluronan hydrolyzing enzyme involved in tumor growth and angiogenesis
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
RSFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Hyaluronidase-1
publication title Structure of Human Hyaluronidase-1, a Hyaluronan Hydrolyzing Enzyme Involved in Tumor Growth and Angiogenesis
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 139
structure length 417
sequence length 417
ec nomenclature ec 3.2.1.35: Hyaluronoglucosaminidase.
pdb deposition date 2007-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01630 Glyco_hydro_56 Hyaluronidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2pe4A00
1TPB1 4UMBA 1PHQA 2WSYA 3EEGA 4A2SA 3NQAA 2VENA 2NX1A 1JRCA 1QAPA 4FO4A 5G2IA 4AVFA 1MSSA 4O4WA 3S1UA 4A22A 3P84A 5D33A 1TV7A 4O57A 1DBTA 1UJPA 2GVJA 1K03A 3E49A 5FEPA 4NXKA 4AHPA 2Z1BA 4MY8A 3W7KA 5AB3A 3NDOA 4Q32A 3G3MA 3G1SA 5CZTA 3LRLA 5G2WA 4GXMA 3CT7A 5FF4A 3UZ5A 1KM6A 4FXSA 4UC5A 2FIQA 3RLUA 3KXQA 3LCFA 3NEVA 2NXHA 3MI3A 5DCDA 1MEIA 4RV8A 1HUVA 2DJXA 3EKLA 3TA6A 3C56A 2QCLA 3UZJA 3SECA 2RDTA 4UUIA 3L65A 3T78A 3CU2A 4JTSA 1PL9A 3HPXA 3PY2A 3W9ZA 1XDMA 1P0NA 5HUOA 3GDRA 3IVSA 3NNTA 4JTKA 2AGKA 3B05A 4OHQA 3SZ8A 2CU0A 4E2DA 3HBLA 3NQCA 1N55A 2A0NA 4BF9A 4LUJA 5F4SA 2JGYA 1QPNA 2ZA3A 3G18A 1EUNA 2RDUA 4O50A 4AWSA 4RK8A 1KTCA 5C54A 4AB4A 2C1HA 4JR5A 1ME7A 1F76A 4PC8A 2Z2UA 1X8FA 2D73A 1LTDA 1RPXA 4LC6A 1AMKA 4ADUA 2E5DA 1A5CA 5LHEA 3NQ6A 3GVGA 4JDYA 3BO9A 2YW4A 2E5CA 1KTBA 1OK4A 1OFQA 1P5BA 2AAMA 2FB3A 4NJKA 3F4NA 1CI1A 4TO8A 4DO4A 4XZ9A 1H62A 1A50A 3RFAA 4MLJA 2A2IA 4FB7A 1C8VA 4O18A 3TU9A 1ZCOA 2ZRYA 4M6QA 1O60A 3O15A 4JIQA 3B06A 5FF2A 1MXSA 1SQ7A 5FF7A 1GVRA 5AYXA 1H50A 2CLIA 1ZAHA 3EX2A 3VKJA 3G0UA 1H7XA 4FF7A 1VYRA 4JY8A 1VR6A 3DH7A 3NOEA 2NUWA 1AW1A 1EWEA 1GWJA 2C13A 1KM5A 1Y0EA 2CLLA 3TSDA 3SGUA 1Q6QA 1OVDA 4DBDA 1TPFA 4CNOA 5D2WA 4UMAA 1J5TA 3EWWA 1C29A 3DENA 3P67A 3NQ7A 2A6NA 3W07A 1SPQA 2OMAA 4JYDA 5F4XA 3UQNA 3MHGA 3ATYA 3OVQA 3RMJA 3IGUA 1YXYA 4Q33A 4LVGA 3B8DA 2E1DA 4HSOA 4B5NA 1KFLA 3GLCA 5HWJA 5I3KA 3LXCA 4OE7A 3HG3A 1GYLA 4IQLA 4IPIA 2Q3RA 1BWKA 3BLEA 5IBXC 5BRBA 1UUMA 4I7WA 3W70A 3K30A 3MBDA 2A7RA 1RD5A 4X2RA 2V9DA 1SR9A 3W3OA 2NV1A 2ZZ7A 3WJSA 2OT1A 3G1XA 5D30A 4BI6A 5G1YA 1LBMA 3WJWA 4UTHA 3GIYA 2JGQA 2EPHA 3WJYA 2YXGA 1XUUA 3BW4A 1IGSA 5D03A 1VS1A 4AWUA 4Q4KA 3CEUA 4NJJA 3LHWA 5HQEA 5IM51 3TJLA 1G7VA 1OYAA 4AF0A 3O16A 3L5MA 2V2CA 4OBTA 1JUEA 2RH9A 4FNTA 3EXTA 3LCXA 1F6KA 4TU1A 2FTPA 4MYAA 4O13A 1K8XA 1DJQA 4HNNA 1SW3A 3CIXA 1LCOA 1I2NA 1VCFA 1EX5A 1I2OA 5CSRA 1TTQA 3JR2A 4TIMA 2Y6ZA 3GDLA 1LLWA 3S5YA 1U5JA 1TRDA 2KZHA 4IPJA 3TQVA 4DPPA 3B0VC 2TYSA 1QPOA 3NQDA 3LB0A 5I3HA 4G1KA 5GVJA 1TQXA 1H5YA 4DPQA 3M47A 2DZXA 1TTIA 2XN2A 4ML9A 1I4NA 4UNKA 3AO0A 2Y88A 2J9ZA 4BFAA 5AC6A 2V0TA 1G4EA 2C0AA 5D2VA 1GYNA 4QITA 4P61A 5KZDA 5LNRA 4EF8A 3DZ1A 3DFNA 5AC7A 5C5YA 4Y6GA 3EXRA 3QSRA 3N73A 1FCQA 3B04A 5EYWA 3S42A 1K3UA 3LM7A 4NU7A 5FI8A 3LCGA 2B7OA 3C0JA 3GXPA 5F2MA 1JQVA 4OV4A 4JXCA 4O28A 6ALDA 4BWLC 4JTJA 4Y90A 5K4XA 4EWND 3HB9A 4OQVA 3P8JA 4AHQA 1YTDA 1EEPA 1FWTA 3I7SA 3C61A 1H51A 1XM3A 1F2JA 3VE9A 1PIIA 3NQ2A 3A5VA 2O7SA 1FY6A 1DL3A 2VEPA 1OFEA 3BW2A 4UIOA 3P5YA 2QCNA 3N9SA 1QR7A 3IVTA 4MFEA 3R13A 4ZQCA 4E2BA 4ADTA 3PWAA 3LHTA 2PRMA 1G4SA 4KWWA 5SWUA 3W7DA 1WAUA 4MOZA 1B4KA 5HNRA 4HHPA 3GXNA 2VEMA 3O6CA 3W7EA 4ZQOA 3PUDA 4MYXA 3IEBA 3ZWSA 4CCCA 1YADA 1QOQA 4FIRA 3IIPA 3KHJA 4FHAA 3QC3A 1GG1A 1JUBA 1RQBA 2GVGA 2CLOA 3HG2A 3PM6A 3S1VA 3EKZA 4PODA 2HMCA 3QMRA 1FDYA 1HO4A 4HIBA 2YFNA 4O54A 5F4WA 3GKAA 1QFEA 2H6RA 2V30A 2WNZA 3OBKA 1TPWA 1ICQA 4X9SA 4AF0B 4LWWA 3HGSA 3DBPA 3W7QA 1TJRA 1G69A 5AHFA 4ZVJA 2WSQA 1H7PA 3TNOA 4WZHA 3IRDA 4IXXA 1QMLA 1SW0A 3Q58A 3WJXA 2V81A 1TPUA 3PB2A 2G97A 3VCRA 2PE4A 4HNUA 5D2TA 4N6FA 3S8HA 3ABRA 3FEMA 3KVJA 5D38A 4Z1AA 3LX9A 3LTSA 3C6CA 3EX3A 4JTTA 3CLMA 1KM0A 2ZRWA 1OFRA 4YL2A 4LOCA 1W5MA 3BARA 3TJXA 4D2JA 4Z0SA 3N9RA 1FCBA 1XBZA 3NPWA 3S5OA 3W88A 4QAIA 3G1HA 1DV7A 1QO5A 2YPIA 3NZRA 1IF2A 1OFBA 4TX9A 3U2OA 1TREA 3FYPA 3NGJA 3QYQA 1LORA 3OG3A 5K9XA 1JCYA 3SI9A 3HGRA 3L0NA 3L21A 2QCFA 4UTJA 1LRQA 4WUIA 4MUZA 2X1SA 2A1YA 1EWDA 1D3HA 3SY5A 3TROA 4N4PA 4NJHA 3EWBX 3W71A 3I68A 2WOQA 2ZZ5A 1H7RA 2YW3A 3P61A 3VI2A 2H90A 3BG9A 4O0KA 2NWRA 1FWNA 3F4WA 2NX9A 1JCXA 5HMSA 5F2LA 3QMSA 3BGGA 1AG1O 1SU5A 2Y63A 1ME9A 3PSVA 3E02A 5LGZA 3VNDA 3W1UA 4K38A 1KBJA 4CNNA 3L0GA 3PBWA 4OT7A 5BW6A 4GUJA 2X16A 3LV5A 3W7GA 2HS8A 3LXBA 4IX2A 1SO4A 4KKXA 4QSHA 2EAWA 2QJHA 3EWZA 4LVBA 4UTWC 1TMHA 4GNJA 3UYCA 3M16A 1TPH1 3T7VA 4EOUA 2ABAA 5CGQA 3EX4A 4JICA 1IIGA 1OF8A 4DF1A 1Z44A 4JY9A 1IXNA 2R14A 4A29A 2VXNA 3TQKA 3G0SA 4NXSA 5KITA 1LZOA 4HPXA 4WOZA 3NA8A 1R46A 2BTMA 1FCVA 3QJAA 2EGZA 1X1OA 3LCHA 1K7EA 4Y96A 3DFTA 2C16A 1OG0A 3HOJA 3TKFA 2F7FA 3NL3A 3L9CA 4UTLA 4Z1CA 4YMZA 1B9BA 3W74A 3UPBA 2JKAA 1KFEA 5J5RA 2E6AA 1XXXA 4NJGA 2RFGA 3NQ8A 3G24A 1R30A 2I1OA 1KLYA 3NXFA 1FWWA 3O8AA 4W9TA 3C2EA 5EKYA 2JKPA 1YYAA 3CIWA 3OIXA 1TPVA 4JTIA 2E09A 5DXYA 1DOSA 1GVSA 4XKYA 1AK5A 4FX7A 1FUYA 1WOBA 1YXDA 4N4QA 1QPRA 2QJGA 1SZEA 2ZZ3A 1L6WA 3E9AA 3PB0A 2VFIA 3IVUA 3HO8A 3ZR4A 1VH7A 3DHDA 3EX6A 3GXTA 3KX6A 3TV8A 3W7JA 3C3NA 1SZNA 2A85A 2FPTA 3FYOA 3PVFA 5BMXA 3G22A 3I6RA 4PEKA 4M7TA 4N9CA 1Q6LA 3NQFA 1Q45A 4LC8A 1YPIA 2C18A 3PBVA 3W76A 3OVPA 3W7RA 3TXVA 1M7PA 5EBUA 4TMCA 2PURA 3PG9A 1W37A 1FQ0A 4MZ1A 3KOFA 3C52A 4PH6A 3L2IA 3WK2A 3U8GA 2ISVA 4LW7A 2A21A 3DAQA 4BI7A 2GOUA 1W5NA 4UNLA 2V2HA 5CPOA 5FEXA 4HKPA 4K36A 2QUTA 5T26A 3BK0A 3P7YA 1ALDA 1A5BA 3QW3A 3TAKA 2QCDA 2YDAA 3GZ3A 3MP5A 3NYZA 4WQ6A 3M9YA 2ZRZA 3FKRA 3LRKA 4NQ1A 1T0OA 4Y8FA 3WFAA 3MYPA 1OFDA 2E68A 4H3DA 5HINA 3O05A 1TCDA 3UD6A 4M5PA 3CPRA 5CPNA 3UWQA 4O11A 2YYTA 1JQXA 1ZHAA 4E0CA 1KA9F 1EB3A 5G4EA 3C4UA 1LDCA 2Y61A 1GT8A 2X1TA 4NNAA 3F03K 2NWSA 1G4TA 1VCVA 1LRTA 3KRUA 3KAOA 4YWIA 2E6YA 1YTEA 2CLFA 3T55A 1VLIA 4OWGA 5CSSA 1M5WA 5FF0A 2Y7FA 3KFTA 4LUIA 1UB3A 4HT3A 1GG0A 2OT0A 4NX0A 2QCEA 3LCIA 5LZLA 1AL8A 2PC4A 2H8XA 1B3OA 1P0KA 2FPYA 2C15A 2JKEA 2TPSA 4UFHA 6TIMA 2P0OA 3VE7A 3HMJG 3O6YX 2ALDA 3W7OA 2CW6A 4X3ZA 4GWEA 1AW5A 1H1YA 1UUOA 1QCWA 2V82A 3NM1A 1HTIA 1BTMA 2X30A 3W72A 4C1KA 3YPIA 3TSBA 1C9DA 3LCWA 2G96A 1DKWA 3B03A 1GTHA 1K02A 1VPXA 1YDNA 3TW6A 4K37A 5LNUA 3W2KA 4IMFA 3UWZA 3R2GA 4IMDA 4JDBA 1RQEA 3GNNA 1MZHA 2DJLA 3MYOA 3M5YA 4UR8A 4GFSA 2QUUA 2CLMA 1XBXA 4FX8A 3QEZA 4JYEA 3O6DA 3PBYA 3ELFA 4NVTA 3CHVA 4I7VA 3OA3A 2YGYA 5LNWA 1LP6A 5G5IA 1EIXA 4GUFA 1CW2A 3MUXA 3V1PA 3QPYA 3G8RA 3TFXA 1HO1A 4CLMA 3LV6A 4OV9A 3W1LA 3PSWA 1D3GA 1VCGA 5C55A 2B7NA 4HSNA 1GTEA 1YDVA 4LV9A 4M6PA 2X1UA 1ZAJA 5MHBA 1I2QA 8TIMA 2ZZ4A 1SO3A 2RKXA 1YLVA 5CPMA 1EUAA 3HGOA 1R2RA 1IXQA 4ZQNA 4ZL1A 1M6JA 2Y7GA 2VC6A 2GJLA 2CWNA 3M5ZA 4MZ8A 4ONVA 5D2YA 2XFWA 1JJKA 1OF6A 3HGJA 5AHLA 4AWTA 2IQTA 3CWOX 4GC4A 1ZJIA 4O19A 5KINA 5LNSA 1Z48A 2ZRXA 3Q94A 3STFA 4ADSA 5FEWA 2VFGA 3C2OA 5E0KA 2A7PA 1T96A 2XN0A 5A5WA 3S5NA 2ZA1A 3W23A 4H6KA 1O5KA 3HPZA 4AH7A 1BEUA 4HN4A 2V5BA 3EXSA 1NF7A 1SUXA 5FF3A 4O8RA 1DQWA 3PBUA 4BR1A 3NAVA 3T40A 4U28A 1NSJA 3LGEA 1VHCA 1TTPA 1P1XA 4JYFA 3NO5A 5AHMA 4WJEA 4O52A 1WA3A 1W5QA 4PL2A 3A24A 3LHUA 3EB2A 5ABTA 3LHZA 3M5XA 3NVTA 1BWLA 4XQ6A 3LCLA 3FKKA 3M1ZA 2Y7DA 5F2IA 1WOAA 3UXDA 3UWWA 4JS3A 4PL1A 1KV5A 1OFOA 4OU1A 3LHVA 3RNDA 1PCWA 4WY0A 3GDMA 4M7SA 2ZCGA 4O14A 4BI5A 4OGZA 2QCHA 1TV8A 2B0MA 3FOKA 3W86A 2VKZG 3QSTA 4LNYA 4UTTA 3S1WA 1S3HA 2Q8ZA 4DEFA 1I2RA 2QEZA 4HPJA 3W7IA 1PHWA 1VRDA 2BLEA 3LERA 4YCOA 3HJZA 3UXAA 3QQ0A 1GVOA 3R5EA 1F74A 2VFEA 3ABQA 1DVJA 4M19A 2ZA2A 3LLFA 2V5LA 1KFCA 2CZEA 2VOMA 3LRMA 3DU0A 2ZRVA 2OX1A 3MHUA 3SR7A 5KZMA 5TBOA 3IGSA 4J9JA 4JX4A 4NX5A 3N3MA 4KWVA 1H7NA 2TSYA 2X2GA 3G0XA 4MLRA 3UWYA 1ONRA 1JR1A 1TJPA 4YLWA 1N7KA 3W87A 3GDTA 2O7QA 2NUYA 5DCEA 4FNPA 2BSLA 2R8WA 3TAOA 1XDLA 4O4VA 2Z0IA 4KFPA 2YYUA 1KLZA 1TQJA 5D05A 2BZNA 1H7OA 3PULA 1RR2A 2WKJA 4XTIA 3GNDA 3HPSA 4HNTA 4R53A 2ABBA 3GK0A 4ZQRA 4UFLA 2ZZ1A 4ORIA 3S6DA 1ICSA 3MW7A 1VQTA 2ZDRA 3WK0A 4LRTA 4JGDA 3SFKA 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 5LSM A;  1WXJ A;  4MY9 A;  3UY7 A;  1O95 A;  3H53 A;  3EX1 A;  2OZ0 A;  3BG3 A;  3N14 A;  5L9F A;  4FIQ A;  4I9A A;  2VFH A;  4U4M A;  3W1N A;  2ZFA A;  1DOR A;  1JRB A;  3LXA A;  2NZL A;  3M41 A;  1OYC A;  2LLE A;  3UWU A;  3G1V A;  4UXD A;  1VGA A;  5U7S A;  2EF9 A;  4RZ4 A;  1UBS A;  1SSD A;  4CQ8 A;  1SO6 A;  4JD4 A;  3BW3 A;  4MJM A;  1YTK A;  3KVL A;  1R2T A;  4RLI A;  1FCU A;  5DN1 A;  1LM1 A;  2I14 A;  3W85 A;  3U6W A;  3NZ1 A;  1IXP A;  1L6Y A;  1VC4 A;  1SSG A;  2NLI A;  2CZD A;  4POC A;  4RXF A;  1FDJ A;  4JTF A;  3GDK A;  3M6Y A;  4GUH A;  3S1X A;  3DFP A;  3S5Z A;  5DLC A;  3F1Q A;  3MP3 A;  4CQ9 A;  1NFB A;  3W2U A;  1ZNN A;  3W7M A;  3HF3 A;  3NG3 A;  3TML A;  2RDW A;  3NQE A;  5TIM A;  4RJE A;  1RQH A;  3P60 A;  1OAB A;  4K8H A;  1HG3 A;  3W7L A;  2ZYF A;  4ZQM A;  5K3V A;  5HJL A;  2J6X A;  2W79 A;  1OX4 B;  3HG5 A;  4JX6 A;  3I7Q A;  2QCC A;  1S5V A;  1I2P A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WSY A;  3EEG A;  1MRQ A;  3PJW A;  1R3R A;  2VEN A;  4GC3 A;  4S3K A;  1FH7 A;  4PCN A;  1CEO A;  2BOD X;  2QLY A;  3LU2 A;  1BLI A;  3P84 A;  4MJ4 A;  3PZU A;  1QOX A;  1S3T C;  5D33 A;  1WKF A;  1UJP A;  2L5H A;  2D3L A;  3DG3 A;  4BQ4 A;  2VZS A;  4EXA A;  4BKN A;  1N8I A;  4US6 A;  4R85 A;  5G2W A;  4XIM A;  1K9F A;  1MDR A;  4HA1 A;  1KM6 A;  4B90 A;  3LCF A;  3HV8 A;  2EPO A;  5DCD A;  3S46 A;  5CCZ A;  2DJX A;  3ARR A;  1RBA A;  4IZG A;  4LCS A;  2X1I A;  1WE5 A;  5ABE A;  1ZU8 A;  1XDM A;  2Y5S A;  1R3Q A;  1E4L A;  5HPC A;  4JTK A;  4AD1 A;  2AGK A;  3TEV A;  4LB3 A;  4E2D A;  3FYY A;  4MM1 A;  2A0N A;  4LUJ A;  3WY1 A;  1QPN A;  1FHD A;  4HK5 A;  5C54 A;  2C1H A;  3DX5 A;  1ME7 A;  1S2C A;  4U5I A;  2FGZ A;  2DW7 A;  1JFH A;  1RPX A;  2DSK A;  5C7V A;  1IWB A;  1KXH A;  4ADU A;  1W9U A;  5LHE A;  2QIW A;  1E0X A;  2E5C A;  3GXD A;  2AAM A;  1P5B A;  2HNE A;  3OIH A;  4EAC A;  4NYY A;  3F4N A;  3DCP A;  1U1J A;  4CD8 A;  1Q85 A;  3ALG A;  1A50 A;  5JIW A;  1Z3N A;  1C8V A;  2XUC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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