2PMOX

Crystal structure of pfpk7 in complex with hymenialdisine
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
348
structure length
340
Chain Sequence
GPLGSMKDILSNYSNLIYLNKYVKEKDKYINDYRIIRTLNQGKFNKIILCEKDNKFYALKKYEKSLLEKKRDFTKSNNDKISIKSKYDDFKNELQIITDIKNEYCLTCEGIITNYDEVYIIYEYMENDSILKFDEYFFVLDKNYTCFIPIQVIKCIIKSVLNSFSYIHNEKNICHRDVKPSNILMDKNGRVKLSDFGESEYMVDKKIKGSRGTYEFMPPEFFSNESSYNGAKVDIWSLGICLYVMFYNVVPFSLKISLVELFNNIRTKNIEYPLDRNHFLYPLTNFLSNEDIDFLKLFLRKNPAERITSEDALKHEWLADTNIEDLREFSKELYKKRKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Ser/Thr protein kinase
publication title Structures of P. falciparum protein kinase 7 identify an activation motif and leads for inhibitor design.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 88
structure length 340
sequence length 348
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2pmoX02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2pmoX01
3TJCA 1B38A 3HX4A 4BCHA 4ANBA 2QCSA 3LIJA 2B9HA 4GG7A 3PTGA 2YDJA 4IXPA 2QOIA 2YZLA 5DRDA 4FTJA 3WZJA 3PLAE 5FEDA 4JBOA 4J52A 3ZUUA 3FMEA 2F7EE 4YJVA 3ORIA 3OXZA 2VWVA 4MXYA 3U8WA 4QQTA 4UB7A 1R1WA 3MJ1A 4QNAA 4BI0A 4DTBA 2Z7QA 4U7ZA 2G15A 1PMUA 2XNBA 3P4KA 4NJDA 5CSHA 4HVIA 3FYKX 3SA0A 4IJ9A 2WMTA 3EYHA 3ORMA 4O7TA 1VEBA 2XM9A 2ESMA 4R78A 1GJOA 1RW8A 1JKTA 4JXFA 3QX4A 2UZOA 3QF9A 4GT4A 3OXTA 3SXFA 3PPKA 4QMSA 5EKNA 4RPVA 3IDPA 2YA9A 4IZ5A 2Q83A 2R7BA 1O6YA 4FT3A 2WELA 3ZONA 3F5GA 1PJKA 1PKDA 4RX9A 4C2VA 2X4FA 4N4SA 2WMXA 1REKA 5FWKK 4OBPA 3TV4A 1PYEA 2JKQA 3M1SA 3QTZA 4QRCA 4ACHA 4AT3A 4BVUA 4W9WA 2F2UA 2VX1A 5A4EA 3MS9A 4I6FA 3ZTXA 3QA8A 4F6WA 3EYGA 5E8TA 5GJDA 4NL0A 4ZLOA 5ETIA 5C9CA 3WBLA 3N9XA 2HIWA 3FKLA 4CRSA 4V0GA 4HGSA 4O7VA 1U54B 2ITNA 2REIA 4AW0A 5EH0A 2CCHA 2WQOA 4CKIA 1ZY4A 2RGPA 2WMVA 4EOLA 1YHSA 2RG6A 3VC4A 3KN5A 5CSWA 4AA5A 4YBKA 2XBJA 4F70A 4S2ZA 2WTIA 1KE7A 4ERWA 5HG7A 3BX5A 4RZWA 5KUPA 2F4JA 3CKWA 4IX4A 1FOTA 1P5EA 5I0BA 4PMTA 1H4LA 1OL5A 3R2BA 5IMXA 1GIHA 2GTMA 5L6PA 3R8PA 4C3RA 2UW9A 2ZVAA 4RIXA 1V0BA 4IW0A 5HICA 2B9FA 3DBFA 3MWUA 2OZAB 4ZLYA 3QRKA 4AG8A 5B0XA 4A9UA 3KREA 2Z8CA 1ZZLA 3ZDIA 3A7JA 1XR1A 4B4LA 5AP0A 2BAJA 1OIYA 3EFJA 3NUAA 3D15A 4IX3A 3RPVA 2B4SB 4AF3A 5KNJA 3NVMB 1Q99A 1UKIA 5IQFA 3D2KA 4RMZA 5TKDA 3W16A 4ZJVA 3RCDA 5DLSA 3H3CA 4CKRA 4U41A 3W18A 3HUBA 3PVGA 4MBIA 5A14A 3UIMA 3PG3A 3ZO2A 5CF4A 5IQGA 4B9DA 4JS8A 2CNQA 1I09A 4NKAA 4EK3A 3KRLA 2XNMA 4PP7A 5DGZA 5CVHA 3TG1A 1Y91A 3UP7A 4DGOA 3ORNA 4XUFA 3AG9A 4ZMEA 5C4KA 1Y6AA 1Q24A 4ACCA 3BZ3A 4ZZOA 1Q8TA 2OI4X 5ANDA 2CGWA 4UWYA 4C0TA 3OT8A 4C3PA 3V5WA 5CF5A 2A2AA 5HO7A 2CKEA 1O6KA 2R0IA 2OXXA 3KCFA 4TYHB 2R3GA 5DR9A 3O0GA 3CQUA 1M7NA 3QTXA 4MXOA 5HNIX 1H28A 5FTGA 3IKAA 3IQ7A 4DF3A 4PX6A 3MPMA 5BVOA 1KOBA 3W2QA 3VN9A 4J97A 4WRSA 4NK9A 4FEWA 3P7BA 1NVRA 2O2UA 3SXSA 4AQCA 2BZKB 3OUKA 4BWPA 3MB7A 4QQJA 3CD8A 4IAZA 4JX7A 3DKOA 4O6LA 4EK5A 2VN9A 2OJFE 4O81A 2OH4A 2WZJA 4J95A 4LOPA 4PMSA 4M8TA 4OTFA 3O7LD 5DOSA 3PY0A 2HYYA 5FBOA 4O7SA 3KGAA 1L3RE 5JRSA 1GZOA 1ZY5A 2C6MA 4QP1A 3DK3A 4WNPA 4MNFA 2PE2A 2GNHA 4MWIA 5AV4A 3EWHA 3RINA 3OD6X 5L4QA 3FKNA 3OWKA 3FL5A 1ZYSA 2F7XE 4TYEA 3UVRA 5LARA 3PUPA 3R04A 2VWUA 5HTCA 4F0GA 1OM1A 4HVDA 4L68A 1BMKA 4DGNA 2ITPA 4F6UA 1G8SA 3CEKA 3VW8A 4BBFA 5IH4A 1WBPA 4DH1A 2AC5A 2WFYA 2YM8A 5A9UA 4DBXA 2QONA 4C37A 4FSNA 3DXQA 3QUPA 1MRUA 3DBCA 5IA2A 4H3QA 3HKOA 2VTPA 4R5YA 2CGUA 4JG6A 4L53A 4P5ZA 3C5IA 2I7QA 2NRYA 4FICA 2XK8A 3D5UA 4O0TA 5IF1A 3MA6A 4A07A 2UW5A 5HTIA 2J7TA 3FLNC 4DEAA 3QC9A 5HNGA 2C0OA 4ZSJA 2W1ZA 3QWJA 1ZMUA 3C4FA 1UU3A 4L01A 5IH6A 3PJ3A 3NAXA 3A2CA 4DITA 2JD5A 4LGGA 4EC8A 2WO6A 4YU2A 2BRHA 4X3FC 5FLFA 2VTAA 4FBXA 3EQGA 4I5CA 3EOCA 4DT8A 2QVSE 2WTCA 5CU0A 3LE6A 1JKLA 3EFLA 3OWLA 3ULZA 5I5ZA 4FKIA 3NUPA 3PIXA 3FXWA 5LVMA 4F1MA 3O8PA 3NW6A 3OW3A 5DR6A 4XG7A 2PTKA 3EN7A 4BRXA 3IW8A 3VS0A 3OOMA 3TCPA 4L00A 4ANMA 4MXZA 5G1XA 3HV3A 2PUIA 2CGVA 5TT7A 3ZS5A 4BDJA 5IUHA 4I92A 5KKRC 1Q3WA 4BIDA 4FIGA 3RZBA 3QZFA 4UZHA 4LV5A 4KINA 1UNGA 4EUTA 4I0SA 5CALA 2QOCA 3U4UA 3Q4ZA 4U44A 2J4ZA 2Y4IB 3LAUA 3G33A 2VNWA 2WEVA 3CTQA 3PVUA 3V5PA 4AW1A 4YP8A 1ZZ2A 5LMKC 4IB1A 3Q96A 3E64A 3VF8A 3TJDA 4KKGA 3OG7A 2J51A 2OF4A 5ETFA 2WOTA 3V01A 3LXNA 2FB8A 2QLUA 3OWJA 4HYIA 2J5FA 2R2PA 4ZIMA 3PRFA 1H00A 3UO5A 3LM0A 4CQEA 5CANA 4RA4A 2XA4A 2RL5A 3C50A 2GNJA 4GUEA 4DT9A 4D58A 3UP2A 3BQCA 3DJ6A 4RLLA 4BHZA 5BPYA 1EH4A 2V0DA 2OO8X 3KXGA 3Q52A 5BQ0A 1H01A 3LCOA 4YJPA 5CTPA 4R1YA 2BALA 5BMMA 4FV2A 1UNLA 4YTHA 2WB8A 1IRKA 3U51A 5EI2A 3ZZEA 5HORA 2YHVA 3D14A 4AE9A 3OWPA 3QQUA 3RTPA 5M4CA 2QC6A 3VBXA 4EK4A 2IW6A 2X9FA 1FGKA 4E8AA 3WZDA 5J9LA 2VTMA 5D41A 2UVYA 2X2MA 3BU6A 4EH3A 5IA4A 4C59A 1QPEA 4QTAA 2YERA 4OLIA 2BRMA 4LL5A 3SLSA 4GS6A 2PVFA 2GU8A 3WARA 3ZFYA 4DLJA 2ITXA 3OS3A 3FLYA 3T3UA 4A9RA 3QUEA 4AGUA 4CMUA 4CV9A 3JUHA 3R63A 4FR4A 4FTKA 3NUSA 2BPMA 4HW7A 1UU7A 3EQCA 3JPVA 3FLSA 3QD4A 2CJMA 1MRVA 1FPUA 5EI8A 4KIKA 4CV8A 3I60A 3ENHA 4M3QA 1QMZA 2W1GA 1AD5A 5A6OA 3OW4A 1LR4A 2HY81 3JVSA 5CXHA 3S3IA 2E9PA 4IC7A 3P0MA 4QTBA 3F7ZA 4HGTA 5AUVA 2RG5A 1PHKA 1BUHA 5HZNA 4RX7A 3VUMA 3ZCLA 4LOOA 3FMHA 2JKKA 3O71A 3ORLA 4FSZA 3V6SA 3Q4CA 4IIRA 4X3FB 2HCKA 4KSQA 4FTRA 5AAEA 4WG5A 3TUCA 3BWFA 3QUDA 2YM5A 5HO6A 4C2WA 4ITIA 3PXYA 1FINA 2EXEA 3DXNA 5M4FA 4O0WA 3ACKA 3QZIA 2UZUE 1LEZA 4HGLA 4JDKA 3KL8A 3KKVA 3TZMA 2H6DA 3EN5A 4KKEA 1ZYJA 2UW8A 4RX8A 4TN6A 1PF8A 2I0VA 3VUTA 3OUNB 4F7JA 2R3QA 1H1PA 3UVQA 1H0WA 2ZV7A 3AOXA 3I5ZA 4LRMA 3TNHA 5CEKA 3O2MA 3GOPA 3SV0A 3GU5A 5F95A 3R71A 3TZ8A 4CT2A 1CTPE 3O17A 5KKRB 3QTWA 3EZVA 4FMQA 4D4YA 1SMHA 3Q6UA 4XP2A 3I0QA 4ZTLA 4AN3A 4DGGA 3FI8A 4KIOA 2X0GA 3LFDA 2E9OA 3R00A 2IZSA 2FSLX 4IAYA 2BILB 4RIYB 4GJ2A 4F9CA 3EL7A 3MI9A 4ZOGA 1JLUE 2OIQA 2W1CA 1G5SA 5D9HA 4HYSA 5CZHA 4AFJA 5A4TA 2UUEA 3Q9WA 3R1SA 4MD8E 4AOJA 2R64A 4FEXA 5CSVA 5BMSA 3R9RA 2PMNX 5AAGA 3MESA 2ETKA 2GHMA 3POOA 4IWOA 2PVMA 2WQMA 4IH8A 3CCNA 4GYIA 4RWLA 3P79A 4OAVB 2XK4A 3QCXA 5M55A 4TY1A 2OH0E 2G2IA 2OIDA 2OLCA 2QR7A 3RVGA 4BBMA 2IN6A 2ITVA 2QU5A 2VZ6A 3HV6A 5JGAA 3R28A 3GCQA 5I9XA 3TZ7A 1PXNA 4RJ7A 5IQIA 5DR2A 1Z57A 4I23A 3R22A 4AZTA 2KULA 4X0MA 2IWIA 1OIUA 2X8EA 1M14A 4FX3A 3FZRA 5LVLA 3O96A 4RQVA 4EHGA 4F1TA 1Y6BA 2JBOA 5ETAA 4KBCA 3RK9A 5K9IA 4FA2A 2R3NA 3H30A 3LOKA 3TNQB 4A06A 4XBRA 2QO2A 3F66A 4GV1A 5E8VA 1IAJA 2JKMA 2ZOQA 1WBNA 2BMCA 5AADA 2HK5A 4F4PA 3NYOA 4UWBA 3BU3A 1WVWA 4F08A 2VTJA 1H1QA 3MH3A 2NP8A 4OTRA 4CFXA 4JRVA 5M44A 2XKEA 4EH6A 4USEA 3A4PA 5E92A 2VO6A 3GB2A 4ZP5A 5M06A 4MVFA 1H25A 3DPKA 1DM2A 5IDNA 3G9NA 4E93A 3P7AA 2BDWA 4QP7A 2J5EA 4MBJA 2PUNA 1JBPE 4E6AA 4RRVA 2QG7A 3CPBA 4QPSA 4Y72A 4UBAA 3LFBA 3B2TA 3RMFA 3I0OA 4QYHA 4BI2A 2R3IA 3V5LA 3W8QA 3G51A 4BB4A 2YWVA 4LL0A 4GMYA 3NLBA 4TZRA 4YMJA 4X2NA 1JSVA 3V8TA 5FEQA 3BLQA 5AR7A 5J9YA 1XKKA 4R77A 3EIDA 4YPSA 3NYXA 3QC4A 4KB8A 4WOVA 3I7CA 2VWBA 3K3JA 3UZRA 3ORXA 2WIPA 2GFCA 2BR1A 3K54A 3ZRKA 5GZ8A 4FEUA 5LWMA 2HWPA 4FZDB 5FG8A 2WEIA 5ACKA 5D7AA 1WZYA 3NIZA 5AEPA 2W96B 3VUHA 3TZ9A 4FSWA 5ACBC 4FT9A 3DJ5A 4MEDA 2BVAA 5E9EA 1W8CA 2WQEA 3R7IA 2C3JA 4FTCA 3PPJA 3PWDA 4RG0A 3FLWA 4D4VA 1KOAA 3VS1A 4EZ5A 3BHUA 5D12A 4D2WA 4D1SA 5I9YA 3QWKA 3CGOA 4WUNA 4D4SA 4DFXE 4FZFB 3GUBA 3QCQA 3MVMA 4LMNA 4WA9A 3B8QA 4EH7A 2W17A 5HBJA 2UW3A 3D2IA 2B52A 3R0TA 2ZDTA 3VS7A 4N57A 5M4UA 4RSSA 2Y0AA 5EM5A 2Z7SA 3S00A 4B7TA 4NZWB 3R1NA 5EQPA 3FZOA 2PY3A 5EDRA 3WILA 3VWAA 2PHKA 3OBGA 3C4WA 4AW5A 4V01A 5CYIA 3V04A 5IQBA 5DHJA 2VX3A 2VWWA 3QAME 3EFWA 3D83A 3ULIA 4IC8A 4QQCA 4TPTA 3BU5A 4UMUA 3HAVA 4AW2A 5EI6A 5FGKA 4UMPA 4HPTE 3OP5A 3Q9ZA 4NSTA 3K5VA 5CNOA 3GU8A 2WPAA 1J7UA 4GU6A 1MP8A 1F3MC 4O2PA 4XG6A 1J3HA 1YXTA 4O1OA 4B0GA 4YJQA 3C1XA 2ZV2A 3W55A 4DFLA 1TQPA 2C5VA 2XCKA 4PPBA 4JJRA 4PP9A 1IR3A 5HQ0A 3WYXA 1H1RA 3QRIA 4FK6A 3MDYA 1JKSA 1P4OA 2WTJA 4IVDA 3PPZA 3COIA 1YWVA 4DH8A 1W7HA 1JQHA 1OKVA 1PXJA 4MYGA 1ZLTA 3P7CA 2UW6A 2XKCA 3BCEA 5EYCA 3UZPA 5L2IA 4FKQA 5IA0A 4GKIA 2X7GA 3VS2A 1ZOGA 4AN9A 1ZARA 2W1IA 3ANQA 4NYEA 2QR8A 3IO7A 3QD0A 5J1WA 2WMAA 4RC3A 3GXLA 2JDRA 4W4XA 4QMOA 4FKOA 4EH9A 2QKWB 1GOLA 2BFYA 4Z9LA 4L6QA 2QLQA 3MSSA 5HX8A 5IU2A 4ANLA 5DYJA 2RSVA 5AA9A 4QTCA 5DT3A 3VBTA 5DEYA 4FZAB 5CEIA 3Q2MA 4C58A 4E6QA 5CAVA 3PYYA 3KXMA 4FIHA 1GZNA 1MUOA 3PJ8A 4KWPA 1A9UA 2IW8A 5AUUA 3IPHA 1KV2A 4L3PA 3T3VA 1NXKA 4D2VA 2Y9QA 4IFCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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