The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
217
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structure length |
217
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Chain Sequence |
TQRTFPGCTIRNTPSEPIHCIVWAKYLFNQLFGEEDADQEVSPDRADPEAAWEPTEAEARARASNEDGDIKRISTKEWAKSTGYDPVKLFTKLFKDDIRYLLTMDKLWRKRKPPVPLDWAEVQSQGEETNASDQQNEPQLGLKDQQVLDVKSYARLFSKSIETLRVHLAEKGDGAELIWDKDDPSAMDFVTSAANLRMHIFSMNMKSRFDIKSMAGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| molecule keywords |
SUMO-activating enzyme subunit 2
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| publication title |
The intrinsic affinity between E2 and the Cys domain of E1 in ubiquitin-like modifications.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
62
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| structure length |
217
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| sequence length |
217
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| ec nomenclature |
ec
6.3.2.-: |
| pdb deposition date | 2007-05-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Ubiquitin activating enzymes (Uba3). Chain: B, domain 2 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1R4M B; 1TT5 B; 2NVU B; 3DBL B; 1R4N B; 1Y8Q B; 3DBR B; 3DBH B; 2PX9 A; 3GZN B; 3KYD B; 1Y8R B; 1YOV B; 3KYC B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ROU A; 3L2R A; 1BR2 A; 2K5C A; 3HJE A; 4XID A; 1HDP A; 2IA2 A; 2XF5 A; 5L3B A; 3BZ6 A; 3S2D J; 3LSP A; 2E36 A; 2RNJ A; 3H9J A; 3A03 A; 3E7L A; 5J8F A; 1T0F C; 3E3V A; 4O3M A; 2EFP A; 1P2F A; 2KJC A; 3M8E A; 1HC8 A; 1VQ8 I; 4H0E A; 2XVC A; 2EBI A; 1PYV A; 5EYR A; 2MH2 A; 2UXN A; 1T56 A; 3L2C A; 1P9Q C; 3V8K A; 2HR3 A; 3K4C A; 3CDH A; 2A68 F; 1JUM A; 2CV1 A; 1RR7 A; 4QSH A; 4BL0 B; 4L9J A; 2LBF A; 3OR1 C; 4KYW A; 2VKD A; 2R3S A; 3KET A; 3KYD B; 5K7F A; 1R7J A; 3LA2 A; 2NVX J; 3TO9 A; 1MZB A; 2EIL H; 3I3L A; 2RRE A; 3ZQC A; 2L7K A; 2DOD A; 4MO7 A; 2V9P A; 4PJM A; 3L2Q A; 1T98 A; 1MBE A; 3LNQ A; 1UCR A; 3LAJ A; 2PBI A; 1W7P D; 2K85 A; 4M71 A; 2DYR H; 1F9N A; 3SJM A; 2CU7 A; 3FX3 A; 1G3T A; 2TRT A; 2BBY A; 2GIZ A; 3KFW X; 3K1N A; 1U9N A; 2DBB A; 2Y31 A; 2XAJ A; 4XRM A; 1FLI A; 4B44 A; 1XDU A; 1U5T B; 4LLG F; 5JFR A; 3ZCO A; 3SQN A; 2F4O B; 2NVT J; 1ITY A; 5F1R A; 1SD7 A; 1Y0N A; 5IOY A; 1UHM A; 2YSR A; 4YRV A; 3HHH A; 4O5V A; 2HWV A; 2L4A A; 2M8E A; 2F2E A; 3E5X A; 3HYI A; 4CCO A; 1E0E A; 3KEQ A; 3ZQI A; 1MH3 A; 3ONQ A; 3EYI A; 2VON A; 1TNT A; 2DQL A; 3U1D A; 2LKP A; 4LFU A; 1G3Y A; 1REP C; 4XQF A; 2IP2 A; 5TJJ A; 1FP1 D; 1P7J A; 3D5S C; 4UUS A; 3GFM A; 2Y0S A; 3KP3 A; 2BV6 A; 2RGV A; 1FMW A; 5DUI A; 5D6F A; 2K9S A; 4YEL A; 2M4G A; 3IWF A; 1I6H J; 2L4M A; 4E4H A; 3ZPL A; 2Q8K A; 3KX2 A; 3BTC A; 2XGE A; 1O3T A; 1JUP A; 4AUX A; 2DMP A; 2FSW A; 1BI1 A; 3LSK A; 4HPQ A; 2MD5 A; 2DA2 A; 2HTJ A; 5LEK A; 2UXX A; 2IGO A; 1MNE A; 3U9G A; 2BY2 A; 1TWG J; 2RAE A; 1FT9 A; 1GXP A; 1BI2 A; 2ZME C; 4ENN A; 4LD5 A; 1ZG5 A; 1VQO I; 2MW8 A; 1GDT A; 3PNT A; 1IN5 A; 3U21 A; 2D45 A; 3ULQ B; 3OYE A; 1PDN C; 2DXI A; 4PK4 A; 3C2B A; 1XGS A; 2DTZ A; 1TWF J; 3WU0 A; 3Q5F A; 5E3L A; 3I5U A; 1X2M A; 5LLQ A; 3AFH A; 4R8H A; 3FXU A; 2PX9 A; 1X3W B; 4PJ0 C; 3LQQ A; 1LKX A; 3TBI A; 3H35 A; 4LMY A; 1ON1 A; 1EKE A; 4DZP A; 3WG9 A; 3V7S A; 1TWC J; 3BTL A; 2Y9Y A; 2ZXI A; 2L9S A; 2PMZ N; 4MFE A; 1N78 A; 3H1C A; 4R79 A; 2GXB A; 4XR6 A; 4HNT A; 1YTY A; 1P4A A; 1Y0U A; 2AO9 A; 3WTW C; 2DQR A; 4XOP A; 2QM3 A; 3SZT A; 5K5Q A; 1X3Z B; 2E1N A; 3BCA A; 1ERD A; 4LJZ F; 4B09 A; 2X0L A; 3K4B A; 2O3F A; 2H27 A; 1NHA A; 1X4P A; 3PUF A; 3S93 A; 1EJ9 A; 5HNF A; 2R7V A; 1KQ8 A; 2JZY A; 2X48 A; 2CFO A; 1JGS A; 1GHC A; 3K4N A; 3HSR A; 2XGC A; 1ZYR F; 1Y1W J; 2XUB A; 2V1D A; 1ZRC A; 5CVV A; 1GT0 C; 4OAY A; 4HX4 A; 2VBZ A; 3SEQ A; 1SAN A; 2ME0 A; 3P9C A; 1VQ9 I; 4BY1 J; 2ZXW H; 1BOA A; 4JBA A; 1J7K A; 2PEX A; 3FXQ A; 5J6X A; 1HKS A; 4KMF A; 1X4O A; 4CCK A; 2DW4 A; 3BPX A; 1XN7 A; 1LJ9 A; 3DF8 A; 4NC8 A; 4CA0 A; 3E5U A; 4BHC A; 1ZH5 A; 2JA7 J; 3LA3 A; 1MMS A; 1ZQ3 P; 3I53 A; 4B1R A; 4Y52 J; 1UG2 A; 3R0J A; 4BEH B; 2R92 J; 4J01 A; 3ZR8 X; 3GCM A; 5BOX A; 1WZ2 A; 1WKM A; 4LOC A; 3PFI A; 2V6C A; 2GQQ A; 2XAF A; 3HIF A; 1YLF A; 1HST A; 1KU7 A; 1Z67 A; 2LRE A; 3RYR A; 3KLN A; 4MEY F; 3IHU A; 2V9V A; 4XN0 A; 1OLT A; 3I55 I; 5F0C A; 3BWG A; 2MLG A; 2KPM A; 3GXO A; 3DEU A; 4D5F A; 2QSG X; 3VPR A; 3CUQ C; 3GF2 A; 2EFO A; 2NOG A; 3IAM 2; 4BQA A; 1LDD A; 5FRM A; 3IH2 A; 3KP2 A; 2PJR A; 3RKY A; 3C3W A; 3C18 A; 1IF1 A; 2VBW A; 1TNS A; 1O3Q A; 4FE7 A; 2HQ5 A; 2ADU A; 1FNN A; 5J4V A; 3HOX J; 3F8F A; 1IUY A; 2L9R A; 4WF2 A; 3QOD A; 1MBF A; 4CUG A; 3HOZ J; 2VJI A; 5J8C A; 2V26 A; 2E5Z A; 4U7D A; 2CYY A; 3K4M A; 2DFF A; 4A6D A; 1YI2 I; 3IC7 A; 4HAM A; 3ASO H; 3WU2 C; 5C4J J; 1PUF B; 3FBI B; 2E60 A; 2GA2 A; 2LF8 A; 1YYV A; 4IO9 F; 4BQQ A; 5F1J A; 4UUS B; 1V5E A; 4Y15 A; 3DBR B; 2WAD A; 3VYU B; 4PGG A; 2WA0 A; 3IUO A; 4XRS G; 3DBL B; 2P81 A; 1I6X A; 4RB1 A; 1P7I A; 2FBH A; 2HOA A; 1ETQ A; 1WPK A; 3DWL E; 3BJA A; 4HYE A; 1KQ0 A; 1SFE A; 4G7O F; 4ZZL A; 5IOZ A; 3AKZ A; 3OS1 A; 2VPR A; 2XAU A; 4XLN F; 2I5U A; 2NVQ J; 1X58 A; 2HKX A; 2W48 A; 3QWL A; 1SFU A; 2P7C B; 4G9Y A; 5FRN A; 4IHW A; 2WB1 A; 2HKO A; 1HW2 A; 1K6Y A; 2P0W A; 4M9X A; 1Z21 A; 4ZYD A; 3SXY A; 4IPA A; 3I4P A; 5J4Y A; 1SC7 A; 3I64 A; 3J7Y J; 1R4M B; 2NNN A; 2JN6 A; 1RIO H; 2R7Z J; 3NQO A; 4IJA A; 1ONV A; 2ICW G; 2LVS A; 4YFX F; 1KON A; 1L3L A; 4ZTF A; 3OYG A; 1WCM J; 2F5D A; 3V7C A; 2MC3 A; 2LH9 A; 2ZFW A; 2X6Y A; 4UXN A; 2V6E A; 3FXM A; 2R7S A; 1U2W A; 4N9H A; 2BZT A; 1MW7 A; 3KZZ A; 4A0X A; 4MTD A; 2CJJ A; 2HGC A; 1Z1D A; 2H6C A; 5FB2 A; 3ERE D; 1DGW Y; 1GVJ A; 3OV8 A; 4JOM A; 2P4W A; 3ABM H; 3EDP A; 5HS9 A; 2CFX A; 5F64 A; 4FHT A; 2X1D A; 3D1N I; 2P7V B; 5CLS A; 2W7N A; 3B02 A; 4HG2 A; 4L9T A; 2B7E A; 1AU7 A; 1KYW A; 2E7X A; 1Y8R B; 3WHB A; 2CUJ A; 2V4J C; 3CCU I; 2ELH A; 1MSE C; 3E6B A; 4E7H A; 2CV2 A; 3MKL A; 1KA8 A; 3VB2 A; 2KRC A; 3R60 A; 4BGD A; 4D0P A; 5K7H A; 2DK5 A; 1ETX A; 5FLM J; 4Y17 A; 1ZGW A; 2FNA A; 1B9N A; 4WXD A; 5LHI A; 4CXF A; 3ML6 A; 3K70 C; 4E7K A; 2VT3 A; 3Q0W A; 2YR2 A; 3FDY A; 2M87 A; 1T08 B; 2QWW A; 3FM5 A; 3H5N A; 2O7O A; 3IL2 A; 3FMS A; 4F52 A; 3K9T A; 4B3A A; 3BDD A; 3I54 A; 4EGY A; 3I9V 2; 3H9G A; 2MFZ A; 3PNV A; 2LY2 A; 5HLI A; 3M07 A; 2GBY A; 3ZMD A; 1T95 A; 2HFH A; 1RR8 C; 3CF5 F; 4G7H F; 2EZL A; 2LD5 A; 2OAZ A; 3H3Z A; 1BI3 A; 1GUU A; 2MSY A; 3HXL A; 3S8P A; 1YRN B; 4IQ4 A; 1WVR A; 3P5J A; 4M3D A; 2XHK A; 1PP8 F; 3HSE A; 2RNG A; 4IRH A; 3JRD A; 4JQF A; 4EJV A; 3VEP A; 1SVO A; 1STZ A; 2VQG A; 3LFU A; 3UNG C; 5H2F C; 2PJR B; 3CDI A; 4BYY A; 3BY6 A; 4XK4 A; 2M1B A; 4EM0 B; 2COM A; 3K4J A; 4E7I A; 3H0D A; 1HF0 A; 2X6X A; 4RAG A; 3WG7 H; 4ZTJ A; 1O3S A; 4ZDO A; 1J09 A; 1VF9 A; 1Z3Y A; 2KKO A; 5KAF C; 5F08 A; 1XD7 A; 3DPT A; 3RKX A; 1BW5 A; 3EUH C; 2VI6 A; 3HG9 A; 3IV5 A; 4CZZ A; 3W2A A; 1XMX A; 3FIS A; 4PJJ A; 3A1Y A; 5GP9 A; 1DU6 A; 2R7U A; 2JVH A; 4I09 A; 3CCS I; 1IV6 A; 4QWQ A; 1FBS A; 3LMM A; 3UR3 C; 3V42 A; 3HUG B; 3HOS A; 4NC6 A; 2Z5U A; 2B0L A; 4EV0 A; 2CSO A; 1VQK I; 3WTX C; 3EQL F; 4KDP A; 4YG2 F; 2P6S A; 2STW A; 1S7O A; 4QTR A; 1OCC H; 1R00 A; 4DIQ A; 1DPR A; 1ON2 A; 1ZR2 A; 1DUX C; 4CCM A; 5LD2 C; 2L54 A; 4PDK A; 4GXO A; 2ELJ A; 1SD6 A; 2WBM A; 3EET A; 4AU7 A; 3GLX A; 3MZH A; 2F5V A; 3V7R A; 5JI6 A; 3E5Q A; 4HQM A; 4CIC A; 1AWC A; 4FAS D; 3HOV J; 1S3J A; 1R58 A; 1SVM A; 4ZDL A; 3RKW A; 1UZC A; 2EQR A; 3T8T A; 2FUG 2; 2K3F A; 4M3G A; 3OYI A; 2A3S A; 2CQ7 A; 2XDV A; 3GFJ A; 3PSF A; 1FX7 A; 5IPA A; 4XL9 A; 2LG4 A; 3G1O A; 4NC7 A; 4DYC A; 5B3S H; 2W25 A; 2EV5 A; 2BVL A; 4FE4 A; 3D5L A; 5LRR A; 1MIJ A; 3CCL I; 1VQP I; 3L00 A; 1SFK A; 2L9V A; 1XG1 A; 4PFP A; 2D2W A; 4HEA 2; 1VZ0 A; 2W1O A; 3H3U A; 3H0G J; 2DPD A; 3ZQG A; 2MC4 A; 3QAH A; 2X51 A; 4BUP A; 2DPU A; 5EGO A; 2K02 A; 3JRF A; 3RSN A; 1MBH A; 2V1X A; 3ECO A; 1XPX A; 1X2N A; 1YO5 C; 1RPW A; 1HA8 A; 2M5W A; 4KIS A; 1F4K A; 2AXL A; 1EF4 A; 3S2W A; 3SFZ A; 1FSE A; 1FY7 A; 5LGT A; 4L18 B; 1W4M A; 1D1B A; 4I76 A; 4QIW N; 3OYF A; 2E19 A; 3KP7 A; 2VBY A; 5E1Z B; 4OIQ F; 4BE0 A; 2K4B A; 2K4J A; 5LHH A; 1IRG A; 2K3P A; 4J00 A; 2PMZ A; 1MJ9 A; 1WJD A; 2LK2 A; 2UZK A; 2LP0 A; 1VQ6 I; 2NS0 A; 2E1M B; 4QPQ A; 5LRS A; 4J19 A; 4DYQ A; 2KIM A; 2Q2E A; 3BP8 A; 1ZR4 A; 5CYV A; 5H20 A; 2IS2 A; 1WH5 A; 3FIW A; 3LST A; 1YIT I; 4HF2 A; 3BR0 A; 1MBG A; 2DT6 A; 1T0F A; 3CO6 C; 4ZH4 F; 1V55 H; 2D1V A; 2AXT C; 4P9F A; 5M5X J; 3HEF A; 3F72 A; 1VQL I; 4C3H J; 3FKI J; 4IRI A; 2QEX I; 3Q0U A; 4I01 A; 3JRC A; 1HCR A; 2MLK A; 2VC1 A; 1K4T A; 2HDD A; 4B8X A; 3B6C A; 2NOJ B; 4IF4 A; 4E70 A; 1V3F A; 1S6L A; 2WAQ N; 4Z6Y A; 1JHH A; 3H36 A; 2ID6 A; 3HC7 A; 4HOB A; 2CW8 A; 1FIA A; 1WWX A; 5E1X A; 2LY9 A; 4RM2 A; 1D8K A; 3VYR B; 3COA C; 1M1E B; 3W6J B; 3OOU A; 1HQC A; 4RAZ A; 5E3N A; 4KA4 A; 3OYK A; 3V8J A; 4ZZD A; 4A3G J; 2P6T A; 4UVB A; 1SMY F; 5ICE A; 2JRM A; 1J5Y A; 1HKT A; 1F36 A; 4M74 A; 3KE2 A; 1E3H A; 3SEZ A; 2XRO A; 1WI3 A; 3RIR A; 2M4K A; 2XAH A; 1WJB A; 4BXX J; 5GAD J; 3KYC B; 2NRA C; 4BJT A; 3ZMS A; 2JA5 J; 3H5R A; 3PFY A; 4G94 A; 1DP7 P; 2JT1 A; 4BDY A; 1BIB A; 2CUZ A; 3RCO A; 2Z2S B; 2VB6 A; 2JSC A; 3W2V A; 2EA4 A; 2NS7 A; 4RB2 C; 1JKQ C; 1J75 A; 5GPA A; 1R5G A; 1D0Y A; 5FGM A; 2EIN H; 2DOF A; 1J9I A; 5BS6 A; 5C3E J; 1T8I A; 2QQ9 A; 4MLO A; 4EVI A; 2HVS A; 2N8G A; 5CVJ A; 4NQW A; 1K4S A; 1HW5 A; 1BN5 A; 2M2E A; 1Z6R A; 5AIQ A; 4PGH A; 5GAH J; 1ZRE A; 1D1A A; 2HQN A; 2XKP A; 4U0Y A; 2XPU A; 3DTK A; 4P1W A; 5D6E A; 3S14 J; 3VYS B; 4G8X A; 3R6S A; 2V79 A; 2R5Z A; 1LDK B; 2YS9 A; 3L7W A; 4AD9 A; 3H9Q A; 1XB4 A; 4KIC A; 3OR2 C; 1I3A A; 3A02 A; 4LG0 B; 4OIO F; 4DBR A; 4PUS A; 4A3B J; 4A5N A; 4Y4R A; 4RBO A; 4FTH A; 2JTV A; 2DMT A; 1ZEL A; 1LE8 A; 3S17 J; 4I2O A; 2ZME A; 2GLO A; 3NWT A; 3BJO A; 3FBN B; 1ZAO A; 4ESF A; 3EUA A; 5FKN A; 1L0O C; 3M4O J; 5DCF A; 2LFB A; 1JI8 A; 1WQ2 A; 1VQN I; 1DGR M; 4V2F A; 3L2V A; 2QSH X; 3CF2 A; 2Y30 A; 3F23 A; 1BI0 A; 2CMP A; 2KRH A; 2IXS A; 4BBR J; 3ZQF A; 4M6X A; 3PO2 J; 2OZ6 A; 2CO5 A; 4UNO A; 4XLP F; 4F55 A; 1ZGJ A; 5EDN A; 2F48 A; 3OSF A; 4BNC A; 2F5F A; 3K2A A; 1UFM A; 2EB7 A; 2Y75 A; 2DA7 A; 4XKW A; 2WV1 A; 4LG3 A; 1FSH A; 1O7L A; 3PQK A; 1OCR H; 2VE8 A; 4BY7 J; 1FJL A; 2KL4 A; 2PI0 A; 2R0Q C; 2Z1D A; 4W1U A; 3K7A J; 4FQG A; 3DKY A; 3KPH A; 4MQ9 F; 3PSI A; 1PJR A; 5M3M J; 4CHU A; 2W4S A; 3V4G A; 3DBH B; 4X0G A; 2EIK H; 2FU4 A; 1Z7U A; 4ESB A; 1TL8 A; 2MH9 A; 1OYY A; 3KEO A; 4L9V A; 2EFW A; 1SAX A; 4LLN A; 2WTE A; 3WOD F; 2HXO A; 3BG7 A; 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