2Q0RA

Structure of pectenotoxin-2 bound to actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
ALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
publication title A structural basis for regulation of actin polymerization by pectenotoxins.
pubmed doi rcsb
total genus 122
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q0rA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q0rA03
3MCPA 2HMPA 1MDUB 1DGKN 4JD2B 4E1JA 5E84A 5AQOA 1QZ6A 5ADXA 2Q1NA 2IIRA 2CH5A 4BC3A 4YDUC 1KAYA 1BWFO 4BRHA 5BRFA 3EL2A 2P9UB 5JLHA 1S3XA 3VPZA 1U2VA 1GLLO 1DKGD 3VF6A 3VEVA 2IVOA 4FPAA 3L0QA 2QWRA 4BVPA 1ZC6A 4BGBA 1BO5O 4JNEA 1BOTO 3DXKA 4MO4A 1ATNA 3VESA 3P4IA 5AZJA 2E20A 4CZIA 3MN6A 5AQVA 4IO8A 5BRHA 2CGLA 5AFUA 2FSKA 4WQ5A 3A8YA 1YXQA 3UKUB 4IZ9A 2GWKA 3WQUA 3DXMA 5AQMA 4J8FA 1QQOA 3FLCO 4QS7A 3WT0A 2GEMA 3W0LA 1U6ZA 2J4RA 3H46O 4PL8A 3VEXA 5KPTA 2A41A 4PKGA 2P9KA 3LM9A 5AQNA 2Q0RA 3ZEUA 1TYQA 2YHXA 3EO3A 3QDKA 3SK3A 5FPEA 4H5TA 4BRQA 2PAVA 3QMLA 2OANA 4GY2B 2A3ZA 2AP1A 4BC5A 5AQXA 1JCGA 4DB3A 3VGKA 4JD2A 1BUPA 4FWOA 3VOVA 5FPDA 1XQSC 3IUCA 4H5WA 4H0PA 4BR4A 4CZHA 4BRMA 1U2VB 2FSJA 2CGJA 4RWTA 2P9UA 2ZF5O 2ASPA 3VETA 1BDGA 2Q31A 2E2PA 5AR0A 3DXKB 3D7EO 1BA0A 3MK6A 4A62A 4CBUA 3MN9A 2H3GX 3CQXA 4BRIA 3D2FB 3VENA 1X3MA 4CZEA 1NLVA 2UYTA 3SLCA 3UKRA 3O8MA 3BP8A 1ATRA 1XC3A 1EQYA 4ISGA 1IJJA 4BRDA 4CZKA 3D2EB 3SJHA 5AZIA 4BRNA 1HKGA 3CQYA 1RGIA 3H1VX 3UKUA 4NO7A 2I7NA 5AQYA 2YJEA 1NGJA 4BVOA 1HX1A 4BRKA 2FF6A 2F9TA 4FOIA 3HTVA 1BU6O 1HKCA 1XUPO 3HI0A 3WQTA 3GL1A 4YDUA 1TYQB 1YUWA 1S22A 2D0PA 2ZGZA 4EAHD 3CJAA 4EFHA 4BG9A 2E1YA 2BTFA 1NGCA 4BR9A 1HJOA 4BR2A 1GLFO 3U4LA 4BC2A 3EKSA 4H0VB 3VEWA 4I6MA 2QWPA 4EHTA 4CD3A 4PKIA 2AA4A 3FZLA 1Z05A 3B8AX 2P9NB 2A40A 3A5NC 2YHYA 3GOIA 4IXCA 5AQTA 2P9LA 3FR0A 3J8AA 4BRAA 2E2QA 4BR7A 4CD1A 2VWBA 1DEJA 3DJCA 4B1XB 1NGGA 5FPMA 2Q36A 5JICA 5AQIA 1MA9B 5EOYA 1GLBG 3H1QA 3HBTA 3BF3A 3I8BA 3SMPA 5BREA 3LL3A 5BPLA 5AQRA 2Q97A 3UKRB 4QS8A 1H1VA 3D2FA 4CBXA 5TKYA 4BRGA 3R6MA 2P9SA 1QZ5A 4K25A 4F9OA 1T44A 5AQZA 5AZIB 1MWKA 5BRDA 3CHWA 4H0XB 1IG8A 3D2EA 5KPRA 3ATVA 4BR5A 4CBWA 1E4FT 4DCHA 1NBWA 3KVGA 2QWLA 3O6WA 1Q18A 2FLOA 2EWSA 3VEZA 3A5MC 4FWSA 4GNIA 3U9DA 3WXIA 1NGFA 2ZGYA 3QICA 3QB0A 4K42A 2E1ZA 3ENOA 3O4WA 5F1XA 2HF3A 3FZFA 1SAZA 2YHWA 1V4SA 5LY3A 2P9IA 4FWRA 2KHOA 3ENHA 1BA1A 1WUAA 3CJCA 2NRHA 3VEYA 4I6MB 1G99A 3VGMA 2QWQA 3AAPA 1HUXA 3MN5A 2D1KA 5BPMA 2FSNA 2W40A 1NGDA 3WXLA 1T6CA 4CZLA 1NGHA 2BUPA 3CJBA 1NGAA 3M3ZA 2P9LB 4BG8A 3ZX2A 2P9NA 3GE1A 3G25A 5B8HA 3HZ6A 3WUHA 2HOEA 4H0YB 2QWMA 3I33A 2F9WA 3JXUA 3LDNA 5EX5A 3CETA 1ESVA 5F2RA 4MLEA 5ELZA 1RDWX 4MO5A 4A2BA 3BUZB 2P9PA 2P9SB 3WEEA 3MDQA 3UE5A 3VGLA 4DHYA 3CIPA 4B1WB 3FE1A 1GLCG 4FL9A 1JCEA 3CJ7A 3ZX3A 4Y0WA 2Q0UA 4O5FA 3WXKA 4EHUA 1NM1A 2QWOA 5BN9A 1CZAN 4WQ4C 5KPZA 3WXJA 3IMXA 3HSCA 3LM2A 3O5BA 4IJNA 1K8KA 4EIAA 5FPNA 4QS9A 1KXPA 2WUSA 4FWMA 2FF3B 2E8AA 2ZWHA 4RCHA 4PKHA 3ZETB 1NGEA 4JN4A 1YAGA 2P9IB 1Y64A 3AY9A 3AAQA 3ID8A 4CZGA 3CI5A 2D4WA 2NLXA 4ISFA 4HWIA 2E88A 1NGIA 1E4GT 2DPNA 4XH5A 2QW9A 5BN8A 4FOEA 3S41A 5F0XA 4HTLA 3VERA 5JMVA 4FWQA 4CI6A 3U8XA 3EKUA 3ULEA 1OKJA 2QWNA 3FFKB 5AQWA 5AQGA 4BRPA 4CJ7A 3ATUA 3RSEA 3MMVA 4FPBA 5JLFA 2QM1A 2V51B 5LJWA 1JCFA 1NMDA 2P9PB 3DWLA 1HPMA 2FXUA 3WEEB 3BF1A 3IFRA 3O1WA 4H03B 4AM7A 3H3NO 4K43A 1GLAG 5AQJA 2NZTA 3CJ9A 1HKBA 4JHDA 1LCUA 5AQKA 4ISEA 4BQZA 2GUPA 3TU5A 4IJAA 3W3DA 3O08A 4XH4A 1D4XA 3HM8A 1K8KB 4IWVA 4DQ8A 3A5LC 3JS6A 3R9PA 1C0GA 4JAXA 5LJVA 3QBXA 1GLEG 5EXWA 1TUUA 4A2AA 4B1ZA 2D0OA 3O1BA 4XEIA 2ASOA 4KBOA 3ZETA 4B1UB 4LC9B 1NWKA 2ASMA 1LOTB 3M1FA 1MWMA 5ADXH 5BR9A 3VEOA 2A5XA 1QQMA 4CZJA 2GELA 4FWPA 1KAZA 2CH6A 4BROA 1HLUA 2PBDA 3GG4A 3U9ZA 4H0OA 1ZBSA 1C0FA 4H5VA 1SQKA 3MN7A 4BR0A 3C7NB 2CGKA 3ULEB 4WQ5C 3QBWA 1WOQA 2YJFA 3CERA 5EY4A 4FWLA 5KQDA 1GLJO 2ITMA 3VF2A 1V4TA 5CE3A 2I7PA 4RTFD 1BG3A 3RSEB 2E2NA 2VYPA 4K41A 4L3QA 1X9JA 4WQ4A 1P8ZA 5AFUH 3OHRA 4AM6A 3LDPA 2V52B 3GDQA 1J6ZA 2GTDA 2VCPA 5BPNA 3H3OB 3KHYA 5AQPA 3M6GA 4MLHA 4B1VA 3GBTA 1KAXA 3FZMA 2IVNA 3FGUA 1X3NA 4JHDB 4NB4A 5AQUA 4FSVA 2YI1A 3H6EA 2A6AA 5I9EB 1QHAA 3DAWA 3IDHA 1T6DA 4BGAA 4CZFA 1ZXOA 5AQHA 4B1YB 4BQLA 1TUYA 5AQQA 3C0BA 3F9MA 3O80A 2W41A 5AZJB 3ZX0A 2E2OA 1SZ2A 4B9QA 3UB5A 3EN9A 4H0TB 3FZKA 4XH1A 4CZMA 1GLDG 4BRLA 3AARA 4M63C 5AQLA 4M7YA 1NGBA 3R8EA 1ATSA 1QQNA 3EZWA 2V7YA 4FWNA 3DXMB 3LDQA 2IVPA 4H5NA 4PL7A 3LDLA 5AQFA 3L4IA 3QFUA 4BRFA 3QFPA 4BRCA 4WYBA 2QXLA 4O8KA 4M7XA 5EVZA 5AQSA 5E26A 2Q2RA 5KQ8A 1RFQA 2P9KB 4FO0A 3CJ1A 4BREA 3SMSA 3ZEUB 3LDOA 3A0IX 2HF4A 2YCHA 3A5OC 3C7NA 3KZBA 4Z94A 3VF4A 2GWJA 4FWKA 4BC4A 4C23A 3H45C 2A42A 1R59O 3TPQA 1Z6RA 3BEXA 3FZHA 2V7ZA 4H5RA 4A61A 3L6QA 1YVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MCPA 4H4OA 4E7LA 2HMPA 4DR1K 1C0UA 1MDUB 4BE7B 3AVCA 5E84A 4JK8A 1Y97A 2G8WA 4YFUA 3KTQA 3CD6N 1KAYA 4DV1K 4O8UA 3C6HA 1NK5A 1U2VA 2QK9A 1K73O 3VEVA 2IVOA 4FPAA 4BVPA 4C1NI 3VQ5A 3CG7A 1BO5O 2OPQA 2LSNA 1BQMA 4CGHA 1NK6A 4CZIA 4JI6K 4YORA 1WAJA 3QETA 3Q7BA 4JKAA 3T1HK 4FJ8A 2HB5A 1JXEA 4WQ5A 3PV8A 1JXBA 3A8YA 3UKUB 1HPZA 4IZ9A 4HCCA 1IKXA 3WQUA 3DXMA 2P1JA 4OPJA 3VQ9A 1QQOA 1IG9A 3DYAA 3Q7CA 4KHYA 3EZ5A 3CC4N 3CCUN 2J4RA 3H46O 1HRHA 2GV9A 1VQKN 4A5BA 5JVGL 1VAZA 3MEEA 2YHXA 4Z4FA 3AO4A 3SK3A 3AV9A 4DF4A 3M5RA 4GY2B 3G71N 4PQUA 4Z4HA 5GIOA 1QHTA 4O44A 4FWOA 3VOVA 3S5TA 4LD0A 3IUCA 4H5WA 2VQEK 1VQ5N 4H0PA 3AVGA 1GOAA 4BR4A 2UU9K 1Q81O 2CGJA 2P9UA 2ZF5O 2WBNA 3ZSWA 4JS5A 3VETA 4AHSA 4N76A 4CJTA 3DXKB 2EHGA 1L3VA 1BA0A 3QERA 4Y1CA 3ZSZA 3LDSA 3UKRA 4AF1A 1LW0A 1BI4B 1EQYA 1A5XA 3SJHA 3ZSRA 4BRNA 4CJKA 1HKGA 1RGIA 2RHKA 4NO7A 2I7NA 3HOTA 1FKOA 3AVJA 1WSJA 1S6QA 1HX1A 1WSFA 1XWLA 4FOIA 1HKCA 3SV3A 3PX0A 3GL1A 3CCVN 3KIOA 4EAHD 4F3OA 2Z1HA 5C25A 4B3RK 4CESA 5JS1A 3EKSA 4H0VB 3VEWA 3T1AA 3FZLA 4RG8A 4DFKA 3B8AX 1HYVA 3A5NC 4IXCA 3TWHA 4B8CA 2D0AA 4CE9A 4E7IA 3BGRA 3DJCA 1DEJA 4B1XB 1C1AA 2E4LA 1NK8A 4FXDA 3VMFB 4KHSA 3NDKA 2RF2A 4CF0A 3IRXA 5JICA 5HRNA 2B5JA 1X1PA 3KK7A 3H1QA 3QNOA 5M1FA 5BREA 3WXMB 1HQEA 4CBXA 4BRGA 2JWLA 3MX5A 1N34K 2P9SA 1QZ5A 1ZBIA 4K25A 4DTJA 4A5AA 1XI1A 3MXMA 3QLHA 3D2EA 4BR5A 2YX6A 4CBWA 1E4FT 4DCHA 1W9HA 2QWLA 4DSJA 1GOBA 4FWSA 4GNIA 3U9DA 2ZGYA 4F4KA 3CCLN 2NRRA 5LMNK 3K57A 1L3UA 4CJQA 5F1XA 3U6FA 2O8DB 2OYQA 3V9SA 3FZFA 4GV6A 2P9IA 1BA1A 2KFZA 2O8DA 2X6SA 2DFFA 1TKXA 3AAPA 4LH4A 3TSPA 2YKNA 2ETJA 2W40A 3SAHA 2W6KA 4MDBA 1GOCA 4CZLA 3CJBA 3QESA 1IKYA 2R7YA 4FJJA 3ZX2A 1T8EA 3OYDA 3DM2A 3G25A 5B8HA 2HOEA 2F9WA 4IG3A 4B9TA 1WN7A 3O9SA 5F2RA 4MLEA 5ELZA 4A2BA 1U45A 4CJVA 4KO0A 2KQ2A 3UE5A 3CIPA 3FE1A 3KJVA 4MFBA 4FK2A 1JCEA 3THWA 3SBGA 2Q0UA 3WNEA 2OA8A 1NM1A 4QCLA 4M3UA 2NUBA 1C6VA 1ZBHA 4BE0A 3IMXA 4CEQA 4DSIA 4BE2A 1HNIA 3K59A 5FPNA 4K8ZA 2XY6A 1RT2A 5HROA 4FWMA 4U67L 3ZSOA 4UY8O 2E8AA 3H08A 2RN2A 3NH0A 3CI5A 3OW2M 3CM5A 2D0BA 4LF4K 1KC8O 1NGIA 3V4IA 4O55A 1OVYA 4KHUA 4M42A 4KH6A 3SQ4A 3CCSN 1S1UA 5F0XA 3EEQA 4FWQA 5JS2A 3PO5A 3EKUA 1S1WA 1OKJA 2QWNA 4K0KK 4DV6K 3RSEA 5J1EA 4LF7K 3MMVA 3CFOA 1HQUA 1D9DA 4LF5K 2UXDK 1WNSA 3J7YP 1JCFA 3RR8A 3VQBA 1NNEA 3O4NA 4K43A 2KFNA 4W5NA 5AQJA 4JI2K 3CJ9A 4DR7K 4JHDA 4B3SK 1R0AA 1A5VA 3U3GA 3V9UA 3O08A 1SL1A 1BISA 2NRTA 4IWVA 5GINA 2VQFK 4HTUA 1C0GA 4JLHA 3QBXA 1X9MA 1RTJA 5EXWA 3M8SA 1TUUA 1JLAA 2ITGA 4B1ZA 3M8RA 1KVCA 3O1BA 4BWJA 4XEIA 3CYMA 2ASOA 4IFYA 3ZETA 3O3FA 3AVHA 4CVNE 4GVEA 1LOTB 1S1TA 1MWMA 4F8RA 1LWEA 3VEOA 1RT1A 2GELA 4FWPA 5LMUK 1N5YA 5M1OA 1U47A 4CEFA 4CIFA 4JI1K 4CW7B 3GG4A 5BR8K 3G0ZA 1VQ9N 3AGKA 2QKKA 4FLWA 4B9LA 4X66K 2CGKA 1W7AA 2FBVA 4WQ5C 3QBWA 1SKWA 3AVAA 4JKCA 2GX9A 1FJGK 3ZYYX 2ITMA 3VF2A 4EZ9A 3QEIA 3J7ZO 2DFHA 1X9JA 4WQ4A 5AFUH 4M3XA 3K0SA 3KHYA 1TK8A 3M6GA 3TSUA 4MLHA 2B4JA 1RTHA 3TABA 2YI1A 1HR0K 4YOYA 4JKGB 4CGGA 3CF5L 4KTWA 4LF6K 4FLUA 5E41A 5AQHA 2FBXA 1TUYA 4KFBA 1UOCA 3NF7A 3C0BA 3EY1A 1BIZA 4BDYA 2YNGA 3K9JA 3SAGA 4H4MA 3EN9A 4BRLA 3RR7A 1B9DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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