2Q1NA

Actin dimer cross-linked between residues 41 and 374
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
369
structure length
345
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHLTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
total genus 114
structure length 345
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q1nA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q1nA03
4CZIA 1OKJA 5AQUA 2E2PA 3CQYA 3DXKA 3ENOA 4M7YA 4B1UB 1HKBA 3QB0A 4WQ5C 1XQSC 1HJOA 5AQNA 1BWFO 3CETA 3ZEUA 1ATSA 3GOIA 1NGBA 4FWSA 1Q18A 1XUPO 4B1YB 4A2BA 3HZ6A 4H5TA 3QFUA 4BVOA 1RFQA 2GEMA 3CJCA 2P9LB 4M63C 3SLCA 3MN9A 3VGMA 3M6GA 5AR0A 4MLHA 4MO4A 2Q36A 4JN4A 4ISFA 2FSNA 3J8AA 4RTFD 3BEXA 4RWTA 2YJEA 3UE5A 2VCPA 3ZX0A 3LM9A 2EWSA 2CH5A 3LDOA 3FZFA 2GTDA 1NMDA 1TYQA 2CH6A 1MWKA 4BRMA 4AM6A 2ZWHA 1QQMA 1TUYA 1NBWA 2GWKA 1YUWA 4PL7A 1YAGA 2P9SA 3CJ9A 1XC3A 3VETA 5BRHA 3MCPA 2D4WA 1MDUB 1JCGA 1ATRA 4H0XB 4XH5A 4YDUC 4PL8A 2Q97A 1KXPA 3MN5A 5AZJB 5EX5A 4BRGA 4BVPA 2Q0RA 4FPAA 3A5MC 3F9MA 3I33A 4FL9A 4K41A 2VWBA 3CHWA 3O1WA 5AQHA 3GE1A 1QQOA 4JNEA 4QS8A 2BUPA 4ISGA 5AZIA 3VEOA 4I6MA 4MO5A 2Q2RA 3VF2A 4AM7A 3O6WA 4BRKA 3IUCA 3FFKB 3A8YA 4JD2A 5BRFA 4LC9B 3CQXA 4CD3A 3A5LC 4E1JA 3D2EB 5AQFA 2KHOA 4NO7A 5AQKA 5AQLA 2QWOA 3ZEUB 2IVNA 1H1VA 1LCUA 2OANA 3G25A 3LDLA 4BC5A 3GBTA 2HOEA 1MWMA 5TKYA 4H0YB 5ELZA 3WXKA 5AQWA 2AA4A 3W0LA 3WXJA 5AFUH 1BG3A 4FO0A 3VGLA 3C7NA 4CZJA 3VERA 4DB3A 1IG8A 4PKGA 5AQQA 3ENHA 5I9EB 5AQSA 5F0XA 2P9IB 2GELA 3RSEB 1HUXA 2IVPA 2YI1A 3MDQA 4H5NA 2YHYA 4FSVA 5AQIA 5AQPA 3UKUA 1E4FT 3W3DA 2YCHA 2CGKA 3QICA 4H5VA 4BRHA 5BR9A 1BA0A 5AQXA 3A5OC 2D0OA 5B8HA 3VF4A 4QS9A 5AZJA 2ASOA 2Q0UA 5E26A 1JCFA 2Q1NA 1BA1A 1IJJA 1KAYA 3UB5A 1T6DA 3EKSA 4XH4A 4O5FA 5ADXA 4H0PA 3WXLA 5KQDA 3H1QA 5EOYA 1NGFA 1HKGA 2WUSA 1RGIA 4XH1A 3ZX3A 1WOQA 3HSCA 3WXIA 5AZIB 1S22A 1GLAG 4BRIA 3D2EA 4I6MB 2A41A 4JD2B 2UYTA 4PKIA 5AQVA 4BR5A 4BGAA 1BO5O 3L6QA 3MK6A 3QBXA 4IXCA 4XEIA 2A3ZA 3ULEA 2YHWA 3CERA 4CZKA 2Q31A 4B9QA 1MA9B 1NGAA 4CZEA 2FF3B 4H0TB 3WT0A 2P9IA 4H0VB 5KPRA 3RSEA 3C7NB 3HM8A 1DKGD 1NM1A 1GLFO 3O08A 1ZXOA 3O4WA 4CZGA 3O1BA 2QWPA 5E84A 1DGKN 3VOVA 3R9PA 3ATUA 3WEEB 4HTLA 2F9TA 3I8BA 1X3NA 3UKUB 2QXLA 3EKUA 5AQYA 3ATVA 3CJBA 3P4IA 1ESVA 3UKRB 4NB4A 1QZ5A 2D0PA 2P9PA 4EAHD 1BOTO 3FZHA 1JCEA 3VF6A 4ISEA 5EXWA 4CZFA 4BRAA 2P9NA 4GY2B 1DEJA 4H5WA 1ZBSA 2E2QA 4CD1A 1U6ZA 2ASPA 3SK3A 4L3QA 3JS6A 4BG9A 5KQ8A 3BP8A 3VEYA 3TPQA 4BROA 5FPDA 3QDKA 4H03B 4DCHA 3DXMB 5AQTA 1NGGA 1GLLO 2NZTA 2A40A 3MN7A 3A0IX 5AQOA 3D2FB 4WQ4A 2ZGYA 3QFPA 2HF4A 4F9OA 3GL1A 2QWQA 4BRFA 3AAQA 3ULEB 2V51B 1KAZA 3H6EA 2P9KA 4HWIA 4B1VA 2QWMA 1U2VA 2GWJA 4FWKA 1NGEA 1NGCA 1GLBG 5ADXH 1BUPA 4BG8A 3DAWA 1C0FA 1ZC6A 3AAPA 4BGBA 4O8KA 1R59O 1NGIA 3U8XA 1X9JA 3WEEA 1YXQA 3U9DA 3KZBA 4DQ8A 1K8KB 4CBWA 3ID8A 5BPNA 5EY4A 4WQ4C 3UKRA 2CGLA 3L0QA 2ITMA 5BRDA 1BDGA 2A42A 3U4LA 5JICA 1LOTB 3H45C 3DJCA 1HLUA 1NGJA 4B1XB 4MLEA 3FGUA 2P9PB 4FWRA 4FOIA 4EIAA 3SJHA 4K43A 1J6ZA 1BU6O 1SAZA 4GNIA 4CZLA 3O5BA 3A5NC 2P9NB 4B1ZA 1SZ2A 4A2AA 3IFRA 1V4SA 2HF3A 3ZETA 2PBDA 2W41A 4JAXA 4B1WB 4WQ5A 3DXMA 3VESA 4RCHA 3EL2A 2NRHA 1NGDA 2NLXA 3AY9A 4BR4A 3D2FA 4Y0WA 3U9ZA 4BRNA 4IO8A 3TU5A 1HKCA 5LY3A 3S41A 2H3GX 3FZMA 4A62A 4FWNA 4IJAA 1P8ZA 4DHYA 3M1FA 4FWQA 3VEZA 2FLOA 3IMXA 5AQZA 1GLJO 2ZF5O 2P9KB 4IZ9A 4KBOA 4BR9A 4CBXA 1U2VB 5EVZA 1X3MA 2D1KA 2E8AA 2QWNA 2V52B 4FOEA 2W40A 2P9UB 3CJ1A 3FE1A 4JHDA 1EQYA 4CZMA 1GLEG 3QMLA 1K8KA 4FWMA 4BQLA 5FPMA 3SMPA 5AQGA 2QWLA 2V7ZA 1Y64A 3GG4A 3C0BA 4BRLA 2FXUA 3CJ7A 4BC4A 2A6AA 4EFHA 5CE3A 4IJNA 3CI5A 5FPNA 4BR2A 1Z6RA 3LDPA 2VYPA 3M3ZA 3HBTA 4K25A 5KPZA 3KVGA 4YDUA 1TUUA 4QS7A 3HTVA 3LL3A 3AARA 1T6CA 2PAVA 1G99A 2BTFA 5KPTA 4FPBA 4FWPA 2ASMA 2QM1A 3QBWA 3MMVA 3LDQA 5AQRA 3VEXA 1QHAA 3EN9A 1Z05A 2FF6A 2IIRA 5BN9A 2FSKA 3VENA 3IDHA 2DPNA 3GDQA 3ZETB 2CGJA 2GUPA 2I7PA 3CJAA 1C0GA 3H1VX 3LDNA 2A5XA 3FZLA 5AQMA 4BR0A 2QWRA 3BUZB 4FWLA 5BREA 4CBUA 2F9WA 5JLFA 3CIPA 4FWOA 4BRPA 5LJWA 5BPMA 4H5RA 2E88A 5AQJA 2IVOA 3KHYA 5BPLA 2QW9A 3WQTA 2E1ZA 3BF3A 3WUHA 2YJFA 3R6MA 3O80A 3D7EO 3O8MA 2HMPA 3L4IA 3VEVA 5LJVA 3H46O 1D4XA 3FLCO 3LM2A 5F1XA 5JLHA 2P9UA 1HPMA 3DXKB 4H0OA 3SMSA 3BF1A 4BC3A 1ATNA 3FR0A 5JMVA 5FPEA 1NWKA 1T44A 3VGKA 3JXUA 4JHDB 4BRDA 4EHUA 2P9LA 3EO3A 4A61A 3B8AX 4M7XA 3FZKA 3EZWA 1V4TA 2YHXA 1YVNA 4CI6A 1RDWX 1KAXA 1E4GT 4BREA 2J4RA 1CZAN 2ZGZA 2V7YA 3H3NO 4CJ7A 1NGHA 4Z94A 4K42A 4BRCA 4J8FA 1S3XA 1TYQB 4BC2A 1NLVA 2E2OA 2FSJA 3ZX2A 3DWLA 3HI0A 5F2RA 3OHRA 4EHTA 3H3OB 3MN6A 4WYBA 3R8EA 4IWVA 4PKHA 2P9SB 1QQNA 4BR7A 5BN8A 2E2NA 1GLDG 1SQKA 4BQZA 3VEWA 2E1YA 3VPZA 5AFUA 4C23A 1QZ6A 1HX1A 2I7NA 2AP1A 4CZHA 1GLCG 4BRQA 3WQUA 2E20A 1WUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CZ9A 4EP4A 4FVUA 4FJKA 3HK2A 1OKJA 3CQYA 3THXA 4CE9A 1G15A 4MQ3A 1XQSC 1P90A 3OYGA 1U49A 5HBMA 3ZEUA 1BISA 1NGBA 3VQ5A 1L3SA 3PY8A 4ZTFA 1XUPO 1L5UA 1B9DA 4A2BA 3QO9A 4IDHA 4A5BA 4JI1K 1RFQA 2P9LB 4BDZA 3M6GA 4CHQA 1JKHA 5TKWA 2O8EB 2Q36A 4ELVA 3J8AA 1S9GA 3EEQA 1XMQK 4KI4A 2KW4A 3N4QA 4FK4A 3RVCA 4B3TK 2EWSA 1NMDA 1C1AA 1TYQA 2CH6A 3C65A 4FW2A 2GWKA 4CEAA 4PL7A 3M8RA 4YOWA 4BACA 1U45A 1XC3A 4J2BA 4CIEA 3U3YA 1JCGA 1ATRA 3KWIA 2YNFA 5AZJB 2KFZA 3EYZA 2VWJA 4JI5K 1EXQA 5HRNA 1U04A 3CHWA 1HQEA 3C6AA 1W9HA 3O1WA 4O8UA 3M8SA 4HUEA 1QHTA 2HBJA 2D0BA 1QQOA 4ISGA 4JI0K 3SI6A 2Q2RA 3E66A 3CCQN 4DWIA 4X62K 4HUGA 4Z4IA 2PYJA 3THXB 3KK7A 5KGWA 5AQFA 4H8KA 3RMDA 5AQKA 4DUZK 5AQLA 3ZEUB 1LCUA 3G25A 2HOEA 1YJ9N 1J54A 1MWMA 4CJTA 4DV2K 4DFPA 3SPYA 4H0YB 2KLAA 2NNWA 5AQWA 3W0LA 3J81O 4FO0A 4CJLA 5JVHL 4DTPA 3PX0A 4DB3A 2PYLA 4M41A 2FBVA 5J2QA 1D9FA 3O3HA 2F8TA 1QE1A 4NYNA 4JI2K 1BIUA 5I42A 1TAUA 2YHYA 4FSVA 2OPSA 4DR5K 1CLQA 5AQIA 4JEPA 5AQPA 4U7BA 3ULDA 1N5YA 3LWLA 1YF5L 3O9RA 4IBNA 2OZMA 3J7YP 2W00A 5AQXA 1GOAA 3MX5A 2IDOA 2D0OA 4PA1A 2RKIA 4NXMK 1N36K 4ID1A 1U4BA 2ASOA 3AVAA 3CXCM 1VAZA 3O9UA 1JCFA 4DSKA 3QEIA 2Q1NA 3I8DA 4IO9L 4ILGB 4YOYA 3BDPA 4ILHA 3HVRA 1VQNN 2HHTA 2B6AA 4OLAA 3HP6A 3VQAA 3WXLA 3V9SA 1RILA 5EOYA 1HKGA 1OH6A 3P5JA 3HSCA 3WXIA 1S22A 1GLAG 2HVIA 4YHHK 1LAVA 1LV5A 2A41A 1RTDA 4CERA 3LP3A 3BGRA 3LZJA 4YFUA 4E1MA 4FLUA 2X6NA 3LAKA 3CERA 2HHQA 4CJKA 3Q7BA 3K5LA 4JKCA 3DLKA 1RTHA 1NGAA 5D3GA 1NK6A 4C1NK 4KTQA 4DR7K 1KFSA 1DKGD 3QESA 3THWB 3T1HK 4CJ3A 4CW7B 2W6KA 2VGMA 4HTLA 2O8CB 1KQSM 2F9TA 4F8RA 4KREA 3AVBA 2QXLA 5AQYA 2WOMA 3P4IA 1QZ5A 1RT5A 1BOTO 4W5TA 3JYTA 3CPWM 2W6LA 4CECA 3RMCA 4V19S 1F21A 4BRAA 2P9NA 4GY2B 1KSPA 4H5WA 4JK8A 5DM7L 2E2QA 3HPHA 1Q9XA 4K8XA 1U6ZA 3AVFA 3SK3A 1W97L 1VSEA 5FPDA 5M1KA 4H03B 4YY3K 5AQTA 3TSQA 3D45A 1GLLO 4CK1A 4ZHRA 3A0IX 1WSEA 2NRRA 1CXUA 1HNXK 4YOVA 1LWEA 5SZTA 2Y1JA 2OYQA 5T7BA 1HMVA 1VK0A 2G8KA 2WONA 4JLHA 4WF9L 1NGCA 1M90O 5KGXA 3G0ZA 3TWHA 3WNEA 1QTMA 2HHSA 1O1WA 3CCSN 2Q3SA 3KD5E 3OTOK 1CZBA 1S1VA 4E3SA 4CFAA 3OS2A 4WCEL 4KH5A 5BPNA 3ID8A 3NH2A 2HVHA 2NRXA 3V9ZA 2A1SA 2CGLA 3CF5L 3V1RA 2RPIA 3RR7A 4MDAA 3CCVN 4DSEA 1KVCA 4IFYA 1HLUA 3KKRA 4MLEA 2OPRA 3FGUA 3NH0A 4DV6K 1TKDA 1J6ZA 2X74A 2Z1HA 4JKGA 1NK8A 2WBNA 4GNIA 3O5BA 3KLIA 4KRFA 2P9NB 4JI3K 1SZ2A 4A2AA 3DLGA 3IFRA 4BE2A 2PBDA 3DLLL 4B1WB 3ZSQA 5C25A 3DXMA 3VESA 3DOLA 2NLXA 3NDKA 5FRMA 4EZ6A 3PO4A 4LF9K 3PLAA 3TU5A 1VQPN 1SS6A 1RDBA 1HKCA 3O3GA 3SQ4A 1NK4A 2E6MA 1E3MA 2H3GX 5SWMA 4DS4A 3FZMA 4B9TA 1VSMA 3NMUA 2XO7A 4DHYA 4FWQA 1ZBLA 1GLJO 1NG9A 4BR9A 4CBXA 1HR0K 2QWNA 2V52B 1J5OA 4N41A 4BQLA 2Z1JA 4IEEA 5FPMA 4IFEA 5AQGA 1OVQA 4XIUA 1J53A 2FXUA 3V1QA 2O4IA 2A6AA 1HPZA 3CFPA 3J80O 3DLHA 4FJ9A 1Z6RA 4DR3K 3M3ZA 4K25A 4CK3A 4KHYA 3L2WA 4CJ5A 3NF6A 4CHYA 2BTFA 4FPBA 4O0JA 3ISNC 2IOCA 3O9TA 2HHUA 2YV0X 3VEXA 1QHAA 3LP0A 4X65K 3S3MA 2IIRA 1TAQA 3AVKA 3VENA 4A5AA 3IDHA 2O8FA 3G71N 1XC9A 3S3OA 4CEBA 4OO1J 4DQIA 4ELUA 4BR0A 3BUZB 1NMNA 4FWLA 1QS4A 4E19A 4B9LA 3CIPA 4FWOA 1NKEA 5LJWA 2DFFA 3D0PA 3J7AP 1DT9A 3OJSA 4LSLA 3DLEA 1IKXA 3O80A 3NF8A 4B9UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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