2Q1ZB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
193
structure length
185
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRQIADPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords RpoE, ECF SigE
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 36
structure length 185
sequence length 193
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2q1zB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2q1zB02
1O3RA 3S0MA 2D93A 4E2GA 4ONUA 4UBHA 3H50A 2WFPA 2HKXA 1J59A 5D1IA 4HVOA 4R8HA 5HI0A 4XF4A 4Q29A 4AXOA 2XL7A 3NVCA 1CGPA 1VP6A 4Q0QA 4HZFA 4YARA 4HN1A 1X8MA 2Z69A 4YYOA 1DZTA 2GAUA 1FI2A 3H7JA 5C8WA 3D0JA 5CADA 2BNMA 3LOIA 4RD7A 2OA2A 3LZZA 4FAHA 4KWLA 2Q30A 4BHPA 1EPZA 4IEVA 3VHRA 1UW8A 1J58A 3PLQA 4AVBA 4I0BA 4IEOA 4PIXA 1H1IA 4MGYE 4ORFA 4I02A 5LRRA 5FQ0A 3RZZA 3M3IA 3DN7A 4Q0VA 1LR5A 4KWKA 5JAXA 2XL9A 3LA2A 4ZU7A 1ZZ9A 3CO2A 2BNOA 1O3QA 4ZU5A 3N4MA 4I0AA 1CAVB 3EJKA 1ZZ7A 2H6BA 3BB6A 3U11A 2GC2A 4FT8A 3LA3A 4I3PA 4BH9A 5I0UA 3EQEA 2Q1ZB 1X8EA 4XFGA 4KWJA 1ZRFA 2ZCWA 2IXJA 1FT9A 4GULA 4HMZA 3I59B 3G7DA 4NQWB 2H6CA 5I0SA 5BV6A 1G6NA 2EAAA 2IXCA 1ZZ8A 3NSTA 2PAMA 3OGJA 4IEWA 3I7DA 2D40A 4L11A 1QY4A 5I8TA 3MYXA 4PIYA 4TLFA 1O5UA 3BALA 2WC2A 4IEXA 3CL1A 5KHIA 4OLLA 2PA7A 4L2NA 2PAEA 2CGPA 4XFAA 3WW2A 2IXLA 1NXMA 3UKTA 2Q4SA 3BU7A 4IEYA 1WLTA 1CAVA 4MZUA 3MPBA 2ET7A 2MNGA 2B8MA 4MUVA 3I54A 2QJVA 2K9ZA 1CX4A 4Q0SA 1SEFA 4CYDA 4MGKE 5I8YA 5LRSA 3ETQA 5BPXA 3QACA 2XLGA 3I59A 3IBMA 1DZRA 5JSRA 3SHRA 1OD5A 3FWEA 1GQGA 3H9AA 3HQXA 4NVPA 1ZZBA 3E5QA 2K0GA 3OD0A 3H3UA 4IESA 4XFBA 1YFYA 2PAKA 1VR3A 3IDCB 2IC1A 2H0VA 2MHFA 4E2SA 1HW5A 3ELNA 5JSPA 5CU1A 4BIFA 5T3NA 4EWEA 5BY5A 1ZVFA 2BGCA 1ZZCA 3KCCA 3RDIA 1DGWA 3UKNA 3E6CC 4BYYA 4Q0UA 4LULA 4XF0A 3GYDA 3OF1A 2B5HA 1EY2A 3FE5A 2QDRA 4XF1A 4QM8A 3IWZA 4EWAA 2Z2SB 4XFIA 3EHKA 2BNNA 2V09A 2KXLA 2QVSB 4LLOA 5JCTA 1YHFA 1CAXB 2XKOA 2PQQA 3L2HA 5E1RA 4KU8A 3FZ3A 3HIFA 4META 2PHDA 4D7SA 3PVBB 3H3ZA 2XLAA 2Q0AA 2EVXA 5LEJA 1LB2A 3CLPA 4E2QA 4QGMA 5F1RA 4IERA 1UCXA 4AVAA 1O7FA 4DINB 1I5ZA 4B29A 2VECA 2XKPA 3SCHA 3USSA 4LA3A 2PYTA 2OZ6A 2BEOA 1VJ2A 2OPKA 4YNIA 4HBNA 1JUHA 1TQ5A 2I45A 4PIZA 3E5UA 2DCTA 2VPVA 3MZHA 1ZREA 1I6XA 1ZZ6A 4LUMA 4J1XA 5CVRA 2FQPA 4XEZA 5FPZA 3ST7A 3M70A 1ZRDA 4EROA 1CAXA 4HSLA 3ROUA 2PFWA 4Z82A 4HN0A 1L3JA 5BUVA 3H7YA 1UPIA 5AVPA 3E5XA 4YSFA 3KGLA 4YRDA 3FX3A 1XE8A 3OCPA 1H1MA 4EV0A 4LTAA 3WW4A 2D5HA 2D5FA 1UIJA 1Q5OA 2FMYA 4F8AA 5I91A 3NW4A 4UBGA 3CF6E 1YFUA 1UD1A 3C3VA 1J3PA 1PM7A 3FFQA 2MPFA 2PTMA 4HSJA 1J3QA 4XFHA 2F4PA 3HT2A 2UYAA 4XF9A 5KHJA 2CV6A 4WZCA 4QMAA 5I93A 4IEPA 1ZNPA 4MH0E 2HJIA 4WVZA 3HUGB 1NE4A 4QM9A 4HLTA 1RTVA 1QXRA 2GU9A 1WGPA 5FCCA 3E97A 3ES4A 4Q0PA 5FDBA 4JV4A 3PNAA 2C0ZA 1NE6A 2UY8A 3WW1A 2IXKA 1QXJA 3H1YA 2ATFA 2O8QA 3RPQA 2UYBA 3CJXA 3E6BA 4KL1A 4X6QB 3UKVA 1FXZA 5C6CA 2QCSB 4IEUA 3IDBB 3ACLA 3H1WA 3RYRA 3CEWA 1YWKA 1XE7A 4AQ2A 3SCGA 2OZJA 3O14A 1NZCA 1Q3EA 1GQHA 3KGZA 1RL3A 4H7LA 1CAWA 2IXIA 1NYWA 3IIAA 3DKWA 1YLLA 1RC6A 2N7GA 4QX5A 1LRHA 3RYPA 3BPZA 4IEQA 3DL3A 3D82A 4EWDA 1CAUA 2EA7A 2QNKA 5EZWA 4QGNA 5K8SA 3ZDSA 4MGIE 1XRUA 3ES1A 4WBBA 1ZX5A 5I0RA 4F7ZA 2XHKA 5KHHA 5JSOA 3E6DA 4X6RB 3QOPA 1YFXA 4XETA 3RNSA 3SXWA 2P17A 1WA4A 4N9HA 3R6SA 5J48A 3H1MA 4LUKA 2IXHA 1SFNA 1O5LA 4ZU4A 5J7MA 4KU7A 4O9GA 1PMIA 4R52A 4PJYA 3FJSA 5KBFA 3SCFA 4LA2A 1YUDA 3KMHA 1OFNA 4IETA 1OMIA 2GC0A 4N9IA 4JVAA 2GZWA 2ZKLA 1RGSA 2BYVE 2ET1A 4QXKA 4FBFA 3KSCA 3GBFA 3JZVA 3NL1A 4UXAA 4MV2A 4AVCA 1IPJA 4K8FA 1ZRCA 4FAGA 1QWRA 4JTNA 2GC3A 5J3UA 5LEKA 3S7EA 2O1QA 1O3TA 4A2UA 2CAUA 4AQ6A 1EYBA 4MGZE 4LEJA 5FLJA 3SMHA 3BCWA 3LA7A 3TNQA 2XLFA 1YFWA 4XF3A 2VQAA 4XFFA 5FPXA 3HT1A 3WW3A 1IPKA 3RYKA 2GH2A 1X7NA 1CAWB 1UIKA 4JTOA 1Q43A 4O9EA 3S7IA 2UY9A 1SQ4A 4I2OA 2ETEA 1Y9QA 5FLHA 4I01A 3D0SA 5KHGA 3LWCA 3H8UA 3LAGA 4P9GA 2OYZA 1U12A 3U0ZA 4D7TA 5E16A 3FHIB 1CAUB 1O3SA 2GC1A 4Z07A 3EBRA 1J3RA 1EP0A 4HVRA 3B02A 5KHKA 5BXXA 4J1WA 4I09A 4OFGA 5JR7B 3NKTA 1OI6A 5I0TA 2CAVA 3U10A 4HVQA 1LKNA 1DGRA 2XGXA 2PHLA 4IEZA 3DV8A 3EO6A 4QGLA 1O4TA 1ZRRA 1RUNA 2B9UA 1RUOA 5FLIA 1J1LA 3MDPA 4XFCA 1X82A 5I8SA 1V70A 2Y0OA 4MX3A 5FQ0B 3OTFA 3TNPB 2E9QA 5EFUA 3NJZA 1Y3TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LLFA 4Y1YA 4ONUA 3FBIB 3KT7A 1POQA 2XB5A 5E3LA 2DU0A 2G9WA 4B09A 1C1LA 2Z69A 3H7JA 4Q4W2 2P81A 5F1JA 4N8MA 3J7NA 5FO9B 4YW4A 1KYZA 1OQYA 2QQ9A 3J7HA 4PIXA 1H1IA 3O8HA 3UT0A 1WA6X 4KWKA 1I39A 2JG8A 4ZU7A 3FMSA 1WHUA 4GCVA 1G2HA 2IS4A 1CONA 4XTMA 3TBIA 2ID4A 1U5TB 1KZHA 5JHFA 1W04A 2W91A 2FDFA 2CY6A 1KITA 5FO7B 1J7KA 4FT8A 4I3PA 2VBZA 2A05A 3EDPA 2PXJA 4FPKA 3CZUA 1VRH2 4CZCA 4LHLA 4OHYA 4RLQA 3G7DA 1FBUA 4CP9B 2L7MP 1CESA 3OSDA 3LAPA 3ZDVA 3KM5A 5I8TA 1LVKA 5HV0A 1UQXA 4TLFA 3SITA 4ON0A 4IEXA 3AKSA 3GJAA 2QZ3A 5J3LA 3IAM2 2ZNYA 2PAEA 4BQNA 3HEIA 2ZXJA 3BU7A 4IEYA 1BOAA 2P6SA 1FX7A 3E3VA 1WLTA 3KYCB 1ZG1A 3R05A 3CCQI 5EHDA 3LSIA 1H30A 3NNGA 4JRAA 5EIYB 3QQAA 5E1XA 4NWWA 1TWHJ 4DZGA 2RR12 5JXIA 3I71A 2RS32 1H4GA 3H0GJ 4NNJA 1Z6TA 2K0GA 4W50A 1HBXG 4ZYDA 1XYPA 3VBFA 3WNKA 1JTYA 4XR6A 5FYUA 3FHNA 4QPIB 1TP4A 3T2TA 4PCQA 1OCCH 3PNVA 4XC9A 1FYKA 1HC8A 1TW2A 3NO8A 2JIGA 4QPWA 3VDXA 4CUCA 4U36A 4EZ4A 1OLQA 4Z8BA 4A12A 3BG5A 5GPCA 1WCDJ 3LL7A 4QPQA 1BI3A 5FREA 1KS4A 1GWLA 4Q48A 3VV1A 4F3JA 5FY0A 3A03A 2EIGA 1HSJA 5G04L 4BHCA 3ZN5A 3IC7A 3RJ2X 4GWMA 5IK4A 1HB4A 4N7UA 5F37A 2CQQA 4B29A 1OISA 3ZLIA 5E6HA 4D9JA 1D4VB 5DUKA 2OZ6A 4Y1UA 4E4SA 2BEOA 1RHI1 2QQ8A 4A6DA 1GP4A 2IGOA 1TE1B 2AC1A 3VBSB 3THDA 3PJRA 1PK6A 1C3HA 3HQRA 1BOBA 5LK5A 5FUPA 2FQPA 5AC93 5HS8A 3BGAA 3CF2A 1T2KA 3AJYA 1ZLKA 2R32A 1ULGA 2VCMA 3IHUA 4XYXA 5C71A 4YW2A 2BW3A 4HDUA 1B8IB 5KWRA 4Q4V1 3GDBA 3ILRA 3IUOA 3M3OA 1O91A 2HWE2 1REDA 1FPN3 3F8BA 3J7LA 4UNOA 1J09A 3OGRA 4JHTA 3P7NA 3OS2A 3HOBA 1WJ5A 4BQYA 2HDCA 3J81Z 5FK7A 2MPFA 4R79A 3VBHA 3OPTA 1MS8A 3D5OA 2DVDA 4XF9A 4XCAA 2QSGX 3MFCA 4OMZA 5H20A 2F48A 4YVSB 1EH7A 2BW8A 1VPHA 4XQ4A 1NE6A 1DU0A 1QXJA 5IP6A 2ZXHA 3KS7A 4Y22A 1Q1VA 4RHV3 3RSNA 1YTYA 3CEWA 4BQ1A 4E4HA 5ERIA 3GCWA 1V0AA 5H9QA 4H7LA 4XRFA 1NYWA 4IQ4A 3GALA 1DP0A 1PP7U 2B9VA 1FTTA 4A3FJ 2D43A 3GXUA 5LY1A 5FJ8J 1VFCA 2VZ1A 2Y9ZA 2V6EA 3ILNA 1MBEA 2CWMA 1UMHA 2CYFA 1OA4A 3ZDSA 2Y0SA 4L92A 4MGIE 4V2WA 2ZJCA 1DQUA 1UY3A 3DWLE 3GZAA 1XC5A 4Y4RA 3VZMA 1WA4A 5A7OA 2HEWF 1UU6A 4PK4A 1O5LA 4IV3A 1K78B 5FZ9A 1UELB 4R52A 4WVVA 2JWPA 2AXTC 3LOBA 3FJSA 1SVMA 2ZXWH 1RMU3 1XSQA 4EGYA 4LLGF 4XABA 4QWNA 3QBQA 1OMIA 5FUIA 2V4JC 4DQAA 2PN6A 3ABMH 5L73A 5JVTA 3S17J 3TP3A 2EF6A 4P9XA 2A6HF 2K4JA 3S6PA 5EG0A 2TUNA 2ISZA 1W6PB 4G6TB 2OUJA 2O9LA 5C4WB 2Q8DA 1I50J 1HJGA 4XFFA 1SBDA 1U6GA 1RUI2 4GJZA 1OCTC 4UVBA 1Q43A 3AMHA 3OYMA 2X1DA 5DTDA 1Y9QA 1KQRA 5B2GB 4CEWC 4KG0A 1U12A 3U78A 2JK3A 3FHIB 2VUDA 1W8WA 3A0KA 1JUSA 3V42A 2DYSH 3OS0A 3WX5A 1J3RA 1EP0A 4DOUA 1W5CC 1R64A 1F4HA 2NNYA 1JXSA 2HH9A 3GMEA 3LSKA 1FYLA 2R7VA 2OS2A 3ZFGB 1USSA 2JG9A 3BG9A 3BTXA 3AP4A 2QF7A 5L3GA 3UETA 2GDFA 3S1MJ 2K46A 3ZOIA 2VOXA 3DBLB 5F7UA 3MQ0A 2DTRA 4C90A 3A4UA 2N8GA 2RQPA 2ZXQA 1Z0XA 3S32A 1ZK8A 5F2WA 1BW6A 1T56A 1ETVA 5JR2A 3I2KA 3NV2A 2IT0A 4P14A 3KB5A 5BMZA 2CV2A 3V8KA 1LNSA 3OG2A 1O6UA 1X8MA 5JMOA 5FP7A 3THTA 3KZIC 3ZN6A 2O0YA 4LPLA 3O0VA 5BNQA 1K4TA 3D5RC 4BHPA 1EPZA 4IEVA 2E7QA 5A32B 2R5YB 1RESA 2DVGA 3WT3A 2VXDA 3I3EA 4DRRA 2YMZA 3ZP5A 3LMMA 5AC91 2JE9A 2FZ2A 2PJRA 2XC7A 1URXA 5FYCA 1O3QA 1XSXA 3TEYA 2OTJI 1H9PA 1GZ9A 2ZX0A 3WTTC 2FX0A 1B9MA 3HBLA 4D0PA 1AXKA 1FPN1 3O1OA 1LDDA 3PVOA 1R5GA 1UZZA 2IA2A 2PHWA 1W6QB 1VQMI 5HCHA 1DIWA 3DPLC 3JRHA 3WNXA 3HNMA 1REPC 1N1YA 1HB1A 2X5IC 2Q1FA 4HT1T 5K7PA 2E5NA 3ZYFA 5JOZA 4L0YB 4CZZA 3VN4A 1W6OB 1QHDA 4ZYHA 1ZBE2 5FXWA 3ZYGA 3DBHB 3P5BA 5B3SH 3C18A 2ZO4A 1ZH5A 5F3CA 3RG0A 3KF5A 4IL7A 1OLMA 4FOVA 4ES8A 1ZG3A 3JRDA 5LRSA 2VY0A 3ETQA 2ICWG 1HDDC 3I59A 4HQMA 2EXIA 4RHV1 1EV12 4IF4A 2Z79A 3PVEA 2W87A 5T52A 1OHFA 1A35A 3HL2A 1D8JA 1JYWA 2GSYA 3M8FA 5B4XA 2H0VA 4E2SA 5FBZA 1WZ2A 4UUSA 3WTXC 5A2QK 4ZYGA 1N25A 4LULA 1TW3A 3E6MA 1S0JA 3GTGJ 4PLMA 4ASNA 2IUWA 3X29B 1AOYA 3DF0A 1BJAA 4LLOA 1LOAA 1W8FA 1UMQA 1RYYA 5FRMA 4KU8A 1MMAA 5CKQA 2WV1A 2LDUA 1P9QC 3URFA 4YW6A 3WUCA 3K70C 4XOGA 2E33A 1W99A 2JJ7A 2V4VA 2XPWA 1CVNA 1RMU1 4NIDA 4AVAA 1UPSA 5J8FA 4I30A 1W9SA 2E35A 1ON2A 3ZSJA 3W5NA 2O8OA 3ZN0A 4DJAA 3DEEA 1IDYA 4PIZA 5L9RA 1X1AA 2V1UA 1QJX2 1RUC3 2RHPA 1VF9A 1I6XA 1P4WA 4HPQA 5FY1A 1H0MA 2XG3A 3K4MA 3RZHA 3ZSKA 3K77A 5AVPA 4GD4A 3KGLA 5K1YA 4LTAA 3LEMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1O3R A;  3S0M A;  2D93 A;  4E2G A;  4ONU A;  4UBH A;  3H50 A;  2WFP A;  2HKX A;  1J59 A;  5D1I A;  4HVO A;  4R8H A;  5HI0 A;  4XF4 A;  4Q29 A;  4AXO A;  2XL7 A;  3NVC A;  1CGP A;  1VP6 A;  4Q0Q A;  4HZF A;  4YAR A;  4HN1 A;  1X8M A;  2Z69 A;  4YYO A;  1DZT A;  2GAU A;  1FI2 A;  3H7J A;  5C8W A;  3D0J A;  5CAD A;  2BNM A;  3LOI A;  4RD7 A;  2OA2 A;  3LZZ A;  4FAH A;  4KWL A;  2Q30 A;  4BHP A;  1EPZ A;  4IEV A;  3VHR A;  1UW8 A;  1J58 A;  3PLQ A;  4AVB A;  4I0B A;  4IEO A;  4PIX A;  1H1I A;  4MGY E;  4ORF A;  4I02 A;  5LRR A;  5FQ0 A;  3RZZ A;  3M3I A;  3DN7 A;  4Q0V A;  1LR5 A;  4KWK A;  5JAX A;  2XL9 A;  3LA2 A;  4ZU7 A;  1ZZ9 A;  3CO2 A;  2BNO A;  1O3Q A;  4ZU5 A;  3N4M A;  4I0A A;  1CAV B;  3EJK A;  1ZZ7 A;  2H6B A;  3BB6 A;  3U11 A;  2GC2 A;  4FT8 A;  3LA3 A;  4I3P A;  4BH9 A;  5I0U A;  3EQE A;  2Q1Z B;  1X8E A;  4XFG A;  4KWJ A;  1ZRF A;  2ZCW A;  2IXJ A;  1FT9 A;  4GUL A;  4HMZ A;  3I59 B;  3G7D A;  4NQW B;  2H6C A;  5I0S A;  5BV6 A;  1G6N A;  2EAA A;  2IXC A;  1ZZ8 A;  3NST A;  2PAM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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