2Q2RA

Trypanosoma cruzi glucokinase in complex with beta-d-glucose and adp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
373
structure length
370
Chain Sequence
APAGSHMNIKELSLHELCEELKTPAWNAPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITEIIEFFNEIIELMPASVMKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGHSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPQHIVVPLELGSQTLPMRKDIDYIQTLHAELKLFPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHHEALNHEMERFGFQSRVSYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase 1, putative
publication title The Crystal Structure of Trypanosoma cruzi Glucokinase Reveals Features Determining Oligomerization and Anomer Specificity of Hexose-phosphorylating Enzymes.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 124
structure length 370
sequence length 373
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q2rA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 2q2rA02
2FF6A 3DJCA 3CI5A 3ATVA 3D2EA 4BRNA 5AQKA 5AQFA 4FOIA 1NWKA 4K41A 1WOQA 4ISGA 3U4LA 2D0PA 4BRIA 4XH5A 4EHTA 3WXJA 3HTVA 1NMDA 1BA0A 1NGIA 1TUYA 3UKRA 1E4FT 3CETA 4WQ5C 5ADXH 5AZJA 3A8YA 2P9SB 2Q31A 4E1JA 5BRHA 3BP8A 1GLAG 1LCUA 5ADXA 3VGLA 5B8HA 5AQJA 3BF1A 1RFQA 3WXIA 3CJCA 2ITMA 2E2OA 3DXKB 2KHOA 1Y64A 3HI0A 3MN5A 1Z05A 2YI1A 1BA1A 5AFUH 2FSNA 5LJWA 1GLCG 4FWKA 4M63C 5AFUA 5JLHA 2Q97A 3D2FA 1P8ZA 2IVPA 5EY4A 2P9KA 2GEMA 4M7YA 2V52B 3DAWA 4FOEA 1J6ZA 1HKGA 4BRFA 2AA4A 2V7YA 3O4WA 4BVOA 3MMVA 4BVPA 1DEJA 1EQYA 1NGCA 2W41A 3U9DA 2E1YA 5LJVA 3MN9A 2A3ZA 3FE1A 4QS7A 3ZX0A 2F9WA 3QFUA 1KAXA 3RSEA 5JLFA 2GUPA 4IO8A 4BROA 4MLEA 2GWKA 4GY2B 3VPZA 2P9NA 3O6WA 3VOVA 3LDNA 4IZ9A 4A62A 3LDQA 4BQLA 3VGKA 1JCGA 3WEEB 3SLCA 3ZETA 3L4IA 4I6MB 4B1WB 1BUPA 5AQPA 5KPRA 2Q0UA 4BC2A 2VWBA 5E84A 1BU6O 1E4GT 4HWIA 1C0GA 2P9PA 3FZMA 3JXUA 5LY3A 4WQ5A 3H1QA 3AARA 4F9OA 5BPNA 2ZWHA 3VESA 4BRLA 1YUWA 1G99A 3H6EA 3SMPA 4DCHA 1HKCA 3DXMB 3ID8A 3W0LA 2QXLA 5AQMA 1YVNA 3ENHA 2QWLA 2I7NA 4K25A 1HLUA 3P4IA 2BTFA 2Q2RA 2P9UB 3JS6A 3HSCA 4JAXA 4BR4A 3OHRA 4JD2B 2P9LB 3A5MC 2IIRA 5BPMA 3UE5A 4CZKA 3O80A 3FZLA 3W3DA 3H3OB 1GLFO 1NGDA 3MDQA 3L6QA 3VEZA 5FPMA 3WQTA 3G25A 4FWMA 1XQSC 4CZGA 2I7PA 3HBTA 5AQNA 5AQGA 2QWPA 5BRFA 4CBWA 4PL8A 2V51B 1BDGA 1QZ6A 3A5LC 3LDLA 4WYBA 2CH6A 2OANA 4BRQA 4BGBA 3FFKB 4L3QA 3FZHA 3VEWA 4DB3A 3FLCO 3EO3A 2YHXA 1K8KB 2YJFA 4RWTA 3SJHA 1Z6RA 3KVGA 4K43A 1ZC6A 3ZEUB 4A2AA 1IG8A 1QQMA 3IUCA 1KAYA 4BR9A 1MWMA 2YHWA 4EAHD 1RDWX 2QWMA 4BR5A 3CJBA 4BQZA 4CD3A 4H5WA 5AQSA 3WXLA 1BO5O 2AP1A 5AQOA 1TUUA 4FO0A 5BREA 5EXWA 3ULEB 3VEVA 4CZFA 4EFHA 2D1KA 3ATUA 1NM1A 2ASMA 4O5FA 3R6MA 4YDUC 3R9PA 4WQ4C 3VERA 2P9IB 5KPTA 4A2BA 3CHWA 3CJAA 3FZFA 5CE3A 3H1VX 4BRPA 1HPMA 3H3NO 2FSKA 3UB5A 3MCPA 1TYQB 3C7NB 1NBWA 2P9SA 2CGLA 2GELA 3KZBA 1SAZA 5FPNA 2E20A 1DGKN 1MDUB 1ZXOA 3H46O 2H3GX 3D2FB 3L0QA 3GE1A 1SQKA 1D4XA 3BUZB 1H1VA 2P9KB 3DXKA 4Y0WA 4NB4A 1HJOA 1KXPA 5AR0A 3LDPA 2YHYA 4H5VA 4H5TA 3VGMA 1ATRA 4IXCA 1NGAA 3DWLA 2VYPA 4H5NA 1HX1A 4C23A 3QMLA 3BF3A 4BG8A 2ASPA 4FWRA 3CJ9A 4CJ7A 1DKGD 3VETA 1GLEG 4BGAA 3QFPA 4CBUA 5I9EB 3O5BA 3IFRA 2F9TA 3KHYA 1CZAN 1QQNA 1OKJA 3EKSA 1GLLO 1XC3A 1QHAA 1BWFO 2P9PB 5EX5A 1QQOA 2NZTA 2DPNA 1ATNA 3M3ZA 5F2RA 2YCHA 3QBWA 3GOIA 2VCPA 5AQVA 1GLDG 4YDUA 4FSVA 3WT0A 1R59O 1LOTB 2HOEA 4WQ4A 3WEEA 2J4RA 2PAVA 3O08A 4QS9A 3QICA 4NO7A 4LC9B 2BUPA 1T6CA 1GLJO 2A41A 4RCHA 3O1WA 3MN7A 3LDOA 3BEXA 3MK6A 3O8MA 2NRHA 1JCFA 5AQQA 3O1BA 1S3XA 4PKHA 2ZF5O 3VF4A 3D7EO 1IJJA 4JHDA 3LL3A 1SZ2A 2P9UA 1HKBA 5KPZA 1BG3A 4EIAA 4CZIA 3AY9A 3WXKA 4CBXA 4JNEA 2P9LA 3MN6A 4ISFA 4B1VA 4BG9A 4O8KA 5AZIA 1C0FA 1S22A 3EZWA 1MA9B 3VF2A 1BOTO 5AQYA 4IJAA 5TKYA 3GG4A 4BC4A 4B9QA 3ZX2A 2E88A 5EOYA 2A40A 3HZ6A 2Q1NA 1NLVA 4FL9A 2GTDA 3UKUB 4B1ZA 2ZGYA 4J8FA 1YXQA 5EVZA 3A5OC 3CJ7A 4A61A 2D4WA 3AAQA 5FPEA 3D2EB 2E1ZA 3GDQA 2FLOA 3EKUA 4Z94A 4BR7A 5KQ8A 4FWQA 2ASOA 3WQUA 4CZEA 4QS8A 2QWQA 4FWPA 3UKRB 1K8KA 3CERA 5AZJB 3CJ1A 1U2VA 4CZLA 1ZBSA 3ZEUA 1ATSA 3I33A 5BR9A 1X9JA 3J8AA 2FSJA 3SMSA 4BRAA 3ULEA 1NGEA 5AQTA 1T44A 5F1XA 4HTLA 3FZKA 3GL1A 3QDKA 1NGHA 1V4SA 3LM9A 2CH5A 2P9IA 4FWNA 4H0VB 5ELZA 2IVNA 1WUAA 3ZX3A 3CQYA 1NGFA 3VEOA 2E2NA 1TYQA 3C7NA 4DHYA 3B8AX 3RSEB 4CZJA 4BC5A 2CGJA 4H0YB 3VENA 4JN4A 4FPAA 5FPDA 2QWNA 1T6DA 5AQHA 3GBTA 3S41A 2P9NB 4FPBA 4H0XB 2PBDA 4B1XB 4XEIA 2QW9A 2CGKA 3ZETB 5F0XA 2YJEA 4GNIA 5AQIA 2A6AA 3M6GA 4PL7A 2ZGZA 3VF6A 5AQRA 4MO4A 4DQ8A 4BRMA 1NGGA 4EHUA 2UYTA 4IJNA 4MLHA 2HF4A 2E2QA 1X3MA 3R8EA 3IMXA 4K42A 5JMVA 4H0TB 4I6MA 3WUHA 2QM1A 3HM8A 3M1FA 1QZ5A 3VEXA 2WUSA 5AQXA 2A5XA 5BN9A 3VEYA 4CZHA 4BRCA 4PKIA 2IVOA 4CZMA 4BC3A 3QB0A 3EL2A 3DXMA 1MWKA 4XH4A 2A42A 3CQXA 1JCEA 3ENOA 2EWSA 5BN8A 4AM7A 2GWJA 5JICA 2FF3B 1HUXA 2D0OA 4FWLA 2Q0RA 4BREA 2QWRA 4AM6A 4JHDB 2NLXA 4H0OA 4M7XA 4JD2A 1V4TA 3EN9A 5AQUA 3FR0A 2V7ZA 4PKGA 4ISEA 4CD1A 5AZIB 4H0PA 3C0BA 1YAGA 3SK3A 4H5RA 1KAZA 4BR0A 3QBXA 5AQZA 4KBOA 5BPLA 4BR2A 2FXUA 3U9ZA 4BRKA 3TU5A 4BRGA 3IDHA 1GLBG 2E2PA 4BRDA 1XUPO 4IWVA 5BRDA 4CI6A 5KQDA 5AQWA 4FWOA 3AAPA 2Q36A 1ESVA 3H45C 1U6ZA 3LM2A 4BRHA 3F9MA 1X3NA 4RTFD 3U8XA 3TPQA 2HF3A 3CIPA 3A0IX 4FWSA 3A5NC 3FGUA 2QWOA 1Q18A 4XH1A 5AQLA 1RGIA 2E8AA 1NGBA 2W40A 2HMPA 4H03B 3UKUA 3I8BA 4B1UB 4B1YB 1NGJA 1U2VB 5E26A 4MO5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DJCA 3L2WA 2G8UA 3ZYYX 2KQ2A 3O3HA 1WOQA 2D0PA 2WONA 3CMAN 3UKRA 3A8YA 1S1XA 1VSKA 3VGLA 5B8HA 4CF0A 5AQJA 3BF1A 3CJCA 4HHTA 1VRTA 3DXKB 2KHOA 3ZT1A 2BDPA 1J53A 3AA5X 1KLMA 3HI0A 3OTOK 1JLCA 1UWBA 1Z05A 1JLQA 4O0IA 4OKJA 3VQ8A 1LAVA 1J5OA 4DQIA 3S3OA 4JKEA 2GEMA 3THXA 4M7YA 2V52B 3DAWA 4FOEA 4JI2K 4CVNE 4GV9A 3MMVA 4BVPA 4B9VA 3HVTA 4OX9K 2W41A 3LAMA 2E1YA 4DTSA 3OYIA 4FJ9A 3SBGA 2A3ZA 3FE1A 1KAXA 3RSEA 4CJUA 2GUPA 3SV3A 5A2QO 4MLEA 1BQMA 3VOVA 4DQPA 3SLCA 4I6MB 1A5VA 1BUPA 3F9KA 3AVCA 2VWBA 5E84A 4HWIA 1C0GA 2ZD1A 4HVJA 3AO2A 4WQ5A 4HTUA 4PQUA 4F9OA 3VN5A 3H08A 3NF9A 3VESA 4BRLA 4OGEA 4DSIA 3RMDA 3HM9A 3ID8A 1IV0A 4C8MA 4E89A 5AQMA 1T03A 4O4GA 4K25A 3T19A 1JKHA 3P4IA 2RKIA 4BE2A 1M90O 4CGGA 3AVKA 1TGOA 3ZSXA 3P39A 1W9HA 1NNEA 2D0BA 4O55A 3IRXA 4YNQA 3SUOA 4R5PA 1JXBA 3O80A 3W3DA 1TKTA 1HNZK 3MDQA 3RTVA 4PY5A 3LPTA 1BCMA 1NK4A 4FWMA 2B4JA 1JL2A 3T1HK 3HBTA 2F96A 4PHTX 4YHHK 4AHTA 4CBWA 2V51B 4WFAL 3C95A 1BDGA 4WF9L 3E9LA 3OVNA 3MAQA 4HCCA 1VAZA 4BGBA 2ITGA 3ULDA 4DU3A 1DT9A 4L3QA 5FRNA 1I39A 1SV5A 1VQ4N 3EO3A 2KTQA 1TAUA 2QI2A 2YJFA 4F3TA 1QHTA 4K43A 4IKFA 3OYFA 1QQMA 2UUCK 1MWMA 3CJBA 3DM2A 1HRHA 4A59A 2VWKA 3EEQA 5AQOA 4FO0A 2EX3A 1SUQA 1VSDA 5EXWA 3VEVA 1EKEA 3V9ZA 4YOTA 4FZZA 2D0CA 2D1KA 1NM1A 4YDUC 4H8KA 4WE1A 4JI6K 3AVFA 5KTQA 3DRRA 3AVMA 4NYFA 3NVKA 3CJAA 3FZFA 3H1VX 4BRPA 5JS1A 2NRXA 1I3AA 3VQ6A 2OZMA 3UB5A 1X9MA 4CEZA 2GELA 3KZBA 5FPNA 1REVA 2E20A 2HHTA 2WTUA 3CFRA 3K5LA 2P5GA 3L0QA 4NCBA 3D2FB 2KFZA 1W0HA 3GE1A 1SQKA 4CEOA 3BUZB 3DXKA 5CHIA 4DTXA 4Y0WA 3AV9A 1KXPA 1HPZA 4FK2A 3TAGA 1IG9A 2O8EB 2IDOA 2HHQA 4NXNK 1B9FA 4ID1A 1NGAA 4H5NA 4HCBA 3BF3A 4BG8A 2ASPA 1TAQA 4CJ7A 2ZJPL 1Q7YO 3MCAB 1C1AA 3VETA 2VWJA 3MWPA 1N33K 4DU4A 3O5BA 3KHYA 1CZAN 4KHUA 2X6NA 1U45A 3O9UA 1S6PA 3L2UA 2P9PB 1VQPN 3T1YK 3TSQA 2NZTA 3M3ZA 1ATNA 5F2RA 3GOIA 2VCPA 5AQVA 1DTTA 3L2VA 4KHPK 3WT0A 2HOEA 4WFBL 4YOWA 5FROA 5K14A 3LWLA 3O08A 1NK0A 2QEXN 4LY7A 4ILGB 3TTDA 4FLZA 4NO7A 4HUGA 1HMVA 4GVEA 5AJ3K 1T6CA 1U49A 4RCHA 1TVRA 3MN7A 3MK6A 2KW4A 3C6TA 4YOVA 4KHWA 1VQ5N 3CMEN 3E9PA 3AGKA 3O1BA 4B3MK 3OA9A 4CE9A 5HLFA 4N5SA 4FM1A 4M45A 3VF4A 3D7EO 4CFDA 1IJJA 2YX6A 3LL3A 1SZ2A 3S9HA 3ASMA 3BZKA 4JKFA 2RN2A 5GIPA 3SAFA 4B1VA 4BG9A 4O8KA 3ID6A 1C0FA 3EZWA 3PV8A 4FJLA 1MA9B 3VF2A 3GG4A 1RBRA 4CF1A 3OYHA 3HZ6A 1WSEA 3PUFA 1NLVA 5MLCQ 3OYKA 1IBLK 4FCYA 2HBLA 3TTCA 1OH8A 1S1UA 5KQ8A 2ASOA 3N4QA 1KC8O 1D8YA 4FWPA 3D0PA 4CJ3A 5C10A 3ZSYA 4DV6K 1UOCA 3HPOA 3PIPL 4DV3K 1YJNN 4PWDA 1X9WA 4IFYA 4JLHA 4DTRA 4AHSA 5JS2A 3KLFA 5AQTA 3KTQA 1ZBIA 3FZKA 2YV0X 2NUBA 1HNIA 5C12A 3LM9A 4LF8K 1XNQK 3CC4N 2Z1JA 2IVNA 3ZX3A 3SZ2A 2E2NA 1VQNN 3WNFA 4DHYA 5J2NA 4RG8A 4MDBA 3THWB 1RDCA 2D0AA 4X62K 4FPAA 2P9NB 3F2KA 4BWJA 5IWAK 1JJ2M 4XEIA 4B9UA 4CFCA 1Q8IA 3CC7N 3C94A 3NAEA 1WLJA 5AQRA 4B8AB 1VQ6N 4DQ8A 1XI1A 4BRMA 4EHUA 4ZTFA 2UYTA 1FKPA 5DK5A 1OVQA 4KREA 4HUFA 3U3GA 4K42A 4AILC 1NKEA 3M8QA 4FYDA 4H0TB 3WUHA 3VEXA 3SAGA 2A5XA 1IKYA 3AVNA 1N34K 4Y1CA 4KTZA 3HVRA 4BRCA 4E19A 3D6RA 4PKIA 4MQ3A 3K5MA 4I9LA 1Z25A 3RVCA 3CQXA 3OY9A 1D9FA 2GBZA 4DV4K 3MECA 4M3TA 1U04A 3O9TA 2GWJA 4BDPA 4CJQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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