2Q36A

Actin dimer cross-linked between residues 191 and 374 and complexed with kabiramide c
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
369
structure length
360
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple crystal structures of actin dimers and their implications for interactions in the actin filament.
pubmed doi rcsb
total genus 126
structure length 360
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2q36A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2q36A03
5AQIA 5EX5A 4BRIA 1GLJO 4CZHA 2Q0RA 3O5BA 3P4IA 3FLCO 5FPEA 3SMSA 1BA1A 1NGFA 3BP8A 1BDGA 3GBTA 3WXIA 1TUUA 3MK6A 5BREA 3MN9A 2A41A 3IFRA 2CH5A 1NGHA 2D0OA 3WUHA 1BU6O 5BN9A 1QQMA 3ID8A 2Q0UA 3RSEA 3UE5A 2NLXA 2Q36A 4YDUC 3QBWA 3B8AX 3WQTA 1U2VB 4A62A 3M6GA 3DXKA 3FR0A 2CH6A 3U9ZA 4EAHD 4BRGA 2E20A 4GNIA 1JCGA 5BRHA 5JLHA 3H45C 4PKGA 5AQHA 1HLUA 3DXMB 5AQTA 4WQ5A 3UKUB 1MA9B 4JHDA 1NGCA 2YI1A 4BRDA 2E2OA 3HM8A 3SJHA 4BRNA 1BA0A 1QZ6A 4J8FA 3EKUA 1X9JA 4FWLA 4EIAA 5BR9A 4FSVA 3VEOA 3ZX2A 1KAZA 3CJAA 4BC4A 2W41A 3EO3A 3DAWA 4PKHA 2HMPA 3FZHA 3H1QA 4O5FA 3SLCA 2CGKA 5KPRA 3WEEA 1SAZA 3U8XA 1JCFA 4KBOA 3CERA 2H3GX 4BG9A 2YHXA 2V7YA 2NRHA 2P9LA 5F2RA 3VERA 3LDPA 4H5TA 4BQLA 1V4SA 2NZTA 1XUPO 3VEXA 2AP1A 3A5LC 4PL8A 1HX1A 3AAPA 3H46O 3EZWA 3HTVA 3AARA 3CJ7A 2FLOA 5BRDA 4F9OA 3LDOA 5ELZA 1Y64A 3J8AA 2P9UB 3VEZA 3DJCA 1BG3A 5BPLA 1NBWA 1P8ZA 2GUPA 3W0LA 3EKSA 2QWMA 2VYPA 2QWPA 4EHTA 1D4XA 1DKGD 2E2NA 1R59O 4CZLA 5F0XA 3QFPA 2QM1A 3OHRA 3QMLA 1BO5O 2QWLA 1RDWX 4M7XA 1RGIA 3JS6A 2FSJA 3U4LA 4MLEA 3ULEB 5AZJB 3MN5A 3VETA 4IO8A 4CZKA 3TPQA 4H0PA 2P9IB 3D2EB 3H3NO 2QW9A 2PAVA 3EL2A 5KPZA 3UKRB 5LJVA 1YAGA 1GLAG 5AQXA 1G99A 5AZIB 5AQPA 3VPZA 2P9PA 3GL1A 4A2AA 3TU5A 2E1YA 3GOIA 4FO0A 2BUPA 4MO5A 3VENA 4A2BA 4FPAA 4WYBA 1MWMA 4H5NA 4BVOA 1TYQB 2HF3A 3FZFA 3MN6A 4FWQA 5AQGA 3R8EA 5KQDA 4BC5A 3VGLA 2V51B 4CZFA 3WXKA 3A8YA 2E8AA 4FPBA 1ATRA 1T44A 4BRMA 3FZMA 3VF2A 4AM7A 3CJ1A 3ZETA 2GWJA 3C7NA 2A5XA 5AQWA 4B9QA 4FOIA 1NLVA 3D2FA 5EXWA 2P9NB 5FPDA 4JD2A 4BR2A 1EQYA 3ATUA 2QWRA 2FSKA 3A5OC 4CBXA 3QDKA 3RSEB 4Y0WA 4DHYA 1HKBA 1WOQA 3H3OB 3W3DA 2BTFA 1S3XA 4Z94A 1IG8A 3DXKB 1NM1A 3LDQA 1ZC6A 4QS7A 4BR7A 3L4IA 3LM2A 3VF4A 4FWPA 4BREA 5LJWA 2IVOA 3EN9A 3IUCA 5AFUA 1S22A 2QWQA 1RFQA 5AQFA 2ZGYA 3JXUA 1TUYA 4BC3A 2F9TA 4BRFA 1HKGA 4QS9A 4RWTA 2F9WA 3GDQA 3O08A 2KHOA 3DWLA 4BR0A 3L0QA 4K41A 1E4GT 2W40A 4NB4A 1HUXA 2P9SA 3KHYA 1GLCG 1Z6RA 3ZEUA 4BRPA 1NGIA 4CBUA 2VCPA 2Q1NA 2FF6A 3O8MA 5EOYA 2ZWHA 4BC2A 2IVNA 4CZGA 4CZJA 2CGJA 1ATSA 2D4WA 2WUSA 4IZ9A 2P9LB 1HKCA 5BPMA 4H5VA 4HWIA 4BGBA 3I8BA 4IWVA 5I9EB 1GLFO 3HBTA 3O4WA 5FPNA 5ADXH 2P9KA 4BG8A 1LOTB 3BF3A 1BOTO 4FWOA 4WQ5C 3U9DA 3ATVA 4HTLA 4B1WB 4JNEA 1GLBG 3UB5A 5E26A 5AQJA 4BRQA 3CIPA 3CHWA 4XH5A 5KQ8A 1OKJA 4L3QA 2ASOA 2YHYA 3IMXA 3WT0A 1YVNA 3H1VX 4FWRA 2A42A 4B1YB 1GLEG 2CGLA 2V7ZA 3MN7A 4IJNA 5B8HA 2D0PA 2IVPA 4PKIA 1XC3A 4BRAA 3KZBA 3IDHA 1Z05A 4XEIA 1NGDA 1IJJA 3QICA 3L6QA 4H5RA 4WQ4A 2P9UA 5AQKA 2YCHA 2EWSA 1MDUB 3VOVA 5AR0A 4B1XB 1DEJA 1NWKA 4MO4A 4CI6A 1MWKA 3MDQA 4E1JA 4BRKA 4BROA 3ULEA 4FWMA 5BRFA 1NMDA 4H0XB 1T6CA 4DQ8A 1ZBSA 3HZ6A 3D2EA 1ESVA 4BVPA 4I6MA 3QB0A 3UKRA 3C0BA 5AFUH 1X3NA 1HPMA 2FF3B 3S41A 4RCHA 4B1VA 1K8KA 4YDUA 3KVGA 4IJAA 1KAYA 5AQMA 2YJFA 5EVZA 2E2PA 5CE3A 3WQUA 1V4TA 3ZETB 4BR9A 3MCPA 2GTDA 1WUAA 4AM6A 3D7EO 3C7NB 3GE1A 4H03B 4CZEA 1TYQA 4C23A 4CJ7A 1SZ2A 4BRCA 3CI5A 4FWKA 3CQXA 2OANA 5JICA 4DCHA 4JD2B 4K25A 1Q18A 3SK3A 1QHAA 2ASMA 3WXJA 4B1UB 3H6EA 4CD1A 4BRHA 5AQZA 1NGAA 2I7PA 2J4RA 4O8KA 1DGKN 2YHWA 1KAXA 3VGMA 2ZGZA 4CBWA 1J6ZA 1KXPA 5KPTA 3GG4A 2E2QA 3FZLA 3LDLA 5AQLA 5E84A 4BR5A 5AQRA 2P9NA 4FL9A 4MLHA 2HF4A 3BEXA 4ISEA 2ITMA 3A5NC 3VEVA 4H0YB 4QS8A 3FGUA 5JLFA 1U2VA 4JHDB 5EY4A 4EHUA 2A40A 2E88A 1JCEA 3G25A 1QQOA 2QWOA 3CETA 4BRLA 2E1ZA 4M63C 1H1VA 1C0GA 3O80A 3VEYA 2P9SB 3QFUA 4H5WA 4PL7A 4BGAA 3ZEUB 3DXMA 3UKUA 4B1ZA 4FWSA 1YUWA 3WEEB 4BR4A 4CZMA 3VESA 4GY2B 4ISFA 1E4FT 2HOEA 3M1FA 1QQNA 3BF1A 3FE1A 1XQSC 4H0TB 3R9PA 1LCUA 2FSNA 4IXCA 3HI0A 5AQVA 1YXQA 5BN8A 5JMVA 3LM9A 2DPNA 1ZXOA 4EFHA 2QWNA 3M3ZA 3HSCA 3LDNA 3FFKB 2Q2RA 2P9KB 1BUPA 2YJEA 4RTFD 1NGEA 4H0VB 4LC9B 5FPMA 3O1BA 3QBXA 1NGBA 5AQQA 4XH4A 3O1WA 2ASPA 2UYTA 3A0IX 4CZIA 2ZF5O 4M7YA 1HJOA 4FWNA 2D1KA 1SQKA 3MMVA 5F1XA 1BWFO 1T6DA 4XH1A 5AQYA 2GWKA 2A3ZA 5AQUA 1U6ZA 3CJBA 2GELA 2Q97A 1ATNA 3ZX0A 1GLLO 4JAXA 1QZ5A 3BUZB 1X3MA 1C0FA 3ENHA 3ENOA 3AY9A 1NGJA 2A6AA 2P9PB 3A5MC 3CJCA 1GLDG 2AA4A 4H0OA 1NGGA 2PBDA 2VWBA 5AZJA 5LY3A 2GEMA 5AQSA 4A61A 3ZX3A 3I33A 2P9IA 4FOEA 3FZKA 1CZAN 2V52B 5TKYA 3VGKA 4CD3A 5BPNA 4NO7A 2QXLA 3SMPA 4I6MB 5AZIA 3CJ9A 2I7NA 4K42A 2FXUA 3WXLA 4JN4A 4BQZA 2Q31A 5AQOA 3VEWA 4DB3A 1K8KB 3F9MA 3R6MA 3LL3A 3VF6A 5AQNA 4WQ4C 3AAQA 3CQYA 3O6WA 5ADXA 4K43A 4ISGA 2IIRA 3D2FB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FM0A 2D0AA 1VK0A 3MWTA 3T1HK 2JGUA 4PA1A 2P5OA 2HHQA 1HQEA 1RDUA 3WXIA 3KIOA 1RTHA 4KFBA 4BDZA 2CH5A 5C25A 4KB1A 5DM7L 4Z4CA 2KQ2A 4LF4K 3ID8A 2Q0UA 4FJGA 3UE5A 2Q36A 4NXNK 4YDUC 4HVJA 3WQTA 2DY4A 1NOZA 4BDPA 4EAHD 4LF7K 1EETA 3C6AA 1JXBA 4IFVA 3G0ZA 1HLUA 2QEXN 3DXMB 4C1NK 4DG1A 4CHYA 1JXEA 2E2OA 3SJHA 1QZ6A 1KTQA 4A5AA 2G8FA 1NKEA 4FWLA 4EIAA 4FSVA 4IEEA 4CHNA 4HHTA 3CJAA 4BC4A 2W42A 3EO3A 4PKHA 4F4KA 3C95A 3KK1A 1ZBUA 5M1QA 4N47A 5GINA 2H3GX 4BG9A 1QE1A 3T1YK 2IAJA 4ILHA 4B3TK 4BQLA 1V4SA 3G71N 2AP1A 4DR7K 3P5JA 4PL8A 2KTQA 3VQ7A 3AARA 4KREA 3HT3A 3EEQA 1HYVA 5BRDA 2BE2A 2OPPA 3EYZA 5ELZA 3MWPA 1Y64A 3J8AA 4DMNA 1OH8A 2P9UB 4N56A 1BG3A 5BPLA 2GUPA 3N4PA 3W0LA 2QWMA 4LF6K 5A2QO 2VWKA 3ZT4A 2E2NA 3SAFA 4CESA 1GOBA 2QM1A 4DF4A 1HNZK 2QWLA 3U4LA 4M7XA 4DSFA 4FJ7A 2FSJA 1XNRK 4MDBA 4TSXA 4CZKA 3L2RA 3HL8A 2P9IB 2YNIA 3AVNA 4W5RA 1JLEA 2PY5A 5HOOA 3U6FA 5LJVA 5KPZA 3UKRB 1YAGA 3ZYYX 5AQXA 1G99A 4DV4K 5AZIB 3G6EN 2X6SA 3AVIA 1YVUA 3VQ9A 4A2AA 1LAWA 3TU5A 4BE1A 3GOIA 4L8RB 3TSUA 2UUBK 4A2BA 4M3YA 3E9LA 1KVBA 5C24A 4H5NA 1YJ9N 2XY8A 1CLQA 1SKRA 3SZ2A 2HF3A 4ELVA 5KQDA 3T7ZA 3OTOK 3O4QA 4AHVA 2E8AA 3FZMA 4OGEA 2GWJA 4DTPA 3HYFA 1WBBA 4NYNA 1KFDA 4HCBA 4AHSA 1NLVA 3D2FA 3TSPA 5FPDA 4BR2A 2UXDK 3ZSQA 1RDDA 1S9EA 2QWRA 4CBXA 1Q7YO 1EWQA 4CF8A 4CJ3A 5KGXA 3O9QA 4Y0WA 2XO7A 3TANA 3OW2M 1IBKK 1HKBA 1WOQA 1VSLA 4ELTA 1S3XA 3NHGA 4LFAK 3KK7A 4DSLA 3LDQA 1ZC6A 3O3FA 3L4IA 3SPYA 3VF4A 4IOXA 5LJWA 3MAQA 2IVOA 4CVNE 4FK0A 4DFMA 1J5EK 3JXUA 3PO4A 4BC3A 2F9TA 4DQQA 4LF5K 4CJWA 4RWTA 2IC3A 2KHOA 4K41A 1E4GT 2NRTA 1TVRA 2ZD1A 1TK8A 4CJVA 3SCXA 1HNVA 3TTFA 4CJTA 1X9MA 4BRPA 2VCPA 2Q1NA 1HR0K 4CZJA 2C1IA 1JLFA 3F2KA 1ATSA 3NGZA 4I2QA 4IZ9A 2P9LB 4CJPA 3WNFA 1RDBA 3EE8A 4FZYA 3HXMA 1RT3A 2G8HA 5I9EB 4JI8K 3OYEA 5FPNA 3O4WA 4HUGA 1W97L 2P9KA 2W6LA 5JS1A 4DU1A 1BOTO 3ATVA 4HTLA 1XMQK 5AQJA 2O8EB 5C10A 4HUFA 4M42A 1O13A 2UUAK 3LPUA 4XH5A 3V4IA 2HBMA 3TAFA 3H1VX 3DLHA 3AV9A 5C12A 3MN7A 5DK5A 4CK1A 1KLMA 5B8HA 3SQ2A 3KJVA 1XC3A 5FROA 1RDAA 1WAJA 4XEIA 1WSEA 1IJJA 4NCAA 3CCEN 3CCVN 1BQNA 5HLFA 2UUCK 1NKBA 1VRTA 4GV3A 5CZ2A 5HP1A 1DEJA 4DR5K 3K0SA 3CM6A 4MO4A 3MDQA 1NK9A 5GAEP 4WFAL 3C65A 4HTUA 3VN5A 1FKOA 4GV9A 4WFBL 4EZ9A 3J80O 3OYLA 4H0XB 1T6CA 3TR8A 3HPGA 2W6KA 1VQLN 4FZXC 4N41A 4OPJA 1WSFA 3NF8A 4BVPA 3V9ZA 1SL0A 4AHUA 2YX6A 2FF3B 2Z1IA 3EY1A 4BE0A 4RCHA 4YOTA 2IS3A 3C6UA 1BL3A 3QO9A 1K73O 1CZ9A 3KVGA 3J81O 4IJAA 2O8CB 3CYGA 5AQMA 2YJFA 4YOWA 3L2UA 3MCPA 1RDCA 1UAXA 1NJIO 2BH1A 3C7NB 4H03B 4YORA 2Y1JA 5M1KA 2GUIA 1VSMA 1RT1A 1SZ2A 4MFBA 3CQXA 3QERA 3C6HA 3AGKA 4Z0UA 3ZSRA 1NGAA 4O8KA 2WTUA 5LMNK 1VQON 4DWIA 4RW9A 4BACA 3GG4A 4DU3A 3CPEA 2Q3SA 3FZLA 3S3OA 1Y97A 3CQ8A 2ZM6K 1UA1A 3M8RA 5J1EA 4R5PA 4KTQA 3VQEA 1D8YA 4X65K 4EHUA 4CF1A 1A5WA 2HNDA 3CETA 1H1VA 1C0GA 3I8DA 2HNYA 5KTQA 2YKNA 1BIZA 3LDSA 4PL7A 4DTMA 4PHTX 4BGAA 4JI6K 2PYJA 4OLAA 3O9SA 3UKUA 4DSKA 4FZZA 1YUWA 1A5XA 3G4SN 4CGFA 1IH7A 3VESA 4ISFA 3Q7CA 1N34K 1XQSC 1YT3A 1XHZA 1VQ8N 3V9UA 3LP0A 4QAGA 5CY4A 2NRVA 1KD1O 3DLLL 1N5YA 4N76A 3TI0A 4B3MK 4GKKK 1ZXOA 4Z4EA 1XC9A 2OZMA 3S5TA 3PX6A 1EKEA 3NF9A 4KHWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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