2Q38A

Carbonic anhydrase ii in complex with saccharin at 1.95 angstrom
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Saccharin Inhibits Carbonic Anhydrases: Possible Explanation for its Unpleasant Metallic Aftertaste.
pubmed doi rcsb
total genus 75
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2007-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2q38A00
1RAZA 2CBCA 1IF4A 3BL0A 2Q38A 3KKXA 4DZ7A 1IF9A 4JSAA 1IF5A 1BNMA 3F8EA 2CBBA 3SAPA 5JQ0A 1TEUX 3RZ0B 4FPTA 4X5SA 5AMLA 3W6IA 1CRAA 5CLUA 1CNGA 3LXEA 4QTLA 5DSKA 2Q1QA 1BNVA 1G4JA 4Q09A 1BN4A 3F7BA 5E2NA 3S76A 3P58A 2NNOA 1I90A 5FLPA 3V3HB 1UGEA 2ABEA 3DD8A 3T5UA 3KONA 1BCDA 3NJ9A 3TMJA 1XEVA 1KOQA 5BNLA 1I9MA 2F14A 5SZ1A 3DCCA 2Q1BA 1RZBA 5DVXA 3TVNX 4CNXA 1BNNA 4QSIA 4COQA 5EZTX 5JGSB 5AMDA 3NB5A 3MWOA 4QSBA 5DSMA 3ZP9A 4KV0A 3VBDA 1BICA 2OSFA 5JEPB 4G7AA 3IBNA 1KWQA 3W6HA 3M2YA 2H15A 3DC3A 2HOCA 1HEAA 2CBAA 3RYVB 1ZGFA 5EHEA 3MNUA 2FOYA 4Q90A 2NWYA 1G46A 5JG5B 1HUGA 4KUVA 4QJ0A 3MNHA 3CAJA 4Q83A 3V7XA 3CYUA 3NI5A 1CA2A 3HKNA 5FNHA 1Z97A 1TG3A 4Q0LA 4E3HA 3MNIA 4Q08A 3D93A 4KP5A 1CAZA 4YYTA 1LG6A 4K13A 1UGCA 1FSNA 3N4BA 4Z1EA 3T83A 4Q81A 4XIXA 1CNBA 1BNQA 1I9OA 3HKTA 3T5ZA 1Z93A 2CABA 1CAHA 2EU2A 4L5WA 3L14A 3ML5A 5JESB 3DA2A 3OYQA 3OKVA 5EKJA 4JSWA 4ZWYA 2WD2A 3SAXA 2VVBX 5FLRA 2AX2A 4WUQA 1CVBA 3MNAA 4HT2A 1BN3A 1CVAA 1I9NA 2NNGA 4KNMA 4PYXA 3IGPA 1CALA 1G1DA 2OSMA 3MNKA 4E5QA 3EFIA 3M1WA 3D8WA 4KNIA 5CACA 1CAOA 1DCAA 4BF6A 4YXOA 1YO0A 2FNMA 4L5UA 4Z1KA 1XQ0A 2NXRA 1RZEA 4DZ9A 1UGAA 4RUZA 4QK2A 3MHIA 3P5AA 3RZ1B 1BN1A 4Q87A 1ZH9A 4QJPA 5L3OA 3RYJB 5G03A 1TG9A 1UGDA 4XZ5A 1G0EA 5JQTA 3SBHA 4R5BA 3OILA 3HKUA 1TH9A 4QJOA 3RZ8A 4QK1A 4RUXA 3V3GB 3DCWA 1Z9YA 5EH7A 5DSRA 4Z0QA 1G0FA 4YX4A 1J9WA 3DBUA 5A25A 2O4ZA 3M2ZA 5DSQA 2X7SA 3CA2A 3DAZA 5CJFA 4UOVA 4CNVA 4M2VA 4RN4A 2FMGA 3B1BA 3UYQA 6CA2A 3M1KA 5JEGB 1G54A 1ZSBA 3MZCA 2NXSA 3IAIA 4ZWXA 4ZX0A 1HEDA 4RFCA 2NN7A 4KNNA 2CBEA 1I9QA 1YO2A 4IWZA 3P3HA 5SZ6A 1CIMA 4HF3A 2X7TA 1LGDA 1HVAA 2FNKA 4KP8A 3KWAA 1YDBA 3C7PA 4TWLA 1CILA 3S8XA 3Q31A 4HBAA 4JSZA 5EOIA 1OQ5A 1IF6A 3RZ7A 4G0CA 3S72B 4BCWA 4QJWA 1ZNCA 3D92A 1RAYA 4MDMA 4E4AA 1CCUA 1H4NA 3S78B 2WEGA 1T9NA 2NWPA 4BF1A 3ML2A 2H4NA 4CACA 3PJJA 5FNKA 3DVDA 1CAMA 4TWMA 4QJMA 3SBIA 4ZWIA 5FLOA 1IF7A 4FVNA 1BZMA 1LZVA 1FSQA 1CVHA 2FOSA 3IBUA 4ILXA 1V9IC 1RZAA 3EFTA 1THKA 5FDIA 3K2FA 3DD0A 5SZ3A 3P4VA 4Q7VA 5E28A 3RLDA 3KIGA 1CA3A 2NN1A 3RYXB 1RZDA 1YO1A 3RYYA 4N0XB 4PQ7A 1I9PA 1G3ZA 1TBTX 3HS4A 1JCZA 4RH2A 3M5TA 5LMDA 1BNTA 3CZVA 1I8ZA 5CA2A 4LP6A 3M1QA 3DVCA 3U7CA 1FSRA 3T85A 1MUAA 3FW3A 1KWRA 1TE3X 1G45A 4FIKA 3S9TA 3P3JA 3MNJA 3BL1A 3KOIA 5FL6A 1YDAA 3U45X 3MYQA 3OY0A 3TVOX 1YDDA 4PZHA 4Q8ZA 1XEGA 2GEHA 4HT0A 5FNGA 3M96A 3MHCA 2IT4A 4Q78A 5G0CA 2NNSA 1OKNA 5FLQA 3M5EA 5EHVA 1V9EA 1UGGA 2FOQA 3R17B 3M5SA 4MTYA 1YDCA 1G53A 4CA2A 3KOKA 4HEZA 3KNEA 3M3XA 1CNIA 5IPZA 4C3TA 3JXFA 4GL1X 3PYKA 1CCSA 4QJXA 3V3FA 4HEYA 1CAJA 3HKQA 3JXHC 4FU5A 4KNJA 2FMZA 3U47A 1OKMA 1ZSCA 4Z1NA 4LHIA 2WEJA 4KAPA 1CAKA 5E2SA 1HEBA 5FNLA 1ZFKA 4Q9YA 5EKMA 3S75B 4E3DA 3DC9A 1CVFA 3M04A 4KUWA 4R5AA 4YHAA 5FDCA 2NWZA 1FQLA 3RGEA 4HU1A 2NMXA 12CAA 1FQRA 3OIMA 5E2KA 2WD3A 3F4XA 4K0ZA 2FW4A 2HKKA 3OKUA 2ZNCA 5DRSA 5BRVA 3M98A 4Q6EA 3ZNCA 4MLTA 3M14A 1CANA 3F7UA 4XFWA 5JEHB 3S74B 5G01A 4QK3A 3FFPX 3P5LA 1ZSAA 2FOUA 4N16A 2HL4A 4YWPA 3UYNA 1LG5A 1HECA 3KLDB 3DVBA 5SZ0A 3DV7A 1BNUA 3JXGA 5FNJA 3RJ7A 4RIVA 2GD8A 1URTA 4JS6A 3HFPA 3N3JA 4Y0JA 3MMFA 3M1JA 2ILIA 2FOVA 5G0BA 4YGJA 1TEQX 4Q7WA 3M2NA 3U3AX 3GZ0A 4MDLA 1XPZA 5BRWA 1CNCA 1FR4A 4QEFA 3B4FA 1AM6A 4RUYA 4M2UA 1FLJA 1F2WA 4L5VA 2QOAA 1BNWA 5DSNA 3R16A 1KOPA 4LU3A 1CVEA 1CAYA 4ETQC 4FRCA 2WEOA 1I91A 4WW6A 2AW1A 3DCSA 3MHLA 1UGBA 5EH5A 5DSIA 1UGFA 1IF8A 4YGNA 4RIUA 3RZ5A 5EIJA 5E5UA 4Q8XA 1H9NA 4Q99A 5JGTB 1ZGEA 3V5GA 4ZWZA 1AZMA 5FLTA 3K7KA 4MLXA 4MO8A 1I9LA 3T82A 2CA2A 4QSAA 4YGLA 8CA2A 2HFWA 1G4OA 5DSOA 3V3JA 4Q49A 1Y7WA 1HCAA 3S97A 5EHWA 3IEOA 5DSJA 3T84A 2QP6A 3IBIA 5SZ4A 4ZAOA 3S71B 1KEQA 2VVAX 4K0TA 3FE4A 4FVOA 4Z1JA 3K34A 1CNKA 1CNHA 4WUPA 5DSPA 5BRUA 1CVCA 1FQMA 1DMXA 4Q07A 1ZFQA 4XE1A 2HD6A 3BETA 1EOUA 3IBLA 1DCBA 4YXIA 2POWA 1A42A 4E49A 5JDVB 5C8IA 1CNWA 3HLJA 5FL5A 5FLSA 5DOGA 4ZX1A 2HNCA 4JSSA 5L6KA 1G6VA 5J8ZA 3RYZA 2NWOA 1CINA 4QY3A 3D0NA 1ZE8A 5SZ2A 4PXXA 5A6HA 1HUHA 4Q7PA 4E3GA 2EU3A 3D9ZA 4YGFA 2QO8A 2WEHA 2POUA 3N0NA 5E2RA 4CNWA 5BYIA 2NNVA 3MHOA 4QIZA 4M2WA 1DMYA 1G48A 1TTMA 4QIYA 3M40A 4Q8YA 1RZCA 4ITPA 1BV3A 1TB0X 1HCBA 1LUGA 2X7UA 3P55A 5FNIA 4WL4A 5DOHA 4IDRX 4E3FA 3N2PA 3V2MA 2W2JA 3S77B 4CNRA 4WW8A 2EZ7A 1JV0A 2POVA 2CBDA 5SZ5A 3V2JA 3PO6A 3S73B 4YGKA 9CA2A 3OYSA 3QYKA 4RFDA 1JD0A 1RJ6A 1OKLA 2NXTA 4M2RA 3MDZA 1CCTA 4XIWA 1CAIA 5FNMA 1CNYA 4K0SA 1FR7A 5DSLA 7CA2A 3V3IB 4QSJA 5FL4A 5E5RA 3RG4A 4HEWA 4YXUA 4Q6DA 4PYYA 5EH8A 3OIKA 1G52A 5AMGA 3MHMA 1CNXA 5SZ7A 3M67A 5EKHA 1FQNA 4CQ0A 5E2MA 3P44A 1MOOA 1CNJA 4K1QA 4KUYA 4Q06A 3RG3A 4ITOA 4Q7SA 4MDGA 1H9QA 3KS3A 1CVDA 1CRMA 4YVYA 1AVNA 5JG3B 2FNNA 1RJ5A 1CZMA 4WR7A 4FL7A 4E9OX 5HPJA 4R59A 3M2XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RAZ A;  2CBC A;  1IF4 A;  3BL0 A;  2Q38 A;  3KKX A;  4DZ7 A;  1IF9 A;  4JSA A;  1IF5 A;  1BNM A;  3F8E A;  2CBB A;  3SAP A;  5JQ0 A;  1TEU X;  3RZ0 B;  4FPT A;  4X5S A;  5AML A;  3W6I A;  1CRA A;  5CLU A;  1CNG A;  3LXE A;  4QTL A;  5DSK A;  2Q1Q A;  1BNV A;  1G4J A;  4Q09 A;  1BN4 A;  3F7B A;  5E2N A;  3S76 A;  3P58 A;  2NNO A;  1I90 A;  5FLP A;  3V3H B;  1UGE A;  2ABE A;  3DD8 A;  3T5U A;  3KON A;  1BCD A;  3NJ9 A;  3TMJ A;  1XEV A;  1KOQ A;  5BNL A;  1I9M A;  2F14 A;  5SZ1 A;  3DCC A;  2Q1B A;  1RZB A;  5DVX A;  3TVN X;  4CNX A;  1BNN A;  4QSI A;  4COQ A;  5EZT X;  5JGS B;  5AMD A;  3NB5 A;  3MWO A;  4QSB A;  5DSM A;  3ZP9 A;  4KV0 A;  3VBD A;  1BIC A;  2OSF A;  5JEP B;  4G7A A;  3IBN A;  1KWQ A;  3W6H A;  3M2Y A;  2H15 A;  3DC3 A;  2HOC A;  1HEA A;  2CBA A;  3RYV B;  1ZGF A;  5EHE A;  3MNU A;  2FOY A;  4Q90 A;  2NWY A;  1G46 A;  5JG5 B;  1HUG A;  4KUV A;  4QJ0 A;  3MNH A;  3CAJ A;  4Q83 A;  3V7X A;  3CYU A;  3NI5 A;  1CA2 A;  3HKN A;  5FNH A;  1Z97 A;  1TG3 A;  4Q0L A;  4E3H A;  3MNI A; 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