The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
86
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structure length |
86
|
Chain Sequence |
ASIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLSPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILKQRPGGGGST
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase regulator
|
| molecule keywords |
E80-TELSAM domain
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| publication title |
Polymer-driven crystallization.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
19
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3IDW A; 2F8K A; 2L5Y A; 2KMD A; 4MHV A; 4IS7 A; 5JTI A; 4RQN A; 2B6G A; 1UCV A; 4NJ8 A; 1F0M A; 2EAN A; 2EAP A; 1SGG A; 1LKY B; 2QB0 A; 3BS5 B; 2Y9U A; 1SV4 A; 1WWV A; 2E8P A; 2F44 A; 1SV0 A; 2QB0 B; 2DKZ A; 2QKQ A; 5JU5 A; 2E8O A; 2GLE A; 1PK1 B; 1B0X A; 1WWU A; 5J8Y A; 1KW4 A; 3H8M A; 1Z1V A; 4NL9 A; 3K1R B; 1SXE A; 4PZO A; 1X40 A; 2K4P A; 2D3D A; 3SEN A; 3TAD C; 5L1M A; 5KNI A; 1UQV A; 2EAM A; 2D8C A; 3BS7 A; 2LMR A; 2QAR A; 3KKA A; 2FE9 A; 3BQ7 A; 2KSO A; 1OXJ A; 1OW5 A; 1JI7 A; 1SV0 C; 3HIL A; 2QB1 A; 2E8N A; 2KG5 A; 1X9X A; 2Y9T A; 4NL9 C; 5JRT A; 1V85 A; 1V38 A; 2DL0 A; 1SXD A; 2JV3 A; 2YTU A; 2KE7 A; 4RQM A; 1COK A; 3TAD A; 1LKY A; 2ES6 A; 3BS5 A; 5F3X B; 2QAR B; 4PZN A; 1B4F A; 3KKA C; 2KSO B; 2EAO A; 2ESE A; 2DKX A; 3SEI A; 1RG6 A; 2F3N A; 3TAC B; 1DXS A; 1PK1 A; 1PK3 A; 2K60 A; 2LPE A; 5J8Y C; 2KIV A; 1X66 A; 2E8M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4F72 A; 5KAI U; 4UAV A; 2E1F A; 2G5I B; 1NJX A; 3A0B U; 2P6R A; 4KLI A; 3GQC A; 2ZIU A; 5KFS A; 3PX6 A; 4F91 B; 1JMS A; 2W03 A; 4F93 B; 3H8W A; 2G0A A; 2G06 A; 1UA1 A; 2FPK A; 4I2D A; 2JEI A; 2Y9U A; 1NKC A; 1WWV A; 2VAN A; 3F53 A; 7ICH A; 5KT3 A; 5EE9 A; 4YQW A; 8ICR A; 1KEJ A; 1K1Q A; 3Q8S B; 1S0N A; 3BQ0 A; 3RAX A; 1K5O A; 4K4I A; 1Z1V A; 4QWE A; 2KFN A; 1A77 A; 2NRT A; 3M7D A; 1MC8 A; 4DO9 A; 5HR6 A; 5J2G A; 4B9V A; 2KVS A; 4RQ7 A; 1TVA A; 2D8C A; 4UQG A; 2EQY A; 4UB8 U; 5CJ7 A; 3Q8K A; 3RH5 A; 2K4H A; 2XY5 A; 3U26 A; 5HNK A; 5J2E A; 2BQR A; 3M6Z A; 8ICL A; 1T3N A; 3NVW A; 9ICN A; 2UVV A; 2BGW A; 5J0O A; 5KFD A; 4NL9 C; 5EE3 A; 7ICU A; 4BWM A; 5HR7 A; 5J0R A; 2MUT B; 1TAQ A; 4LZD A; 7ICF A; 2YML A; 1QSY A; 4Q43 A; 2VA8 A; 8ICK A; 1X9M A; 1KQQ A; 2AQ0 A; 3RB6 A; 3H40 A; 5AKK A; 4I2E A; 2HHS A; 3H7I A; 4KIT B; 3MR3 A; 1ZQY A; 2A3V A; 5HP4 A; 1RG6 A; 2XO7 A; 4YVZ A; 4DS4 A; 2DBY A; 3HX0 A; 4YG2 A; 2BPC A; 4KX3 A; 5ALI A; 3SI8 A; 5IIJ A; 2CN1 A; 4RQ5 A; 1Z00 B; 4PHE A; 4DSJ A; 1S8O A; 3Q8P B; 5EE1 A; 2B6G A; 1PUZ A; 4NJ8 A; 4PL1 A; 4R8U A; 5IIO A; 1N61 A; 4J03 A; 5JUM A; 4NLZ A; 2Z7J A; 4YFK A; 2NO4 A; 2ZIW A; 4QZD A; 5DBB A; 2WFA A; 2P66 A; 1B0X A; 2NYV A; 2KZ3 A; 1KW4 A; 4M6W A; 5ALZ A; 2H3Q A; 5AM4 A; 1N63 A; 5KG0 A; 4ICA A; 4KLQ A; 2FLL A; 2F1H A; 1SKW A; 4K4G A; 3RR7 A; 4M9L A; 4KLM A; 5KFB A; 3EW9 A; 5L1J A; 4M9H A; 5AI9 A; 1ZD2 P; 2H5X A; 1RQL A; 3IP4 B; 2DUY A; 5J2D A; 1LVH A; 2HMX A; 3C2M A; 2KSO A; 4RUC A; 4F71 A; 3QZ8 A; 5CA7 A; 1A76 A; 1CUK A; 1ZJM A; 4I27 A; 1U4B A; 3PZP A; 3DV9 A; 4MF8 A; 4ELT A; 3ZDA A; 1ZQS A; 3C28 A; 4I2B A; 4O0I A; 4F3O A; 4IRD A; 3ZDD A; 2KTQ A; 2KJ5 A; 5EWE A; 2BHN A; 1S97 A; 2QAR B; 1ZQR A; 4IQU A; 9ICR A; 1N60 A; 2EAO A; 5J0P A; 9ICE A; 3MDC A; 1VJ5 A; 4KLJ A; 5DB7 A; 1Q46 A; 4M2Y A; 3I28 A; 3M6K A; 5KFH A; 4O5K A; 3F5E A; 1KTQ A; 3RAQ A; 3RH4 A; 4BXO B; 2AQ4 A; 2EZX A; 1ECW A; 5KFF A; 3C1Y A; 4WJ3 B; 5AKX A; 4I28 A; 5DGA A; 1TV9 A; 3MAB A; 4OO1 J; 3ZDE A; 2A1A A; 3D2Q A; 3WKA A; 4C4T A; 3PW4 A; 4YR0 A; 7ICP A; 1SL2 A; 4PHP A; 4KLL A; 1PK1 B; 2FLP A; 4IQW A; 4AP9 A; 4Q8E A; 3PX4 A; 2NRW A; 1X40 A; 3RTV A; 4RNM A; 2B21 A; 1T8E A; 3F2D A; 4TUR A; 3SEN A; 3ISD A; 1MSW D; 4QZC A; 3D2S A; 4Q45 A; 1ZOL A; 5L1I A; 3C2K A; 3KKA A; 3J81 j; 4ECS A; 2BCS A; 5AM0 A; 1NZB A; 5KFA A; 3KZI U; 1K1S A; 2HOI A; 2XCP A; 2XVT A; 3N4M B; 1UHU A; 3OPX A; 4C8M A; 2YY6 A; 4OCZ A; 1L3U A; 1XSN A; 1S9F A; 2RLT A; 1OUQ A; 4US9 A; 3RF9 A; 2XID A; 3BQT A; 3QU4 A; 5KG3 A; 2JV3 A; 3JPR A; 1ZQQ A; 1DK3 A; 4DL4 A; 5DB6 A; 2OM6 A; 4BJQ A; 3KTQ A; 2KKV A; 4ACO A; 1L8L A; 4EX7 A; 2Q0Z X; 4C7Y A; 3QU9 A; 4PH5 A; 2KK0 A; 2KJ8 A; 3AU2 A; 4PHD A; 2MRL A; 2RDI A; 2EDU A; 3TAC B; 2MAX A; 1UT8 A; 3QEA Z; 2FLN A; 4O3S A; 3BQ2 A; 4DCC A; 7ICV A; 5AI4 A; 3LYS A; 5III A; 4MHV A; 5ALT A; 3M1Y A; 4B9U A; 2ZIX A; 1BPB A; 2HBJ A; 3C2L A; 3RRH A; 2A1J A; 4DL6 A; 2IOF K; 1SV4 A; 3PSP A; 4F2S A; 2F44 A; 4XQ8 A; 1SV0 A; 4ECX A; 3HT3 A; 1SWV A; 1D8Y A; 2JR5 A; 2DQN B; 5J8Y A; 2XY6 A; 4TUQ A; 2YMM A; 4TQS A; 3GZF A; 5KT5 A; 2W43 A; 4TUS A; 2ISO A; 8ICX A; 5ALR A; 8ICA A; 1L8O A; 3KHL A; 2FI1 A; 1S10 A; 5AI0 A; 4IR9 A; 2IHN A; 2ZXI A; 1ZQX A; 4DSE A; 3PW7 A; 3G6V A; 4JWM A; 1BPZ A; 4YXJ A; 1BPD A; 3MBY A; 4RU9 A; 4MEX A; 2HSZ A; 4O5E A; 1ZD3 A; 2C2R A; 5ALE A; 5DDY A; 2KZM A; 3IM1 A; 2LYB A; 2W7P A; 3BJY A; 3NTU A; 3HWT A; 4Z6C A; 2EH9 A; 1NNL A; 4QWC A; 4Q8F A; 2XGP A; 4XUS A; 2KN7 A; 1V38 A; 3DDH A; 5KFI A; 3ZI4 A; 2KE7 A; 7ICR A; 1HEK A; 3ETL A; 4EBD A; 3KHR A; 5KL1 B; 2K8B B; 2QLT A; 2BCR A; 3JPT A; 1LKY A; 8ICQ A; 3OHA A; 5DG8 A; 1NKB A; 2ZIV A; 4UAY A; 3PW2 A; 2WB1 F; 1FFU A; 2WB1 C; 1N2X A; 3RB4 A; 3TAQ A; 4ED3 A; 1ZQB A; 3MGH A; 2W9M A; 8ICO A; 7ICI A; 5KG2 A; 1Z19 A; 2L5Y A; 5KT4 A; 5AK3 A; 3TAN A; 3KFU F; 4Z6D A; 4R63 A; 1ZXI A; 5JTI A; 3C23 A; 4JV1 A; 5KG1 A; 2KIW A; 2DPI A; 5ALH A; 4ECR A; 2M9N A; 3GIJ A; 3RJG A; 2WF9 A; 3IG8 A; 1YT3 A; 5J2J A; 1DGS A; 3ISB A; 4EEN A; 2H3I A; 4DFM A; 4RPZ A; 3AN1 A; 5KT7 A; 3PY8 A; 2ZG6 A; 5AM3 A; 4DWI A; 2PFP A; 2BPF A; 2PXI A; 4NLN A; 2ATL A; 5KFN A; 3K1R B; 5TZV A; 3QZ7 A; 2HHT A; 2HCF A; 4OD0 A; 4EX6 A; 3PW0 A; 4O9M A; 2FMQ A; 4C8O A; 3HRD D; 1NZP A; 1ZRN A; 1QSL A; 4OJ6 A; 3AM9 A; 1L7P A; 2NRZ A; 2LI6 A; 3BQ1 A; 4EYH B; 2KZZ A; 2ASD A; 2BR0 A; 3HIL A; 3NRZ A; 2LYA A; 4ELV A; 1NK6 A; 1PVP A; 3OHB A; 1RDF A; 1WUD A; 2VKQ A; 1IIP A; 3FYH A; 4QW8 A; 4DQR A; 4J9L A; 2PI5 A; 3ALR A; 4NLK A; 4P0Q A; 2C22 A; 1ZYQ A; 5KFZ A; 4K4H A; 3RBE A; 1Z4N A; 4C4R A; 5F3X B; 4ECY A; 1L3V A; 3M8R A; 3AQE A; 3B0Y A; 3EWA A; 2ZUC A; 4QZ8 A; 4IRC A; 1JN3 A; 5DB8 A; 5KFJ A; 1ZJN A; 1X66 A; 3SV3 A; 1QTM A; 1ARO P; 4FZN A; 2W54 A; 4ED7 A; 5ALW A; 2NO5 A; 3WKD A; 4NWI A; 3M9N B; 2HI0 A; 4I2H A; 2DPJ A; 1X6J A; 3BS5 B; 7ICQ A; 2PMZ F; 3H0R B; 2PMZ C; 2N1R A; 2VA3 A; 4P4P A; 2E8P A; 1LV5 A; 1MQ3 A; 5G5G A; 3QX7 A; 4GIB A; 1Z1B A; 5B66 U; 2WHE A; 3T5K A; 1RYR A; 2HBM A; 4UB3 A; 1S0O A; 4USA A; 4FFD A; 4EEL A; 3ICX A; 3EPG A; 4J9O A; 3B9J A; 3JPQ A; 4ECW A; 3SAF A; 1D9F A; 4B9M A; 1TK5 A; 7ICE A; 3WK7 A; 1SWW A; 1XNS A; 2K4I A; 3M9M B; 4ELU A; 2O6K A; 4QZA A; 7ICG A; 4HAI A; 4QZ9 A; 5KFY A; 1RQN A; 1NJW A; 2V4Q A; 4P0P A; 3NVV A; 3QUT A; 3UMG A; 2AXT U; 4UBC A; 1JXL A; 2JEF A; 4UB1 A; 2RHF A; 1T7P A; 5A0L A; 5KFK A; 1UPH A; 5KFW A; 5DQH A; 4F4Y A; 2FPL A; 5JRT A; 2R8I A; 2DL0 A; 1KSP A; 8ICN A; 2CRX A; 4IQV A; 3WKB A; 7ICK A; 3PW5 A; 3OTQ A; 3RJH A; 2D6F C; 1KFD A; 2W55 A; 4BGD A; 5AHX A; 2FMP A; 4Z6E A; 3OJU A; 5AKY A; 5J2C A; 4FS2 A; 3SEI A; 4LZG A; 4AYB F; 4AYB C; 1X9S A; 4QZE A; 1XU4 A; 2E8M A; 1HJP A; 4I2F A; 5AIB A; 2KMD A; 5D46 A; 1UA0 A; 5ALU A; 1NK9 A; 1RZT A; 9ICT A; 4O3R A; 3RJJ A; 4QZG A; 5KFU A; 9ICU A; 4ECQ A; 4UB5 A; 4DSL A; 3SYZ A; 4RNO A; 2JXJ A; 3L4P A; 5F9L A; 4DQS A; 1U9L A; 8ICI A; 3CW2 C; 2E3T A; 4EEK A; 3RH6 A; 3RFA A; 3C5G A; 5IIM A; 4DL5 A; 2K8C B; 2PFN A; 4B9L A; 1JUD A; 3QU7 A; 1MA7 A; 5AI6 A; 4DSK A; 9ICF A; 3JPO A; 4FBT A; 7ICJ A; 1D8L A; 3TFR A; 2W9C A; 3BS7 A; 3NAS A; 3MGI A; 1U49 A; 1KN5 A; 4R66 A; 1AQ6 A; 9ICX A; 4BWJ A; 3UXO A; 4KTQ A; 4GFJ A; 3V6H A; 1H38 A; 9ICA A; 4E0D A; 9ICS A; 4MFA A; 4IR1 A; 1LB2 B; 1C20 A; 1XO0 A; 4PGQ A; 4DS5 A; 4DL7 A; 5AM1 A; 1COK A; 4JMU A; 1JXE A; 8ICJ A; 7ICT A; 3A0H U; 2JH7 A; 3PST A; 4YR2 A; 4B9N A; 3WU2 U; 3PNC A; 4UB6 U; 4J9Q A; 3UXP A; 2R18 A; 4ECV A; 2W9B B; 3KKA C; 1BGX T; 3L5K A; 1HUZ A; 9ICM A; 3ZDB A; 3KHG A; 9ICO A; 1KKX A; 2JZB B; 2R8K A; 5IIK A; 1YZ7 A; 2ODG A; 8ICF A; 4G3I A; 2NV3 A; 4UB4 A; 2AJQ A; 1ZQI A; 3NVZ A; 1IG6 A; 1F0M A; 2W9A A; 4TUP A; 5EWF A; 1ZQ1 C; 2IA6 A; 2RP5 A; 2XIC A; 4ECZ A; 3EYZ A; 3TFS A; 2J6U A; 2BKE A; 4QZI A; 4QW9 A; 2FMS A; 1L6N A; 2CXY A; 3GV7 B; 5KTQ A; 3RB0 A; 2W3R A; 3PML A; 4GC6 A; 4M9J A; 3C29 A; 1BPX A; 5DGB A; 8ICM A; 2MUT A; 3TAR A; 9ICL A; 4ED1 A; 4C0Z A; 2OCE A; 3OSP A; 2G07 A; 5HMM A; 4CDG A; 2OH2 A; 5KNI A; 5DB9 A; 3IV6 A; 2LMR A; 3V72 A; 2W8K A; 4Y2S A; 1Q3U A; 1N56 A; 4ED2 A; 4KLO A; 4B9S A; 5CB1 A; 4Y2J A; 1TK0 A; 9ICB A; 1SV0 C; 4P4O A; 4OJO A; 4P4M A; 3KZX A; 4IC9 A; 4J9M A; 2YMQ A; 3MFH A; 1BPE A; 4P2H A; 3N7R C; 4Y2P A; 9ICG A; 3PO5 A; 1QQ7 A; 2HHX A; 1Z00 A; 1KBU A; 5J2K A; 2OWO A; 5ALX A; 1GO3 F; 3SAG A; 1S0M A; 3RJF A; 2K89 A; 4PGY A; 8ICC A; 3UMC A; 3NRW A; 4PGX A; 1DRG A; 1CRX A; 4KLF A; 4RT2 A; 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4DLG A; 2AH5 A; 3TQ1 A; 2IMW P; 4RQ8 A; 1PK1 A; 1S76 D; 3QUC A; 2W7O A; 2WF7 A; 1DGJ A; 3FM9 A; 1S77 D; 2G5H B; 4F4W A; 1RXV A; 4M9G A; 5KFV A; 3FAH A; 5K4L A; 3E0F A; 1BNO A; 4KLE A; 4Y2R A; 3Q8Q B; 3SD7 A; 3QU5 A; 1L7N A; 2Y1I A; 5KFR A; 3S6J A; 5HHH A; 5DG9 A; 5FP0 A; 1NK5 A; 1F5S A; 1PVQ A; 3H8M A; 1TK8 A; 1L3T A; 4MF2 A; 3QUB A; 8ICT A; 4CCH A; 2ZIU B; 3TAD C; 4Y2X A; 5L1M A; 2XCA A; 2XC9 A; 3EZ5 A; 3ZDC A; 2JEG A; 8ICP A; 3QNM A; 4QWB A; 2YN4 A; 2KOB A; 5KG7 A; 3F2C A; 3RJE A; 1ZQL A; 2Y0S F; 2Y0S C; 1FO4 A; 4IRK A; 2QB1 A; 2W3S A; 4KLH A; 1Z4O A; 3MDA A; 3BZC A; 4F92 B; 5ALP A; 3SMV A; 2IBK A; 5J0W A; 4JWN A; 9ICQ A; 4FS1 A; 2EZZ A; 1ZQG A; 1SXD A; 4DSI A; 4MEY A; 3N97 B; 5AKZ A; 5BOL A; 1RXW A; 1NK7 A; 5G5H A; 3VC8 A; 8ICH A; 1RPL A; 2F8L A; 3F2B A; 5ALN A; 3FC4 A; 5IIL A; 3C5F A; 4J9R A; 1DOQ A; 4M0A A; 3EPI A; 4EBE A; 1MQ2 A; 3RBD A; 2HDO A; 4YN4 A; 2KKP A; 5J2I A; 8ICG A; 1XWL A; 4BX9 C; 4NM1 A; 2GOL A; 4RPX A; 3CP8 A; 1ZQP A; 3AU6 A; 2KHV A; 1KFT A; 2CPR A; 4NV0 A; 2WAQ F; 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